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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4121 | 2026-04-07 |
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-May-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114757
PMID:41780688
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在胰腺导管腺癌(PDAC)中用于解析肿瘤内异质性、微环境成分及动态细胞相互作用的应用 | 系统总结了scRNA-seq在PDAC研究中的工作流程、数据分析方法及其在识别细胞亚群转化、生物标志物和治疗靶点方面的创新应用 | 作为综述文章,未进行原始实验研究,主要依赖现有文献总结,可能未涵盖所有最新技术进展 | 探讨scRNA-seq技术如何帮助理解PDAC的肿瘤内异质性、微环境动态及潜在治疗策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤细胞、微环境成分(如免疫细胞、癌症相关成纤维细胞)及相关生物标志物 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4122 | 2026-04-07 |
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70036
PMID:41670056
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索了子宫颈腺样基底癌向鳞状细胞癌转化的分子机制 | 首次应用空间转录组学技术分析腺样基底癌、过渡巢、鳞状细胞癌和高级别鳞状上皮内病变之间的分子差异,并识别出区分过渡巢的关键基因CK13和SCCA2 | 样本量有限(仅4例用于空间转录组分析),未来需要更大规模的研究来指导临床决策 | 阐明腺样基底癌与鳞状细胞癌之间的转化关系,为治疗策略提供指导 | 子宫颈腺样基底癌及其伴随的鳞状细胞癌、过渡巢和高级别鳞状上皮内病变 | 数字病理学 | 子宫颈癌 | 空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据,组织图像 | 20例腺样基底癌病例,其中4例用于空间转录组分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4123 | 2026-04-07 |
The immune-metabolism interactome in efferocytosis: a new paradigm for the central nervous system diseases revealed by single-cell sequencing analysis
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70031
PMID:41693397
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综述 | 本文综述了胞葬作用在维持中枢神经系统稳态中的基本过程、免疫-代谢交互作用及其调控,并基于单细胞测序分析探讨了其在多种中枢神经系统疾病中的关键作用 | 提出了免疫-代谢相互作用组在胞葬作用中的新范式,并利用单细胞测序分析揭示了小胶质细胞在胞葬过程中的异质性 | NA | 总结胞葬作用在中枢神经系统发育、衰老及疾病中的作用,并探讨其潜在治疗策略 | 小胶质细胞、中枢神经系统疾病(如脑缺血、脑出血、创伤性脑损伤、重度抑郁症、多形性胶质母细胞瘤、阿尔茨海默病、帕金森病等) | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4124 | 2026-04-07 |
Xenium-based spatial transcriptomic analyses uncover prognosis-associated heterogeneity in the tumor microenvironment (TME) of angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL)
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70035
PMID:41711078
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研究论文 | 本研究利用Xenium空间转录组学技术,比较了难治/复发性和治疗敏感的血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤样本,揭示了肿瘤微环境的异质性并鉴定出与预后相关的新型Tfh细胞亚群 | 首次在AITL中鉴定出具有干细胞样特征的NEIL3+ Tfh细胞亚群,并系统描绘了难治/复发与治疗敏感病例间肿瘤微环境免疫细胞组成的空间分布差异 | 样本量较小(10例临床样本),且为观察性研究,需要更大规模队列和功能实验验证 | 解析血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤肿瘤微环境的异质性及其与治疗抵抗的关联 | 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤患者的临床组织样本 | 空间转录组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 10例临床样本(包括难治/复发和治疗敏感病例) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析平台 |
| 4125 | 2026-04-07 |
Intervention of Rutin and Ochnaflavone in the Attenuation of Neuroinflammation and Neuronal Apoptosis in Spinal Cord Injury
2026-Apr, Global spine journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1177/21925682251383489
PMID:41001708
|
研究论文 | 本研究探讨了芦丁和欧查黄酮在脊髓损伤中通过调节小胶质细胞和PI3K/AKT及NF-κB信号通路减轻神经炎症和神经元凋亡的神经保护机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学方法,揭示了芦丁和欧查黄酮协同抑制小胶质细胞激活及下游信号通路的分子机制,为脊髓损伤提供了一种新的联合治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类临床中进行验证,且具体剂量和长期安全性需进一步评估 | 阐明芦丁和欧查黄酮在脊髓损伤中的神经保护作用机制,特别是对次级损伤过程的调控 | 脊髓损伤小鼠模型、LPS刺激的BV2小胶质细胞、小胶质细胞-神经元共培养系统 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、网络药理学、Western blotting、免疫荧光、ELISA | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4126 | 2026-04-07 |
A universal and cost-efficient sample labeling approach for multiplexed single-cell RNA-seq based on recombinant HUH-endonuclease-agglutinin tagging
2026-Apr, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.10.004
PMID:41167558
|
研究论文 | 本文提出了一种基于重组HUH-核酸内切酶-凝集素标记(HEATag)的通用且成本效益高的样本标记方法,用于多重单细胞RNA测序 | 结合鸭圆环病毒HUH核酸内切酶(DCV)和小麦胚芽凝集素(WGA),开发了一种新型通用细胞膜标记方法,实现了快速、序列特异性的索引单链DNA标记,且适用于新鲜或固定细胞及多种物种 | NA | 解决单细胞转录组学中多重样本标记方法成本高或操作复杂的问题,以降低单细胞测序的每样本成本 | 细胞膜(适用于新鲜或固定细胞及多种物种) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 兼容商业平台和定制系统,可适配多种单细胞组学工作流程 |
| 4127 | 2026-04-07 |
Efferocytosis deficiency exacerbates local inflammation and predicts recurrence in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.1016
PMID:41638263
|
研究论文 | 本研究全面表征了慢性鼻窦炎(CRS)中胞葬作用的缺陷,并探讨了其与炎症内型及临床结局的关联 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了CRS中胞葬作用的广泛缺陷,并识别出与疾病复发相关的5分子特征预测面板 | 研究主要基于组织样本分析,缺乏体内功能验证实验 | 探究胞葬作用在慢性鼻窦炎(特别是伴鼻息肉型)中的作用机制及其临床意义 | 慢性鼻窦炎(CRS)患者,特别是伴鼻息肉型(CRSwNP)的鼻息肉组织与健康鼻黏膜 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 定量实时PCR、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 回归模型、受试者工作特征分析 | 基因表达数据、组织图像数据 | 未明确样本数量,涉及CRS患者与健康对照的鼻组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4128 | 2026-04-07 |
Endogenous oestrogens as neuroprotective modulators in the human retina: Evidence from transcriptomic profiling and aromatase inhibition
2026-Apr, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70171
PMID:41877439
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析和小鼠视网膜外植体实验,探讨了内源性雌激素在人视网膜中的神经保护作用及其细胞类型特异性表达 | 首次在单细胞水平上系统描绘了人视网膜中类固醇激素代谢和雌激素信号通路基因的表达图谱,并利用芳香化酶抑制剂验证了局部雌激素合成对光感受器维持和免疫调节的功能相关性 | 研究主要基于小鼠视网膜外植体模型,可能无法完全模拟人视网膜的生理环境;且实验仅使用单一浓度(20 μM)的来曲唑进行抑制,缺乏剂量依赖性验证 | 探究内源性雌激素在人视网膜中的神经保护作用及其细胞类型特异性功能 | 人视网膜单细胞RNA测序数据和小鼠视网膜外植体 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 基于公开数据集E-MTAB-7316,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4129 | 2026-04-07 |
Pathogenic GM-CSF drives functional diversification of inflammatory macrophages in autoimmune arthritis
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec0986
PMID:41880492
|
研究论文 | 本研究探讨了在自身免疫性关节炎中,致病性GM-CSF如何驱动炎症性巨噬细胞的功能多样化,从而加剧关节炎症和疼痛 | 揭示了GM-CSF在促进关节浸润单核细胞分化为功能不同的巨噬细胞亚群中的关键作用,并识别了两个GM-CSF依赖的致病性滑膜巨噬细胞亚群 | 研究基于T辅助17细胞介导的自身免疫性关节炎模型,可能不适用于所有类型的关节炎,且单细胞RNA测序的样本量有限 | 阐明自身免疫性关节炎中巨噬细胞发育和功能多样化的机制 | 关节浸润的Ly6C单核细胞和滑膜巨噬细胞 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4130 | 2026-04-07 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于热力学的可编程核酸扩增方法,通过机器学习优化,提高了扩增效率的调控精度,应用于DNA数据存储和临床诊断 | 通过引物标签补偿策略解耦序列特异性和杂交能量调控,实现了连续精确的扩增效率调制,并利用机器学习模型显著提升预测准确性 | 未明确说明方法在单细胞测序和空间转录组学中的具体应用验证,临床验证仅基于模拟测序深度 | 开发可编程核酸扩增技术,用于分子诊断和DNA数据存储 | 核酸扩增过程、DNA数据存储系统、宫颈癌RNA变异 | 机器学习 | 宫颈癌 | 核酸扩增、机器学习建模 | 机器学习模型 | 实验数据 | 2483个实验数据点 | NA | NA | NA | NA |
| 4131 | 2026-03-28 |
Correction: Single-cell RNA-seq integrated with multi-omics reveals SERPINE2 as a target for metastasis in advanced renal cell carcinoma
2026-Mar-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08472-z
PMID:41876448
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4132 | 2026-04-07 |
SR2P: an efficient stacking method to predict protein abundance from gene expression in spatial transcriptomics data
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.04.709692
PMID:41846960
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SR2P的堆叠机器学习框架,用于从空间转录组学数据中的基因表达预测蛋白质丰度 | SR2P通过集成11种互补的预测模型,在多个空间多组学基准测试中持续优于现有方法,首次实现了从仅含RNA的空间数据中推断蛋白质丰度 | 技术仍受限于仅基于RNA表达进行预测,可能无法完全捕捉蛋白质-RNA丰度不一致性,且依赖于现有空间多组学数据进行训练 | 开发一种高效方法,从空间转录组学数据中的基因表达预测蛋白质丰度,以增强对肿瘤微环境中免疫细胞状态的分析能力 | 空间转录组学数据,特别是头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间转录组学,空间多组学分析 | 堆叠机器学习框架,集成11种预测模型 | 基因表达数据,蛋白质丰度数据 | NA | NA | 空间转录组学,空间多组学 | NA | NA |
| 4133 | 2026-04-07 |
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
2026-Mar-02, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag023
PMID:41879291
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研究论文 | 本研究探讨卵巢激素缺乏如何通过转录组和代谢改变加剧木烟暴露引起的免疫功能障碍 | 首次在单细胞水平揭示卵巢激素缺乏与木烟暴露协同作用导致骨髓免疫细胞转录程序和代谢重编程的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;单细胞分析仅聚焦卵巢切除背景 | 识别木烟暴露免疫毒性的易感因素,特别是卵巢激素缺乏的作用 | 卵巢切除小鼠的骨髓免疫细胞和骨髓来源巨噬细胞 | 单细胞组学 | 免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 卵巢切除和假手术小鼠的骨髓细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4134 | 2026-04-07 |
Unraveling the carcinogenic mechanisms of benzo[a]pyrene in prostate cancer: a multi-omics approach
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04842-0
PMID:41288678
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、单细胞转录组学、分子对接、孟德尔随机化等多种方法,揭示了苯并[a]芘在前列腺癌中的致癌机制 | 首次采用多组学方法系统研究苯并[a]芘在前列腺癌中的具体作用机制,并识别出TP53等关键基因的诊断和因果相关性 | 研究主要基于生物信息学分析和已有数据,缺乏实验验证,且样本来源和具体技术细节未明确说明 | 阐明苯并[a]芘在前列腺癌中的致病机制 | 苯并[a]芘靶点基因与前列腺癌相关基因 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 网络毒理学、单细胞转录组学、差异基因表达分析、分子对接、孟德尔随机化、文献计量学 | NA | 基因表达数据、文献数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4135 | 2026-04-07 |
Unraveling the ferroptosis landscape in intervertebral disc degeneration through integrated bioinformatics and single-cell sequencing
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04826-0
PMID:41288682
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和单细胞RNA测序分析,系统揭示了铁死亡在椎间盘退变中的关键基因网络和细胞分布,并探索了白藜芦醇作为潜在治疗药物的可能性 | 首次在椎间盘退变中整合转录组和单细胞RNA测序数据,系统识别了铁死亡相关的核心枢纽基因网络,并揭示了这些基因在12种主要细胞亚群中的异质性表达模式,同时通过药物预测和体外实验验证了白藜芦醇的治疗潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;单细胞测序样本量未明确说明;药物作用机制仍需进一步深入探究 | 阐明铁死亡在椎间盘退变发病机制中的作用,并探索潜在的治疗干预策略 | 椎间盘退变患者样本、髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、转录组分析、生物信息学分析、分子对接、CCK-8检测、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4136 | 2026-04-07 |
Circulating tumor cells in myeloma are a compound biomarker for bone marrow high-risk genomic alterations and tumor load
2026-Feb-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030083
PMID:41411148
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和全基因组测序分析,揭示了多发性骨髓瘤中循环肿瘤细胞(CTC)水平与骨髓高风险基因组改变及肿瘤负荷的关联 | 首次在单克隆水平上证明CTC与配对骨髓细胞转录相似,并发现高CTC水平患者骨髓细胞增殖增加和基因组事件不平衡,同时开发了预测遗传改变和肿瘤负荷对CTC水平影响的模型 | 研究主要基于新诊断多发性骨髓瘤患者,可能不适用于复发或难治性病例,且样本量有限,需进一步验证 | 探究CTC水平与骨髓高风险基因组改变及肿瘤负荷之间的机制关联 | 新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学, 全基因组测序, 全外显子测序, 批量RNA测序 | 预测模型 | 转录组数据, 基因组数据 | 来自新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本,并利用Multiple Myeloma Research Foundation CoMMpass数据集及内部数据集进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组测序, 全外显子测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4137 | 2026-04-07 |
Single-cell RNA Sequencing Identifies Prognostic Biomarkers in Extramedullary Multiple Myeloma
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了与多发性骨髓瘤髓外进展相关的预后生物标志物 | 利用单细胞RNA测序数据结合LASSO方法开发了一个基于七个特征基因的风险评分模型,并揭示了CD4+ T细胞在多发性骨髓瘤进展中的关键作用 | 研究依赖于公共数据库的数据,未进行独立的前瞻性验证,且样本来源和临床信息可能有限 | 探究多发性骨髓瘤髓外进展的克隆进化特征,识别新的预后生物标志物 | 多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4138 | 2026-04-07 |
Functional characterization of a human epilepsy-associated gene network reveals metabolic regulation as a critical factor underlying seizure susceptibilities
2026-01-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052307
PMID:40401642
|
研究论文 | 本研究利用果蝇全脑单细胞RNA测序技术,验证并表征了一个人类癫痫相关基因共表达网络,揭示了代谢调控在癫痫易感性中的关键作用 | 首次结合果蝇单细胞表达数据和行为学分析,验证人类癫痫基因网络,并发现AMPK介导的代谢通路作为癫痫易感性的新调控机制 | 研究基于果蝇模型,结果向人类直接转化需进一步验证;样本规模相对有限 | 揭示癫痫的分子机制,特别是代谢调控在癫痫易感性中的作用 | 人类癫痫相关基因网络及其在果蝇中的同源基因 | 单细胞测序 | 癫痫 | 单细胞RNA测序 | 基因敲低模型 | RNA测序数据 | 涉及26个基因的果蝇全脑单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4139 | 2026-04-07 |
ANGPTL3 in Podocytes Contributes to the Pathogenesis of Lupus Nephritis by Activating MSR1 in Macrophages
2026 Jan-Dec, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000550803
PMID:41883862
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研究论文 | 本研究揭示了ANGPTL3在足细胞中通过激活巨噬细胞上的MSR1受体,驱动狼疮肾炎中干扰素偏向性炎症的关键机制 | 首次鉴定出ANGPTL3作为MSR1的配体,并揭示了其在狼疮肾炎中连接足细胞损伤与巨噬细胞驱动的炎症的新信号轴 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且未深入探讨ANGPTL3-MSR1轴在其他肾脏疾病中的普适性 | 探究ANGPTL3在足细胞中是否通过激活巨噬细胞的MSR1受体,驱动狼疮肾炎的干扰素偏向性炎症 | 狼疮肾炎的足细胞与巨噬细胞相互作用 | NA | 狼疮肾炎 | 分泌组蛋白-蛋白相互作用筛选、共免疫沉淀、RNA测序、siRNA沉默、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞RNA-seq数据 | 使用pristane诱导的狼疮小鼠模型、人类LN肾脏标本及Nephroseq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4140 | 2026-04-07 |
Identification and Validation of a Novel Theranostic Target in Triple Negative Breast Cancer with Transcriptomics and Protein Analyses
2026, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S568001
PMID:41884418
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质分析,识别并验证了三阴性乳腺癌中潜在的治疗靶点LY6E | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质验证,在三阴性乳腺癌中识别出LY6E作为新型治疗靶点 | 研究样本量有限,且主要基于体外细胞系和异种移植模型,需要进一步临床验证 | 识别三阴性乳腺癌的潜在治疗靶点,以改善其成像和治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者样本、正常乳腺组织、TNBC细胞系及小鼠异种移植肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质印迹分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据 | 8名TNBC患者和11名正常患者的单细胞RNA测序数据,TCGA队列中162个TNBC和113个正常乳腺组织的批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |