单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4121	2025-02-11	CD34+ cell atlas of main organs implicates its impact on fibrosis 2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04606-6 PMID:36315271	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析和遗传谱系追踪小鼠模型，研究了CD34+细胞在生理和病理条件下的异质性及其在血管生成和器官纤维化中的作用	揭示了CD34+细胞在血管生成和器官纤维化中的双重作用，特别是表达Pi16的CD34+细胞可能转化为肌成纤维细胞并参与器官纤维化	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨CD34+细胞在生理和病理条件下的身份和作用，特别是其在血管生成和器官纤维化中的角色	CD34+细胞	单细胞RNA测序	心血管疾病	单细胞RNA测序，遗传谱系追踪	遗传谱系追踪小鼠模型	单细胞RNA测序数据	NA
4122	2025-02-11	Integrative insights and clinical applications of single-cell sequencing in cancer immunotherapy 2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04608-4 PMID:36316529	综述	本文综述了单细胞测序在癌症免疫治疗中的进展和应用	单细胞测序提供了单细胞水平的多维度细胞特征，揭示了肿瘤微环境的复杂性、肿瘤异质性的普遍性、细胞组成和细胞间相互作用、细胞谱系追踪以及肿瘤耐药机制	单细胞技术的临床转化尚未深入，特别是在免疫治疗中的应用	提高免疫治疗疗效，推动精准医学发展	癌症患者	数字病理	癌症	单细胞测序	NA	基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组和多组学数据	NA
4123	2025-02-10	Hypoxia regulates small extracellular vesicle biogenesis and cargo sorting through HIF-1α/HRS signaling pathway in head and neck squamous cell carcinoma 2025-Mar, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111546 PMID:39631619	研究论文	本研究探讨了缺氧条件下头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞中小细胞外囊泡（sEVs）的生物生成和货物分选的机制	揭示了缺氧通过HIF-1α/HRS信号通路调控sEVs生物生成和货物分选的新机制	研究主要集中于HNSCC细胞，未涉及其他类型癌症细胞	研究缺氧对头颈部鳞状细胞癌中小细胞外囊泡生物生成和货物分选的影响	头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞	细胞生物学	头颈部鳞状细胞癌	空间转录组学和免疫组织化学	NA	细胞实验数据	NA
4124	2025-02-10	Decoding the blueprints of embryo development with single-cell and spatial omics 2025-Mar, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.semcdb.2025.01.002 PMID:39889540	综述	本文深入探讨了单细胞和空间组学技术在胚胎发育研究中的最新技术进展及其应用	提供了单细胞和空间多组学方法的最新进展，并系统整理了这些技术在胚胎发育领域的应用	未具体提及技术的局限性	探讨单细胞和空间组学技术在胚胎发育研究中的应用及其潜力	胚胎发育过程中的细胞分化和基因表达变化	生物信息学	NA	单细胞测序、空间转录组学	NA	转录组数据、多组学数据	NA
4125	2025-02-10	Large-Scale Production of Expandable Hepatoblast Organoids and Polarised Hepatocyte Organoids From hESCs Under 3D Static and Dynamic Suspension Conditions 2025-Feb-08, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.70001 PMID:39921573	研究论文	本研究开发了一种新的培养系统，能够在3D悬浮条件下从人类胚胎干细胞（hESCs）大规模生成可扩展的肝母细胞类器官（HB-orgs）和成熟的极化肝细胞类器官（P-hep-orgs）	利用低浓度Matrigel支持的3D悬浮条件，首次实现了在培养皿和生物反应器中大规模生成可扩展的肝母细胞类器官和成熟的极化肝细胞类器官	研究中未提及长期培养的稳定性和功能维持情况	开发一种成本效益高且稳健的平台，用于大规模生产功能性hESC衍生的肝细胞，以用于细胞治疗、疾病建模、药理学和毒理学研究	人类胚胎干细胞（hESCs）	细胞生物学	NA	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	NA
4126	2025-02-10	ICOSL, OX40L, and CD30L Control Persistence of Asthmatic CD4 Trm cells 2025-Feb-05, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1097 PMID:39921040	研究论文	本文研究了控制哮喘CD4 Trm细胞持久性的共刺激分子，并探讨了它们的靶向治疗对哮喘相关记忆T细胞群体寿命的影响	通过单细胞RNA测序技术，识别了ICOSL、OX40L和CD30L在哮喘患者和小鼠模型中的表达，并展示了联合抑制这些分子对减少肺部炎症和记忆T细胞积累的有效性	研究主要基于小鼠模型，人类样本的研究结果需要进一步验证	探索控制过敏原诱导的记忆CD4 T细胞再激活的共刺激分子，并评估其靶向治疗对哮喘相关记忆T细胞群体寿命的影响	人类和小鼠的哮喘肺CD4 T细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	人类和小鼠的哮喘肺CD4 T细胞样本
4127	2025-02-10	Identification of potential immunologic resilience in the healing process of diabetic foot ulcers 2024-Mar, International wound journal IF:2.6Q1 DOI:10.1111/iwj.14465 PMID:37926487	研究论文	本研究通过生物信息学工具和单细胞RNA测序技术，分析了糖尿病足溃疡（DFU）患者的基因表达数据，揭示了CD8 T细胞在DFU愈合过程中的重要作用	首次通过单细胞RNA测序技术识别了DFU中不同细胞群体的分布，并验证了CD8 T细胞及其相关关键基因在DFU愈合过程中的作用	研究主要依赖于公共数据库的基因表达数据，样本来源和数量可能有限	探讨糖尿病足溃疡的发病机制及治疗新视角	糖尿病足溃疡患者	生物信息学	糖尿病	单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术	NA	基因表达数据	NA
4128	2025-02-09	Immune mechanisms in multiple sclerosis: CD3 levels on CD28+ CD4+ T cells link antibody responses to human herpesvirus 6 2025-Mar, Cytokine IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.cyto.2025.156866 PMID:39884183	研究论文	本研究通过孟德尔随机化分析探讨了抗体介导的免疫反应与多发性硬化症（MS）之间的联系，并揭示了CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变人类疱疹病毒6（HHV-6）的比例对MS进展的影响	揭示了CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变HHV-6比例对MS进展的影响，为HHV-6介导的MS生物学机制提供了新的见解	抗体介导的免疫反应与MS之间的确切因果关系仍不明确	探讨抗体介导的免疫反应与多发性硬化症（MS）之间的关联，并识别可能参与MS发病和进展的特定感染病原体	多发性硬化症（MS）患者和对照组	免疫学	多发性硬化症	单细胞测序，孟德尔随机化分析	NA	基因表达数据	MS患者和对照组
4129	2025-02-09	Characterization of T-bet expressing B cells in lupus patients indicates a putative prognostic and therapeutic value of these cells for the disease 2025-Feb-07, Clinical and experimental immunology IF:3.4Q3 DOI:10.1093/cei/uxaf008 PMID:39918986	研究论文	本文研究了T-bet+ B细胞在系统性红斑狼疮（SLE）患者中的预后和治疗价值	首次提出T-bet+ B细胞可作为SLE严重程度的预后生物标志物，并可能成为新的治疗靶点	样本量较小，仅包括10名健康捐赠者和22名活动性SLE患者	探讨T-bet+ B细胞在系统性红斑狼疮中的预后和治疗潜力	系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康捐赠者的外周血样本	免疫学	系统性红斑狼疮	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	流式细胞数据、RNA测序数据	10名健康捐赠者和22名活动性SLE患者
4130	2025-02-09	Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity, gene expression profiles, and pathway dynamics in acne vulgaris 2025-Feb-07, Archives of dermatological research IF:1.8Q3 DOI:10.1007/s00403-025-03894-9 PMID:39920471	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术分析了痤疮患者的皮肤组织，揭示了细胞异质性、基因表达谱和代谢途径的动态变化	首次利用单细胞RNA测序技术全面解析痤疮病变皮肤的细胞异质性、基因表达差异及代谢途径变化，并识别了与痤疮相关的特定配体-受体对	样本量较小，仅包含六名痤疮患者的数据，可能限制了结果的普适性	探究痤疮的细胞和分子机制，为治疗策略提供新的见解	痤疮患者的皮肤组织	数字病理学	皮肤病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	六名痤疮患者的皮肤组织样本
4131	2025-02-09	Exploring molecular disparities of H-type vasculature endothelial cells in osteonecrosis of the femoral head through single-cell analysis 2025-Feb-06, BMC musculoskeletal disorders IF:2.2Q3 DOI:10.1186/s12891-024-08267-3 PMID:39910554	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探索了股骨头坏死和髋关节骨关节炎中H型血管内皮细胞的分子差异	首次在单细胞水平上揭示了H型血管内皮细胞在股骨头坏死中的分子变化及其与细胞死亡模式的关系	样本量较小，仅包括9个股骨头样本，可能影响结果的普遍性	探索股骨头坏死和髋关节骨关节炎中H型血管内皮细胞的分子差异	股骨头坏死和髋关节骨关节炎患者的H型血管内皮细胞	数字病理学	股骨头坏死	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	9个股骨头样本（3个髋关节骨关节炎，3个股骨头坏死3A期，3个股骨头坏死4期）
4132	2025-02-09	Identification of mitochondrial carrier homolog 2 as an important therapeutic target of castration-resistant prostate cancer 2025-Feb-05, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07406-5 PMID:39910035	研究论文	本文研究了线粒体载体同源物2（MTCH2）在去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中的表达及其潜在功能	揭示了MTCH2在CRPC中的关键作用，并通过基因沉默和敲除实验验证了其对线粒体功能和肿瘤进展的影响	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探索MTCH2在CRPC中的功能及其作为治疗靶点的潜力	去势抵抗性前列腺癌（CRPC）细胞和小鼠模型	癌症研究	前列腺癌	CRISPR-sgRNA敲除、shRNA基因沉默、单细胞测序	NA	基因表达数据、细胞实验数据、动物实验数据	多种原发性人类CRPC细胞和小鼠模型
4133	2025-02-09	CoTF-reg reveals cooperative transcription factors in oligodendrocyte gene regulation using single-cell multi-omics 2025-Feb-05, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-07570-6 PMID:39910206	研究论文	本文介绍了一种名为coTF-reg的分析框架，用于识别在少突胶质细胞中协同调控目标基因的转录因子	coTF-reg框架整合了单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，通过深度学习模型预测目标基因表达，并揭示了协同转录因子对之间的高相互作用	尽管模型在预测性能上表现稳定，但仍需进一步实验验证以确认更多协同转录因子对	研究少突胶质细胞中转录因子协同调控基因的机制	少突胶质细胞	生物信息学	NA	scRNA-seq, scATAC-seq, ChIP-seq	深度学习模型	单细胞RNA测序数据, 单细胞ATAC测序数据	NA
4134	2025-02-09	Single-cell RNA sequencing reveals tumor heterogeneity in small cell neuroendocrine cervical carcinoma 2025-Feb-05, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-07605-y PMID:39910262	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了小细胞神经内分泌宫颈癌（SCNECC）的肿瘤异质性	首次绘制了SCNECC的单细胞图谱，揭示了恶性上皮细胞的神经内分泌分化和角化减少，并定义了分子亚型及其致癌途径	样本量较小，仅包括6个样本，可能限制了结果的普遍性	研究SCNECC的肿瘤异质性，以提供精准治疗和预后预测的线索	小细胞神经内分泌宫颈癌（SCNECC）的癌细胞和正常宫颈组织	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	6个样本（包括SCNECC癌灶和正常宫颈组织），共68,455个高质量细胞
4135	2025-02-09	Transcriptional regulatory network analysis identifies GRN as a key regulator bridging chemotherapy and immunotherapy response in small cell lung cancer 2025-Feb-05, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1 DOI:10.1186/s13045-025-01667-5 PMID:39910394	研究论文	本研究通过构建小细胞肺癌（SCLC）的调控网络，识别出GRN作为化疗和免疫治疗反应的关键调节因子	首次将GRN识别为SCLC化疗和免疫治疗反应的关键调节因子，并揭示了其在肿瘤相关巨噬细胞中的高表达与免疫治疗抵抗的关联	研究主要基于基因组学和单细胞RNA测序数据，缺乏临床前模型的验证	探索小细胞肺癌对化疗和免疫治疗抵抗的机制	小细胞肺癌（SCLC）患者及其肿瘤样本	基因组学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因组数据、单细胞RNA测序数据	未明确说明样本数量，但涉及SCLC患者及其肿瘤样本
4136	2025-02-09	IL-23 Promotes γδT Cell Activity in Dry Eye Disease Progression 2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.66.2.10 PMID:39903182	研究论文	本研究探讨了结膜IL-23表达在介导γδT细胞生成中的作用及其对干眼病炎症反应的贡献	首次揭示了IL-23在干眼病中通过促进γδT细胞活性来诱导炎症反应的机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步扩展	研究IL-23在干眼病炎症反应中的作用及其机制	小鼠和人类γδT细胞	免疫学	干眼病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、转录组测序	NA	RNA测序数据、流式细胞数据	小鼠模型和人类干眼病患者样本
4137	2025-02-09	Massively parallel flow-cytometry-based screening of hematopoietic lineage cell populations from up to 25 donors simultaneously 2025-Feb, Methods (San Diego, Calif.) DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.014 PMID:39608688	研究论文	本研究旨在开发一种方法，允许对造血来源细胞表面标记进行高维度和技术统一的筛选	该方法能够在技术上统一的方式下筛选数百万细胞上的数百个标记，从而识别和表征稀有细胞群体的变化	虽然该方法能够处理大量细胞，但对于极低丰度的细胞群体，仍可能遗漏某些调控异常	开发一种高维度且技术统一的细胞表面标记筛选方法，以识别和表征稀有细胞群体的变化	造血来源的细胞群体	生物信息学	NA	流式细胞术、单细胞RNA测序（RNAseq）	机器学习算法	细胞表面标记数据	25个供体的细胞样本
4138	2025-02-09	An analysis of single-cell data reveals therapeutic effects of AMG487 in experimental autoimmune uveitis 2025-Feb, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2024.116671 PMID:39615601	研究论文	本文通过单细胞测序技术分析了AMG487在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的治疗效果及其机制	首次使用单细胞测序技术全面分析了AMG487对免疫细胞的转录组影响，揭示了其在调节免疫细胞比例和功能中的作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探讨AMG487在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗效果及其作用机制	实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及Vogt-Koyanagi-Harada患者的免疫细胞	数字病理学	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞ATAC测序、RNA测序、流式细胞术	NA	单细胞转录组数据	实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及Vogt-Koyanagi-Harada患者的免疫细胞样本
4139	2025-02-09	CMAP prediction and experimental validation of Forskolin as a podocyte protective and anti-proteinuric drug for nephrotoxic serum-treated mice 2025-Feb, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2024.116727 PMID:39716644	研究论文	本文通过结合肾脏单细胞RNA-seq数据库和Connectivity Map数据库（CMAP），预测并验证了Forskolin作为一种足细胞保护和抗蛋白尿药物在肾毒性血清（NTS）处理小鼠中的效果	首次结合单细胞RNA-seq和CMAP数据库预测特定足细胞损伤的药物，并验证了Forskolin的保护作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中进行验证	探索针对特定足细胞损伤的药物预测和验证方法	NTS处理的小鼠和培养的足细胞	数字病理学	肾脏疾病	单细胞RNA-seq, CMAP分析	NA	RNA-seq数据	NTS处理的小鼠和培养的足细胞
4140	2025-02-09	Single-Cell Sequencing Reveals Heterogeneity and Interactions Between Epithelial Cells and Fibroblasts in Post-ESD Oesophageal Stricture 2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70411 PMID:39910700	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了食管狭窄组织中的细胞异质性和上皮细胞与成纤维细胞之间的相互作用	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了食管狭窄组织中细胞组成的变化，特别是上皮细胞、内皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞的变化，并发现了DFSC_2细胞的增加及其在上皮重塑中的作用	研究样本量有限，且仅关注了术后食管狭窄组织，未涉及其他类型的食管疾病	研究食管狭窄的发病机制，特别是组织微环境的变化，以寻找潜在的治疗靶点	食管狭窄组织和正常对照组织	数字病理学	食管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	食管狭窄样本和正常对照样本