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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4121 | 2025-10-06 |
Kidney organoids demonstrate that PTH1R drives a cystogenic cAMP-pPKA-pCREB axis in developmental polycystic kidney disease
2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00056.2025
PMID:40602764
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研究论文 | 本研究利用肾脏类器官揭示了PTH1R在发育性多囊肾病中驱动囊肿形成的cAMP-pPKA-pCREB信号轴 | 首次发现甲状旁腺激素1受体(PTH1R)作为G蛋白偶联受体在发育性多囊肾病中启动囊肿形成信号级联反应 | 研究主要基于体外类器官模型,缺乏体内验证 | 探索发育性多囊肾病的囊肿形成机制并寻找潜在治疗靶点 | 人类诱导多能干细胞衍生的ARPKD类器官、等基因野生型类器官、人类ARPKD组织 | 发育生物学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序、靶向机制研究 | 肾脏类器官模型 | 基因表达数据、组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4122 | 2025-10-06 |
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveal PAK kinase as a therapeutic target in fibroblastic foci and dense fibrosis of IPF
2025-Jul-17, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00022-2025
PMID:40675771
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了PAK激酶在特发性肺纤维化纤维化病灶和致密纤维化中的治疗靶点作用 | 首次发现++肌成纤维细胞群体在纤维化病灶和致密纤维化区域富集,并证实PAK2在这些纤维化区域激活,PAK抑制剂能显著抑制纤维化进程 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 阐明特发性肺纤维化中纤维化病灶和致密纤维化的细胞异质性及治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者肺组织和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 空间转录组学,单细胞测序 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
4123 | 2025-10-06 |
The impact of neddylation on prognosis in the immune microenvironment of neuroblastoma: a single-cell transcriptomic analysis
2025-Jul-17, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09662-1
PMID:40676385
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析建立neddylation相关预后标志物,并评估其在神经母细胞瘤免疫微环境中的临床意义 | 首次在神经母细胞瘤中构建neddylation相关预后标志物,并通过单细胞分辨率揭示不同细胞类型的neddylation特征 | NA | 建立neddylation相关预后标志物并评估其在神经母细胞瘤中的临床应用价值 | 神经母细胞瘤患者 | 数字病理 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 单样本基因集富集分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 171,992个细胞分为19个细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4124 | 2025-10-06 |
Research advances in intramuscular fat deposition and chicken meat quality: genetics and nutrition
2025-Jul-16, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01234-5
PMID:40665461
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综述 | 本文综述了过去十年间遗传学和营养学调控鸡肉质性状的研究进展,重点关注肌内脂肪沉积机制 | 单细胞RNA测序揭示肌细胞是鸡肌内脂肪新生合成的主要场所;首次发现LncHLFF通过外泌体机制促进异位肌内脂肪沉积;发现miR-27b-3p和miR-128-3p通过靶向PPARG抑制脂肪生成;营养基因组学研究显示果糖通过激活ChREBP增强肌内脂肪沉积 | NA | 改善肉鸡肉质性状,同时保证生长性能 | 肉鸡 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4125 | 2025-10-06 |
Genomic and Single-Cell Analyses Characterize Patient-Derived Tumor Organoids to Enable Personalized Therapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2850
PMID:40261963
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研究论文 | 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官,分析其基因组特征和药物敏感性,为个性化治疗提供依据 | 首次系统建立头颈部鳞癌患者来源类器官模型,发现混合上皮-间质转化状态与顺铂耐药相关,并鉴定amphiregulin作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(31例患者),需要更大规模验证 | 开发头颈部鳞癌个性化治疗模型并探索治疗耐药机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 药物敏感性测试 | 患者来源肿瘤类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 病理图像 | 31例头颈部鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4126 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Advances the Use of Canine Patients in Cancer Research: Analysis of Osteosarcoma-Bearing Pet Dogs Enrolled in a Clinical Trial
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0687
PMID:40392977
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研究论文 | 本研究首次将GeoMx犬类癌症图谱应用于骨肉瘤临床试验犬患者的预后相关样本分析 | 首次在犬类骨肉瘤临床试验样本中应用空间转录组学技术,验证犬类模型在人类癌症研究中的价值 | 样本量较小(n=16),仅分析了疾病无进展间隔的极端分组 | 探索犬类骨肉瘤模型中基因表达与疾病预后的关联 | 宠物犬原发性骨肉瘤组织样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 16例犬骨肉瘤样本(高DFI组8例,低DFI组8例) | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx犬类癌症图谱 |
4127 | 2025-10-06 |
Disruption of cell-intrinsic PCSK9 enhances the antitumor efficacy of CD8+ T cells
2025-Jul-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011657
PMID:40664445
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研究论文 | 本研究揭示了免疫细胞内在PCSK9对CD8+ T细胞抗肿瘤功能的抑制作用及其作为癌症免疫治疗新靶点的潜力 | 首次发现CD8+ T细胞自身表达的PCSK9会抑制其抗肿瘤功能,敲除PCSK9可增强CD8+ T细胞和CAR-T细胞的肿瘤杀伤能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的转化效果需要进一步验证 | 探究免疫细胞内在PCSK9在肿瘤控制中的作用机制 | 胰腺癌和黑色素瘤小鼠模型、CD8+ T细胞、CAR-T细胞 | 免疫肿瘤学 | 胰腺癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | Pcsk9缺陷小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4128 | 2025-10-06 |
High-resolution mapping of single cells in spatial context
2025-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61667-4
PMID:40664667
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研究论文 | 开发了一种名为CMAP的方法,通过整合单细胞和空间数据实现大规模单个细胞到精确空间位置的映射 | 采用分治策略整合单细胞和空间数据,有效处理两种数据间的不一致性,实现完整单细胞分辨率 | NA | 解决空间转录组技术中基因恢复不足和难以实现完整单细胞分辨率的问题 | 组织微环境中的细胞 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学,单细胞测序 | 分治策略 | 单细胞数据,空间数据 | 模拟和真实数据集 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
4129 | 2025-10-06 |
Exploring the mechanism of metabolic cell death-related genes AKR1C2 and MAP1LC3A as biomarkers in Parkinson's disease
2025-Jul-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11481-1
PMID:40664780
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研究论文 | 本研究通过整合帕金森病相关差异表达基因和代谢性细胞死亡相关基因,鉴定AKR1C2和MAP1LC3A作为帕金森病的潜在生物标志物 | 首次系统分析代谢性细胞死亡相关基因在帕金森病中的作用,并鉴定出AKR1C2和MAP1LC3A作为新型生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索代谢性细胞死亡相关基因在帕金森病发病机制中的作用 | 帕金森病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 蛋白质相互作用网络分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | GSE7621数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
4130 | 2025-10-06 |
A novel cancer-associated membrane signature predicts prognosis and therapeutic response for lung adenocarcinoma
2025-Jul-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11105-8
PMID:40664871
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组数据开发了基于膜蛋白的肺腺癌预后预测模型LCaMPS | 首次在单细胞和空间分辨率水平系统识别肺腺癌特异性膜蛋白并构建预后模型 | 需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发肺腺癌预后预测和治疗指导的生物标志物 | 肺腺癌患者队列 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | 预后预测模型 | RNA测序数据,蛋白质表达数据 | 多个肺腺癌队列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
4131 | 2025-10-06 |
Deciphering cancer therapy resistance via patient-level single-cell transcriptomics with CellResDB
2025-Jul-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08457-2
PMID:40664938
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研究论文 | 介绍了一个用于研究癌症治疗耐药性的患者水平单细胞转录组数据库CellResDB | 开发了首个整合患者水平单细胞转录组数据和临床注释的癌症治疗耐药性数据库,并包含智能机器人辅助数据检索 | NA | 系统研究癌症治疗耐药性的潜在机制 | 肿瘤微环境中的细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 单细胞转录组数据 | 1391个患者样本,约470万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4132 | 2025-10-06 |
Unraveling the role of gut microbiota on the formation of nephrolithiasis: insights from integrated analysis of GWAS, single-cell transcriptomics, bulk RNA sequencing and network Pharmacology
2025-Jul-15, Urolithiasis
IF:2.0Q2
DOI:10.1007/s00240-025-01809-x
PMID:40664942
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研究论文 | 通过整合GWAS、单细胞转录组学、bulk RNA测序和网络药理学分析,探索肠道微生物群在肾结石形成中的分子机制 | 首次通过多组学整合分析鉴定出与肾结石相关的关键基因PALLD和R3HDM1,并发现成纤维细胞和血管平滑肌细胞/周细胞是关键的细胞类型 | 研究数据来源于公共数据库,缺乏实验验证 | 探索肠道微生物群在肾结石形成中的分子机制 | 肾结石患者和肠道微生物群 | 生物信息学 | 肾结石 | GWAS, 单细胞转录组测序, bulk RNA测序, 网络药理学, 分子对接 | 孟德尔随机化, 差异表达分析, 富集分析 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个公共数据集(ukb-b-18372, GSE73680, GSE117518, GSE231569) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, GWAS | NA | NA |
4133 | 2025-10-06 |
In silico analysis of the oncogenic role of myoferlin (MYOF) and suggestion of folate as a potential therapeutic for brain cancer in the Caucasian population
2025-Jul-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03091-0
PMID:40665025
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研究论文 | 通过生物信息学分析探讨肌铁蛋白(MYOF)在脑癌中的致癌作用并提出叶酸作为潜在治疗方法 | 首次通过计算药物发现和空间转录组学结合生成式人工智能实验,研究叶酸在MYOF敲低中的治疗潜力 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索MYOF在脑癌发生发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肌铁蛋白(MYOF)基因及其在脑癌中的作用机制 | 生物信息学 | 脑癌 | 生物信息学分析, 计算药物发现, 空间转录组学, 生成式人工智能 | 生成式人工智能 | 基因表达数据, 突变数据, 通路数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4134 | 2025-10-06 |
Role of PRC2 in the stochastic expression of Aire target genes and development of mimetic cells in the thymus
2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20240817
PMID:40244172
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学方法揭示了PRC2在Aire靶基因随机表达和胸腺模拟细胞发育中的关键作用 | 首次发现PRC2通过染色质抑制为Aire实现随机基因表达提供先决条件,并独立于Aire调控模拟细胞的发育 | 研究聚焦于胸腺上皮细胞,未涉及其他免疫细胞类型 | 阐明Aire靶基因的表达调控机制及其在胸腺中枢耐受中的作用 | 髓质胸腺上皮细胞(mTECs) | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞多组学分析,深度单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
4135 | 2025-10-06 |
Myeloma cell-intrinsic ANXA1 elevation and T cell dysfunction contribute to BCMA-negative relapse after CAR-T therapy
2025-Jul-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.03.001
PMID:40057828
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了骨髓瘤细胞内在ANXA1升高和T细胞功能障碍导致BCMA阴性复发的新机制 | 首次在单细胞水平发现BCMA阴性骨髓瘤细胞高表达ANXA1,并证实ANXA1通过激活AMPKα信号通路促进肿瘤生长和削弱CAR-T细胞功能 | 研究样本量有限,主要基于单个病例的深入分析,需要更大规模研究验证 | 探究多发性骨髓瘤在接受BCMA CAR-T细胞治疗后出现BCMA阴性复发的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者、骨髓瘤细胞系、CAR-T细胞 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例CAR-T治疗后复发患者及未接受CAR-T治疗的MM患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4136 | 2025-10-06 |
Targeting IGF1-Induced Cellular Senescence to Rejuvenate Hair Follicle Aging
2025-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70053
PMID:40159808
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研究论文 | 本研究揭示了IGF-1信号通路通过诱导毛囊干细胞衰老调控毛发老化的机制,并提出了针对性的干预策略 | 首次发现皮肤中IGF-1水平随年龄显著增加,并通过转基因模型证实过量IGF-1会触发毛囊干细胞衰老,同时验证了多种干预策略的有效性 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需要进一步验证;干预策略的长期效果和安全性需进一步评估 | 探究IGF-1信号通路在毛囊老化过程中的作用机制及潜在治疗策略 | 小鼠模型(包括转基因小鼠)和人类皮肤样本 | 细胞生物学 | 毛发老化 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4137 | 2025-10-06 |
Pyrroloquinoline Quinone Reprograms the Single-Cell Landscape of Immune Aging in Hematopoietic Immune System
2025-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70050
PMID:40192736
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了吡咯喹啉醌在重编程造血免疫系统衰老单细胞景观中的作用 | 首次在单细胞水平系统阐明PQQ通过调控ASPP1、Yy1和CD62L等关键分子靶点逆转免疫衰老的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探究PQQ对造血免疫系统衰老的调控作用及分子机制 | 小鼠脾脏和骨髓免疫细胞 | 单细胞生物学 | 免疫衰老 | 单细胞RNA测序 | 机器学习程序 | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4138 | 2025-10-06 |
Deciphering Immunosenescence From Child to Frailty: Transcriptional Changes, Inflammation Dynamics, and Adaptive Immune Alterations
2025-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70082
PMID:40285422
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研究论文 | 通过整合分析儿童至衰弱老年人的PBMC转录组数据,揭示免疫衰老的复杂动态变化 | 首次结合bulk-cell和单细胞RNA-seq数据,系统描绘从儿童到衰弱老年人全年龄段的免疫衰老轨迹 | 样本年龄跨度大但具体样本数量未明确说明,缺乏功能验证实验 | 研究年龄相关的免疫系统变化,特别是免疫衰老过程 | 外周血单个核细胞(PBMCs),涵盖从儿童到衰弱老年人的不同年龄段人群 | 生物信息学 | 老年疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从儿童到衰弱老年人的PBMC样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4139 | 2025-10-06 |
C-COUNT: a convolutional neural network-based tool for automated scoring of erythroid colonies
2025-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104786
PMID:40287006
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研究论文 | 开发基于卷积神经网络的自动化红细胞集落计数工具C-COUNT | 首次将卷积神经网络应用于红细胞集落形成单位(CFU-e)检测的自动化评分 | 未明确说明模型在更广泛实验条件下的泛化能力 | 解决红细胞集落形成检测中人工计数耗时且易出错的问题 | 红细胞集落形成单位(CFU-e)集落 | 计算机视觉 | 血液疾病 | 自动显微镜成像 | CNN | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
4140 | 2025-10-06 |
Spatial Analysis Identifies CD147 as a Novel Marker of High-Grade Childhood Posterior Fossa Ependymoma
2025-Jul, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104175
PMID:40250710
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研究论文 | 通过空间表型分析发现CD147是儿童后颅窝高级别室管膜瘤的新型标志物 | 首次在儿童PFA-EPN中通过空间表型分析鉴定CD147作为高级别肿瘤的新型标志物,并揭示CD147+小胶质细胞在肿瘤进展中的关键作用 | 样本量较小(G2 n=5,G3 n=7),仅针对后颅窝A型室管膜瘤 | 研究儿童后颅窝室管膜瘤肿瘤微环境的空间异质性及其与肿瘤分级的关系 | 儿童后颅窝A型室管膜瘤(WHO 2级和3级)肿瘤样本 | 数字病理学 | 室管膜瘤 | 多重免疫荧光,单细胞RNA测序 | 空间表型分析 | 图像,基因表达数据 | 12例肿瘤样本(5例G2,7例G3) | NA | 空间表型分析,单细胞RNA测序 | NA | NA |