单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4121 - 4140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4121 | 2025-10-06 |
Characterizing spatial gene expression heterogeneity in spatially resolved single-cell transcriptomic data with nonuniform cellular densities
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271288.120
PMID:34035045
|
研究论文 | 开发了一种名为MERINGUE的计算框架，用于分析空间分辨单细胞转录组数据中的空间基因表达异质性 | 首个能够考虑组织内细胞类型固有3D空间组织和非均匀细胞密度的可扩展计算方法 | NA | 识别空间异质性表达基因、推断细胞间通讯、进行空间感知的细胞聚类 | 空间分辨转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间自相关和互相关分析 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,多重误差稳健荧光原位杂交,Slide-seq,原位杂交 | MERFISH,空间转录组学,Slide-seq,ISH | NA |
| 4122 | 2025-10-06 |
Combinatorial transcription factor profiles predict mature and functional human islet α and β cells
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151621
PMID:34428183
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胰岛α和β细胞中转录因子组合表达模式，预测高功能成熟细胞亚群 | 首次基于组合转录因子表达谱对人类胰岛细胞进行分层，发现ARX/MAFB（α细胞）和MAFA/MAFB（β细胞）共表达亚群具有更强的葡萄糖感知和激素分泌功能 | 研究仅限于正常人类胰岛细胞，未涉及糖尿病病理状态下的变化 | 定义胰岛细胞中转录因子异质性及其对细胞功能的影响 | 人类胰岛α和β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, Patch-Seq | NA | 单细胞转录组数据, 电生理数据 | 超过40,000个正常人类胰岛细胞，来自多个供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4123 | 2025-10-06 |
The Distinct Immune Nature of the Fetal Inflammatory Response Syndrome Type I and Type II
2021-09-14, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2100047
PMID:34521696
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序分析揭示了胎儿炎症反应综合征I型和II型在免疫机制上的本质差异 | 首次系统阐明FIRS I型和II型在分子水平上的免疫特征差异，发现I型主要由先天免疫驱动，II型则类似于半同种异体移植排斥反应 | 样本量有限且为早产儿，产后诊断困难可能影响样本准确性 | 探究胎儿炎症反应综合征I型和II型的分子基础和免疫机制差异 | 诊断为FIRS I型或II型的早产儿脐带血样本 | 生物医学 | 胎儿炎症反应综合征 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 早产儿脐带血样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4124 | 2025-10-06 |
LDHA is enriched in human islet alpha cells and upregulated in type 2 diabetes
2021-09-03, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2021.06.065
PMID:34217973
|
研究论文 | 本研究揭示了乳酸脱氢酶A亚型在人类胰岛α细胞中的特异性表达及其在2型糖尿病中的上调现象 | 首次系统证实LDHA主要定位于人类胰岛α细胞而非β细胞，并在2型糖尿病条件下发生特异性上调 | 研究主要基于体外实验和病理样本观察，缺乏在体功能验证 | 探究LDHA在人类胰岛细胞中的表达特征及其在2型糖尿病病理过程中的作用 | 人类胰岛细胞（重点关注α细胞和β细胞）及2型糖尿病患者胰腺组织 | 细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫标记，显微镜分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据，代谢产物数据 | 公共单细胞RNA-seq数据库，慢性高糖处理的人类胰岛，2型糖尿病患者尸检胰腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4125 | 2025-10-06 |
Using single-nucleus RNA-sequencing to interrogate transcriptomic profiles of archived human pancreatic islets
2021-08-10, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00941-8
PMID:34376240
|
研究论文 | 本研究使用单核RNA测序技术分析存档人类胰岛的转录组特征 | 首次将单核RNA测序应用于移植人类胰岛细胞的研究，并与传统单细胞RNA测序方法进行系统比较 | 未明确说明样本数量和研究规模 | 开发可靠的方法来研究移植人类胰岛细胞的转录组特征 | 人类胰岛细胞，包括新鲜、冷冻培养和移植到免疫缺陷动物体内的存档胰岛 | 单细胞组学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序，单细胞RNA测序 | Nuclei EZ | Nuclei EZ核制备协议 |
| 4126 | 2025-10-06 |
DIAPH1 Variants in Non-East Asian Patients With Sporadic Moyamoya Disease
2021-08-01, JAMA neurology
IF:20.4Q1
DOI:10.1001/jamaneurol.2021.1681
PMID:34125151
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序发现DIAPH1基因变异是非东亚人群散发性烟雾病的新型风险基因 | 首次在非东亚人群中发现DIAPH1基因作为烟雾病风险基因，揭示了血管细胞肌动蛋白重塑在疾病发病机制中的作用 | 样本量相对较小，发现队列仅24例先证者，验证队列84例先证者 | 评估超罕见新生变异和罕见有害遗传变异与烟雾病风险的关联 | 烟雾病患者及其父母（病例-父母三重样本） | 医学遗传学 | 烟雾病 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 发现队列24例先证者（22个三重样本和2个单样本），验证队列84例先证者（29个三重样本和55个单样本） | NA | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4127 | 2025-10-06 |
Transcriptional programs of neoantigen-specific TIL in anti-PD-1-treated lung cancers
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03752-4
PMID:34290408
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析抗PD-1治疗的非小细胞肺癌中新生抗原特异性T细胞的转录程序 | 首次利用T细胞受体作为条形码追踪分析肿瘤微环境中新生抗原特异性TIL的转录程序，揭示了其独特的组织驻留记忆特征和功能状态 | 样本量有限，仅针对非小细胞肺癌患者，需要更大规模验证 | 研究抗PD-1治疗中新生抗原特异性肿瘤浸润淋巴细胞的转录特征和功能状态 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据 | 抗PD-1治疗的非小细胞肺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4128 | 2025-10-06 |
New insights for precision treatment of glioblastoma from analysis of single-cell lncRNA expression
2021-Jul, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03584-9
PMID:33693962
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞lncRNA表达谱对胶质母细胞瘤进行重新分型，并提出新的精准治疗策略 | 首次将lncRNA作为分型标志物结合单细胞表达谱对胶质母细胞瘤进行重新分型，揭示了传统组织分型的局限性 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本量有限 | 基于单细胞lncRNA表达谱改进胶质母细胞瘤分子分型并开发精准治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者单细胞测序数据和TCGA数据库组织数据 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | t-SNE，Seurat无监督聚类 | 单细胞测序数据，基因表达数据 | GSE84465数据库单细胞数据，TCGA数据库组织数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4129 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies macrophage transcriptional heterogeneities in granulomatous diseases
2021-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03794-2020
PMID:33602861
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4130 | 2025-10-06 |
Systematic determination of the mitochondrial proportion in human and mice tissues for single-cell RNA-sequencing data quality control
2021-05-17, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa751
PMID:32840568
|
研究论文 | 系统分析人类和小鼠组织中线粒体比例，为单细胞RNA测序数据质量控制提供新参考值 | 首次系统评估跨物种、组织和细胞类型的线粒体比例阈值，提出针对不同组织的特异性参考值 | 分析基于公开数据库数据，未进行实验验证 | 改进单细胞RNA测序数据质量控制中线粒体比例阈值的准确性 | 人类和小鼠组织中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5,530,106个细胞，来自1349个注释数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4131 | 2025-10-06 |
Airspace Macrophages and Monocytes Exist in Transcriptionally Distinct Subsets in Healthy Adults
2021-04-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202005-1989OC
PMID:33079572
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示健康成人肺泡和气道中存在转录水平不同的巨噬细胞和单核细胞亚群 | 首次在健康人呼吸道中发现两个新的巨噬细胞亚群：促炎症基因表达谱和金属硫蛋白基因表达谱亚群 | 样本量较小（仅10名受试者），且仅针对健康成人 | 确定健康成人支气管肺泡灌洗液中人类细胞的转录异质性 | 健康成人的支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10名健康成人 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4132 | 2025-10-06 |
Single-cell immunophenotyping of the fetal immune response to maternal SARS-CoV-2 infection in late gestation
2021-Mar-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-311000/v1
PMID:33758834
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析母体SARS-CoV-2感染对晚期妊娠胎儿免疫系统的影响 | 首次在单细胞水平系统描述母体SARS-CoV-2感染引起的胎儿免疫表型变化，发现胎儿TCR受体库扩张等新现象 | 样本量有限，仅针对晚期妊娠感染病例，无法评估早期感染的影响 | 表征母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫反应的影响 | 第三孕期感染SARS-CoV-2母亲的新生儿脐带血单核细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 感染组与未感染对照组新生儿脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 4133 | 2025-10-06 |
GLP-1 receptor signaling increases PCSK1 and β cell features in human α cells
2021-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.141851
PMID:33554958
|
研究论文 | 本研究揭示了GLP-1受体激动剂通过β细胞GLP-1R依赖机制增强人α细胞中PCSK1表达和β细胞特征的分子通路 | 首次发现GLP-1介导的调节人α细胞功能的新通路，并应用新型单细胞RNA测序技术DART-Seq进行验证 | 研究机制尚未完全阐明，动物实验仅在小鼠中进行 | 探索α细胞中PC1/3表达激活机制，为糖尿病治疗寻找新靶点 | 人胰岛α细胞和小鼠模型 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 人胰岛样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | DART-Seq | 新型高灵敏度单细胞RNA测序技术 |
| 4134 | 2025-10-06 |
Transcriptional profiling of pediatric cholestatic livers identifies three distinct macrophage populations
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0244743
PMID:33411796
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析首次在儿童胆汁淤积性肝脏中鉴定出三种不同的巨噬细胞亚群 | 首次对人类儿童胆汁淤积性肝脏进行单细胞RNA测序，发现与健康肝脏巨噬细胞不同的三个新亚群 | 样本量较小(BA和ALGS各6例)，需要进一步分析不同病因胆汁淤积疾病中巨噬细胞亚群的异同 | 表征儿童胆汁淤积性肝病中巨噬细胞的转录谱特征 | 胆道闭锁(BA)、Alagille综合征(ALGS)和非胆汁淤积性儿童肝脏的肝免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 胆汁淤积性肝病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | BA患者6例, ALGS患者6例, 非胆汁淤积儿童肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4135 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of human islet ontogeny defines the molecular basis of β-cell dedifferentiation in T2D
2020-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.101057
PMID:32739450
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人类胰岛细胞发育成熟的分子程序以及2型糖尿病中β细胞去分化的分子基础 | 首次详细描绘了人类胰岛α和β细胞在个体发育过程中的成熟程序，并揭示了2型糖尿病中胰岛细胞转录组成熟度丧失的分子机制 | 研究样本量有限，未能确定β细胞去分化在2型糖尿病中的普遍程度和可塑性 | 阐明人类胰岛细胞发育成熟的分子程序以及2型糖尿病中β细胞去分化的分子基础 | 人类胰岛α细胞和β细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非糖尿病和2型糖尿病供体的胰岛组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4136 | 2025-10-06 |
Multimodal Mapping of the Tumor and Peripheral Blood Immune Landscape in Human Pancreatic Cancer
2020-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00121-4
PMID:34296197
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研究论文 | 通过多模态分析方法揭示人类胰腺癌中肿瘤和外周血的免疫景观特征 | 首次采用CyTOF、单细胞RNA测序和多重免疫组化相结合的多模态方法，系统解析胰腺癌免疫抑制微环境的细胞互作网络 | 样本量相对有限，需要在更大队列中验证发现的患者特异性免疫变化 | 阐明胰腺导管腺癌的免疫景观特征及其对免疫治疗的影响 | 胰腺癌患者肿瘤组织、匹配血液样本和非恶性组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | CyTOF, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 图像数据 | 患者肿瘤、匹配血液和非恶性样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 4137 | 2025-10-06 |
Analysis of Dual Class I Histone Deacetylase and Lysine Demethylase Inhibitor Domatinostat (4SC-202) on Growth and Cellular and Genomic Landscape of Atypical Teratoid/Rhabdoid
2020-Mar-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030756
PMID:32210076
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研究论文 | 研究表观遗传调节剂Domatinostat(4SC-202)对非典型畸胎样/横纹肌样瘤生长及细胞基因组景观的影响 | 首次探索双重I类组蛋白去乙酰化酶和赖氨酸去甲基化酶抑制剂Domatinostat在ATRT中的抗癌作用机制 | 目前仅为体外研究，缺乏体内实验验证 | 评估表观遗传药物对ATRT肿瘤生长的抑制作用及其机制 | 非典型畸胎样/横纹肌样瘤(ATRT)细胞系 | 癌症表观遗传学 | 非典型畸胎样/横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光,多组学富集分析 | 2D和3D支架细胞培养模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | ATRT-06细胞球状体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4138 | 2025-10-06 |
scGEAToolbox: a Matlab toolbox for single-cell RNA sequencing data analysis
2019-Nov-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz830
PMID:31697351
|
研究论文 | 开发了一个用于单细胞RNA测序数据分析的Matlab工具箱 | 提供了全面的单细胞RNA测序数据分析功能，包含图形用户界面，支持第三方工具集成 | 未在摘要中明确说明 | 开发单细胞RNA测序数据分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4139 | 2025-10-06 |
Evaluation of PANoptosis activation in irreversible pulpitis: An in vitro study based on human tissue samples
2025-Sep, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
|
研究论文 | 通过分析人牙髓组织样本，评估不可逆性牙髓炎中PANoptosis的激活状态 | 首次在牙髓炎中系统研究PANoptosis三种细胞死亡途径的激活情况及其在不同细胞类型中的分布 | 未检测到caspase-8和PYCARD的相互作用，且仅证实凋亡和焦亡的激活 | 研究牙髓炎中PANoptosome的激活机制 | 健康与炎症牙髓组织 | 生物信息学 | 牙髓疾病 | RNA-seq, qRT-PCR, 免疫印迹, 共免疫沉淀, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人类牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4140 | 2025-10-06 |
siHIF-1α-loaded micellar nanoparticles inhibit M1 macrophage activation to ameliorate chronic rhinosinusitis
2025-Sep, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究探讨了负载siHIF-1α的胶束纳米颗粒通过调控巨噬细胞极化和铁死亡改善慢性鼻窦炎的分子机制 | 首次揭示HIF-1α通过激活TFRC转录驱动M1巨噬细胞极化和铁死亡的新机制，并开发了基于纳米技术的siRNA递送系统用于CRS治疗 | 需要进一步验证长期安全性和临床转化潜力 | 研究纳米颗粒递送siHIF-1α对慢性鼻窦炎中巨噬细胞极化和铁死亡的调控作用 | 慢性鼻窦炎小鼠模型和Raw264.7巨噬细胞系 | 生物医学工程 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告实验, 流式细胞术, 动态光散射, 凝胶阻滞实验 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 组织病理数据 | GSE10406数据集和CRS小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat软件包进行单细胞RNA测序数据分析 |