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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4121 | 2025-10-06 |
Multimodal Mapping of the Tumor and Peripheral Blood Immune Landscape in Human Pancreatic Cancer
2020-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00121-4
PMID:34296197
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研究论文 | 通过多模态分析方法揭示人类胰腺癌中肿瘤和外周血的免疫景观特征 | 首次采用CyTOF、单细胞RNA测序和多重免疫组化相结合的多模态方法,系统解析胰腺癌免疫抑制微环境的细胞互作网络 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证发现的患者特异性免疫变化 | 阐明胰腺导管腺癌的免疫景观特征及其对免疫治疗的影响 | 胰腺癌患者肿瘤组织、匹配血液样本和非恶性组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | CyTOF, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 图像数据 | 患者肿瘤、匹配血液和非恶性样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
4122 | 2025-10-06 |
Analysis of Dual Class I Histone Deacetylase and Lysine Demethylase Inhibitor Domatinostat (4SC-202) on Growth and Cellular and Genomic Landscape of Atypical Teratoid/Rhabdoid
2020-Mar-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030756
PMID:32210076
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研究论文 | 研究表观遗传调节剂Domatinostat(4SC-202)对非典型畸胎样/横纹肌样瘤生长及细胞基因组景观的影响 | 首次探索双重I类组蛋白去乙酰化酶和赖氨酸去甲基化酶抑制剂Domatinostat在ATRT中的抗癌作用机制 | 目前仅为体外研究,缺乏体内实验验证 | 评估表观遗传药物对ATRT肿瘤生长的抑制作用及其机制 | 非典型畸胎样/横纹肌样瘤(ATRT)细胞系 | 癌症表观遗传学 | 非典型畸胎样/横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光,多组学富集分析 | 2D和3D支架细胞培养模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | ATRT-06细胞球状体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4123 | 2025-10-06 |
scGEAToolbox: a Matlab toolbox for single-cell RNA sequencing data analysis
2019-Nov-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz830
PMID:31697351
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研究论文 | 开发了一个用于单细胞RNA测序数据分析的Matlab工具箱 | 提供了全面的单细胞RNA测序数据分析功能,包含图形用户界面,支持第三方工具集成 | 未在摘要中明确说明 | 开发单细胞RNA测序数据分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4124 | 2025-10-06 |
Evaluation of PANoptosis activation in irreversible pulpitis: An in vitro study based on human tissue samples
2025-Sep, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 通过分析人牙髓组织样本,评估不可逆性牙髓炎中PANoptosis的激活状态 | 首次在牙髓炎中系统研究PANoptosis三种细胞死亡途径的激活情况及其在不同细胞类型中的分布 | 未检测到caspase-8和PYCARD的相互作用,且仅证实凋亡和焦亡的激活 | 研究牙髓炎中PANoptosome的激活机制 | 健康与炎症牙髓组织 | 生物信息学 | 牙髓疾病 | RNA-seq, qRT-PCR, 免疫印迹, 共免疫沉淀, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人类牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4125 | 2025-10-06 |
siHIF-1α-loaded micellar nanoparticles inhibit M1 macrophage activation to ameliorate chronic rhinosinusitis
2025-Sep, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究探讨了负载siHIF-1α的胶束纳米颗粒通过调控巨噬细胞极化和铁死亡改善慢性鼻窦炎的分子机制 | 首次揭示HIF-1α通过激活TFRC转录驱动M1巨噬细胞极化和铁死亡的新机制,并开发了基于纳米技术的siRNA递送系统用于CRS治疗 | 需要进一步验证长期安全性和临床转化潜力 | 研究纳米颗粒递送siHIF-1α对慢性鼻窦炎中巨噬细胞极化和铁死亡的调控作用 | 慢性鼻窦炎小鼠模型和Raw264.7巨噬细胞系 | 生物医学工程 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告实验, 流式细胞术, 动态光散射, 凝胶阻滞实验 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 组织病理数据 | GSE10406数据集和CRS小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat软件包进行单细胞RNA测序数据分析 |
4126 | 2025-10-06 |
Specificity protein 1 suppresses prohibitin 1 to induce macrophage M1 polarization and impair phagocytosis, exacerbating sepsis-associated acute lung injury
2025-Sep, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示了特异性蛋白1通过抑制抑制素1诱导巨噬细胞M1极化并削弱吞噬功能,从而加剧脓毒症相关急性肺损伤的分子机制 | 首次发现SP1/PHB1轴在调控巨噬细胞极化和功能中的关键作用,并阐明其通过炎症因子分泌、线粒体功能障碍和氧化应激介导脓毒症诱导的急性肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型,未来需要临床验证;靶向治疗策略尚未进行临床前评估 | 探究SP1/PHB1轴在脓毒症相关急性肺损伤中调控巨噬细胞极化和功能的分子机制 | CLP诱导的脓毒症小鼠模型和巨噬细胞 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 高通量测序, 机器学习算法, 免疫荧光, ELISA, RT-qPCR, Western blot | 机器学习算法 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高通量测序 | NA | NA |
4127 | 2025-10-06 |
Novel NLRP3 inhibitors mitigate acute radiation-induced lung injury by suppressing pyroptosis in alveolar epithelial cells
2025-Sep, Toxicology and applied pharmacology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.taap.2025.117458
PMID:40618790
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研究论文 | 本研究开发新型NLRP3抑制剂并通过抑制肺泡上皮细胞焦亡来减轻急性辐射性肺损伤 | 首次设计靶向NLRP3蛋白NACHT结构域的喹喔啉酮衍生物抑制剂,并证实其通过NLRP3/GSDMD通路特异性抑制肺泡2型细胞焦亡 | 研究主要聚焦早期辐射损伤阶段,长期疗效和安全性需进一步验证 | 开发针对辐射性肺损伤的新型治疗策略 | 肺泡上皮细胞(A549、MLE-12细胞系)和C57BL/6小鼠模型 | 分子药理学 | 辐射性肺损伤 | 单细胞测序、分子对接、高内涵筛选、Western blot、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、蛋白质印迹数据、组织病理图像 | 细胞系实验和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4128 | 2025-10-06 |
A multimorphic variant in ThPOK causes an inborn error of immunity with T cell defects and fibrosis
2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241174
PMID:40392549
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研究论文 | 首次报道由ThPOK基因变异引起的人类免疫缺陷疾病,该变异导致T细胞发育异常和纤维化 | 首次发现ThPOK基因变异导致的人类疾病,揭示了该变异具有多态性功能异常 | 仅基于单个病例研究,样本量有限 | 研究ThPOK基因变异对人类免疫系统和组织纤维化的影响 | 携带ThPOKK360N变异的患者、健康对照者的T细胞和成纤维细胞 | 免疫学 | 先天性免疫缺陷 | 单细胞RNA测序,慢病毒转导,转录组分析 | NA | 基因测序数据,转录组数据 | 1例患者和健康对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4129 | 2025-10-06 |
Multiomic analysis uncovers a continuous spectrum of differentiation and Wnt-MDK-driven immune evasion in hepatoblastoma
2025-Aug, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.01.031
PMID:39900120
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研究论文 | 通过多组学分析揭示肝母细胞瘤的分化连续谱和Wnt-MDK驱动的免疫逃逸机制 | 首次发现肝母细胞瘤细胞存在连续分化谱系,并揭示Wnt信号通过上调midkine改变巨噬细胞表型驱动免疫逃逸 | 需要进一步的机制和临床验证来实现这些发现的临床转化 | 全面分析肝母细胞瘤肿瘤微环境,揭示其空间结构和关键信号机制 | 经治疗、未治疗和转移性儿童肝母细胞瘤样本,包括肝母细胞瘤、非肿瘤和胎儿肝脏样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞/单核RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光染色, Western blotting | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 单细胞RNA-seq (n=15), 空间转录组学 (n=22), 多重免疫荧光 (n=7), RNA-seq验证队列 (n=110) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
4130 | 2025-10-06 |
A review of spatial transcriptomics in psoriasis: new insights into cellular contributions
2025-Aug, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2025.102585
PMID:40505496
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在银屑病研究中的应用及其对细胞作用的新见解 | 整合空间转录组学与单细胞RNA测序技术,揭示银屑病皮肤组织中细胞空间分布特征及细胞间相互作用 | NA | 总结空间转录组学在银屑病研究中的应用进展 | 银屑病皮肤组织 | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4131 | 2025-10-06 |
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveal PAK kinase as a therapeutic target in fibroblastic foci and dense fibrosis of IPF
2025-Jul-17, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00022-2025
PMID:40675771
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了PAK激酶在特发性肺纤维化纤维化病灶和致密纤维化中的治疗靶点作用 | 首次发现++肌成纤维细胞群体在纤维化病灶和致密纤维化区域富集,并证实PAK2在这些纤维化区域激活,PAK抑制剂能显著抑制纤维化进程 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 阐明特发性肺纤维化中纤维化病灶和致密纤维化的细胞异质性及治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者肺组织和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 空间转录组学,单细胞测序 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
4132 | 2025-10-06 |
The impact of neddylation on prognosis in the immune microenvironment of neuroblastoma: a single-cell transcriptomic analysis
2025-Jul-17, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09662-1
PMID:40676385
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析建立neddylation相关预后标志物,并评估其在神经母细胞瘤免疫微环境中的临床意义 | 首次在神经母细胞瘤中构建neddylation相关预后标志物,并通过单细胞分辨率揭示不同细胞类型的neddylation特征 | NA | 建立neddylation相关预后标志物并评估其在神经母细胞瘤中的临床应用价值 | 神经母细胞瘤患者 | 数字病理 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 单样本基因集富集分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 171,992个细胞分为19个细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4133 | 2025-10-06 |
Research advances in intramuscular fat deposition and chicken meat quality: genetics and nutrition
2025-Jul-16, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01234-5
PMID:40665461
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综述 | 本文综述了过去十年间遗传学和营养学调控鸡肉质性状的研究进展,重点关注肌内脂肪沉积机制 | 单细胞RNA测序揭示肌细胞是鸡肌内脂肪新生合成的主要场所;首次发现LncHLFF通过外泌体机制促进异位肌内脂肪沉积;发现miR-27b-3p和miR-128-3p通过靶向PPARG抑制脂肪生成;营养基因组学研究显示果糖通过激活ChREBP增强肌内脂肪沉积 | NA | 改善肉鸡肉质性状,同时保证生长性能 | 肉鸡 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4134 | 2025-10-06 |
Genomic and Single-Cell Analyses Characterize Patient-Derived Tumor Organoids to Enable Personalized Therapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2850
PMID:40261963
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研究论文 | 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官,分析其基因组特征和药物敏感性,为个性化治疗提供依据 | 首次系统建立头颈部鳞癌患者来源类器官模型,发现混合上皮-间质转化状态与顺铂耐药相关,并鉴定amphiregulin作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(31例患者),需要更大规模验证 | 开发头颈部鳞癌个性化治疗模型并探索治疗耐药机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 药物敏感性测试 | 患者来源肿瘤类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 病理图像 | 31例头颈部鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4135 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Advances the Use of Canine Patients in Cancer Research: Analysis of Osteosarcoma-Bearing Pet Dogs Enrolled in a Clinical Trial
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0687
PMID:40392977
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研究论文 | 本研究首次将GeoMx犬类癌症图谱应用于骨肉瘤临床试验犬患者的预后相关样本分析 | 首次在犬类骨肉瘤临床试验样本中应用空间转录组学技术,验证犬类模型在人类癌症研究中的价值 | 样本量较小(n=16),仅分析了疾病无进展间隔的极端分组 | 探索犬类骨肉瘤模型中基因表达与疾病预后的关联 | 宠物犬原发性骨肉瘤组织样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 16例犬骨肉瘤样本(高DFI组8例,低DFI组8例) | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx犬类癌症图谱 |
4136 | 2025-10-06 |
Disruption of cell-intrinsic PCSK9 enhances the antitumor efficacy of CD8+ T cells
2025-Jul-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011657
PMID:40664445
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研究论文 | 本研究揭示了免疫细胞内在PCSK9对CD8+ T细胞抗肿瘤功能的抑制作用及其作为癌症免疫治疗新靶点的潜力 | 首次发现CD8+ T细胞自身表达的PCSK9会抑制其抗肿瘤功能,敲除PCSK9可增强CD8+ T细胞和CAR-T细胞的肿瘤杀伤能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的转化效果需要进一步验证 | 探究免疫细胞内在PCSK9在肿瘤控制中的作用机制 | 胰腺癌和黑色素瘤小鼠模型、CD8+ T细胞、CAR-T细胞 | 免疫肿瘤学 | 胰腺癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | Pcsk9缺陷小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4137 | 2025-10-06 |
High-resolution mapping of single cells in spatial context
2025-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61667-4
PMID:40664667
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研究论文 | 开发了一种名为CMAP的方法,通过整合单细胞和空间数据实现大规模单个细胞到精确空间位置的映射 | 采用分治策略整合单细胞和空间数据,有效处理两种数据间的不一致性,实现完整单细胞分辨率 | NA | 解决空间转录组技术中基因恢复不足和难以实现完整单细胞分辨率的问题 | 组织微环境中的细胞 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学,单细胞测序 | 分治策略 | 单细胞数据,空间数据 | 模拟和真实数据集 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
4138 | 2025-10-06 |
Exploring the mechanism of metabolic cell death-related genes AKR1C2 and MAP1LC3A as biomarkers in Parkinson's disease
2025-Jul-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11481-1
PMID:40664780
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研究论文 | 本研究通过整合帕金森病相关差异表达基因和代谢性细胞死亡相关基因,鉴定AKR1C2和MAP1LC3A作为帕金森病的潜在生物标志物 | 首次系统分析代谢性细胞死亡相关基因在帕金森病中的作用,并鉴定出AKR1C2和MAP1LC3A作为新型生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索代谢性细胞死亡相关基因在帕金森病发病机制中的作用 | 帕金森病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 蛋白质相互作用网络分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | GSE7621数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
4139 | 2025-10-06 |
A novel cancer-associated membrane signature predicts prognosis and therapeutic response for lung adenocarcinoma
2025-Jul-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11105-8
PMID:40664871
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组数据开发了基于膜蛋白的肺腺癌预后预测模型LCaMPS | 首次在单细胞和空间分辨率水平系统识别肺腺癌特异性膜蛋白并构建预后模型 | 需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发肺腺癌预后预测和治疗指导的生物标志物 | 肺腺癌患者队列 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | 预后预测模型 | RNA测序数据,蛋白质表达数据 | 多个肺腺癌队列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
4140 | 2025-10-06 |
Deciphering cancer therapy resistance via patient-level single-cell transcriptomics with CellResDB
2025-Jul-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08457-2
PMID:40664938
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研究论文 | 介绍了一个用于研究癌症治疗耐药性的患者水平单细胞转录组数据库CellResDB | 开发了首个整合患者水平单细胞转录组数据和临床注释的癌症治疗耐药性数据库,并包含智能机器人辅助数据检索 | NA | 系统研究癌症治疗耐药性的潜在机制 | 肿瘤微环境中的细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 单细胞转录组数据 | 1391个患者样本,约470万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |