单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 4121 - 4140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4121 | 2025-03-21 |
Human Pancreatic Cancer Single-Cell Atlas Reveals Association of CXCL10+ Fibroblasts and Basal Subtype Tumor Cells
2025-Feb-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2183
PMID:39636224
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）构建了人类胰腺癌的单细胞图谱，揭示了CXCL10+成纤维细胞与基底亚型肿瘤细胞之间的关联 | 发现了CXCL10+癌症相关成纤维细胞与基底肿瘤细胞之间的新型富集和空间关联，并揭示了这些细胞类型在PDAC肿瘤微环境中的关系 | 研究主要依赖于公开的原始数据，可能受到数据质量和一致性的限制 | 开发基因组资源，以统计学严谨的方式识别新的潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学（ST），多重免疫染色 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | 229例患者样本，744例bulk RNA-seq样本，22例空间转录组样本，总计70万个细胞 |
| 4122 | 2025-03-21 |
Single-cell RNA sequencing of shoot apex reveals the mechanism of cyclin regulating cell division via auxin signaling pathway in Populus alba
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1555388
PMID:40104035
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了白杨顶端分生组织的细胞分裂和分化过程，揭示了细胞周期蛋白通过生长素信号通路调控细胞分裂的机制 | 首次在单细胞水平上揭示了白杨顶端分生组织中细胞分裂和分化的分子调控机制，特别是生长素信号通路在叶片组织发育中的作用 | 研究仅基于两个生物学重复，样本量较小，可能影响结果的普适性 | 研究白杨顶端分生组织中细胞分裂和分化的分子调控机制 | 白杨顶端分生组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 29,011个细胞，来自两个生物学重复 |
| 4123 | 2025-03-21 |
Multi-omics approach reveals the impact of prognosis model-related genes on the tumor microenvironment in medulloblastoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1477617
PMID:40104502
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了预后模型相关基因对髓母细胞瘤肿瘤微环境的影响 | 开发了一个与肿瘤微环境相关的风险评分模型（TMErisk），并利用单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间RNA分析验证了结果 | NA | 预测髓母细胞瘤患者的预后并阐明生物学机制 | 髓母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）、空间RNA分析 | LASSO-COX模型、COX回归模型 | RNA测序数据 | 322个天坛样本和763个GSE85217样本 |
| 4124 | 2025-03-21 |
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-related platelet bias: implications for bone marrow transplantation and blood disorders
2024-Dec-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04084-6
PMID:39623507
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研究论文 | 本文探讨了造血干细胞（HSCs）的异质性和与年龄相关的血小板偏向性，及其对骨髓移植和血液疾病的影响 | 揭示了血小板偏向性造血干细胞（P-HSCs）的存在及其在衰老过程中的扩展，提供了跨物种血小板偏向性HSCs的进化保守性证据 | 当前方法学存在局限性，需要进一步研究以优化HSC疗法并改善血液疾病的临床结果 | 研究HSCs的异质性和血小板偏向性对骨髓移植和血液疾病的影响 | 造血干细胞（HSCs） | 血液学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序，分子条形码 | NA | NA | NA |
| 4125 | 2025-03-21 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
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研究论文 | 本文探讨了在慢性炎症性疾病中，通过局部控制递送IL-4来减少炎症性骨丢失的可行性 | 使用可生物降解聚合物载体封装IL-4，并在口腔内局部递送，以靶向巨噬细胞，从而减少炎症性骨丢失并促进骨再生 | 研究仅在鼠类模型中进行，尚未在人体中验证其效果 | 评估在慢性炎症性疾病中，通过局部控制递送IL-4来减少炎症性骨丢失的可行性 | 鼠类模型中的牙周病 | 免疫学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序技术 | NA | 基因表达数据 | 鼠类模型 |
| 4126 | 2025-03-21 |
Endocytosis as a critical regulator of hematopoietic stem cell fate -implications for hematopoietic stem cell and gene therapy
2024-Sep-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03927-6
PMID:39334274
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评论 | 本文讨论了内吞作用在造血干细胞（HSCs）命运中的关键调节作用，及其对造血干细胞和基因治疗的影响 | 揭示了MYCT1蛋白在HSCs维持中的新作用，特别是在调节内吞作用和环境感知方面 | 尽管在体外培养HSCs方面取得了显著进展，但仍未完全理解所有潜在机制及其在HSCs增殖时的变化 | 探讨内吞作用在HSCs命运中的调节作用，及其对细胞治疗和基因治疗应用的影响 | 造血干细胞（HSCs）和造血祖细胞（HSPCs） | 再生医学 | 血液和免疫细胞相关疾病 | 敲低、过表达、单细胞RNA测序和移植实验 | NA | NA | NA |
| 4127 | 2025-03-21 |
In vivo CRISPR screens identify Mga as an immunotherapy target in triple-negative breast cancer
2024-Sep-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2406325121
PMID:39298484
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研究论文 | 本文通过体内CRISPR筛选，识别了Mga作为三阴性乳腺癌免疫治疗的潜在靶点 | 通过七种同源肿瘤模型的迭代体内CRISPR筛选，识别了跨癌症类型的核心和上下文依赖性免疫逃逸途径，并发现Mga敲除显著增强抗肿瘤免疫并抑制肿瘤生长 | Mga在肿瘤免疫景观中的精确调控机制尚需进一步研究 | 探索肿瘤免疫逃逸机制，并寻找有效的抗癌治疗靶点 | 三阴性乳腺癌（TNBC） | 癌症研究 | 乳腺癌 | CRISPR筛选、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 七种同源肿瘤模型 |
| 4128 | 2025-03-21 |
A practical handbook on single-cell RNA sequencing data quality control and downstream analysis
2024-Sep, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100103
PMID:39094968
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review | 本文提供了一本实用的手册，指导单细胞RNA测序数据的质量控制和下游分析 | 提出了选择高质量细胞的指南和分析过程中的注意事项，为改进单细胞分析质量奠定了基础 | 未提及具体的技术或模型限制 | 提高单细胞RNA测序数据的质量和分析流程的标准化 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4129 | 2025-03-21 |
Pharmacology of Hydrogen Sulfide and Its Donors in Cardiometabolic Diseases
2024-Aug-15, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1124/pharmrev.123.000928
PMID:38866561
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综述 | 本文综述了硫化氢（HS）及其供体在心脏代谢疾病（CMDs）中的生理作用和药理作用的最新研究进展 | 强调了HS通过调节蛋白质的硫化修饰在CMDs发病机制中的重要性，并探讨了新兴技术如多组学、肠道菌群分析、类器官和单细胞测序在HS药理研究中的应用 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨内源性HS及其供体在心脏代谢疾病中的生理和药理作用 | 心脏代谢疾病（CMDs） | 药理学 | 心血管疾病 | 多组学、肠道菌群分析、类器官、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 4130 | 2025-03-21 |
Transfer Learning Reveals Cancer-Associated Fibroblasts Are Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition and Inflammation in Cancer Cells in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1660
PMID:38587552
|
研究论文 | 本研究通过整合人类肿瘤的单细胞数据和人类类器官共培养实验，揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）中癌症相关成纤维细胞（CAF）与上皮细胞的上皮-间质转化（EMT）和炎症的关联 | 引入了从人类单细胞数据到类器官共培养分析的迁移学习，用于实验验证细胞间相互作用的发现，并识别了成纤维细胞介导的EMT和炎症调控 | 研究主要基于体外实验和计算模型，未涉及体内实验验证 | 探索PDAC中CAF与上皮细胞之间的相互作用及其对EMT和炎症的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的癌症相关成纤维细胞（CAF）和上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、类器官共培养实验 | 迁移学习 | 单细胞RNA测序数据、转录数据 | NA |
| 4131 | 2025-03-21 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotype and phenotype in chronic lymphocytic leukemia
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585298
PMID:38559060
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研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术，探讨了慢性淋巴细胞白血病（CLL）中癌症亚克隆的基因型和表型特征 | 采用MAS-seq长读长单细胞RNA测序技术，显著提高了转录本的覆盖范围，并扩展了可用于将细胞与癌症亚克隆关联的信息突变集 | 研究样本量较小，仅涉及六名CLL患者 | 研究CLL亚克隆中是否存在额外的驱动突变加速亚克隆扩展，以及突变亚克隆是否表现出与其他癌症亚克隆不同的转录组行为 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序（MAS-seq） | NA | RNA测序数据 | 六名CLL患者 |
| 4132 | 2025-03-21 |
Opposing roles of hepatic stellate cell subpopulations in hepatocarcinogenesis
2022-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05289-6
PMID:36198802
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研究论文 | 本文探讨了肝星状细胞（HSCs）在肝细胞癌（HCC）发生中的双重作用 | 揭示了HSCs亚群在肝细胞癌发生中的动态变化及其介导因子的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究 | 研究肝星状细胞在肝细胞癌发生中的作用 | 肝星状细胞（HSCs）及其亚群 | 癌症研究 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA测序数据 | 小鼠和人类HSC样本 |
| 4133 | 2025-03-21 |
Redefining inflammatory macrophage phenotypes across stages and tissues by single-cell transcriptomics
2022-04-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abo4652
PMID:35427177
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据重新定义了炎症性巨噬细胞在不同阶段和组织中的表型 | 利用单细胞转录组数据识别单核细胞来源巨噬细胞的主要激活路径，为炎症性组织巨噬细胞提供了一个框架 | NA | 研究炎症性巨噬细胞在不同阶段和组织中的表型 | 单核细胞来源的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 4134 | 2025-03-21 |
Lifting the veil on macrophage diversity in tissue regeneration and fibrosis
2019-10-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aaz0749
PMID:31604845
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了巨噬细胞在组织修复和纤维化中的作用 | 使用单细胞RNA测序技术深入解析巨噬细胞的多样性及其在组织修复和纤维化中的具体作用 | NA | 研究巨噬细胞在组织修复和纤维化中的具体作用 | 巨噬细胞 | 生物信息学 | 纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4135 | 2025-03-21 |
Environments Tune and Select Cellular Diversity
2017-09, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2017.07.006
PMID:28774723
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在揭示细胞间表达水平变异及其在细胞间分子传播中的应用 | 应用系统和统计模型的新定量方法，揭示了表型多样性的驱动因素 | NA | 研究细胞间表达水平变异及其传播机制 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 系统和统计模型 | 单细胞测序数据 | NA |
| 4136 | 2025-03-20 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a tumor-associated macrophage subpopulation that mediates prostate cancer progression and metastasis
2025-Mar-19, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0791
PMID:40105746
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、空间转录组学和多重免疫荧光技术，揭示了前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的动态变化及其在癌症进展和转移中的作用 | 发现了SPP1+/TREM2+ TAMs亚群在前列腺癌转移中的重要作用，并提出了针对该亚群的潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要进一步的大规模临床验证 | 研究前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的异质性及其在癌症进展和转移中的作用 | 前列腺癌患者样本和小鼠模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光 | NA | RNA测序数据、图像数据 | 人类患者样本和小鼠模型 |
| 4137 | 2025-03-20 |
Targeting the histone reader ZMYND8 inhibits antiandrogen-induced neuroendocrine tumor transdifferentiation of prostate cancer
2025-Mar-18, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00928-z
PMID:40102673
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研究论文 | 本文通过CRISPR‒Cas9筛选与单细胞RNA测序追踪肿瘤转变，揭示了抗雄激素治疗诱导的ZMYND8依赖的表观遗传编程在前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化中的关键作用 | 揭示了ZMYND8依赖的表观遗传编程在前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化中的关键作用，并开发了iZMYND8-34小分子抑制剂以阻断这一过程 | NA | 研究抗雄激素治疗诱导的前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化的分子机制 | 前列腺癌神经内分泌肿瘤 | 表观遗传学 | 前列腺癌 | CRISPR‒Cas9筛选, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4138 | 2025-03-20 |
Pan-cancer analysis and experimental verification of cytochrome B561 as a prognostic and therapeutic biomarker in breast cancer
2025-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02094-1
PMID:40091073
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研究论文 | 本研究探讨了细胞色素B561（CYB561）在泛癌中的表达、其与免疫侵袭的关系及其在乳腺癌（BRCA）患者中的预后价值 | 首次在泛癌范围内分析CYB561的表达，并验证其在乳腺癌中的预后和治疗生物标志物作用 | 研究主要依赖于TCGA数据库，缺乏外部验证数据集 | 探讨CYB561在癌症中的表达模式及其作为乳腺癌预后和治疗生物标志物的潜力 | 乳腺癌患者及癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，基因敲除 | 逻辑回归，Cox回归分析 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA数据库中的乳腺癌样本及实验验证的癌细胞系 |
| 4139 | 2025-03-20 |
Single-cell RNA sequencing revealed cell landscape of tongue dorsal mucosa in rats with gastric intestinal metaplasia
2025-Mar-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02386-z
PMID:40090940
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了胃肠化生大鼠舌背黏膜的细胞景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示胃肠化生大鼠舌背黏膜的细胞景观，并发现与炎症反应和组织屏障完整性受损相关的基因表达变化 | 研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 探讨胃肠化生对舌背黏膜细胞景观的影响 | 胃肠化生大鼠的舌背黏膜 | 数字病理 | 胃肠化生 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 胃肠化生大鼠模型 |
| 4140 | 2025-03-20 |
Interrogating mediators of single-cell transcriptional changes in the acute damaged cerebral cortex: Insights into endothelial-astrocyte interactions
2025-Mar-14, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2025.104003
PMID:40090391
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研究论文 | 本文研究了内皮细胞EphA4在调节受损大脑皮层细胞特异性转录组变化中的作用，特别是在星形胶质细胞和内皮细胞之间的相互作用 | 通过单细胞RNA测序技术，揭示了EphA4特异性敲除对星形胶质细胞基因表达和亚群分布的显著影响，并发现了一个新的Sox9+星形胶质细胞亚群 | 研究主要基于实验性创伤性脑损伤模型，可能无法完全反映人类创伤性脑损伤的复杂性 | 探讨创伤性脑损伤后内皮细胞和星形胶质细胞之间的相互作用及其对转录组变化的影响 | 受损大脑皮层中的内皮细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |