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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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4101 | 2025-03-22 |
Clusterin knockdown has effects on intracellular and secreted von Willebrand factor in human umbilical vein endothelial cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298133
PMID:38363768
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研究论文 | 本研究探讨了clusterin (CLU)在调控von Willebrand因子(VWF)中的作用,特别是在von Willebrand病(VWD)中的影响 | 首次通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析识别CLU作为VWF的潜在调控因子,并使用siRNA和CRISPR-Cas9技术在人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)中进行验证 | 研究未发现CLU敲低对Weibel-Palade小体(WPBs)的数量或大小有显著影响,且未探讨CLU在其他类型细胞中的作用 | 研究CLU在VWF调控中的作用,特别是在VWD中的机制 | 人类脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 分子生物学 | von Willebrand病 | siRNA, CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据, 蛋白质水平数据 | 人类脐静脉内皮细胞(HUVECs) |
4102 | 2025-03-22 |
Early human lung immune cell development and its role in epithelial cell fate
2023-12-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adf9988
PMID:38100545
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研究论文 | 本文研究了人类胚胎和胎儿肺免疫细胞的发育及其对上皮细胞命运的影响 | 首次系统性地描述了人类胚胎和胎儿肺免疫细胞的发育过程,并探讨了免疫细胞在肺上皮细胞成熟中的作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序,体内实验的证据尚不充分 | 探讨人类肺发育过程中免疫细胞的作用及其对上皮细胞命运的影响 | 人类胚胎和胎儿肺免疫细胞及上皮细胞 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, smFISH, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 人类胚胎和胎儿肺组织样本 |
4103 | 2025-03-22 |
p53 governs an AT1 differentiation programme in lung cancer suppression
2023-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06253-8
PMID:37468633
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研究论文 | 本文探讨了p53在肺腺癌(LUAD)抑制中的作用,特别是通过调控肺泡1型(AT1)细胞分化来抑制LUAD的发展 | 揭示了p53通过调控细胞状态,特别是促进AT1细胞分化来抑制LUAD的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类LUAD中的具体机制仍需进一步验证 | 研究p53在肺腺癌(LUAD)抑制中的具体机制 | 肺腺癌(LUAD)细胞和小鼠模型 | 癌症研究 | 肺癌 | RNA测序、ATAC测序、单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据、染色质重塑数据 | 使用表达致癌Kras和不同Trp53等位基因的小鼠模型 |
4104 | 2025-03-22 |
Ornithine decarboxylase supports ILC3 responses in infectious and autoimmune colitis through positive regulation of IL-22 transcription
2022-Nov-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2214900119
PMID:36279426
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研究论文 | 本文研究了第3组先天淋巴细胞(ILC3s)在感染性和自身免疫性结肠炎中通过正调控IL-22转录的机制 | 揭示了ILC3s通过多胺生物合成途径增强IL-22产生的新机制,并发现鸟氨酸脱羧酶(ODC1)在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨ILC3s在感染性和自身免疫性结肠炎中的代谢适应及其对IL-22产生的影响 | 第3组先天淋巴细胞(ILC3s) | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序和代谢组学分析 | NA | RNA测序数据和代谢组数据 | 小鼠模型 |
4105 | 2025-03-21 |
Single-cell RNA sequencing-guided engineering of mitochondrial therapies for intervertebral disc degeneration by regulating mtDNA/SPARC-STING signaling
2025-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.036
PMID:40104024
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据指导,开发了一种针对椎间盘退变的仿生疗法,并在动物模型中进行了验证 | 提出了线粒体移植作为一种新的治疗策略,并设计了具有抗氧化和抗炎活性的生物活性大分子,增强了治疗效果 | 研究主要基于动物模型,尚未在人类临床试验中验证其安全性和有效性 | 开发针对椎间盘退变的新型治疗方法 | 人类髓核组织和动物模型 | 数字病理 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类髓核组织和动物模型 |
4106 | 2025-03-21 |
Double-target magnetic stimulation attenuates oligodendrocyte apoptosis and oxidative stress impairment after spinal cord injury via GAP43
2025-Apr, The spine journal : official journal of the North American Spine Society
DOI:10.1016/j.spinee.2024.12.025
PMID:39701305
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研究论文 | 本研究评估了双靶点(大脑和脊髓)磁刺激(DTMS)治疗对脊髓损伤(SCI)大鼠的功能恢复和神经回路改善的影响,并探讨了DTMS对胶质细胞调节的作用 | 揭示了DTMS通过调节GAP43在少突胶质细胞中的抗凋亡和抗氧化应激作用,促进少突胶质细胞的分支和成熟以及轴突再生,从而改善SCI后的神经回路功能 | 研究主要基于动物模型,尚未在人类中进行验证 | 评估DTMS对脊髓损伤后功能恢复和神经回路改善的影响,并探讨其作用机制 | 脊髓损伤模型大鼠 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、透射电子显微镜、Western blotting、免疫荧光染色、TUNEL染色、Annexin V-FITC凋亡试剂盒、脂质ROS试剂盒 | NA | 行为评估数据、组织染色数据、单细胞RNA测序数据 | 脊髓损伤模型大鼠 |
4107 | 2025-03-21 |
Trends in Research of Odontogenic Keratocyst and Ameloblastoma
2025-Apr, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241282256
PMID:39876078
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综述 | 本文综述了牙源性角化囊肿(OKC)和成釉细胞瘤(AM)研究的最新进展和趋势 | 利用单细胞和空间组学技术深入理解OKC和AM的肿瘤微环境和细胞异质性,以及3D培养技术在AM亚型分析中的应用 | 尽管AM已有可靠的临床前模型,但OKC的可靠体外和体内模型仍然稀缺 | 探讨OKC和AM的生物学行为机制及其潜在治疗靶点 | 牙源性角化囊肿(OKC)和成釉细胞瘤(AM) | 数字病理学 | 口腔颌面部疾病 | 单细胞组学、空间转录组学、3D培养技术、人工智能(机器学习和深度学习) | NA | NA | NA |
4108 | 2025-03-21 |
SPRY1 regulates macrophage M1 polarization in skin aging and melanoma prognosis
2025-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102331
PMID:40023001
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研究论文 | 本研究探讨了SPRY1在皮肤老化中的作用,特别是其对巨噬细胞M1极化的影响,并探索其作为缓解皮肤老化和黑色素瘤治疗靶点的潜力 | 首次揭示了SPRY1在皮肤老化中的关键作用,特别是通过促进巨噬细胞M1极化加速皮肤老化,并发现其在黑色素瘤中的表达与患者生存率相关 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内验证,未来需要进一步探索其调控网络 | 研究SPRY1在皮肤老化中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞白血病细胞和NIH/3T3小鼠皮肤成纤维细胞 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞测序、基因转染、CCK-8实验、qRT-PCR、ROS和SOD活性测量 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | GTEx和GEO数据库中的数据集,以及RAW264.7和NIH/3T3细胞系 |
4109 | 2025-03-21 |
Islet single-cell transcriptomic profiling during obesity-induced beta cell expansion in female mice
2025-Mar-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112031
PMID:40104055
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术研究了肥胖诱导的雌性小鼠胰岛β细胞扩增过程中的分子机制 | 揭示了Xbp1和Myc在缓解未折叠蛋白反应(UPR)和刺激β细胞增殖中的协调转录机制 | 研究仅限于雌性小鼠,未涉及雄性小鼠或其他物种 | 探索肥胖诱导的β细胞增殖的分子机制,以寻找新的治疗靶点 | 雌性小鼠的胰岛β细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 雌性KO小鼠的胰岛β细胞 |
4110 | 2025-03-21 |
De novo TANC2 variants caused developmental and epileptic encephalopathy and epilepsy
2025-Mar-20, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/epi.18358
PMID:40110879
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研究论文 | 本研究探讨了TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异的机制 | 首次将TANC2基因与癫痫和发育性癫痫性脑病(DEE)关联起来,并通过果蝇模型和单细胞RNA测序验证了其功能 | 样本量较小,仅包括六例不相关的病例 | 探索TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异的机制 | 癫痫患者和果蝇模型 | 遗传学 | 癫痫 | 外显子测序、单细胞RNA测序 | 果蝇模型 | 基因序列数据、RNA表达数据 | 六例不相关的癫痫患者 |
4111 | 2025-03-21 |
NKG2D-mediated cytotoxicity of CD4 cytotoxic T cells in multiple myeloma
2025-Mar-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025875
PMID:40106762
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序,研究了多发性骨髓瘤患者骨髓中CD4+ T细胞的细胞毒性作用及其与NKG2D的关系 | 发现了CD4+细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)在多发性骨髓瘤患者中的显著增加和克隆扩展,并揭示了其通过NKG2D介导的细胞毒性作用 | 研究局限于多发性骨髓瘤患者,未涉及其他类型的癌症 | 探讨CD4+ T细胞在多发性骨髓瘤中的抗肿瘤免疫作用 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD4+ T细胞 | 免疫学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | RNA序列数据 | 多发性骨髓瘤患者骨髓样本 |
4112 | 2025-03-21 |
Identification of NETs-related genes as diagnostic biomarkers in ischemic stroke using RNA sequencing and single-cell analysis
2025-Mar-19, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10117-z
PMID:40107980
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞分析,识别了与缺血性中风相关的NETs相关基因,并评估了其作为诊断生物标志物的潜力 | 首次结合RNA测序和单细胞RNA测序技术,系统地研究了NETs在缺血性中风中的作用,并识别了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明NETs在缺血性中风进展中的作用,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 小鼠脑组织样本 | 生物信息学 | 缺血性中风 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | 小鼠脑组织样本 |
4113 | 2025-03-21 |
BubR1 Controls Heart Development by Promoting Expression of Cardiogenesis Regulators
2025-Mar-18, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.038286
PMID:40055864
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研究论文 | 本文研究了BubR1在心脏发育中的作用,揭示了其通过促进心脏生成调节因子的表达来调控心脏发育的机制 | 首次揭示了BubR1在心脏发育中的关键作用,特别是其在心脏成熟和形态发生中的调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探讨BubR1在心脏发育中的分子机制及其对先天性心脏缺陷的影响 | 小鼠胚胎心脏 | 发育生物学 | 先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序,轨迹分析,CellChat分析 | NA | RNA测序数据 | 小鼠胚胎心脏样本 |
4114 | 2025-03-21 |
New insights into cancer immune checkpoints landscape from single-cell RNA sequencing
2025-Mar-13, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189298
PMID:40088992
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review | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示癌症免疫检查点景观中的新见解,特别是在免疫检查点阻断治疗前后的免疫浸润模式 | 利用单细胞RNA测序技术高分辨率描绘了免疫检查点之间的功能相互作用,揭示了免疫检查点阻断治疗中肿瘤微环境的异质性 | 未提及具体的研究样本量或实验数据,可能缺乏定量分析 | 探讨免疫检查点阻断治疗在肿瘤免疫治疗中的效果及其失败的原因 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | digital pathology | cancer | single-cell RNA sequencing | NA | RNA sequencing data | NA |
4115 | 2025-03-21 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing identifies APOC1 as a biomarker and therapeutic target for G0/G1 cell cycle arrest in cholangiocarcinoma
2025-Mar-08, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111028
PMID:40064358
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序技术,识别出APOC1作为胆管癌G0/G1细胞周期阻滞的生物标志物和治疗靶点 | 首次将APOC1识别为胆管癌G0/G1期细胞的特征基因,并通过实验验证其通过抑制Wnt/β-catenin信号通路诱导G0/G1期阻滞的机制 | 未明确APOC1在胆管癌G0/G1期细胞中的具体分子机制 | 探索胆管癌G0/G1期细胞的生物标志物及其分子机制 | 胆管癌细胞 | 生物信息学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulkRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量 |
4116 | 2025-03-21 |
Independent signaling pathways provide a fail-safe mechanism to prevent tumorigenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640798
PMID:40093137
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了促增殖信号对上皮细胞稳态的影响,揭示了EGFR-Ras和Hh信号通路在肿瘤发生中的独立作用 | 揭示了非相互作用的信号通路在转录水平上如何汇聚以防止恶性细胞行为的新机制 | 研究主要基于果蝇滤泡细胞系,可能需要在哺乳动物系统中进一步验证 | 研究促增殖信号对上皮细胞稳态的影响及其在肿瘤发生中的作用 | 果蝇滤泡细胞系 | 分子生物学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
4117 | 2025-03-21 |
Role of cancer stem cell heterogeneity in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Feb-28, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1286
PMID:40104739
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研究论文 | 本研究探讨了癌症干细胞异质性在肝内胆管癌(ICC)中的作用,通过单细胞RNA测序技术分析了不同细胞亚群的信号通路活动和细胞间通讯 | 利用单细胞RNA测序技术深入探索了ICC中癌症干细胞的异质性,揭示了不同亚群对肿瘤进展和患者预后的影响 | 研究依赖于公开的数据库数据,可能受到数据质量和样本量的限制 | 研究ICC中癌症干细胞异质性对预后的影响 | 肝内胆管癌(ICC)患者 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 来自GEO数据库的scRNA-seq数据集GSE142784和TCGA数据库的Bulk RNA-seq数据 |
4118 | 2025-03-21 |
Fast, flexible analysis of differences in cellular composition with crumblr
2025-Feb-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5921338/v1
PMID:40060050
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研究论文 | 本文介绍了一种名为crumblr的可扩展统计方法,用于分析细胞类型组成的变化 | crumblr方法在细胞谱系层次结构的多个级别上进行统计测试,采用多变量方法提高检测能力 | NA | 开发一种统计方法来识别细胞类型频率的变化 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | RNA测序数据 | NA |
4119 | 2025-03-21 |
Cluster replicability in single-cell and single-nucleus atlases of the mouse brain
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639959
PMID:40060489
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研究论文 | 本文评估了小鼠大脑图谱中通过单细胞RNA测序和单核测序识别的细胞簇的可重复性 | 通过转录组范围的邻居投票方法,识别了2009对具有一致空间定位和协调基因表达的互配簇,这些簇在多个物种的数据集中也被观察到 | 下丘脑的异质性限制了簇的一致性,且使用标记基因区分紧密簇比区分大多数其他簇更具挑战性 | 评估小鼠大脑图谱中细胞簇的可重复性,以确定其生物学稳健性 | 小鼠大脑中的细胞簇 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序, 单核测序 | NA | RNA测序数据 | 超过400万个细胞,分为5000多个簇 |
4120 | 2025-03-21 |
Cell Type-Agnostic Transcriptomic Signatures Enable Uniform Comparisons of Neurodevelopment
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639936
PMID:40060479
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析,开发了一种细胞类型无关的转录组特征模型,用于比较不同背景、模型系统和物种间的神经发育 | 提出了一种细胞类型无关的模型,能够准确预测细胞自主成熟度,并在不同细胞类型和数据集中捕捉发育动态 | 尽管模型在人类神经类器官和小鼠大脑中表现出良好的泛化能力,但其在其他物种或更广泛的应用场景中的有效性仍需进一步验证 | 开发一种统一的框架,用于比较不同背景、模型系统和物种间的神经发育 | 人类大脑发育数据集和小鼠大脑发育数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | 正则化回归模型 | 单细胞转录组数据 | 超过280万个细胞 |