单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 4101 - 4120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4101 | 2025-02-11 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
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研究论文 | 本研究通过遗传学证据揭示了视黄酸（RA）和雌激素信号在维持成年小鼠子宫上皮细胞命运中的拮抗作用 | 首次提供了RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中拮抗作用的遗传学证据，并揭示了RA信号缺失导致的细胞命运转变和免疫细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中的作用 | 小鼠子宫上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种相关小鼠遗传模型 |
| 4102 | 2025-02-11 |
Suppressing recurrence in Sonic Hedgehog subgroup medulloblastoma using the OLIG2 inhibitor CT-179
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54861-3
PMID:39904981
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研究论文 | 本研究探讨了OLIG2抑制剂CT-179在Sonic Hedgehog亚型髓母细胞瘤中的治疗潜力 | 首次展示了CT-179通过破坏OLIG2二聚化、磷酸化和DNA结合来改变肿瘤细胞周期动力学，增加分化和凋亡，并延长SHH-MB模型的生存期 | 研究中未提及CT-179的长期副作用或对其他类型肿瘤的影响 | 研究旨在通过靶向OLIG2+肿瘤干细胞来改善SHH驱动的髓母细胞瘤的治疗反应和患者预后 | SHH-MB外植体器官样、PDX和GEM SHH-MB模型 | 肿瘤学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | PDX和GEM模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 4103 | 2025-02-11 |
Phospho-seq: integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56590-7
PMID:39905064
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研究论文 | 本文介绍了Phospho-seq，一种集成方法，旨在量化细胞质和核蛋白，包括具有翻译后修饰的蛋白，并将其活性与顺式调控元件和转录目标联系起来 | Phospho-seq结合了简化的实验台抗体偶联方法，创建了大型定制神经聚焦抗体面板，用于同时进行蛋白质和scATAC-seq分析，并结合实验和计算策略整合转录组测量 | NA | 研究细胞内蛋白质动态的多模态分析，特别是在神经发育中的细胞信号状态 | 细胞系、诱导多能干细胞、数月龄的视网膜和脑类器官 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq, 转录组测量 | NA | 蛋白质数据、转录组数据 | 细胞系、诱导多能干细胞、视网膜和脑类器官 |
| 4104 | 2025-02-11 |
Expression of Osteopontin in M2 and M4 Intrinsically Photosensitive Retinal Ganglion Cells in the Mouse Retina
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.14
PMID:39908128
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研究论文 | 本研究旨在表征小鼠视网膜中不同亚型的光敏性视网膜神经节细胞（ipRGCs）中骨桥蛋白的表达模式 | 研究发现骨桥蛋白不仅在M4-ipRGCs中表达，还在M2-ipRGCs中表达，挑战了骨桥蛋白仅作为αRGCs标记物的观点 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种或人类视网膜 | 研究目的是确定骨桥蛋白在ipRGCs亚型中的表达模式 | 小鼠视网膜中的光敏性视网膜神经节细胞（ipRGCs） | 神经科学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组织化学（IHC） | NA | RNA测序数据、图像数据 | C57BL/6J小鼠的视网膜切片和平面标本 |
| 4105 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human blood eosinophils reveals plasticity and absence of canonical cell subsets
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16213
PMID:38934897
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4106 | 2025-02-11 |
Changes in border-associated macrophages after stroke: single-cell sequencing analysis
2025-Jan-29, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01092
PMID:39927762
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研究论文 | 本文通过单细胞测序分析研究了中风后边界相关巨噬细胞的变化 | 首次全面分析了中风后边界相关巨噬细胞的转录变化及其在炎症相关通路中的调控作用 | 许多细节和潜在机制仍不清楚 | 研究中风后边界相关巨噬细胞的变化及其在神经炎症中的作用 | 小鼠边界相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 中风 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE174574和GSE225948数据集 |
| 4107 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4108 | 2025-02-11 |
Whole-exome sequencing association study reveals genetic effects on tumor microenvironment components in nasopharyngeal carcinoma
2025-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182768
PMID:39744943
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研究论文 | 本文通过全外显子测序关联研究揭示了鼻咽癌肿瘤微环境成分的遗传影响 | 揭示了与鼻咽癌易感性相关的3种遗传变异，并引入了一种改进的复合多基因风险评分（rcPRS），在预测鼻咽癌风险方面优于现有模型 | NA | 研究鼻咽癌的遗传基础及其与肿瘤微环境成分的相互作用 | 鼻咽癌患者和对照组 | 基因组学 | 鼻咽癌 | 全外显子测序、批量转录组测序、单细胞RNA测序 | 复合多基因风险评分（rcPRS） | 基因组数据、转录组数据 | 6,969例鼻咽癌患者和7,100例对照 |
| 4109 | 2025-02-11 |
Integrative analysis of SEPN1 in glioma: Prognostic roles, functional implications, and potential therapeutic interventions
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318501
PMID:39919065
|
研究论文 | 本研究探讨了SEPN1在胶质瘤中的表达、预后意义及其在肿瘤微环境中的作用，并开发了基于SEPN1相关长链非编码RNA的风险评分（SRS） | 首次将SEPN1作为胶质瘤的新型生物标志物和治疗靶点进行研究，并开发了SEPN1相关的风险评分（SRS）用于预后评估 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，缺乏实验验证 | 探讨SEPN1在胶质瘤中的表达、预后意义及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序分析、富集分析 | NA | RNA测序数据、生存分析数据 | TCGA、CGGA、GEO和ZN-GC队列的数据 |
| 4110 | 2025-02-11 |
Single-cell transcriptomes of dissecting the intra-tumoral heterogeneity of breast cancer microenvironment
2024-Dec-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06015-7
PMID:39724260
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，探讨了乳腺癌微环境中的肿瘤内异质性机制 | 识别了恶性上皮细胞的六种常见表达程序和六种亚型特异性表达程序，揭示了乳腺癌中髓系细胞谱系的深刻细胞异质性 | 样本量较小，仅包括4名恶性和4名非恶性患者的样本 | 研究乳腺癌异质性发展的机制及其在单细胞转录组中的作用 | 乳腺癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | 非负矩阵分解（NMF） | 单细胞转录组数据 | 54,055个高质量细胞，来自4名恶性和4名非恶性患者的临床样本 |
| 4111 | 2025-02-11 |
Integrated analysis reveals prognostic correlation and immune characteristics of a tumor-associated macrophage-based risk signature in triple-negative breast cancer
2024-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1037
PMID:39525038
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据识别了三阴性乳腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞簇，构建了与预后相关的风险特征，并验证了其与免疫特征的关系 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别了三阴性乳腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞簇，并构建了一个8基因风险特征，验证了其作为独立预后因素的价值 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，样本量和数据来源可能限制了结果的普适性 | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的特性，构建与预后相关的风险特征，并验证其与免疫特征的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），逆转录聚合酶链反应（RT-PCR），蛋白质印迹（Western blot），免疫组织化学 | LASSO回归 | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 4112 | 2025-02-11 |
Cystic fibrosis-related diabetes is associated with reduced islet protein expression of GLP-1 receptor and perturbation of cell-specific transcriptional programs
2024-10-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76722-1
PMID:39463434
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研究论文 | 本文研究了囊性纤维化相关糖尿病（CFRD）中胰岛GLP-1受体蛋白表达的减少及其对胰岛素分泌的影响 | 通过空间转录组学技术揭示了CFRD患者胰岛中α和β细胞基因的差异表达，并发现GLP-1受体蛋白水平的降低可能是胰岛素分泌受损的原因 | 研究样本量未明确说明，且仅针对CFRD患者，未涉及其他类型的糖尿病 | 探讨CFRD中胰岛GLP-1及其信号成分的表达变化，以改善CFRD的治疗方法 | CFRD患者的胰腺组织 | 生物医学 | 囊性纤维化相关糖尿病 | 免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 未明确说明 |
| 4113 | 2025-02-11 |
Sympathetic neuropeptide Y protects from obesity by sustaining thermogenic fat
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07863-6
PMID:39198648
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研究论文 | 本文揭示了交感神经元中的神经肽Y（NPY）如何通过维持产热脂肪来防止肥胖的机制 | 发现了NPY在交感神经元中通过维持血管周围细胞来保护肥胖的新机制，并揭示了NPY在能量消耗中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 研究NPY在交感神经元中防止肥胖的机制 | 小鼠的棕色脂肪组织（BAT）和白色脂肪组织（WAT） | 生物医学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序、成像技术 | 小鼠模型 | 基因表达数据、成像数据 | 小鼠脂肪组织样本 |
| 4114 | 2025-02-11 |
The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.026
PMID:38776918
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研究论文 | 本文研究了外周CD8+ T细胞耐受性检查点，揭示了其与自身免疫疾病和抗癌免疫的关系 | 通过流式细胞术、单细胞RNA测序和染色质可及性分析，发现耐受性触发了一种与耗竭、记忆和功能性效应细胞不同的分化状态 | 研究主要关注于小鼠模型，可能需要在人类样本中进一步验证 | 探讨外周CD8+ T细胞耐受性检查点的分子机制及其在自身免疫疾病和抗癌免疫中的作用 | 外周CD8+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病, 癌症 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 染色质可及性分析 | NA | RNA测序数据, 染色质可及性数据 | NA |
| 4115 | 2025-02-11 |
β-cell Jagged1 is sufficient but not necessary for islet Notch activity and insulin secretory defects in obese mice
2024-Mar, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101894
PMID:38311286
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研究论文 | 本文研究了肥胖小鼠和2型糖尿病患者胰岛中Jagged1的表达及其对Notch信号通路和胰岛素分泌缺陷的影响 | 研究发现Jagged1是肥胖小鼠和2型糖尿病患者胰岛中Notch活性增加的唯一配体，并通过中和抗体实验证明抑制Jagged1-Notch信号可能具有治疗益处 | 遗传功能丧失实验表明β细胞可能不是Jagged1信号的来源，这限制了Jagged1作为治疗靶点的潜力 | 研究Jagged1在肥胖小鼠和2型糖尿病患者胰岛中的表达及其对Notch信号通路和胰岛素分泌缺陷的影响 | 肥胖小鼠和2型糖尿病患者的胰岛 | 生物医学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），葡萄糖耐量测试，单克隆中和抗体 | NA | 基因表达数据，生理数据 | 高脂饮食喂养的小鼠和瘦素受体缺陷小鼠，以及有和无2型糖尿病患者的胰岛 |
| 4116 | 2025-02-11 |
Single-cell RNA-seq and single-cell bisulfite-sequencing reveal insights into yak preimplantation embryogenesis
2024-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105562
PMID:38097189
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞亚硫酸盐测序揭示了牦牛胚胎植入前发育过程中的基因表达和DNA甲基化变化 | 结合单细胞DNA甲基化和转录组分析，鉴定了43个可能与胚胎发育相关的候选甲基化驱动基因，并确定了与组蛋白去乙酰化酶HDAC1/2相关的表观遗传修饰对胚胎发育的重要性 | 研究主要聚焦于牦牛胚胎，可能限制了其在其他物种中的普适性 | 研究牦牛胚胎植入前发育过程中的表观遗传重编程及其对转录调控网络的影响 | 牦牛的卵母细胞和不同发育阶段的胚胎 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞亚硫酸盐测序 | NA | 单细胞基因表达数据, 单细胞DNA甲基化数据 | 牦牛的卵母细胞和一系列不同发育阶段的胚胎 |
| 4117 | 2025-02-11 |
Human placental cells are resistant to SARS-CoV-2 infection and replication
2024, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20514.2
PMID:39640372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术，探讨了人类胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性及其支持病毒释放的能力 | 首次量化了胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性，并确定了其支持病毒释放的能力 | 研究主要依赖于体外实验，可能无法完全反映体内情况 | 探讨SARS-CoV-2在胎盘细胞中的感染和复制能力 | 人类胎盘细胞 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），共聚焦显微镜 | NA | RNA测序数据，显微镜图像 | 包括早期妊娠和足月胎盘细胞，以及JEG-3、JAR和HUVEC细胞系 |
| 4118 | 2025-02-11 |
Preventing recurrence in Sonic Hedgehog Subgroup Medulloblastoma using the OLIG2 inhibitor CT-179
2023-Jun-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2949436/v1
PMID:37333134
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研究论文 | 本研究探讨了小分子OLIG2抑制剂CT-179在预防Sonic Hedgehog亚型髓母细胞瘤复发中的抗肿瘤潜力 | 首次使用CT-179靶向治疗耐药性髓母细胞瘤干细胞，结合CDK4/6抑制剂palbociclib，显著延缓复发 | 研究主要基于体外器官模型和动物模型，尚未进行临床试验 | 预防Sonic Hedgehog亚型髓母细胞瘤的复发 | Sonic Hedgehog亚型髓母细胞瘤患者来源的器官模型、异种移植肿瘤模型和基因工程小鼠 | 癌症研究 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 患者来源的器官模型、异种移植肿瘤模型和基因工程小鼠 |
| 4119 | 2025-02-11 |
Phospho-seq: Integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534442
PMID:37034703
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Phospho-seq的集成方法，旨在量化磷酸化的细胞内和核内蛋白质，并将其活性与顺式调控元件和转录目标联系起来 | Phospho-seq是一种创新的集成方法，能够同时分析蛋白质和scATAC-seq，并与scRNA-seq数据集整合，从而定义细胞状态和轨迹，重建基因调控关系，并表征神经发育中异质细胞信号传导的原因和后果 | NA | 研究细胞内蛋白质动态的多模态分析，以更好地理解细胞信号传导在细胞行为和命运调控中的作用 | 细胞系、诱导多能干细胞和3个月大的脑类器官 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq, 抗体偶联方法 | NA | 蛋白质数据、基因表达数据、染色质可及性数据 | 细胞系、诱导多能干细胞和3个月大的脑类器官 |
| 4120 | 2025-02-11 |
Here and there a trophoblast, a transcriptional evaluation of trophoblast cell models
2022-Nov-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04589-4
PMID:36346530
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综述 | 本文综述了人类滋养层细胞和干细胞（hTSCs）模型的转录组数据，评估了这些模型的实用性和适用性 | 整合了单细胞RNA测序数据集，以识别这些模型如何重现早期滋养层发育 | NA | 评估人类滋养层细胞和干细胞模型的转录组数据，以确定其在实际应用中的价值 | 人类滋养层细胞和干细胞模型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |