单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4081	2025-07-05	Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma 2024-06-17, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06699-2 PMID:38886351	研究论文	提出一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略，通过SAMD4B-APOA2-PD-L1轴增强抗肿瘤免疫	首次提出基于三种常见抗肿瘤药物的协同免疫化疗策略，并揭示其通过SAMD4B介导的2'-O-甲基化修饰调控免疫微环境的机制	研究主要基于PDX小鼠模型，临床样本量可能有限	开发针对晚期肝细胞癌的有效治疗方案	肝细胞癌患者和PDX小鼠模型	肿瘤免疫治疗	肝细胞癌	单细胞RNA测序、2'-O-甲基化修饰、多重免疫荧光染色	PDX小鼠模型	RNA测序数据、免疫荧光图像数据	未明确说明具体样本量，涉及PDX小鼠模型和临床患者数据
4082	2025-07-05	MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing 2024-06-12, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06775-7 PMID:38866777	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现MAL2在肝内胆管癌中特异性富集，并通过调控EGFR/SREBP-1通路促进脂质代谢，影响癌细胞增殖和迁移	首次揭示MAL2通过稳定EGFR膜定位激活PI3K/AKT/SREBP-1轴促进脂质积累的机制，并筛选出小分子抑制剂sarizotan	研究主要基于体外实验和类器官模型，尚未进行大规模临床验证	探究MAL2在肝内胆管癌发生发展中的作用机制及治疗靶点	肝内胆管癌细胞及类器官模型	肿瘤生物学	肝内胆管癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、代谢组学、分子对接、Co-IP	类器官模型	RNA测序数据、代谢物数据	未明确说明具体样本数量
4083	2025-07-05	Temporal Single-Cell Sequencing Analysis Reveals That GPNMB-Expressing Macrophages Potentiate Muscle Regeneration 2024-Mar-28, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-4108866/v1 PMID:38585871	研究论文	通过单细胞RNA测序分析揭示表达GPNMB的巨噬细胞在肌肉再生中的关键作用	发现了一个表达GPNMB的巨噬细胞亚群，该亚群在巨噬细胞介导的肌肉再生中发挥关键作用	研究未详细探讨GPNMB信号通路在肌肉再生中的具体分子机制	探究巨噬细胞在骨骼肌修复过程中的表型多样性和功能	骨骼肌损伤后的巨噬细胞	单细胞测序	肌肉损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	不同时间点的骨骼肌单细胞样本
4084	2025-07-04	Large-scale dependency and drug screens to characterize the therapeutic vulnerabilities of multiple myeloma with 1q 2025-Jul-03, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025102 PMID:40073369	研究论文	通过大规模依赖性和药物筛选，系统性表征了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性，并发现其对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性增加	首次系统性揭示了1q+多发性骨髓瘤对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性，并阐明了其作用机制	研究主要基于体外实验，尚未进行临床验证	开发针对1q+多发性骨髓瘤的靶向治疗策略	1q+多发性骨髓瘤患者	肿瘤学	多发性骨髓瘤	大规模依赖性筛选、药物筛选、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
4085	2025-07-04	IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes 2025-Jul-03, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027689 PMID:40163892	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的免疫景观，揭示了IL-6和IFN-II信号通路在疾病进展中的关键作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了iMCD患者中CCL单核细胞通过IFN-II信号与NK/NKT细胞相互作用，以及IFN-γ水平与疾病严重程度和治疗抵抗的正相关性	样本量较小（15例iMCD患者和4例健康对照），且部分发现需要在大规模独立队列中进一步验证	深入了解iMCD的免疫机制，建立早期预后分层并发现新的治疗靶点	特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的外周血单个核细胞（PBMCs）、淋巴结和骨髓样本	免疫学	特发性多中心Castleman病（iMCD）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	15例iMCD患者和4例健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs），以及部分淋巴结和骨髓样本
4086	2025-07-04	Single-cell transcriptomics reveals depletion and dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-specific Th1 and Th17 cells early after acquisition of HIV 2025-Jul-03, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiaf354 PMID:40605619	研究论文	该研究通过单细胞转录组学揭示了HIV感染早期对结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭和功能失调	首次在HIV感染早期阶段，通过单细胞RNA测序技术揭示了结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞的耗竭和功能失调机制	研究样本量有限，且仅关注了HIV感染早期的变化	探究HIV感染如何影响对结核分枝杆菌的CD4 T细胞免疫应答	HIV感染者和非感染者的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞	免疫学	结核病/HIV感染	流式细胞术、单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	一组HIV感染者和非感染者的样本（具体数量未明确说明）
4087	2025-07-04	Engineering a Lipid Nanoparticle with Atypical Calcium Crystal Structure for Enhanced IFNβ-Mediated Immunotherapy 2025-Jul-03, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202419870 PMID:40605669	研究论文	本研究开发了一种具有非典型晶体结构和pH响应特性的纳米材料NanoCa，用于增强IFNβ介导的免疫治疗	发现NanoCa通过Ca-calcineurin-NFATc2-PKCβ-IRF3信号通路触发干扰素，增强抗肿瘤免疫反应	未明确提及具体局限性	探索金属离子通过干扰素激活促进树突状细胞成熟的机制，并开发新型抗肿瘤免疫治疗策略	钙磷酸盐脂质体纳米材料(NanoCa)及其在肿瘤模型中的免疫调节作用	纳米医学	癌症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	CT26肿瘤模型	基因表达数据	多种肿瘤模型(具体数量未明确)
4088	2025-07-04	A Comparative Analysis Dissecting the Immune Landscape of Vitiligo and Melanoma from a single-cell Perspective: Two Sides of the Same Coin? 2025-Jul-03, Inflammation IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s10753-025-02332-2 PMID:40608219	研究论文	通过单细胞RNA测序技术比较分析白癜风和黑色素瘤的免疫微环境差异	首次从单细胞角度全面比较白癜风和黑色素瘤的免疫微环境，揭示两者在免疫激活与逃逸机制上的根本差异	样本来源和数量未明确说明，可能影响结果的普适性	解析白癜风和黑色素瘤免疫微环境的异同点	健康对照者、白癜风患者和黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据	数字病理学	皮肤病（白癜风和黑色素瘤）	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	未明确说明具体样本数量
4089	2025-07-04	Nonhuman Primates Model of Super-selective Intraarterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection 2025-Jul-02, Aesthetic surgery journal IF:3.0Q1 DOI:10.1093/asj/sjaf132 PMID:40601619	研究论文	本研究提出了一种非人灵长类动物的视网膜缺血再灌注模型，用于研究透明质酸填充剂美容注射导致的眼动脉栓塞的治疗方法	首次建立了非人灵长类动物眼动脉缺血再灌注的临床相关模型，并生成了缺血损伤的视网膜细胞图谱	研究仅使用恒河猴作为模型，可能无法完全模拟人类临床情况	验证动脉内溶栓治疗对透明质酸注射导致的视力障碍的有效性	恒河猴眼动脉栓塞模型	眼科研究	眼动脉栓塞	数字减影血管造影(DSA)、眼底荧光素血管造影(FFA)、视网膜电图(ERG)、苏木精-伊红(HE)染色、透射电子显微镜(TEM)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	恒河猴动物模型	影像数据、电生理数据、组织学数据、单细胞测序数据	未明确说明具体样本数量，使用恒河猴作为研究对象
4090	2025-07-04	Pathogenic mechanism of extracranial arteriovenous malformations: insights from clinical, pathological, and genetic analyses 2025-Jul-02, Virchows Archiv : an international journal of pathology IF:3.4Q1 DOI:10.1007/s00428-025-04158-7 PMID:40603544	研究论文	本研究通过临床、病理和遗传分析探讨了颅外动静脉畸形（AVMs）的致病机制	揭示了MAP2K1、KRAS和BRAF突变与AVMs的基因型-表型相关性，并发现MAP4K4在异常小血管中的高表达	样本量较小（30例患者），且为回顾性研究	阐明颅外AVMs的发病机制及其与基因突变的关系	30例颅外AVMs患者	血管病理学	动静脉畸形	免疫组织化学、空间转录组学	NA	临床数据、病理数据、遗传数据	30例颅外AVMs患者
4091	2025-07-04	Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma 2025-Jul-02, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002903 PMID:40607924	research paper	该研究通过整合多组学数据，揭示了MS4A2在肺腺癌中的功能景观及其预后价值	首次在四种生存指标（OS/DSS/PFI/DFI）上全面评估了MS4A2在肺腺癌中的预后分层，并揭示了其通过双趋化因子极化调控免疫抑制微环境的机制	研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证MS4A2的功能机制	阐明MS4A2在肺腺癌中的功能角色和临床意义	肺腺癌（LUAD）患者	digital pathology	lung cancer	bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 甲基化表观遗传分析	Cox回归模型, Kaplan-Meier模型	转录组数据, 表观遗传数据, 药物敏感性数据	TCGA/GTEx数据库中的33种癌症数据及NSCLC队列的单细胞数据
4092	2025-07-04	Single-cell transcriptomic analysis reveals therapeutic mechanisms of adipose-derived stem cell exosomes in sepsis-induced lung injury 2025-Jul-02, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002894 PMID:40607951	研究论文	本研究探讨了脂肪源性干细胞外泌体对脓毒症诱导的肺损伤的治疗效果及其潜在机制	首次使用单细胞转录组分析揭示ADSC外泌体通过调节免疫细胞功能和细胞间通讯网络治疗脓毒症肺损伤的新机制	样本量较小（每组仅2个样本进行单细胞RNA测序），且仅使用雄性小鼠模型	探索脓毒症诱导的急性肺损伤的新型治疗方法	脓毒症诱导的急性肺损伤小鼠模型	单细胞转录组学	脓毒症	单细胞RNA测序	小鼠盲肠结扎穿孔(CLP)模型	转录组数据	每组12只小鼠用于生存率分析，5只用于肺组织病理学分析，2只用于单细胞RNA测序
4093	2025-07-04	FLI1 and GATA1 govern TLN1 transcription: new insights into FLI1-related platelet disorders 2025-Jul-01, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2024.286372 PMID:39744817	研究论文	本研究旨在阐明FLI1变异对人类巨核细胞和血小板的影响，揭示了FLI1与GATA1在TLN1转录调控中的新机制	发现FLI1变异通过影响与GATA1的协同转录活性导致talin-1缺乏，从而影响血小板功能，并提出talin-1可作为FLI1变异致病性的生物标志物	研究仅针对四种FLI1变异，可能无法涵盖所有相关变异的影响	阐明FLI1变异导致血小板功能障碍的分子机制	人类巨核细胞和血小板	分子生物学	血小板功能障碍	单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、荧光素酶报告基因检测	NA	基因表达数据、蛋白质水平数据	患者巨核细胞和血小板样本
4094	2025-07-04	Enhancing genetic transformation efficiency in cucurbit crops through AtGRF5 overexpression: Mechanistic insights and applications 2025-Jul, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1 DOI:10.1111/jipb.13912 PMID:40213927	研究论文	本研究通过过表达AtGRF5基因，提高了葫芦科作物的遗传转化效率，并揭示了其机制	发现AtGRF5过表达通过促进愈伤组织增殖和增加再生过程中的密集细胞来显著提高遗传转化效率，并开发了ABA诱导的AtGRF5表达系统以减少多效性影响	AtGRF5过表达可能引起生长缺陷，需要进一步优化以减少副作用	提高葫芦科作物的遗传转化效率并揭示其分子机制	葫芦科作物	植物遗传学	NA	DNSO方法、高分辨率时间序列转录组学、单细胞RNA测序、DAP-seq	NA	转录组数据、单细胞RNA测序数据	未明确说明具体样本数量
4095	2025-07-04	Distinct transcriptional changes in hematopoietic progenitor subsets on LPS-induced emergency granulopoiesis 2025-Jul, Experimental hematology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.exphem.2025.104792 PMID:40316244	研究论文	研究探讨了不同多能祖细胞（MPPs）在LPS诱导的紧急粒细胞生成早期阶段的转录变化及其作用	揭示了LPS暴露如何通过转录重编程影响MPPs的谱系输出，特别是发现炎症祖细胞群体的出现及其染色质可及性变化	研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本或其他感染模型	探究MPPs在LPS诱导的紧急粒细胞生成中的作用及其分子机制	野生型小鼠的多能祖细胞（MPPs）	免疫学	感染性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、移植实验、伪时间分析	NA	单细胞转录组数据	野生型小鼠的MPPs样本
4096	2025-07-04	Differentiable graph clustering with structural grouping for single-cell RNA-seq data 2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btaf347 PMID:40511990	研究论文	提出了一种名为DGCSG的新型可微分图聚类方法，用于单细胞RNA测序数据分析，通过结合图聚类信息优化细胞亚群划分	设计了可微分聚类机制，将K-way归一化割从离散优化问题转化为可微分学习目标，并通过谱松弛联合优化GATE	未明确提及方法在大规模数据集上的计算效率或可扩展性	改进单细胞RNA测序数据中的细胞亚群聚类效果	单细胞RNA测序数据中的细胞亚群	生物信息学	NA	scRNA-seq	GATE (图注意力自编码器), AE (自编码器)	单细胞RNA测序数据	14个scRNA-seq基准数据集
4097	2025-07-04	Putting AML Differentiation States on the BoneMarrowMap 2025-Jul-01, Blood cancer discovery IF:11.5Q1 DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0083 PMID:40294281	研究论文	本文介绍了一种名为'BoneMarrowMap'的新型计算工具，用于将白血病单细胞RNA测序数据集映射到造血分化状态	开发了BoneMarrowMap工具，发现了12种与预后和治疗相关的急性髓系白血病分化模式，并解析了患者个体内的白血病克隆结构	NA	研究急性髓系白血病的分化状态及其与预后和治疗的关系	白血病单细胞RNA测序数据集	数字病理学	急性髓系白血病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
4098	2025-07-04	T-cell differentiation stage block bias confers hypermethylation and mediastinal preference in T-cell lymphoblastic lymphoma 2025-Jul, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70380 PMID:40579780	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序，揭示了T-LBL中恶性T细胞主要阻滞在DN和DP阶段，并探讨了这种阻滞模式如何导致免疫抑制微环境和纵隔偏好	首次从分化阻滞的角度揭示T-LBL与T-ALL的异质性，并发现E2F2上调UHRF1表达导致肿瘤抑制基因高甲基化的新机制	研究样本量有限，且主要基于单中心数据	重新评估T-LBL和T-ALL之间的差异，并探索其分子机制	T细胞淋巴母细胞淋巴瘤（T-LBL）和T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）	肿瘤学	淋巴瘤	单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序，流式细胞术	NA	单细胞测序数据，表达阵列数据，流式细胞数据	NCH-TALL-LBL队列（具体样本数量未明确说明）
4099	2025-07-04	Spatially informed phenotyping by cyclic-in-situ-hybridisation identifies novel fibroblast populations and their pathogenic niches in systemic sclerosis 2025-Jul-01, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1016/j.ard.2025.06.002 PMID:40603206	研究论文	本研究利用循环原位杂交技术（cISH）进行单细胞空间转录组分析，识别了系统性硬化症（SSc）皮肤中新的成纤维细胞亚群及其致病性微环境	首次采用cISH技术实现单细胞分辨率下的原位转录组分析，并结合BANKSY算法进行空间信息聚类，发现了SFRP2+网状真皮成纤维细胞和CCL19+非血管周围成纤维细胞两个新亚群	研究样本可能不足以代表所有SSc亚型，且机制验证主要基于转录组数据	解析系统性硬化症皮肤纤维化过程中成纤维细胞亚群的时空特征与致病机制	系统性硬化症患者和健康人的皮肤成纤维细胞	数字病理学	系统性硬化症	循环原位杂交（cISH）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	BANKSY聚类算法	空间转录组数据、单细胞转录组数据	未明确说明样本数量（SSc患者和健康对照的皮肤样本）
4100	2025-07-04	Innovative Single-Cell Sequencing Techniques for B-Cell Analysis and Their Implications for Rational HIV-1 Vaccine Design 2025-Jul-01, Current HIV research IF:0.8Q4 DOI:10.2174/011570162X362655250620115404 PMID:40605159	综述	本文综述了单细胞测序技术在B细胞分析中的最新进展及其在HIV-1疫苗设计中的应用	介绍了革命性的单细胞分析技术，能够以前所未有的方式探索免疫细胞多样性，特别是在B细胞反应方面的详细表征	NA	促进下一代疫苗的设计，特别是针对HIV-1的疫苗	B细胞及其在感染和疫苗接种中的反应	生物信息学	HIV-1感染	单细胞测序	NA	单细胞数据	NA