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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 4081 - 4100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4081 | 2026-02-03 |
Development and application of a barcoded rabies viral tracing method for mapping brain-wide inputs to single neurons
2025-Dec-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101244
PMID:41338190
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研究论文 | 本研究开发了一种条形码狂犬病毒示踪方法，用于在单细胞水平上绘制全脑对单个神经元的输入连接图谱 | 将逆行病毒示踪与单细胞RNA测序相结合，创建了条形码狂犬病毒示踪方法，首次实现了在单细胞分辨率下对转录组定义的神经元进行局部和长程输入连接的同时绘制 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够绘制单个神经元输入连接图谱的方法，以构建细胞分辨率的大脑介观连接组 | 小鼠内侧前额叶皮层神经元 | 神经科学 | NA | 逆行病毒示踪，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，连接数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4082 | 2026-02-03 |
Investigating the role of inflammatory bowel disease-associated gene expression in oral cancer using single-cell RNA sequencing
2025-Dec-15, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04131-5
PMID:41396398
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨炎症性肠病相关基因在口腔癌中的表达及其潜在治疗靶点 | 首次在口腔癌中通过单细胞RNA测序分析炎症性肠病相关基因的表达，揭示了NFKBIA与趋化因子介导信号通路的关联 | 样本来源和数量未在摘要中明确说明，可能限制结果的普遍性 | 研究炎症性肠病相关基因在口腔癌中的作用，以识别潜在治疗靶点 | 口腔癌组织样本 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | UMAP, t-SNE | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4083 | 2026-02-03 |
Decoding osteosarcoma from heterogeneity to precision therapy
2025-Dec-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04256-7
PMID:41379383
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综述 | 本文综述了骨肉瘤的分子亚型研究进展，强调了亚型特异性致癌驱动因素及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用，并探讨了基于分子谱的精准医学策略潜力 | 整合了多组学数据（包括单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱）来解码骨肉瘤的异质性，并识别了新的生物标志物 | NA | 解码骨肉瘤的异质性，并探索针对其分子亚型的精准治疗策略 | 骨肉瘤（OS），一种青少年中最常见的恶性骨肿瘤 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 多组学研究，包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间分析, 表观遗传图谱 | NA | NA |
| 4084 | 2026-02-03 |
Single-cell transcriptomics identifies altered neutrophil dynamics and accentuated T-cell cytotoxicity in tobacco flavored e-cigarette exposed mouse lungs
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638715
PMID:40027777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了小鼠肺部在急性暴露于不同口味电子烟气溶胶后，免疫细胞（特别是髓系和淋巴系细胞）的动态变化及风味依赖性影响 | 首次利用单细胞转录组学全面解析了不同口味电子烟暴露下小鼠肺部的细胞特异性免疫变化，并发现了烟草口味电子烟导致的嗜中性粒细胞动态改变和T细胞毒性增强 | 研究仅基于小鼠模型，样本量较小（每组2只/性别），且为急性暴露实验，长期效应尚不明确 | 探究不同口味电子烟气溶胶急性暴露对小鼠肺部免疫景观的影响 | C57BL/6J小鼠的肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，图像数据 | 71,725个细胞，来自对照组和处理组（每组每性别2只小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4085 | 2026-02-03 |
A molecular, spatial and regulatory atlas of the Hydra vulgaris nervous system
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204983
PMID:41071669
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术，对Hydra vulgaris神经系统进行了全面的分子和空间图谱绘制 | 首次提供了Hydra vulgaris神经系统最全面的分子和空间特征，识别了8种神经元类型和15种转录亚型，并整合了基因调控网络分析 | 研究主要基于单细胞测序数据，可能未完全覆盖所有神经元功能或动态变化 | 揭示Hydra vulgaris神经系统的发育、稳态、再生和功能的分子机制 | Hydra vulgaris的神经系统 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4086 | 2026-02-03 |
Multi-scaled transcriptomics of chronically inflamed nasal epithelium reveals immune-epithelial dynamics and tissue remodeling in nasal polyp formation
2025-Oct-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.009
PMID:40945518
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了慢性鼻窦炎中免疫细胞与上皮细胞之间的相互作用及组织重塑机制，特别是在鼻息肉形成过程中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学，系统解析了慢性鼻窦炎中免疫-上皮细胞互作网络，并识别了与鼻息肉形成相关的基底细胞轨迹 | 研究主要基于人类组织样本，可能受样本异质性影响，且机制验证仍需进一步功能实验 | 探究慢性鼻窦炎的病理生理机制，特别是免疫-上皮细胞相互作用在疾病进展和组织重塑中的作用 | 慢性鼻窦炎患者（伴或不伴鼻息肉）及对照个体的鼻窦组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 超过100名慢性鼻窦炎患者及对照个体的组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4087 | 2026-02-03 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
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研究论文 | 本文报道了乳腺癌中肿瘤细胞通过去分化程序表达白细胞表面受体蛋白，称为“免疫拟态”，并探讨其与肿瘤进展和治疗抵抗的关系 | 首次提出乳腺癌细胞通过“免疫拟态”表达白细胞表面受体蛋白，并证明这赋予肿瘤细胞增殖优势，促进早期肿瘤生长 | 需要更多乳腺癌队列验证其预后价值，并评估与远端转移、生存期和治疗反应的相关性 | 研究乳腺癌细胞去分化程序中的免疫拟态现象及其对肿瘤进展的影响 | 人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织病理学标本、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺癌症模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据、图像、细胞系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4088 | 2026-02-03 |
Single-cell and clonal analysis of AL amyloidosis plasma cells and their bone marrow microenvironment
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024719
PMID:40493887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和克隆分析，揭示了AL淀粉样变性患者浆细胞及其骨髓微环境的转录特征和功能改变 | 首次在治疗初治的AL淀粉样变性患者中，结合单细胞RNA测序和定量蛋白质组学，系统描绘了克隆性浆细胞及其骨髓微环境的转录景观，并识别出与蛋白质稳态相关的关键基因表达变化 | 研究样本量有限，且为横断面研究，未能追踪疾病进展或治疗后的动态变化 | 阐明AL淀粉样变性中克隆性浆细胞的功能特性及其与骨髓微环境的相互作用 | 新诊断、未经治疗的AL淀粉样变性患者和健康对照者的骨髓样本 | 单细胞组学 | AL淀粉样变性 | 5' 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 新诊断、未经治疗的AL淀粉样变性患者和健康对照者（具体人数未在摘要中明确给出） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5' 单细胞RNA测序 |
| 4089 | 2026-02-03 |
A novel multislice framework for precision 3D spatial domain reconstruction and disease pathology analysis
2025-Aug-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280281.124
PMID:40659497
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研究论文 | 本文提出了一种名为STMSC的多切片联合分析框架，用于精确三维空间域重建和疾病病理分析 | STMSC框架引入了预校正机制，通过结合H&E成像数据增强切片对齐精度，利用图注意力自编码器平衡不同层次的生物信息，从而精确识别复杂空间域并深入解析癌症环境 | NA | 开发一个多切片联合分析框架，以实现精确的三维空间域重建和疾病病理分析 | 连续组织切片和病理数据集 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 图像、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4090 | 2026-02-03 |
A replication study of novel fetal hemoglobin-associated genetic variants in sickle cell disease-only cohorts
2025-Apr-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf015
PMID:39886999
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研究论文 | 本研究验证了在镰状细胞病（SCD）患者中，胎儿血红蛋白（HbF）水平与五个新基因位点（ASB3、BACH2、PFAS、ZBTB7A和KLF1）的遗传变异之间的关联，并利用CRISPR抑制和单细胞转录组学技术探索了这些非编码变异在调控β-珠蛋白基因表达中的功能 | 首次在独立的SCD队列中复制了先前GWAS发现的20个HbF相关新变异中的五个，并利用CRISPR抑制和单细胞转录组学技术验证了BACH2和KLF1位点非编码变异的功能性作用 | 未能通过全外显子组测序在SCD患者中鉴定出对HbF水平有显著影响的罕见遗传变异 | 验证镰状细胞病（SCD）患者中胎儿血红蛋白（HbF）水平与新基因位点的遗传关联，并探索这些变异的功能机制 | 镰状细胞病（SCD）患者，具体包括3740名SCD患者用于遗传关联验证，以及1354名SCD患者用于全外显子组分析，同时使用红细胞系HUDEP-2细胞进行功能研究 | 遗传学 | 镰状细胞病 | 全基因组关联研究（GWAS）、CRISPR抑制、单细胞转录组学、全外显子组测序 | NA | 遗传变异数据、转录组数据、外显子组序列数据 | 3740名SCD患者用于遗传关联验证，1354名SCD患者用于全外显子组分析 | NA | 单细胞转录组学、全外显子组测序 | NA | NA |
| 4091 | 2026-02-03 |
Single-Cell RNA Profiling of Ocular Adnexal Sebaceous Carcinoma Reveals a Complex Tumor Microenvironment and Identifies New Biomarkers
2025-Feb, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.10.001
PMID:39393421
|
研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术深入分析了眼附件皮脂腺癌的转录组特征，揭示了其复杂的肿瘤微环境，并鉴定了CALML5作为敏感的诊断标志物 | 首次在单细胞分辨率下对眼附件皮脂腺癌进行转录组分析，揭示了肿瘤微环境的细胞组成和分子通路变化，并发现CALML5作为新的生物标志物 | 样本量较小（仅6例患者标本），且为回顾性观察性病例系列研究，可能限制结果的普遍性 | 探究眼附件皮脂腺癌的肿瘤组成、转录特征及潜在治疗靶点，以推动医疗进展 | 眼附件皮脂腺癌患者标本（包括原发性肿瘤、Paget样扩散肿瘤及正常组织） | 数字病理学 | 眼附件皮脂腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，免疫组织化学图像数据 | 6例患者标本（3例原发性肿瘤，2例Paget样扩散肿瘤，1例正常组织），共29,219个细胞；另加存档队列（28例OaSC，25例鳞状细胞癌和OSSN，12例基底细胞癌） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4092 | 2026-02-03 |
The critical role of endoplasmic reticulum stress and the stimulator of interferon genes (STING) pathway in kidney fibrosis
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.021
PMID:39566842
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研究论文 | 本研究探讨了内质网应激和STING通路在肾脏纤维化中的关键作用 | 揭示了STING作为内质网应激的上游激活因子，并发现STING与PERK的物理相互作用，以及STING激动剂诱导PERK激活的新机制 | 内质网应激在肾脏疾病中的精确激活机制仍不完全清楚 | 研究内质网应激在肾脏疾病中的激活机制及其在肾脏纤维化中的作用 | 慢性肾脏病患者、小鼠急性及慢性肾损伤模型（顺铂、单侧输尿管梗阻、叶酸和TFAM敲除小鼠） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 转录组学分析、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 慢性肾脏病患者及多种小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4093 | 2026-02-03 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Selective Lineage-Specific Regulation of Genes in Aortic Smooth Muscle Cells in Mice
2025-Feb, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321482
PMID:39744838
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，识别了小鼠主动脉平滑肌细胞中第二心场和心脏神经嵴谱系特异性基因的差异表达 | 首次在对照主动脉中探索了两种谱系来源的平滑肌细胞之间的转录组差异，并识别了谱系特异性上调基因 | 研究仅基于14周龄雄性小鼠，样本量有限，且未涉及疾病模型 | 探究主动脉平滑肌细胞中谱系特异性基因调控的差异 | 小鼠主动脉根部和升主动脉的平滑肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核转座酶可及染色质测序, RNA原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间表达数据 | 14只14周龄雄性小鼠（SHF追踪和CNC追踪各半） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4094 | 2026-02-03 |
Opportunities and challenges in the application of single-cell transcriptomics in plant tissue research
2025-Feb, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01558-6
PMID:40070535
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物组织研究中的应用、挑战及整合多源单细胞多模态数据的方法 | 总结了整合多源单细胞RNA测序和单细胞多模态数据的方法，以构建全面的细胞图谱并探索跨模态的因果关系和基因调控机制 | 单细胞RNA测序实验通常无法全面捕获所有细胞和基因，且单模态数据不足以解释细胞状态和系统变化 | 探讨单细胞转录组学在植物组织研究中的机遇与挑战，以及整合方法在揭示生物变化中的应用和价值 | 植物组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多模态 | NA | NA |
| 4095 | 2026-02-03 |
A regularized Bayesian Dirichlet-multinomial regression model for integrating single-cell-level omics and patient-level clinical study data
2025-Jan-07, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf005
PMID:39887052
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研究论文 | 提出一种正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归框架，用于整合单细胞RNA测序数据与患者临床数据，以探究细胞类型丰度与临床变量之间的关系 | 引入新型分层树结构以识别不同细胞类型水平上的关联，并首次将正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归应用于单细胞与临床数据的整合分析 | 未明确说明模型对数据规模和质量的敏感性，且仅在三类疾病中验证，普适性有待进一步验证 | 开发一种整合单细胞组学数据与患者临床数据的方法，以揭示细胞类型丰度与临床变量之间的关联 | 肺纤维化、COVID-19和非小细胞肺癌患者的单细胞RNA测序数据及临床数据 | 单细胞组学 | 肺纤维化, COVID-19, 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | 正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4096 | 2026-02-03 |
Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680305
PMID:41246341
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、单细胞转录组学和体外验证，系统鉴定了与骨质疏松症中赖氨酸乳酰化相关的关键差异表达基因，并探讨了其在代谢-免疫调控轴中的潜在作用 | 首次将乳酰化修饰与骨质疏松症的代谢-免疫调控轴联系起来，并通过多组学整合、单细胞转录组学和体外实验验证，揭示了AKR1A1基因在疾病中的关键作用及其通过SPP1-CD44信号通路介导免疫细胞间通讯的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，体外实验仅使用了RAW264.7巨噬细胞系，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 | 系统识别骨质疏松症中与赖氨酸乳酰化相关的关键差异表达基因，并探索其在疾病发病机制中的代谢和免疫调控作用 | 骨质疏松症相关的基因表达数据、乳酰化相关基因、RAW264.7巨噬细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 基因表达微阵列、单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫共沉淀 | 机器学习模型（113种组合） | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 五个骨质疏松症相关基因表达微阵列数据集和一个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4097 | 2026-02-03 |
Single-cell RNA sequencing comparison of the human metastatic prostate spine tumor microenvironment
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102805
PMID:38341849
|
研究论文 | 本文提出了一种从前列腺癌患者临床样本中，从手术室到实验台进行单细胞处理的方案，并比较了人类转移性前列腺脊柱肿瘤的微环境 | 针对脊柱肿瘤组织异质性高、难以处理的特点，开发了从手术室到实验台的单细胞处理方案，用于骨性脊柱转移瘤的研究 | NA | 开发用于临床样本单细胞组学研究的方案，以识别预后标志物和治疗靶点 | 前列腺癌患者的脊柱转移瘤临床样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4098 | 2026-02-03 |
A deep learning adversarial autoencoder with dynamic batching displays high performance in denoising and ordering scRNA-seq data
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109027
PMID:38361616
|
研究论文 | 本文提出了一种名为动态批处理对抗自编码器（DB-AAE）的深度神经网络生成框架，用于有效去噪和排序单细胞RNA测序数据 | DB-AAE直接捕获输入数据中的最优特征，增强特征保留能力，包括细胞类型特异性基因表达模式，并在去噪准确性和生物信号保留方面优于其他方法 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的去噪质量和下游分析的可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4099 | 2026-02-03 |
Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites
2024-02-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7481
PMID:38354249
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研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过减少血流再循环并激活内皮SCD1酶来催化保护性脂质代谢物，从而改善血管健康 | 首次揭示了运动通过调节血流动力学（如减少主动脉弓小弯处的血流再循环）并激活内皮SCD1酶，催化产生抗炎脂质代谢物（油酸和棕榈油酸），为血管保护提供新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；且SCD1的具体信号通路和长期效应需进一步探索 | 探究运动如何通过代谢转换器SCD1介导血管保护作用，并阐明其与血流动力学变化的关联 | 野生型小鼠、内皮特异性SCD1敲除小鼠、高脂饮食小鼠以及主动脉内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 非靶向代谢组学分析、单细胞转录组学、计算机模拟分析、腺病毒转染 | NA | 代谢组数据、转录组数据、血流动力学模拟数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4100 | 2026-02-03 |
Benchmarking algorithms for joint integration of unpaired and paired single-cell RNA-seq and ATAC-seq data
2023-10-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03073-x
PMID:37875977
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研究论文 | 本文对九种单细胞多组学数据整合方法进行了基准测试，评估了多组学数据在分析单模态数据中的指导作用以及从单模态数据中揭示峰-基因关联的能力 | 首次系统性地比较了现有单细胞多组学数据整合方法在整合未配对和配对的scRNA-seq与snATAC-seq数据方面的性能，并强调了多组学数据中足够细胞核数量对准确细胞类型注释的重要性 | 研究仅基于现有九种方法进行基准测试，可能未涵盖所有新兴整合方法；同时，结论可能受特定数据集和评估指标的限制 | 评估单细胞多组学数据整合方法在整合未配对和配对的scRNA-seq与snATAC-seq数据时的性能，以提供全面的细胞复杂性视图 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据、单核ATAC测序（snATAC-seq）数据以及配对的多组学数据 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核ATAC测序（snATAC-seq）、多组学测序 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |