单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4081	2025-03-23	APOE deficiency impacts neural differentiation and cholesterol biosynthesis in human iPSC-derived cerebral organoids 2023-08-21, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-023-03444-y PMID:37605285	研究论文	本研究探讨了APOE基因缺失对人类iPSC来源的脑类器官中神经分化和胆固醇生物合成的影响	首次在人类iPSC来源的脑类器官中揭示了APOE缺失对脑脂质稳态的影响，并发现了APOE4与APOE3在神经发生和胆固醇代谢上的差异	研究仅限于体外模型，未涉及体内环境的影响	探讨APOE基因在脑稳态中的作用及其与阿尔茨海默病的关系	人类iPSC来源的脑类器官	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	人类iPSC来源的脑类器官，包括APOE缺失和未缺失的样本
4082	2025-03-22	Screening Therapeutic Core Genes in Sepsis Using Network Pharmacology and Single-Cell RNA Sequencing 2025-Mar-20, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-025-11075-6 PMID:40113718	研究论文	本研究采用网络药理学和单细胞RNA测序技术，筛选脓毒症中的核心治疗基因，并探讨金银花的潜在治疗机制	结合网络药理学和单细胞RNA测序技术，首次系统性地筛选并验证了脓毒症中的核心治疗基因及其与金银花成分的潜在相互作用	研究结果需要进一步的实验验证，特别是金银花成分与核心基因的具体作用机制尚未明确	阐明金银花在脓毒症中的潜在治疗机制，并筛选核心治疗基因	脓毒症患者和健康对照者的血液样本	生物信息学	脓毒症	RNA测序、单细胞RNA测序、网络药理学	NA	RNA测序数据	22名脓毒症患者和10名健康对照者
4083	2025-03-22	The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment 2025-Mar-20, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-025-11086-3 PMID:40113719	研究论文	本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用，包括肿瘤微环境、预后和治疗反应	首次从肿瘤微环境、凝血功能差异、治疗和预后等多个角度全面探讨了凝血相关基因在GBM中的作用，并构建了基于五个CRGs的风险特征模型	研究主要依赖于公开数据集和体外实验，缺乏大规模的临床验证	探讨凝血相关基因在GBM中的作用及其对预后和治疗的影响	胶质母细胞瘤（GBM）患者及其肿瘤微环境	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、免疫组化、CCK8实验、伤口愈合实验、克隆形成实验	LASSO回归、随机生存森林分析	SNP、拷贝数变异数据、单细胞RNA测序数据	461例GBM患者（TCGA队列）和CGGA693队列
4084	2025-03-22	Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration 2025-Mar-18, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02085-2 PMID:40100436	研究论文	本研究探讨了STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能，发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中显著下调，并与较好的预后相关	首次系统地评估了STAT家族在结直肠癌中的表达水平和预后价值，并探索了其与免疫功能和免疫浸润水平的关系	研究主要依赖于公共数据库和有限的临床样本，可能影响结果的普遍性	研究STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能	结直肠癌样本	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序、空间转录组学技术	NA	基因表达数据、临床数据	TCGA数据库644样本、GTEx数据库308样本、中国临床样本30样本
4085	2025-03-22	Identification of a Subpopulation of Astrocyte Progenitor Cells in the Neonatal Subventricular Zone: Evidence that Migration is Regulated by Glutamate Signaling 2025-Jan-09, Neurochemical research IF:3.7Q2 DOI:10.1007/s11064-024-04326-2 PMID:39789409	研究论文	本研究通过基因工程小鼠模型，探索了新生儿脑室下区星形胶质细胞前体细胞的亚群及其迁移机制，特别是谷氨酸信号在其中的调控作用	首次发现并描述了新生儿脑室下区星形胶质细胞前体细胞的亚群，并提供了谷氨酸信号调控这些细胞迁移的新证据	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探索新生儿脑室下区星形胶质细胞前体细胞的亚群及其迁移机制	基因工程小鼠模型中的星形胶质细胞前体细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、器官型切片培养	NA	基因表达数据、荧光成像数据	1-3天大的小鼠皮质星形胶质细胞培养物
4086	2025-03-22	LKB1 inactivation promotes epigenetic remodeling-induced lineage plasticity and antiandrogen resistance in prostate cancer 2025-Jan, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-024-01025-z PMID:39743630	研究论文	本文探讨了LKB1失活在前列腺癌中促进表观遗传重塑诱导的谱系可塑性和抗雄激素耐药性的分子机制	揭示了LKB1失活导致AR独立的谱系可塑性和全局DNA低甲基化，并提出了通过靶向DNA低甲基化的潜在治疗策略	研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序，尚未在人类临床试验中验证	研究AR独立谱系可塑性的分子机制，并探索潜在的治疗策略	人类和小鼠前列腺癌样本	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序	基因工程小鼠模型	RNA测序数据、DNA甲基化数据	人类和小鼠前列腺癌样本
4087	2025-03-22	Identification and Evaluation of Lipocalin-2 in Sepsis-Associated Encephalopathy via Machine Learning Approaches 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S504390 PMID:40109658	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，识别并评估了在脓毒症相关脑病中起关键作用的Lipocalin-2（LCN2）基因	首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法，识别出LCN2作为中性粒细胞诱导的脓毒症相关脑病的关键基因，并通过体内实验验证了其作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	识别与脓毒症相关脑病（SAE）相关的关键基因，并探索潜在的治疗靶点	脓毒症患者和小鼠模型	机器学习	脓毒症相关脑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Western blotting、行为测试	多种二分类机器学习算法	基因表达数据、行为数据	脓毒症患者和小鼠模型
4088	2025-03-22	Integrated single-cell analysis reveals the regulatory network of disulfidptosis-related lncRNAs in bladder cancer: constructing a prognostic model and predicting treatment response 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1527036 PMID:40110199	研究论文	本研究通过单细胞测序和RNA测序数据，构建了一个与膀胱癌（BLCA）患者预后相关的二硫化物死亡相关长链非编码RNA（DRLs）模型	首次将二硫化物死亡相关基因（DRGs）与长链非编码RNA（lncRNAs）结合，构建了一个新的预后模型，并探讨了其在膀胱癌中的潜在应用	研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	探讨二硫化物死亡相关长链非编码RNA（DRLs）作为膀胱癌（BLCA）患者预后标志物的潜力	膀胱癌（BLCA）患者	生物信息学	膀胱癌	单细胞测序，RNA测序，RT-qPCR	LASSO回归，Cox回归	单细胞测序数据，RNA测序数据，临床信息	来自GEO和TCGA数据库的样本
4089	2025-03-22	Single-cell transcriptome analysis of stem cells from human exfoliated deciduous teeth investigating functional heterogeneity in immunomodulation 2024-12-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-82734-8 PMID:39732760	研究论文	本文通过单细胞转录组分析研究了人类脱落乳牙干细胞（SHED）在免疫调节中的功能异质性	揭示了SHED在不同分化状态下的免疫调节能力，并比较了其与人类骨髓来源间充质干细胞（hBMSCs）和人类脐带来源间充质干细胞（hUCMSCs）的免疫调节特性	研究主要基于体外实验，未涉及体内实验验证	探讨SHED在炎症和自身免疫疾病治疗中的潜力	人类脱落乳牙干细胞（SHED）	单细胞转录组学	炎症和自身免疫疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	未明确提及具体样本数量
4090	2025-03-22	Extrasinusoidal macrophages are a distinct subset of immunologically active dural macrophages 2024-12-20, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adh1129 PMID:39705337	研究论文	本文通过单细胞转录组学、命运图谱、共聚焦成像、克隆分析和转基因小鼠模型，全面表征了硬脑膜外窦巨噬细胞，揭示了它们在自身免疫性神经炎症中的作用	首次全面表征了硬脑膜外窦巨噬细胞，揭示了其与软脑膜和中枢神经系统实质巨噬细胞在起源、扩展动力学和转录谱上的差异，并发现其在自身免疫性神经炎症中执行凋亡粒细胞的吞噬作用	研究中使用的转基因小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病状态，且单细胞转录组学数据的解释可能存在偏差	研究硬脑膜外窦巨噬细胞的细胞和功能异质性，及其在生理和病理过程中的作用	硬脑膜外窦巨噬细胞	免疫学	自身免疫性神经炎症	单细胞转录组学、命运图谱、共聚焦成像、克隆分析、转基因小鼠模型	NA	单细胞转录组数据、成像数据	转基因小鼠模型
4091	2025-03-22	New Window Into Hepatitis B in Africa: Liver Sampling Combined With Single-Cell Omics Enables Deep and Longitudinal Assessment of Intrahepatic Immunity in Zambia 2024-Nov-15, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiae054 PMID:38332750	研究论文	本文介绍了在赞比亚卢萨卡进行的肝脏细针穿刺活检（FNAB）研究，结合单细胞组学技术，深入评估了慢性乙型肝炎病毒（HBV）感染患者的肝内免疫情况	首次在非洲地区将肝脏细针穿刺活检与单细胞RNA测序技术结合，用于评估HBV感染患者的肝内免疫反应	样本量相对较小，且仅在一个地区进行，可能无法完全代表整个非洲的HBV感染情况	深入了解非洲地区HBV感染的免疫学特征，为治愈策略提供信息	未接受过治疗的慢性HBV感染成人患者，包括有和无HIV共感染的患者，以及急性HBV感染患者	数字病理学	乙型肝炎	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	117例入组样本和47例纵向随访样本
4092	2025-03-22	Comprehensive analysis of the endothelin system in the kidneys of mice, rats, and humans 2024-07-31, Bioscience reports IF:3.8Q2 DOI:10.1042/BSR20240768 PMID:38904098	研究论文	本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据和免疫定位技术，对小鼠、大鼠和人类肾脏中的内皮素系统进行了全面分析	首次结合scRNA-seq和免疫定位技术，跨物种（小鼠、大鼠、人类）和性别分析肾脏内皮素系统的表达特征	商业抗体无法在所有物种中有效工作，RNA表达水平并不总是与蛋白质水平相关，需采用多种方法以确保研究的严谨性和可重复性	表征肾脏内皮素系统的表达特征，探讨其在慢性肾病病理生理和进展中的作用	小鼠、大鼠和人类肾脏样本	生物医学	慢性肾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫定位	NA	RNA测序数据、免疫定位数据	正常人类活检样本（两性）、啮齿动物肾脏样本
4093	2025-03-22	Heart failure promotes multimorbidity through innate immune memory 2024-05-24, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.ade3814 PMID:38787963	研究论文	本文探讨了心力衰竭（HF）如何通过造血干细胞（HSCs）的改变促进多发病，并揭示了其机制	研究发现HF通过改变HSCs的表观基因组，影响其生成促炎性巨噬细胞的能力，从而驱动反复的HF事件和相关并发症	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	揭示心力衰竭与多发病之间的病理相互作用机制	心力衰竭小鼠模型及其造血干细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），全局染色质可及性分析	小鼠模型	基因表达数据，染色质可及性数据	小鼠骨髓移植实验
4094	2025-03-22	Gene networks and systems biology in Alzheimer's disease: Insights from multi-omics approaches 2024-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association DOI:10.1002/alz.13790 PMID:38534018	综述	本文综述了阿尔茨海默病（AD）领域中的基因网络和系统生物学研究，探讨了多组学方法的应用及其发现	本文强调了单细胞组学和空间组学技术在AD研究中的应用，提供了对基因调控网络的全面研究	本文主要集中于技术应用的综述，未涉及具体实验数据或模型验证	探讨阿尔茨海默病的基因网络和系统生物学研究	阿尔茨海默病	系统生物学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序、表观基因组学、空间组学	NA	RNA转录本、染色质状态	NA
4095	2025-03-22	Clonal differences underlie variable responses to sequential and prolonged treatment 2024-Mar-20, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.01.011 PMID:38401539	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和条形码技术追踪了癌症细胞在长期和连续治疗中的抗性克隆，揭示了克隆间基因表达状态的差异如何影响对后续治疗的反应	结合单细胞RNA测序和条形码技术，首次系统地追踪了抗性克隆在长期和连续治疗中的命运，并识别了预测克隆存活的基因表达状态	研究主要基于实验室环境下的细胞模型，未涉及体内肿瘤微环境的复杂性	探究癌症细胞克隆间基因表达差异如何影响对连续或长期治疗的反应，并寻找预测克隆存活的基因表达状态	癌症细胞及其抗性克隆	癌症生物学	癌症	单细胞RNA测序，条形码技术	NA	单细胞RNA测序数据	未明确说明具体样本数量，但涉及多个抗性克隆的追踪和分析
4096	2025-03-22	Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology 2024-Mar, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07187-5 PMID:38509377	研究论文	本文识别了一种表观遗传控制的记忆性星形胶质细胞亚群，该亚群在再次刺激时表现出加剧的促炎反应	发现了由代谢酶ATP-柠檬酸裂解酶（ACLY）控制的星形胶质细胞记忆机制，该机制通过产生乙酰辅酶A（acetyl-CoA）并由组蛋白乙酰转移酶p300控制染色质可及性	研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型，人类星形胶质细胞的研究仅限于体外实验	探讨星形胶质细胞亚群在神经系统疾病中的病理作用及其表观遗传记忆机制	星形胶质细胞亚群	神经科学	多发性硬化症	单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序、染色质免疫共沉淀测序、核酸检测和测序、CRISPR-Cas9基因扰动	NA	单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据	急性及慢性EAE模型、人类星形胶质细胞体外培养
4097	2025-03-22	Response to tumor-infiltrating lymphocyte adoptive therapy is associated with preexisting CD8+ T-myeloid cell networks in melanoma 2024-02-02, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adg7995 PMID:38306416	研究论文	本文研究了肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）过继细胞疗法（ACT）在转移性黑色素瘤患者中的疗效，并探讨了肿瘤微环境（TME）中的细胞状态及其相互作用	通过纵向样本分析，发现ACT响应者具有更高的基础肿瘤细胞内在免疫原性和突变负担，并揭示了响应者中丰富的基线肿瘤内和基质肿瘤反应性T细胞网络与激活的髓系细胞群	样本量较小，仅涉及13名患者，可能影响结果的普遍性	探索TIL-ACT疗法在转移性黑色素瘤患者中的疗效机制，并寻找潜在的生物标志物以改善患者选择和指导ACT临床试验设计	转移性黑色素瘤患者	肿瘤免疫学	黑色素瘤	bulk和单细胞RNA测序、全外显子测序、空间蛋白质组分析	NA	RNA测序数据、蛋白质组数据	13名转移性黑色素瘤患者
4098	2025-03-22	A single-cell atlas of IL-23 inhibition in cutaneous psoriasis distinguishes clinical response 2024-01-26, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adi2848 PMID:38277466	研究论文	本文通过单细胞转录组学技术，研究了IL-23信号阻断治疗在皮肤银屑病中的临床反应机制	揭示了IL-23阻断治疗在临床反应良好和反应不佳患者中的不同机制，并发现了一种不可逆的免疫状态	研究样本量有限，且未涉及长期治疗效果的观察	探讨IL-23信号阻断治疗在皮肤银屑病中的临床反应机制	银屑病患者的皮肤免疫细胞	单细胞转录组学	银屑病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	银屑病患者的皮肤免疫细胞样本
4099	2025-03-22	Tuft cells and fibroblasts promote thymus regeneration through ILC2-mediated type 2 immune response 2024-01-12, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.abq6930 PMID:38215193	研究论文	本文研究了胸腺再生机制，特别是通过ILC2介导的2型免疫反应中胸腺绒毛细胞和成纤维细胞的作用	揭示了胸腺绒毛细胞和成纤维细胞通过激活2型免疫反应在胸腺再生中的新角色	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探讨胸腺再生的机制，特别是非T细胞的胸腺造血细胞的作用	小鼠胸腺细胞，特别是ILC2、胸腺绒毛细胞和成纤维细胞	免疫学	NA	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	使用地塞米松诱导的急性胸腺萎缩小鼠模型
4100	2025-03-22	Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche 2024-01-05, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152 PMID:38181095	研究论文	本文探讨了皮肤中调节性T细胞（Treg）在维持毛囊干细胞（HFSC）生态位免疫特权中的作用	开发了一种技术，将基因重组限制在皮肤中的调节性T细胞，揭示了皮肤Treg通过高亲和力IL-2受体表达在细胞外方式中保护HFSC生态位的机制	研究主要集中在皮肤中的Treg，未涉及其他非淋巴器官中的免疫耐受机制	研究皮肤中调节性T细胞在维持毛囊干细胞生态位免疫特权中的作用	皮肤中的调节性T细胞和毛囊干细胞生态位	免疫学	脱发症	基因重组技术、空间转录组学	NA	基因表达数据、空间转录组数据	NA