单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4081 - 4100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4081 | 2025-10-06 |
AHR, a novel inhibitory immune checkpoint receptor, is a potential therapeutic target for chemoresistant glioblastoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04894-w
PMID:37233762
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析发现AHR是胶质母细胞瘤的新型抑制性免疫检查点受体，可作为替莫唑胺耐药患者的潜在治疗靶点 | 首次揭示AHR作为新型抑制性免疫检查点在替莫唑胺耐药胶质母细胞瘤中的关键作用，并发现七叶树种子可作为AHR靶向药物 | 回顾性研究设计，需要进一步的前瞻性临床试验验证 | 阐明MGMT启动子非甲基化胶质母细胞瘤患者对替莫唑胺耐药的机制并寻找治疗靶点 | 457例胶质母细胞瘤患者样本、临床组织样本、T细胞与肿瘤细胞共培养模型 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞测序、多组学分析、多重免疫荧光染色 | NA | 转录组数据、多组学数据、单细胞测序数据、免疫荧光图像数据 | 457例胶质母细胞瘤患者 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 4082 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-Seq and bulk RNA-Seq reveal reliable diagnostic and prognostic biomarkers for CRC
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04882-0
PMID:37247080
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，识别结直肠癌可靠的诊断和预后生物标志物 | 首次通过腺瘤-癌序列整合单细胞和bulk RNA测序数据，系统筛选上皮特异性基因作为结直肠癌生物标志物 | 未明确说明样本来源和具体样本量，需要外部验证数据集进一步确认生物标志物的普适性 | 筛选结直肠癌的诊断和预后生物标志物 | 正常肠黏膜、腺瘤和结直肠癌组织 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,甲基化分析 | LASSO-Cox回归,双向逐步回归 | 基因表达数据,甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4083 | 2025-10-06 |
A Bayesian multivariate mixture model for high throughput spatial transcriptomics
2023-09, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13727
PMID:35895854
|
研究论文 | 开发了一种基于贝叶斯空间多元混合模型SPRUCE，用于分析高通量空间转录组数据以识别细胞亚群 | 提出了首个基于多元偏态正态分布的贝叶斯空间多元有限混合模型，结合Pólya-Gamma数据增强和空间随机效应来推断空间相关的混合成分成员概率 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发统计模型来识别组织样本中的细胞亚群，以揭示生物现象 | 高通量空间转录组数据 | 空间转录组学 | 脑部疾病, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 贝叶斯空间多元混合模型, 多元偏态正态分布 | 空间基因表达数据 | 公开可用的人脑HST数据和人类乳腺癌HST数据 | NA | 高通量空间转录组学 | NA | NA |
| 4084 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on T-cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in bladder cancer
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04881-1
PMID:37244876
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个基于T细胞标记基因的膀胱癌预后和免疫治疗反应预测模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，识别T细胞标记基因并构建膀胱癌预后特征 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏外部实验验证 | 开发膀胱癌预后预测和免疫治疗反应评估的生物标志物 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预后特征模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和GEO数据库中的膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4085 | 2025-10-06 |
CD4-/CD8- double-negative tumor-infiltrating lymphocytes expanded from solid tumor tissue suppress the proliferation of tumor cells in an MHC-independent way
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04823-x
PMID:37165118
|
研究论文 | 本研究从胃癌组织中扩增CD4-/CD8-双阴性肿瘤浸润淋巴细胞并验证其通过MHC非依赖性方式抑制肿瘤细胞增殖 | 首次系统表征胃癌来源DN-TILs的表型特征和抗癌功能，发现其具有MHC非依赖性细胞毒性 | 研究主要基于体外实验和异种移植模型，尚未进行临床试验验证 | 研究实体瘤中CD4-/CD8-双阴性TILs的特征和功能 | 胃癌组织来源的CD3+CD4-CD8- TILs | 免疫学 | 胃癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 从胃癌组织扩增的DN-TILs（7028个细胞进行单细胞测序） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4086 | 2025-10-06 |
The HDAC inhibitor domatinostat induces type I interferon α in Merkel cell carcinoma by HES1 repression
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04733-y
PMID:37071208
|
研究论文 | 本研究揭示了HDAC抑制剂多马替司他通过抑制HES1表达诱导I型干扰素α产生，从而抑制默克尔细胞癌细胞增殖并诱导凋亡的机制 | 首次发现HDAC抑制剂多马替司他通过抑制HES1转录因子来诱导IFNα表达，阐明了HDACi在默克尔细胞癌中的新型作用机制 | 研究仅使用有限细胞系进行验证，未涉及动物模型或临床样本验证 | 探究HDAC抑制剂多马替司他在默克尔细胞癌中诱导I型干扰素α的分子机制 | 默克尔细胞癌细胞系（MCPyV阳性的WaGa、MKL-1和阴性的UM-MCC 34）及原代成纤维细胞 | 癌症生物学 | 默克尔细胞癌 | RT-qPCR, 流式细胞术, RNA干扰, 单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据, 细胞功能数据 | 3种默克尔细胞癌细胞系和原代成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4087 | 2025-10-06 |
Generative modeling of single-cell gene expression for dose-dependent chemical perturbations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100817
PMID:37602218
|
研究论文 | 提出基于变分自编码器的scVIDR模型，用于预测单细胞基因表达在化学扰动下的剂量依赖性响应 | 首次将变分自编码器应用于多剂量化学扰动的单细胞基因表达预测，优于现有单剂量预测模型 | 模型验证仍需更多实验数据支持，预测精度可能受细胞类型和化学物质种类限制 | 开发能够预测化学扰动剂量依赖性单细胞基因表达响应的计算方法 | 小鼠肝细胞、人血细胞和癌细胞系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VAE（变分自编码器） | 基因表达数据 | 多种细胞类型（小鼠肝细胞、人血细胞、癌细胞系） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4088 | 2025-10-06 |
Tff2 defines transit-amplifying pancreatic acinar progenitors that lack regenerative potential and are protective against Kras-driven carcinogenesis
2023-08-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.07.002
PMID:37541213
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序鉴定了一类表达Tff2的胰腺腺泡转运扩增祖细胞群体 | 首次发现Tff2标记的胰腺转运扩增祖细胞群体具有抵抗Kras驱动癌变的保护功能 | 未明确Tff2发挥保护作用的具体分子机制 | 研究胰腺腺泡中Tff2表达细胞群体的生物学特性及其在肿瘤发生中的作用 | 小鼠胰腺Tff2表达细胞群体 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 谱系追踪, scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4089 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of transcriptome dynamics during human craniofacial development identifies candidate disease genes
2023-08-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40363-1
PMID:37532691
|
研究论文 | 通过整合分析人类颅面发育过程中的转录组动态，识别候选疾病基因 | 结合bulk和单细胞RNA-seq数据，首次系统识别出539个可能参与颅面疾病的候选基因 | 大多数候选基因尚未在颅面疾病中得到功能验证，需要进一步研究 | 识别与颅面发育障碍相关的候选疾病基因 | 人类颅面组织（受孕后4-8周） | 生物信息学 | 颅面畸形 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, 表观基因组数据 | 人类颅面组织（受孕后4-8周），与数十种其他人组织比较 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4090 | 2025-10-06 |
Sub-Cluster Identification through Semi-Supervised Optimization of Rare-Cell Silhouettes (SCISSORS) in single-cell RNA-sequencing
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad449
PMID:37498558
|
研究论文 | 提出SCISSORS框架用于单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型的识别 | 通过多步骤半监督重聚类过程结合轮廓评分来识别异质性聚类中的稀有细胞 | NA | 开发识别单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 半监督聚类算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4091 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive role of SPP1-CD44 in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma assessed by single-cell RNA sequencing
2023-Aug, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04498-w
PMID:36469154
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序评估SPP1-CD44在肝内胆管癌肿瘤微环境中的免疫抑制作用 | 首次在单细胞水平揭示SPP1-CD44相互作用通过抑制T细胞增殖在肝内胆管癌中发挥免疫抑制功能 | 样本量较小（仅9例患者），缺乏功能实验验证 | 探究SPP1在肝内胆管癌中的生物学功能及其免疫抑制作用 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织和癌旁组织细胞 | 单细胞转录组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | 差异基因表达分析、生存分析、相关性分析、CellChat、CytoSig | 单细胞转录组数据 | 9例患者的62,770个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4092 | 2025-10-06 |
Heterogeneity and Functional Analysis of Cardiac Fibroblasts in Heart Development
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551164
PMID:37577541
|
研究论文 | 本研究通过单细胞mRNA测序和功能分析揭示了心脏成纤维细胞在胚胎和新生阶段的异质性及其在心脏发育中的关键作用 | 首次系统比较了不同来源心脏成纤维细胞的转录谱，通过条件性消融技术揭示了成纤维细胞在心脏发育不同阶段的功能差异 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究心脏成纤维细胞的异质性及其在心脏发育过程中的功能 | 小鼠心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序, 生物信息学分析, 单分子原位杂交, 白喉毒素片段A消融系统 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 两个小鼠品系在18个发育阶段的成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4093 | 2025-10-06 |
Loss of metabolic fitness drives tumor resistance after CAR-NK cell therapy and can be overcome by cytokine engineering
2023-07-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add6997
PMID:37494448
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式分析，揭示了CAR-NK细胞在输注后的异质性演变及其代谢适应性丧失导致肿瘤耐药的机制 | 首次在临床前模型和患者样本中系统追踪CAR-NK细胞从肿瘤控制到复发阶段的体内演变过程，发现代谢适应性丧失是耐药关键机制，并提出IL-15细胞因子工程可部分克服此问题 | 研究样本量有限，仅包含一个应答者和一个无应答者患者样本，需要在更大队列中验证发现 | 探究CAR-NK细胞输注后的转录特征和影响肿瘤控制的因素 | CAR-NK细胞和淋巴瘤模型 | 细胞治疗 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 临床前淋巴瘤模型及2例患者样本（1例应答者，1例无应答者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4094 | 2025-10-06 |
p38MAPKα Stromal Reprogramming Sensitizes Metastatic Breast Cancer to Immunotherapy
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0907
PMID:36883955
|
研究论文 | 本研究揭示p38MAPKα抑制剂通过重编程转移性肿瘤微环境增强乳腺癌对免疫疗法的敏感性 | 发现p38MAPKα抑制与OX40激动剂联合使用的协同抗转移效应，并建立p38i转移基质特征与患者预后的关联 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 开发针对转移性乳腺癌的有效免疫治疗策略 | 转移性乳腺癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，基质标记方法 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4095 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of xenotransplanted human retinal organoids defines two migratory cell populations of nonretinal origin
2023-05-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.04.004
PMID:37163980
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人视网膜类器官移植后产生的两种非视网膜来源的迁移细胞群 | 首次发现移植后出现非视网膜来源的星形胶质细胞和脑/脊髓样神经前体细胞，这些细胞在体外培养的类器官中罕见或缺失 | 研究仅在光感受器缺陷小鼠模型中进行，未验证其他视网膜疾病模型 | 探索受体视网膜环境对移植类器官细胞存活、成熟和增殖的调控机制 | 人视网膜类器官来源细胞和光感受器缺陷小鼠 | 单细胞转录组学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学图像 | 移植人视网膜类器官细胞至光感受器缺陷小鼠，并与时间匹配的体外培养类器官对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4096 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptomics contrasts fatty acid metabolism with hypoxia response in β-cell subpopulations associated with glycemic control
2023-Mar-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09232-5
PMID:36978008
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，探索肥胖小鼠中β细胞异质性及其与血糖控制相关的亚群 | 整合单细胞和批量转录组数据识别β细胞新亚群，并发现脂肪酸代谢与缺氧反应在不同血糖表型肥胖中的关联 | 研究仅限于SM/J肥胖小鼠模型，未在其他物种或模型中验证 | 探索β细胞异质性对糖尿病发病机制的影响 | 肥胖SM/J小鼠的胰腺胰岛β细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4097 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicle distribution and localization in skeletal muscle at rest and following disuse atrophy
2023-03-10, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-023-00315-1
PMID:36895061
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞外囊泡在骨骼肌中的分布定位及其在废用性萎缩中的变化 | 首次系统揭示了骨骼肌中细胞外囊泡生物发生因子的细胞类型表达谱和空间定位特征，并比较了不同物种在废用性萎缩模型中细胞外囊泡浓度的差异 | 样本量有限，仅使用了啮齿动物和人类模型，且未深入探讨细胞外囊泡功能机制 | 研究骨骼肌中细胞外囊泡的生物发生、标记物表达和细胞定位，及其在废用性萎缩中的变化 | 大鼠骨骼肌和血清样本，以及人类卧床休息模型的血清样本 | 细胞生物学 | 肌肉萎缩疾病 | 密度梯度超速离心，荧光相关光谱，qPCR，单细胞RNA测序，免疫组织化学，纳米颗粒跟踪分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质定位数据，纳米颗粒浓度数据 | 大鼠和人类废用性萎缩模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4098 | 2025-10-06 |
A cellular taxonomy of the adult human spinal cord
2023-02-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.007
PMID:36731429
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学技术构建了成人人类脊髓的细胞分类系统 | 首次系统性地建立了成人人类脊髓的细胞分类图谱，揭示了运动神经元的特异性分子特征 | 研究主要基于单核RNA测序数据，可能无法完全反映细胞在生理状态下的完整功能特性 | 构建人类脊髓细胞分类系统并探索其在人类疾病中的意义 | 成人人类脊髓组织 | 单细胞生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 抗体验证 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4099 | 2025-10-06 |
Enteroendocrine Cells Protect the Stem Cell Niche by Regulating Crypt Metabolism in Response to Nutrients
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.016
PMID:36608902
|
研究论文 | 本研究揭示了肠内分泌细胞通过调节隐窝代谢向干细胞巢传递营养信息的重要机制 | 首次证明肠内分泌细胞作为营养传感器，通过调节隐窝代谢向肠道干细胞巢传递营养状态信息 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道类器官，需要进一步验证在完整生理系统中的功能 | 探究肠内分泌细胞在调节肠道干细胞巢代谢和功能中的作用 | 小鼠肠道上皮细胞、人类肠道类器官、肠道干细胞 | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 间接热量测定、1H-NMR代谢组学、线粒体活体成像、单细胞测序 | NA | 代谢数据、成像数据、基因表达数据 | 转基因小鼠模型和人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 10x Genomics, Agilent Technologies | 单细胞RNA测序, 代谢分析 | 10x Chromium, Seahorse生物分析仪 | 10x Genomics单细胞测序平台，Agilent Seahorse XF分析仪 |
| 4100 | 2025-10-06 |
A novel cuproptosis-related gene signature of prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma cancer
2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04471-7
PMID:36376617
|
研究论文 | 本研究构建了一个铜死亡相关基因特征模型，用于预测头颈鳞状细胞癌患者的预后和免疫微环境 | 首次系统评估头颈鳞状细胞癌中铜死亡相关基因的差异表达和遗传改变，并构建了基于10个CRG的风险预测模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 评估铜死亡相关基因在头颈鳞状细胞癌中的预后价值和免疫微环境关联 | 头颈鳞状细胞癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序，基因表达分析，拷贝数变异分析 | Cox回归分析，lasso回归 | 基因表达数据，临床数据，单细胞测序数据 | 来自公共数据库的头颈鳞状细胞癌和正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |