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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4081 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptomics contrasts fatty acid metabolism with hypoxia response in β-cell subpopulations associated with glycemic control
2023-Mar-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09232-5
PMID:36978008
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,探索肥胖小鼠中β细胞异质性及其与血糖控制相关的亚群 | 整合单细胞和批量转录组数据识别β细胞新亚群,并发现脂肪酸代谢与缺氧反应在不同血糖表型肥胖中的关联 | 研究仅限于SM/J肥胖小鼠模型,未在其他物种或模型中验证 | 探索β细胞异质性对糖尿病发病机制的影响 | 肥胖SM/J小鼠的胰腺胰岛β细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4082 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicle distribution and localization in skeletal muscle at rest and following disuse atrophy
2023-03-10, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-023-00315-1
PMID:36895061
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研究论文 | 本研究探讨了细胞外囊泡在骨骼肌中的分布定位及其在废用性萎缩中的变化 | 首次系统揭示了骨骼肌中细胞外囊泡生物发生因子的细胞类型表达谱和空间定位特征,并比较了不同物种在废用性萎缩模型中细胞外囊泡浓度的差异 | 样本量有限,仅使用了啮齿动物和人类模型,且未深入探讨细胞外囊泡功能机制 | 研究骨骼肌中细胞外囊泡的生物发生、标记物表达和细胞定位,及其在废用性萎缩中的变化 | 大鼠骨骼肌和血清样本,以及人类卧床休息模型的血清样本 | 细胞生物学 | 肌肉萎缩疾病 | 密度梯度超速离心,荧光相关光谱,qPCR,单细胞RNA测序,免疫组织化学,纳米颗粒跟踪分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据,纳米颗粒浓度数据 | 大鼠和人类废用性萎缩模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4083 | 2025-10-06 |
A cellular taxonomy of the adult human spinal cord
2023-02-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.007
PMID:36731429
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学技术构建了成人人类脊髓的细胞分类系统 | 首次系统性地建立了成人人类脊髓的细胞分类图谱,揭示了运动神经元的特异性分子特征 | 研究主要基于单核RNA测序数据,可能无法完全反映细胞在生理状态下的完整功能特性 | 构建人类脊髓细胞分类系统并探索其在人类疾病中的意义 | 成人人类脊髓组织 | 单细胞生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 抗体验证 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4084 | 2025-10-06 |
Enteroendocrine Cells Protect the Stem Cell Niche by Regulating Crypt Metabolism in Response to Nutrients
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.016
PMID:36608902
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研究论文 | 本研究揭示了肠内分泌细胞通过调节隐窝代谢向干细胞巢传递营养信息的重要机制 | 首次证明肠内分泌细胞作为营养传感器,通过调节隐窝代谢向肠道干细胞巢传递营养状态信息 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道类器官,需要进一步验证在完整生理系统中的功能 | 探究肠内分泌细胞在调节肠道干细胞巢代谢和功能中的作用 | 小鼠肠道上皮细胞、人类肠道类器官、肠道干细胞 | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 间接热量测定、1H-NMR代谢组学、线粒体活体成像、单细胞测序 | NA | 代谢数据、成像数据、基因表达数据 | 转基因小鼠模型和人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 10x Genomics, Agilent Technologies | 单细胞RNA测序, 代谢分析 | 10x Chromium, Seahorse生物分析仪 | 10x Genomics单细胞测序平台,Agilent Seahorse XF分析仪 |
4085 | 2025-10-06 |
A novel cuproptosis-related gene signature of prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma cancer
2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04471-7
PMID:36376617
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研究论文 | 本研究构建了一个铜死亡相关基因特征模型,用于预测头颈鳞状细胞癌患者的预后和免疫微环境 | 首次系统评估头颈鳞状细胞癌中铜死亡相关基因的差异表达和遗传改变,并构建了基于10个CRG的风险预测模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 评估铜死亡相关基因在头颈鳞状细胞癌中的预后价值和免疫微环境关联 | 头颈鳞状细胞癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序,基因表达分析,拷贝数变异分析 | Cox回归分析,lasso回归 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | 来自公共数据库的头颈鳞状细胞癌和正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4086 | 2025-10-06 |
CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201537R
PMID:36468677
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研究论文 | 本研究探讨CD73通过产生细胞外腺苷在胰腺炎中促进中性粒细胞介导的组织损伤修复和抑制化生的作用机制 | 首次揭示CD73缺失导致胰腺炎中持续化生和炎症的机制,并证明中性粒细胞清除可显著减少化生 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 阐明CD73在胰腺炎炎症消退和组织修复中的作用机制 | CD73基因敲除小鼠和野生型C57BL/6小鼠 | 分子病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | CD73敲除和野生型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4087 | 2025-10-06 |
The Simple prEservatioN of Single cElls method for cryopreservation enables the generation of single-cell immune profiles from whole blood
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1271800
PMID:38090590
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研究论文 | 开发了一种名为SENSE的单步冷冻保存全血方法,用于生成高质量单细胞免疫图谱 | 开发了单步冷冻保存全血的新方法,在单细胞检测过程中同时进行粒细胞去除,简化了传统多步骤流程 | 样本量较小(n=6),在髓系细胞中存在批次效应 | 开发简化的全血单细胞冷冻保存方法,促进单细胞RNA测序在临床中的应用 | 人类全血样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6个全血样本,获得22,353个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4088 | 2025-10-06 |
EasyCellType: marker-based cell-type annotation by automatically querying multiple databases
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad029
PMID:36998720
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研究论文 | 开发了一个名为EasyCellType的用户友好计算工具,用于基于标记基因自动注释单细胞RNA测序数据的细胞类型 | 通过自动查询多个数据库并提供图形化注释建议,解决了手动检查细胞标记列表的困难 | NA | 促进单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的自动化过程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因集富集分析,改进的Fisher精确检验 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4089 | 2025-10-06 |
Processing and cryopreservation of human ureter tissues for single-cell and spatial transcriptomics assays
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101854
PMID:36595885
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研究论文 | 本文介绍了用于单细胞和空间转录组学分析的人类输尿管组织处理与冷冻保存优化方案 | 开发了针对人类输尿管组织的单细胞悬液制备和冷冻保存优化方案,以及适用于10x Genomics Visium空间基因表达平台的组织冷冻保存方法 | NA | 建立人类输尿管组织的单细胞和空间转录组学分析样本制备标准流程 | 人类输尿管组织(来自膀胱切除术后) | 单细胞测序技术 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间基因表达平台 |
4090 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling reveals heterogeneity and developmental trajectories of Ewing sarcoma
2022-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04073-3
PMID:35713707
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示尤文肉瘤的异质性、发育轨迹及其与神经嵴细胞起源的关系 | 首次在单细胞分辨率揭示尤文肉瘤的发育轨迹异质性,发现JAK1基因在肿瘤发生中的关键作用及潜在治疗价值 | 样本量较小(仅4个肿瘤组织),需要更大规模验证 | 探究尤文肉瘤的细胞异质性、发育轨迹和肿瘤发生机制 | 尤文肉瘤肿瘤组织样本 | 单细胞转录组学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | K-近邻算法, Monocle2伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 4个尤文肉瘤肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4091 | 2025-10-06 |
Endocardium-to-coronary artery differentiation during heart development and regeneration involves sequential roles of Bmp2 and Cxcl12/Cxcr4
2022-11-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.10.007
PMID:36347256
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研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞RNA测序揭示了心内膜向冠状动脉分化过程中Bmp2和Cxcl12/Cxcr4信号的时序调控机制 | 首次发现Bmp2表达的心内膜过渡群体特异性存在于妊娠中期,并证实CXCL12/CXCR4信号特异性调控动脉形态发生而非血管生成 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类心脏中验证 | 揭示心内膜血管生成的分子机制,寻找促进心脏损伤后血管再生的潜在治疗靶点 | 小鼠胚胎心内膜细胞和冠状动脉内皮细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 小鼠遗传学, 谱系追踪, 基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据, 遗传学数据 | 小鼠胚胎心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4092 | 2025-10-06 |
A dietary change to a high-fat diet initiates a rapid adaptation of the intestine
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111641
PMID:36384107
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研究论文 | 本研究通过生理指标和单细胞转录组学揭示了高脂饮食对肠道上皮细胞的快速适应性反应 | 首次系统揭示了肠道上皮细胞在饮食改变后1天内的快速转录组适应机制 | 研究仅关注短期反应,长期影响仍需进一步探索 | 探究饮食改变对肠道上皮细胞的即时响应机制 | 小鼠肠道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞转录组学,计算轨迹分析 | NA | 转录组数据,生理指标数据 | 高脂饮食处理的小鼠肠道样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4093 | 2025-10-06 |
ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01653-6
PMID:36280724
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研究论文 | 介绍了一种名为clampFISH 2.0的新型原位RNA检测方法,能够快速、可扩展地检测和扩增RNA信号 | 采用反向挂锁设计,可同时高效检测多种RNA物种并指数级扩增信号,相比前代方法显著减少时间和成本 | NA | 开发高效的多重RNA原位检测和信号扩增技术 | RNA分子在单细胞和组织切片中的检测 | 空间转录组学 | NA | clampFISH 2.0, 原位RNA标记 | NA | RNA检测信号 | 超过100万个细胞 | NA | 空间转录组学, 多重信号扩增, 顺序检测 | NA | NA |
4094 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome highlights a multilayer regulatory network on an invasive trajectory within colorectal cancer progression
2022-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04020-2
PMID:35523976
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌中从癌症干细胞到侵袭性细胞的多层调控网络 | 首次构建了结直肠癌中'干细胞-侵袭路径'的分支轨迹,并建立了多层调控网络来阐明肿瘤细胞获得侵袭特性的关键机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 探索结直肠癌中癌症干细胞向侵袭性细胞转化的分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞,特别是恶性上皮细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序,生物信息学分析 | 聚类分析,伪时间分析,基因集变异分析,基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4095 | 2025-10-06 |
α Cell dysfunction in islets from nondiabetic, glutamic acid decarboxylase autoantibody-positive individuals
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI156243
PMID:35642629
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研究论文 | 本研究探讨了非糖尿病但谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体胰岛中α细胞功能异常的特征 | 首次发现在胰岛自身免疫早期阶段,当β细胞数量仍正常时α细胞功能已出现异常 | 样本量有限,需要更大规模研究验证 | 研究单自身抗体阳性个体胰岛细胞功能异常的早期特征 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛组织 | 糖尿病研究 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,分子表型分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学数据,功能测定数据 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4096 | 2025-10-06 |
NeuCA web server: a neural network-based cell annotation tool with web-app and GUI
2022-04-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac108
PMID:35176143
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研究论文 | 开发了一个基于神经网络的单细胞RNA测序细胞注释工具,提供网页应用和图形用户界面 | 首个采用神经网络架构的网页应用工具,提供超过20个常用组织类型的预训练分类器 | NA | 开发自动细胞类型注释工具,促进单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4097 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic landscapes of a rare human laryngeal chondrosarcoma
2022-Apr, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03883-1
PMID:34931260
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示罕见人类喉软骨肉瘤的细胞组成和肿瘤微环境特征 | 首次系统研究喉软骨肉瘤的单细胞转录组景观,发现SLAMF9基因在肿瘤非免疫细胞中的特异性表达 | 仅分析单一样本,样本量有限 | 解析喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 74岁男性原发性喉软骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 喉软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 1例患者,5455个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4098 | 2025-10-06 |
Mechanotherapy Reprograms Aged Muscle Stromal Cells to Remodel the Extracellular Matrix during Recovery from Disuse
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqac015
PMID:35434632
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现机械疗法能够重编程衰老肌肉基质细胞,促进废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 首次揭示机械疗法通过调节衰老肌肉中基质细胞的基因表达模式,使其更接近年轻肌肉状态,从而促进细胞外基质重塑 | 研究主要基于大鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 探究机械疗法是否能够促进衰老肌肉在废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 成年和老年大鼠的腓肠肌单核细胞 | 单细胞转录组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序,同位素示踪,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学图像数据 | 成年和老年大鼠腓肠肌单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4099 | 2025-10-06 |
IFN-γ transforms the transcriptomic landscape and triggers myeloid cell hyperresponsiveness to cause lethal lung injury
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011132
PMID:36203588
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研究论文 | 本研究揭示了流感诱导的IFN-γ通过触发髓系细胞过度反应导致MRSA共感染时致命性肺损伤的机制 | 首次证明IFN-γ受体信号驱动髓系细胞(特别是CD11c单核吞噬细胞)转录组重编程和过度反应,导致炎症因子风暴和肺组织损伤 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究急性呼吸窘迫综合征(ARDS)发病机制中IFN-γ信号通路的作用 | 小鼠模型中的免疫细胞,特别是髓系细胞和单核吞噬细胞 | 免疫学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4100 | 2025-10-06 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
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病例报告 | 通过一例重症COVID-19康复期血浆输注后完全缓解的病例,分析疾病消退的关键生物学动态 | 首次通过纵向蛋白质组学和单细胞转录组学联合分析,揭示康复期血浆输注后免疫稳态重建的生物学过程 | 单病例报告,结果需要更大规模研究验证 | 探索COVID-19疾病消退过程中的关键生物学相关因素 | 重症COVID-19患者 | 单细胞分析 | COVID-19 | 无偏蛋白质组学分析,单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组分析 | NA | NA |