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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4081 | 2025-10-06 |
A dietary change to a high-fat diet initiates a rapid adaptation of the intestine
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111641
PMID:36384107
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研究论文 | 本研究通过生理指标和单细胞转录组学揭示了高脂饮食对肠道上皮细胞的快速适应性反应 | 首次系统揭示了肠道上皮细胞在饮食改变后1天内的快速转录组适应机制 | 研究仅关注短期反应,长期影响仍需进一步探索 | 探究饮食改变对肠道上皮细胞的即时响应机制 | 小鼠肠道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞转录组学,计算轨迹分析 | NA | 转录组数据,生理指标数据 | 高脂饮食处理的小鼠肠道样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4082 | 2025-10-06 |
ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01653-6
PMID:36280724
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研究论文 | 介绍了一种名为clampFISH 2.0的新型原位RNA检测方法,能够快速、可扩展地检测和扩增RNA信号 | 采用反向挂锁设计,可同时高效检测多种RNA物种并指数级扩增信号,相比前代方法显著减少时间和成本 | NA | 开发高效的多重RNA原位检测和信号扩增技术 | RNA分子在单细胞和组织切片中的检测 | 空间转录组学 | NA | clampFISH 2.0, 原位RNA标记 | NA | RNA检测信号 | 超过100万个细胞 | NA | 空间转录组学, 多重信号扩增, 顺序检测 | NA | NA |
4083 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome highlights a multilayer regulatory network on an invasive trajectory within colorectal cancer progression
2022-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04020-2
PMID:35523976
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌中从癌症干细胞到侵袭性细胞的多层调控网络 | 首次构建了结直肠癌中'干细胞-侵袭路径'的分支轨迹,并建立了多层调控网络来阐明肿瘤细胞获得侵袭特性的关键机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 探索结直肠癌中癌症干细胞向侵袭性细胞转化的分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞,特别是恶性上皮细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序,生物信息学分析 | 聚类分析,伪时间分析,基因集变异分析,基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4084 | 2025-10-06 |
α Cell dysfunction in islets from nondiabetic, glutamic acid decarboxylase autoantibody-positive individuals
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI156243
PMID:35642629
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研究论文 | 本研究探讨了非糖尿病但谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体胰岛中α细胞功能异常的特征 | 首次发现在胰岛自身免疫早期阶段,当β细胞数量仍正常时α细胞功能已出现异常 | 样本量有限,需要更大规模研究验证 | 研究单自身抗体阳性个体胰岛细胞功能异常的早期特征 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛组织 | 糖尿病研究 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,分子表型分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学数据,功能测定数据 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4085 | 2025-10-06 |
NeuCA web server: a neural network-based cell annotation tool with web-app and GUI
2022-04-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac108
PMID:35176143
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研究论文 | 开发了一个基于神经网络的单细胞RNA测序细胞注释工具,提供网页应用和图形用户界面 | 首个采用神经网络架构的网页应用工具,提供超过20个常用组织类型的预训练分类器 | NA | 开发自动细胞类型注释工具,促进单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4086 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic landscapes of a rare human laryngeal chondrosarcoma
2022-Apr, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03883-1
PMID:34931260
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示罕见人类喉软骨肉瘤的细胞组成和肿瘤微环境特征 | 首次系统研究喉软骨肉瘤的单细胞转录组景观,发现SLAMF9基因在肿瘤非免疫细胞中的特异性表达 | 仅分析单一样本,样本量有限 | 解析喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 74岁男性原发性喉软骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 喉软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 1例患者,5455个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4087 | 2025-10-06 |
Mechanotherapy Reprograms Aged Muscle Stromal Cells to Remodel the Extracellular Matrix during Recovery from Disuse
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqac015
PMID:35434632
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现机械疗法能够重编程衰老肌肉基质细胞,促进废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 首次揭示机械疗法通过调节衰老肌肉中基质细胞的基因表达模式,使其更接近年轻肌肉状态,从而促进细胞外基质重塑 | 研究主要基于大鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 探究机械疗法是否能够促进衰老肌肉在废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 成年和老年大鼠的腓肠肌单核细胞 | 单细胞转录组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序,同位素示踪,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学图像数据 | 成年和老年大鼠腓肠肌单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4088 | 2025-10-06 |
IFN-γ transforms the transcriptomic landscape and triggers myeloid cell hyperresponsiveness to cause lethal lung injury
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011132
PMID:36203588
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研究论文 | 本研究揭示了流感诱导的IFN-γ通过触发髓系细胞过度反应导致MRSA共感染时致命性肺损伤的机制 | 首次证明IFN-γ受体信号驱动髓系细胞(特别是CD11c单核吞噬细胞)转录组重编程和过度反应,导致炎症因子风暴和肺组织损伤 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究急性呼吸窘迫综合征(ARDS)发病机制中IFN-γ信号通路的作用 | 小鼠模型中的免疫细胞,特别是髓系细胞和单核吞噬细胞 | 免疫学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4089 | 2025-10-06 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
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病例报告 | 通过一例重症COVID-19康复期血浆输注后完全缓解的病例,分析疾病消退的关键生物学动态 | 首次通过纵向蛋白质组学和单细胞转录组学联合分析,揭示康复期血浆输注后免疫稳态重建的生物学过程 | 单病例报告,结果需要更大规模研究验证 | 探索COVID-19疾病消退过程中的关键生物学相关因素 | 重症COVID-19患者 | 单细胞分析 | COVID-19 | 无偏蛋白质组学分析,单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组分析 | NA | NA |
4090 | 2025-10-06 |
Human B Cells Mediate Innate Anti-Cancer Cytotoxicity Through Concurrent Engagement of Multiple TNF Superfamily Ligands
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.837842
PMID:35392082
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研究论文 | 研究发现人类循环B细胞通过同时表达多种TNF超家族配体介导先天性抗癌细胞毒性 | 首次揭示B细胞作为适应性免疫介质也具有先天性抗癌细胞毒性功能,通过同时表达四种跨膜TNFSF配体协同作用 | 研究样本主要来自头颈鳞状细胞癌患者,需要验证在其他癌症类型中的普适性 | 探索B细胞在先天性抗癌免疫中的作用机制 | 人类外周血B细胞及多种白血病和实体瘤细胞 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 健康个体和头颈鳞状细胞癌患者的外周血B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4091 | 2025-10-06 |
CCR2 Signaling Restricts SARS-CoV-2 Infection
2021-12-21, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02749-21
PMID:34749524
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了CCR2信号通路在限制SARS-CoV-2感染中的保护作用机制 | 首次在小鼠模型中证明CCR2信号通过促进单核细胞肺内浸润限制SARS-CoV-2病毒载量 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明COVID-19先天免疫保护机制 | SARS-CoV-2感染小鼠模型 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活体抗体标记 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4092 | 2025-10-06 |
NK and CD8+ T cell phenotypes predict onset and control of CMV viremia after kidney transplant
2021-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153175
PMID:34609965
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研究论文 | 本研究通过分析肾移植受者中NK细胞和CD8+ T细胞的表型特征,预测巨细胞病毒病毒血症的发生和控制 | 首次在肾移植受者中纵向表征CMV特异性免疫反应,发现未成熟CD56bright NK细胞与病毒血症发生相关,而记忆NK细胞和NK样CD28-CD8+ T细胞与病毒控制相关 | 样本量较小(31例患者),仅针对肾移植受者,结果可能不适用于其他器官移植类型 | 研究肾移植后CMV病毒血症的免疫预测因子和控制机制 | 31例肾移植受者(包括CMV病毒血症患者和匹配的非病毒血症患者) | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, Luminex多重蛋白检测, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 细胞表型数据 | 31例肾移植受者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 多重蛋白检测 | NA | NA |
4093 | 2025-10-06 |
Adenine base editing reduces misfolded protein accumulation and toxicity in alpha-1 antitrypsin deficient patient iPSC-hepatocytes
2021-11-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2021.06.021
PMID:34217893
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研究论文 | 本研究应用腺嘌呤碱基编辑器纠正AATD患者iPSC和肝细胞中的Z突变,减少错误折叠蛋白积累 | 首次在AATD患者iPSC来源的肝细胞中应用腺嘌呤碱基编辑技术纠正致病突变 | 研究未通过全基因组测序发现脱靶突变,但可能存在其他未知限制 | 探索碱基编辑技术纠正α-1抗胰蛋白酶缺乏症致病突变的可行性 | AATD患者诱导多能干细胞及其分化的肝细胞 | 基因编辑 | α-1抗胰蛋白酶缺乏症 | 腺嘌呤碱基编辑,单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 患者来源的iPSC和分化肝细胞 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
4094 | 2025-10-06 |
The hepatocyte growth factor/c-met pathway is a key determinant of the fibrotic kidney local microenvironment
2021-Oct-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103112
PMID:34622165
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研究论文 | 本研究通过多学科方法揭示了肝细胞生长因子/c-met信号通路在调控纤维化肾脏局部微环境形成中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和数学建模结合条件性基因敲除小鼠验证,系统阐明了c-met信号通路在肾脏纤维化微环境调控中的核心机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类慢性肾脏病中的直接适用性需要进一步验证 | 探索肝细胞生长因子/c-met信号通路在肾脏纤维化微环境形成中的调控作用 | 慢性肾脏病模型中的肾小管上皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序,数学建模,条件性基因敲除 | 数学预测模型,基因敲除动物模型 | 单细胞转录组数据 | 多种慢性肾脏病模型小鼠的回顾性单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4095 | 2025-10-06 |
Characterizing spatial gene expression heterogeneity in spatially resolved single-cell transcriptomic data with nonuniform cellular densities
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271288.120
PMID:34035045
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研究论文 | 开发了一种名为MERINGUE的计算框架,用于分析空间分辨单细胞转录组数据中的空间基因表达异质性 | 首个能够考虑组织内细胞类型固有3D空间组织和非均匀细胞密度的可扩展计算方法 | NA | 识别空间异质性表达基因、推断细胞间通讯、进行空间感知的细胞聚类 | 空间分辨转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间自相关和互相关分析 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,多重误差稳健荧光原位杂交,Slide-seq,原位杂交 | MERFISH,空间转录组学,Slide-seq,ISH | NA |
4096 | 2025-10-06 |
Combinatorial transcription factor profiles predict mature and functional human islet α and β cells
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151621
PMID:34428183
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胰岛α和β细胞中转录因子组合表达模式,预测高功能成熟细胞亚群 | 首次基于组合转录因子表达谱对人类胰岛细胞进行分层,发现ARX/MAFB(α细胞)和MAFA/MAFB(β细胞)共表达亚群具有更强的葡萄糖感知和激素分泌功能 | 研究仅限于正常人类胰岛细胞,未涉及糖尿病病理状态下的变化 | 定义胰岛细胞中转录因子异质性及其对细胞功能的影响 | 人类胰岛α和β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, Patch-Seq | NA | 单细胞转录组数据, 电生理数据 | 超过40,000个正常人类胰岛细胞,来自多个供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4097 | 2025-10-06 |
The Distinct Immune Nature of the Fetal Inflammatory Response Syndrome Type I and Type II
2021-09-14, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2100047
PMID:34521696
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析揭示了胎儿炎症反应综合征I型和II型在免疫机制上的本质差异 | 首次系统阐明FIRS I型和II型在分子水平上的免疫特征差异,发现I型主要由先天免疫驱动,II型则类似于半同种异体移植排斥反应 | 样本量有限且为早产儿,产后诊断困难可能影响样本准确性 | 探究胎儿炎症反应综合征I型和II型的分子基础和免疫机制差异 | 诊断为FIRS I型或II型的早产儿脐带血样本 | 生物医学 | 胎儿炎症反应综合征 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 早产儿脐带血样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4098 | 2025-10-06 |
LDHA is enriched in human islet alpha cells and upregulated in type 2 diabetes
2021-09-03, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2021.06.065
PMID:34217973
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸脱氢酶A亚型在人类胰岛α细胞中的特异性表达及其在2型糖尿病中的上调现象 | 首次系统证实LDHA主要定位于人类胰岛α细胞而非β细胞,并在2型糖尿病条件下发生特异性上调 | 研究主要基于体外实验和病理样本观察,缺乏在体功能验证 | 探究LDHA在人类胰岛细胞中的表达特征及其在2型糖尿病病理过程中的作用 | 人类胰岛细胞(重点关注α细胞和β细胞)及2型糖尿病患者胰腺组织 | 细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,免疫标记,显微镜分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,代谢产物数据 | 公共单细胞RNA-seq数据库,慢性高糖处理的人类胰岛,2型糖尿病患者尸检胰腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4099 | 2025-10-06 |
Using single-nucleus RNA-sequencing to interrogate transcriptomic profiles of archived human pancreatic islets
2021-08-10, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00941-8
PMID:34376240
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研究论文 | 本研究使用单核RNA测序技术分析存档人类胰岛的转录组特征 | 首次将单核RNA测序应用于移植人类胰岛细胞的研究,并与传统单细胞RNA测序方法进行系统比较 | 未明确说明样本数量和研究规模 | 开发可靠的方法来研究移植人类胰岛细胞的转录组特征 | 人类胰岛细胞,包括新鲜、冷冻培养和移植到免疫缺陷动物体内的存档胰岛 | 单细胞组学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序,单细胞RNA测序 | Nuclei EZ | Nuclei EZ核制备协议 |
4100 | 2025-10-06 |
DIAPH1 Variants in Non-East Asian Patients With Sporadic Moyamoya Disease
2021-08-01, JAMA neurology
IF:20.4Q1
DOI:10.1001/jamaneurol.2021.1681
PMID:34125151
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序发现DIAPH1基因变异是非东亚人群散发性烟雾病的新型风险基因 | 首次在非东亚人群中发现DIAPH1基因作为烟雾病风险基因,揭示了血管细胞肌动蛋白重塑在疾病发病机制中的作用 | 样本量相对较小,发现队列仅24例先证者,验证队列84例先证者 | 评估超罕见新生变异和罕见有害遗传变异与烟雾病风险的关联 | 烟雾病患者及其父母(病例-父母三重样本) | 医学遗传学 | 烟雾病 | 全外显子测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 发现队列24例先证者(22个三重样本和2个单样本),验证队列84例先证者(29个三重样本和55个单样本) | NA | 全外显子测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |