本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
4061 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis of expression profile and prognostic values of connexin family in LUAD
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05075-5
PMID:37458803
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了连接蛋白家族在肺腺癌中的表达谱和预后价值 | 首次在泛癌和肺腺癌中系统分析连接蛋白家族的表达差异和预后意义,并构建了结合风险评分和临床特征的预后模型 | NA | 全面分析连接蛋白基因家族在肺腺癌中的表达谱、预后意义、遗传改变、潜在生物学功能和药物敏感性 | 连接蛋白基因家族,特别是GJB2-5基因 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,多组学分析 | 预后风险模型,列线图 | 基因表达数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4062 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk sequencing analyses with experimental validation identify the prognostic and immunological implications of CD226 in pan-cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05268-y
PMID:37580402
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量测序分析结合实验验证,研究CD226在泛癌中的预后和免疫学意义 | 首次在泛癌水平系统研究CD226的表达特征、预后价值和免疫调控功能,并验证其作为免疫治疗生物标志物的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于小鼠黑色素瘤模型,需要更多临床样本验证 | 探究CD226在泛癌中的生物学功能、肿瘤免疫作用及其预测预后和免疫治疗反应的潜力 | 多种癌症类型、肿瘤浸润免疫细胞(CD8+T细胞、NK细胞) | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞测序, 批量测序, 基因集富集分析, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床预后数据 | 多种癌症类型的批量测序数据和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
4063 | 2025-10-06 |
Selenium metabolism heterogeneity in pan-cancer: insights from bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05333-6
PMID:37648807
|
研究论文 | 通过批量和单细胞RNA测序分析泛癌中硒代谢异质性及其与免疫反应和癌症生物学的关联 | 首次在泛癌水平系统描绘硒代谢景观,结合单细胞分辨率揭示细胞间通讯机制 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证硒代谢的具体分子机制 | 探究硒代谢在癌症发生发展和免疫调节中的作用 | 多种癌症类型和细胞类型(包括上皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞) | 生物信息学 | 泛癌 | RNA测序, 基因集富集分析(GSEA), 机器学习, 细胞间通讯分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | TCGA、GTEx、CCLE和单细胞数据集整合分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
4064 | 2025-10-06 |
Identification an innovative classification and nomogram for predicting the prognosis of thyroid carcinoma patients and providing therapeutic schedules
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05252-6
PMID:37596371
|
研究论文 | 本研究基于程序性细胞死亡模式开发甲状腺癌预后预测模型和分子分型 | 首次系统分析程序性细胞死亡模式与甲状腺癌预后的关联,开发了基于机器学习的预后特征和分子分型 | 研究数据主要来自公共数据库,需要进一步实验验证 | 探讨程序性细胞死亡模式与甲状腺癌预后的关系并开发预后预测模型 | 甲状腺癌患者 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 机器学习算法,非负矩阵分解,单细胞转录组分析 | SVM,多变量Cox回归,逻辑回归 | 基因表达谱,临床数据,单细胞转录组数据 | 568名甲状腺癌患者(来自TCGA数据库)和GSE184362单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
4065 | 2025-10-06 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq constructs a stemness-related signature for predicting prognosis and immunotherapy responses in hepatocellular carcinoma
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05202-2
PMID:37535162
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和批量RNA测序数据构建了一个干细胞相关特征模型,用于预测肝细胞癌的预后和免疫治疗反应 | 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,结合WGCNA和CytoTRACE分析方法,构建了包含10个基因的干细胞相关预后特征模型 | 研究使用的生物信息学分析方法存在一定局限性,需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌预后预测和免疫治疗反应评估的生物标志物 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, WGCNA, CytoTRACE, LASSO, Cox回归分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | 四个数据集的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4066 | 2025-10-06 |
A comprehensive analysis of the potential role of necroptosis in hepatocellular carcinoma using single-cell RNA Seq and bulk RNA Seq
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05208-w
PMID:37535163
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和bulk RNA测序分析坏死性凋亡在肝细胞癌中的作用,并构建预后预测模型 | 首次在肝细胞癌中鉴定出两种不同的坏死性凋亡亚型,并发现特定巨噬细胞亚群对坏死性凋亡高度敏感 | 研究主要基于TCGA数据库数据,需要进一步实验验证 | 研究坏死性凋亡在肝细胞癌发生发展中的作用并构建预后预测模型 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | 5基因预后模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4067 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of anoikis-related genes in prognosis and immune infiltration of gastric cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05157-4
PMID:37474682
|
研究论文 | 基于批量和单细胞RNA测序数据,构建胃癌失巢凋亡相关基因的预后风险模型并分析其与免疫浸润的关系 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据系统分析失巢凋亡相关基因在胃癌预后和免疫浸润中的作用 | 研究基于回顾性数据分析,需要进一步实验验证 | 建立胃癌预后预测模型并指导临床治疗 | 胃癌患者和胃癌相关细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | 多个数据集的胃癌样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
4068 | 2025-10-06 |
Combinatorial Immunotherapy with Agonistic CD40 Activates Dendritic Cells to Express IL12 and Overcomes PD-1 Resistance
2023-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0699
PMID:37478171
|
研究论文 | 本研究通过联合CD40激动剂、CSF1R阻断剂和抗PD-1的三联疗法克服黑色素瘤对PD-1抑制剂的耐药性 | 发现CCL22+CCL5+ IL12分泌型树突状细胞亚群是三联疗法的关键早期效应细胞,并证明IL12 mRNA单独治疗足以克服PD-1耐药 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据仅限于系统细胞因子谱比较 | 探索克服抗PD-1耐药性的免疫治疗新策略 | 小鼠黑色素瘤模型和人类患者样本 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,微孔检测,细胞因子分泌分析 | 动物模型 | 基因表达数据,细胞因子数据 | 多数小鼠显示完全肿瘤消退 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4069 | 2025-10-06 |
MuDCoD: multi-subject community detection in personalized dynamic gene networks from single-cell RNA sequencing
2023-10-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad592
PMID:37740957
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序数据中个性化动态基因网络的多主体社区检测方法 | 首次同时处理多个主体和多个时间点的网络,通过谱聚类框架促进主体间和不同时间点网络间的信息共享 | NA | 从个性化动态基因共表达网络中识别随时间变化和主体间共享或可变的基因社区 | 人类诱导多能干细胞在多巴胺能神经元分化过程中的单细胞RNA测序数据和CD4+ T细胞激活数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谱聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4070 | 2025-10-06 |
Investigation and verification of GIMAP6 as a robust biomarker for prognosis and tumor immunity in lung adenocarcinoma
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04980-z
PMID:37338641
|
研究论文 | 本研究验证了GIMAP6作为肺腺癌预后和肿瘤免疫的稳健生物标志物 | 首次系统验证GIMAP6在肺腺癌中的预后价值和免疫调节功能,并构建了包含GIMAP6的预后预测列线图 | NA | 探究GIMAP6在肺腺癌发展和肿瘤免疫中的作用机制 | 肺腺癌患者和肺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RT-qPCR, western blotting, CCK-8, 集落形成实验, Transwell实验, 单细胞RNA测序 | 列线图 | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的肺腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | TIMER 2.0和Tumor Immune Single-cell Hub数据库 |
4071 | 2025-10-06 |
Comprehensive landscape of the miRNA-regulated prognostic marker LAYN with immune infiltration and stemness in pan-cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04986-7
PMID:37335337
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法系统分析了LAYN基因在泛癌中的表达特征、预后价值和免疫调控功能 | 首次从泛癌角度全面分析LAYN基因,发现其与免疫浸润、肿瘤干细胞性和预后的关联,并预测其作为mRNA疫苗和分子治疗新靶点的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;部分结论需要进一步临床研究确认 | 探讨LAYN基因在泛癌中的表达模式、预后价值和生物学功能 | 人类多种癌症类型和正常组织样本 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 生物信息学分析,单细胞测序,机器学习 | 机器学习预后模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据,临床预后数据 | 来自GTEx和TCGA数据库的健康和癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4072 | 2025-10-06 |
LncRNAs associated with vascular mimicry establish a novel molecular subtype and prognostic model for pancreatic cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05015-3
PMID:37400573
|
研究论文 | 本研究通过血管生成拟态相关lncRNAs建立了胰腺癌的新型分子分型和预后模型 | 首次开发了基于血管生成拟态相关lncRNAs的胰腺癌分子分型,并构建了相应的预后风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索血管生成拟态在胰腺癌中的作用并建立相关预后模型 | 胰腺癌患者数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,差异分析,Spearman相关分析,非负矩阵分解算法 | Cox回归模型,LASSO回归模型 | 基因表达数据,临床病理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4073 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell RNA sequencing analysis reveals a mesenchymal stem cell-associated signature for estimating prognosis and drug sensitivity in gastric cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05058-6
PMID:37410142
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析识别间充质干细胞相关标志基因,构建了胃癌预后预测和药物敏感性评估模型 | 首次整合单细胞和批量测序数据构建MSC相关预后特征,并验证其在免疫微环境调节和药物敏感性预测中的价值 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证MSC特征的功能机制 | 评估间充质干细胞相关特征在胃癌预后预测和药物敏感性中的价值 | 胃癌患者和胃癌细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR | Cox回归风险模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-STAD训练队列和GEO验证队列的胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4074 | 2025-10-06 |
Identification and validation of cancer-associated fibroblast-related subtypes and the prognosis model of biochemical recurrence in prostate cancer based on single-cell and bulk RNA sequencing
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05011-7
PMID:37369799
|
研究论文 | 基于单细胞和批量RNA测序识别癌症相关成纤维细胞相关亚型并构建前列腺癌生化复发预后模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,通过NMF聚类识别CAF相关前列腺癌亚型,并建立BCR相关CAF特征标志 | 研究依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 研究前列腺癌中癌症相关成纤维细胞特征并开发生化复发预后预测模型 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NMF聚类, Lasso回归, Cox回归, 列线图 | RNA测序数据, 临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的前列腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
4075 | 2025-10-06 |
Identification a unique disulfidptosis classification regarding prognosis and immune landscapes in thyroid carcinoma and providing therapeutic strategies
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05006-4
PMID:37347261
|
研究论文 | 本研究通过双硫死亡相关基因建立了甲状腺癌的新型分类系统,用于预测患者预后和免疫治疗敏感性 | 首次将双硫死亡与甲状腺癌预后关联,建立了基于24个双硫死亡基因的分类模型和预后指数 | 研究机制尚未完全阐明,双硫死亡与甲状腺乳头状癌预后的具体关联仍需进一步验证 | 探讨双硫死亡与甲状腺癌预后的关系,开发基于双硫死亡基因的预后预测模型 | 甲状腺癌患者 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 非负矩阵分解,单细胞转录组分析,多变量cox回归分析 | Enet模型,列线图模型 | 基因表达谱,体细胞突变信息,拷贝数变异数据,临床数据 | TCGA甲状腺癌患者数据集和GEO数据库GSE184362单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4076 | 2025-10-06 |
Lung tumor-infiltrating Treg have divergent transcriptional profiles and function linked to checkpoint blockade response
2023-09-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg1487
PMID:37713507
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据,揭示了肺肿瘤浸润调节性T细胞在免疫检查点阻断治疗中的双重作用 | 首次发现TIL-Treg细胞可分为具有相反功能的亚群,其中OX40+GITR+亚群具有强抑制性且与PD-1阻断耐药相关,而TAA特异性Treg细胞可转化为T1样表型并促进抗肿瘤免疫 | 研究样本量相对有限,动物模型与人类肿瘤环境存在差异,需要进一步验证这些亚群的功能机制 | 探究调节性T细胞在免疫检查点阻断治疗应答中的作用机制 | 非小细胞肺癌患者和鼠类肿瘤模型的肿瘤浸润T细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 转移学习 | 单细胞转录组数据 | 超过73,000个肿瘤浸润T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, TCR测序 | NA | NA |
4077 | 2025-10-06 |
A unified pipeline for FISH spatial transcriptomics
2023-Sep-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100384
PMID:37719153
|
研究论文 | 开发了一个用于FISH空间转录组学数据分析的统一标准化流程PIPEFISH | 扩展并改进了starfish库,创建了半自动化、可通用的FISH空间转录组学分析流程 | 流程为半自动化,需要一定程度的人工介入 | 解决空间转录组学数据分析工具缺乏标准化的问题 | FISH空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 荧光原位杂交(FISH) | NA | 空间转录组学图像数据 | 三个真实数据集(MERFISH、seqFISH和ISS) | NA | 空间转录组学,FISH | NA | NA |
4078 | 2025-10-06 |
An ovarian phenotype of alpha 7 nicotinic receptor knockout mice
2023-09-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-23-0123
PMID:37432973
|
研究论文 | 本研究通过形态学和分子生物学方法探讨了α7烟碱型乙酰胆碱受体在成年小鼠卵巢中的表达及其功能 | 首次系统揭示了Chrna7基因敲除对卵巢形态、原始卵泡数量和卵巢基质细胞的显著影响 | 研究仅针对成年小鼠,未涉及其他发育阶段;样本量相对有限 | 探索nAChRa7受体在卵巢功能中的潜在作用 | Chrna7基因敲除成年小鼠和野生型小鼠的卵巢组织 | 分子生物学 | 生殖系统疾病 | qPCR, 免疫组织化学, 原位杂交, 单细胞测序, 蛋白质组学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 分子数据, 形态学数据, 蛋白质组数据 | 成年Chrna7基因敲除小鼠和野生型小鼠(3月龄,动情间期) | NA | 单细胞测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
4079 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04965-y
PMID:37296316
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,构建基于NK细胞标记基因的特征来预测肝细胞癌预后和免疫治疗反应 | 首次结合单细胞测序和转录组数据构建基于NK细胞标记基因的肝细胞癌预后预测模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌预后预测和免疫治疗反应评估的生物标志物 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Cox回归模型, lasso回归 | 基因表达数据 | TCGA、GEO和ICGC数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4080 | 2025-10-06 |
A pairwise immune gene model for predicting overall survival and stratifying subtypes of colon adenocarcinoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04957-y
PMID:37316691
|
研究论文 | 开发基于免疫基因对的模型用于预测结肠腺癌患者总生存期和亚型分层 | 首次构建基于三对免疫基因对的预后模型,并通过单细胞RNA测序验证关键基因在炎症巨噬细胞中的表达模式 | 模型验证主要依赖公共数据库数据,需要进一步前瞻性临床研究验证 | 建立结肠腺癌预后评估模型和风险分层方法 | 结肠腺癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | Cox回归模型,基因对模型 | 基因表达谱,临床生存数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结肠腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |