单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4041	2025-03-02	In Vivo Developmental Trajectories of Human Podocyte Inform In Vitro Differentiation of Pluripotent Stem Cell-Derived Podocytes 2019-07-01, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2019.06.001 PMID:31265809	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了人类胎儿肾脏中足细胞的发育轨迹，并探讨了多能干细胞衍生的足细胞在体外分化中的应用	揭示了人类足细胞发育的内在调控机制，并展示了器官样衍生的足细胞在疾病建模和肾脏功能恢复中的潜力	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证	理解足细胞的发育和功能，以创建相关的体外足细胞模型	人类胎儿肾脏中的足细胞	生物医学	慢性肾病	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	人类胎儿肾脏样本
4042	2025-03-01	Single-cell immunopathology of recurrent acute generalized exanthematous pustulosis associated with vancomycin 2025-May, The journal of allergy and clinical immunology. Global DOI:10.1016/j.jacig.2025.100426 PMID:40008097	研究论文	本文通过单细胞测序技术研究了一位由万古霉素引发的复发性急性泛发性发疹性脓疱病（AGEP）患者的免疫病理机制和遗传风险因素	首次在AGEP患者中应用单细胞测序技术，揭示了TH17样效应细胞在AGEP皮肤炎症中的关键作用，并探讨了HLA-A∗32:01等遗传风险因素	研究仅基于单一病例，样本量有限，结果可能需要更大规模的研究验证	探讨AGEP的免疫病理机制和遗传风险因素	一位复发性AGEP患者	数字病理	皮肤疾病	单细胞测序	NA	基因和蛋白质表达数据	1位患者，3个时间点的皮肤活检样本
4043	2025-03-01	Single-cell sequencing revealed the necessity of macrophages in brain microenvironment remodeling by breast cancer metastasis 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102287 PMID:39837060	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了乳腺癌脑转移中巨噬细胞在脑微环境重塑中的必要性	首次在小鼠模型中进行乳腺癌脑转移的单细胞RNA测序，揭示了巨噬细胞亚群在中枢神经系统中的变化及其在免疫逃逸和营养供应中的作用	研究样本量较小，仅分析了三个脑手术标本和小鼠模型的数据	全面研究脑肿瘤微环境，识别促进脑转移的促肿瘤机制及关键分子	乳腺癌脑转移的脑手术标本和小鼠模型	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	三个脑手术标本和小鼠模型
4044	2025-03-01	Comprehensive analysis and experiments identified ANXA1 as an unfavorable prognosticator in glioma 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102286 PMID:39842212	研究论文	本文通过生物信息学分析和实验验证了ANXA1在胶质瘤中的不利预后作用	首次通过单细胞测序技术揭示了ANXA1在胶质母细胞瘤细胞中的高表达及其在免疫细胞中的富集情况	ANXA1在胶质瘤中的促癌机制及其与患者功能状态的相关性需要进一步研究	探讨ANXA1在胶质瘤中的预后价值及其对细胞增殖、迁移和侵袭的影响	胶质瘤患者和胶质瘤细胞	数字病理学	胶质瘤	实时定量PCR、Western blotting、单细胞测序	NA	基因表达数据、实验数据	两个队列的胶质瘤患者样本
4045	2025-03-01	CD47 is a tumor cell-derived exosomal signature and regulates tumor immune microenvironment and immunotherapy responses 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102291 PMID:39864342	研究论文	本文探讨了CD47作为肿瘤细胞来源的外泌体标志物，在调节肿瘤免疫微环境和免疫治疗反应中的作用	研究发现CD47是肿瘤来源外泌体的标志物，能够区分免疫热和免疫冷肿瘤，并反映免疫治疗反应	研究主要基于转录组和单细胞RNA测序数据，未涉及实验验证	识别能够区分免疫热和免疫冷肿瘤并反映免疫治疗反应的肿瘤来源外泌体标志物	卵巢癌、乳腺癌及其他妇科癌症患者	肿瘤免疫学	卵巢癌、乳腺癌	转录组测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据、单细胞RNA测序数据	大量转录组和单细胞RNA测序数据集，包括卵巢癌、乳腺癌及其他妇科癌症患者
4046	2025-03-01	Cellular heterogeneity and communication networks in gastric cancer: Single-cell analysis reveals β-hydroxybutyrylation-associated genes and immune infiltration characteristics 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102270 PMID:39884220	研究论文	本研究利用单细胞测序技术解析了胃癌的细胞异质性和细胞间通讯网络，重点研究了β-羟基丁酰化（Kbhb）相关基因及其对肿瘤微环境的影响	首次在单细胞水平上鉴定了胃癌中与β-羟基丁酰化相关的基因，并揭示了这些基因在免疫浸润和肿瘤微环境重塑中的关键作用	研究主要基于TCGA数据集，样本来源和多样性可能有限，且未进行实验验证	解析胃癌的细胞异质性和细胞间通讯网络，探索β-羟基丁酰化相关基因的预后价值和治疗潜力	胃癌患者	数字病理学	胃癌	单细胞测序	风险评分模型	单细胞基因表达数据	189,700个单细胞样本
4047	2025-03-01	Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis of clock circadian regulator with prognostic and immune microenvironment in thyroid cancer 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102299 PMID:39892222	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，探讨了时钟昼夜节律调节器（CLOCK）在甲状腺癌进展及其免疫微环境中的作用	首次结合单细胞和批量RNA测序技术，揭示了CLOCK在甲状腺癌中的过表达及其对肿瘤生长和免疫微环境的影响	研究主要依赖于生物信息学分析和体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索CLOCK在甲状腺癌中的作用及其潜在机制	甲状腺癌	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序, 批量RNA测序	LASSO回归, Kaplan-Meier生存估计	RNA测序数据	小鼠模型和人类样本
4048	2025-03-01	Exploration of heterogeneity and recurrence signatures in hepatocellular carcinoma 2025-Feb-28, Molecular oncology IF:5.0Q1 DOI:10.1002/1878-0261.70012 PMID:40018995	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据的整合分析，探索了肝细胞癌（HCC）的异质性和复发特征，揭示了复发HCC中恶性细胞和免疫细胞的变化，并提出了MIF-(CD74+CXCR4)信号通路作为关键机制	开发了一个复发肿瘤细胞相关风险评分（RTRS），能够独立预测总体生存时间和无复发生存时间，且比传统临床变量具有更高的准确性	研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和数据质量的限制	探索肝细胞癌的异质性和复发特征，识别关键治疗靶点，设计有效的抗癌疗法	肝细胞癌（HCC）的原发和早期复发样本	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序，RT-qPCR	机器学习	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
4049	2025-03-01	Transcriptome Landscape of Cancer-Associated Fibroblasts in Human PDAC 2025-Feb-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415196 PMID:40019403	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序分析，全面描绘了人类胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）的转录组景观	识别了包括新发现的CAF亚型在内的九种不同的CAF亚型，并揭示了CAF亚型之间的分化可塑性及其与临床不良结果的关联	NA	研究胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的转录组特征及其动态转换	人类胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
4050	2025-03-01	The bone marrow NK cell profile predicts MRD negativity in patients with multiple myeloma treated with daratumumab-based therapy 2025-Feb-28, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024026455 PMID:40019438	研究论文	本研究通过单细胞转录组学、流式细胞术和功能实验，探讨了多发性骨髓瘤（MM）患者诊断时和治疗期间骨髓中自然杀伤（NK）细胞的变化	揭示了诊断时CD16+细胞毒性NK细胞比例降低与达雷妥尤单抗治疗下细胞因子产生减少和NK细胞脱颗粒能力下降的相关性，并发现CD16+骨髓NK细胞比例低的患者在接受达雷妥尤单抗治疗后达到MRD阴性的可能性降低	研究结果主要基于CASSIOPEIA试验的数据，可能不适用于其他治疗方案或患者群体	探讨骨髓NK细胞在多发性骨髓瘤患者接受达雷妥尤单抗治疗中的预测作用	多发性骨髓瘤患者	免疫治疗	多发性骨髓瘤	单细胞转录组学、流式细胞术、功能实验	NA	细胞数据	CASSIOPEIA试验中的多发性骨髓瘤患者
4051	2025-03-01	Elucidating prognostic significance of purine metabolism in colorectal cancer through integrating data from transcriptomic, immunohistochemical, and single-cell RNA sequencing analysis 2025-Feb-27, Molecular oncology IF:5.0Q1 DOI:10.1002/1878-0261.70010 PMID:40017120	研究论文	本研究通过整合转录组、免疫组化和单细胞RNA测序数据，探讨了嘌呤代谢在结直肠癌中的预后意义	首次通过免疫组化验证嘌呤代谢作为结直肠癌预后标志物的临床相关性，并发现五个嘌呤代谢相关基因的低表达与不良预后相关	嘌呤代谢反应的可逆性可能影响研究结果的稳定性	评估嘌呤代谢在结直肠癌中的临床相关性及其作为预后标志物的潜力	结直肠癌患者	数字病理学	结直肠癌	转录组分析、免疫组化(IHC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据、免疫组化数据、单细胞RNA测序数据	结直肠癌患者亚组（包括野生型TP53、突变型TP53和微卫星稳定表型）
4052	2025-03-01	The spatial landscape of cancer hallmarks reveals patterns of tumor ecological dynamics and drug sensitivity 2025-Feb-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115229 PMID:39864059	研究论文	本文通过空间转录组学技术，探索了10种癌症类型中63个未经治疗的原发性肿瘤的癌症标志物空间分布，揭示了肿瘤生态动力学模式和药物敏感性	首次展示了癌症标志物在肿瘤空间中的组织化分布，并发现肿瘤亚克隆之间的基因组距离与标志物活性差异相关，甚至导致克隆-标志物特化	研究样本量相对较小，仅涉及63个肿瘤样本和33名膀胱癌患者，可能限制了结果的普遍性	探索肿瘤生态动力学和药物敏感性，以改善对肿瘤生态的理解并帮助识别新的药物生物标志物	10种癌症类型中63个未经治疗的原发性肿瘤和33名膀胱癌患者	数字病理学	癌症	空间转录组学	NA	空间转录组数据	63个原发性肿瘤样本和33名膀胱癌患者
4053	2025-03-01	Pde4b-regulated cAMP signaling pathway in the AUDGABA-S1TrSst circuit underlies acute-stress-induced anxiety-like behavior 2025-Feb-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115253 PMID:39891910	研究论文	本文研究了急性应激诱导的焦虑样行为的神经和分子机制，发现S1Tr区域的GABA能生长抑素神经元在这一过程中起关键作用	揭示了急性应激通过AUD-S1Tr投射中的Pde4b调控的cAMP信号通路影响S1Tr神经元活动，从而调控焦虑行为的分子机制	研究主要聚焦于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探索急性应激诱导焦虑行为的神经和分子机制	小鼠的S1Tr区域GABA能生长抑素神经元	神经科学	焦虑症	单细胞测序、空间转录组测序	NA	基因表达数据	NA
4054	2025-03-01	Single-cell multi-omics analysis identifies SPP1+ macrophages as key drivers of ferroptosis-mediated fibrosis in ligamentum flavum hypertrophy 2025-Feb-25, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-025-00746-6 PMID:40001138	研究论文	本研究通过单细胞多组学分析揭示了SPP1+巨噬细胞在铁死亡介导的黄韧带肥厚纤维化中的关键作用	首次通过单细胞RNA测序和多组学整合分析，揭示了SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴调控高铁死亡评分成纤维细胞的铁死亡，从而促进黄韧带肥厚纤维化的机制	研究主要基于单细胞测序和动物模型，临床样本验证仍需进一步扩大	探讨黄韧带肥厚纤维化的细胞和分子机制	人类黄韧带样本和小鼠模型	数字病理	腰椎管狭窄症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、孟德尔随机化（MR）	NA	单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据	人类黄韧带样本和小鼠模型
4055	2025-03-01	Molecular profiling of skin cells identifies distinct cellular signatures in radiation-induced skin injury across various stages in the murine dataset 2025-Feb-25, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1 DOI:10.1186/s40164-025-00596-w PMID:40001256	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，详细分析了辐射诱导皮肤损伤（RISI）在不同阶段的分子特征，揭示了细胞亚群和分子机制	首次使用单细胞RNA测序技术全面解析辐射诱导皮肤损伤的细胞亚群和分子机制，揭示了循环角质形成细胞、分泌乳头状成纤维细胞和淋巴内皮细胞在RISI中的关键作用	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	增强对辐射诱导皮肤损伤的分子机制的理解，为治疗提供新的靶点	C57BL/6小鼠的皮肤细胞	数字病理学	皮肤损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-PCR、多重免疫荧光染色	NA	单细胞RNA测序数据	71,412个细胞，来自C57BL/6小鼠的皮肤样本
4056	2025-03-01	Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects 2025-Feb-24, American journal of hypertension IF:3.2Q2 DOI:10.1093/ajh/hpaf027 PMID:39989120	研究论文	本文探讨了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性机制及其治疗前景	利用单细胞RNA测序技术深入揭示了内皮细胞的分子多样性和转录异质性，并探讨了内皮细胞表型转换在心血管疾病中的作用	文章未明确提及具体的研究样本量或实验设计的局限性	研究内皮细胞的表型可塑性及其在心血管疾病中的机制，以开发靶向治疗策略	内皮细胞及其在不同血管床和发育阶段的表型转换	心血管疾病	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
4057	2025-03-01	Advances and Challenges in Modeling Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease: A Focus on Kidney Organoids 2025-Feb-19, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13020523 PMID:40002937	综述	本文综述了常染色体显性多囊肾病（ADPKD）模型的最新进展，特别是肾脏类器官构建技术的创新，以及这些技术在疾病机制研究和药物发现中的应用	利用iPSC衍生的ADPKD类器官模型，结合微流体生物反应器培养系统和单细胞转录组学等新兴技术，提供了更直接的病理表型观察和疾病机制探索	当前技术存在血管化和成熟度不足的问题，限制了模型的准确性	总结ADPKD类器官构建的最新进展，探讨当前技术的局限性，并提出未来突破的关键问题	常染色体显性多囊肾病（ADPKD）	数字病理学	肾脏疾病	微流体生物反应器培养系统, 单细胞转录组学	iPSC衍生的ADPKD类器官模型	NA	NA
4058	2025-03-01	The Endothelial Cell-Related Genes EIF1 and HSPA1B Contribute to the Pathogenesis of Alzheimer's Disease by Modulating Peripheral Immunoinflammatory Responses 2025-Feb-16, Brain sciences IF:2.7Q3 DOI:10.3390/brainsci15020205 PMID:40002537	研究论文	本文通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B在阿尔茨海默病（AD）发病机制中的作用，特别是通过调节外周免疫炎症反应	首次识别出内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B与AD进展相关，并揭示了它们通过调节外周免疫炎症反应参与AD发病机制的潜在分子机制	研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证这些基因在AD中的具体作用机制	探讨内皮细胞相关基因在阿尔茨海默病发病机制中的作用	内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B	生物信息学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	LASSO回归和随机森林算法	RNA测序数据	单细胞RNA测序数据集GSE157827及队列外周血RNA测序数据
4059	2025-03-01	EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma Cell-Derived Exosomal miR-651-5p Induces CD8+ T Cell Apoptosis via Downregulating BCL2 Expression 2025-Feb-15, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13020482 PMID:40002895	研究论文	本文研究了EGFR突变型肺腺癌细胞通过外泌体miR-651-5p诱导CD8+ T细胞凋亡的机制，并探讨了miR-651-5p拮抗剂在增强PD-1抑制剂疗效中的作用	揭示了EGFR突变型肺腺癌细胞通过外泌体miR-651-5p诱导CD8+ T细胞凋亡的新机制，并提出了miR-651-5p拮抗剂与PD-1抑制剂联合治疗的新策略	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证其效果	探讨EGFR突变型非小细胞肺癌（NSCLC）患者对PD-1或PD-L1抑制剂疗效不佳的机制，并寻找新的治疗策略	EGFR突变型肺腺癌细胞、CD8+ T细胞、外泌体miR-651-5p	肿瘤免疫学	肺癌	小RNA测序、单细胞测序、流式细胞术、小鼠模型	小鼠模型	RNA测序数据、流式细胞数据	临床标本、小鼠模型
4060	2025-03-01	Assessing the Causal Relationship Between Plasma Proteins and Pulmonary Fibrosis: A Systematic Analysis Based on Mendelian Randomization 2025-Feb-14, Biology DOI:10.3390/biology14020200 PMID:40001968	研究论文	本研究利用孟德尔随机化方法评估血浆蛋白与肺纤维化之间的因果关系，并识别潜在药物靶点	首次系统性地通过孟德尔随机化方法分析血浆蛋白与肺纤维化的因果关系，并结合多种生物信息学方法评估靶点的生物学功能和药理潜力	研究依赖于已有的GWAS和pQTL数据，可能受限于数据的质量和样本量	探索血浆蛋白与肺纤维化之间的因果关系，识别潜在药物靶点	血浆蛋白和肺纤维化	生物信息学	肺纤维化	孟德尔随机化、富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、药物预测、分子对接、单细胞测序	NA	基因组数据、蛋白质数据	血浆蛋白数据样本量35,559，肺纤维化相关GWAS数据样本量469,126