单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4041 - 4060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4041 | 2025-10-06 |
A novel EIF3C-related CD8+ T-cell signature in predicting prognosis and immunotherapy response of nasopharyngeal carcinoma
2024-Feb-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05552-x
PMID:38400862
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于EIF3C相关CD8+ T细胞特征的预测模型，用于评估鼻咽癌预后和免疫治疗反应 | 首次构建了EIF3C相关的CD8+ T细胞特征(ETS)预测模型，能够同时预测鼻咽癌预后和免疫治疗反应 | NA | 开发可靠的生物标志物以准确预测鼻咽癌免疫治疗效果 | 鼻咽癌肿瘤免疫微环境中的CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫浸润评估算法 | LASSO算法, Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4042 | 2025-10-06 |
Indoximod-based chemo-immunotherapy for pediatric brain tumors: A first-in-children phase I trial
2024-02-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad174
PMID:37715730
|
研究论文 | 评估吲哚莫德联合化疗和放疗治疗儿童复发性脑肿瘤或新诊断弥漫性内生性脑桥胶质瘤的首次儿童I期临床试验 | 首次在儿童中评估IDO通路抑制剂吲哚莫德联合治疗的临床试验，通过单细胞测序证实了新循环CD8 T细胞克隆型的出现 | I期试验主要关注安全性和剂量确定，样本量有限，需要进一步II/III期试验验证疗效 | 评估吲哚莫德联合化疗或放疗治疗儿童脑肿瘤的安全性、耐受性和初步疗效 | 儿童复发性脑肿瘤或新诊断弥漫性内生性脑桥胶质瘤患者 | 临床试验 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序 | NA | 临床数据，血液样本测序数据 | 81名患者 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 4043 | 2025-10-06 |
Dictionary learning for integrative, multimodal and scalable single-cell analysis
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01767-y
PMID:37231261
|
研究论文 | 提出了一种名为'桥接整合'的新方法，通过多组学数据集作为分子桥梁整合跨模态的单细胞数据 | 首次使用多组学数据集作为字典来重建单模态数据集并将其转换到共享空间，实现了跨模态的单细胞数据整合 | 需要多组学数据集作为桥梁，可能受到多组学数据质量和可用性的限制 | 开发能够整合不同分子模态的单细胞数据分析方法 | 人类免疫细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性分析,组蛋白修饰分析,DNA甲基化分析,蛋白质水平检测 | 字典学习 | 单细胞多组学数据 | 860万个人类免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 4044 | 2025-10-06 |
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) deletion in myeloid cells augments cholestatic liver injury
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52710-3
PMID:38273071
|
研究论文 | 本研究探讨骨髓细胞中TRAIL缺失对胆汁淤积性肝损伤的影响 | 首次揭示骨髓细胞来源的TRAIL通过限制胆管反应细胞扩张来减轻胆汁淤积性肝损伤 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 阐明TRAIL在胆汁淤积性肝损伤中的保护机制 | 野生型、Trail缺失和骨髓特异性Trail缺失的C57BL/6小鼠 | 肝脏病理学 | 胆汁淤积性肝病 | 高维质谱流式细胞术、空间转录组学、原位杂交 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组织学数据 | 多组基因工程小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4045 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals STAT1 Drives LHPP Downregulation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241293485
PMID:39497541
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了STAT1通过下调LHPP表达在食管鳞状细胞癌进展中的核心调控作用 | 首次发现STAT1对LHPP的转录调控关系，揭示了ESCC中复杂的调控环路 | 样本量相对有限（21例患者），需要更大规模研究验证 | 探索食管鳞状细胞癌的分子机制和细胞动态，重点关注STAT1与LHPP的调控关系 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本和细胞系 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21例ESCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4046 | 2025-10-06 |
Applications of single-cell RNA sequencing in rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491318
PMID:39600707
|
综述 | 探讨单细胞RNA测序技术在类风湿关节炎研究中的应用与前景 | 系统阐述单细胞RNA测序技术在解析类风湿关节炎细胞异质性和分子机制中的创新应用价值 | 成本较高、低丰度转录本检测灵敏度不足、数据分析流程相对复杂 | 探索单细胞RNA测序在自身免疫疾病研究中的应用潜力 | 类风湿关节炎 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4047 | 2025-10-06 |
Unique lymphocyte transcriptomic profiles in septic patients with chronic critical illness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1478471
PMID:39691721
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者淋巴细胞转录组特征，揭示慢性危重症患者特有的免疫细胞变化模式 | 首次在单细胞水平系统描述脓毒症后慢性危重症患者淋巴细胞群体的转录组特征，发现CD8+效应记忆T细胞和NK细胞的耗竭特征 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究脓毒症后不同临床轨迹患者的免疫细胞转录组特征 | 健康受试者、急性期脓毒症患者、快速康复患者和慢性危重症患者 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, ELISpot, 细胞因子分析, T细胞增殖实验 | NA | 单细胞转录组数据, 功能验证数据 | scRNA-seq: 12名健康人+4名急性期+4名快速康复+5名CCI；功能验证: 19名健康人+68名急性期+27名快速康复+20名CCI | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4048 | 2025-10-06 |
Current state and future prospects of spatial biology in colorectal cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1513821
PMID:39711954
|
综述 | 本文综述了空间生物学技术在结直肠癌研究中的最新进展、应用挑战及未来发展方向 | 系统评估空间转录组学和空间蛋白质组学在解析结直肠癌肿瘤微空间结构中的创新应用价值 | 当前方法存在组织异质性挑战，缺乏有效管理复杂数据集的计算工具 | 探讨空间生物学技术在结直肠癌精准医疗策略中的应用前景 | 结直肠癌肿瘤微环境及其空间组织结构 | 空间生物学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 4049 | 2025-10-06 |
Computational discovery of co-expressed antigens as dual targeting candidates for cancer therapy through bulk, single-cell, and spatial transcriptomics
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae096
PMID:39872360
|
研究论文 | 开发计算流程发现共表达抗原对作为癌症治疗的双特异性抗体靶点 | 结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学优势，克服单一方法的局限性 | 研究聚焦于肝细胞癌，在其他癌症类型中的适用性需进一步验证 | 开发计算流程识别癌症特异性共表达抗原对用于双特异性抗体治疗 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞和正常细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 计算流程 | 转录组数据 | bulk RNA-seq数据库OCTAD，单细胞RNA-seq包含39,361个健康细胞和18,000个HCC肿瘤细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4050 | 2025-10-06 |
Deriving early single-rosette brain organoids from human pluripotent stem cells
2023-12-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.020
PMID:37995702
|
研究论文 | 开发了一种从人多能干细胞生成早期单玫瑰花结脑类器官的新方法 | 通过从二维单层细胞而非三维拟胚体起始，实现了具有可重复大小和结构的单玫瑰花结皮质类器官的生成 | NA | 开发改进的脑类器官生成方法用于研究人脑发育和疾病建模 | 人多能干细胞生成的脑类器官 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序,免疫细胞化学 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4051 | 2025-10-06 |
Integrative lactylation and tumor microenvironment signature as prognostic and therapeutic biomarkers in skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05483-7
PMID:37955686
|
研究论文 | 本研究通过整合乳酸化修饰和肿瘤微环境特征，构建了皮肤黑色素瘤的预后预测模型和治疗生物标志物 | 首次将乳酸化修饰与肿瘤微环境特征相结合构建预后模型，并发现CLPB基因在黑色素瘤中的关键功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测方法和治疗指导策略 | 皮肤黑色素瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，LASSO回归，Cox回归，CIBERSORT算法 | LAC-TME分类器，预后模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的皮肤黑色素瘤样本 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4052 | 2025-10-06 |
Combined signature of G protein-coupled receptors and tumor microenvironment provides a prognostic and therapeutic biomarker for skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05486-4
PMID:38006451
|
研究论文 | 本研究通过分析G蛋白偶联受体相关基因和肿瘤微环境构建了皮肤黑色素瘤的预后模型 | 首次结合GPCRs相关基因和肿瘤微环境构建预后分类器，并鉴定出GPR19作为新的生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 构建皮肤黑色素瘤的预后模型以指导临床治疗策略 | 皮肤黑色素瘤患者和黑色素瘤细胞系(A375, A2058) | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 差异表达分析, LASSO算法, Cox回归分析, 单细胞RNA测序, 细胞实验 | 预后模型, GPR-TME分类器 | 基因表达数据, 临床信息, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4053 | 2025-10-06 |
Machine learning- and WGCNA-mediated double analysis based on genes associated with disulfidptosis, cuproptosis and ferroptosis for the construction and validation of the prognostic model for breast cancer
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05378-7
PMID:37712959
|
研究论文 | 基于双硫死亡、铜死亡和铁死亡相关基因构建乳腺癌预后模型 | 首次整合双硫死亡相关基因(DRGs)、铜死亡相关基因(CRGs)和铁死亡相关基因(FRGs)构建乳腺癌预后特征 | NA | 构建和验证乳腺癌预后预测模型 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,Cox回归分析 | 无监督聚类分析,Lasso-Cox分析,WGCNA | 基因表达数据 | TCGA-BRCA数据库训练集和验证集,GSE20685和GSE42568外部验证集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4054 | 2025-10-06 |
Anti-PD-1 immunotherapy with androgen deprivation therapy induces robust immune infiltration in metastatic castration-sensitive prostate cancer
2023-11-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.10.006
PMID:37922910
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析转移性去势敏感性前列腺癌患者在接受抗PD-1免疫治疗联合雄激素剥夺治疗后的肿瘤微环境免疫浸润变化 | 首次在转移性去势敏感性前列腺癌中开展纵向单细胞RNA测序分析，揭示跨多个转移部位保守的免疫亚群及其与治疗反应和临床结局的关联 | 样本来源于单一二期临床试验，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探究转移性去势敏感性前列腺癌肿瘤微环境的免疫特征及治疗反应机制 | 转移性去势敏感性前列腺癌患者的转移部位组织样本 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 二期临床试验(NCT03951831)参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4055 | 2025-10-06 |
Transcriptomes and metabolism define mouse and human MAIT cell populations
2023-11-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abn8531
PMID:37948512
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢分析定义了小鼠和人类MAIT细胞在不同器官中的群体特征及发育途径 | 首次系统比较了小鼠和人类MAIT细胞的转录组和代谢特征，揭示了物种间MAIT细胞功能的差异及环境对MAIT细胞的影响 | 研究主要关注MAIT17和MAIT1亚群，可能未完全覆盖所有MAIT细胞亚型；人类样本仅限于肺和血液 | 阐明小鼠和人类MAIT细胞在不同组织中的转录组和代谢特征差异 | 小鼠和人类黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 表型分析, 代谢分析 | NA | 转录组数据, 代谢数据 | 多器官组织样本（包括胸腺、肺、血液） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4056 | 2025-10-06 |
IFNɣ but not IFNα increases recognition of insulin defective ribosomal product-derived antigen to amplify islet autoimmunity
2023-11, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05991-8
PMID:37581620
|
研究论文 | 本研究探讨了干扰素γ通过诱导免疫蛋白酶体亚基表达增强胰岛素缺陷核糖体产物衍生抗原呈递的机制 | 首次揭示IFNγ通过诱导PSMB10表达增强胰岛素DRiP衍生抗原呈递，并发现该基因在1型糖尿病患者胰岛β细胞中特异性上调 | 研究主要使用人β细胞系EndoC-βH1，未在原发性人胰岛中完全验证 | 研究早期先天细胞因子和晚期免疫适应性事件在胰岛素DRiP衍生肽呈递中的作用 | 人胰岛β细胞、EndoC-βH1细胞系、糖尿病源性CD8+ T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组测序、siRNA干扰、抗原肽呈递检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4057 | 2025-10-06 |
Spatial enrichment of the type 1 interferon signature in the brain of a neuropsychiatric lupus murine model
2023-11, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.06.021
PMID:37369340
|
研究论文 | 本研究通过验证神经精神性狼疮小鼠模型，揭示大脑中1型干扰素信号的空间富集特征及其对细胞通讯通路的抑制作用 | 首次发现1型干扰素特征在大脑实质中形成空间分区的斑块状富集，并通过单核测序揭示其对神经元发育通路的普遍抑制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究1型干扰素在中枢神经系统中介导神经精神性狼疮症状的机制 | 神经精神性狼疮小鼠模型的大脑组织 | 空间转录组学 | 神经精神性狼疮 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4058 | 2025-10-06 |
Machine learning and single-cell sequencing reveal the potential regulatory factors of mitochondrial autophagy in the progression of gastric cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05287-9
PMID:37648811
|
研究论文 | 通过机器学习和单细胞测序技术分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的潜在调控因子 | 结合机器学习算法与单细胞RNA测序技术系统分析胃癌中线粒体自噬的调控网络 | 研究样本量有限（13个GC样本），需要进一步实验验证 | 全面分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 胃癌细胞和组织 | 机器学习 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 支持向量机, 随机森林 | 基因表达数据 | 13个GC样本中的28,836个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4059 | 2025-10-06 |
A novel coiled-coil domain containing-related gene signature for predicting prognosis and treatment effect of breast cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05222-y
PMID:37558766
|
研究论文 | 开发了一个基于卷曲螺旋结构域相关基因的预后特征模型，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗效果 | 首次系统研究CCDC蛋白家族在乳腺癌中的预后价值，并构建了包含5个基因的风险预测模型 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证 | 建立乳腺癌预后预测模型并评估其治疗指导价值 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序，基因表达分析，药物敏感性分析 | Cox回归，LASSO回归，风险评分模型 | 基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA、METABRIC和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4060 | 2025-10-06 |
The role of KPNA2 as a monotonically changing differentially expressed gene in the diagnosis, risk stratification, and chemotherapy sensitivity of chronic hepatitis B-liver cirrhosis-hepatocellular carcinoma
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05213-z
PMID:37526663
|
研究论文 | 本研究探讨KPNA2基因在慢性乙型肝炎-肝硬化-肝细胞癌演变过程中的诊断、风险分层和化疗敏感性价值 | 首次发现KPNA2作为单调变化差异表达基因在CLH演变过程中的动态表达规律，并构建了预测HCC发生风险的列线图模型 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证KPNA2的临床应用价值 | 探索KPNA2在慢性乙型肝炎-肝硬化-肝细胞癌演变过程中的诊断和预后价值 | 慢性乙型肝炎患者、肝硬化患者和肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | ELISA, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | 列线图模型, Cox回归模型 | 基因表达数据, 临床病理数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |