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当前共找到 40084 篇文献,本页显示第 4021 - 4040 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4021 2026-04-19
Smoothie: efficient inference and integration of spatial co-expression networks from denoised spatial transcriptomics data
2026-Mar-26, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Smoothie的流程,用于对空间转录组数据进行去噪并构建和整合全基因组共表达网络 提出了一个结合高斯平滑去噪与并行化计算的高效流程,能够处理超过1亿个空间分辨点的数据集,并实现快速运行和低内存使用 NA 从高分辨率空间转录组数据中提取深入的生物学见解,包括基因模块检测、功能注释和跨样本比较 空间转录组数据中的基因共表达网络 空间转录组学 NA 空间转录组学 高斯平滑 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
4022 2026-04-19
Palmatine ameliorates MASLD in type 2 diabetes by modulating hepatic apoptosis and inflammation
2026-Mar-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过多组学生物信息学分析和实验验证,揭示了黄连素通过调控ADRB2、BCL3等五个核心靶点抑制肝细胞凋亡,从而改善2型糖尿病相关的代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) 首次采用顺序性多组学生物信息学工作流程,结合机器学习预测和单细胞测序验证,系统性地识别了黄连素治疗MASLD的五个核心靶点,并通过动物模型进行了机制验证 研究主要在动物模型中进行,尚未进行人体临床试验;多组学预测的靶点网络需要更深入的分子机制研究 探究黄连素改善2型糖尿病相关MASLD的作用机制 2型糖尿病相关的代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) 生物信息学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 单细胞测序,分子对接,多组学分析 机器学习 基因表达数据,单细胞测序数据 大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4023 2026-03-11
DGM: deep graph clustering with mincut for analysis of single-cell transcriptomics
2026-Mar-09, BMC genomics IF:3.5Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4024 2026-03-11
Single-cell RNA-seq and in vitro study reveal Fusobacterium nucleatum impairs β-cell identity in type 2 diabetes via the NF-κB-CDKN1C axis
2026-Mar-09, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4025 2026-04-19
CD19+Ki67+B cells regulated by NAMPT as key modulators in triple-negative breast cancer with brain metastasis
2026-Mar-09, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了CD19+Ki67+ B细胞通过激活NAMPT/ITGA5/ITGB1通路驱动三阴性乳腺癌脑转移的机制 首次在单细胞水平上鉴定出CD19+Ki67+ B细胞作为三阴性乳腺癌脑转移的关键调节细胞,并阐明了其通过NAMPT/ITGA5/ITGB1信号通路促进肿瘤进展的新机制 样本量相对较小(15例单细胞测序患者),需要在更大规模的前瞻性队列中进一步验证 探究三阴性乳腺癌脑转移的免疫调节机制,寻找潜在治疗靶点 三阴性乳腺癌患者(包括有和无脑转移者)、肿瘤类器官、B细胞亚群 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,RNA-seq,多重免疫荧光,细胞共培养 NA 单细胞转录组数据,批量RNA-seq数据,免疫荧光图像 15例患者(单细胞测序),两个独立RNA-seq队列(TCGA, GSE65194),湘雅真实世界队列,74例患者样本验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4026 2026-04-19
Single-cell and multi-omics analysis identifies mitophagy-related biomarkers and therapeutic targets in ischemic stroke
2026-Mar-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞和多组学分析,识别了缺血性卒中中与线粒体自噬相关的生物标志物和治疗靶点 整合了bulk和单细胞RNA测序数据,结合WGCNA和机器学习模型,首次在缺血性卒中中识别出五个核心线粒体自噬相关基因生物标志物,并揭示了小胶质细胞亚群中线粒体自噬活性的动态变化 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分有限,且缺血性卒中的具体病理机制仍需进一步体内外实验探索 探究线粒体自噬相关基因在缺血性卒中中的作用,以识别新的生物标志物和治疗靶点 缺血性卒中患者或模型中的基因表达数据,特别是线粒体自噬相关基因 生物信息学 缺血性卒中 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qPCR 机器学习模型,加权基因共表达网络分析(WGCNA) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
4027 2026-04-19
Parvimonas micra exacerbates periodontitis by infiltrating host cells through TmpC and circumventing lysosomal elimination via AppA
2026-Mar, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究揭示了小单胞菌通过TmpC蛋白侵入宿主细胞,并利用AppA蛋白逃逸溶酶体清除,从而加剧牙周炎的分子机制 首次系统阐明了小单胞菌在牙周炎发病中的关键作用,并发现了其通过表面黏附素TmpC结合宿主细胞受体以及利用AppA蛋白逃逸自噬清除的两种新机制 研究主要在动物模型和体外实验中进行,人体内的直接验证尚需进一步研究 探究小单胞菌在牙周炎发病过程中的具体作用机制 小单胞菌、牙周韧带干细胞、大鼠实验模型 微生物学与细胞生物学 牙周炎 16S rRNA测序、单细胞RNA测序、His pull-down assay、LC-MS/MS、micro-CT NA 测序数据、质谱数据、影像数据 人类龈沟液样本及实验大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4028 2026-04-19
DuaST: an integrated deep learning framework for spatial transcriptomics with cross-branch interaction
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了DuaST,一个集成的双分支深度学习框架,用于空间转录组学数据分析,通过结合空间和非空间信息来提升生物表征学习 DuaST设计了空间感知分支和非空间分支来分别建模邻域依赖和拓扑无关特征,并采用局部-全局对比学习、对抗对齐和基于注意力的融合机制来整合这些互补表示,从而强化跨分支交互并学习有生物学意义的表征 NA 开发一个通用的计算框架,以整合空间转录组学中的空间和非空间信息,用于空间域识别、空间可变基因检测和多组学分析 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 深度学习框架(双分支架构) 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
4029 2026-04-19
STING activation induces polarized cytokine secretion of IFN-β and IL-17A promoting photoreceptor death and choroidal disruption in age-related macular degeneration
2026-Feb-27, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了STING通路在年龄相关性黄斑变性(AMD)中作为免疫介导视网膜变性的调控者,通过双相、阶段依赖性功能,在健康组织中提供细胞保护,但在早期AMD进展中驱动致病性炎症 发现STING通路在AMD中作为主调控因子,通过空间组织化的炎症同时控制多种病理过程,从保护性监视转变为致病驱动因子,并确定了统一的治疗靶点 NA 探究STING通路在年龄相关性黄斑变性(AMD)发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 人类眼睛组织、患者来源的诱导多能干细胞-视网膜色素上皮细胞(iPSC-RPE)、人类视网膜类器官、Cryba1条件性敲除(cKO)AMD样小鼠模型、Il17a敲入小鼠、Cryba1/Sting双杂合(dhet)小鼠 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 免疫组织化学分析、单细胞转录组学、AAV2介导的IFN-β过表达 NA 图像、文本(转录组数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4030 2026-04-19
Ets1-regulated endothelial-secreted factors promote compact myocardial growth and contribute to the pathogenesis of ventricular non-compaction
2026-Feb-24, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究揭示了Ets1调控的内皮细胞分泌因子在致密心肌发育中的关键作用,并提出了心室致密化不全的潜在治疗靶点 首次通过单细胞RNA测序揭示了心室致密化不全中异常的心肌细胞和内皮细胞状态,并明确了Ets1在内膜和冠状动脉内皮中通过不同信号通路调控致密心肌生长的具体机制 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类疾病中的适用性仍需进一步验证;治疗性ECM蛋白和Nrg1的体内疗效和安全性尚未评估 探究致密心肌变薄的机制,并鉴定治疗性内皮分泌因子,以阐明心室致密化不全的病理机制 小鼠心脏内皮细胞(心内膜和冠状动脉内皮)及致密心肌细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4031 2026-04-19
CD14 Plays a Critical Role in Pain and Inflammation Across Multiple Models of Post-traumatic Osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法,在多模型小鼠中验证了CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的关键作用 首次在多严重程度、多进展速率的创伤后骨关节炎模型中系统验证CD14的致病作用,并采用单细胞转录组学和空间蛋白质组学揭示其调控机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本关联分析相对有限,临床转化效果需进一步验证 验证CD14抑制能否减轻骨关节炎进展过程中的滑膜炎症和相关疼痛 人类骨关节炎滑液样本、多种严重程度的小鼠创伤后骨关节炎模型(包括手术和非手术模型) 数字病理学 骨关节炎 流式细胞术、单细胞转录组学、空间蛋白质组学、高维转录组和蛋白质组分析 NA 蛋白质组数据、转录组数据、行为学数据、组织病理学数据 人类滑液样本及多组小鼠模型(包含不同性别、肥胖等风险因素) NA 单细胞转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
4032 2026-04-19
Multi-omics analysis reveals that CAPG positive macrophages are key immunosuppressive drivers and prognostic determinants in the ferroptosis landscape of hepatocellular carcinoma
2026-Feb-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学分析揭示了CAPG阳性巨噬细胞在肝细胞癌铁死亡景观中是关键的免疫抑制驱动因素和预后决定因素 首次整合多组学数据系统描绘了HCC中铁死亡-免疫网络的组成与功能,并识别出CAPG阳性巨噬细胞作为核心免疫抑制驱动因素 研究主要基于生物信息学分析,缺乏体内外实验验证CAPG阳性巨噬细胞的具体功能机制 探究肝细胞癌中铁死亡与免疫微环境的相互作用及其对肿瘤进展和免疫治疗的影响 肝细胞癌患者样本中的免疫细胞,特别是巨噬细胞亚群 生物信息学与计算生物学 肝细胞癌 多组学分析、加权基因共表达网络分析、单细胞转录组测序、空间转录组学 预后模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 基于TCGA数据库的HCC样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
4033 2026-04-19
Lactylation-related genes contribute to neurological injury and prognosis of acute ischemic stroke based on transcriptome and single-cell sequencing analysis
2026-Feb-22, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过转录组和单细胞测序分析,探讨了乳酰化相关基因在急性缺血性卒中神经损伤和预后中的作用 首次结合转录组和单细胞测序,揭示了乳酰化相关基因在急性缺血性卒中患者中的分子亚型分类及其通过NK&T细胞与神经细胞间通讯调节神经损伤的机制 样本量相对较小(60例患者和60例对照),且研究主要基于外周血单核细胞,可能未能完全反映脑内局部变化 阐明高乳酸诱导的乳酰化在调节急性缺血性卒中神经损伤和预后中的病理生理机制 急性缺血性卒中患者和健康对照的外周血单核细胞 数字病理学 急性缺血性卒中 转录组测序, 单细胞测序分析 LASSO回归 转录组数据, 单细胞数据 60例急性缺血性卒中患者和60例健康对照 Illumina 转录组测序, 单细胞测序分析 Illumina测序平台 NA
4034 2026-04-19
Milk fat globule-EGF factor 8 enhances the proliferation and migration of thyroid carcinoma cells through epithelial-mesenchymal transition and PI3K/AKT signaling pathway
2026-Feb-21, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
研究论文 本研究探讨了MFG-E8在甲状腺癌中的表达、功能及其通过调控EMT和PI3K/AKT信号通路促进癌细胞增殖与迁移的机制 首次揭示了MFG-E8在甲状腺癌(特别是高细胞亚型)中的关键作用,并阐明了其通过MFG-E8-PI3K/AKT-EMT轴驱动肿瘤进展和免疫抑制微环境形成的机制 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证;临床样本的异质性可能影响结果的普适性 探究MFG-E8在甲状腺癌中的表达、功能及其分子机制 甲状腺癌组织、甲状腺癌细胞系 癌症生物学 甲状腺癌 单细胞RNA测序、转录组测序、质谱分析、免疫组化、Western blotting、RT-PCR、生物信息学分析 NA 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据 NA NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
4035 2026-04-19
Spatial multiomics reveals irreversible electroporation-induced immuno-metabolic characteristics of the inflammatory margin in liver cancer
2026-Feb-20, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过空间多组学方法揭示了肝细胞癌中不可逆电穿孔诱导的炎症边缘的免疫代谢特征 首次整合空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序和飞行时间质谱流式细胞术,精确绘制了不可逆电穿孔诱导的炎症边缘的空间图谱,并发现了类似脂质相关巨噬细胞的Ly6CPD-L1细胞浸润及其免疫抑制表型 研究基于雄性C57BL/6小鼠原位肝细胞癌模型,可能无法完全反映人类肝细胞癌的复杂性 探究不可逆电穿孔治疗肝细胞癌时炎症边缘的免疫和代谢变化 雄性C57BL/6小鼠原位肝细胞癌模型 数字病理学 肝细胞癌 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 飞行时间质谱流式细胞术 NA 空间转录组数据, 空间代谢组数据, 单细胞RNA测序数据, 质谱流式细胞术数据 NA NA 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 NA NA
4036 2026-04-19
Single-cell transcriptomic analysis and machine learning identify ATAD3A as a key gene that stabilizes mitochondrial-endoplasmic reticulum membranes, promoting bladder cancer progression
2026-Feb-20, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习,识别出ATAD3A作为稳定线粒体-内质网膜的关键基因,促进膀胱癌进展 首次将线粒体相关内质网膜(MAM)与膀胱癌化疗耐药性联系起来,并利用机器学习识别出ATAD3A作为关键预测基因 研究主要基于生物信息学分析和体外/体内验证,临床样本验证和机制深入探索可能有限 探究MAM在膀胱癌中的作用,识别与化疗耐药相关的关键基因 膀胱癌患者样本、细胞模型和动物模型 数字病理学 膀胱癌 RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、机器学习、电子显微镜、荧光共聚焦显微镜 随机森林、LASSO-Cox回归 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及广泛RNA测序和单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
4037 2026-04-19
TWIST1 drives endothelial-to-mesenchymal-transition to stabilize atherosclerotic plaques
2026-Feb-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了转录因子TWIST1在动脉粥样硬化斑块中通过驱动内皮-间质转化来促进斑块稳定的作用 挑战了内皮-间质转化仅会破坏斑块稳定的传统观点,提出TWIST1驱动的内皮-间质转化可促进斑块稳定性 NA 研究TWIST1在动脉粥样硬化斑块进展中的作用及其对内皮-间质转化的调控机制 高胆固醇血症小鼠模型和人类主动脉内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、组织学图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4038 2026-04-19
Beyond macrophages: FIPV tropism includes T and B lymphocytes
2026-Feb, Veterinary microbiology IF:2.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)不仅感染单核/巨噬细胞,还能感染T和B淋巴细胞,并能在这些细胞内进行病毒基因组复制 首次在自然感染FIP的猫体内,通过单细胞RNA测序等技术,证实FIPV可感染T和B淋巴细胞并进行病毒基因组复制,修正了现有关于FIPV仅选择性感染单核/巨噬细胞的致病模型 研究样本来源于自然感染的猫,可能存在个体差异;研究主要关注淋巴结组织,其他组织中的病毒感染情况可能不同 探究猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)的细胞嗜性范围及免疫细胞入侵机制 自然发生渗出性猫传染性腹膜炎(FIP)的猫的肠系膜淋巴结穿刺液和福尔马林固定石蜡包埋的淋巴结组织 单细胞组学 猫传染性腹膜炎 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 原位杂交 NA RNA序列数据, 图像数据 来自自然感染FIP猫的肠系膜淋巴结穿刺液和淋巴结组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4039 2026-04-19
A mouse organoid platform for modeling cerebral cortex development and cis-regulatory evolution in vitro
2025-Dec-15, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文开发了一种从小鼠外胚层干细胞生成大脑皮层类器官的可重复协议,用于模拟皮层发育和顺式调控进化 首次利用小鼠类器官平台结合单细胞RNA测序,全面绘制了发育中皮层细胞类型的顺式调控变异图谱,揭示了动态等位基因失衡 研究基于体外类器官模型,可能无法完全复制体内环境的复杂性 研究大脑皮层发育的基因调控网络和顺式调控进化机制 小鼠大脑皮层类器官,源自实验室小鼠和四种野生近交系杂交的F1代外胚层干细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 类器官模型 单细胞转录组数据 使用来自实验室小鼠(C57BL/6J)与四种野生近交系杂交的F1代外胚层干细胞生成的皮层类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4040 2026-04-19
Expression of ACTR3 in cervical cancer and impact on immune cell infiltration and prognosis: A comprehensive analysis based on bulk RNA-Seq and single-cell RNA-Seq
2025-Dec-05, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据,分析了ACTR3在宫颈癌中的表达及其对免疫细胞浸润和患者预后的影响 首次将PI3K/Akt/mTOR通路基因ACTR3与宫颈癌的肿瘤免疫微环境及预后联系起来,并利用单细胞RNA测序技术解析了表达ACTR3的免疫细胞亚群 研究主要基于生物信息学分析和回顾性数据,需要进一步的实验验证来确认ACTR3的功能机制 探究ACTR3过表达是否影响宫颈癌患者的生存,并阐明其对肿瘤免疫微环境的作用 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌(CESC) 生物信息学 宫颈癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 LASSO Cox回归, 诺模图 基因表达数据, 临床数据 未明确指定具体样本数量,但使用了公共数据库的RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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