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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4021 | 2025-10-06 |
Stem-cell states converge in multistage cutaneous squamous cell carcinoma development
2024-05-31, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adi7453
PMID:38815020
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研究论文 | 通过构建基因表达网络并结合谱系追踪和单细胞RNA测序,揭示皮肤鳞状细胞癌多阶段发展过程中干细胞状态的收敛现象 | 发现癌前肿瘤细胞中表达谱系可塑性和耐药性标记的细胞状态收敛现象,并揭示增殖状态与多谱系可塑性状态之间的互斥关系 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚需进一步研究 | 探索干细胞在癌症发展过程中的作用机制 | 小鼠正常组织和肿瘤组织 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 基因表达网络分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 数百个小鼠组织样本(包括正常和肿瘤组织) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4022 | 2025-10-06 |
Pioneer factor ETV2 safeguards endothelial cell specification by recruiting the repressor REST to restrict alternative lineage commitment
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.595971
PMID:38853821
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研究论文 | 本研究揭示了先驱因子ETV2通过招募抑制因子REST来限制替代谱系承诺,从而保障内皮细胞特化的机制 | 首次发现ETV2通过招募转录抑制因子REST来抑制非内皮细胞谱系基因,揭示了先驱因子招募抑制因子以限制替代谱系承诺的新机制 | 研究主要基于体外诱导多能干细胞分化系统,需要在体内模型中进一步验证 | 探索ETV2驱动细胞命运特化的分子机制,特别是内皮细胞谱系特化过程 | 人诱导多能干细胞来源的中胚层祖细胞和内皮细胞 | 发育生物学 | NA | CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组学数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
4023 | 2025-10-06 |
Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma
2024-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114139
PMID:38652658
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研究论文 | 本研究利用单细胞谱系追踪技术分析胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂的耐药机制 | 首次在患者来源的胶质母细胞瘤神经球中结合谱系追踪条码和单细胞RNA测序技术研究KIF11抑制剂耐药性 | 主要基于体外模型研究,动物模型验证相对有限 | 探究胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂ispinesib的耐药机制和潜在联合治疗策略 | 患者来源的胶质母细胞瘤神经球、患者来源的异种移植模型、人源离体胶质母细胞瘤切片 | 单细胞测序 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者来源的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4024 | 2025-10-06 |
Envelope protein-specific B cell receptors direct lentiviral vector tropism in vivo
2024-May-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.002
PMID:38449314
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研究论文 | 本研究揭示了慢病毒载体通过B细胞受体介导的靶向转导机制 | 发现不同假型包膜蛋白通过特异性BCR基因型靶向转导不同B细胞亚群 | 研究主要聚焦于脾脏B细胞,未涉及其他组织或细胞类型 | 探究慢病毒载体体内转导的靶向性机制 | 小鼠脾脏B细胞 | 基因治疗 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4025 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-04-29, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03734-z
PMID:38679747
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研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过刺激骨髓血管和基质生态位来缓解急性辐射综合征的机制 | 首次阐明了TPOm通过调节骨髓血管和基质生态位促进造血干细胞再生的新机制,并发现其能增强间充质基质细胞的胶原表达和再生通路 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 研究血小板生成素模拟物在缓解急性辐射综合征中的作用机制 | C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞、血管内皮细胞和间充质基质细胞 | 放射医学 | 急性辐射综合征 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据,细胞计数数据,组织学图像 | 9-14周龄C57BL/6J小鼠,在辐射后多个时间点(第4、7、10、14、18、21天)采集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4026 | 2025-10-06 |
STRUCTURE-FUNCTION RELATIONSHIPS OF MUCOCILIARY CLEARANCE IN HUMAN AIRWAYS
2024-Apr-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4164522/v1
PMID:38746209
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研究论文 | 本研究首次绘制了人类和大鼠气道树中纤毛细胞和分泌细胞的分布图谱,揭示了组织水平结构与纤毛功能之间的关系 | 首次在人类和大鼠中系统比较气道树细胞分布,发现物种特异性纤毛功能差异,并识别出能预测清除功能的上皮结构参数 | 研究仍部分依赖动物模型数据,对人类气道屏障功能的理解仍有限 | 探索人类气道组织水平结构与纤毛器官功能之间的关系,特别是形态组织与黏液纤毛清除功能的联系 | 人类和大鼠的气道组织 | 组织生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 组织样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4027 | 2025-10-06 |
Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells
2024-Mar-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46428-z
PMID:38467611
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq分析揭示细胞间通讯对视网膜神经节细胞存活的影响,并发现Oprm1的神经保护作用 | 首次从细胞间通讯角度研究视网膜神经节细胞存活机制,发现高存活RGCs具有更多配体-受体相互作用,并验证Oprm1的神经保护功能 | 研究主要聚焦于视网膜细胞,尚未在其他神经系统中验证Oprm1的普适性神经保护作用 | 探索细胞间通讯对视网膜神经节细胞在视神经损伤后存活的贡献 | 视网膜神经节细胞及其与星形胶质细胞、Müller胶质细胞的相互作用 | 单细胞转录组学 | 视网膜神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个视网膜损伤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4028 | 2025-10-06 |
An organism-wide atlas of hormonal signaling based on the mouse lemur single-cell transcriptome
2024-Mar-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46070-9
PMID:38467625
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研究论文 | 基于小鼠狐猴单细胞转录组构建了全生物体范围的激素信号图谱 | 首次利用非人灵长类动物全生物体单细胞转录组图谱系统绘制了84类激素的源细胞和靶细胞 | 研究局限于小鼠狐猴这一特定物种,需要进一步验证在人类中的适用性 | 系统绘制激素信号网络并研究其进化特征 | 小鼠狐猴(Microcebus murinus)的全生物体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 全生物体范围的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4029 | 2025-10-06 |
A novel EIF3C-related CD8+ T-cell signature in predicting prognosis and immunotherapy response of nasopharyngeal carcinoma
2024-Feb-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05552-x
PMID:38400862
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研究论文 | 本研究开发了一种基于EIF3C相关CD8+ T细胞特征的预测模型,用于评估鼻咽癌预后和免疫治疗反应 | 首次构建了EIF3C相关的CD8+ T细胞特征(ETS)预测模型,能够同时预测鼻咽癌预后和免疫治疗反应 | NA | 开发可靠的生物标志物以准确预测鼻咽癌免疫治疗效果 | 鼻咽癌肿瘤免疫微环境中的CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫浸润评估算法 | LASSO算法, Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4030 | 2025-10-06 |
Indoximod-based chemo-immunotherapy for pediatric brain tumors: A first-in-children phase I trial
2024-02-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad174
PMID:37715730
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研究论文 | 评估吲哚莫德联合化疗和放疗治疗儿童复发性脑肿瘤或新诊断弥漫性内生性脑桥胶质瘤的首次儿童I期临床试验 | 首次在儿童中评估IDO通路抑制剂吲哚莫德联合治疗的临床试验,通过单细胞测序证实了新循环CD8 T细胞克隆型的出现 | I期试验主要关注安全性和剂量确定,样本量有限,需要进一步II/III期试验验证疗效 | 评估吲哚莫德联合化疗或放疗治疗儿童脑肿瘤的安全性、耐受性和初步疗效 | 儿童复发性脑肿瘤或新诊断弥漫性内生性脑桥胶质瘤患者 | 临床试验 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 | NA | 临床数据,血液样本测序数据 | 81名患者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
4031 | 2025-10-06 |
Dictionary learning for integrative, multimodal and scalable single-cell analysis
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01767-y
PMID:37231261
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研究论文 | 提出了一种名为'桥接整合'的新方法,通过多组学数据集作为分子桥梁整合跨模态的单细胞数据 | 首次使用多组学数据集作为字典来重建单模态数据集并将其转换到共享空间,实现了跨模态的单细胞数据整合 | 需要多组学数据集作为桥梁,可能受到多组学数据质量和可用性的限制 | 开发能够整合不同分子模态的单细胞数据分析方法 | 人类免疫细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性分析,组蛋白修饰分析,DNA甲基化分析,蛋白质水平检测 | 字典学习 | 单细胞多组学数据 | 860万个人类免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学,质谱流式细胞术 | NA | NA |
4032 | 2025-10-06 |
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) deletion in myeloid cells augments cholestatic liver injury
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52710-3
PMID:38273071
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研究论文 | 本研究探讨骨髓细胞中TRAIL缺失对胆汁淤积性肝损伤的影响 | 首次揭示骨髓细胞来源的TRAIL通过限制胆管反应细胞扩张来减轻胆汁淤积性肝损伤 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 阐明TRAIL在胆汁淤积性肝损伤中的保护机制 | 野生型、Trail缺失和骨髓特异性Trail缺失的C57BL/6小鼠 | 肝脏病理学 | 胆汁淤积性肝病 | 高维质谱流式细胞术、空间转录组学、原位杂交 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组织学数据 | 多组基因工程小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4033 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals STAT1 Drives LHPP Downregulation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241293485
PMID:39497541
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了STAT1通过下调LHPP表达在食管鳞状细胞癌进展中的核心调控作用 | 首次发现STAT1对LHPP的转录调控关系,揭示了ESCC中复杂的调控环路 | 样本量相对有限(21例患者),需要更大规模研究验证 | 探索食管鳞状细胞癌的分子机制和细胞动态,重点关注STAT1与LHPP的调控关系 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本和细胞系 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21例ESCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4034 | 2025-10-06 |
Applications of single-cell RNA sequencing in rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491318
PMID:39600707
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术在类风湿关节炎研究中的应用与前景 | 系统阐述单细胞RNA测序技术在解析类风湿关节炎细胞异质性和分子机制中的创新应用价值 | 成本较高、低丰度转录本检测灵敏度不足、数据分析流程相对复杂 | 探索单细胞RNA测序在自身免疫疾病研究中的应用潜力 | 类风湿关节炎 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4035 | 2025-10-06 |
Unique lymphocyte transcriptomic profiles in septic patients with chronic critical illness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1478471
PMID:39691721
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者淋巴细胞转录组特征,揭示慢性危重症患者特有的免疫细胞变化模式 | 首次在单细胞水平系统描述脓毒症后慢性危重症患者淋巴细胞群体的转录组特征,发现CD8+效应记忆T细胞和NK细胞的耗竭特征 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究脓毒症后不同临床轨迹患者的免疫细胞转录组特征 | 健康受试者、急性期脓毒症患者、快速康复患者和慢性危重症患者 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, ELISpot, 细胞因子分析, T细胞增殖实验 | NA | 单细胞转录组数据, 功能验证数据 | scRNA-seq: 12名健康人+4名急性期+4名快速康复+5名CCI;功能验证: 19名健康人+68名急性期+27名快速康复+20名CCI | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4036 | 2025-10-06 |
Current state and future prospects of spatial biology in colorectal cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1513821
PMID:39711954
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综述 | 本文综述了空间生物学技术在结直肠癌研究中的最新进展、应用挑战及未来发展方向 | 系统评估空间转录组学和空间蛋白质组学在解析结直肠癌肿瘤微空间结构中的创新应用价值 | 当前方法存在组织异质性挑战,缺乏有效管理复杂数据集的计算工具 | 探讨空间生物学技术在结直肠癌精准医疗策略中的应用前景 | 结直肠癌肿瘤微环境及其空间组织结构 | 空间生物学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
4037 | 2025-10-06 |
Computational discovery of co-expressed antigens as dual targeting candidates for cancer therapy through bulk, single-cell, and spatial transcriptomics
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae096
PMID:39872360
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研究论文 | 开发计算流程发现共表达抗原对作为癌症治疗的双特异性抗体靶点 | 结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学优势,克服单一方法的局限性 | 研究聚焦于肝细胞癌,在其他癌症类型中的适用性需进一步验证 | 开发计算流程识别癌症特异性共表达抗原对用于双特异性抗体治疗 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞和正常细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 计算流程 | 转录组数据 | bulk RNA-seq数据库OCTAD,单细胞RNA-seq包含39,361个健康细胞和18,000个HCC肿瘤细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
4038 | 2025-10-06 |
Deriving early single-rosette brain organoids from human pluripotent stem cells
2023-12-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.020
PMID:37995702
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研究论文 | 开发了一种从人多能干细胞生成早期单玫瑰花结脑类器官的新方法 | 通过从二维单层细胞而非三维拟胚体起始,实现了具有可重复大小和结构的单玫瑰花结皮质类器官的生成 | NA | 开发改进的脑类器官生成方法用于研究人脑发育和疾病建模 | 人多能干细胞生成的脑类器官 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序,免疫细胞化学 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4039 | 2025-10-06 |
Integrative lactylation and tumor microenvironment signature as prognostic and therapeutic biomarkers in skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05483-7
PMID:37955686
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研究论文 | 本研究通过整合乳酸化修饰和肿瘤微环境特征,构建了皮肤黑色素瘤的预后预测模型和治疗生物标志物 | 首次将乳酸化修饰与肿瘤微环境特征相结合构建预后模型,并发现CLPB基因在黑色素瘤中的关键功能 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测方法和治疗指导策略 | 皮肤黑色素瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,LASSO回归,Cox回归,CIBERSORT算法 | LAC-TME分类器,预后模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的皮肤黑色素瘤样本 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
4040 | 2025-10-06 |
Combined signature of G protein-coupled receptors and tumor microenvironment provides a prognostic and therapeutic biomarker for skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05486-4
PMID:38006451
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研究论文 | 本研究通过分析G蛋白偶联受体相关基因和肿瘤微环境构建了皮肤黑色素瘤的预后模型 | 首次结合GPCRs相关基因和肿瘤微环境构建预后分类器,并鉴定出GPR19作为新的生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 构建皮肤黑色素瘤的预后模型以指导临床治疗策略 | 皮肤黑色素瘤患者和黑色素瘤细胞系(A375, A2058) | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 差异表达分析, LASSO算法, Cox回归分析, 单细胞RNA测序, 细胞实验 | 预后模型, GPR-TME分类器 | 基因表达数据, 临床信息, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |