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当前共找到 39637 篇文献,本页显示第 4021 - 4040 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4021 2026-03-25
Single-cell transcriptomics reveals a new marine parasite: Characterization and distribution of Rozellomyces from the Gulf of Alaska
2026-Mar-23, Mycologia IF:2.6Q2
研究论文 本文通过单细胞转录组学在阿拉斯加湾发现并描述了一种新的海洋寄生虫Rozellomyces,揭示了其在生态系统中的多样性和分布 首次利用单细胞转录组学技术从阿拉斯加湾分离并鉴定出一种新的Rozellomycota门寄生虫,建立了新属,并基于宏数据库分析其地理分布 研究仅基于单一分离株,可能未完全代表该寄生虫的多样性;地理分布分析依赖于数据库中的ASV数据,可能存在偏差 探索海洋生态系统中寄生虫的多样性、分布及其生态角色,特别是针对Rozellomycota门这一研究不足的谱系 从阿拉斯加湾分离的Rozellomycota门寄生虫(新属Rozellomyces)及其宿主硅藻 微生物学 NA 单细胞转录组学,系统基因组学分析(基于238个基因),扩增子序列变异(ASV)分析 NA 转录组数据,序列数据 单一分离株(来自阿拉斯加湾),结合metaPR数据库中的ASV数据 NA NA NA NA
4022 2026-03-25
Giant cell tumor of bone inhibits osteoblastogenesis via WNT5B
2026-Mar-23, Journal of bone and mineral metabolism IF:2.4Q3
研究论文 本研究揭示了骨巨细胞瘤通过表达WNT5B抑制成骨细胞生成,从而拮抗骨形成 首次发现骨巨细胞瘤通过WNT5B抑制成骨细胞分化,扩展了对该肿瘤骨破坏机制的理解 研究主要基于体外细胞系实验,缺乏体内验证;样本来源有限,仅使用单一细胞系 探究骨巨细胞瘤对骨形成的影响机制 人骨巨细胞瘤细胞系(NCC-GCTB1-C1)和人脂肪来源干细胞(ADSCs) 数字病理学 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序,空间转录组分析,CRISPR/Cas9基因敲除 NA RNA测序数据,空间转录组数据 使用人骨巨细胞瘤细胞系和人脂肪来源干细胞进行共培养实验 10x Genomics 单细胞RNA-seq,空间转录组学 10x Visium 10x Visium FFPE(针对骨巨细胞瘤石蜡切片进行空间转录组分析)
4023 2026-03-25
Tissue-restricted secondary TCR engagement drives the transition from stem-like to CD200+ Egr2hi arthritogenic Th17 cells
2026-Mar-23, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体分析,揭示了关节炎致病性T17细胞的异质性及其向高度致病状态转变的关键调控机制 首次发现关节组织中限制性的次级TCR信号是驱动T17细胞从干细胞样状态向CD200+ Egr2hi高度致病状态选择性转变的关键决定因素,而非炎症信号的默认进程 研究基于小鼠自身免疫性关节炎模型,其在人体中的普适性仍需验证 探究自身免疫性关节炎中致病性T17细胞的异质性、发育轨迹及其增强致病性的机制 关节组织中的CD4 T细胞,特别是白介素-17产生的辅助T细胞和调节性T细胞 单细胞组学 自身免疫性关节炎 单细胞RNA测序,谱系追踪,T细胞受体库分析 NA 单细胞转录组数据,TCR序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4024 2026-03-25
kUncited referencesCo-localization analysis of spatial transcriptomics in ligand-receptor pairs from tumor microenvironment
2026-Mar-21, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文综述了基于空间转录组学的共定位分析在肿瘤微环境中配体-受体对研究中的应用、计算方法和未来前景 系统性地整合了空间原位信息以提升配体-受体对分析的准确性,并探讨了人工智能技术在该领域的应用潜力 作为一篇综述文章,未提出新的实验方法或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 探讨空间转录组学共定位分析在识别肿瘤微环境中细胞间相互作用(特别是配体-受体对)中的应用价值 肿瘤微环境中的细胞间相互作用及配体-受体对 空间转录组学 肿瘤 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
4025 2026-03-25
Selective Impact on Regulatory T cell with Sustained Functional Phenotype by the IL-2 Mutein VIS171 in a Nonhuman Primate Model
2026-Mar-16, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 本研究评估了IL-2突变体VIS171在非人灵长类动物模型中,与雷帕霉素联用,选择性扩增调节性T细胞(Tregs)并维持其功能表型的能力 VIS171被设计为延长半衰期并增强对高表达三聚体IL-2受体的Tregs的选择性结合和扩增,结合雷帕霉素使用,在非人灵长类模型中实现了对Tregs的稳健、选择性和持久性扩增,同时不影响细胞毒性T淋巴细胞(CTLs) 研究仅基于非人灵长类动物模型,未涉及人类临床试验,且样本量有限,长期效应和安全性需进一步验证 评估VIS171在非人灵长类动物中扩增Tregs并增强移植耐受性的策略 非人灵长类动物(恒河猴)的免疫细胞群体,特别是调节性T细胞(Tregs) 免疫学 移植耐受 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4026 2026-03-25
Spatial transcriptomics reveals altered communities and drivers of aberrant epithelia and pro-fibrotic fibroblasts in interstitial lung diseases
2026-Mar-11, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化,并识别了纤维化过程中的关键分子驱动因素 通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,首次全面描绘了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化,并识别了异常上皮细胞和促纤维化成纤维细胞共定位的致病生态位 NA 探究间质性肺疾病中肺纤维化的细胞和分子机制 间质性肺疾病患者的远端肺组织 空间转录组学 间质性肺疾病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 NA NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
4027 2026-03-25
scGPT: end-to-end protocol for fine-tuned retinal cell type annotation
2026-03, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文提供了一个针对单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的scGPT模型微调完整指南 提出了一套端到端的scGPT微调协议,实现了自动化数据处理、模型微调和评估,并在视网膜数据集上达到99.5%的F1分数 需要用户具备基本的生物信息学知识,对Python和Linux有最低要求 解决单细胞研究中高分辨率细胞类型注释的挑战,特别是针对大规模数据集和罕见细胞群体 单细胞RNA测序数据中的视网膜细胞类型 单细胞分析 NA 单细胞RNA测序 Transformer (scGPT) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4028 2026-03-25
An integrative multi-omics study reveals glutamine metabolism dysregulation connecting Alzheimer's disease and age-related macular degeneration
2026-Mar, Journal of Alzheimer's disease : JAD
研究论文 本研究采用整合多组学策略,揭示了谷氨酰胺代谢失调是连接阿尔茨海默病和年龄相关性黄斑变性的共同机制 首次通过整合孟德尔随机化、转录组学和靶向代谢组学,系统性地揭示了AD与AMD之间共享的谷氨酰胺代谢通路异常 研究主要基于动物模型(APP/PS1小鼠)和遗传推断数据,需要在人类临床样本中进行进一步验证 探索阿尔茨海默病与年龄相关性黄斑变性之间的共享代谢特征和通路 阿尔茨海默病(AD)和年龄相关性黄斑变性(AMD)两种神经退行性疾病 多组学整合分析 阿尔茨海默病, 年龄相关性黄斑变性 孟德尔随机化, 转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 孟德尔随机化模型, 差异表达分析 遗传数据, 转录组数据, 代谢组数据 APP/PS1小鼠模型(5月龄) NA 单细胞RNA-seq, 靶向代谢组学 NA NA
4029 2026-03-25
Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Ischemic Injury Promoting Polyomavirus Replication by DNA Damage Response
2026-Mar, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了缺血性损伤通过激活DNA损伤应答通路促进多瘤病毒复制的分子机制,并鉴定出CDK1为关键枢纽基因 首次结合单细胞与批量转录组数据,系统解析缺血性损伤促进BK多瘤病毒复制的分子通路,并跨物种验证CDK1的关键作用 研究主要基于测序数据的生物信息学分析,实验验证部分仅限于细胞水平的siRNA敲降,缺乏动物模型或临床样本的进一步验证 阐明缺血性损伤促进BK多瘤病毒复制的分子机制,寻找关键调控通路和基因 BK多瘤病毒(BKPyV)及其在肾移植患者中的再激活机制 生物信息学 肾移植相关病毒感染 单细胞RNA测序,批量RNA测序,siRNA敲降实验 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
4030 2026-03-25
Systems Biology of Metabolic Dysregulation in Ankylosing Spondylitis Using scRNA-Seq Data
2026-Mar, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,通过构建基因组尺度代谢模型,分析了强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的代谢失调,并识别了关键的蛋白质相互作用网络重连 整合单细胞RNA测序与基因组尺度代谢模型,首次在强直性脊柱炎中系统量化免疫细胞类型的代谢通路活性和反应通量差异,并识别了跨细胞类型的重连蛋白质枢纽 研究基于外周血单个核细胞,可能无法完全反映疾病在关节等靶组织中的局部代谢变化,且样本量未明确说明 揭示强直性脊柱炎的免疫细胞代谢重编程机制,以发现转化治疗靶点和生物标志物 强直性脊柱炎患者和健康对照的外周血单个核细胞,包括CD14单核细胞、CD4记忆T细胞、CD4初始T细胞和CD8 T细胞等免疫细胞亚型 系统生物学 强直性脊柱炎 单细胞RNA测序 基因组尺度代谢模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4031 2026-03-25
Unraveling the tapestry: Lessons from multi-omics and spatial biology in hepatocellular cancer
2026-Feb-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
综述 本文综述了空间组学技术在肝细胞癌研究中的应用进展,探讨了肿瘤微环境的空间结构如何影响疾病进展和治疗反应 整合了多种空间组学技术(转录组、蛋白质组、基因组、表观基因组、代谢组)来解析肝细胞癌的肿瘤微环境空间结构,揭示了传统批量或单细胞分析无法发现的细胞间通讯网络 NA 总结空间组学技术在肝细胞癌研究中的最新进展,探讨其转化应用前景 肝细胞癌的肿瘤微环境空间结构 空间生物学 肝细胞癌 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间基因组学、空间表观基因组学、空间代谢组学 NA 空间组学数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学, 空间代谢组学 NA NA
4032 2026-03-25
Generating and characterizing human telencephalic brain organoids from stem cell-derived single neural rosettes
2026-02, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文开发了一种从干细胞衍生的单个神经玫瑰花结生成人端脑类器官的方法,并描述了相关实验协议 使用单个神经玫瑰花结生成类器官,模拟体内神经组织从单一神经管发育的过程,提供更一致和可重复的端脑神经细胞组成 协议完成需5-6个月,且需要细胞培养经验,可能限制了广泛适用性 研究人端脑中不同神经细胞的规范和组织,以及模拟与神经网络破坏相关的神经发育障碍 人端脑类器官、干细胞衍生的单个神经玫瑰花结、CRISPR-Cas9工程化人干细胞 数字病理学 神经发育障碍 单细胞RNA测序、免疫组织化学、切片膜片钳电生理学、CRISPR-Cas9基因编辑 类器官模型 基因表达数据、图像数据、电生理数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4033 2026-03-25
Single-cell sequencing and network pharmacology coupled with molecular docking and experimental validation reveal the effects of YPFS on macrophages in stage I non-small cell lung cancer
2026-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究结合单细胞测序、网络药理学、分子对接和实验验证,揭示了玉屏风散(YPFS)对I期非小细胞肺癌(NSCLC)中巨噬细胞的影响 首次将单细胞测序与网络药理学、分子对接及实验验证相结合,系统研究了传统中药玉屏风散(YPFS)对NSCLC肿瘤微环境中巨噬细胞亚群极化的调控作用,并鉴定出关键靶点AHSA1及活性成分槲皮素 研究主要聚焦于I期NSCLC,未涵盖更晚期肿瘤;分子对接和体外实验的发现需进一步的体内实验和临床研究验证 探究I期非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤微环境中巨噬细胞的异质性,并评估传统中药玉屏风散(YPFS)对其极化的调控作用及潜在治疗价值 I期非小细胞肺癌(NSCLC)患者的肿瘤组织样本(用于单细胞测序),以及巨噬细胞系(用于实验验证) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),网络药理学,分子对接,体外细胞实验 NA 单细胞转录组数据,化合物结构数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4034 2026-03-25
Acute Phase Response-driven Hepatic Niche Remodeling Promotes Fibrosis Resolution After Alcohol Cessation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探究了酒精戒断后急性期反应驱动的肝微环境重塑如何促进纤维化消退的机制 首次通过空间转录组学识别了酒精戒断后肝内独特的纤维生成与纤维溶解微环境,并揭示了血清淀粉样蛋白A(SAA)通过HDL介导的巨噬细胞摄取促进纤维化消退的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;空间转录组学数据可能受技术分辨率限制;未全面评估长期戒断效果 探究酒精戒断后酒精相关性肝病(ALD)纤维化消退的分子与细胞机制 酒精相关性肝病(ALD)小鼠模型及人类肝组织样本 空间转录组学 酒精相关性肝病 空间转录组学、体外细胞分析、基因敲除模型 小鼠疾病模型 空间转录组学数据、基因表达数据 未明确指定样本数量,但涉及小鼠模型和人类肝样本 Nanostring 空间转录组学 CosMx 1000-plex CosMx空间转录组学检测
4035 2026-03-25
Proteasome Assembly Chaperone 3 Defines Metabolic-Immune Programs and Poor Prognosis in Breast Cancer via Multi-Omics Approaches
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合多组学方法,揭示了蛋白酶体组装伴侣PSMG3在乳腺癌中的关键作用,其高表达与不良预后、代谢重编程及肿瘤免疫微环境特征相关 首次系统性地将PSMG3家族基因与乳腺癌的代谢-免疫程序及临床预后联系起来,并利用多队列基因组学、转录组学及单细胞RNA测序数据进行综合分析 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本数据来源于公共数据库,可能存在批次效应或选择偏倚 探究PSMG家族基因在乳腺癌中的作用,特别是PSMG3与临床预后、代谢通路及肿瘤免疫微环境的关系 乳腺癌患者的多组学数据,包括TCGA-BRCA、METABRIC及多个NCBI GEO队列 生物信息学 乳腺癌 RNA测序、单细胞RNA测序、基因集富集分析、免疫浸润分析、分子对接 生物信息学分析模型(如CIBERSORT、TIMER) 基因组数据、转录组数据 多个乳腺癌队列(具体样本数未明确说明) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
4036 2026-03-25
NUP85 as a Pan-Cancer Immune Biomarker: Integrated Multi Omics and Functional Analyses Reveal Its Role in Tumor Prognosis
2026, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和功能验证,探讨NUP85作为泛癌免疫生物标志物在肿瘤预后中的作用 首次全面整合多组学数据和功能实验,揭示NUP85在肿瘤免疫和预后中的关键作用,特别是在增殖性T细胞中的表达特征 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 阐明NUP85在癌症发病机制中的潜在作用,探索其作为肿瘤标志物的价值 多种肿瘤类型,重点关注肺腺癌和口腔鳞状细胞癌的细胞系 生物信息学 泛癌研究 多组学分析,包括转录组、蛋白质组、表观遗传组和单细胞测序 NA 多组学数据,包括基因表达、蛋白质表达、甲基化、拷贝数变异等 基于TCGA、GTEx、CPTAC等多个公共数据库的大规模样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,多组学分析 NA NA
4037 2026-03-25
Integrative Multi-Omics and Single-Cell Profiling Identify Chitinase Domain Containing Protein 1 (CHID1) as a Prognostic Biomarker in Glioblastoma
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合多组学和单细胞分析,鉴定CHID1作为胶质母细胞瘤的预后生物标志物 首次全面探索CHID1在胶质母细胞瘤中的表达模式及其与代谢和氧化还原相关通路的关联 研究主要基于生物信息学分析,缺乏深入的实验验证 探究CHID1在胶质母细胞瘤中的表达、功能及其作为预后标志物的潜力 胶质母细胞瘤患者样本及正常脑组织 生物信息学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、转录组学分析、分子对接 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 TCGA-GBM和CGGA数据集中的胶质母细胞瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
4038 2026-03-25
Spatial Omics in Gastrointestinal Oncology: Recent Advances, Therapeutic Insights, and Clinical Translation
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
综述 本文综述了空间组学技术在胃肠道肿瘤学中的最新进展、治疗见解及临床转化应用 整合了空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学和表观基因组学等多组学技术,以高分辨率解析肿瘤微环境,揭示空间定义的生态位,为个性化治疗提供新视角 面临标准化、数据整合和临床验证等挑战,尚未完全融入常规肿瘤学实践 探讨空间组学技术在胃肠道肿瘤诊断、治疗分层和疗效监测中的应用潜力 胃肠道癌症,包括结直肠癌、胃癌和食管癌 数字病理学 胃肠道癌症 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间表观基因组学 NA 空间多组学数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学 NA NA
4039 2026-03-25
Mapping Myeloid Cell Diversity in Diffuse Large B-Cell Lymphoma: Impact on T Cell Exhaustion and Clinical Prognosis
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序技术分析了超过3000名弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的免疫微环境,揭示了恶性B细胞和髓系细胞的多样性及其与临床预后的关联 利用单细胞测序技术大规模描绘DLBCL肿瘤微环境中的髓系细胞多样性,并发现巨噬细胞与CD8 T细胞间的相互作用可能导致T细胞耗竭,为免疫抑制微环境提供了新见解 研究主要基于单细胞和RNA表达微阵列数据的回顾性分析,缺乏实验验证和前瞻性临床研究 研究弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的免疫细胞多样性及其对临床预后的影响 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者肿瘤组织中的恶性B细胞和髓系细胞 数字病理学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 单细胞测序,RNA表达微阵列 NA 单细胞数据,RNA表达数据 超过3000名DLBCL患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4040 2026-03-25
CellPhoneDB v5: inferring cell-cell communication from single-cell multiomics data
2025-12, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文介绍了CellPhoneDB v5,一个用于从单细胞多组学数据推断细胞间通信的生物信息学工具包 扩展了配体-受体相互作用库,新增约1000个非肽类配体介导的相互作用;引入了新的数据库查询方式,允许用户根据实验设计定制查询;整合了新的策略,利用空间转录组学或单细胞ATAC-seq数据优先考虑特定细胞间相互作用;新增了CellPhoneDBViz模块用于交互式可视化和结果共享 需要基本的Python知识,且协议执行时间约为15分钟,可能对非专业用户有一定门槛 开发并优化一个生物信息学工具包,以从单细胞多组学数据中推断细胞间通信 单细胞多组学数据,包括配体-受体相互作用、空间转录组学和单细胞ATAC-seq数据 生物信息学 NA 单细胞多组学分析、空间转录组学、单细胞ATAC-seq NA 单细胞多组学数据、空间转录组学数据、单细胞ATAC-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 NA NA
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