单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 4001 - 4020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4001 | 2025-02-13 |
Integrative Multi-omics Analysis and Mendelian Randomization Reveal Potential Therapeutic Targets and their Stratification in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-06, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法，识别了肺鳞状细胞癌（LUSC）的潜在治疗靶点，并对其进行了分层 | 结合了bulk RNA测序、WGCNA、生存分析、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、免疫浸润评估、单细胞RNA测序和伪时间分析等多种技术手段，全面探索了LUSC的治疗靶点 | 未提及具体样本量，可能影响结果的普适性 | 识别肺鳞状细胞癌（LUSC）的新型治疗靶点，以改善其治疗策略 | 肺鳞状细胞癌（LUSC） | 数字病理 | 肺癌 | bulk RNA测序、WGCNA、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、单细胞RNA测序、伪时间分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4002 | 2025-02-13 |
Integrative mapping of human CD8+ T cells in inflammation and cancer
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02530-0
PMID:39614111
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scAtlasVAE的深度学习模型，用于整合大规模单细胞RNA测序数据并进行跨图谱比较，构建了一个广泛的人类CD8 T细胞图谱 | 开发了scAtlasVAE模型，能够整合大规模单细胞RNA测序数据，构建了包含1,151,678个细胞的人类CD8 T细胞图谱，揭示了不同细胞亚型之间的联系及其表型和功能转变 | NA | 研究人类CD8 T细胞在炎症和癌症中的克隆景观和动态变化 | 人类CD8 T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | VAE（变分自编码器） | 单细胞RNA测序数据 | 1,151,678个细胞，来自961个样本，涵盖68项研究和42种疾病条件 |
| 4003 | 2024-12-01 |
Human CD8+ T cell map with single-cell transcriptome and TCR information
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02529-7
PMID:39614112
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4004 | 2024-12-01 |
Publisher Correction: Massively parallel single-cell sequencing of diverse microbial populations
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02570-6
PMID:39614113
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4005 | 2025-02-13 |
Capture of Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells in the Absence of Pdzk1
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408852
PMID:39630006
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研究论文 | 本研究通过删除单个基因Pdzk1，在胚胎干细胞（ESCs）中建立了全能性 | 首次通过删除Pdzk1基因在胚胎干细胞中实现全能性，突破了胚胎和胚胎外组织之间的屏障 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞，尚未在人类细胞中验证 | 探索胚胎干细胞的全能性扩展及其分化潜能 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析，bulk RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 4006 | 2025-02-13 |
SYISL Knockout Promotes Embryonic Muscle Development of Offspring by Modulating Maternal Gut Microbiota and Fetal Myogenic Cell Dynamics
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410953
PMID:39680624
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研究论文 | 本研究探讨了SYISL基因敲除如何通过调节母体肠道微生物群和胎儿肌源性细胞动态来促进胚胎肌肉发育 | 揭示了SYISL基因敲除通过改变母体肠道微生物群组成和提高胚胎血清中的丁酸水平，进而通过丁酸-HDAC-H3K9ac/H3K27ac途径调节肌肉生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他动物模型中进行验证 | 探讨SYISL基因敲除对胚胎肌肉发育的影响及其机制 | 小鼠胚胎 | 生物医学 | 肌肉疾病 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 4007 | 2025-02-13 |
Mesenchymal Stem Cells Prevent SLC39A14-Dependent Hepatocyte Ferroptosis through Exosomal miR-16-5p in Liver Graft
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411380
PMID:39680749
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研究论文 | 本文研究了间充质干细胞通过外泌体miR-16-5p预防肝移植中SLC39A14依赖的肝细胞铁死亡 | 首次发现SLC39A14在肝移植中的促铁死亡作用，并揭示了hBMSCs通过外泌体miR-16-5p下调SLC39A14表达的治疗机制 | 未提及具体样本量及实验设计的局限性 | 探究肝移植中肝细胞损伤的机制及间充质干细胞的治疗作用 | 肝移植中的肝细胞及人骨髓来源的间充质干细胞 | 生物医学 | 肝移植相关疾病 | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4008 | 2025-02-13 |
Aberrant Chitinase 3-Like 1 Expression in Basal Cells Contributes to Systemic Sclerosis Fibrosis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310169
PMID:39686726
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了系统性硬化症（SSc）中基底细胞异常表达的几丁质酶3样1（Chi3L1）在纤维化过程中的作用，并探讨了其作为潜在生物标志物和治疗靶点的可能性 | 首次在SSc患者中识别出高表达Chi3L1的基底细胞亚群，并揭示了Chi3L1通过IL-17RA介导的纤维化机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体临床试验中验证Chi3L1和IL-17RA作为治疗靶点的有效性和安全性 | 探讨系统性硬化症纤维化的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 系统性硬化症患者的皮肤细胞和小鼠模型 | 生物医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA测序数据 | SSc患者和健康对照的皮肤细胞样本 |
| 4009 | 2025-02-13 |
Single Cell RNA-Seq Identifies Cell Subpopulations Contributing to Idiopathic Pulmonary Fibrosis in Humans
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70402
PMID:39928535
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，识别了在特发性肺纤维化（IPF）患者肺中比例显著改变的细胞群体和亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面识别了IPF患者肺中细胞群体和亚群的比例变化，揭示了这些变化在IPF发病机制中的作用 | 研究未深入探讨这些细胞亚群比例变化的具体分子机制及其对IPF治疗的实际应用价值 | 探讨特发性肺纤维化（IPF）发病机制中的细胞群体和亚群变化 | 特发性肺纤维化（IPF）患者的肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | IPF患者的肺组织样本 |
| 4010 | 2025-02-13 |
Immune profiling of the macroenvironment in colorectal cancer unveils systemic dysfunction and plasticity of immune cells
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70175
PMID:39934971
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研究论文 | 本研究通过CyTOF和RNA-seq技术，揭示了结直肠癌（CRC）宏观环境中免疫细胞的异质性和系统性功能障碍 | 首次全面分析了CRC宏观环境中不同组织结构的免疫细胞组成和相互作用，发现了三级淋巴结构（TLS）对免疫治疗反应的影响 | 研究依赖于特定技术（如CyTOF和RNA-seq），可能限制了结果的广泛适用性 | 探索CRC宏观环境中免疫细胞的异质性和其对免疫治疗反应的影响 | CRC患者的肿瘤、血液和肠道组织结构 | 数字病理学 | 结直肠癌 | CyTOF, RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光染色 | NA | 细胞表型和转录数据 | 包括发现队列和验证队列的CRC患者样本 |
| 4011 | 2025-02-13 |
Hunger Games: A Modern Battle Between Stress and Appetite
2025-Feb, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70006
PMID:39936619
|
综述 | 本文探讨了压力与食欲之间的相互作用，特别是压力如何影响与饮食失调相关的神经回路，并讨论了遗传倾向和环境因素如何加剧饮食失调的易感性 | 强调了肠道微生物组在饮食失调研究中的新兴作用，并提出了未来研究的方向，如特定压力源对神经回路的影响以及关键神经肽在人类饮食失调发病机制中的作用 | 存在未解答的问题，如为什么某些个体对压力具有抵抗力，而其他个体则容易发展为饮食失调 | 探讨压力与食欲之间的相互作用及其在饮食失调发病机制中的作用 | 饮食失调（EDs）患者及其相关神经回路 | 神经科学 | 饮食失调 | 单细胞测序、高级人类成像 | NA | NA | NA |
| 4012 | 2025-02-13 |
A Bi-Specific T Cell-Engaging Antibody Shows Potent Activity, Specificity, and Tumor Microenvironment Remodeling in Experimental Syngeneic and Genetically Engineered Models of GBM
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.18.628714
PMID:39763755
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研究论文 | 本文研究了一种双特异性T细胞接合抗体（BTE）在实验性同源和基因工程胶质母细胞瘤（GBM）模型中的活性、特异性及肿瘤微环境重塑效果 | 在具有完整免疫系统的原位和基因工程小鼠模型中评估BTE的功能，填补了以往研究主要在免疫缺陷动物模型中进行的空白 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨BTE在胶质母细胞瘤中的治疗机制和效果 | 胶质母细胞瘤（GBM） | 生物医学 | 胶质母细胞瘤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、多重免疫荧光、多参数磁共振成像（MRI） | NA | 实验数据 | 多个GBM临床前模型中的小鼠 |
| 4013 | 2025-01-23 |
Finding and Profiling Renal Cells with Spatial Transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000632
PMID:39836482
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4014 | 2025-02-13 |
TGFBR2 High mesenchymal glioma stem cells phenocopy regulatory T cells to suppress CD4+ and CD8+ T cell function
2025-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.07.631757
PMID:39829747
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研究论文 | 本研究通过多方面的分析方法，揭示了TGFBR2高表达的间充质胶质瘤干细胞（GSCs）通过模仿调节性T细胞（Tregs）来抑制CD4+和CD8+ T细胞功能的机制 | 首次发现并描述了TGFBR2驱动的免疫抑制性GSC状态，并确定了其与TGF-β II型受体的特异性关联 | 研究主要基于体外实验和患者来源的细胞，尚未在体内模型中验证这些发现 | 探索胶质母细胞瘤（GBM）中肿瘤微环境的免疫抑制机制，特别是GSCs在其中的作用 | 胶质母细胞瘤中的间充质胶质瘤干细胞（GSCs） | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序，生物信息学分析，分子和药理学操作 | NA | 临床和实验数据集，单细胞测序数据 | 患者来源的GBM神经球和临床GBM标本 |
| 4015 | 2025-02-13 |
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2025-Jan, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00298-9
PMID:39548236
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达，并通过免疫组织化学、空间转录组学和功能实验验证了关键观察结果 | 研究发现APOBEC3A的表达主要局限于终末分化细胞，并需要grainyhead-like转录因子3（GRHL3），而在鳞状细胞癌中，GRHL3的表达和活性扩展到一部分进行DNA复制的细胞，同时APOBEC3A的表达也扩展到增殖细胞 | 研究未涉及APOBEC3A和APOBEC3B在其他类型癌症中的表达和作用 | 研究APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达及其在肿瘤发展中的作用 | 健康和恶性黏膜上皮细胞 | 分子生物学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、空间转录组学 | NA | RNA测序数据、免疫组织化学数据、空间转录组数据 | NA |
| 4016 | 2025-02-13 |
Multi-omics analysis reveals distinct gene regulatory mechanisms between primary and organoid-derived human hepatocytes
2025-Jan-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.050883
PMID:39878507
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示了原代人肝细胞和肝类器官来源的肝细胞之间基因调控机制的差异 | 首次揭示了AP-1因子与肝细胞特异性转录因子（如HNF4A）在调控区域共定位的潜在合作机制，并发现ELF3在肝类器官来源的肝细胞中独特表达且与肝标志基因表达负相关 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全反映体内肝细胞的复杂调控网络 | 研究肝细胞发育和疾病的基因调控机制 | 原代人肝细胞和肝类器官来源的肝细胞 | 基因组学 | 肝病 | 单细胞转录组分析，染色质可及性分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据，染色质可及性数据 | NA |
| 4017 | 2025-02-13 |
Bronchoalveolar lavage single-cell transcriptomics reveals immune dysregulations driving COVID-19 severity
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309880
PMID:39928675
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，揭示了COVID-19严重程度与免疫失调之间的关系 | 首次使用单细胞转录组学技术对COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液进行二次数据分析，揭示了严重病例中免疫细胞的显著改变及其与疾病严重程度的相关性 | 研究依赖于二次数据分析，可能受到原始数据质量和样本量的限制 | 揭示COVID-19严重程度与免疫失调之间的机制 | COVID-19患者和健康对照者的支气管肺泡灌洗液 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | COVID-19患者和健康对照者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 4018 | 2025-02-13 |
Synovial tissue myeloid dendritic cell subsets exhibit distinct tissue-niche localization and function in health and rheumatoid arthritis
2024-12-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.004
PMID:39609125
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研究论文 | 本文通过单细胞和空间转录组学分析，研究了健康人和类风湿性关节炎（RA）患者滑膜组织中树突状细胞（DC）亚群的分布和功能 | 揭示了RA患者滑膜组织中不同DC亚群在疾病状态下的特定功能和空间定位，为恢复免疫耐受提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于滑膜组织样本，未涉及其他组织或全身性免疫反应 | 探讨RA患者滑膜组织中DC亚群的功能和空间定位，以寻找恢复免疫耐受的途径 | 健康人和RA患者的滑膜组织 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学、共培养系统 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4019 | 2025-02-13 |
Tissue-resident natural killer cells support survival in pancreatic cancer through promotion of cDC1-CD8 T activity
2024-Dec-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92672
PMID:39656086
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研究论文 | 本文探讨了通过诱导局部物理损伤（如电离辐射）来揭示免疫疗法益处的方法，特别是通过增加组织驻留自然杀伤细胞（trNK）来支持CD8 T细胞活性，从而改善胰腺导管腺癌（PDAC）的治疗效果 | 揭示了电离辐射与CCR5抑制剂和PD1阻断联合治疗在PDAC中的新机制，即通过招募类似trNK细胞的NKG2D NK群体来支持CD8 T细胞活性，并发现人类PDAC中存在类似的免疫调节trNK细胞群体 | 研究主要基于小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据，尚未在临床环境中验证其治疗效果 | 探索通过增强CD8 T细胞活性来改善PDAC免疫抑制微环境的策略 | 小鼠原位PDAC肿瘤和人类PDAC单细胞RNA测序数据 | 免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和人类PDAC单细胞RNA测序队列 |
| 4020 | 2025-02-13 |
Detecting global and local hierarchical structures in cell-cell communication using CrossChat
2024-Dec-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54821-x
PMID:39627184
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CrossChat的新型计算框架，用于推断和分析细胞间通讯的层次结构 | CrossChat框架通过多分辨率聚类方法和树检测方法，首次全面分析了细胞间通讯的全局和局部层次结构 | 当前方法仅能处理预定义的细胞群，忽略了由信号分子（特别是配体和受体）决定的细胞间通讯的层次结构 | 研究细胞间通讯的层次结构，以理解复杂组织功能的调控机制 | COVID-19患者和小鼠胚胎皮肤的非空间单细胞RNA测序数据，以及小鼠胚胎和小鼠受伤皮肤的空间转录组数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学（Spatial Transcriptomics） | 多分辨率聚类方法，树检测方法 | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | 两个非空间单细胞RNA测序数据集和两个空间转录组数据集 |