单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3981 2025-10-05
Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress
2021-09-14, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究揭示了心脏驻留巨噬细胞通过产生胰岛素样生长因子-1在高血压应激下调节心肌细胞适应性生长的关键机制 首次证明特定心脏驻留巨噬细胞亚群通过产生IGF-1直接调控心肌细胞的适应性生长,而非传统认为的免疫细胞仅参与炎症反应 研究主要基于动物模型,人类样本验证相对有限 探究免疫细胞在高血压引起的心脏适应性生长过程中的作用机制 心脏驻留巨噬细胞和心肌细胞 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 细胞命运示踪, 基因敲除 NA 单细胞转录组数据 正常血压和高血压动物模型,人类心肌病样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3982 2025-10-05
Single-cell multi-omics data reveal heterogeneity in liver tissue microenvironment induced by hypertension
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
研究论文 本研究通过单细胞多组学技术揭示高血压诱导的肝组织微环境异质性 首次在单细胞分辨率上识别高血压相关的肝细胞亚群及其调控网络 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 探究高血压对肝脏细胞亚群和微环境的影响 正常和高血压肝组织 单细胞多组学 高血压 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 组蛋白ChIP测序 NA 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 NA NA
3983 2025-10-05
Single-cell RNA sequencing analysis reveals a novel porcine alveolar macrophage subtype with high SLAMF7 expression promoting PRRSV infection
2025-Dec, Virulence IF:5.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析发现猪肺泡巨噬细胞新亚型,揭示SLAMF7高表达促进PRRSV感染机制 首次通过单细胞RNA测序鉴定出具有高PRRSV感染率的猪肺泡巨噬细胞新亚型S5和SS6,并发现SLAMF7是促进PRRSV感染和炎症反应的关键基因 体外培养的PAMs可能无法完全反映体内疾病过程,仅部分GO术语和KEGG通路重合 研究PRRSV感染机制及猪肺泡巨噬细胞在病毒感染中的作用 猪肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞 单细胞转录组学 猪繁殖与呼吸综合征 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3984 2025-10-05
T Cells Expressing Ras Homolog Family Member a Display Enhanced Cytotoxicity but are Reduced in Lupus Peripheral Blood
2025-Oct, Immunological investigations IF:2.9Q3
研究论文 本研究探讨系统性红斑狼疮患者T细胞亚群中RhoA的表达及其临床意义 首次发现RhoA+T细胞具有增强的细胞毒性功能,并可能作为SLE的早期免疫学标志物 样本量有限,主要关注新诊断患者,需要更大规模研究验证 探索RhoA在系统性红斑狼疮T细胞亚群中的表达和临床相关性 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血T细胞亚群 免疫学 系统性红斑狼疮 流式细胞术, 单细胞RNA测序, ROC曲线分析 NA 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 新诊断SLE患者和年龄性别匹配的健康对照者外周血样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3985 2025-10-05
MAN1A1 promotes colorectal cancer liver metastasis by maintaining TGFBR2 protein stability
2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析发现MAN1A1通过维持TGFBR2蛋白稳定性促进结直肠癌肝转移 首次揭示MAN1A1通过延长TGFBR2蛋白半衰期促进结直肠癌肝转移的分子机制 未详细说明MAN1A1调控TGFBR2蛋白稳定性的具体分子通路 探究结直肠癌肝转移的分子机制及潜在治疗靶点 结直肠癌细胞及肝转移组织 癌症生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序, Transwell实验, 基因操作 NA 基因表达数据, 蛋白质稳定性数据 公共数据库中的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3986 2025-10-05
Single-cell transcriptomics reveals apolipoprotein A4-mediated metabolic-immune reprogramming in lymphocytes during early obesity-related chronic kidney disease
2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了载脂蛋白A4在肥胖相关慢性肾病早期淋巴细胞代谢-免疫重编程中的关键调控作用 首次发现Apoa4通过调节淋巴细胞代谢和免疫功能在肥胖相关慢性肾病早期发挥保护作用,揭示了肾脏免疫代谢景观的重塑机制 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;机制研究仍需进一步深入 探究Apoa4在肥胖诱导的慢性肾病早期免疫细胞代谢和功能调控中的作用 野生型和Apoa4敲除小鼠的肾脏淋巴细胞 单细胞生物学 慢性肾病 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光染色,qPCR NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据,基因表达数据 野生型和Apoa4敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3987 2025-10-05
Single-cell RNA sequencing across diverse cell types to identify PFOA-induced ovarian cellular senescence
2025-Sep-24, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究PFOA暴露诱导卵巢细胞衰老的机制 首次从细胞衰老角度揭示PFOA卵巢毒性的单细胞水平机制,发现卵丘细胞对PFOA诱导的耗竭特别敏感 研究仅使用小鼠模型,样本量相对有限 探究PFOA暴露导致卵巢功能障碍的细胞机制 雌性ICR小鼠卵巢组织 单细胞组学 生殖功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 29,000+个细胞,8个不同细胞群体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3988 2025-10-05
Inflammatory, transcriptomic, and cell fate responses underlying the mammalian transmission of avian influenza viruses
2025-Sep-23, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过雪貂鼻上皮细胞对H1N1禽流感病毒的反应,揭示了与病毒空气传播能力相关的宿主应答机制 首次在哺乳动物呼吸道关键部位识别出与禽流感病毒空气传播表型相关的特异性宿主反应特征 研究仅限于雪貂模型,需要进一步验证在人类中的适用性 探究禽流感病毒在哺乳动物呼吸道中的宿主反应与空气传播能力的关系 雪貂鼻上皮细胞和H1N1禽流感病毒株 转录组学 流感 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 雪貂鼻上皮细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3989 2025-10-05
Comprehensive characterization of the molecular feature of acetylation in colorectal cancer using integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Sep-23, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序技术,全面表征结直肠癌中乙酰化的分子特征 首次结合单细胞RNA测序和WGCNA分析结直肠癌乙酰化特征,开发了乙酰化相关预后标志物 研究基于公共数据库的样本,需要进一步实验验证 探索结直肠癌中乙酰化特征与预后和免疫微环境的关系 结直肠癌患者样本 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, ssGSEA 机器学习算法 RNA测序数据 两个单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
3990 2025-10-05
High expression of Fgr in the left ventricle attenuates myocardial injury in the infarcted region via regulating the phosphorylation level of PI3K/Akt
2025-Sep-23, Bioscience reports IF:3.8Q2
研究论文 本研究探讨Fgr基因在急性心肌梗死中的保护作用及其通过调节PI3K/Akt磷酸化的分子机制 首次揭示Fgr在心血管疾病特别是急性心肌梗死中的保护作用,并通过多组学数据验证其调控PI3K/Akt信号通路的机制 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未在人类临床样本中直接验证 探究Fgr在心肌梗死中的保护作用及其分子机制 大鼠左心室心肌组织、H9C2心肌细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 转录组关联分析、bulk RNA测序、空间转录组学、单核RNA测序、siRNA敲低、药理学抑制 大鼠左前降支冠状动脉结扎模型、体外氧糖剥夺模型 转录组数据、空间转录组数据、单细胞测序数据 大鼠模型和细胞系,具体样本数量未明确说明 NA 空间转录组学,单核RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
3991 2025-10-05
Comparative single-cell and spatial profiling of anti-SSA-positive and anti-centromere-positive Sjögren's disease reveals common and distinct immune activation and fibroblast-mediated inflammation
2025-Sep-22, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间技术比较抗SSA阳性和抗着丝粒阳性干燥综合征的免疫特征 首次结合单细胞RNA测序、T/B细胞受体测序和空间转录组学揭示不同自身抗体谱的细胞特征差异 样本量有限,需要更大队列验证发现 阐明干燥综合征中不同自身抗体谱相关的细胞和转录特征 干燥综合征患者的唾液腺病变组织 单细胞组学 干燥综合征 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, B细胞受体测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
3992 2025-10-05
Per- and Polyfluoroalkyl Substances Induces Salt-Sensitive Hypertension by Upregulating Epithelial Sodium Channel - The First Experimental Evidence Supporting Causality
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究首次通过实验证明全氟和多氟烷基物质通过上调上皮钠通道诱导盐敏感性高血压 首次提供PFAS暴露与高血压因果关系的实验证据,发现PFAS通过降低Nedd4-2磷酸化增加αENaC表达的机制 研究仅使用雄性129S6小鼠,未在雌性小鼠中观察到血压效应,剂量反应关系仍需进一步验证 探究PFAS暴露对血压、盐敏感性和肾损伤的影响及其分子机制 129S6小鼠 毒理学 高血压 单细胞RNA测序,蛋白质印迹 小鼠模型 基因表达数据,蛋白质数据,生理参数 129S6小鼠群体(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3993 2025-10-05
A Human Glomerular Disease Atlas defines the APOL1-JAK-STAT feed forward loop in focal segmental glomerulosclerosis
2025-Sep-19, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 通过整合肾脏活检和参考组织的单细胞测序数据构建人类肾小球疾病图谱,揭示APOL1-JAK-STAT信号通路在局灶节段性肾小球硬化中的调控机制 首次构建综合性肾小球疾病图谱OCEAN,发现APOL1与JAK-STAT通路形成正反馈循环的新机制 样本量相对有限,主要基于观察性数据,需要进一步功能验证 解析罕见肾小球疾病的转录调控程序 人类肾脏组织样本和患者来源的足细胞模型 单细胞基因组学 局灶节段性肾小球硬化 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 无监督分析 单细胞转录组数据 170个样本(120个肾脏活检+50个参考组织) NA 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3994 2025-10-05
VEGFR2 blockade overcomes acquired KRAS G12D inhibitor resistance driven by PI3Kγ activation
2025-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了KRAS G12D抑制剂获得性耐药的新机制,并提出通过阻断VEGFR2来克服耐药性的治疗策略 首次发现PI3Kγ激活通过形成KRAS-p110γ-p101复合物驱动VEGFA-VEGFR2信号通路,导致KRAS G12D抑制剂获得性耐药 研究主要基于体外模型和动物实验,尚未进行临床试验验证 探索KRAS G12D抑制剂获得性耐药的机制并开发克服策略 胃肠道癌症模型和患者来源类器官 癌症生物学 胰腺癌、胃癌、结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 9个人类胃肠道癌症模型,包括3个患者来源类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3995 2025-10-05
Pancreatic tumor microenvironment reprogramming via alloantigen-expressing virotherapy elicits tumor rejection and improves immunotherapy response
2025-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种表达同种异体抗原的溶瘤病毒疗法,通过重编程胰腺癌肿瘤微环境来增强免疫治疗效果 利用表达鼠源H-2Kk MHC I类同种异体抗原的重组溶瘤病毒载体,诱导肿瘤特异性抗原错配反应,将免疫冷肿瘤转化为免疫热肿瘤 rVMG-H-2Kk同时诱导了补偿性免疫抑制通路,包括抗病毒反应基因和免疫检查点受体PDL-2的上调 开发新型免疫治疗策略以改善胰腺导管腺癌的免疫治疗效果 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境 肿瘤免疫治疗 胰腺癌 溶瘤病毒疗法,免疫检查点阻断,空间转录组学 免疫活性PDAC小鼠模型 免疫组织化学,免疫表型分析,空间转录组数据 两个独立的免疫活性PDAC模型 NA 空间转录组学 NA NA
3996 2025-10-05
A Novel Proteoglycan-4 Isoform Drives Skeletal Regeneration
2025-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过RNA-seq和单细胞RNA-seq发现了一种新型PRG4剪接异构体在骨骼再生中的关键作用 首次发现PRG4在骨骼修复中的新功能,鉴定出一种缺乏三个编码外显子的独特剪接异构体,并证实其在成骨过程中的重要作用 研究仅限于小鼠胫骨骨折模型,尚未在人类或其他物种中验证 探究PRG4在骨骼再生过程中的功能和作用机制 小鼠胫骨骨折模型中的骨折痂组织 骨骼生物学 骨骼损伤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 NA RNA测序数据 多个骨折后时间点的小鼠样本 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3997 2025-10-05
Vascular Patterning affects Intramembranous Ossification through HIF1α-Vegf Signaling
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了内皮细胞中Med23通过调控HIF1α-Vegf信号通路协调血管模式化和膜内骨化的关键作用 首次发现Med23在内皮细胞中通过调节HIF1α-VEGF信号轴,在颅面发育中协调血管模式化和膜内骨化的新机制 研究主要基于小鼠胚胎模型,尚未在人类或其他物种中验证 探究Mediator尾部亚基Med23在内皮细胞中的特异性功能及其对颅面发育的影响 小鼠胚胎的内皮细胞和神经嵴细胞 发育生物学 颅面畸形 空间转录组学,基因敲除,药理学干预 NA 基因表达数据,组织形态数据 基因敲除小鼠胚胎模型 NA 空间转录组学 NA NA
3998 2025-10-05
ArchVelo: Archetypal Velocity Modeling for Single-cell Multi-omic Trajectories
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种名为ArchVelo的新方法,用于从单细胞多组学数据推断细胞轨迹和基因调控动态 将染色质可及性表示为共享调控程序的典型集合,并建模其对转录的动态影响 NA 从静态单细胞测量中推断动态细胞过程 小鼠大脑发育、人类造血过程和CD8 T细胞对病毒感染的反应 基因组学 病毒感染 单细胞同时染色质可及性测序(scATAC-seq)和转录组测序(scRNA-seq) 典型速度模型 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
3999 2025-10-05
ZipAEr: A compressive convolutional autoencoder for high-dimensional spatial omics data at subcellular resolution
2025-Sep-17, Research square
研究论文 提出一种名为ZipAEr的压缩卷积自编码器,用于处理高维空间组学数据并提取有意义的潜在特征 在转录水平而非细胞水平处理数据,保留亚细胞和细胞外空间背景;通过卷积层同时减少空间维度和通道数;在损失函数中引入通道加权以平衡低表达基因的表示 NA 解决空间转录组学数据分析复杂性的挑战,开发高效的数据压缩和特征提取方法 高维空间组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 卷积自编码器 空间组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
4000 2025-10-05
Human Cytomegalovirus Infection of Primary Human Oral Keratinocytes Induces Intermediate Keratinocyte Differentiation and an Altered Innate Immune Response
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用原代人类口腔角质形成细胞模型,探究人巨细胞病毒在口腔黏膜感染过程中如何调控宿主细胞分化和先天免疫反应 首次在原发性人类口腔角质形成细胞中通过单细胞RNA测序揭示HCMV感染诱导中间角质形成细胞分化表型并改变先天免疫反应 研究仅限于体外细胞培养模型,未涉及完整的口腔黏膜组织环境 探究人巨细胞病毒在口腔黏膜中的初始感染机制及对宿主细胞的影响 原代人类口腔角质形成细胞 单细胞转录组学 病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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