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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3981 | 2025-10-06 |
Reactivation of CTLA4-expressing T cells accelerates resolution of lung fibrosis in a humanized mouse model
2025-May-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI181775
PMID:40100323
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术,揭示了CTLA4阳性T细胞在肺纤维化消退过程中的关键作用 | 首次发现CTLA4在CD8+ T细胞上的表达与纤维化区域相邻,并证明靶向CTLA4的治疗可加速肺上皮再生和纤维化消退 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的直接转化仍需进一步验证 | 探究免疫检查点蛋白CTLA4在肺纤维化消退过程中的作用机制 | 人源化CTLA4敲入小鼠模型、人类特发性肺纤维化组织 | 空间转录组学 | 肺纤维化 | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 人源化小鼠模型和人类肺纤维化组织样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
3982 | 2025-10-06 |
[Single-cell analysis of immune-lineage features in T-cell large granular lymphocytic leukemia]
2025-May-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析T细胞大颗粒淋巴细胞白血病患者的免疫谱系特征 | 首次在单细胞水平揭示T-LGLL的免疫谱系特征,发现效应CD8+ T细胞异常扩增、Treg细胞减少及功能异常等关键免疫失衡特征 | 样本量较小(5例患者和3例健康对照),单中心研究 | 研究T细胞大颗粒淋巴细胞白血病的免疫谱系改变及其致病机制 | T-LGLL患者和健康对照者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5例T-LGLL患者(治疗前后配对样本)和3例健康对照 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序技术 |
3983 | 2025-10-06 |
POPARI: Modeling multisample variation in spatial transcriptomics
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652741
PMID:40462963
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研究论文 | 提出Popari概率图模型用于多样本空间转录组数据的因子分解分析 | 引入差异先验正则化空间一致性和空间下采样实现多分辨率层次分析 | 未明确说明模型计算复杂度和可扩展性限制 | 开发多样本空间转录组数据整合分析方法 | 空间转录组数据集 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病, 卵巢癌 | 空间转录组学 | 概率图模型 | 空间基因表达数据 | 多个生物样本(小鼠大脑、胸腺、卵巢癌) | NA | 空间转录组学 | STARmap PLUS, Slide-TCR-seq, CosMx | NA |
3984 | 2025-10-06 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2025-May-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf045
PMID:40036847
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研究论文 | 本研究构建了首个小鼠精囊的单细胞转录组图谱,揭示了该组织的细胞组成和功能特征 | 首次创建小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱,系统定义了该组织的细胞类型和转录组特征 | 研究仅基于小鼠模型,结果向人类推演需谨慎;样本数量相对有限 | 解析精囊组织的细胞组成和功能,理解精液形成的分子基础 | 小鼠精囊组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3985 | 2025-10-06 |
Emerging Techniques in Spatial Multiomics: Fundamental Principles and Applications to Dermatology
2025-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.006
PMID:39503694
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综述 | 本文综述了空间多组学技术的基本原理及其在皮肤病学研究中的应用前景 | 介绍了能够同时捕获DNA、基因组可及性、组蛋白修饰和蛋白质的空间多组学新技术,突破了传统空间转录组学的局限 | 作为综述文章,未涉及具体实验验证和数据分析 | 探讨空间多组学技术在皮肤病学研究中的原理、优势和局限性 | 皮肤组织的空间分子特征 | 空间生物学 | 皮肤病 | 空间多组学技术 | NA | 基因组、表观基因组、蛋白质组空间数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | NA |
3986 | 2025-10-06 |
A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus
2025-Apr-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114466
PMID:40090085
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研究论文 | 本研究在青少年系统性红斑狼疮中发现了一类高度活化的CD99-CD72+B细胞亚群,该细胞群通过表达高水平TLR7促进自身免疫进程 | 首次在青少年系统性红斑狼疮中鉴定出CD72+B细胞这一关键过渡细胞群体,揭示了其在自身免疫反应中的新作用机制 | 研究主要基于测序数据分析,需要进一步实验验证该细胞群体的具体功能机制 | 探究青少年系统性红斑狼疮中B细胞亚群的免疫病理机制 | 青少年系统性红斑狼疮患者的B细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多组学整合分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
3987 | 2025-10-06 |
A Spatial Multi-Omic Framework Identifies Gliomas Permissive to TIL Expansion
2025-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645566
PMID:40236001
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研究论文 | 本研究通过多模态分析识别胶质瘤中肿瘤浸润淋巴细胞扩增的空间和分子决定因素 | 首次整合光谱流式细胞术、TCR测序、单细胞RNA-seq、Xenium原位转录组学和CODEX空间蛋白质组学,建立空间多组学框架分析胶质瘤TIL扩增能力 | 研究聚焦于高级别胶质瘤,结果在其他免疫排斥肿瘤中的普适性需进一步验证 | 识别胶质瘤中肿瘤浸润淋巴细胞扩增的基因组和空间决定因素 | 高级别胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 光谱流式细胞术, TCR测序, 单细胞RNA测序, 原位转录组学, 空间蛋白质组学 | 多组学整合分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据, T细胞受体数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Xenium | Xenium原位转录组学平台 |
3988 | 2025-10-06 |
Tracking HIV persistence across T cell lineages during early ART-treated HIV-1-infection using a reservoir-marking humanized mouse model
2025-Mar-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57368-7
PMID:40044684
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研究论文 | 开发HIV-1诱导谱系追踪系统,通过单细胞RNA测序追踪早期ART治疗期间HIV在不同T细胞谱系中的持久性 | 首创HIV-1诱导谱系追踪系统,可永久标记感染细胞并检测稀有潜伏感染细胞 | 基于人源化小鼠模型,可能与人类真实感染情况存在差异 | 研究HIV在ART治疗期间在不同T细胞谱系中的持久性机制 | HIV-1感染的人源化小鼠模型中的CD4 T细胞 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 人源化小鼠模型中的稀有潜伏感染细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3989 | 2025-10-06 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2025-Mar-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.12.016
PMID:39814010
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPRi筛选的iAssembloids系统,用于研究神经元与胶质细胞相互作用的分子机制 | 首次将CRISPRi筛选技术应用于3D共培养的iPSC衍生神经元和胶质细胞系统,建立了可扩展的因果分子机制研究平台 | 基于体外培养系统,可能无法完全模拟体内大脑环境的复杂性 | 阐明神经元与胶质细胞相互作用的分子机制,特别是对神经元存活和死亡的控制 | iPSC衍生的神经元和胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | CRISPRi筛选,单细胞转录组学 | iAssembloids 3D共培养系统 | 基因表达数据,功能筛选数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3990 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of circulating immune cells over the first 2 months of age in extremely premature infants
2025-Mar-05, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr0942
PMID:40043141
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研究论文 | 本研究通过纵向多组学分析描绘了极早产儿出生后前两个月循环免疫细胞的发育轨迹 | 首次利用微量血液样本对极早产儿进行纵向单细胞多组学分析,揭示了其外周免疫发育的独特轨迹 | 样本量较小(仅10名极早产儿),需要更大规模研究验证 | 阐明极早产儿出生后前两个月外周免疫系统的发育特征 | 极早产儿、健康成人、早产和足月脐带血样本 | 单细胞组学 | 早产相关免疫缺陷 | 单细胞RNA测序、T和B细胞受体测序、磷酸化蛋白质质谱流式细胞术 | NA | 单细胞多组学数据 | 10名极早产儿,加上健康成人、早产和足月脐带血对照样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 单细胞BCR测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
3991 | 2025-10-06 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-Mar, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
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综述 | 本文更新并拓展了关于心脏病分子与细胞神经生物学的研究,重点关注心脏自主神经发育、新型细胞内通路和神经可塑性 | 利用患者特异性干细胞研究交感神经功能障碍,以及新型成像技术和空间转录组学在心脏自主神经疾病治疗靶点发现中的应用 | 文中强调了未解决的问题和存在争议的领域 | 探讨心脏疾病的分子与细胞神经生物学机制 | 心脏自主神经系统、神经化学通路、患者特异性干细胞 | 神经心脏病学 | 心脏病 | 空间转录组学、干细胞技术、新型成像技术 | NA | 分子与细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
3992 | 2025-10-06 |
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-Mar, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829
PMID:39746460
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研究论文 | 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡和生育力下降的机制 | 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路导致卵母细胞凋亡和生育力下降的具体分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究PFOA和PFOS混合物对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响机制 | 雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生育障碍 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3993 | 2025-10-06 |
A single-cell sequencing-based analysis of a 13-year-old with maxillary sinus NUT carcinoma
2025-Mar, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤异质性和免疫微环境特征 | 首次在NUT癌中应用单细胞测序技术揭示肿瘤上皮细胞的异质性和免疫微环境特征 | 仅分析单例患者样本,样本量有限 | 探索NUT癌的肿瘤生物学特性和潜在治疗靶点 | 13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | NUT癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3994 | 2025-10-06 |
Biophysical modelling of intrinsic cardiac nervous system neuronal electrophysiology based on single-cell transcriptomics
2025-Mar, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287595
PMID:40077928
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研究论文 | 基于单细胞转录组数据开发心脏内在神经系统神经元电生理计算模型库 | 首次基于单细胞转录组数据建立心脏内在神经系统神经元电生理模型库,填补分子水平基因表达与细胞水平电生理数据之间的空白 | 模型依赖于转录组数据的阈值设定,且电生理数据稀缺可能限制模型验证 | 研究心脏内在神经系统神经元电生理特性及其在心脏调控中的功能作用 | 心脏内在神经系统神经元 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | 计算电生理模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3995 | 2025-10-06 |
SELP+ TEC:CD8+ T cell crosstalk associates with improved radiotherapy efficacy in cervical cancer
2025-Feb-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02244-7
PMID:39901166
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研究论文 | 本研究探讨了宫颈癌中SELP+肿瘤内皮细胞与CD8+ T细胞通过ACKR1-CCL5轴的相互作用对放疗疗效的影响 | 首次发现SELP在宫颈癌特定内皮细胞亚群中的表达与抗癌免疫反应相关,并揭示了SELP TEC与CD8+ T细胞通过ACKR1-CCL5轴互作的新机制 | SELP影响抗癌免疫的具体机制及其在放疗反应中的确切作用尚未完全阐明 | 探究SELP在宫颈癌中对抗癌免疫的影响及其在放疗反应中的作用机制 | 宫颈癌患者肿瘤组织样本、单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 癌症免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 205例宫颈癌患者肿瘤组织样本,8例患者的42,159个细胞的scRNA-seq数据,187例放疗患者的批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
3996 | 2025-10-06 |
Multimodal hierarchical classification of CITE-seq data delineates immune cell states across lineages and tissues
2025-Jan-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100938
PMID:39814026
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研究论文 | 开发了一种名为MMoCHi的多模态分层分类方法,用于准确注释CITE-seq数据中的免疫细胞状态 | 提出不依赖参考图谱的基于标记物的多模态分类方法,能够整合跨谱系、样本或模态的细胞类型注释 | NA | 开发能够整合多模态单细胞数据的准确细胞类型分类方法 | 免疫细胞,特别是T淋巴细胞亚群和跨组织人类免疫细胞 | 生物信息学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | 分层分类器 | 单细胞转录组数据, 表面蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表面蛋白质组分析 | NA | NA |
3997 | 2025-10-06 |
CD8 + T cells mediate vaccination-induced lymphatic containment of latent Mycobacterium tuberculosis infection following immunosuppression, while B cells are dispensable
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634479
PMID:39896630
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了CD8+T细胞在疫苗接种预防潜伏结核感染再激活中的关键作用 | 首次发现CD8+T细胞在缺乏CD4+T细胞情况下仍能介导疫苗接种对潜伏结核感染的淋巴控制 | 研究基于小鼠模型,结果需要在人类中进一步验证 | 阐明潜伏结核感染免疫控制与再激活的免疫学机制 | 潜伏结核分枝杆菌感染的小鼠模型 | 免疫学 | 结核病 | 空间转录组学、多参数成像、网络分析、生物信息学整合 | NA | 组织病理学图像、转录组数据 | 多种免疫细胞缺陷小鼠品系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
3998 | 2025-10-06 |
Aberrant Activation of Wound-Healing Programs within the Metastatic Niche Facilitates Lung Colonization by Osteosarcoma Cells
2025-Jan-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0049
PMID:39540841
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤细胞通过诱导肺组织异常伤口愈合程序促进转移灶形成的机制 | 首次发现骨肉瘤细胞通过诱导肺泡上皮损伤激活慢性不愈合的伤口愈合表型,并证实抗纤维化药物尼达尼布可阻断此过程 | 研究主要基于小鼠模型和异种移植模型,人类样本验证有限 | 阐明骨肉瘤肺转移微环境形成的细胞和分子机制,寻找转移特异性治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺转移微环境中的肿瘤和非肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 免疫活性小鼠模型、免疫缺陷人源异种移植模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
3999 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals Mycobacterium tuberculosis ESX-1-mediated accumulation of permissive macrophages in infected mouse lungs
2025-Jan-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq8158
PMID:39813329
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了结核分枝杆菌ESX-1系统在感染小鼠肺部促进易感巨噬细胞积累的机制 | 首次系统揭示ESX-1系统通过调控肺单核吞噬细胞异质性和免疫逃避特征促进结核分枝杆菌生存的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证 | 探究结核分枝杆菌ESX-1分泌系统对肺单核吞噬细胞招募和分化的影响 | 感染结核分枝杆菌的小鼠和鼠源骨髓衍生巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 多个小鼠模型和骨髓衍生巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4000 | 2025-10-06 |
Exploring the utility of snRNA-seq in profiling human bladder tissue: A comprehensive comparison with scRNA-seq
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111628
PMID:39850354
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研究论文 | 比较单细胞RNA测序和单核RNA测序在人类膀胱组织细胞类型鉴定中的效用 | 首次在人类膀胱组织中系统比较scRNA-seq和snRNA-seq技术的优势与局限 | 研究仅针对人类膀胱组织,结果可能不适用于其他组织类型 | 确定scRNA-seq和snRNA-seq在表征下尿路细胞类型方面的优势和局限性 | 人类膀胱组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |