单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3981 - 4000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3981 | 2025-10-06 |
Multimodal hierarchical classification of CITE-seq data delineates immune cell states across lineages and tissues
2025-Jan-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100938
PMID:39814026
|
研究论文 | 开发了一种名为MMoCHi的多模态分层分类方法，用于准确注释CITE-seq数据中的免疫细胞状态 | 提出不依赖参考图谱的基于标记物的多模态分类方法，能够整合跨谱系、样本或模态的细胞类型注释 | NA | 开发能够整合多模态单细胞数据的准确细胞类型分类方法 | 免疫细胞，特别是T淋巴细胞亚群和跨组织人类免疫细胞 | 生物信息学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | 分层分类器 | 单细胞转录组数据, 表面蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表面蛋白质组分析 | NA | NA |
| 3982 | 2025-10-06 |
CD8 + T cells mediate vaccination-induced lymphatic containment of latent Mycobacterium tuberculosis infection following immunosuppression, while B cells are dispensable
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634479
PMID:39896630
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了CD8+T细胞在疫苗接种预防潜伏结核感染再激活中的关键作用 | 首次发现CD8+T细胞在缺乏CD4+T细胞情况下仍能介导疫苗接种对潜伏结核感染的淋巴控制 | 研究基于小鼠模型，结果需要在人类中进一步验证 | 阐明潜伏结核感染免疫控制与再激活的免疫学机制 | 潜伏结核分枝杆菌感染的小鼠模型 | 免疫学 | 结核病 | 空间转录组学、多参数成像、网络分析、生物信息学整合 | NA | 组织病理学图像、转录组数据 | 多种免疫细胞缺陷小鼠品系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3983 | 2025-10-06 |
Aberrant Activation of Wound-Healing Programs within the Metastatic Niche Facilitates Lung Colonization by Osteosarcoma Cells
2025-Jan-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0049
PMID:39540841
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤细胞通过诱导肺组织异常伤口愈合程序促进转移灶形成的机制 | 首次发现骨肉瘤细胞通过诱导肺泡上皮损伤激活慢性不愈合的伤口愈合表型，并证实抗纤维化药物尼达尼布可阻断此过程 | 研究主要基于小鼠模型和异种移植模型，人类样本验证有限 | 阐明骨肉瘤肺转移微环境形成的细胞和分子机制，寻找转移特异性治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺转移微环境中的肿瘤和非肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 免疫活性小鼠模型、免疫缺陷人源异种移植模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 3984 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals Mycobacterium tuberculosis ESX-1-mediated accumulation of permissive macrophages in infected mouse lungs
2025-Jan-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq8158
PMID:39813329
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了结核分枝杆菌ESX-1系统在感染小鼠肺部促进易感巨噬细胞积累的机制 | 首次系统揭示ESX-1系统通过调控肺单核吞噬细胞异质性和免疫逃避特征促进结核分枝杆菌生存的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究结核分枝杆菌ESX-1分泌系统对肺单核吞噬细胞招募和分化的影响 | 感染结核分枝杆菌的小鼠和鼠源骨髓衍生巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 多个小鼠模型和骨髓衍生巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3985 | 2025-10-06 |
Exploring the utility of snRNA-seq in profiling human bladder tissue: A comprehensive comparison with scRNA-seq
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111628
PMID:39850354
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研究论文 | 比较单细胞RNA测序和单核RNA测序在人类膀胱组织细胞类型鉴定中的效用 | 首次在人类膀胱组织中系统比较scRNA-seq和snRNA-seq技术的优势与局限 | 研究仅针对人类膀胱组织，结果可能不适用于其他组织类型 | 确定scRNA-seq和snRNA-seq在表征下尿路细胞类型方面的优势和局限性 | 人类膀胱组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 3986 | 2025-10-06 |
Single Cell Transcriptomic Profiling of MYBPC3-Associated Hypertrophic Cardiomyopathy Across Species Reveals Conservation of Biological Process But Not Gene Expression
2025-Jan-07, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.035780
PMID:39719426
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较不同物种中MYBPC3相关肥厚型心肌病的生物学过程 | 首次在猫、人类和小鼠中比较MYBPC3相关肥厚型心肌病的单细胞转录组特征，发现生物学过程保守但驱动基因存在物种差异 | 仅关注MYBPC3相关突变，未涵盖其他HCM相关基因突变 | 阐明不同物种间MYBPC3相关肥厚型心肌病的共同和特异性病理通路 | 携带MYBPC3变异的猫、人类和小鼠心脏组织 | 单细胞生物学 | 肥厚型心肌病 | 单核RNA测序 | 基于模型的单细胞转录组分析算法 | 单细胞RNA测序数据 | 猫、人类和小鼠多个物种的心脏组织样本 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 3987 | 2025-10-06 |
CellChat for systematic analysis of cell-cell communication from single-cell transcriptomics
2025-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01045-4
PMID:39289562
|
研究论文 | 介绍用于单细胞转录组数据细胞间通讯系统分析的CellChat v2工具及其使用流程 | 开发了包含扩展配体-受体对数据库、比较功能模块和交互式探索器的CellChat v2更新版本 | 需要基本的R语言和单细胞数据分析知识，处理时间取决于数据集大小 | 系统分析细胞间通讯网络 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 基于质量作用定律的简化模型，机器学习方法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3988 | 2025-10-06 |
CRISPR-based genetic screens in human pluripotent stem cells derived neurons and brain organoids
2025-Jan, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03934-2
PMID:39585363
|
综述 | 总结基于CRISPR的功能基因组学筛选方法在人多能干细胞衍生神经元和脑类器官中的应用 | 整合CRISPR筛选与单细胞RNA测序技术，揭示神经细胞中遗传变异的下游基因和细胞通路 | 面临当前技术挑战，需进一步优化方法 | 理解神经发育疾病的发病机制并开发潜在治疗策略 | 人多能干细胞衍生神经元和脑类器官 | 功能基因组学 | 神经发育障碍（如小头畸形和自闭症谱系障碍） | CRISPR基因编辑, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3989 | 2025-10-06 |
Single-Cell Profiling of Lineages and Cell Types in the Vertebrate Brain
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_15
PMID:39745647
|
研究论文 | 本研究开发了scGESTALTv2技术，结合CRISPR-Cas9谱系追踪和单细胞RNA测序，用于脊椎动物大脑发育过程中的细胞谱系和类型分析 | 开发了scGESTALTv2技术，将累积性CRISPR-Cas9编辑与单细胞转录组分析相结合，实现单细胞分辨率的可扩展谱系追踪 | NA | 研究脊椎动物大脑发育过程中的细胞谱系关系和细胞类型鉴定 | 斑马鱼发育中的大脑细胞 | 单细胞生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个脑细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 3990 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of CD14+CD16+ monocytes identifies a subpopulation with an enhanced migratory and inflammatory phenotype
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1475480
PMID:40051633
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析CD14+CD16+单核细胞，发现具有增强迁移和炎症表型的亚群 | 首次在CD14+CD16+单核细胞中识别出具有独特炎症特征的Group 1亚群，并发现其与神经炎症疾病的潜在关联 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证；样本来源和数量未明确说明 | 探索CD14+CD16+单核细胞的异质性及其在神经炎症疾病中的作用 | 人类CD14+CD16+单核细胞 | 单细胞生物学 | 神经炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3991 | 2025-10-06 |
Single-cell technologies and spatial transcriptomics: decoding immune low - response states in endometrial cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1636483
PMID:40672944
|
综述 | 本文探讨单细胞技术和空间转录组学在解码子宫内膜癌免疫低应答状态中的应用 | 整合单细胞测序与空间转录组技术进行多组学分析，揭示肿瘤微空间异质性 | 存在伦理和法律问题尚未解决 | 开发免疫治疗预测生物标志物并改善临床疗效 | 子宫内膜癌患者（特别关注NSMP亚型伴p53突变） | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3992 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis reveals glutathione metabolism-related immune suppression and constructs a prognostic model in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1608407
PMID:40672941
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了谷胱甘肽代谢相关的免疫抑制机制，并构建了肺腺癌预后预测模型 | 首次通过遗传因果分析结合单细胞RNA测序，系统阐明了谷胱甘肽代谢与肺腺癌免疫微环境的因果关系及其调控机制 | 研究主要基于公共数据库和体外验证，缺乏大规模临床队列的进一步验证 | 探究谷胱甘肽代谢重编程对肺腺癌免疫微环境的影响及其临床意义 | 肺腺癌患者样本、TCGA数据库、GEO数据库、肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 伪时间分析, WGCNA, LASSO-Cox回归, qRT-PCR | 预后风险模型, 列线图模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA队列和两个独立GEO验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序 | NA | NA |
| 3993 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell chromatin and transcriptomic analyses of peripheral immune cells in patients with alopecia areata
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565241
PMID:40672948
|
研究论文 | 通过整合单细胞染色质和转录组分析，研究斑秃患者外周免疫细胞的系统免疫失调 | 首次提供斑秃外周免疫细胞的整合单细胞染色质和转录组图谱，揭示疾病严重程度相关的系统免疫改变 | 仅分析外周血单个核细胞，未包括病变皮肤组织的直接比较 | 探索斑秃患者外周免疫细胞的系统免疫失调机制 | 斑秃患者（轻度和重度）和健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞多组学 | 斑秃 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 伪时序分析, 转录因子分析, 细胞间通讯网络推断 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 32,453个高质量细胞，涵盖36种免疫细胞亚型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3994 | 2025-10-06 |
Prediction and immune landscape study of potentially key autophagy-related biomarkers in preeclampsia with gestational diabetes mellitus
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571795
PMID:40672961
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别妊娠期糖尿病合并先兆子痫的潜在自噬相关生物标志物 | 首次整合多组学方法研究GDM合并先兆子痫的自噬相关基因特征，并利用单细胞RNA测序验证结果 | 样本量有限，需要更大规模研究验证生物标志物的临床适用性 | 探究妊娠期糖尿病合并先兆子痫的自噬相关基因表达变化及其分子机制 | 胎盘组织样本 | 生物信息学 | 妊娠期糖尿病合并先兆子痫 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 基因表达谱分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3995 | 2025-10-06 |
Precancerous pathways to gastric cancer: a review of experimental animal models recapitulating the correa cascade
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1620756
PMID:40673273
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综述 | 本文全面分析胃癌前病变的动物实验模型，评估其模拟人类胃癌发生Correa级联的能力 | 系统分类并比较了五类胃癌前病变动物模型的优缺点，特别关注遗传工程小鼠模型的最新进展 | 现有模型主要产生SPEM而非真正的肠上皮化生，转化相关性有限 | 研究胃癌前病变的发病机制以制定有效预防和治疗策略 | 胃癌前病变动物模型 | 病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、遗传工程 | 动物模型（感染模型、化学致癌模型、多因素诱导模型、遗传工程小鼠模型） | 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3996 | 2025-10-06 |
sc-SPLASH provides ultra-efficient reference-free discovery in barcoded single-cell sequencing
2024-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630263
PMID:39763839
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研究论文 | 开发了sc-SPLASH流程，用于无参考基因组的单细胞RNA测序数据分析 | 将SPLASH框架扩展到条形码单细胞RNA测序和空间转录组学，提供无需参考基因组的统计优先发现方法 | NA | 探索转录组多样性，包括剪接、V(D)J重组和参考基因组中缺失的序列 | 人类、海鞘和海绵的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台，10x Visium空间转录组平台 |
| 3997 | 2025-10-06 |
Chondroitin sulfate proteoglycan 4 increases invasion of recessive dystrophic epidermolysis bullosa-associated cutaneous squamous cell carcinoma by modifying transforming growth factor-β signalling
2024-Dec-23, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae295
PMID:39018437
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研究论文 | 本研究探讨硫酸软骨素蛋白聚糖4在隐性营养不良性大疱性表皮松解症相关皮肤鳞状细胞癌中通过调节TGF-β信号通路增强肿瘤侵袭性的机制 | 首次揭示CSPG4通过调节SMAD3磷酸化增强TGF-β信号通路，从而促进RDEB cSCC肿瘤侵袭的新机制 | 研究主要基于体外细胞系和肿瘤模型，缺乏体内动物实验验证 | 评估CSPG4在RDEB cSCC中的表达和功能作用 | RDEB cSCC细胞系、RDEB cSCC肿瘤组织、非RDEB cSCC肿瘤组织 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 体外全层肿瘤模型 | 基因表达数据、组织病理学图像 | 多个RDEB cSCC细胞系、已发表的scRNA-Seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3998 | 2025-10-06 |
CFTR represses a PDX1 axis to govern pancreatic ductal cell fate
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111393
PMID:39687022
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了CFTR蛋白通过调控PDX1轴决定胰腺导管细胞命运的机制 | 发现CFTR蛋白水平（而非通道功能）通过维持PTEN和GSK3β活性来抑制PDX1表达，调控胰腺细胞命运 | 研究基于CF雪貂模型，在人类中的直接适用性需进一步验证 | 探究CFTR缺失导致胰腺重塑的分子机制 | 囊性纤维化雪貂模型的胰腺组织 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq | NA | 转录组数据，表观基因组数据 | CF雪貂模型 | NA | 单细胞RNA测序，转座酶可及染色质测序 | NA | NA |
| 3999 | 2025-10-06 |
Cycling alpha cells in regenerative drug-treated human pancreatic islets may serve as key beta cell progenitors
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101832
PMID:39626675
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现人类胰岛中循环α细胞可能是β细胞再生的关键前体细胞 | 首次揭示DYRK1A抑制剂通过靶向循环α细胞促进其转分化为β细胞的机制 | 作用机制尚未完全阐明，需要进一步验证 | 探索DYRK1A抑制剂促进β细胞再生的分子机制 | 人类胰岛细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 谱系轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4000 | 2025-10-06 |
Elucidating Sex-Specific Immune Profiles in a Breast Cancer Model
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313113
PMID:39684829
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术揭示乳腺癌模型中性别特异性免疫特征差异 | 首次在雌雄ER+乳腺癌转基因小鼠模型中系统比较性别相关的激素和免疫景观差异 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明乳腺癌中性别特异性免疫反应特征 | MMTV-PyMT转基因小鼠模型的雌雄ER+乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 全片免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 图像数据, 细胞计数数据 | 转基因小鼠乳腺肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |