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当前共找到 38358 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-04-11 |
Integrating Microscopy Methods to Study Gene and Protein Expression alongside Metal Ion Distribution and Speciation: A Case Study of Iron within Pyramidal Neurons from Distinct Hippocampal CA1 Subregions
2026-Mar-23, Chemical & biomedical imaging
DOI:10.1021/cbmi.5c00059
PMID:41889472
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研究论文 | 本研究通过整合多种显微分析方法，探究了海马CA1区不同亚区域中锥体神经元的铁离子分布、氧化状态、储存蛋白表达及基因表达通路，以揭示铁代谢与神经退行性疾病易感性的关联 | 首次将X射线荧光显微镜、XANES光谱、免疫荧光和空间转录组学四种技术结合，对海马CA1区特定脑区域的铁代谢组进行空间解析，揭示了侧向与内侧CA1神经元在铁代谢方面的关键差异 | 研究仅针对海马CA1区，样本范围有限，且为案例研究，可能需要更大样本量验证结果 | 探究铁离子在大脑健康及神经退行性疾病中的作用，特别是在海马CA1区的分布与代谢特征 | 海马CA1区（侧向和内侧）的锥体神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | X射线荧光显微镜，XANES光谱，免疫荧光，空间转录组学 | NA | 图像，光谱数据，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 382 | 2026-04-11 |
Single-cell spatial multi-omics molecular pathology enabled by SuperFocus
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.26.696575
PMID:41890079
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SuperFocus的计算平台，用于从基于点的空间测量中生成与组织病理学整合的单细胞空间多组学数据，无需外部参考数据 | SuperFocus平台结合了约束级联插补与特征级和细胞级质量控制评分，提高了准确性，并在基准数据集上比现有方法提升了28-73%的关键指标 | NA | 开发下一代分子病理学方法，将基因组尺度分子信息以单细胞分辨率投影到整个组织切片的组织病理学图像上 | MALT淋巴瘤微环境、人类海马体基因调控程序、人类MASH中的脂毒性肝细胞状态，以及帕金森病小鼠脑中与神经传递和神经炎症相关的转录组-代谢组状态 | 数字病理学 | MALT淋巴瘤, MASH, 帕金森病 | 空间转录组学, 空间ATAC-RNA, 空间CITE-seq, Visium-MALDI-MSI | 约束级联插补模型 | 空间多组学数据, 组织病理学图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞空间多组学, 空间转录组学 | Visium | Visium-MALDI-MSI (SMA) 数据集 |
| 383 | 2026-04-11 |
Contribution of cytotoxic CD8 T cells, neutrophils and type 1 interferon signaling to hyperinflammation in HIV-associated TB meningitis
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.10.710544
PMID:41959528
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HIV相关结核性脑膜炎患者脑脊液中的免疫细胞，揭示了以细胞毒性CD8 T细胞、高度活化的中性粒细胞和有害的I型干扰素信号为特征的高炎症免疫反应 | 首次在HIV相关结核性脑膜炎患者中，通过大规模单细胞RNA测序（188,983个细胞）系统揭示了脑脊液免疫微环境的细胞组成和功能特征，特别是发现了细胞毒性CD8 T细胞的主导地位、中性粒细胞的异常活化状态以及I型干扰素信号的有害作用 | 样本量相对有限（25名成人患者），且主要针对HIV阳性人群，结果可能无法完全推广到HIV阴性结核性脑膜炎患者；研究为观察性研究，需要进一步实验验证这些免疫特征的因果关系 | 阐明HIV相关结核性脑膜炎患者脑脊液中免疫失调的具体机制，特别是高炎症反应的细胞和分子基础 | 25名患有HIV相关结核性脑膜炎的成人患者的脑脊液细胞 | 单细胞组学 | 结核性脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 25名成人患者，共188,983个脑脊液细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 384 | 2026-04-11 |
TYK2 Inhibition with Deucravacitinib Improves Clinical Outcomes and Resolves Interferon-Driven Inflammation in Lichen Planopilaris
2026-Mar-22, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.03.13.26348272
PMID:41891048
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研究论文 | 本研究通过一项临床试验，评估了口服TYK2抑制剂deucravacitinib治疗扁平苔藓样脱发（LPP）的疗效，并利用bulk和单细胞RNA测序揭示了其通过抑制I型干扰素驱动的炎症通路发挥作用的机制 | 首次在LPP中应用选择性TYK2抑制剂deucravacitinib进行临床治疗，并联合bulk和单细胞RNA测序技术，在单细胞分辨率上阐明了治疗如何下调I型干扰素信号通路、CD8+ T细胞受体信号以及成纤维细胞-免疫细胞间的通讯 | 样本量较小（N=10），为单臂临床试验缺乏安慰剂对照，随访时间较短（24周） | 评估TYK2抑制剂deucravacitinib治疗扁平苔藓样脱发（LPP）的临床疗效并探究其分子机制 | 经活检证实的扁平苔藓样脱发（LPP）患者 | 数字病理 | 皮肤疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 10名LPP患者，采集治疗前和治疗后第4周的头皮活检配对样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 385 | 2026-04-11 |
Diverse high-fat diets drive multi-omic reprogramming that persists after dietary reversal
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.708620
PMID:41889866
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研究论文 | 本研究通过纵向多组学分析，探究了不同高脂饮食对宿主生理和肠道微生物组的长期影响，以及饮食逆转后的恢复情况 | 首次系统比较了七种不同脂肪来源的高脂饮食的长期效应，并揭示了饮食逆转后宿主-微生物组互作网络中存在的持久性“记忆”现象 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果外推至人类需谨慎；研究窗口期可能不足以观察所有特征的完全恢复 | 阐明特定脂肪来源的长期影响，以及饮食逆转后宿主-微生物组变化的可逆性程度 | 小鼠模型及其肠道微生物组 | 微生物组学 | 代谢性疾病 | 粪便宏基因组学、粪便代谢组学、血浆代谢组学与脂质组学、肠道单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据（基因组、代谢组、转录组） | 多个小鼠队列，包括对照组、七种高脂饮食组及饮食逆转组，研究持续一年 | NA | 单细胞RNA-seq, 宏基因组测序, 代谢组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 386 | 2026-04-11 |
Single-cell inflammatory signaling defines a novel CEP135+ endothelial subtype associated with glioma progression
2026-Mar-19, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102742
PMID:41861657
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，识别了一种与胶质瘤进展相关的创新性CEP135+炎症相关内皮细胞亚型 | 首次在单细胞水平上定义了CEP135+炎症相关内皮细胞亚型，并建立了CEP135作为连接内皮炎症重编程、肿瘤进展和不良临床结局的关键生物标志物 | 研究主要基于观察性数据，需要进一步功能实验验证CEP135的具体作用机制 | 探究胶质瘤微环境中慢性炎症的细胞组织及其与肿瘤进展的关系 | 胶质瘤及相邻正常脑组织 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 蛋白质组学, 免疫组化分析 | 通路水平评分方法, 伪时序轨迹分析, 细胞间通讯分析 | RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 来自本中心的人胶质瘤脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 387 | 2026-04-11 |
LIFUS-driven engineered bacteria reprogram immunosuppressive niches via mechano-NOTCH signaling
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102658
PMID:41806839
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研究论文 | 本研究通过工程化改造沙门氏菌表达气囊，利用低强度聚焦超声产生局部机械力，重塑肿瘤微环境，并开发了一种用于过继性T细胞疗法的机械启动方法 | 首次将工程化细菌与低强度聚焦超声结合，通过机械力选择性调控肿瘤微环境中的Notch1-Jagged1信号轴，并基于此开发了增强T细胞疗效的机械启动策略 | 研究主要在临床前模型中进行，尚未在人体中验证其安全性和有效性；机械力作用的长期影响和潜在副作用仍需进一步评估 | 克服实体瘤中限制T细胞浸润和功能的基质与免疫屏障，增强过继性T细胞疗法的疗效 | 实体瘤微环境、工程化沙门氏菌VNP20009、气囊、癌症相关成纤维细胞、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序、工程细菌改造、低强度聚焦超声 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 388 | 2026-04-11 |
ESPeR-seq: Extremely Sensitive and Pure, End-to-end, RNA-seq library preparation
2026-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711386
PMID:41959175
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的RNA-seq文库制备方法ESPeR-seq，旨在解决单细胞RNA测序中的非特异性PCR产物、转录终止位点捕获不精确以及虚假UMI生成等问题 | 开发了Omega-dT引物以精确捕获转录终止位点，并采用含尿嘧啶的TSO和尿嘧啶不耐受DNA聚合酶的生化多锁机制，以消除PCR背景和虚假UMI | NA | 提高单细胞RNA测序的灵敏度和定量准确性，实现全长异构体解析 | 单细胞RNA测序文库 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 389 | 2026-04-11 |
Fibroblasts neurotrophin signaling sustains pathological vascular maturation in rheumatoid arthritis
2026-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711120
PMID:41959252
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研究论文 | 本研究利用高维空间转录组学揭示了神经生长因子信号在类风湿关节炎滑膜中驱动异常血管成熟的关键作用 | 首次发现神经生长因子信号通过激活NOTCH3和NGFR诱导滑膜成纤维细胞分化为壁细胞，从而维持RA滑膜中成熟血管的形成 | 研究主要基于体外组织外植体实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究类风湿关节炎治疗失败机制，特别是滑膜成纤维细胞和血管内皮在驱动病理血管成熟中的作用 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织 | 空间转录组学 | 类风湿关节炎 | 高维空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 390 | 2026-04-11 |
Spatial transcriptomics for gene discovery identifies Slc13a5 as a modulator of bone mechanoadaptation
2026-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.11.711126
PMID:41958988
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，在小鼠胫骨中识别了机械负荷诱导的基因表达变化，并发现Slc13a5作为骨机械适应的调节因子 | 首次应用空间转录组学（GeoMx, NanoString）系统分析骨组织在机械负荷下的空间特异性基因表达，并验证了跨平台一致性基因 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；空间转录组学技术可能受分辨率限制 | 识别骨机械适应的关键分子调节因子，以开发针对骨脆性疾病的治疗策略 | 小鼠胫骨组织，特别是骨膜和骨室在张力和压缩区域的细胞 | 空间转录组学 | 骨脆性疾病 | 空间转录组学，RNA-seq，激光捕获显微切割 | NA | 空间基因表达数据，RNA-seq数据 | 小鼠胫骨样本，具体数量未明确说明 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学平台 |
| 391 | 2026-04-11 |
STEVE: Single-cell Transcriptomics Expression Visualization and Evaluation
2026-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.10.710898
PMID:41959208
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研究论文 | 本文提出了一个名为STEVE的定量框架，用于评估单细胞RNA测序研究中细胞类型注释的准确性、稳健性和可重复性 | 开发了首个系统性框架，可在数据集特定方式或完整分析流程背景下评估细胞类型注释的稳健性，并提供了统一的概率框架进行一致性置信度估计 | 框架主要针对单细胞RNA测序数据，未涉及其他单细胞组学技术；评估依赖于实验定义或专家标注的细胞类型标签 | 解决单细胞RNA测序中细胞类型注释的准确性和可重复性评估问题 | 单细胞RNA测序数据及其细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率框架 | 单细胞RNA测序数据 | 四个独立单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 392 | 2026-04-11 |
Systematic clustering alignment and feature characterization for single-cell omics using ACE-OF-Clust
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710668
PMID:41959377
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ACE-OF-Clust的工具，用于解决单细胞组学数据聚类分析中的对齐与特征表征问题 | 提出了一个四步工作流程，首次实现了聚类解决方案的直接比较、与注释的一致性评估，并利用特征级聚类谱来优先识别区分细胞类型的基因 | 未明确说明算法在处理超大规模数据集时的计算效率限制 | 提高单细胞聚类分析的可解释性、灵活性和鲁棒性，以研究细胞异质性和基因表达动态 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据以及多组学单细胞数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学分析 | 混合隶属度聚类模型 | 转录组数据、空间表达数据、多组学数据 | PBMC单细胞RNA测序数据和乳腺癌空间转录组数据（具体样本数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 393 | 2026-04-11 |
scDEcrypter: Uncertainty-aware differential expression analysis for viral infection in scRNA-seq
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710583
PMID:41959296
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scDEcrypter的惩罚双向混合模型，用于解决单细胞RNA测序中病毒感染的差异表达分析问题 | 利用部分感染状态标签和细胞类型等额外变量，通过数据分割避免双重利用，实现快速基于似然的推断 | NA | 改进病毒感染单细胞RNA测序中的差异表达分析 | 病毒感染的单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 惩罚双向混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 394 | 2026-04-11 |
Rejuvenation of the Aged Cerebrovascular System via Protein Corona-Guided Fusogenic Liposome Delivery
2026-Mar-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.05.709925
PMID:41959031
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研究论文 | 本文介绍了一种利用载脂蛋白E富集的蛋白冠引导的融合性脂质体递送系统，用于改善白藜芦醇向脑血管系统的靶向递送，以对抗血管衰老和认知衰退 | 开发了一种新型的ApoE功能化融合性脂质体纳米载体，它能够自发形成富含ApoE的蛋白冠，通过直接与细胞膜融合（而非内存作用）来规避溶酶体降解，并利用ApoE-LRP1通路实现高效的脑血管靶向和长程递送 | 研究主要在细胞模型和老年小鼠中进行，尚未在更大型的动物模型或人类中进行验证；长期安全性和潜在的免疫原性有待进一步评估 | 开发一种高效的纳米药物递送系统，以靶向治疗与年龄相关的脑血管功能障碍和认知衰退 | 老年小鼠的脑血管系统、人脑微血管内皮细胞 | NA | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用人脑微血管内皮细胞和C57BL/6老年小鼠进行评估 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 395 | 2026-04-11 |
TWIST1-Mediated Induction of AEBP1 in Fibroblast-Like Synoviocytes Activates Transforming Growth Factor β Signaling to Drive Angiogenesis and Promote Rheumatoid Arthritis
2026-Mar-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70124
PMID:41787682
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了在类风湿关节炎中，位于滑膜下层的POSTN+成纤维样滑膜细胞亚群通过TWIST1-AEBP1-POSTN轴驱动疾病进展的机制 | 识别了致病性POSTN+ FLS亚群，并阐明了TWIST1-AEBP1-POSTN轴在调控该亚群激活、细胞外基质重塑和血管生成中的关键作用 | 研究主要基于小鼠胶原诱导性关节炎模型，人类样本的验证可能有限，且药理抑制TWIST1的长期效果和安全性需进一步评估 | 旨在识别导致滑膜增生、ECM重塑和血管翳形成的致病性FLS亚群，阐明其分子调控机制，并探索靶向治疗策略 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织、成纤维样滑膜细胞以及胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | bulk RNA测序、蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | RNA测序数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 396 | 2026-04-11 |
Single cell and multi-omics analysis reveal senescence-related molecular subtypes and a prognostic signature in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04674-1
PMID:41770477
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中细胞衰老相关的分子亚型，并构建了一个基于衰老相关基因的预后风险评分模型 | 首次在ccRCC中系统地表征了细胞衰老特征，定义了两种基于衰老相关基因表达的分子亚型，并识别了ALDH18A1作为一个关键的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步的实验验证来阐明衰老相关基因在ccRCC中的具体分子机制 | 阐明细胞衰老在ccRCC中的特征、临床意义及预后价值 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量转录组测序 | 随机生存森林（RSF） | 转录组数据 | 多个队列总计超过700个样本（包括TCGA-KIRC 537例，E-MTAB-1980 101例，CPTAC-ccRCC 105例，以及单细胞数据集GSE222703和GSE210042） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 397 | 2026-04-11 |
Computational framework for therapeutic target discovery via perturbation simulation: application to cystic fibrosis airway disease
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag129
PMID:41883030
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研究论文 | 提出一个整合单细胞转录组学、加权基因共表达网络分析和计算扰动模拟的计算框架，用于系统发现新的治疗靶点，并以囊性纤维化气道疾病为例进行应用 | 开发了一个结合多尺度生物数据和系统级扰动模拟的新型计算框架，能够高效、系统地发现高新颖性治疗靶点 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发一个用于系统级治疗靶点发现的计算方法 | 囊性纤维化气道疾病 | 计算生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，计算扰动模拟 | 知识图谱，扰动模拟算法 | 单细胞转录组数据 | 38名患者的51,415个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 398 | 2026-04-11 |
BEASTsim-a benchmarking and analysis platform for spatial transcriptomics simulations
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag144
PMID:41947420
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研究论文 | 本文介绍了一个名为BEASTsim的综合性基准测试平台，用于评估空间转录组学模拟方法 | BEASTsim平台不仅评估模拟方法在数据属性分布和生物信号保留方面的表现，还通过相似性指标确保模拟引入有意义的生物变异，而非简单复制输入数据 | NA | 开发一个基准测试和分析平台，以标准化评估空间转录组学模拟方法，促进空间转录组学与单细胞RNA测序数据的整合 | 空间转录组学模拟方法 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 决策树 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2026-04-11 |
Therapeutic strategy for cervical gastric-type adenocarcinoma by targeting CLU to relieve CLU-associated stress and sensitize chemotherapy
2026-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbag003
PMID:41878236
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研究论文 | 本研究探索了宫颈胃型腺癌的致癌机制，并验证了靶向CLU联合化疗的治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了CLU相关热应激在GAS恶性微环境中的作用，并构建了GAS来源的类器官模型用于药物测试 | 样本量较小（单细胞测序仅5例样本），且类器官模型仍需进一步验证其临床相关性 | 探索宫颈胃型腺癌的致癌机制并寻找有效治疗靶点 | 宫颈非HPV相关腺癌患者组织样本及GAS来源的类器官 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，免疫组化染色 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 临床队列172例患者，单细胞测序5例，免疫组化50例，类器官实验未明确数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 400 | 2026-04-11 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
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研究论文 | 本研究开发了基于肝窦细胞特异性基因特征的生物标志物评分，用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 首次整合肝窦内皮细胞、肝星状细胞和巨噬细胞的单细胞转录组特征，构建了反映细胞去分化状态的综合评分系统 | 评分系统基于回顾性数据推导，需要在前瞻性研究中进一步验证 | 开发用于慢性肝病诊断和预后的肝窦细胞特异性生物标志物 | 慢性肝病患者 | 数字病理学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | 生物标志物评分系统 | 基因表达数据 | 内部队列108例，三个独立验证队列总计1008例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |