单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40356 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-06-09 |
Multi-omics analysis identifies a major histocompatibility complex class II-associated antigen-presenting cancer-associated fibroblast-like state linked to the nuclear factor erythroid 2-related factor 2-karyopherin subunit beta 1 axis in nonsmall cell lung cancer
2026-Jun, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.70074
PMID:42256528
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定非小细胞肺癌中与NRF2-KPNB1轴相关的MHC-II类抗原呈递癌症相关成纤维细胞状态及其免疫特性 | 首次发现非小细胞肺癌中存在一种与NRF2-KPNB1轴相关的MHC-II类抗原呈递癌症相关成纤维细胞状态，并阐明其对抗PD-1治疗反应的影响 | 未明确说明局限性 | 定义非小细胞肺癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞状态的转录特征、空间分布和免疫相关特性，并评估其与NRF2-KPNB1轴的关系 | 非小细胞肺癌患者样本中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 从非小细胞肺癌患者获取的原代癌症相关成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 382 | 2026-06-09 |
Species-specific roles of cellular communication network proteins in cartilage development: A comparative study using in vitro chondrogenic models
2026-Jun, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.70089
PMID:42256527
|
研究论文 | 通过比较鸡、小鼠和人软骨发育模型，构建以CCN蛋白为中心的调控网络，揭示其物种特异性作用 | 首次系统比较不同物种软骨发育中CCN蛋白的调控网络，发现CCN1/2为核心保守枢纽，并揭示物种特异性环境感知机制 | 未说明 | 阐明CCN蛋白在软骨发育中的物种特异性作用及其调控网络 | 鸡和小鼠胚胎肢芽微团培养、人间充质干细胞软骨分化模型 | 计算生物学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 共表达网络, 蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 转录组数据 | 鸡和小鼠胚胎肢芽微团培养样本、人间充质干细胞软骨分化样本、人iPSC软骨分化单细胞数据集 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 383 | 2026-06-09 |
Identification of diagnostic biomarkers for neonatal necrotizing enterocolitis via machine learning screening and single-cell virtual gene knockout validation
2026-Jun, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.70081
PMID:42256531
|
research paper | 通过机器学习筛选和单细胞虚拟基因敲除验证，识别新生儿坏死性小肠结肠炎的诊断生物标志物 | 整合113种机器学习算法组合筛选诊断基因，并首次使用单细胞虚拟基因敲除（scTenifoldKnk）和Geneformer组合扰动分析验证生物标志物，揭示铁死亡作为潜在病理汇聚点 | 研究主要基于公开数据集和动物模型，缺乏大规模前瞻性临床队列验证 | 识别新生儿坏死性小肠结肠炎的早期诊断生物标志物并探索其分子机制 | 新生儿坏死性小肠结肠炎患者和对照组的肠道样本、小鼠NEC模型及肠上皮细胞系 | machine learning | neonatal necrotizing enterocolitis | RNA-seq，单细胞RNA测序，qRT-PCR | RF + XGBoost | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 36例NEC患者和34例对照（公共数据集），11,308个肠道细胞（单细胞测序），以及小鼠模型和细胞系 | NA | bulk RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 384 | 2026-06-09 |
A first-in-class bifunctional antibody targeting CD20 and CD37 remodels the immune microenvironment in relapsed or refractory B-cell malignancies
2026-May-29, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01796-5
PMID:42216090
|
研究论文 | 描述了一种靶向CD20和CD37的首创双功能抗体PSB202在复发或难治性B细胞恶性肿瘤中的I期临床试验，该抗体通过重塑免疫微环境发挥抗肿瘤作用 | 首次开发靶向CD20和CD37的双功能抗体，无需T细胞参与即可耗竭恶性B细胞，可能减轻CD3相关毒性同时促进细胞毒性免疫激活 | 该研究为I期试验，样本量较小（15例患者），且未达到最大耐受剂量 | 评估双特异性抗体PSB202在复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的安全性和疗效 | 复发或难治性CD20阳性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 | 数字病理学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例经过大量预治疗的患者，中位年龄67.7岁（范围54-78岁） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 385 | 2026-06-09 |
Single-cell transcriptomics reveals glycolytic heterogeneity and identifies STC2 as a key regulator of metabolic reprogramming in osteosarcoma
2026-May-21, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05578-y
PMID:42166004
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤中糖酵解异质性并确定STC2为代谢重编程的关键调控因子 | 通过整合单细胞RNA测序与hdWGCNA，首次在单细胞水平描绘骨肉瘤的代谢图谱，并发现STC2作为糖酵解相关肿瘤进展的关键调控因子，其靶向治疗可有效逆转代谢重编程 | 文中未明确提及研究局限性 | 解析骨肉瘤中糖酵解相关的细胞亚群和调控网络，探索治疗新靶点 | 骨肉瘤细胞（包括MG-63和U2OS细胞系）以及12个骨肉瘤样本的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、大容量转录组学、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、Seahorse细胞外通量分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 12个骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 386 | 2026-06-09 |
BARseq3: a modular system for integrating spatial multi-omics and cellular barcoding in single cells
2026-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.13.724900
PMID:42182181
|
研究论文 | BARseq3是一个模块化系统，用于在单细胞中整合空间多组学和细胞条形码技术 | 提出了BARseq3模块化系统，将细胞条形码与高空间分辨率转录组和翻译组相结合，支持多种固定样本、免疫染色和物种，且易于扩展以包含其他空间检测方法 | 现有方法在支持的模式、灵活性和效率方面受限，BARseq3虽然解决了这些问题，但可能仍存在技术复杂度和可及性方面的限制 | 开发一种灵活高效的模块化系统，用于在组织单细胞中整合空间多组学与细胞条形码技术 | 单细胞和组织中的分子特征，包括转录组和翻译组 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 细胞条形码 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 387 | 2026-06-09 |
Efficacy and Safety of Tunlametinib in Adults with Inoperable Neurofibromatosis Type 1-Associated Plexiform Neurofibromas: Phase IIa Trial and Biomarker Research
2026-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3291
PMID:41671075
|
研究论文 | 一项IIa期试验评估Tunlametinib在成人不可手术的神经纤维瘤病1型相关丛状神经纤维瘤中的疗效和安全性，并探索相关生物标志物 | 首次在成人PN患者中评估MEK抑制剂Tunlametinib的疗效与安全性，并结合单细胞转录组分析揭示微环境异质性与治疗反应差异的关联 | 样本量小（仅15例），单臂开放标签设计可能引入偏倚，缺乏对照组，且单细胞分析仅基于少数患者（1例快速应答者和2例缓慢应答者） | 评估Tunlametinib对成人不可手术的丛状神经纤维瘤的疗效和安全性，并探索临床变量和单细胞转录组特征以解释应答异质性 | 成人不可手术且放射学上可测量的丛状神经纤维瘤患者 | 机器学习 | 神经纤维瘤病1型 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，单细胞转录组数据 | 15名成人患者（10男5女，中位年龄27岁），其中3例预处理活检用于单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 预处理活检标本进行单细胞RNA测序以分析肿瘤微环境 |
| 388 | 2026-06-09 |
Linking Genetic Risk to Disease-Relevant Cellular States via Metacell-Informed Modeling with ICePop
2026-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715877
PMID:41959181
|
研究论文 | 提出ICePop框架，通过元细胞分辨率整合GWAS与单细胞转录组数据，识别疾病相关细胞状态 | 首次在元细胞水平实现疾病-细胞类型关联，兼具细胞类型级方法的统计功效和单细胞级方法的异质性检测能力 | 未提及具体局限性，但可能依赖单细胞数据质量和GWAS汇总统计精度 | 开发新方法解决GWAS信号向特定细胞状态转化的挑战 | 81种人类疾病/性状与120种细胞类型 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎，自闭症谱系障碍，肺部疾病，血细胞计数相关疾病，免疫疾病 | GWAS，单细胞RNA测序 | 元细胞模型 | 基因表达数据，遗传关联数据 | Tabula Muris数据集，涵盖81种性状和120种细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 389 | 2026-06-09 |
Discovery and Evaluation of Biomarkers for Triple-Negative Breast Cancer Subtypes Uncovers Patient Stratification and Targeted Therapeutic Strategies
2026-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2758
PMID:41671401
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现基底标志物用于三阴性乳腺癌亚型分类，并鉴定达沙替尼作为潜在靶向治疗策略 | 首次利用单细胞RNA测序定义的基底身份基因对三阴性乳腺癌进行精确亚型划分，并发现TAGLN作为达沙替尼疗效的预测性生物标志物 | 未提及具体局限性 | 识别三阴性乳腺癌亚型的生物标志物，改进患者分层并发现靶向治疗方案 | 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、高通量药物筛选 | NA | 基因表达数据 | 两个独立三阴性乳腺癌队列及患者来源异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2026-06-09 |
SOCS2 inhibits neutrophil N1 polarization to attenuate cardiomyocyte PANoptosis through HSPA8 ubiquitination in atrial fibrillation
2026-May-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153941
PMID:42251819
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了SOCS2通过HSPA8泛素化抑制中性粒细胞N1极化，从而减轻房颤中心肌细胞PANoptosis的机制 | 首次阐明SOCS2通过泛素化HSPA8调控中性粒细胞N1极化，进而影响心肌细胞PANoptosis在房颤中的作用 | 未提及具体局限性 | 探究房颤中免疫细胞（特别是中性粒细胞N1极化）对心肌细胞PANoptosis的调控机制及SOCS2的作用 | 房颤患者与非房颤对照者心房组织中的免疫细胞及中性粒细胞、心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、泛素化分析 | NA | 基因表达数据 | 房颤患者与非房颤对照者心房组织（具体样本量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据库GSE224959中的单细胞RNA测序数据 |
| 391 | 2026-06-09 |
Inhibition of the p38/JNK MAPK pathway mediated by circadian rhythm genes: Study of the mechanism of Linggan Wuwei Jiangxin decoction in the treatment of COPD
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121349
PMID:41672117
|
研究论文 | 探索苓甘五味姜辛汤通过调节生物钟基因抑制p38/JNK MAPK通路治疗慢性阻塞性肺疾病的机制 | 首次整合代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序和机器学习，阐明苓甘五味姜辛汤通过生物钟基因Bmal1和Per2调控p38/JNK MAPK通路治疗COPD的新机制 | 研究主要基于大鼠模型和细胞实验，缺乏临床试验验证；具体活性成分在体内的代谢和相互作用机制尚需进一步研究 | 揭示苓甘五味姜辛汤预防和治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制 | 慢性阻塞性肺疾病大鼠模型和CS-LPS刺激的BEAS-2B细胞模型 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | UPLC-MS/MS, 代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 蛋白质印迹法, RT-PCR | WGCNA, 机器学习算法（包括三种机器学习算法） | 代谢组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 大鼠模型（数量未指定）和BEAS-2B细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 392 | 2026-06-09 |
LongAllele: a joint inference framework for allele-specific analysis on long-read bulk and single-cell RNA sequencing
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.05.722992
PMID:42146353
|
研究论文 | 提出一种联合推理框架LongAllele，用于长读长批量与单细胞RNA测序的等位基因特异性分析 | 通过期望最大化算法联合推断杂合变异、单倍型结构和读段-单倍型分配，并引入可定相感知测试避免假阳性 | 未提及具体局限性 | 开发统一的统计框架以全面解析顺式调控效应中的等位基因特异性表达 | 长读长RNA测序数据，包括GTEx多组织批量数据、外周血单核细胞单细胞数据和人海马体单细胞核数据 | 自然语言处理 | NA | 长读长RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | 多个组织（GTEx批量数据）、外周血单核细胞（单细胞）、人海马体（单细胞核） | NA | 长读长RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2026-06-09 |
CDCP1 Deletion Protects Against Pressure Overload-Induced Cardiac Dysfunction and Fibrosis in Mice
2026-May-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9236741/v1
PMID:42147194
|
研究论文 | 本研究证实CDCP1缺失可通过减少成纤维细胞活化和炎症反应来保护小鼠免受压力超负荷诱导的心脏功能障碍和纤维化 | 首次在体内验证CDCP1作为心脏纤维化关键调节因子的作用,并利用空间转录组学揭示其影响成纤维细胞亚群和心肌细胞亚群的分子机制 | 未提及作用机制的完整信号通路以及从动物到人类的转化验证 | 探究CDCP1对压力超负荷诱导的心脏纤维化及功能障碍的体内调控作用 | CDCP1基因敲除小鼠模型及人体心室成纤维细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | CDCP1基因敲除小鼠模型(部分采用血管紧张素Ⅱ/苯肾上腺素诱导),以及人体心室成纤维细胞样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 394 | 2026-06-09 |
CXCL13-CXCR5 Signaling in CD8+ T Cell Recruitment and Lymphoid Immune Organization in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722710
PMID:42146336
|
研究论文 | 探讨CXCL13-CXCR5信号轴在透明细胞肾细胞癌中调节CD8+ T细胞招募及淋巴免疫组织的作用 | 首次揭示CXCL13-CXCR5轴在ccRCC中调控CD8+ T细胞招募、分化和免疫组织形成的新机制，并提出该信号轴作为生物标志物和潜在治疗靶点 | 未明确说明，但可能包括样本量有限和仅针对非转移性高风险ccRCC | 阐明CXCL13-CXCR5信号在透明细胞肾细胞癌中CD8+ T细胞招募及免疫组织形成中的作用机制 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤组织、血浆、匹配邻近肾组织及小鼠模型 | 数字病理学 | 肾癌 | ELISA, 定量PCR, 迁移分析, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 同系小鼠模型 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、图像 | 人类ccRCC肿瘤、血浆和匹配邻近肾组织样本（具体数量未说明），同系小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 395 | 2026-06-09 |
Gene-Modulated Network Diffusion for Improved Modeling of Amyloid- β Spread in Alzheimer's Disease
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722725
PMID:42146687
|
学术论文 | 通过基因调控的网络扩散模型改善阿尔茨海默病中淀粉样蛋白-β扩散的建模 | 将空间转录组学数据（来自Allen人脑图谱）整合到扩展的网络扩散模型中，以调节蛋白质合成项的速率参数，从而反映区域遗传易感性对淀粉样蛋白-β扩散的影响 | 基线网络扩散模型在机制可解释性方面存在不足 | 改进阿尔茨海默病中淀粉样蛋白-β病理扩散的建模与预测 | 阿尔茨海默病神经影像学队列和阿尔茨海默病测序项目的外部验证队列中的受试者 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | NA | 网络扩散模型、扩展网络扩散模型 | 影像数据、基因表达数据 | 阿尔茨海默病神经影像学队列和阿尔茨海默病测序项目的外部队列 | NA | 空间转录组学 | Allen人脑图谱 | 来自艾伦人脑图谱的空间转录组学数据用于调节区域脆弱性 |
| 396 | 2026-06-09 |
Tumor glycosylation engages CD301b-mediated myeloid regulation in breast cancer
2026-May-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9347231/v1
PMID:42147159
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤糖基化通过CD301b介导的髓系调控影响乳腺癌进展的机制 | 首次鉴定了C型凝集素受体CD301b及其人类同源物CLEC10A在乳腺癌微环境中作为免疫调控因子的作用，并建立了跨物种的髓系调控程序连接 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚需扩大；具体髓系-肿瘤相互作用的分子机制仍需进一步阐明 | 探究异常肿瘤糖基化通过凝集素-糖相互作用对乳腺癌免疫微环境的影响及调控机制 | 小鼠三阴性乳腺癌模型及人类乳腺癌组织中的髓系免疫细胞 | 机器学习和转录组学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和人类乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 397 | 2026-06-09 |
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70036
PMID:41670056
|
research paper | 使用空间转录组学探索子宫颈腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌的转化 | 首次通过数字空间分析技术揭示了腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌转化过程中过渡性巢的分子特征，证实了疾病谱系的存在 | 样本量有限（仅20例，其中4例用于数字空间分析），仍需更大规模研究指导临床决策 | 阐明腺样基底细胞癌与鳞状细胞癌之间的组织形态学和分子生物学关系，以指导治疗策略 | 20例腺样基底细胞癌病例，多数伴有鳞状细胞癌、过渡性巢或高级别鳞状上皮内病变亚型 | digital pathology | 子宫颈癌 | DSP, H&E, IHC | NA | image | 20例（其中4例用于数字空间分析） | NA | spatial transcriptomics | NA | 数字空间分析（Digital Spatial Profiling） |
| 398 | 2026-06-09 |
Bispecific T-cell Engager (CD3 × EGFR)-Based Triplet Therapy Unlocks CD40/CD40L Crosstalk to Revert Immunosuppression in Third-Generation EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor-Refractory NSCLC
2026-May, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103607
PMID:41672197
|
研究论文 | 针对第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌，开发出一种基于双特异性T细胞衔接器（CD3×EGFR）的三联疗法，通过激活CD40/CD40L轴逆转免疫抑制 | 首次提出BC3448、西达本胺和WBP3425三联疗法，通过激活CD40/CD40L轴重塑肿瘤微环境，克服双特异性T细胞衔接器在免疫抑制性肿瘤中的局限性 | 未提供明确的局限性信息 | 研究第三代EGFR-TKI耐药非小细胞肺癌的免疫抑制性肿瘤微环境，并开发新型三联疗法恢复T细胞抗肿瘤活性 | 对第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌患者样本及人源化NOG-EXL小鼠模型 | 机器学习 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序、多色荧光染色、多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间表达数据 | 非小细胞肺癌患者样本及人源化NOG-EXL小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 399 | 2026-06-09 |
mosna Reveals Different Types of Cellular Interactions Predictive of Response to Immunotherapies and Survival in Cancer
2026-May, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2026.101536
PMID:41759628
|
研究论文 | mosna是一个Python包，用于分析空间组学数据并整合临床或生物学数据，揭示细胞相互作用模式，预测免疫治疗反应和癌症生存 | mosna能够整合多种算法与临床数据，兼容所有空间组学技术，提供从数据探索到机器学习模型训练的完整分析流程，并识别最具预测能力的变量 | 未明确说明 | 开发一个统一的工具，简化空间组学数据与临床数据的整合分析，以发现影响免疫治疗反应或生存的细胞相互作用模式 | 空间组学数据，包括亚细胞分辨率的转录组学（MERFISH、seqFISH、Xenium）、蛋白质组学（CODEX、MIBI-TOF、低多重免疫荧光）以及基于斑点的空间转录组学（10x Visium、Slide-seq、Stereo-seq） | 计算生物学 | 癌症 | 空间组学 | 机器学习 | 空间组学数据 | 两个空间蛋白质组学数据集、一个空间转录组学数据集（含免疫治疗二元反应或生存数据）以及一个手动注释的空间转录组学数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium 空间转录组学 |
| 400 | 2026-06-09 |
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal rAAV2- and rAAV9-specific transduction signatures in the mouse liver
2026-May, Gene therapy
IF:4.6Q2
DOI:10.1038/s41434-026-00600-w
PMID:41813829
|
研究论文 | 结合空间转录组学和单核RNA测序，揭示rAAV2和rAAV9载体在小鼠肝脏中的转导特征及性别差异 | 首次利用空间转录组学结合单核RNA测序，在空间层面系统描绘了rAAV2和rAAV9载体在雄性和雌性小鼠肝脏中的分布、转导及转录组变化，揭示了性别特异性的脂代谢、昼夜节律和免疫应激反应失调 | 作为概念验证研究，仅使用CMV-EGFP转基因载体，结果可能受限于单一报告基因和特定血清型，且未涉及不同启动子或治疗性转基因的影响 | 探究rAAV血清型、性别和肝脏分区对转导效率和转录组变化的影响 | rAAV2和rAAV9载体处理的雄性和雌性小鼠肝脏 | 空间转录组学 | 基因治疗相关肝脏疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 两种性别（雄性和雌性）、两种血清型（rAAV2和rAAV9）的小鼠肝脏样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium空间转录组学平台用于组织切片分析，10x Chromium单核RNA测序平台用于单核转录组分析 |