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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-05-29 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Early Transcriptional Heterogeneity of Cardiac-Associated Cell Populations During Zebrafish Embryogenesis
2026-May-15, Biology
DOI:10.3390/biology15100791
PMID:42187752
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示斑马鱼胚胎发生过程中心脏相关细胞群的早期转录异质性 | 首次在单细胞水平上描绘了斑马鱼早期心脏谱系特化的转录动态和时序层次，证明了心脏祖细胞的转录异质性及其通过持续调控过程获得心脏命运 | 未提及具体局限性 | 探索斑马鱼胚胎早期心脏谱系特化的单细胞转录动力学 | 斑马鱼胚胎在受精后4小时和6小时的心脏祖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类、子聚类、轨迹推断 | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎在4 hpf和6 hpf的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 382 | 2026-05-29 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomics analysis reveals cellular heterogeneity, immune microenvironment dynamics, and prognostic signatures in oral squamous cell carcinoma
2026-May-14, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100432
PMID:42140356
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研究论文 | 整合单细胞与批量转录组分析揭示口腔鳞状细胞癌的细胞异质性、免疫微环境动态变化及预后标志物 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学，系统描绘了口腔鳞状细胞癌的细胞异质性、免疫微环境动态及预后特征，并鉴定出六基因预后标志物 | 样本量相对有限，且缺乏独立验证队列 | 揭示口腔鳞状细胞癌的分子和细胞复杂性，为精准治疗策略提供依据 | 口腔鳞状细胞癌患者的组织样本，包括HPV阳性、HPV阴性、复发和非复发病例 | 机器学习和数字病理 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组分析、甲基化测序 | 降维、轨迹推断、细胞-细胞通信分析、Kaplan-Meier生存分析、GSEA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、甲基化数据 | 未明确指定，涉及HPV阳性、HPV阴性、复发和非复发口腔鳞状细胞癌病例 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium 空间转录组学平台, Illumina NovaSeq 测序系统 |
| 383 | 2026-05-29 |
Prognostic and Immunological Significance of TIPARP in Pancreatic Cancer
2026-May, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-09546-2
PMID:41284141
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研究论文 | 本文系统分析了TIPARP在胰腺癌中的预后和免疫学意义 | 首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析证实TIPARP在胰腺癌成纤维细胞中特异性表达，并与免疫抑制微环境和不良预后存在因果关联 | 研究主要依赖公共数据库分析，缺乏大规模前瞻性临床验证和体内实验证据 | 探究TIPARP在胰腺导管腺癌中的表达模式、预后价值及其免疫调控机制 | 胰腺导管腺癌患者 | 计算机视觉 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 列线图模型 | 转录组数据 | TCGA-PAAD队列178例和GTEx数据库171例正常胰腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 384 | 2026-05-29 |
High INHBB Expression Shapes an Immunosuppressive Tumor Microenvironment and Predicts Poor Prognosis in Colorectal Carcinoma
2026-May, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-09574-y
PMID:41324886
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研究论文 | 探究INHBB高表达在结直肠癌中塑造免疫抑制肿瘤微环境及预测不良预后的作用 | 首次系统阐明INHBB在结直肠癌中通过促进免疫抑制微环境（T细胞减少、巨噬细胞增多）影响患者预后，并验证其作为免疫逃逸生物标志物和治疗靶点的潜力 | 未发现INHBB为独立预后因素；基于回顾性分析，需前瞻性验证；机制研究局限于相关性分析 | 评估INHBB在结直肠癌中的临床和免疫学意义及其作为预后标志物的潜力 | 248例结直肠癌患者的肿瘤组织样本及临床病理参数 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA原位杂交（RNAscope）、免疫组化（IHC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织标本图像、基因表达数据 | 248例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 385 | 2026-05-29 |
Integrating Spatial Proteogenomics in Cancer Research
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520744
PMID:41655216
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综述 | 系统综述了空间蛋白质基因组学在癌症研究中的发展，从单模态分析到多模态整合，并介绍了关键技术和未来方向 | 首次系统整合空间蛋白质组学与转录组学、代谢组学等多模态数据，并引入深度学习和大模型（如KRONOS和HEIST）驱动的分析框架 | 空间蛋白质组学仍面临分辨率不足、标准化缺失以及数据复杂度带来的挑战 | 综述空间蛋白质基因组学在揭示肿瘤异质性和微环境动态变化中的进展，并探讨其在癌症诊断和免疫治疗中的潜力 | 空间蛋白质基因组学技术及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 空间蛋白质组学, 空间转录组学, 空间代谢组学, MALDI成像, 深度视觉蛋白质组学, 纳米液滴处理, 蛋白质形态成像质谱 | KRONOS, HEIST, 传统机器学习算法, 人工智能驱动框架 | 空间蛋白质数据, 空间转录组数据, 空间代谢组数据, 图像 | 不适用 | NA | 空间蛋白质组学, 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞测序 | NA | 空间CITE-seq, MALDI成像, 纳米液滴处理法（NanoPOTS）, 蛋白质形态成像质谱（PiMS） |
| 386 | 2026-05-29 |
SpatialESD: Spatial Ensemble Domain Detection in Spatial Transcriptomics
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520912
PMID:41677098
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研究论文 | 提出一种名为SpatialESD的空间集成域检测方法，整合不同空间域检测方法的聚类结果以提高空间转录组数据分析中域检测的准确性和鲁棒性 | 通过同时捕获聚类间的直接共现模式和多尺度间接关系，增强了空间域检测的稳健性和准确性，并优于现有集成方法EnSDD | 方法性能依赖于所选基础检测方法的质量，且在大规模数据集上的计算效率可能需要进一步优化 | 改进空间转录组学中空间域检测的准确性和稳定性，以支持下游组织结构和疾病机制解析 | 10x Visium空间转录组数据集，包括人脑、乳腺癌和卵巢癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌, 卵巢癌 | 空间转录组学 | 集成学习 | 空间基因表达数据 | 模拟数据集和多个10x Visium空间转录组数据集（人脑、乳腺癌、卵巢癌样本） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 387 | 2026-05-29 |
Single-cell insights into cisplatin resistance mechanisms in bladder cancer tumor microenvironment
2026-May, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111304
PMID:41724379
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与体外实验验证，揭示了膀胱癌中顺铂耐药性的分子机制，并表征了肿瘤微环境中的细胞异质性 | 首次从单细胞层面揭示膀胱癌顺铂耐药的细胞亚群异质性、代谢重编程特征及细胞间通讯网络，发现SPINK1通过MIF信号轴促进耐药并调控巨噬细胞耐受性的新机制 | 未提及具体局限性 | 阐明膀胱癌（BC）肿瘤微环境中顺铂耐药的分子机制及细胞异质性 | 膀胱癌细胞、成纤维细胞、免疫细胞（尤其是巨噬细胞）及顺铂敏感/耐药样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个顺铂敏感和耐药膀胱癌样本的整合单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 388 | 2026-05-29 |
Intra-Tissue Bacteriome and Cellular Profiles in Periodontal Granulation Tissue From Osseous Defects and Extraction Sockets
2026-05, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70108
PMID:41732956
|
研究论文 | 本研究分析了牙周骨缺损和拔牙窝中牙周肉芽组织的组织内菌群和细胞特征，探索其生物学本质和转化潜力 | 首次系统比较不同类型牙周肉芽组织（骨缺损处、拔牙窝、牙根表面）的菌群和细胞异质性，揭示骨缺损处肉芽组织具有促进牙周健康的特征，尤其是富含间充质干细胞 | 未来仍需转化研究以验证牙周肉芽组织作为间充质干细胞替代来源用于牙周再生的可行性 | 探究牙周肉芽组织的菌群和细胞特征，明确其生物学本质和潜在临床应用价值 | 来自49名重度牙周炎患者的牙周肉芽组织样本，包括骨缺损处组织(GT)、拔牙窝组织(ST)、拔牙根面组织(RT)及手术部位切除的牙周袋壁组织(PT) | 机器学习和生物信息学 | 牙周炎 | 16S rRNA测序、单细胞测序、组织学评估 | 伪时间轨迹分析 | 基因表达数据、组织学图像 | 49例患者 | NA | 16S rRNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 389 | 2026-04-27 |
Single-Cell Nanodroplet Processing Proteomics Pipeline for Analysis of Human-Derived Microglia
2026-05, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.70112
PMID:41742681
|
研究论文 | 提出一种基于纳升液滴处理的单细胞蛋白质组学流程，用于分析人源小胶质细胞 | 首次实现从人脑死后组织来源的小胶质细胞中进行单细胞蛋白质组学分析，无需标记，鉴定蛋白数量与单细胞RNA测序相当 | 该研究仅为初步验证，样本量有限，且未进行大规模亚型分类或疾病相关分析 | 开发一种可用于大规模蛋白质组学的小胶质细胞亚型分类方法，以研究其在神经退行性疾病中的作用 | 人脑死后皮层来源的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病、神经退行性疾病 | 单细胞质谱蛋白质组学、荧光激活细胞分选、纳升液滴处理 | NA | 蛋白质组数据 | 单个小胶质细胞，平均鉴定1039种蛋白质 | NA | 单细胞蛋白质组学 | NA | 基于荧光激活细胞分选和纳升液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学流程 |
| 390 | 2026-05-29 |
Cell-specific gene expression plasticity in response to hypoxia promotes high-altitude adaptive evolution
2026-05, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3108-3
PMID:41793589
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研究论文 | 通过绵羊高原适应实验，揭示细胞特异性基因表达可塑性如何促进高海拔适应性进化 | 首次生成重要器官在低氧适应过程中的细胞转录组图谱，并发现免疫细胞中的逆转可塑性通过自然选择促进遗传适应的新机制 | 未在摘要中明确提及，可能需要进一步验证其他物种或器官的通用性 | 探索基因表达可塑性与遗传适应在低氧环境响应中的分子和细胞机制 | 绵羊（正常氧适应、常氧转低氧、低氧适应三个群体的脑、心脏、肺组织） | 机器学习和转录组学 | 高原适应及低氧相关疾病 | 单细胞RNA测序和单核RNA测序 | NA | 单细胞和单核转录组数据 | 27只绵羊，生成27个scRNA-seq和54个snRNA-seq数据集，分析236,805个细胞和906,315个细胞核 | NA | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | NA |
| 391 | 2026-05-29 |
From Cell-Free Transcriptomes to Single-Cell Landscapes: Biomarker Discovery and Originating Cell Alteration Analysis via Graph Matrix Factorization
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.74814
PMID:41818613
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research paper | 提出CellFreeGMF工具，利用图矩阵分解从无细胞RNA转录组中识别生物标志物并分析其来源细胞的变化 | 通过图矩阵分解方法同时实现临床样本的诊断分类、cfRNA生物标志物识别及其来源细胞变化分析，并利用细胞间通讯分析探究疾病条件下来源细胞的功能变化 | 未提及具体局限性 | 整合cfRNA分析到临床工作流程和精准医学策略中，实现从大量水平到单细胞水平的生物标志物发现和来源细胞变化分析 | 无细胞RNA转录组临床数据集，特别是胰腺导管腺癌样本 | machine learning | pancreatic ductal adenocarcinoma | RNA-seq | NA | gene expression | 涉及多种无细胞RNA转录组临床数据集，具体数量未提及 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 392 | 2026-05-29 |
Cryoablation Activates the cGAS-STING-CXCL10 Axis in Macrophages to Enhance Anti-Tumor Immunity in NSCLC
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521931
PMID:41818612
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研究论文 | 低温消融通过巨噬细胞中的cGAS-STING-CXCL10轴增强非小细胞肺癌的抗肿瘤免疫 | 首次在免疫治疗时代比较低温消融与热消融的疗效，并揭示低温消融通过激活巨噬细胞cGAS-STING信号通路增加CXCL10分泌以增强全身抗肿瘤免疫的机制 | NA | 研究低温消融是否优于热消融以及相关机制，特别是在免疫治疗背景下对非小细胞肺癌的疗效 | 非小细胞肺癌患者及小鼠模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类外周血单核细胞和小鼠肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 393 | 2026-05-29 |
A Soft Matrix Microenvironment Promotes Laterally Spreading Tumors via Oxidative Phosphorylation-Dependent Cell Adhesion
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523872
PMID:41833005
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学等方法，全面剖析了侧向发育肿瘤的分子特征、细胞表型及肿瘤微环境，并提出软基质微环境通过氧化磷酸化依赖的细胞黏附促进肿瘤侧向生长的机制模型 | 首次揭示侧向发育肿瘤在软基质微环境中通过氧化磷酸化调控细胞黏附、促进侧向生长的机制，并发现ENTPD1-ADORA2B信号轴的关键作用 | 对调控机制的体内验证及临床转化应用尚未充分展开 | 探究侧向发育肿瘤与常规隆起性腺瘤在分子机制上的差异，揭示其侧向生长的调控机制 | 侧向发育肿瘤、常规隆起性腺瘤及相邻正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 包含临床标本及患者来源的类器官模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, 空间转录组学可能使用10x Visium平台 |
| 394 | 2026-05-29 |
Size-Modulated Mesoderm-Endoderm Divergence and Myocardial Cavitation in Micropatterned Cardioids
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515661
PMID:41837870
|
研究论文 | 本研究利用微图案化心肌类器官、CRISPR工程报告hiPSC、深层组织成像和单细胞RNA测序，探索中胚层与内胚层的协同发育机制 | 首次整合微图案化心肌类器官与单细胞RNA测序，揭示中胚层与内胚层共发育中的配体-受体信号交互，并发现微图案尺寸可调控细胞组成和心肌腔化 | 未明确提及局限性，但可能包括类器官模型与体内发育的差异、仅使用单一尺寸微图案等假设 | 研究微图案化心肌类器官中中胚层与内胚层的协同发育及信号串扰 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）来源的微图案化心肌类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR基因编辑、深层组织成像、PHATE轨迹映射 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量，但涉及多种微图案尺寸的类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 395 | 2026-05-29 |
PRAMEL12 orchestrates spermiogenesis to ensure male fertility in mice
2026-May, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111392
PMID:41866036
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研究论文 | 揭示PRAMEL12在小鼠精子发生中起关键调控作用，其缺失导致组蛋白-鱼精蛋白转换缺陷及雄性不育 | 首次证明PRAMEL12是精子形成过程中组蛋白-鱼精蛋白转换的关键调控因子，发现其缺失导致多种组蛋白修饰异常和核心组蛋白异常保留 | 未涉及 | 阐明PRAMEL12在精子形成和雄性生育中的具体功能 | PRAMEL12基因敲除小鼠及其精子细胞 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、组织化学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、组织学图像 | PRAMEL12基因敲除小鼠（具体数量未描述） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 396 | 2026-05-29 |
Unannotated noncoding transcripts as a source of intratumor heterogeneity in malignant cell states
2026-05, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3273-6
PMID:41870780
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研究论文 | 通过分析覆盖12种常见癌症类型的3'端标签单细胞RNA测序数据，发现未注释的非编码转录本在恶性细胞状态中表达异质性，并证实其可促进肺癌细胞增殖和迁移 | 揭示了未注释非编码转录本作为肿瘤内异质性来源的新机制，通过整合多组学数据表征其表达模式和表观遗传景观 | 仅依赖3'端标签单细胞RNA测序数据，可能遗漏部分转录本信息；功能验证仅限于肺癌细胞系 | 探究未注释非编码转录本在恶性肿瘤细胞状态异质性中的作用 | 12种常见癌症类型的肿瘤样本及肺癌细胞系 | 单细胞测序 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、多区域批量RNA测序、表观遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、多组学数据 | 覆盖12种癌症类型的3'端标签单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于3'端标签的单细胞RNA测序技术 |
| 397 | 2026-05-29 |
Feature-preserving manifold approximation and projection to analyze single-cell data
2026-May, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-026-00970-6
PMID:41998372
|
研究论文 | 介绍FeatureMAP，一种通过成对切空间嵌入增强流形学习的方法，用于单细胞数据可视化与分析 | 提出FeatureMAP框架，整合UMAP与主成分分析，在保留聚类结构的同时保持特征变化，并引入基因贡献、基因变异轨迹及核心与过渡状态三个新概念 | 未提及具体限制 | 改进单细胞数据可视化与分析，保留基因级信息以支持细胞异质性和动态研究 | 单细胞RNA测序数据，包括胰腺发育和T细胞耗竭数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP, 主成分分析 | 单细胞基因表达数据 | 使用合成和真实单细胞RNA测序数据集，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 398 | 2026-05-29 |
HELIX: a scalable model for predicting context-dependent regulation of RNA splicing and isoform usage
2026-May, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-026-00988-w
PMID:42156927
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研究论文 | 提出HELIX分层深度学习框架，整合前体mRNA序列和RNA结合蛋白表达谱，预测组织与条件特异性剪接模式及转录本异构体使用 | 首次结合短读长和长读长RNA测序数据进行训练，实现同时预测差异性剪接事件、高调控剪接位点剪接强度及异构体使用，并通过迁移学习适配单细胞RNA测序数据预测细胞类型特异性异构体 | 未提及具体限制 | 预测上下文依赖性RNA剪接与异构体使用 | 前体mRNA序列、RNA结合蛋白表达、剪接模式、转录本异构体 | 机器学习 | 结肠癌 | RNA-seq | 分层深度学习 | 序列与表达数据 | 结肠癌队列样本 | NA | 短读长RNA-seq, 长读长RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2026-05-29 |
Sphingomonas paucimobilis-Driven Epithelial-Endothelial Transition in Adenomyosis Pathogenesis
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516652
PMID:41861114
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鞘氨醇单胞菌通过上皮-内皮转化促进子宫腺肌症发病机制 | 首次发现微生物（鞘氨醇单胞菌）驱动上皮-内皮转化作为子宫腺肌症的关键病理机制，并阐明了TNFα→NF-κB→MMP信号级联 | NA | 探究子宫腺肌症的病理机制，特别是微生物驱动的细胞转化机制 | 子宫腺肌症组织、小鼠模型、细胞培养 | 单细胞测序 | 子宫腺肌症 | 单细胞RNA测序、2bRAD-M、Western blot、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 400 | 2026-05-29 |
Single-Cell Computational Frameworks for Quantifying BET Bromodomain Inhibitor Resistance and Screening Re-Sensitizer Drugs in Triple-Negative Breast Cancer
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513246
PMID:41933924
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据，开发了量化BET溴结构域抑制剂耐药性和筛选再敏化药物的计算框架 | 首次提出两个基于单细胞分辨率的计算框架FR20和D-FR20，分别用于量化BET溴结构域抑制剂耐药性和筛选再敏化药物，并揭示了铁死亡在耐药性演化中的作用 | 未在更大规模临床样本中验证框架的普适性，且依赖于scRNA-seq数据的可用性 | 量化三阴性乳腺癌中BET溴结构域抑制剂的耐药性并筛选再敏化药物 | 三阴性乳腺癌细胞及其对BET溴结构域抑制剂的耐药性 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 九个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |