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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-11-04 |
Ex vivo lung-organoid model for aberrant basaloid cell induction and activation
2025-Oct-30, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00396-z
PMID:41168897
|
研究论文 | 本研究开发了一种离体小鼠肺类器官模型,用于诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞 | 开发了首个能够诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞的离体肺类器官模型,并识别出两种不同的ABC亚群 | 研究基于小鼠模型,与人类疾病可能存在差异;模型验证仍需进一步临床相关性研究 | 研究肺纤维化中异常基底样细胞的诱导机制和功能 | 小鼠肺类器官和异常基底样细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,细胞-细胞相互作用分析 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 382 | 2025-11-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals beneficial mechanisms of Exendin-4 in autoimmune uveitis
2025-Oct-30, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117483
PMID:41173056
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的有益作用机制 | 首次探索Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的作用,并发现其通过PIM1-AKT-FOXO1通路调节Teff/Treg细胞平衡的新机制 | NA | 研究Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗作用及其分子机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)模型和Vogt-Koyanagi-Harada病(VKH)患者 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 383 | 2025-11-04 |
Deciphering the role of RGS1-overexpressing CD8+T cells in immune evasion of bone metastatic cancer in the urinary system via single-cell sequencing analysis
2025-Oct-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152893
PMID:41176933
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示RGS1过表达的CD8+T细胞在泌尿系统骨转移癌免疫逃逸中的作用机制 | 首次阐明RGS1在骨转移癌免疫微环境中对CD8+T细胞功能的调控作用,并建立了前列腺癌骨转移小鼠模型进行验证 | 样本量相对有限(8例肾细胞癌和9例前列腺癌患者),需要更大规模研究验证 | 阐明RGS1在肿瘤骨转移免疫微环境中的调控作用及CD8+T细胞功能 | 肾细胞癌和前列腺癌患者的骨转移病灶组织及小鼠前列腺癌骨转移模型 | 单细胞测序分析 | 肾细胞癌,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠骨转移模型 | 单细胞RNA测序数据 | 8例肾细胞癌患者和9例前列腺癌患者的骨转移病灶,共215,864个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 384 | 2025-11-04 |
Next generation DNA sequencing data analysis and its application in clinical genomics
2025-Oct-30, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156280
PMID:41177096
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综述 | 本文综述了新一代测序技术在临床基因组学中的应用及其数据分析方法 | 全面探讨了NGS在临床基因组学中的多领域应用,并强调了云计算平台和多组学数据整合的未来发展方向 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据或具体案例研究 | 探讨新一代测序数据分析方法及其在临床基因组学中的应用价值 | 新一代测序技术及其在癌症研究、罕见病诊断和个性化医疗中的应用 | 生物信息学 | 癌症、罕见病 | NGS, 单细胞测序 | NA | DNA测序数据, RNA测序数据 | NA | NA | 新一代测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 385 | 2025-11-04 |
Advancements in Personalized Medicine for Leukemia: Integrating Genetic, Transcriptomic, and Artificial Intelligence Insights
2025-Oct-29, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
综述 | 探讨遗传学、转录组学和人工智能在白血病精准医疗中的整合应用与进展 | 整合多组学数据与人工智能算法推动白血病个性化治疗策略的优化 | 存在克隆进化、遗传异质性和治疗耐药性等挑战 | 推进白血病精准医疗发展 | 白血病患者 | 自然语言处理 | 白血病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 386 | 2025-11-04 |
Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation
2025-Oct-28, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202561
PMID:41147439
|
研究论文 | 评估II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后伤口修复的影响 | 首次通过临床试验和动物实验证实II型5α-还原酶抑制剂能促进TURP术后伤口修复,并揭示其通过减轻纤维化和炎症的作用机制 | 样本量相对有限(87例患者,12只比格犬),随访时间较短(6个月) | 研究II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后伤口修复的影响 | BPH患者和比格犬动物模型 | 医学研究 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验,组织学分析 | NA | 临床数据,分子标记数据,组织学数据 | 87例BPH患者(47例治疗组,42例安慰剂组),12只比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2025-11-04 |
Temporal Clonal Tracing Reveals Tumor-Intrinsic IFNγ-Dependencies Driving Niche Adaptation and Early Metastatic Colonization
2025-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.669778
PMID:40832237
|
研究论文 | 通过单细胞条形码和转录组分析揭示肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态及IFNγ信号的关键作用 | 开发MetTag单细胞追踪技术,首次发现早期播散克隆具有IFNγ依赖的转移适应机制 | 研究主要聚焦腹膜转移模型,其他转移器官的普适性需进一步验证 | 解析肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态和分子决定因素 | 播散性肿瘤细胞(DTCs)和转移微环境 | 单细胞组学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9筛选,RNA速度分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 腹水和转移灶组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 388 | 2025-11-04 |
Isolation of mitochondrial mutation-specific T cell receptors
2025-Oct-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf139
PMID:40587813
|
研究论文 | 本研究首次成功分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性T细胞受体 | 首次报道从健康供体中分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性TCRs,证明了线粒体突变也能产生可被T细胞识别的新抗原 | 研究中存在一些生物学障碍需要考虑,且仅针对HLA-A*0201等位基因进行了筛选 | 探索肿瘤线粒体DNA突变是否能够产生被T细胞受体识别的新抗原 | 肿瘤线粒体DNA非同义突变及其对应的T细胞受体 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞测序,表位预测算法,TCR筛选验证 | NA | 基因组数据,蛋白质序列数据 | 10名HLA-A*0201纯合子健康供体,38种肿瘤类型的3,798个非同义单核苷酸突变 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 389 | 2025-11-04 |
Single-Cell Transcriptomics Shows Cellular Heterogeneity, Intercellular Communication, and Extracellular Matrix Remodeling in Corneal Fibrosis In Vivo
2025-Oct-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.13.48
PMID:41147949
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示兔角膜纤维化过程中细胞异质性、细胞间通讯和细胞外基质重塑的动态变化 | 首次在体内建立角膜纤维化的整合转录组框架,识别四种基质细胞亚群及其双向分化轨迹 | 研究仅使用新西兰白兔模型,未验证人类样本 | 表征角膜纤维化过程中的细胞异质性和细胞外基质重塑机制 | 新西兰白兔的正常和碱损伤纤维化角膜 | 单细胞组学 | 角膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类、轨迹推断、CellChat分析 | 单细胞转录组数据 | 新西兰白兔角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2025-11-04 |
Integration of phospho-signaling and transcriptomics in single cells reveals distinct Th17 cell fates
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116006
PMID:40674215
|
研究论文 | 开发了一种名为Vivo-seq的创新平台,可在单细胞水平同时捕获转录组和磷酸化信号状态 | 开发了Vivo-seq平台,首次实现单细胞水平转录组与磷酸化信号状态的同步捕获 | NA | 研究Th17细胞分化过程中的信号转导和功能可塑性机制 | T辅助17细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞内转录组和表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据,磷酸化信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | Vivo-seq | 使用低共熔溶剂固定细胞的单细胞转录组和表位索引测序平台 |
| 391 | 2025-11-04 |
Atlas-scale metabolic activities inferred from single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.09.653038
PMID:40463045
|
研究论文 | 开发了一个名为scCellFie的计算框架,用于从单细胞和空间转录组数据推断代谢活动 | 提出了首个能够从转录组数据系统推断代谢活动的计算框架,并应用于约3000万个细胞图谱分析 | 基于转录组数据间接推断代谢活动,而非直接测量代谢物 | 开发计算工具从转录组数据推断细胞代谢功能 | 人类和小鼠的单细胞及空间转录组数据 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症,子宫内膜癌 | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | 计算框架 | 转录组数据 | 约3000万个细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 392 | 2025-11-04 |
A 3D Self-Assembly Platform Integrating Decellularized Matrix Recapitulates In Vivo Tumor Phenotypes and Heterogeneity
2025-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1954
PMID:39888317
|
研究论文 | 开发了一种无水凝胶自组装平台MatriSpheres,用于建立富含细胞外基质的3D肿瘤模型 | 使用脱细胞小肠粘膜下层ECM构建水凝胶自由的3D自组装平台,能够更好地模拟体内肿瘤表型和异质性 | NA | 研究肿瘤微环境中细胞外基质对肿瘤生物学的影响 | 小鼠和人类结直肠癌细胞 | 组织工程 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 3D细胞培养模型 | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2025-11-04 |
Spatial Transcriptomics of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Reveals Divergent Indolent and Malignant States
2025-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1529
PMID:39969959
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析导管内乳头状黏液性肿瘤,揭示了惰性和恶性状态的不同转录组特征 | 首次在IPMN中发现三种不同的上皮转录组状态,并将其与胰腺导管腺癌的分子亚型相关联 | 样本量较小(10个标本),需要更大规模研究验证 | 探索IPMN的转录组特征以改进风险分层 | 导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)标本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 数字空间RNA分析(DSP-RNA), 全转录组分析 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | 10个IPMN标本 | NA | 空间转录组学 | NA | 数字空间RNA分析(DSP-RNA) |
| 394 | 2025-11-04 |
Immune checkpoint TIM-3 regulates microglia and Alzheimer's disease
2025-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08852-z
PMID:40205047
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研究论文 | 本研究揭示了免疫检查点分子TIM-3通过TGFβ信号通路维持小胶质细胞稳态,并探索其在阿尔茨海默病中的治疗潜力 | 首次发现TIM-3通过其羧基末端与SMAD2和TGFBR2相互作用,增强TGFβ信号传导,从而维持小胶质细胞稳态 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究TIM-3在小胶质细胞中的具体功能及其在阿尔茨海默病中的作用机制 | 小鼠小胶质细胞和5×FAD转基因阿尔茨海默病模型小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单核RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 395 | 2025-11-04 |
Construction of a prognostic prediction model for concurrent radiotherapy in cervical cancer using GEO and TCGA databases with preliminary validation analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334281
PMID:41171827
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研究论文 | 利用GEO和TCGA数据库构建宫颈癌同步放疗预后预测模型并进行初步验证分析 | 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别出MPP5、SNX7、LSM12和GALNT3四个与放疗敏感性相关的关键基因并构建预后预测模型 | 研究样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究进一步验证模型的临床适用性 | 开发宫颈癌同步放疗的预后预测模型,识别可靠的预后标志物 | 宫颈癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | Cox回归模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 144例宫颈癌样本(来自TCGA数据库)和两个GEO数据集(GSE236738和GSE56363) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 396 | 2025-11-04 |
In-Silico discovery of Pediatric Acute-Myeloid-Leukemia (pAML) causing druggable molecular signatures highlighting their pathogenetic processes and therapeutic agents through single-cell RNA-Seq profile analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335410
PMID:41171828
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现儿童急性髓系白血病的可靶向分子特征及其治疗药物 | 首次通过整合单细胞RNA测序数据识别pAML关键细胞类型和核心基因,并系统筛选潜在治疗药物 | 研究基于计算模拟和体外数据分析,需要进一步实验验证 | 发现儿童急性髓系白血病的致病分子特征和替代治疗药物 | 儿童急性髓系白血病患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | PPI网络分析,调控网络分析,GSEA分析 | 单细胞RNA测序数据 | 两个数据集(GSE154109和GSE235923) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 397 | 2025-11-03 |
Bioinformatics Analysis of Transcriptomic Data (Bulk and scRNA-Seq) for Immuno-Oncology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4734-9_18
PMID:41028272
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综述 | 本章提供了免疫学研究中使用生物信息学工具分析转录组数据的全面指南 | 系统整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序在免疫肿瘤学中的生物信息学分析方法 | NA | 促进免疫学数据分析和解读,帮助理解免疫反应机制 | 免疫系统动态、免疫细胞异质性、基因表达模式、免疫受体库 | 生物信息学 | 肿瘤 | 下一代测序(NGS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 398 | 2025-11-03 |
Differentiation Trajectory of Virus-Induced Tumour Cells in Rice Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70267
PMID:40693410
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示水稻中病毒诱导肿瘤细胞的分化轨迹 | 首次构建水稻病毒感染的细胞类型特异性图谱,揭示水稻黑条矮缩病毒诱导肿瘤细胞从维管薄壁细胞分化的过程 | 仅针对水稻黑条矮缩病毒,未涵盖其他植物病毒 | 研究植物病毒感染引起的宿主细胞异常分化和发育机制 | 水稻叶片鞘细胞 | 植物病理学 | 植物病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 106,973个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 399 | 2025-11-03 |
Ki-67 in meningioma: distribution and implications
2025-Nov-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2025.4.JNS25438
PMID:40712166
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术解析脑膜瘤中Ki-67表达的细胞来源与分布特征及其临床意义 | 首次在单细胞水平揭示脑膜瘤中Ki-67表达的多细胞来源特征,发现不同WHO分级中Ki-67+细胞组成差异 | 样本量相对有限(32例单细胞分析),需要更大规模研究验证 | 解析脑膜瘤微环境中Ki-67表达的细胞来源、分布特征及其临床基因组学关联 | 脑膜瘤组织样本 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞质谱流式, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞数据, 基因组数据, 临床数据 | 32例脑膜瘤(单细胞分析), 448例脑膜瘤(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | CyTOF | 质谱流式细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序技术 |
| 400 | 2025-11-03 |
Use of integrated spatial transcriptomics and histopathological analysis in adamantinomatous craniopharyngiomas to identify stromal cells as a new cellular source of leukemia inhibitory factor
2025-Nov-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2025.4.JNS243146
PMID:40749237
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和组织病理学分析,鉴定牙釉质瘤型颅咽管瘤中基质细胞是白血病抑制因子的新细胞来源 | 首次确认牙釉质瘤型颅咽管瘤中LIF主要来源于肿瘤微环境基质细胞,发现基质细胞是LIF产生的新细胞来源 | 样本量相对有限(39例),需要进一步验证LIF/LIFR信号通路在肿瘤进展中的具体机制 | 研究牙釉质瘤型颅咽管瘤中LIF的空间分布、细胞来源及其生物学功能 | 39例牙釉质瘤型颅咽管瘤患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 免疫荧光分析 | NA | 转录组数据, 图像数据, 临床数据 | 39例ACP肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |