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当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 381 - 400 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-06-09
LongAllele: a joint inference framework for allele-specific analysis on long-read bulk and single-cell RNA sequencing
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种联合推理框架LongAllele,用于长读长批量与单细胞RNA测序的等位基因特异性分析 通过期望最大化算法联合推断杂合变异、单倍型结构和读段-单倍型分配,并引入可定相感知测试避免假阳性 未提及具体局限性 开发统一的统计框架以全面解析顺式调控效应中的等位基因特异性表达 长读长RNA测序数据,包括GTEx多组织批量数据、外周血单核细胞单细胞数据和人海马体单细胞核数据 自然语言处理 NA 长读长RNA测序 期望最大化算法 RNA测序数据 多个组织(GTEx批量数据)、外周血单核细胞(单细胞)、人海马体(单细胞核) NA 长读长RNA-seq NA NA
382 2026-06-09
CDCP1 Deletion Protects Against Pressure Overload-Induced Cardiac Dysfunction and Fibrosis in Mice
2026-May-08, Research square
研究论文 本研究证实CDCP1缺失可通过减少成纤维细胞活化和炎症反应来保护小鼠免受压力超负荷诱导的心脏功能障碍和纤维化 首次在体内验证CDCP1作为心脏纤维化关键调节因子的作用,并利用空间转录组学揭示其影响成纤维细胞亚群和心肌细胞亚群的分子机制 未提及作用机制的完整信号通路以及从动物到人类的转化验证 探究CDCP1对压力超负荷诱导的心脏纤维化及功能障碍的体内调控作用 CDCP1基因敲除小鼠模型及人体心室成纤维细胞 机器学习 心血管疾病 空间转录组学 NA 转录组数据 CDCP1基因敲除小鼠模型(部分采用血管紧张素Ⅱ/苯肾上腺素诱导),以及人体心室成纤维细胞样本 NA 空间转录组学 NA NA
383 2026-06-09
CXCL13-CXCR5 Signaling in CD8+ T Cell Recruitment and Lymphoid Immune Organization in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 探讨CXCL13-CXCR5信号轴在透明细胞肾细胞癌中调节CD8+ T细胞招募及淋巴免疫组织的作用 首次揭示CXCL13-CXCR5轴在ccRCC中调控CD8+ T细胞招募、分化和免疫组织形成的新机制,并提出该信号轴作为生物标志物和潜在治疗靶点 未明确说明,但可能包括样本量有限和仅针对非转移性高风险ccRCC 阐明CXCL13-CXCR5信号在透明细胞肾细胞癌中CD8+ T细胞招募及免疫组织形成中的作用机制 透明细胞肾细胞癌肿瘤组织、血浆、匹配邻近肾组织及小鼠模型 数字病理学 肾癌 ELISA, 定量PCR, 迁移分析, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 同系小鼠模型 NA 基因表达数据、空间转录组数据、图像 人类ccRCC肿瘤、血浆和匹配邻近肾组织样本(具体数量未说明),同系小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学
384 2026-06-09
Gene-Modulated Network Diffusion for Improved Modeling of Amyloid- β Spread in Alzheimer's Disease
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
学术论文 通过基因调控的网络扩散模型改善阿尔茨海默病中淀粉样蛋白-β扩散的建模 将空间转录组学数据(来自Allen人脑图谱)整合到扩展的网络扩散模型中,以调节蛋白质合成项的速率参数,从而反映区域遗传易感性对淀粉样蛋白-β扩散的影响 基线网络扩散模型在机制可解释性方面存在不足 改进阿尔茨海默病中淀粉样蛋白-β病理扩散的建模与预测 阿尔茨海默病神经影像学队列和阿尔茨海默病测序项目的外部验证队列中的受试者 机器学习 阿尔茨海默病 NA 网络扩散模型、扩展网络扩散模型 影像数据、基因表达数据 阿尔茨海默病神经影像学队列和阿尔茨海默病测序项目的外部队列 NA 空间转录组学 Allen人脑图谱 来自艾伦人脑图谱的空间转录组学数据用于调节区域脆弱性
385 2026-06-09
Tumor glycosylation engages CD301b-mediated myeloid regulation in breast cancer
2026-May-05, Research square
研究论文 本研究揭示了肿瘤糖基化通过CD301b介导的髓系调控影响乳腺癌进展的机制 首次鉴定了C型凝集素受体CD301b及其人类同源物CLEC10A在乳腺癌微环境中作为免疫调控因子的作用,并建立了跨物种的髓系调控程序连接 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需扩大;具体髓系-肿瘤相互作用的分子机制仍需进一步阐明 探究异常肿瘤糖基化通过凝集素-糖相互作用对乳腺癌免疫微环境的影响及调控机制 小鼠三阴性乳腺癌模型及人类乳腺癌组织中的髓系免疫细胞 机器学习和转录组学 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 小鼠模型和人类乳腺癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
386 2026-06-09
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-May, The Journal of pathology IF:5.6Q1
research paper 使用空间转录组学探索子宫颈腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌的转化 首次通过数字空间分析技术揭示了腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌转化过程中过渡性巢的分子特征,证实了疾病谱系的存在 样本量有限(仅20例,其中4例用于数字空间分析),仍需更大规模研究指导临床决策 阐明腺样基底细胞癌与鳞状细胞癌之间的组织形态学和分子生物学关系,以指导治疗策略 20例腺样基底细胞癌病例,多数伴有鳞状细胞癌、过渡性巢或高级别鳞状上皮内病变亚型 digital pathology 子宫颈癌 DSP, H&E, IHC NA image 20例(其中4例用于数字空间分析) NA spatial transcriptomics NA 数字空间分析(Digital Spatial Profiling)
387 2026-06-09
Bispecific T-cell Engager (CD3 × EGFR)-Based Triplet Therapy Unlocks CD40/CD40L Crosstalk to Revert Immunosuppression in Third-Generation EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor-Refractory NSCLC
2026-May, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 针对第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌,开发出一种基于双特异性T细胞衔接器(CD3×EGFR)的三联疗法,通过激活CD40/CD40L轴逆转免疫抑制 首次提出BC3448、西达本胺和WBP3425三联疗法,通过激活CD40/CD40L轴重塑肿瘤微环境,克服双特异性T细胞衔接器在免疫抑制性肿瘤中的局限性 未提供明确的局限性信息 研究第三代EGFR-TKI耐药非小细胞肺癌的免疫抑制性肿瘤微环境,并开发新型三联疗法恢复T细胞抗肿瘤活性 对第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌患者样本及人源化NOG-EXL小鼠模型 机器学习 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序、多色荧光染色、多组学分析 NA 单细胞RNA测序数据、空间表达数据 非小细胞肺癌患者样本及人源化NOG-EXL小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
388 2026-06-09
mosna Reveals Different Types of Cellular Interactions Predictive of Response to Immunotherapies and Survival in Cancer
2026-May, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 mosna是一个Python包,用于分析空间组学数据并整合临床或生物学数据,揭示细胞相互作用模式,预测免疫治疗反应和癌症生存 mosna能够整合多种算法与临床数据,兼容所有空间组学技术,提供从数据探索到机器学习模型训练的完整分析流程,并识别最具预测能力的变量 未明确说明 开发一个统一的工具,简化空间组学数据与临床数据的整合分析,以发现影响免疫治疗反应或生存的细胞相互作用模式 空间组学数据,包括亚细胞分辨率的转录组学(MERFISH、seqFISH、Xenium)、蛋白质组学(CODEX、MIBI-TOF、低多重免疫荧光)以及基于斑点的空间转录组学(10x Visium、Slide-seq、Stereo-seq) 计算生物学 癌症 空间组学 机器学习 空间组学数据 两个空间蛋白质组学数据集、一个空间转录组学数据集(含免疫治疗二元反应或生存数据)以及一个手动注释的空间转录组学数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium 空间转录组学
389 2026-06-09
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal rAAV2- and rAAV9-specific transduction signatures in the mouse liver
2026-May, Gene therapy IF:4.6Q2
研究论文 结合空间转录组学和单核RNA测序,揭示rAAV2和rAAV9载体在小鼠肝脏中的转导特征及性别差异 首次利用空间转录组学结合单核RNA测序,在空间层面系统描绘了rAAV2和rAAV9载体在雄性和雌性小鼠肝脏中的分布、转导及转录组变化,揭示了性别特异性的脂代谢、昼夜节律和免疫应激反应失调 作为概念验证研究,仅使用CMV-EGFP转基因载体,结果可能受限于单一报告基因和特定血清型,且未涉及不同启动子或治疗性转基因的影响 探究rAAV血清型、性别和肝脏分区对转导效率和转录组变化的影响 rAAV2和rAAV9载体处理的雄性和雌性小鼠肝脏 空间转录组学 基因治疗相关肝脏疾病 空间转录组学, 单核RNA测序 NA 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 两种性别(雄性和雌性)、两种血清型(rAAV2和rAAV9)的小鼠肝脏样本 10x Genomics 空间转录组学, 单核RNA测序 10x Visium, 10x Chromium 10x Visium空间转录组学平台用于组织切片分析,10x Chromium单核RNA测序平台用于单核转录组分析
390 2026-06-09
Tumor Matrix Proteoglycan Accumulation and Processing Alter T-cell Effector Function and the Response to Immunotherapy in Patients with Oligometastatic Colorectal Cancer
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
research paper 研究肿瘤基质蛋白聚糖Versican(VCAN)在寡转移结直肠癌患者中如何影响T细胞效应功能及免疫治疗反应 首次在临床试验中评估VCAN蛋白聚糖及其裂解产物versikine对免疫监视和免疫治疗反应的影响,发现VCAN积累与蛋白水解表型(VPP)与循环CD8+ T细胞效应功能和临床结局改善相关 样本量较小(15名患者)的I期临床试验,且未详述机制验证步骤 评估VCAN对结直肠癌免疫监视和免疫治疗反应的影响 寡转移结直肠癌患者的T细胞功能和临床结局 机器学习 结直肠癌 RNA-seq NA 测序数据 243名结直肠癌患者(组织样本)及15名寡转移结直肠癌患者(临床试验) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序用于分析循环免疫表型
391 2026-06-09
Bibliometric analysis of single-cell RNA sequencing in tumor microenvironment
2026-Apr-24, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
392 2026-06-09
Intraovarian injection of securinine stimulates the growth of small ovarian follicles by reducing stromal suppression
2026-Apr-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究发现神经药物securinine通过卵巢内注射可刺激小卵泡生长,改善小鼠和食蟹猴的卵巢功能及生育能力 首次发现神经药物securinine可被重新用于促进卵泡生长,通过单细胞RNA测序揭示其通过缓解基质细胞外基质对颗粒细胞的负调控来发挥作用,并在非人灵长类中验证效果 未提及 探索securinine作为卵巢内注射候选药物治疗早发性卵巢功能不全或卵巢储备功能减退女性的不孕症 老年小鼠和老年食蟹猴的卵巢及卵泡 机器学习 不孕症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠卵巢样本和食蟹猴卵巢样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
393 2026-06-09
Comprehensive guide for optimizing octopus immune cell preparation to enhance single cell RNA sequencing success
2026-Apr-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出一种优化章鱼免疫细胞制备方案以增强单细胞RNA测序成功率的综合指南 首次建立适用于章鱼免疫细胞的单细胞RNA测序方法学框架,解决了血细胞聚集和高盐度化学限制的难题 未提供关于测序深度和细胞类型确认的详细信息 优化章鱼免疫细胞分离方案,实现单细胞RNA测序在非模型海洋物种中的应用 普通章鱼(Octopus vulgaris)的循环血细胞和白体驻留血细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未指定具体数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 使用低EDTA的MAS培养基兼容10x Genomics化学试剂进行GEM生成、逆转录和cDNA文库构建
394 2026-06-09
Identification of stem cell marker-positive subpopulations in the vocal fold of the larynx through transcriptomic analyses
2026-Apr-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过转录组分析鉴定喉部声带中干细胞标志物阳性亚群 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术鉴定小鼠声带中的SOX9阳性基底细胞亚群和Lgr5阳性细胞亚群,并成功生成了喉部上皮类器官作为体外模型 研究仅限于小鼠模型,需要进一步验证人类喉部中的相应细胞亚群 探索喉部组织稳态维持机制,鉴定喉部组织干细胞 小鼠喉部黏膜 机器学习 其他疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 类器官培养 NA 基因表达数据 小鼠喉部黏膜样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'试剂盒,10x Visium空间转录组学通过光隔离化学
395 2026-06-09
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 通过多组学分析揭示苯并[a]芘毒性网络在头颈鳞癌中的作用,并确定SERPINE1和STK3为预后生物标志物和治疗靶点 系统整合苯并[a]芘毒性靶点与细胞程序性死亡机制,利用空间转录组学和单细胞测序解析细胞特异性表达模式,并通过分子对接和动力学模拟验证毒物-蛋白相互作用 未提及 阐明苯并[a]芘诱导头颈鳞癌毒性的分子网络,并鉴定预后生物标志物和治疗靶点 苯并[a]芘毒性网络、头颈鳞癌中的细胞程序性死亡机制 机器学习 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 随机森林、支持向量机 转录组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
396 2026-06-09
Targeting HSPB1 inhibits tumor growth and abrogates Treg-mediated tumor immunosuppression
2026-Apr-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该论文通过整合单细胞RNA测序、TCGA WGCNA和空间转录组学,发现HSPB1是调控结直肠癌中Treg/CD8+ T细胞比例的关键分子,靶向HSPB1可抑制肿瘤生长并解除Treg介导的免疫抑制 首次揭示HSPB1作为结直肠癌内Treg/CD8+ T细胞比例的决定因子,并阐明其通过CCL20-CCR6轴招募Treg的机制,提出靶向HSPB1的双重抗肿瘤作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在临床样本中验证HSPB1抑制剂的疗效和安全性 探索结直肠癌中免疫检查点阻断疗法效果不佳的分子机制,寻找调控肿瘤免疫抑制平衡的关键靶点 结直肠癌肿瘤微环境中的Treg和CD8+ T细胞,以及HSPB1基因 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,流式细胞术,CRISPR-Cas9,RNA-seq NA 基因表达数据,图像 MC38和SW480细胞系,以及皮下肿瘤模型的小鼠样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA-seq,空间转录组学平台用于组织原位分析
397 2026-06-09
Fibroblast Activation Protein Promotes Thoracic Aortic Dissection via PLAUR/ITGB1-Mediated Pro-inflammatory Macrophage Polarization
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了成纤维细胞激活蛋白通过非酶促机制与PLAUR/ITGB1相互作用,促进促炎性巨噬细胞极化,从而推动胸主动脉夹层的发展 首次发现FAP通过非酶促位点与巨噬细胞PLAUR直接结合,激活ITGB1/FAK信号通路,介导成纤维细胞-巨噬细胞互作促进TAD进展,为TAD治疗提供新靶点 未明确说明研究的局限性 探究成纤维细胞激活蛋白在胸主动脉夹层发病机制中的作用及其分子机制 人类TAD标本、β-氨基丙腈诱导的TAD小鼠模型、成纤维细胞特异性Fap敲除小鼠 机器学习 心血管疾病 RNA测序 NA 基因表达数据 人类TAD标本和小鼠模型样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
398 2026-06-09
The importance of long-lived IgE plasma cells for protracted allergies
2026-04, Trends in immunology IF:13.1Q1
评论 本文讨论了关于长寿命IgE浆细胞在持续性过敏中的重要性,基于遗传命运图谱和单细胞测序的最新发现 揭示了两类细胞群(长寿命IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞)共同维持IgE水平,为过敏持久性提供新机制见解 由于是评论文章,未提供实验验证数据,且未讨论不同过敏模型的差异 探讨长寿命IgE浆细胞在持续性过敏中的细胞来源和维持机制 IgE浆细胞和记忆B细胞两类细胞群 机器学习 过敏性疾病 遗传命运图谱、单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
399 2026-06-09
Linking Targeted Pancreatic Cancer Genes With Metabolic Disorders: A Cross-Species Translational Pathway
2026-Apr, Cancer medicine IF:2.9Q2
研究论文 通过跨物种分析,探究胰腺导管腺癌相关基因与代谢紊乱分子间的相互作用 首次系统整合人类与小鼠脂肪组织及胰腺癌单细胞数据,揭示PDAC复发相关基因与肥胖、糖尿病等代谢通路共享的免疫代谢调控轴 样本量有限且仅采用公开数据集,功能验证仅通过qPCR而未进行基因敲除或动物模型验证 阐明胰腺癌相关基因与代谢紊乱(肥胖、糖尿病、炎症)之间的分子联系通路 胰腺导管腺癌相关基因(ITGAM、PECAM1、CCL5、STAT1、STAT2、CD44)及代谢紊乱通路 生物信息学 胰腺癌,代谢性疾病 RNA-seq NA RNA测序数据 公开数据集(人类及小鼠脂肪组织bulk RNA-Seq、晚期PDAC单细胞RNA-Seq)和人类脂肪组织qPCR样本 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
400 2026-06-09
PEBP1 inhibition as a therapeutic target for neurological recovery in ischemic stroke
2026-Apr, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics IF:5.6Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,确定PEBP1为缺血性卒中后神经恢复的治疗靶点 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化结合,鉴定出PEBP1作为缺血性卒中的新风险基因和潜在治疗靶点 可能存在的脱靶效应需进一步验证;仅使用小鼠模型进行实验验证,临床转化性需在人类研究中确认 探索缺血性卒中的新基因治疗靶点以改善神经功能恢复 缺血性卒中患者及小鼠模型(大脑中动脉阻塞模型) 医疗健康 脑血管疾病 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、共定位分析、定量PCR、免疫荧光、药理学抑制、shRNA敲低 NA 基因组数据、单细胞转录组数据 欧洲生物信息学研究所数据集(34,593例病例和624,214例对照)、独立验证数据集(86,668例病例和1,503,898例对照)、英国生物银行(26,052例病例和487,214例对照) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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