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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-06-10
Polyclonal selection of immune checkpoint mutations in thyroid autoimmunity
2026-Jun, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过全外显子和靶向NanoSeq测序,在自身免疫性甲状腺疾病中发现B细胞克隆获得免疫检查点基因TNFRSF14和CD274的功能缺失突变,支持体细胞突变使自身反应性淋巴细胞逃避免疫耐受的假说 首次利用高精度单分子DNA测序技术NanoSeq系统检测自身免疫疾病中的体细胞驱动突变,发现多克隆B细胞同时获得免疫检查点基因突变 每个突变克隆占细胞比例很小(通常<1%),功能验证限于部分克隆,样本量未明确说明 验证体细胞突变使自身反应性淋巴细胞逃避免疫耐受检查点的假说 自身免疫性甲状腺疾病患者的B细胞克隆 digital pathology 自身免疫性甲状腺疾病 NanoSeq NA DNA序列 未明确说明具体样本数 Illumina 全外显子测序 Illumina NovaSeq NA
382 2026-06-10
ScSpTITH: a rank-correlation framework for robust quantification of multi-dimensional tumor heterogeneity
2026-Jun-01, Human genetics IF:3.8Q2
research paper 提出ScSpTITH框架,利用斯皮尔曼等级相关稳健量化单细胞和空间转录组数据的多维度肿瘤异质性 首次采用基于标准差的基因筛选与斯皮尔曼等级相关相结合的策略,对单细胞RNA测序中70-95%的高零膨胀率具有内在鲁棒性,并在多维度(肿瘤间、肿瘤内空间区域、细胞群体和治疗条件)统一量化异质性 框架依赖于转录组特征选择,可能对低表达异质性基因不敏感;仅通过公共数据集验证,缺乏前瞻性临床队列的独立评估 开发一种能够抵抗单细胞测序技术噪声(如dropout伪影)的肿瘤异质性量化方法 单细胞RNA测序和空间转录组数据中的肿瘤细胞及肿瘤微环境细胞 machine learning 癌症 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组表达矩阵 包含多种癌症和发育数据集(具体数量原文未明确) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
383 2026-06-10
Epigenetic reprogramming of T cell metabolism restores function and enhances anti-tumor immunity in lung cancer
2026-Jun, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 该研究通过表观遗传药物筛选发现BET抑制剂能重编程T细胞代谢,恢复其在肺癌中的功能并增强抗肿瘤免疫 首次发现BET抑制剂通过激活多胺生物合成途径和MYC-ODC轴,重新编程T细胞代谢,逆转T细胞耗竭状态,为癌症免疫治疗提供新策略 研究主要基于肺癌恶性胸腔积液样本,尚需在其他癌症类型和更大样本量中验证;BET抑制剂的长期安全性和有效性也需进一步评估 探索表观遗传药物逆转T细胞耗竭、增强抗肿瘤免疫的机制 肺癌患者恶性胸腔积液中的原发性耗竭T细胞 表观遗传学, 免疫学, 癌症生物学 肺癌 表观遗传药物筛选, 转录组学, 代谢组学, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据, 代谢组数据, 染色质可及性数据, 单细胞转录组数据 肺癌患者恶性胸腔积液样本,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
384 2026-06-10
Temporal single-cell transcriptional dynamics of murine pancreatic islet remodeling during hyperglycaemia progression
2026-Jun-01, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 通过纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,构建了高脂饮食诱导胰岛素抵抗过程中小鼠胰岛细胞重塑的高分辨率图谱 首次系统揭示了高脂饮食喂养下胰岛细胞从适应性到炎症状态的时间动态变化,并发现CCL27a-M1巨噬细胞信号通路在β细胞应激与系统性炎症之间的新型关联 未明确提及,但推测可能包括小鼠模型与人类胰岛的物种差异、样本量有限及验证实验的体外条件限制 解析肥胖诱导胰岛素抵抗过程中胰腺胰岛细胞组成和转录状态的纵向动态变化 C57BL/6小鼠(高脂饮食喂养8、16、24周及正常饮食对照)和INS-1细胞系,以及人类胰岛scRNA-seq数据 单细胞转录组学, 机器学习 2型糖尿病, 胰岛素抵抗 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 小鼠胰岛样本:高脂饮食8周、16周、24周及正常饮食对照组,具体数量未明示 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台
385 2026-06-10
Shared diagnostic biomarkers in metabolic syndrome and coronary artery disease identified by integrated bioinformatics and machine learning
2026-Jun-01, Endocrine connections IF:2.6Q3
研究论文 通过综合生物信息学和机器学习方法,识别代谢综合征与冠状动脉疾病的共享诊断生物标志物 首次利用集成生物信息学方法(差异表达基因分析、WGCNA、机器学习算法)结合单细胞分析,筛选出ADRB2和KDM6A作为代谢综合征和冠状动脉疾病的共享诊断生物标志物 研究主要基于公共数据库的微阵列数据集,样本量有限,且筛选出的生物标志物仍需在更大规模临床队列中验证 识别代谢综合征和冠状动脉疾病的共享诊断生物标志物 代谢综合征和冠状动脉疾病患者 机器学习 心血管疾病 微阵列、RT-qPCR 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习算法 基因表达数据 5个微阵列数据集(具体样本数量未说明) NA NA NA NA
386 2026-06-10
Single-cell reveals age-dependent epithelial reprogramming and EMT vulnerability in THCA
2026-Jun-01, Endocrine-related cancer IF:4.1Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析甲状腺癌中年龄相关的上皮重编程及上皮-间充质转化(EMT)易感性 首次在甲状腺癌中通过单细胞分辨率揭示年龄相关的上皮重编程和EMT易感性,并鉴定PHTF2和SNAI1为EMT关键调控因子 未明确提及具体局限性 探究甲状腺癌中上皮-间充质转化(EMT)和肿瘤微环境重塑的机制 甲状腺组织样本:来自未成年和成年患者的20例甲状腺组织、92,849个细胞 机器学习和数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞基因表达数据 20例甲状腺组织样本(包含未成年和成年患者),共92,849个细胞 NA 单细胞RNA测序(single-cell RNA-seq) NA NA
387 2026-06-10
Multi-Omics Integration Reveals Incomplete Reactivation of Developmental Cell-Cycle Programs in Adult Human Infarcted Hearts
2026-Jun, Chemical biology & drug design IF:3.2Q3
研究论文 整合多组学数据揭示成人人类梗死心脏中发育性细胞周期程序的不完全再激活 首次通过多组学整合分析(单核RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq和ATAC-seq)揭示成人心脏梗死后细胞周期活跃的心肌细胞未能完成分裂的分子机制,特别是后期有丝分裂和胞质分裂执行机制的不完全再激活,并识别出ANLN、KIF18A、MDK、RTKN2和SOX11等关键基因 仅基于公共数据集进行分析,且研究主要聚焦于基因表达和表观遗传调控,可能未覆盖蛋白水平或翻译后修饰的影响 探究成人心肌细胞在急性心肌梗死后为何无法完成细胞分裂的分子机制 人类胎儿心脏和成人梗死心脏样本 数字病理学 心血管疾病 单核RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ATAC-seq NA 测序数据, 基因表达数据, 染色质可及性数据 多个公共数据集,包括人类胎儿心脏和成人梗死心脏样本 NA 单核RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq NA NA
388 2026-06-10
Single-cell profiling reveals peripheral blood immune landscape remodelling in breast cancer lymph node metastasis
2026-Jun, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 单细胞图谱揭示乳腺癌淋巴结转移中外周血免疫景观重塑 首次通过单细胞RNA/T细胞受体测序揭示乳腺癌淋巴结转移阳性和阴性患者外周血免疫景观的差异,并发现LGALS9-HAVCR2检查点互作在转移中起关键作用 样本量较小,仅6例患者的外周血单核细胞进行单细胞测序,额外14例乳腺癌组织数据用于验证 研究乳腺癌淋巴结转移中全身免疫环境的变化及其在促进转移中的作用 乳腺癌淋巴结转移阳性和阴性患者的外周血免疫细胞及其在肿瘤微环境中的功能 机器学习和数字病理 乳腺癌 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 NA 单细胞基因表达数据和T细胞受体序列数据 6例乳腺癌患者的外周血单核细胞(3例淋巴结转移阳性,3例阴性)及14例乳腺癌组织数据 10x Genomics 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞T细胞受体测序
389 2026-06-10
Endogenously generated Dutch-type Aβ non-fibrillar aggregates dysregulate presynaptic neurotransmission in the absence of detectable inflammation
2026-Jun, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 研究荷兰型Aβ非纤维聚集体在无炎症条件下对突触前神经传递的调控作用 首次发现内源性荷兰型Aβ非纤维聚集体在无炎症反应情况下即可导致突触前神经传递功能障碍,并揭示其与线粒体复合体I活性降低的相关性 未明确提及研究局限性 探究荷兰型Aβ非纤维聚集体积累对大脑突触功能、转录组、超微结构和代谢的影响 APPE693Q转基因小鼠模型 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 APPE693Q转基因小鼠脑样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
390 2026-06-10
NEDD8 Promotes the Progression and Inflammation of Keratoconus by Increasing the Expression of YAP1
2026-Jun-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,发现NEDD8通过调控Hippo-YAP信号通路促进圆锥角膜的进展和炎症 首次揭示NEDD8在圆锥角膜中通过调控Hippo-YAP通路介导机械信号传导的分子机制,并证实其作为潜在治疗靶点的价值 NA 阐明NEDD8在Hippo-YAP信号通路中的调控作用及其对圆锥角膜病理的影响 圆锥角膜患者中央角膜组织及HTK细胞 数字病理学 圆锥角膜 单细胞RNA测序、机械拉伸实验、功能获得/缺失实验、配体-受体互作分析 NA 单细胞转录组数据 未提及具体样本量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 单细胞转录组测序平台
391 2026-06-10
Identification of zinc finger protein-related feature genes in ischemic stroke via explainable machine learning: A comprehensive analysis
2026-May-30, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过可解释机器学习方法识别缺血性卒中中锌指蛋白相关特征基因并进行综合分析 首次系统整合多组学数据与多种机器学习算法,结合孟德尔随机化、贝叶斯共定位及单细胞测序分析,鉴定出ZNF438、ZNF566和ZNF608作为缺血性卒中的新型生物标志物,并构建了具有高诊断性能的模型 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏大规模前瞻性队列验证;单细胞测序分析未提供样本量信息;药物筛选结果需进一步实验验证 系统鉴定缺血性卒中相关的锌指蛋白特征基因并评估其作为生物标志物的潜力 锌指蛋白相关基因,重点关注ZNF438、ZNF566和ZNF608 机器学习 脑血管疾病 RNA-seq, scRNA-seq LASSO, SVM-RFE, 随机森林, 深度学习 转录组数据, 单细胞测序数据 来自GEO数据库的转录组数据集及外部验证集,具体样本量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
392 2026-06-10
Circadian rhythm disruption aggravates periodontitis via orchestrating TREM2+ macrophage-mediated bone resorption
2026-May-28, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示昼夜节律紊乱通过TREM2+巨噬细胞介导的骨吸收加剧牙周炎 首次发现昼夜节律紊乱通过BMAL1-TREM2调控轴驱动TREM2+巨噬细胞亚群扩增,进而加剧牙周炎骨破坏 未明确阐述人体研究验证及长期昼夜节律干预的临床效果 探索昼夜节律紊乱加剧牙周炎的分子机制及潜在治疗靶点 CRD小鼠模型及牙周组织中的巨噬细胞亚群 机器学习 牙周炎 单细胞RNA测序, CUT&Tag测序 NA 基因表达数据 CRD小鼠模型牙周组织样本 NA 单细胞RNA测序, CUT&Tag测序 NA NA
393 2026-06-10
Molecular signatures and lineage diversification of neurogenic and gliogenic radial glia in the gyrencephalic ferret cortex
2026-May-27, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用脑回雪貂模型系统表征皮层放射状胶质细胞的分子图谱和谱系动态,揭示保守的神经发生和胶质发生调控程序 首次在脑回雪貂模型中系统解析了外侧放射状胶质细胞中ERK和PKA信号通路相互增强的机制,并发现其协同调控神经发生、抑制胶质发生并延长神经发生期;同时鉴定了胶质源性放射状胶质细胞的区域特化机制 未提供明确的局限性信息 探究脑回雪貂皮层中放射状胶质细胞的分子特征和谱系分化机制,以及其与人类皮层进化扩张的关联 脑回雪貂和人类皮层组织 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
394 2026-06-10
Tanreqing injection regulates Sema7a/Plxnc1 signaling pathway mediated neutrophil extracellular trap formation to alleviate lipopolysaccharide-induced acute lung injury
2026-May-23, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 探讨痰热清注射液通过调控Sema7a/Plxnc1信号通路介导的中性粒细胞胞外陷阱形成来缓解脂多糖诱导的急性肺损伤 首次揭示了痰热清注射液通过抑制Sema7a/Plxnc1信号通路减少中性粒细胞胞外陷阱形成来缓解急性肺损伤的分子机制,并发现其活性成分黄芩苷可竞争性抑制Sema7a与Plxnc1的结合 未提及明显的局限性 评估痰热清注射液对急性肺损伤的治疗效果并阐明其分子机制 脂多糖诱导的急性肺损伤大鼠模型 机器学习 急性肺损伤 超高效液相色谱-四极杆-电喷雾质谱(UHPLC-QE-MS),代谢组学,RNA测序,单细胞测序,分子对接 NA 基因表达数据,代谢组数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
395 2026-06-10
Optimized Preparation of Whole Murine Tumor-Bearing Lung Tissue for Flow Cytometry and Single-Cell RNA-Sequencing
2026-May-22, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 提出一种从荷瘤小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液的优化方案,用于流式细胞术和单细胞RNA测序 针对荷瘤肺组织纤维化和异质性导致的单细胞制备难题,开发了一套包含组织灌注、可控酶解和温和机械解离的标准化流程,成功获得>85%的活细胞率 未说明 建立从健康及荷瘤小鼠肺组织中高效分离活单细胞的实验方案,以支持单细胞RNA测序研究 Kras突变驱动的NSCLC小鼠模型中的tdTomato标记肿瘤细胞及健康肺组织细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术 未说明 单细胞转录组数据 未见明确样本量描述,涉及Kras; tdTomato报告基因小鼠模型的荷瘤及健康肺组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 未说明
396 2026-06-10
Single-cell analysis identifies endothelial venous thromboembolism signatures as predictors of immunotherapy resistance and survival across cancers
2026-May-19, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH IF:5.5Q1
研究论文 通过单细胞分析识别肿瘤相关内皮细胞的静脉血栓栓塞特征,作为癌症免疫治疗耐药和生存预测因子 首次系统性地在多种肿瘤中基于单细胞RNA测序数据定义内皮细胞静脉血栓栓塞转录特征,并构建了具有预后和免疫治疗反应预测价值的Endo.VTM模型 该研究主要基于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性临床验证队列 表征肿瘤微环境中静脉血栓栓塞相关的转录特征,识别内皮特异性风险基因,并建立连接高凝状态、免疫功能障碍和肿瘤进展的预后模型 肿瘤相关内皮细胞 机器学习 肿瘤相关静脉血栓栓塞 单细胞RNA测序、批量RNA测序、CRISPR-Cas9依赖筛选 预后模型(Endo.VTM) 基因表达数据 38个单细胞RNA测序数据集,涵盖多种肿瘤类型;使用TCGA和GEO的批量RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
397 2026-06-10
Integrated transcriptomic analysis reveals lymphatic Icam1-mediated immune dynamics after myocardial infarction
2026-May-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 通过整合转录组分析揭示了心肌梗死后淋巴管内皮细胞中Icam1介导的免疫动态变化 首次使用LEC特异性Icam1条件敲除小鼠模型,并结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统性研究了Icam1在心肌梗死后免疫微环境重塑中的作用 未明确说明限制,但可能包括小鼠模型与人类差异及时间点选择 阐明淋巴管内皮细胞中Icam1如何调控心肌梗死后免疫微环境 心肌梗死后小鼠心脏中的淋巴管内皮细胞和免疫细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 条件敲除小鼠模型 基因表达数据 心肌梗死后3、7、21和42天的小鼠心脏样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
398 2026-06-10
In Silico Reconstruction of Primary and Metastatic Tumor Architecture Using Geographic Information System-Augmented Spatial Transcriptomics
2026-May-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 利用地理信息系统增强的空间转录组学在计算机中重构原发性和转移性肿瘤结构 提出了一种结合通路或细胞类型富集分析与空间自相关测量的生物信息学分析框架(GIS-ROTA),在识别空间域之前考虑生物学功能,提供直接可解释性并减少传统分析方法中聚类结果的主观性 未在摘要中明确说明 开发一种利用地理信息系统增强的空间转录组学分析方法,以揭示肿瘤微环境中的功能性空间域 原发性和转移性雌激素受体阳性乳腺癌肿瘤样本 计算病理学 乳腺癌 空间转录组学 NA 空间转录组学数据 原发性和转移性雌激素受体阳性乳腺癌肿瘤样本(具体数量未提供) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学实验
399 2026-06-10
Serglycin Drives LAG3+ Treg Differentiation and Immunosuppression in Gastric Cancer
2026-May-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 研究肿瘤细胞来源的Serglycin通过CD44-TGFβRI-SMAD3信号通路驱动LAG3阳性调节性T细胞分化,从而促进胃癌免疫抑制的机制 首次揭示SRGN-CD44信号通过糖酵解-氧化-泛素化级联反应调控LAG3蛋白稳定性进而促进Treg分化的新机制,为靶向该通路改善胃癌免疫治疗提供临床前证据 已有研究主要聚焦于胃癌中SRGN促进肿瘤进展的功能,但本研究通过单细胞RNA测序分析进一步阐明其在免疫调节中的具体作用 探究肿瘤细胞来源的Serglycin在胃癌免疫调节中的功能及驱动LAG3阳性Treg分化的分子机制 胃癌患者肿瘤组织及配对邻近正常胃黏膜组织中的CD4+调节性T细胞 machine learning 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组测序数据 23对胃癌组织及相邻正常胃黏膜组织 NA 单细胞RNA-seq NA 整合了已发表的单细胞RNA测序数据集
400 2026-06-10
Glomerular Endothelial Rarefaction Associated With Hypoxic Neutrophils Marks Renal Pathology Activity in Lupus Nephritis
2026-May-15, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究探讨狼疮性肾炎患者肾组织中与低氧中性粒细胞相关的肾小球内皮稀疏化及其在肾病理活动中的标志作用 首次通过空间转录组学和多重循环免疫荧光技术揭示狼疮性肾炎中肾小球低氧微环境与中性粒细胞胞外陷阱形成的关联,并提出尿液中中性粒细胞货物蛋白可作为疾病活动性的无创生物标志物 研究样本量有限,且未进行纵向随访以验证低氧中性粒细胞与肾损伤进展的因果关系 探究狼疮性肾炎患者肾组织中低氧和免疫介导损伤的空间转录组特征 狼疮性肾炎患者肾活检组织及肾移植健康对照组织 数字病理学 狼疮性肾炎 空间转录组学、多重循环免疫荧光、酶联免疫吸附测定 NA 空间基因表达数据、免疫荧光图像 狼疮性肾炎患者和肾移植对照组的肾活检样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学分析
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