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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-06-11
Decoding the Mechanisms of Hepatocellular Carcinoma Cancer Stem Cells and Identifying Potential Therapeutic Strategies Based on Single-cell Omics
2026 Mar-Apr, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
研究论文 基于单细胞组学解码肝细胞癌癌症干细胞机制并识别潜在治疗策略 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据系统表征肝细胞癌中癌症干细胞的细胞和空间异质性,构建预后模型并预测靶向癌症干细胞的候选药物 未提及具体局限性 系统表征肝细胞癌相关癌症干细胞,识别预后生物标志物和潜在治疗策略 肝细胞癌癌症干细胞及其微环境 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 HCCDB v2.0数据库中的肝细胞癌样本,以及GSE76427和GSE14520生存数据集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
382 2026-06-11
Machine Learning Reveals the Association Between Gene Expression and Immune Infiltration in Colorectal Cancer: A Comprehensive Study From Single-Cell to Survival Analysis
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 利用机器学习分析单细胞RNA测序数据,揭示结直肠癌中基因表达与免疫浸润的关联,并识别新型分子亚型和生物标志物 首次将机器学习应用于单细胞RNA测序分析,以解析结直肠癌中基因表达谱与免疫细胞浸润之间的复杂相互作用,并识别出两个具有不同预后效果的新型分子亚型以及CD19、MAP2、CALB2和TGFB2作为关键免疫调节生物标志物 未提及 探索结直肠癌肿瘤微环境中基因表达与免疫细胞浸润的分子机制,并开发预测性模型以指导临床治疗决策 结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序、CIBERSORT、ESTIMATE、UMAP、t-SNE 机器学习模型(含无监督聚类、生存分析、基因集富集分析) 单细胞RNA测序数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
383 2026-06-11
Immune Microenvironment Dynamics and Therapeutic Targets in GIST Revealed by Multi-Omics and Functional Validation
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过多组学分析和功能验证,揭示胃肠道间质瘤免疫微环境动态变化及潜在治疗靶点 首次结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和功能实验,系统鉴定出MYBL1和AIF1L作为调节CD8 T细胞功能和PD-1应答的关键介质 未提及具体局限性信息 阐明胃肠道间质瘤免疫微环境的因果机制及识别治疗靶点 胃肠道间质瘤患者肿瘤组织、细胞系(GIST-882)及CD8 T细胞 机器学习 胃肠道间质瘤 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、批量RNA测序、细胞共培养模型、功能实验(增殖、迁移、侵袭和蛋白摄取追踪) NA 基因表达数据、免疫细胞表型数据、血浆代谢物数据 731种免疫细胞表型(孟德尔随机化分析)及多个肿瘤样本(scRNA-seq和bulk RNA-seq) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
384 2026-06-11
Ventricular assist device unloading reverses microvascular senescence in single ventricle disease
2026-Mar, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 通过单核RNA测序和空间转录组学,研究了左心发育不全综合征患者右心室微环境中的微血管衰老及其在心室辅助装置卸载后的逆转 首次揭示HLHS心肌细胞内在衰老特性,并发现微血管衰老生态位与成人心肌梗死相似但不同于儿童扩张型心肌病,VAD卸载可改善该衰老生态位 NA 阐明HLHS右心室微环境的细胞衰老机制及VAD卸载的逆转作用 HLHS患者右心室组织及诱导多能干细胞来源的心肌细胞 数字病理学 左心发育不全综合征 单核RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 出生时(心力衰竭前)、术后伴心力衰竭及VAD卸载后的HLHS患者样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
385 2026-06-11
Dendritic Cell-Associated MARCKSL1 Regulates Fibroblast Differentiation During Wound Healing
2026 Mar-Apr, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析小鼠疤痕组织,发现树突状细胞中的MARCKSL1调节成纤维细胞分化,影响伤口愈合中的疤痕形成 首次揭示树突状细胞中的MARCKSL1基因在伤口愈合过程中调控成纤维细胞分化及其在疤痕形成中的关键作用 主要基于小鼠模型,人类伤口愈合中的机制有待验证;MARCKSL1抑制剂的安全性和长期效果尚未明确 阐明树突状细胞相关MARCKSL1在伤口愈合中调控成纤维细胞分化的机制,探索疤痕预防的新治疗途径 成年小鼠疤痕组织 和 小鼠胎儿伤口愈合模型中的树突状细胞和成纤维细胞 机器学习和数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),shRNA转导 NA 单细胞基因表达数据 小鼠疤痕组织(具体数目未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
386 2026-06-11
The Immune Cell Atlas of "Longevity Molecular Tag": Identification of Principal Immune Cell Subsets and Their Underlying Molecular Regulatory Mechanisms
2026-Mar, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序数据,识别与长寿表型相关的免疫细胞亚群,并揭示其分子调控机制 整合全生命周期单细胞数据与超长寿人群转录组数据,利用Scissor算法构建“长寿分子标签”免疫细胞图谱,发现NK细胞、CD8 T细胞和γδ T细胞等细胞毒性免疫细胞与长寿正相关,而CD4 T细胞、B细胞和树突状细胞与炎症信号通路相关 NA 揭示长寿人群中免疫细胞亚群及其分子调控机制,探索免疫衰老调节策略 东亚人群全生命周期的单细胞RNA测序数据和广西百岁老人队列的批量转录组数据 机器学习 老年疾病 单细胞RNA测序 Scissor算法 基因表达数据 东亚人群全生命周期样本及广西百岁老人队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
387 2026-06-11
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine IF:7.0Q1
research paper 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,开发了正弦细胞特异性生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后预测 首次从单细胞层面识别肝窦内皮细胞毛细血管化、肝星状细胞活化和巨噬细胞极化的细胞类型特异性特征,并将其整合为三个正弦评分(内皮、间充质和巨噬细胞),用于慢性肝病进展和逆转的生物学通路监测 回顾性研究设计,需进行前瞻性验证后才能推广至临床试验实施 开发正弦细胞特异性生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后预测 慢性肝病患者 machine learning chronic liver disease 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因表达定量分析 逻辑回归(AUROC评分) 基因表达数据(来自肝活检样本) 内部队列108例,验证队列1008例(含两年随访数据) NA single-cell RNA-seq NA NA
388 2026-06-11
scDock: streamlining drug discovery targeting cell-cell communication via scRNA-seq analysis and molecular docking
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出scDock管线,整合单细胞RNA测序分析与分子对接,实现靶向细胞间通讯的药物发现 首次将单细胞RNA测序数据处理、细胞间通讯推断和基于分子对接的药物发现整合为无需编程技能的一站式管线 NA 开发一个用户友好的端到端管线,用于从单细胞数据中发现靶向细胞间通讯的治疗化合物 疾病相关的配体-受体相互作用及潜在治疗化合物 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(RNA-seq)、分子对接 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
389 2026-06-11
The dorsal root ganglion T-junction: a critical node in somatosensory processing and pain pathogenesis
2026-Feb-25, Sheng li xue bao : [Acta physiologica Sinica]
PMID:41777127
综述 综述背根神经节T形连接在躯体感觉处理和疼痛发病机制中的关键作用 首次系统总结空间转录组学、单细胞测序、超分辨率显微镜、类器官模型等新技术对T形连接分子组成、离子通道分布和电生理特性的解析 T形连接体内动态调控机制尚不完全清楚,精准靶向治疗临床转化仍有挑战 阐明背根神经节T形连接在感觉信号处理和疼痛病理中的功能机制 背根神经节中的假单极神经元及其T形连接 数字病理学 神经病理性疼痛 空间转录组学、单细胞测序、超分辨率显微镜、电生理记录 NA 空间转录组数据、单细胞测序数据、图像数据 NA 10x Genomics, Illumina 空间转录组学, 单细胞RNA测序 10x Visium, Illumina NovaSeq NA
390 2026-06-11
A comprehensive single-cell analysis reveals the impact of laser interstitial thermal therapy on the tumor microenvironment in glioblastoma
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 利用单细胞RNA测序和免疫荧光技术,研究激光间质热疗对胶质母细胞瘤肿瘤微环境的影响 首次通过单细胞RNA测序全面揭示激光间质热疗诱导的亚致死高温对胶质母细胞瘤肿瘤微环境的多重复杂影响,包括促进细胞毒性T细胞浸润、驱动树突状细胞成熟、增强生发中心B细胞募集、减少M2型巨噬细胞浸润,并发现其通过减弱胶原相关基因与Cd44的相互作用抑制肿瘤,同时通过增强Ptn与Ncl的相互作用促进肿瘤血管生成和增殖的双重效应 研究基于大鼠颅内胶质母细胞瘤模型,结论可能需要进一步在人类患者中验证 研究激光间质热疗诱导的亚致死高温对胶质母细胞瘤肿瘤细胞及其微环境的影响 胶质母细胞瘤(GBM)大鼠颅内模型 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、免疫荧光分析 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 大鼠颅内胶质母细胞瘤模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序,10x Visium空间转录组学
391 2026-06-11
T cells co-expressing high levels of CD29 and CD99 show increased cytotoxic potential and are upregulated in Sjögren's disease
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究旨在探讨CD29和CD99在人类T淋巴细胞中的作用及其在干燥综合征中的意义 首次发现CD29和CD99在T细胞中高度共表达,并鉴定出CD29hiCD99hi T细胞亚群具有增强的细胞毒性潜能和活化表型,且在干燥综合征患者中上调 仅分析了外周血中的T细胞,缺乏对组织浸润T细胞的直接验证,且ROC分析显示仅CD29hiCD99hi CD4+ T细胞中的TIGIT表达达到高AUC值,临床价值有限 探索CD29和CD99在人类T细胞中的协同作用及其在干燥综合征发病机制中的意义 人类T淋巴细胞,特别是外周血单个核细胞中的CD4+和CD8+ T细胞亚群 数字病理学 干燥综合征 单细胞RNA测序,流式细胞术,批量RNA测序 NA 基因表达数据 干燥综合征患者和健康对照者的外周血样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
392 2026-06-11
IFNγ/JAK/STAT1/CD38 pathway in SH2D1Bhigh NK cells: Implications for inflammation in type 1 diabetes
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究探讨了SH2D1B高表达的自然杀伤细胞中IFNγ/JAK/STAT1/CD38通路在1型糖尿病炎症中的作用 首次揭示SH2D1B高表达的NK细胞通过IFNγ/JAK1/STAT/CD38通路产生腺苷,可能限制1型糖尿病的自身免疫和疾病发展 NA 探究1型糖尿病中SH2D1B高表达NK细胞的分子机制及其对炎症的影响 1型糖尿病患者外周血中的NK细胞 机器学习 1型糖尿病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, Western blotting LASSO 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
393 2026-06-11
Spatial transcriptomics reveals the mechanistic role of lactate metabolism in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过空间转录组学揭示乳酸代谢在胰腺导管腺癌微环境中的机制作用 首次结合高通量转录组测序和单细胞转录组分析,系统探讨乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的作用,并建立基于机器学习的预后模型,识别出溶菌酶和聚合免疫球蛋白受体作为潜在临床生物标志物 样本量相对较小(8个PDAC样本,50795个细胞),且主要依赖公开数据集,缺乏独立外部验证队列 阐明乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的作用机制,并建立基于乳酸代谢基因的预后模型以指导早期诊断和个性化治疗 胰腺导管腺癌患者的肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,高通量转录组测序 机器学习(StepCox + Enet,α=0.5) 基因表达数据 8个PDAC样本中的50795个细胞,以及多个队列共345个患者(ICGC:92;GSE28735:45;GSE62452:69;GSE183795:139) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
394 2026-06-11
Identification and validation of prognostic genes related to glycolysis and M2 macrophage in hepatocellular carcinoma: an integrated analysis of bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,鉴定与肝细胞癌中糖酵解和M2巨噬细胞相关的预后基因 首次通过整合糖酵解相关基因、M2巨噬细胞相关基因和差异表达基因,系统筛选出8个与两者交叉相关的预后基因,并构建风险模型 研究基于公共数据库数据,缺乏多中心外部验证队列,且RT-qPCR验证样本量有限 鉴定肝细胞癌中同时与糖酵解和M2巨噬细胞相关的预后基因并阐明其机制 肝细胞癌肿瘤组织和细胞样本 生物信息学 肝细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR 回归分析风险模型 转录组数据, 单细胞表达数据 公共数据库数据(TCGA-LIHC等)+ RT-qPCR验证样本(具体数量未说明) NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
395 2026-06-11
Reprogramming the immunosuppressive breast cancer microenvironment: integrating cellular, metabolic, and stromal targets for rational immunotherapy
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 这篇综述整合了关于乳腺癌肿瘤免疫微环境在细胞、分子和代谢层面复杂性的最新进展,并强调了阻碍持久治疗效果的免疫抑制机制 提出了将免疫“冷”肿瘤转化为免疫“热”肿瘤的新策略,包括代谢调节、基质重编程和精准联合疗法,并整合了空间转录组学和液体活检等新型生物标志物策略 未明确提及具体局限性 总结乳腺癌肿瘤免疫微环境的最新研究进展,并探讨克服免疫抑制的合理免疫治疗策略 乳腺癌肿瘤免疫微环境 machine learning 乳腺癌 空间转录组学 NA 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
396 2026-06-11
Integrative omics and experimental validation reveal METTL17 and SLC27A1 as biomarkers and potential therapeutic targets in chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
research paper 通过整合分析转录组、单细胞测序和实验验证,发现METTL17和SLC27A1是慢性肾病中连接线粒体功能障碍和巨噬细胞极化的关键基因,可作为生物标志物和潜在治疗靶点 首次整合多组学数据与实验验证,揭示METTL17和SLC27A1在慢性肾病中调节线粒体功能和免疫失衡的双重作用,并明确其细胞来源为近端肾小管细胞和平滑肌细胞 研究仅在体外和动物模型中进行验证,缺乏大规模临床队列验证,且样本量有限 鉴定慢性肾病中连接线粒体调节与巨噬细胞极化的关键基因及潜在治疗靶点 慢性肾病患者外周血样本和单侧输尿管梗阻小鼠模型 machine learning chronic kidney disease bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, qPCR, immunohistochemistry, Western blotting, machine learning machine learning models (unspecified specific type) gene expression data (RNA-seq), single-cell transcriptomic data, clinical data CKD患者外周血样本(具体数量未提及)和UUO小鼠模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
397 2026-06-11
Single-cell transcriptomic profiling of C. elegans Q neuroblast lineage during migration and differentiation
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示秀丽隐杆线虫Q神经母细胞在迁移和分化过程中的分子机制 首次构建了Q神经母细胞谱系的高分辨率转录组分化图谱,发现亲代Q细胞初始具有上皮样特性并经历上皮-间充质转化,以及Wnt相关基因的左右不对称表达 未在摘要中明确说明局限性 研究Q神经母细胞迁移和分化的分子机制 秀丽隐杆线虫Q神经母细胞谱系 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、流式细胞分选 NA 转录组数据 Q谱系细胞在不同发育阶段分离 NA 单细胞RNA测序 NA 通过FACS分离Q谱系细胞进行单细胞RNA测序
398 2026-06-11
Mass spectrometry-based multi-omics analysis elucidates immune microenvironmental characteristics and the risk of distant metastasis in N1c colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 基于质谱的多组学分析阐明了N1c结直肠癌的免疫微环境特征及远处转移风险 首次通过DIA-MS蛋白质组学技术系统研究了N1c结直肠癌的分子特征,并基于机器学习算法鉴定了10个肿瘤沉积相关转移基因(TDRGs),用于预测无病生存期和免疫治疗反应 样本量较小(13例),缺乏独立外部验证队列,且PLOD1的功能验证仅限于体外实验 揭示N1c结直肠癌的生物学特征、免疫微环境及其与远处转移的关系 N1c结直肠癌患者的FFPE样本(13例T1-T4N1cM1)及多个公共数据集的1582例结直肠癌患者 机器学习 结直肠癌 DIA-MS蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, Masson三色染色, 伤口愈合实验, Transwell实验 9种机器学习算法(具体未列出) 蛋白质组学数据, 单细胞RNA测序数据, 组织病理图像 13例N1c结直肠癌患者的FFPE组织样本;单细胞RNA测序及公共数据集共1582例结直肠癌患者样本 NA 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 NA NA
399 2026-06-11
Multi-dimensional evidence establishing the causal association between metabolic syndrome and gout and the molecular mechanisms of comorbidity
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多维方法系统证明代谢综合征与痛风的因果关系,并揭示其共病的分子机制 首次整合真实世界队列、孟德尔随机化和单细胞转录组等多维证据,建立代谢综合征与痛风的因果关系链,并提出TAP2-UPR-Th17病理轴 研究可能受到观察性研究的混杂因素影响,且样本量和数据集的代表性存在一定局限 系统评估代谢综合征及其组分与痛风的因果关系,揭示共病的遗传基础和转录组特征 代谢综合征、痛风及共病患者,包括真实世界临床队列、遗传数据和转录组样本 机器学习 代谢综合征, 痛风 倾向性评分匹配, 限制性立方样条, 潜类别轨迹建模, 孟德尔随机化, 连锁不平衡分数回归 NA 临床数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 真实世界临床队列样本量8,853人,转录组数据GSE160170和GSE98895,单细胞数据GSE217561 NA 单细胞RNA-seq NA NA
400 2026-06-11
Integrating multi-omics and machine learning to unravel mechanisms of lymph node metastasis in papillary carcinoma with and without thyroiditis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学与机器学习方法,揭示伴或不伴甲状腺炎的乳头状甲状腺癌淋巴结转移的不同机制 首次比较PTC-blank和PTC-thyroiditis两种亚型淋巴结转移的分子和细胞异质性,发现PI16+成纤维细胞亚群在PTC-blank中与ECM重塑相关,并利用机器学习和孟德尔随机化鉴定出SHISA5作为新的因果基因和潜在治疗靶点 未明确说明,但可推测单细胞数据仅来自一个公开数据集,且预测模型的外部验证可能有限 比较PTC-blank和PTC-thyroiditis的分子和细胞异质性,识别淋巴结转移的关键驱动因素,并开发临床预测模型 乳头状甲状腺癌(PTC)患者,分为伴甲状腺炎(PTC-thyroiditis)和不伴甲状腺炎(PTC-blank)两类 机器学习 甲状腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO, 随机森林, KNN 基因表达数据 TCGA数据库的bulk RNA-seq数据和GSE184362的单细胞RNA-seq数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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