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当前共找到 38991 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 381 | 2026-04-30 |
Transcriptional and spatial profiling of fibroblasts from human lungs highlights CTHRC1+ cells as fibrogenic signaling hubs in fibrosis
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.08.717092
PMID:41993306
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示人肺成纤维细胞在肺纤维化中的转录和空间特征，突出CTHRC1+细胞作为纤维化信号中枢的作用 | 首次在组织水平上对IPF患者和健康供体的肺成纤维细胞进行高分辨率转录和空间分析，识别出六种间充质亚型，并发现CTHRC1+成纤维细胞作为最促纤维化的亚型及信号中枢 | 体外培养导致成纤维细胞转录特征改变，无法完整再现天然组织中的异质性，限制了研究结果的直接转化应用 | 阐明肺成纤维细胞亚型的转录异质性及体外培养对天然组织特征的影响，为开发靶向成纤维细胞的IPF治疗策略提供依据 | IPF患者和年龄匹配健康供体的肺组织以及体外培养的成纤维细胞（传代1和6） | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA序列数据, 空间转录组数据 | IPF患者和健康供体的肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞测序，10x Visium 用于空间转录组学 |
| 382 | 2026-04-30 |
From Normal Mucosa to Colorectal Cancer in Lynch Syndrome: Single-Cell Dissection of Cellular Heterogeneity and Communication Networks
2026-Apr-09, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL47730
PMID:42052848
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研究论文 | 对林奇综合征相关结直肠癌从正常黏膜到癌变过程进行单细胞解析，揭示细胞异质性和通信网络 | 首次构建林奇综合征结直肠癌发展的单细胞图谱，发现DMBT1下调通过激活WNT/β-catenin通路促进肿瘤生长，并鉴定出免疫抑制性微环境特征 | 研究样本量有限，需更多队列验证；功能验证主要基于类器官和Transwell实验，缺乏体内模型 | 解析林奇综合征相关结直肠癌发展过程中的细胞重编程和细胞间通信网络 | 林奇综合征患者的配对正常黏膜、腺瘤和癌组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 林奇综合征患者的配对正常黏膜、腺瘤和癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 383 | 2026-04-30 |
ScRNA-Seq and BCR Analysis of Murine Immune Responses to Inactivated DHAV-1 as a Model Antigen
2026-Apr-08, Viruses
DOI:10.3390/v18040448
PMID:42043237
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研究论文 | 利用单细胞测序和B细胞文库技术，研究了灭活鸭甲型肝炎病毒1型（DHAV-1）作为模型抗原在小鼠脾脏中诱导的B细胞免疫反应特征 | 首次在单细胞水平上系统解析了灭活病毒抗原诱导的B细胞亚群变化、细胞间通讯以及B细胞受体（BCR）谱系特征，揭示了免疫球蛋白重链可变区基因家族使用模式和CDR3区序列特征 | 仅在小鼠模型中研究，未在禽类模型中进行验证；样本量未明确说明；为初步表征，需进一步的机制研究验证假设 | 探究灭活DHAV-1作为模型抗原在小鼠模型中诱导的B细胞免疫学特征及B细胞受体特征 | 小鼠脾脏中B细胞及其受体 | 单细胞免疫学 | 鸭甲型肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），B细胞文库技术 | NA | 单细胞转录组数据，BCR序列数据 | NA（未明确说明具体样本数量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 384 | 2026-04-30 |
Monocyte Lineage Expansion Drives Transcriptomic Individuality in Genetically Identical Armadillo Quadruplets
2026-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.30.715171
PMID:41959222
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研究论文 | 本研究通过分析基因完全相同的九带犰狳四胞胎，发现单核细胞谱系扩增驱动转录组个体性，并揭示其与免疫细胞组成的持久差异相关 | 首次在基因完全相同的个体中，将转录组个体性与单核细胞谱系扩增及免疫细胞组成的持久差异联系起来，并证明这些差异在时间上稳定且不受实验性麻风感染影响 | 仅基于一个高度变异窝的数据，样本量有限，且未涉及其他组织或物种的验证 | 探究基因完全相同个体中转录组个体性是否反映功能生物学差异 | 五组基因完全相同的九带犰狳四胞胎 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 五组四胞胎，每组四个个体，共20个个体，每个个体三个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 385 | 2026-04-30 |
Unlocking single-cell level and continuous whole-slide insights in spatial transcriptomics with PanoSpace
2026-Apr, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00938-y
PMID:41495261
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研究论文 | 提出了PanoSpace计算框架，整合低分辨率空间转录组学、高分辨率组织学与单细胞RNA测序，在全组织切片上重构连续单细胞级基因表达图谱 | 利用计算模型将粗粒度空间斑点数据提升至连续单细胞分辨率，填补斑间未测区域，并实现细胞身份、位置及表达谱的精确重建 | 文中未明确讨论框架对异质性组织或低质量数据的鲁棒性，也未提及计算资源需求 | 开发一种计算框架，克服现有空间转录组平台分辨率低和采样稀疏的局限，实现全切片连续单细胞级空间转录组分析 | 乳腺癌、前列腺癌组织及小鼠脑组织 | 计算生物学 | 乳腺癌，前列腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，组织学图像，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 386 | 2026-04-30 |
Developing a Single-Cell Spatial Transcriptomics Workflow for In Vivo Evaluation of Implanted Biomaterials
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513242
PMID:41691505
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研究论文 | 开发了一种用于评估植入生物材料的单细胞空间转录组学工作流程，揭示了聚己内酯（PCL）支架植入小鼠皮下后的细胞动态和空间组织 | 首次将高分辨率空间转录组学（Xenium平台）应用于生物材料的体内评估，能够识别组织学无法检测的巨噬细胞和成纤维细胞亚群的转录组空间转变 | 该工作流程可能依赖特定的平台（Xenium），且尚未在多种生物材料或更长的时间点进行验证以评估其普适性 | 开发一个生物信息学工作流程，通过空间转录组学评估植入生物材料的体内反应，以便更好地理解细胞机制并实现以生物学信息为基础的设计 | 小鼠皮下植入的静电纺丝聚己内酯（PCL）支架 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 皮下植入PCL支架的小鼠样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台用于原位基因表达分析 |
| 387 | 2026-04-30 |
PICDGI: A framework for predicting cancer driver genes through dynamic gene-gene interaction modeling of single-cell data
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014143
PMID:42044093
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研究论文 | 提出PICDGI框架，通过动态基因-基因相互作用建模基于单细胞数据预测癌症驱动基因 | 不依赖DNA突变，而是通过单细胞RNA测序时间序列表达模式推断功能性驱动基因，采用时变状态空间模型结合变分贝叶斯推断和MCMC采样 | 文中未明确提及局限性 | 开发一种通用且生物学基础的计算框架，识别罕见和情境特异性的癌症进展调控驱动基因 | 肺癌（肺腺癌）和儿童急性髓系白血病的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肺癌, 白血病 | 单细胞RNA测序 | 时变状态空间模型, 变分贝叶斯, 马尔可夫链蒙特卡洛抽样 | 基因表达数据 | 肺腺癌单细胞RNA测序数据及独立儿童急性髓系白血病单细胞RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 388 | 2026-04-30 |
Single-cell profiling reveals that dynamic lung immune responses distinguish protection from susceptibility to tuberculosis
2026-Apr, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013635
PMID:42044120
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序，揭示动态肺部免疫反应区分结核病保护与易感性的机制 | 首次在多个时间点、小鼠品系和结核分枝杆菌菌株下，利用单细胞RNA测序系统比较了初次感染和已控制感染小鼠的肺部免疫动态差异，发现保护性免疫依赖于免疫激活的时间协调而非单一反应强度 | 研究基于小鼠模型，结果向人类的直接推广性有限；未验证这些免疫动态特征在人类疫苗反应中的适用性 | 阐明结核分枝杆菌感染后保护性免疫的免疫相关性，为疫苗策略提供框架 | 初生小鼠和已控制结核分枝杆菌感染的小鼠的肺部免疫细胞 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点、小鼠品系和结核分枝杆菌菌株的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 389 | 2026-04-30 |
Chemotherapy-induced reactive myelopoiesis promotes expansion of immunosuppressive neutrophil-like monocytes in mice and humans
2026-Mar-31, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198360
PMID:41945895
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC测序，揭示了化疗诱导的反应性髓细胞生成促进免疫抑制性中性粒细胞样单核细胞扩增的机制 | 首次在化疗后小鼠和人类中鉴定出CXCR4⁺CX3CR1⁻中性粒细胞样单核细胞亚群，并证明其具有强T细胞抑制活性，揭示了化疗后免疫抑制的新机制 | 对临床样本仅分析了淋巴瘤患者，机制研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证规模有限 | 探究化疗诱导的反应性髓细胞生成及其对免疫抑制性单核细胞扩增的分子机制和临床意义 | 化疗处理的小鼠骨髓单核细胞和接受含环磷酰胺化疗的淋巴瘤患者外周血单核细胞 | 数字病理 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、ATAC测序 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据 | 化疗处理的小鼠（样本量未明确）以及公共数据集中化疗治疗的癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 390 | 2026-04-30 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0775
PMID:41874448
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研究论文 | 介绍IN-DEPTH工作流程，实现同一玻片上的空间多组学整合，并揭示肿瘤病毒相关的肿瘤微环境空间重组 | 开发了IN-DEPTH工作流程，结合单细胞空间蛋白质组学成像引导转录组捕获，无需RNA信号损失；并开发了光谱图互相关（SGCC）框架，实现蛋白质-转录组模态的整合分析 | 尚未提及方法的局限性 | 实现同一玻片上的空间多组学整合，揭示弥漫大B细胞淋巴瘤中EB病毒相关的肿瘤微环境空间重组 | 弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）肿瘤组织，包括EBV阳性和EBV阴性样本 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、IN-DEPTH、SGCC | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组成像数据 | 包含EBV阳性和EBV阴性的弥漫大B细胞淋巴瘤样本 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 391 | 2026-04-30 |
Mucosal Inflammation Shapes Human Neutrophil States in Tissue and Circulation
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.21.713286
PMID:42051301
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、光谱流式细胞术和空间蛋白质组学，研究牙龈、血液和口腔中中性粒细胞在健康与牙周炎状态下的组织特异性状态及其系统性影响 | 首次在健康与疾病状态下系统性表征人类口腔粘膜中性粒细胞的组织特异性状态，揭示牙周炎通过血液样中性粒细胞亚群浸润和转录噪声增加破坏粘膜免疫调节程序，并发现局部炎症可系统性重塑循环中性粒细胞——共享一个Rho-GTPase调控程序，该程序在多种人类炎症性疾病中普遍存在 | 未提及具体限制 | 探究口腔粘膜组织中中性粒细胞在健康与炎症性疾病中的组织特异性状态及其对循环中性粒细胞的系统性影响 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织、血液和口腔腔隙中的中性粒细胞 | 自然语言处理 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、空间蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、空间蛋白质组数据 | 健康个体和牙周炎患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 392 | 2026-04-30 |
Spatial transcriptomics from pancreas and local draining lymph node tissue reveals a lymphotoxin-β signature in human type 1 diabetes
2026-Mar-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117144
PMID:41875135
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研究论文 | 利用空间转录组学分析人类1型糖尿病胰腺和局部引流淋巴结组织，揭示淋巴毒素-β特征 | 首次在人类1型糖尿病中通过多细胞分辨率空间转录组学发现胰腺淋巴结中淋巴毒素-β（LTB）在淋巴滤泡中显著上调，并鉴定滤泡B细胞为LTB的主要来源 | 样本量有限；亚细胞分辨率空间转录组平台仅用于独立供体验证；未进行功能验证实验 | 探究1型糖尿病自然病程中胰腺和胰腺淋巴结的炎症反应特征 | 无糖尿病个体、自身抗体阳性风险个体和1型糖尿病供体的胰腺与胰腺淋巴结组织 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 无糖尿病、自身抗体阳性和1型糖尿病供体的胰腺及胰腺淋巴结组织样本 | NA | 空间转录组学 | 多细胞分辨率空间转录组平台、亚细胞分辨率空间转录组平台 | 多细胞分辨率空间转录组学和正交亚细胞分辨率空间转录组平台 |
| 393 | 2026-04-30 |
Mathematical dissection of tumor phenotypic heterogeneity in a spatial data-informed nonlocal reaction-diffusion model
2026-Mar-22, Journal of mathematical biology
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s00285-026-02380-8
PMID:41866589
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研究论文 | 提出一种结合空间转录组数据的非局部反应-扩散数学模型，严格分析肿瘤内表型异质性的演化动态 | 首次将空间基因表达数据与非局部反应-扩散模型整合，开展严格的数学分析并揭示表观突变率决定肿瘤细胞表型集中分布的关键作用 | 模型假设依赖血管化肿瘤且参数空间维度较高，实际应用时计算复杂度较大 | 通过数学建模剖析肿瘤内表型异质性及其演化机制 | 血管化肿瘤及其内部异质性表型细胞群体 | 机器学习 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | 非局部反应-扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 394 | 2026-04-30 |
Human Single-cell Atlas Analysis Reveals Heterogeneous Endothelial Signaling
2026-Mar-20, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag025
PMID:41863304
|
研究论文 | 通过整合15个人体组织中的三百万个单细胞进行单细胞RNA-seq数据分析，揭示了内皮细胞的异质性及其在血管类型和组织微环境中的信号传导机制 | 首次大规模整合多个组织单细胞转录组数据，开发计算流程分析代谢物或蛋白质介导的细胞间通讯，利用主题建模识别内皮细胞与其他组织驻留细胞之间的通讯模式 | 研究主要依赖公开数据集，可能受限于原始数据质量及组织覆盖的全面性 | 系统研究内皮细胞在血管类型和组织微环境背景下的异质性及其调控机制 | 人体15个组织中的内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 主题建模 | 单细胞转录组数据 | 15个人体组织中三百万个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 395 | 2026-04-30 |
Dynamic and cell-type specific transcriptional reprogramming underlies the floral transition in the maize shoot apical meristem
2026-Mar-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04033-x
PMID:41851888
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研究论文 | 通过整合时间序列批量RNA-seq、单细胞转录组学、染色质可及性和转录因子结合谱，构建玉米茎尖分生组织花转变的时空分子框架，揭示动态和细胞类型特异性转录重编程机制 | 首次构建了玉米花转变的完整时空调控框架，发现花转变并非由统一的转录开关驱动，而是源自空间上不同的茎尖分生组织区域的协同作用，并鉴定出ZmMADS69-ZmRap2.7-ZMM4调控模块以及UNBRANCHED2和UNBRANCHED3在促进花转变中的新角色 | 未明确提及局限性 | 研究玉米茎尖分生组织在花转变过程中的转录重编程和细胞身份变化的分子机制 | 玉米茎尖分生组织 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq， 单细胞转录组学， 染色质可及性分析， 转录因子结合谱分析 | NA | 转录组数据， 染色质可及性数据 | 时间序列样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq， 批量RNA-seq | NA | NA |
| 396 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing uncovers neutrophil clusters associated with autoimmune neuroinflammation
2026-Mar-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03772-9
PMID:41851894
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2026-03-19 |
A differential single-cell transcriptome atlas of left-sided and right-sided colorectal cancer
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04789-5
PMID:41844817
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2026-03-19 |
Identification of TRPM4 related genes in LUAD by RNA seq and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04797-5
PMID:41845138
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2026-03-13 |
Molecular subtypes of vascular endothelial cell differentiation in keloid by single-cell sequencing
2026-Mar-12, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003971
PMID:41813334
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2026-04-28 |
Artificial intelligence-assisted spatial omics-based biomimetic nanoplatform for intelligent and precise intervention in the immunosuppressive core region of ovarian cancer
2026-Mar-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01345-w
PMID:41814059
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综述 | 综述了人工智能辅助的空间组学基于仿生纳米平台用于卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 提出人工智能辅助的闭环治疗框架，整合识别、递送和反馈，实现个性化精准免疫治疗，并系统梳理了空间组学鉴定免疫抑制核心区域的方法 | 空间图谱标准化、递送系统稳定性和跨平台兼容性仍需进一步技术突破 | 实现卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 卵巢癌免疫抑制肿瘤微环境中的核心区域，包括调节性T细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞构成的“排斥结构” | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |