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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2025-12-02
Multi-omics, histologic, and scRNA-seq profiling of pleural mesothelioma reveals negative prognosis associated with a novel uncommitted molecular phenotype
2025-Nov-28, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过多组学、组织学和单细胞RNA测序分析胸膜间皮瘤,揭示了一种与不良预后相关的新型未分化分子表型 发现了一种在双相型胸膜间皮瘤中富集的新型未分化恶性细胞状态,并鉴定了TGF-β和GAS6-AXL信号通路作为候选驱动因子 需要进一步的实验探索和临床验证来确认这些发现 识别胸膜间皮瘤恶性细胞状态的候选驱动因子和预后生物标志物 胸膜间皮瘤患者组织样本 数字病理学 胸膜间皮瘤 单细胞RNA测序, 外显子组测序, RNA测序, 光学基因组图谱, 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据, 外显子组数据, RNA测序数据, 空间转录组数据, 组织学图像 来自40名患者的93个样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 外显子组测序, RNA-seq NA NA
382 2025-12-02
Multi-Omics Reveals CCL3 Driving Neuronal Sensitization in Chronic Pruritus of Unknown Origin
2025-Nov-28, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性不明原因瘙痒症中CCL3驱动神经元敏化的机制 首次在慢性不明原因瘙痒症患者中通过单细胞RNA测序发现系统性免疫失调,并确定CCL3-CCR1轴是慢性瘙痒的关键神经免疫通路 研究主要基于小鼠模型,需要在人类患者中进行更直接的验证;CCL3作为直接诊断标志物的临床应用仍需进一步研究 探究慢性不明原因瘙痒症的发病机制并寻找潜在的治疗靶点 慢性不明原因瘙痒症患者和小鼠模型 单细胞组学 慢性瘙痒症 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 CPUO患者和健康对照(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
383 2025-12-02
Acute phase response-driven hepatic niche remodeling promotes fibrosis resolution after alcohol cessation
2025-Nov-28, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,揭示了酒精戒断后急性期反应驱动的肝脏微环境重塑如何促进纤维化消退的机制 首次在酒精相关性肝病戒断模型中,通过空间转录组学识别了独特的促纤维化与促纤维溶解微环境,并发现SAA高表达肝细胞通过HDL-SR-BI轴调控巨噬细胞功能以促进纤维化消退 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;空间转录组学数据为1000-plex,分辨率仍有提升空间 探究酒精相关性肝病戒断后疾病消退的分子与细胞机制 酒精相关性肝病小鼠模型及人类肝脏样本 空间转录组学 酒精相关性肝病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 小鼠模型(20周酒精喂养+4周戒断)及人类肝脏样本 Nanostring 空间转录组学 CosMx 1000-plex CosMx空间转录组学检测
384 2025-12-02
The glutamine metabolic switch influences the response of neonatal intestinal macrophages to breast milk
2025-Nov-28, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿坏死性小肠结肠炎中对肠道巨噬细胞代谢重编程的调控作用及其对疾病进展的双重影响 揭示了谷氨酰胺代谢开关在新生儿肠道巨噬细胞中的关键作用,并阐明了其通过调控α-酮戊二酸与琥珀酸代谢平衡来影响炎症反应的机制 研究主要基于大鼠模型和体外实验,人类临床数据的直接验证有限,且未探讨其他免疫细胞类型的作用 探究谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿肠道炎症中的作用机制 新生大鼠坏死性小肠结肠炎模型、骨髓来源巨噬细胞、回肠巨噬细胞 NA 坏死性小肠结肠炎 单细胞RNA测序、流式细胞术、转录组学分析 NA 基因表达数据、细胞表型数据 未明确样本数量,使用了大鼠模型和已发表的人类新生儿单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
385 2025-12-02
NK cells undergo transcriptional and functional reprogramming following Streptococcus pneumoniae infection
2025-Nov-28, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自然杀伤细胞在肺炎链球菌感染后的转录和功能重编程 首次在细菌感染背景下系统描述了NK细胞的转录重编程和记忆形成机制 研究主要关注肺炎链球菌感染,未涉及其他细菌种类 探究NK细胞在细菌感染中的记忆形成机制 自然杀伤细胞 单细胞组学 细菌感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
386 2025-12-02
CCL19+ fibroblast-CCR7+ T-cell crosstalk coordinates immunofibrotic signalling networks in systemic sclerosis
2025-Nov-28, The British journal of dermatology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了系统性硬化症中CCL19+成纤维细胞与CCR7+ T细胞之间的相互作用如何协调免疫纤维化信号网络 首次在系统性硬化症中识别出CCL19+成纤维细胞亚群,并阐明其通过CCL19-CCR7轴促进CCR7+ T细胞浸润以驱动纤维化的新机制 样本量较小(7名患者和4名健康对照),且主要基于小鼠模型验证,人类体内直接功能验证有限 探索系统性硬化症中成纤维细胞如何通过免疫调节信号与免疫细胞相互作用促进纤维化 系统性硬化症患者的皮肤和血液样本,以及博来霉素诱导的系统性硬化症小鼠模型 单细胞组学 系统性硬化症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫组化、流式细胞术、空间分析、轨迹伪时间分析 NA 单细胞RNA测序数据、免疫组化图像、流式细胞数据 7名系统性硬化症患者和4名健康对照的皮肤与血液样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
387 2025-12-02
Neuroectoderm-derived iris muscle characterization at the single-cell resolution in native human iris and a pluripotent stem cell eye model
2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了成人原生虹膜组织与人类多能干细胞衍生的虹膜平滑肌,揭示了虹膜肌肉的转录特征及其在神经外胚层发育中的特异性 首次在单细胞分辨率下表征人类原生虹膜与干细胞眼模型中神经外胚层衍生的虹膜肌肉,并建立了虹膜肌肉基因签名 研究主要基于体外干细胞模型,可能无法完全模拟体内虹膜发育的复杂微环境 探究神经外胚层衍生的虹膜肌肉在人类发育中的转录基础及其疾病相关性 成人原生虹膜组织与人类多能干细胞衍生的虹膜平滑肌 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
388 2025-12-02
Multimodal single cell analyses reveal gene networks of planarian stem cell differentiation
2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和染色质可及性数据,揭示了涡虫干细胞分化的基因调控网络 整合单细胞转录组学和染色质可及性数据,以计算方式推断基因调控网络,无需传统扰动实验,提高了可扩展性 未明确提及具体限制,但基于方法推断,可能依赖于计算预测的准确性,需要实验验证 研究涡虫干细胞分化的基因调控网络,以揭示细胞类型身份的控制机制 涡虫干细胞及其分化细胞类型,包括肌肉、神经元、分泌细胞、肠道吞噬细胞、杯状细胞和实质细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组学,染色质可及性分析 NA 单细胞转录组数据,染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
389 2025-12-02
Senescent SPP1+ macrophages remodel the tumor microenvironment and promote the progression of early-stage lung adenocarcinoma featured with mixed ground glass nodule
2025-Nov-27, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示了衰老的SPP1+巨噬细胞在混合磨玻璃结节型早期肺腺癌的肿瘤微环境重塑和恶性进展中的关键作用 首次利用单细胞RNA测序结合多色免疫组化和流式细胞术,系统阐明了SPP1+巨噬细胞(特别是单核来源巨噬细胞)在混合磨玻璃结节恶性转化中的核心作用,并提出了靶向SPP1巨噬细胞的治疗新策略 研究主要基于观察性数据和体外/体内实验,尚未在临床治疗中验证SPP1抑制策略的有效性 探究混合磨玻璃结节向早期肺腺癌恶性转化的分子机制,特别是巨噬细胞在肿瘤微环境重塑中的作用 早期肺腺癌患者的混合磨玻璃结节组织、正常肺组织、肿瘤细胞系和异种移植瘤模型 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序, 多色免疫组化, 流式细胞术, 体外实验, 体内实验 异种移植瘤模型 单细胞转录组数据, 组织图像数据, 流式细胞数据, 临床预后数据 未明确样本数量,但包含正常肺组织、磨玻璃区域和实性区域的多组样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
390 2025-12-02
Exploring the mechanisms of protective effect of high-energy X-ray FLASH radiotherapy on intestine through multi omics analysis
2025-Nov-27, Radiation oncology (London, England)
研究论文 本研究通过多组学分析探讨高能X射线FLASH放疗对肠道的保护机制 首次结合宏基因组学、非靶向代谢组学和单细胞测序技术,系统揭示FLASH放疗通过重塑菌群-代谢物轴、减轻炎症反应和增强干细胞保护等多方面机制实现对肠道的保护作用 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;观察时间点限于照射后72小时,缺乏长期效应数据 探究高能X射线FLASH放疗对肠道的保护作用机制 CT26和MC38同源结肠癌小鼠模型及健康C57BL/6雌鼠的肠道组织和内容物 数字病理学 结肠癌 宏基因组分析, 非靶向代谢组学, 单细胞测序 NA 基因组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 CT26和MC38小鼠肿瘤模型及健康C57BL/6雌鼠的肠道样本 NA 宏基因组测序, 代谢组学分析, 单细胞RNA-seq NA NA
391 2025-12-02
Integrative single-cell transcriptomic and experimental analyses unveil Qihuang granule's protection against retinal photodamage via PI3K/AKT/mTOR-mediated autophagy
2025-Nov-27, The international journal of biochemistry & cell biology
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和实验分析,揭示了杞黄颗粒通过PI3K/AKT/mTOR介导的自噬途径保护视网膜免受光损伤的机制 首次结合单细胞RNA测序和实验验证,阐明杞黄颗粒在视网膜光损伤中的保护作用及其通过PI3K/AKT/mTOR信号通路调节自噬的具体分子机制 研究主要基于大鼠模型和ARPE-19细胞系,未涉及更复杂的人类临床样本或长期疗效评估 探究杞黄颗粒在视网膜光损伤中的保护作用及其分子机制 蓝光诱导视网膜损伤的大鼠模型和人类视网膜色素上皮细胞(ARPE-19) 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
392 2025-12-02
Sequencing-free whole-genome spatial transcriptomics at single-molecule resolution
2025-Nov-26, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文开发了一种名为RAEFISH的基于图像的空间转录组学方法,实现了全基因组覆盖和单分子分辨率,用于完整组织中的转录本空间分析 RAEFISH技术结合了反向锁式扩增子编码荧光原位杂交,提供了全基因组覆盖和单分子分辨率,克服了现有空间转录组学工具在转录组覆盖或空间分辨率上的限制 NA 开发一种高覆盖、高分辨率的空间转录组学技术,以无偏、无假设的方式在单细胞和组织切片中进行转录组分析 人类和小鼠组织中的转录本,包括天然和工程RNA,如引导RNA(gRNA) 空间转录组学 NA 反向锁式扩增子编码荧光原位杂交(RAEFISH),基于图像的CRISPR筛选 NA 图像数据 涉及23,000个人类基因或22,000个小鼠基因的转录本分析 NA 空间转录组学,单分子分辨率成像 NA RAEFISH技术配置,用于完整组织中的全基因组空间转录组分析
393 2025-12-02
High-resolution single-cell analyses reveal evolutionary constraints and evolvability of sexual circuits in Drosophila
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,分析了果蝇性行为神经回路在进化中的细胞和分子变化 首次在单细胞分辨率下揭示了果蝇性行为神经回路的进化保守性和可进化性,特别是神经肽信号通路的细胞类型特异性进化更替 研究仅针对果蝇属的四个物种,可能无法完全代表其他生物或更广泛的进化模式 探究神经回路如何进化以编码物种特异性行为,特别是性行为的进化机制 果蝇属四个物种的性行为神经回路中的doublesex阳性神经元 神经科学 NA 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据 涉及四个果蝇物种的doublesex阳性神经元 NA 单细胞RNA-seq NA NA
394 2025-12-02
Putative muscle stem cells promote Xenopus tail regeneration by modifying macrophage function via c1qtnf3
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析蝌蚪尾部再生过程中的侧群细胞,鉴定出假定的肌肉干细胞,并发现其通过表达c1qtnf3调控巨噬细胞功能以促进尾部再生 首次在蝌蚪尾部再生模型中揭示假定的肌肉干细胞通过c1qtnf3表达调控巨噬细胞功能的新机制 研究基于F0代CRISPR/Cas9嵌合体进行基因敲低,可能存在脱靶效应;未完全解析c1qtnf3调控巨噬细胞的具体分子通路 探究蝌蚪尾部再生过程中组织干细胞的行为动态及其调控机制 非洲爪蟾蝌蚪尾部再生模型中的侧群细胞及假定的肌肉干细胞 发育生物学 组织再生 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因敲低, 轨迹推断分析 NA 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
395 2025-12-02
Engineering a spatiotemporal macrophage circuit via STING phase separation to override immune suppression in pancreatic cancer
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究开发了一种基于STING相分离的时空巨噬细胞重编程平台,用于克服胰腺癌的免疫抑制微环境 首次利用STING相分离原理构建时空可控的巨噬细胞回路,实现巨噬细胞表型的顺序、可控重编程,同时防止过度炎症反应 研究目前处于临床前模型阶段,尚未进行人体临床试验 开发新型免疫治疗策略以克服胰腺癌的免疫抑制微环境 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 肿瘤免疫学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
396 2025-12-02
Single-cell transcriptomic analysis reveals the molecular alterations of endothelial cells during ageing
2025-Nov-24, Archives of gerontology and geriatrics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了年轻与年老主动脉中内皮细胞的分子变化,探讨血管老化的潜在机制 首次利用单细胞转录组技术系统比较年轻与年老主动脉内皮细胞的基因表达差异,并识别出AP-1和Egr1作为血管老化的关键转录因子 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源局限于主动脉,未涵盖其他血管类型;机制研究尚未通过体内实验证实 阐明血管老化过程中内皮细胞的分子变化机制 年轻与年老小鼠主动脉内皮细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 年轻组与年老组小鼠主动脉样本(具体数量未说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
397 2025-12-02
Reveal a risk and potential mechanism for keratoconus progression with isotretinoin: Toxicogenomic, transcriptomics and real-world evidence insights
2025-Nov-22, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过整合药物警戒数据与计算方法,揭示了异维A酸与圆锥角膜进展之间的关联及其潜在分子机制 首次结合药物警戒信号、网络毒理学、转录组学及单细胞转录组分析,系统性地识别了异维A酸诱导圆锥角膜的关键分子靶点 研究主要基于计算分析和现有数据库,缺乏直接的临床或动物实验验证 探究异维A酸使用与圆锥角膜进展之间的风险关联及其生物学机制 异维A酸相关的眼部不良事件数据、角膜细胞(基质细胞、上皮细胞、免疫细胞亚群)的基因表达 生物信息学 圆锥角膜 药物警戒分析、网络毒理学、转录组学、单细胞转录组分析、机器学习、分子对接与动力学模拟 随机森林、SVM-RFE、LASSO回归 文本报告数据、基因表达数据、蛋白质结构数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
398 2025-12-02
Single-cell transcriptomics reveals dynamic reprogramming of testicular immunity in Brucella-infected goat testis
2025-Nov-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了布鲁氏菌感染山羊睾丸中免疫系统的动态重编程过程 首次在单细胞水平上解析了布鲁氏菌感染下睾丸免疫微环境的转录变化,并识别了新的免疫治疗靶点如硫氧还蛋白相互作用蛋白 研究仅基于山羊模型,结果可能不完全适用于人类或其他物种,且机制验证需进一步实验 探究布鲁氏菌感染导致睾丸免疫病理的分子机制 山羊睾丸组织 数字病理学 布鲁氏菌病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 生理和感染条件下的山羊睾丸组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
399 2025-12-02
Multiomics and Single-Cell Insights Reveal a Lysophosphatidic Acid-Mediated Resistant Mechanism to Third-generation EGFR-TKI in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-Nov-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过多组学和单细胞分析揭示了非小细胞肺癌中第三代EGFR-TKI耐药的新机制,涉及溶血磷脂酸介导的信号通路和代谢重编程 首次整合血浆代谢组学、多组学分析和单细胞RNA测序,系统揭示了LPA介导的第三代EGFR-TKI耐药机制,并提出了靶向LPA信号通路的新治疗策略 研究主要基于细胞系和患者样本的回顾性分析,缺乏前瞻性临床试验验证靶向LPA通路的治疗效果 探究第三代EGFR-TKI在非小细胞肺癌中的耐药代谢机制 非小细胞肺癌患者血浆样本、耐药细胞系、单细胞RNA测序数据 数字病理学 肺癌 血浆代谢组学分析、单细胞RNA测序、多组学分析、功能实验 代谢物预测模型 代谢组数据、单细胞RNA测序数据、多组学数据 216份纵向血浆样本(来自186名患者)、215名患者的单细胞RNA测序数据、耐药细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
400 2025-12-02
Protocol for preparation of mouse synovium for flow cytometry and RNA-seq
2025-Nov-13, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种从小鼠滑膜制备单细胞悬浮液的实验方案,用于关节炎模型研究 该方案结合了关节炎诱导、细胞收获和单细胞悬浮液制备,并支持血管内标记,适用于多种下游分析 NA 开发一种标准化的小鼠滑膜单细胞悬浮液制备方法,以模拟关节炎中的无菌炎症 小鼠滑膜细胞 数字病理学 关节炎 RNA-seq, 流式细胞术, FACS NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
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