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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-06-20 |
Single cell and multi-omics analysis reveal senescence-related molecular subtypes and a prognostic signature in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04674-1
PMID:41770477
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研究论文 | 通过单细胞和多组学分析,揭示了透明细胞肾细胞癌中与衰老相关的分子亚型并构建了预后风险评分模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征ccRCC中细胞衰老的特征,并基于随机生存森林构建了具有强预后价值的风险评分模型,同时鉴定出ALDH18A1作为潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究中使用的数据来自公共数据库,缺乏多中心前瞻性队列验证;另外,SASP特征的评估可能受限于现有数据的分辨率和选择偏差 | 阐明透明细胞肾细胞癌中细胞衰老的全面特征及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌患者样本和组织细胞系 | 计算机视觉 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA-KIRC队列537例,E-MTAB-1980队列101例,CPTAC-ccRCC队列105例,以及两个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 382 | 2026-06-20 |
Identification of PANoptosis-related genes in lung cancer and investigation of their role mechanisms in the immune microenvironment
2026-Feb-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04739-1
PMID:41760846
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研究论文 | 整合批量与单细胞RNA-seq数据,鉴定肺癌中PANoptosis相关基因,并探讨其在肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 首次系统鉴定并验证了与PANoptosis相关的八个关键基因(DAPK2、CAV1、PDK4、IL3RA、NOTCH1、CHMP4B、IRAK1、SFN)在肺癌中的异常表达,并揭示CHMP4B和IRAK1在调控肿瘤免疫微环境中的新作用 | 结果主要基于公开数据库的转录组数据分析,缺乏大规模前瞻性临床样本验证;机制研究尚处于生物信息学预测和初步实验验证阶段,未深入阐明分子调控网络 | 揭示PANoptosis相关基因在肺癌发生发展中的作用,并评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺癌患者肿瘤组织和正常对照组织;肺癌细胞系;TCGA和GEO数据库中的转录组数据 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,qPCR,免疫组化 | NA | 基因表达数据,图像 | 肺癌细胞系及临床组织标本(具体数量未在摘要中明确) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 383 | 2026-06-20 |
Dominant intragraft plasma cells targeting bilirubin implicate local heme catabolism in human cardiac allograft vasculopathy
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194138
PMID:41289018
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白基因分析,发现心脏移植物血管病变中占主导的移植物内浆细胞靶向胆红素,揭示了局部血红素分解代谢在病变发展中的作用 | 首次发现并证明心脏移植物血管病变中,移植物内浆细胞克隆产生的抗体主要靶向胆红素,并关联局部血红素分解代谢途径 | 未在文中明确提及研究局限性 | 探讨心脏移植物血管病变中移植物内浆细胞反应的抗原驱动因素及其在病变发病机制中的作用 | 心脏移植后发生血管病变的患者心脏外植体及其中浸润的免疫细胞 | 免疫学 | 心脏移植血管病变 | 单细胞RNA测序, 免疫球蛋白基因谱分析, 重组抗体生成, 抗原筛选, 组织学分析 | NA | DNA测序数据, 组织图像, 抗体结合数据 | 37个来自移植物内浆细胞克隆的重组单克隆抗体和24个来自外周血浆细胞的对照抗体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白基因谱分析技术研究心脏移植血管病变患者样本 |
| 384 | 2026-06-20 |
CARD9-dependent macrophage plasticity regulates effective fungal clearance
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188827
PMID:41329515
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研究论文 | 研究CARD9缺陷如何通过调节巨噬细胞可塑性影响真菌清除效率 | 揭示CARD9缺陷通过NF-κB/CREB/C/EBPβ通路促进TREM2hi巨噬细胞分化,导致Th1细胞耗竭和抗真菌功能受损,并发现靶向TREM2可增强抗真菌免疫反应 | 未提及具体局限性 | 阐明CARD9缺陷导致慢性真菌感染的细胞机制 | 小鼠和人类皮肤样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 385 | 2026-06-20 |
Vinculin influences essential processes in enteric nervous system development and Hirschsprung disease pathogenesis
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198531
PMID:41364504
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研究论文 | 探究Vinculin在肠神经系统发育和Hirschsprung病发病机制中的关键作用 | 首次发现Vinculin突变与Hirschsprung病关联,并通过体内外实验揭示其对ENS发育和肠-间充质相互作用的调控机制 | 未明确说明限制 | 阐明Vinculin在肠神经系统发育中的作用及其与Hirschsprung病的关系 | 肠神经系统发育和Hirschsprung病相关基因与细胞相互作用 | 机器学习(应用于单细胞和空间转录组学数据分析) | Hirschsprung病 | 全基因组测序、体外实验、单细胞转录组学、空间RNA-seq | NA | 基因测序数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 人类HSCR患者样本(4个VCL突变)、神经嵴特异性Vcl敲除小鼠、Ptn敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 386 | 2026-06-20 |
TNF superfamily member 14 drives post-influenza depletion of alveolar macrophages, enabling secondary pneumococcal pneumonia
2026-01-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI185390
PMID:41252214
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研究论文 | 该研究发现肿瘤坏死因子超家族成员14(TNFSF14)是流感病毒感染后肺泡巨噬细胞减少的关键驱动因子,从而促进继发性肺炎球菌肺炎的发生 | 首次揭示TNFSF14配体/受体轴在流感后肺泡巨噬细胞耗竭中的驱动作用,并证明通过基因修饰的肺泡巨噬细胞移植或抗体中和可减轻疾病严重程度 | NA | 阐明流感病毒感染后组织驻留肺泡巨噬细胞(TR-AM)减少的分子机制,并确定治疗靶点 | 甲型流感病毒感染和流感-肺炎链球菌共感染的体内模型,以及严重病毒性急性呼吸窘迫综合征患者 | NA | 肺炎球菌肺炎,流感诱导的肺损伤 | 单细胞转录组学,细胞特异性PCR分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2026-06-20 |
Clonal hematopoiesis activates procalcific pathways in macrophages and promotes aortic valve stenosis
2026-01-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI171634
PMID:41252200
|
research paper | 研究发现克隆性造血通过激活巨噬细胞中的促钙化通路促进主动脉瓣狭窄 | 首次揭示克隆性造血(特别是TET2突变)在主动脉瓣狭窄发病机制中的直接作用,并阐明了OSM信号因子的关键角色 | NA | 研究克隆性造血在主动脉瓣狭窄发病中的作用机制 | 克隆性造血患者、主动脉瓣狭窄患者、Tet2基因敲除小鼠 | machine learning | cardiovascular disease | meta-analysis, single-cell RNA-seq, 基因沉默 | NA | NA | 来自All of Us、BioVU和UK Biobank的多个队列的患者数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 388 | 2026-06-20 |
Integrative single-cell transcriptomic and experimental analyses unveil Qihuang granule's protection against retinal photodamage via PI3K/AKT/mTOR-mediated autophagy
2026-01, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106881
PMID:41318054
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学与实验分析,揭示芪黄颗粒通过PI3K/AKT/mTOR介导的自噬保护视网膜光损伤的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术从细胞异质性角度解析传统中药芪黄颗粒保护视网膜光损伤的分子机制,聚焦于PI3K/AKT/mTOR信号通路与自噬的调控关系 | 未明确指出局限性 | 探究芪黄颗粒对视网膜光损伤的保护作用及其潜在分子机制 | 蓝光诱导视网膜损伤大鼠模型和ARPE-19细胞模型 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序、Western blot、qPCR | NA | 单细胞转录组数据、蛋白表达数据、基因表达数据 | 大鼠模型和ARPE-19细胞模型(具体数量未详述) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 389 | 2026-06-20 |
Workshop Introduction: Advances of AI Methods in Single Cell Spatial Omics
2026, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
DOI:10.1142/9789819824755_0061
PMID:41758189
|
研讨会介绍 | 介绍单细胞空间组学中人工智能方法的最新进展 | 强调AI和机器学习在空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学中的前沿应用,涵盖数据整合、细胞间相互作用建模以及疾病和精准医学的转化应用 | 未明确提及具体局限 | 展示AI方法在单细胞空间组学中的最新发展及其在疾病和精准医学中的应用 | 单细胞空间组学中的AI和机器学习方法 | 机器学习 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 390 | 2026-06-20 |
Molecular glue degrader function of SPOP inhibitors enhances STING-dependent immunotherapy efficacy in melanoma models
2025-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191772
PMID:41148213
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研究论文 | 揭示SPOP抑制剂通过分子胶降解STING和CBX4增强黑色素瘤免疫治疗疗效的机制 | 首次发现SPOP抑制剂具有分子胶降解剂功能,可重定向SPOP降解新底物CBX4,激活STING依赖的先天免疫 | 研究主要基于小鼠模型,需在人类样本中验证SPOP抑制剂的临床转化潜力 | 探索SPOP E3连接酶在肿瘤免疫中的角色及其抑制剂作为免疫治疗增敏剂的潜力 | 黑色素瘤细胞系、B16小鼠肿瘤模型、CAR.CD19-T细胞治疗模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | B16肿瘤模型小鼠(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台用于单细胞RNA-seq分析 |
| 391 | 2026-06-20 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies oxidative stress signatures of radiation-induced lung injury in mice through machine learning
2025-12, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106863
PMID:40967560
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研究论文 | 整合批量RNA测序和单细胞RNA测序,通过机器学习识别小鼠放射性肺损伤的氧化应激标志 | 首次结合批量与单细胞RNA测序及多种机器学习算法(随机森林、支持向量机),系统筛选出放射性肺损伤中与氧化应激相关的五个关键基因(Stk4、Aaas、Ets1、Sesn2、Kit),并构建了高准确率的诊断模型 | 研究基于小鼠模型,结果需进一步在人类样本中验证;未探讨五个关键基因在临床样本中的表达及功能 | 系统分析放射性肺损伤中与氧化应激相关的分子特征,筛选可用于早期诊断和靶向干预的生物标志物及分子机制 | 放射性肺损伤小鼠模型 | 机器学习 | 放射性肺损伤 | RNA测序、单细胞RNA测序、RT-PCR、免疫组化 | 随机森林、支持向量机、LASSO回归 | 基因表达数据 | 未明确样本数量,涉及小鼠批量与单细胞样本 | 未提供 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 392 | 2026-06-20 |
Irf4 participates in benzene-induced hematopoietic senescence through mitochondrial ROS-dependent BCAA catabolism
2025-12, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2025.154271
PMID:40885242
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研究论文 | 该研究揭示了Irf4通过线粒体ROS依赖的支链氨基酸分解代谢参与苯诱导的造血衰老 | 首次从代谢和衰老角度揭示环境剂量苯通过Irf4介导的支链氨基酸代谢异常导致造血干细胞损伤的分子机制 | NA | 探究苯暴露是否通过诱导细胞衰老造成造血损伤,以及其分子机制 | 雄性C57BL/6J小鼠和FDC-P1小鼠造血祖细胞系 | NA | 造血损伤、苯中毒 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 小鼠暴露于0、10、50 ppm苯蒸气12周;细胞暴露于0、5、10 μM 1,4-BQ 24小时 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 393 | 2025-12-23 |
Correction to "Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema"
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70723
PMID:41424021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2026-06-20 |
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-11-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190635
PMID:41178716
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研究论文 | 该研究揭示了脂肪细胞死亡通过促进S100A8+巨噬细胞浸润肝脏,进而驱动肝细胞脂质储存并加剧代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)进展的机制 | 首次发现脂肪细胞死亡后产生的S100A8+巨噬细胞通过抑制CCN3、上调CD36促进肝细胞脂质积累,为MASLD进展提供了新的细胞和分子机制 | 研究仅在动物模型中进行,缺乏人类样本验证;未明确S100A8+巨噬细胞与CCN3抑制之间的完整信号通路细节 | 探究脂肪细胞死亡后介导肝细胞脂肪储存并触发MASLD进展的额外信号 | 高脂饮食喂养的小鼠模型及基因修饰小鼠 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq | NA | 序列数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 395 | 2026-06-20 |
Macrophage EHD1 promotes inflammation and stabilizes sortilin to accelerate atherosclerosis
2025-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684958
PMID:41279772
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研究论文 | 该研究揭示了巨噬细胞中EHD1蛋白通过促进炎症反应和稳定分拣蛋白(sortilin)加速动脉粥样硬化的作用机制 | 首次发现EHD1在巨噬细胞中通过调控TNFR2内吞循环和稳定retromer的逆向运输货物sortilin来促进炎症反应,从而加速动脉粥样硬化进展 | 未提及 | 探索EHD1在巨噬细胞免疫反应中的作用及其对动脉粥样硬化进展的贡献 | 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 机器学习 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类斑块样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 396 | 2026-06-20 |
Single-cell sequencing reveals distinct peripheral immune responses in anti-MDA5 antibody positive dermatomyositis with rapidly progressive interstitial lung disease
2025-10-08, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03639-z
PMID:41063280
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序揭示抗MDA5抗体阳性皮肌炎伴快速进展间质性肺病的外周免疫反应特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示MDA5+ DM伴RPILD患者外周血单个核细胞的免疫景观,发现抗病毒反应增强和MHC-II信号通路在CD4+幼稚T细胞中缺失 | 样本量较小(每组3-4例),且仅为外周血样本分析,未涉及组织或纵向时间点研究 | 探索MDA5+ DM伴RPILD的外周免疫机制,寻找潜在治疗靶点 | 抗MDA5抗体阳性皮肌炎伴快速进展间质性肺病患者 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病(皮肌炎伴间质性肺病) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例(4例RPILD,3例非RPILD,3例健康对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 397 | 2026-06-20 |
UBE2D1 as a key biomarker in systemic juvenile idiopathic arthritis: a new perspective on diagnosis and disease activity assessment
2025-07-09, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03606-8
PMID:40635084
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序,发现UBE2D1可作为全身型幼年特发性关节炎的新型诊断和疾病活动性评估生物标志物 | 首次揭示UBE2D1在全身型幼年特发性关节炎经典单核细胞中的高表达与疾病活动性密切相关,并阐明其通过激活NLRs通路介导疾病进展的分子机制 | 研究结论尚需更多独立队列和功能实验进一步验证 | 识别用于全身型幼年特发性关节炎早期诊断和疾病活动性评估的非侵入性生物标志物 | 中国全身型幼年特发性关节炎患者外周血中的单核细胞 | 机器学习 | 儿童风湿性疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自中国全身型幼年特发性关节炎队列的外周血单个核细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 398 | 2026-06-20 |
Enhanced cytotoxicity of aging associated NKG2C + CD8 + T cells in ankylosing spondylitis via HLA-B27
2025-06-14, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03585-w
PMID:40517268
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研究论文 | 本研究探讨了强直性脊柱炎中与衰老相关的NKG2C+ CD8+ T细胞通过HLA-B27增强细胞毒性的机制 | 首次揭示衰老相关NKG2C+ CD8+ T细胞在强直性脊柱炎发病中的角色,并验证HLA-B27通过PI3K-Akt信号通路驱动其细胞毒性,提出NKG2C抑制作为新型治疗策略 | 未详细描述样本量统计功效、细胞亚群功能验证的局限性或动物模型与人类疾病的差异 | 探索强直性脊柱炎与衰老的共同机制,寻找潜在治疗靶点 | 强直性脊柱炎患者外周血免疫细胞、胶原诱导关节炎小鼠模型、HLA-B27转基因小鼠 | 机器学习 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 多维流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 87例强直性脊柱炎患者及匹配对照 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 399 | 2026-06-20 |
CD200-based cell sorting results in homogeneous transplantable striatal neuroblasts for human cell therapy for Huntington's disease
2025-06-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106905
PMID:40220917
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研究论文 | 通过基于CD200的细胞分选获得同质性纹状体神经母细胞,用于亨廷顿病的人类细胞治疗 | 首次发现CD200作为人类纹状体神经母细胞的表面标志物,并建立基于CD200的免疫磁珠分选流程,实现高产量富集,减少了细胞异质性和批次差异 | 研究仅在小鼠模型中验证移植效果,缺乏人类临床试验数据 | 开发一种减少异质性并提高移植安全性的细胞分选策略,用于神经退行性疾病的细胞替代治疗 | 人类多能干细胞分化的纹状体神经母细胞 | 机器学习 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 400 | 2026-06-20 |
Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema
2025-06, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70485
PMID:40546220
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示高原脑水肿后认知下降中少突胶质细胞-神经元相互作用的新机制 | 首次揭示了高原脑水肿后认知障碍与核糖体应激、氧化磷酸化失调以及神经活性配体-受体相互作用受损的关联,并鉴定出PI3K/mTOR动态、Rps29-bax轴和Tnfrsf21-App为新型调控因子和潜在治疗靶点 | 文中未明确提及限制条件 | 阐明高原脑水肿导致认知下降的细胞和分子机制 | 暴露于低压低氧(模拟海拔6000米)的HACE小鼠模型的海马组织细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | HACE小鼠模型,分别在暴露后3天和7天收集海马组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |