单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
381	2025-06-14	Exploring the role of neutrophils in inflammatory pain hypersensitivity via single-cell transcriptome profiling 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1552993 PMID:40503232	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索了中性粒细胞在炎症性疼痛超敏反应中的作用及其机制	首次使用scRNA-seq技术分析术后和CFA诱导炎症中CD11b+细胞的组成，并发现CXCR2抑制剂NAMO通过抑制中性粒细胞分化成熟缓解疼痛	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证	探索中性粒细胞在炎症性疼痛中的作用及潜在治疗靶点	小鼠术后和CFA诱导的炎症模型中的CD11b+细胞	单细胞转录组学	炎症性疼痛	scRNA-seq, 蛋白质组学分析	小鼠炎症模型	单细胞转录组数据	未明确说明样本量，但使用小鼠模型
382	2025-06-14	Identification of mitophagy-related biomarkers in severe acute pancreatitis: integration of WGCNA, machine learning algorithms and scRNA-seq 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1594085 PMID:40503237	研究论文	本研究通过整合WGCNA、机器学习算法和scRNA-seq技术，识别了严重急性胰腺炎(SAP)中与线粒体自噬相关的关键基因MAPK14，并初步验证了其在SAP炎症调控中的作用	首次将WGCNA、机器学习算法和scRNA-seq技术相结合，系统性地识别SAP中与线粒体自噬相关的关键基因MAPK14，并阐明其通过调控巨噬细胞介导炎症的潜在机制	研究主要基于生物信息学分析，动物模型验证尚属初步阶段，需要进一步实验验证MAPK14的具体作用机制	探究线粒体自噬在严重急性胰腺炎发病机制中的作用，寻找潜在治疗靶点	严重急性胰腺炎患者和小鼠模型	生物信息学	胰腺炎	WGCNA, 机器学习算法, scRNA-seq, ssGSEA	机器学习算法(未指定具体模型)	基因表达数据	GSE194331和GSE279876数据集(未明确样本数量)，SAP小鼠模型
383	2025-06-14	Corrigendum: Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1629322 PMID:40510421	correction	该文章是对先前发表的一篇关于Inonotus obliquus（桦褐孔菌）改善叶酸诱导的小鼠肾纤维化研究的更正	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
384	2025-06-14	A sexually dimorphic hepatic cycle of periportal VLDL generation and subsequent pericentral VLDLR-mediated re-uptake 2024-09-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52751-2 PMID:39341814	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肝脏中性别、空间和时间对异源物质解毒和脂蛋白代谢的显著影响，并发现了一种性别二态性的肝循环机制	首次揭示了性别二态性如何影响肝脏的时空功能逻辑，特别是在VLDL生成和再摄取方面的性别差异	研究主要基于小鼠模型，人类数据相对有限	探究性别二态性对肝脏功能时空逻辑的影响	小鼠和人类肝脏	分子生物学	心血管疾病	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，但涉及小鼠和人类肝脏样本
385	2025-06-14	Hypoxia induces ROS-resistant memory upon reoxygenation in vivo promoting metastasis in part via MUC1-C 2024-09-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51995-2 PMID:39341835	research paper	该研究探讨了缺氧条件下乳腺癌细胞如何通过MUC1-C促进转移的机制	揭示了缺氧诱导的ROS抵抗记忆在再氧合过程中促进转移的新机制，特别是通过MUC1-C的作用	研究主要基于动物模型和体外实验，临床应用的直接证据仍需进一步验证	研究缺氧如何通过MUC1-C促进乳腺癌转移	乳腺癌细胞和循环肿瘤细胞(CTCs)	癌症生物学	乳腺癌	空间转录组学	动物模型和患者来源的异种移植模型	基因表达数据和细胞表型数据	未明确说明具体样本数量，但涉及动物模型和患者来源的异种移植模型
386	2025-06-14	Introducing synthetic thermostable RNase inhibitors to single-cell RNA-seq 2024-09-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52717-4 PMID:39333520	研究论文	本文介绍了一种合成热稳定RNase抑制剂（SEQURNA）在单细胞RNA测序中的应用，证明其性能优于常用的蛋白质重组RNase抑制剂（RRIs）	提出了一种新型合成热稳定RNase抑制剂，相比传统RRIs在重现性、通量和实验流程上具有独特优势，并能减少干冰运输需求	未提及具体样本量或实验规模限制	改进单细胞转录组学中的RNase抑制技术	合成热稳定RNase抑制剂（SEQURNA）与蛋白质重组RNase抑制剂（RRIs）	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	NA
387	2025-06-14	The chemokine receptor CXCR3 promotes CD8+ T cell-dependent lung pathology during influenza pathogenesis 2024-01-05, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adj1120 PMID:38170765	research paper	研究探讨了CXCR3趋化因子受体在流感发病过程中对CD8+ T细胞依赖性肺病理的促进作用	通过单细胞RNA测序分析揭示了CD8+ T细胞亚群在流感感染期间的多样性，并发现CXCR3阻断可以减轻肺损伤而不影响病毒清除	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探索CD8+ T细胞在流感控制与肺病理中的双重作用及CXCR3的潜在治疗价值	流感感染的小鼠肺组织中的CD8+ T细胞	免疫学	流感	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	流感感染的小鼠模型
388	2025-06-14	Comprehensive single-cell analysis demonstrates radiotherapy-induced infiltration of macrophages expressing immunosuppressive genes into tumor in esophageal squamous cell carcinoma 2023-12-15, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adh9069 PMID:38091397	研究论文	通过综合空间和单细胞分析，研究了放疗后食管鳞状细胞癌中免疫细胞的浸润及其基因表达变化	揭示了放疗后肿瘤中表达免疫抑制基因的巨噬细胞的浸润动态，并识别了潜在的免疫治疗靶点	研究样本可能有限，且未涉及放疗与免疫治疗联合应用的具体临床效果	探索放疗后食管鳞状细胞癌中的免疫反应特征，以指导个性化免疫治疗	食管鳞状细胞癌患者放疗后的肿瘤组织	数字病理学	食管鳞状细胞癌	CODEX, VISIUM, 单细胞RNA测序	NA	图像, 转录组数据	未明确说明样本数量
389	2025-06-14	Opsonization-independent antigen-specific recognition by myeloid phagocytes expressing monoclonal antibodies 2023-09, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adg1812 PMID:37656789	研究论文	本文介绍了一种新型的先天免疫细胞，称为“可变免疫受体表达髓系细胞”（VIREMs），并展示了它们在抗原特异性识别中的独特功能	发现了VIREMs这一新型先天免疫细胞，它们能够重组并表达抗体基因，这是B淋巴细胞的独有特征	研究尚未深入探讨VIREMs在其他疾病模型中的功能及其潜在的治疗应用	探索先天免疫细胞在抗原特异性识别和组织维护中的新功能	可变免疫受体表达髓系细胞（VIREMs）	免疫学	NA	单细胞转录组学、全基因组表观遗传分析、活细胞成像	NA	单细胞数据、活细胞成像数据	健康个体的血液样本
390	2025-06-14	Reprogramming Müller glia to regenerate ganglion-like cells in adult mouse retina with developmental transcription factors 2022-11-25, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.abq7219 PMID:36417510	研究论文	研究通过转录因子重编程Müller胶质细胞，在成年小鼠视网膜中再生类似神经节细胞的神经元	首次在成年哺乳动物视网膜中通过特定转录因子组合重编程Müller胶质细胞，再生出功能性的神经节样细胞	研究仅在成年小鼠模型中进行，尚未验证在人类或其他哺乳动物中的效果	探索通过转录因子重编程实现成年哺乳动物中枢神经系统神经元再生的可能性	成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞和再生的神经节样细胞	神经再生	青光眼	免疫组织化学、单细胞RNA测序、单细胞转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)和电生理学	NA	基因表达数据、电生理数据	转基因小鼠模型
391	2025-06-13	Loss of Plxdc2 exacerbates microglia-mediated neuroinflammation and ischemic brain injury 2025-Sep, Experimental neurology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115302 PMID:40345569	研究论文	本研究探讨了Plxdc2在调节小胶质细胞活化和缺血性脑损伤中的作用	首次揭示了Plxdc2在小胶质细胞稳态维持和缺血性脑损伤中的保护作用，并发现其通过调节NF-κB p65信号和脂质代谢发挥作用	研究主要基于动物模型，尚未在人类患者中进行验证	探究Plxdc2在小胶质细胞功能和缺血性脑损伤中的作用	小胶质细胞和缺血性脑损伤	神经科学	缺血性脑卒中	scRNA-seq, 转录组分析, AAV和慢病毒载体技术	动物模型	基因表达数据	NA
392	2025-06-13	Microglial colonization routes and their impacts on cellular diversity 2025-Jul, Neuroscience research IF:2.4Q3 DOI:10.1016/j.neures.2025.04.004 PMID:40288616	review	本文探讨小胶质细胞在脑发育过程中的多样性形成机制，重点关注其不同的定植路线	综述了小胶质细胞多样性的两种可能形成机制，特别强调了不同定植路线的影响	主要关注理论假设，缺乏实验验证数据	探索小胶质细胞多样性形成的机制	小胶质细胞	神经科学	NA	单细胞转录组学	NA	NA	NA
393	2025-06-13	Insights into Keratinocyte and Immunologic Landscape in Cutaneous Graft-Versus-Host Disease through Single-Cell Transcriptomics 2025-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health DOI:10.1016/j.xjidi.2025.100373 PMID:40492027	研究论文	通过单细胞转录组学揭示皮肤移植物抗宿主病（GVHD）中角质形成细胞和免疫细胞的复杂反应	首次使用单细胞RNA测序技术比较慢性GVHD与健康对照样本的转录组，揭示了角质形成细胞和免疫细胞的非免疫和免疫学变化	研究样本量未明确说明，可能限制结果的普遍性	探讨皮肤GVHD的发病机制，特别是角质形成细胞和其他皮肤结构细胞的作用	慢性GVHD患者的表皮和真皮样本与健康对照样本	单细胞转录组学	皮肤移植物抗宿主病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
394	2025-06-13	Spatial transcriptomics of progression gene signature and tumor microenvironment leading to progression in mycosis fungoides 2025-Jun-24, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024014495 PMID:40163757	研究论文	本研究通过空间转录组学分析了蕈样肉芽肿（MF）进展过程中的基因特征和肿瘤微环境变化	首次利用CD3、CD4和CD30形态标记进行空间分辨转录组分析，揭示了MF从斑片期到斑块期再到肿瘤期进展过程中的关键基因表达变化和肿瘤微环境特征	样本量相对有限，且仅针对MF这一特定类型的皮肤T细胞淋巴瘤进行研究	探索MF进展过程中的转录组表达变化和肿瘤微环境特征，以识别早期MF患者进展的风险因素	蕈样肉芽肿（MF）患者	数字病理学	皮肤T细胞淋巴瘤	空间转录组学分析，免疫组织化学染色	NA	转录组数据，免疫组织化学数据	未明确说明具体样本数量，但包括不同阶段的MF患者样本
395	2025-06-13	SOAR elucidates biological insights and empowers drug discovery through spatial transcriptomics 2025-Jun-13, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adt7450 PMID:40498826	研究论文	介绍了一个名为SOAR的空间转录组学平台，该平台整合了3461个样本的数据，用于生物发现和药物研发	SOAR平台首次系统地整合了多种空间转录组学技术的数据，揭示了巨噬细胞极性在肿瘤微环境中的作用，并发现了潜在的抗癌药物	未明确提及样本的多样性是否足够覆盖所有相关疾病类型或技术平台	通过空间转录组学数据促进生物发现和药物研发	3461个样本，涵盖13个物种、42种组织类型和19种空间转录组学技术	空间转录组学	肿瘤和溃疡性结肠炎	空间转录组学技术	NA	基因表达和位置数据	3461个样本
396	2025-06-13	Current concepts in the pathogenesis and clinical management of lymphangioleiomyomatosis 2025-Jun-13, Current opinion in pulmonary medicine IF:2.8Q2 DOI:10.1097/MCP.0000000000001185 PMID:40501369	review	本文综述了淋巴管平滑肌瘤病（LAM）的发病机制和临床管理的最新进展，包括病理机制的理解、新型治疗方法以及未来诊断和治疗方向	探讨了激素途径、免疫系统相互作用、mTOR信号抑制及LAM微环境在联合治疗中的作用，以及单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术在LAM研究中的应用	NA	总结LAM研究的最新进展，推动从基础研究到靶向治疗的转化	淋巴管平滑肌瘤病（LAM）及其相关病理机制和治疗方法	NA	淋巴管平滑肌瘤病	单细胞RNA测序、空间转录组学、人工智能	NA	NA	NA
397	2025-06-13	NOTCH1 dimeric signaling is essential for T-cell leukemogenesis and leukemia maintenance 2025-Jun-12, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027020 PMID:40009499	research paper	该研究揭示了NOTCH1二聚体信号在T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）发生和维持中的关键作用	发现了NOTCH1二聚体信号依赖的基因特征，包括HES4转录因子，并揭示了其在T-ALL细胞中的抗凋亡机制	研究主要基于合成模型和患者来源的异种移植模型，临床样本的直接验证有限	探究NOTCH1二聚体信号在T-ALL发生和维持中的作用机制	人类造血干细胞/祖细胞（HSPCs）和T-ALL细胞	肿瘤生物学	T细胞急性淋巴细胞白血病	RNA/染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、测序数据	脐带血来源的HSPCs和患者来源的T-ALL异种移植模型
398	2025-06-13	Triggering Mechanisms of Hepatocyte Repopulation during liver Regeneration 2025-Jun-12, Biomolecules & therapeutics IF:3.0Q2 DOI:10.4062/biomolther.2025.035 PMID:40500106	review	本文综述了肝再生过程中肝细胞再生的触发机制及其分子和细胞机制	总结了利用谱系追踪和空间转录组学等先进技术研究肝细胞再生来源的最新发现	再生肝细胞的确切来源仍存在争议	阐明肝再生过程中肝细胞增殖的触发机制及新生肝细胞的来源	肝细胞再生过程	NA	NA	谱系追踪, 空间转录组学	NA	NA	NA
399	2025-06-13	Disruption of Morrbid alleviates autoinflammatory osteomyelitis in Pstpip2-deficient mice 2025-Jun-12, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052176 PMID:40503910	研究论文	本研究探讨了Morrbid基因在Pstpip2缺陷小鼠中缓解自身炎症性骨髓炎的作用	发现Morrbid与Pstpip2在成熟髓系细胞中共表达，并证实Morrbid缺失能显著抑制CRMO症状的起始和进展	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究Morrbid基因在慢性复发性多灶性骨髓炎(CRMO)中的致病机制及潜在治疗靶点	Pstpip2缺陷小鼠模型	免疫学	骨髓炎	单细胞转录组分析	小鼠基因敲除模型	基因表达数据	Pstpip2-/-和Pstpip2-/-Morrbid-/-复合突变小鼠
400	2025-06-13	How single-cell transcriptomics of Hydractinia is informing the evolution of cnidarian sensory systems 2025-Jun-12, Integrative and comparative biology IF:2.2Q1 DOI:10.1093/icb/icaf090 PMID:40504553	研究论文	本文探讨了利用单细胞转录组学技术研究水螅（Hydractinia）感觉系统的进化	更新了水螅成虫的单细胞转录组图谱，探索了细胞生物学和细胞类型表达谱，并验证了细胞类型特异性标记的空间表达模式	NA	深入了解水螅感觉系统的进化及其细胞生物学	水螅（Hydractinia）的细胞类型和感觉系统	生物信息学	NA	单细胞转录组学、CRISPR/Cas9基因敲除、shRNA敲低、合成RNA过表达	NA	转录组数据	两种水螅物种（H. symbiolongicarpus和H. echinata）的实验室克隆系