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当前共找到 35396 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 381 | 2026-01-16 |
Single-cell transcriptome analysis reveals regulatory programs of prognosis-associated RNA binding proteins during LIHC development
2025-Dec-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04088-z
PMID:41351009
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了与肝细胞癌预后相关的RNA结合蛋白在肿瘤发展过程中的调控程序 | 首次在单细胞水平系统解析了肝细胞癌中RNA结合蛋白的异质性及其调控网络，并鉴定出HDGF作为关键的致癌性RNA结合蛋白，关联了其与选择性剪接事件的关系 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内动物模型验证；单细胞数据样本量有限，且未涵盖所有HCC亚型 | 探究肝细胞癌中RNA结合蛋白的单细胞水平异质性、调控作用及其治疗潜力 | 肝细胞癌肿瘤组织、恶性细胞群、髓系来源细胞群 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，体外功能验证 | NMF算法，单细胞转录组分析 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 基于TCGA-LIHC队列数据，具体单细胞样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 382 | 2026-01-16 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics to develop an efferocytosis-related prognostic model for lung adenocarcinoma and validate the key gene LDHA
2025-Dec-04, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03622-z
PMID:41345972
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞转录组学，构建了一个与胞葬作用相关的肺腺癌预后模型，并验证了关键基因LDHA的功能 | 首次整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，构建了基于胞葬作用相关基因的肺腺癌预后模型，并通过实验验证了LDHA在调控肿瘤相关巨噬细胞极化及促进肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要更多前瞻性临床队列验证；体外实验未能完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 识别肺腺癌中与胞葬作用相关的预后基因和潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者、肿瘤相关巨噬细胞、LUAD细胞系 | 生物信息学、肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, 伪时间轨迹分析, 细胞通讯分析, 体外功能实验 | 预后模型（四基因特征）, 机器学习（LASSO回归） | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 来自UCSC Xena和GEO数据库的肺腺癌患者bulk RNA-seq数据，以及scRNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 383 | 2026-01-16 |
The multifaceted role of SQSTM1/p62 in disc degeneration: A master regulator of cellular stress responses
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102222
PMID:40933658
|
综述 | 本文综述了SQSTM1/p62蛋白在椎间盘退变中的多面性作用，包括其调控自噬、氧化应激、炎症和程序性细胞死亡等多种细胞应激反应通路 | 系统总结了SQSTM1/p62作为细胞应激反应主调控因子在椎间盘退变中的核心作用，并提出了其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 精确调控SQSTM1活性仍面临挑战，且相关研究发现向临床治疗转化存在困难 | 阐明SQSTM1/p62在椎间盘退变发病机制中的作用，探索其作为治疗靶点的可能性 | SQSTM1/p62蛋白及其在椎间盘退变中的功能 | NA | 椎间盘退变 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 384 | 2026-01-16 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell alterations in patients with allergic rhinitis treated with Peiyuan Tong-qiao decoction
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102325
PMID:41323806
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了培元通窍汤治疗过敏性鼻炎患者时免疫细胞的变化及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术分析培元通窍汤治疗过敏性鼻炎患者前后外周血单个核细胞的免疫细胞变化，并探索细胞间通讯和转录因子调控网络 | 样本量可能有限，且仅基于外周血单个核细胞分析，未涉及局部组织如鼻黏膜的免疫细胞变化 | 探索传统中药培元通窍汤治疗过敏性鼻炎的作用机制 | 过敏性鼻炎患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 385 | 2026-01-16 |
Integration of single-cell and RNA-seq analysis reveals sepsis heterogeneity and prognostic significance of FCGR3A+ Macrophage subtypes
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102352
PMID:41332909
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，揭示了脓毒症免疫微环境的异质性，并识别了FCGR3A+巨噬细胞亚型在预后中的关键作用 | 通过整合单细胞与批量转录组数据，首次系统分析了脓毒症的免疫微环境异质性，并发现FCGR3A+巨噬细胞亚型在预后中的核心作用 | 样本量相对有限，且为回顾性分析，需要进一步前瞻性研究验证 | 分析脓毒症免疫微环境异质性并开发预后标志物 | 脓毒症患者 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | scVI算法, BayesPrism分析, StepCox + Ridge模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 53个单细胞RNA测序样本和479名脓毒症患者的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 386 | 2026-01-16 |
Elucidating cardiac fibroblasts heterogeneity and activation during experimental autoimmune myocarditis using spatial transcriptomics
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102344
PMID:41341993
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，探究了实验性自身免疫性心肌炎急性炎症期中心脏成纤维细胞的转录模式变化及其异质性 | 首次在实验性自身免疫性心肌炎模型中，通过空间转录组学解析了心脏成纤维细胞在急性炎症期的时空异质性及其与免疫细胞浸润的共定位关系 | 研究基于动物模型，其结果向人类疾病的转化需进一步验证；空间转录组学分辨率可能不足以完全区分所有细胞亚群 | 阐明实验性自身免疫性心肌炎急性炎症期心脏成纤维细胞的异质性、激活状态及其与免疫微环境的相互作用 | 实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型中的心脏组织 | 空间转录组学 | 心肌炎、扩张型心肌病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 1545个心脏成纤维细胞富集区域（其中657个以成纤维细胞为主） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 387 | 2026-01-16 |
ER Stress Ire1-Xbp1s Pathway Maintains Youthful Epidermal Basal Layer Through the Regulation of Cell Proliferation
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70258
PMID:41077712
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研究论文 | 本研究通过引入Ire1-Xbp1s内质网应激反应通路敏感报告基因到短寿命脊椎动物Nothobranchius furzeri中，揭示了该通路在维持年轻表皮基底层细胞增殖和皮肤老化中的作用 | 首次在Nothobranchius furzeri模型中利用Ire1-Xbp1s通路敏感报告基因，结合光隔离化学空间转录组学，发现了该通路通过激活细胞周期调节因子Vcp维持年轻表皮细胞增殖的新机制 | 研究主要基于短寿命脊椎动物模型，结果在人类或其他哺乳动物中的普适性尚需进一步验证 | 探究内质网应激反应在衰老过程中的时空调控和功能角色 | 短寿命脊椎动物Nothobranchius furzeri的表皮组织 | 空间转录组学 | 皮肤老化 | 光隔离化学空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 388 | 2026-01-16 |
Systematic analysis of the expression profiles and prognostic values of the FAM72 family in liver cancer
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102358
PMID:41378103
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析评估了FAM72家族成员在肝癌中的表达水平和预后意义 | 首次系统分析了FAM72A-D在肝癌中的表达谱和预后价值，并构建了基于FAM72的基因特征来预测肝癌患者预后 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；单细胞RNA测序结果仅提示FAM72A-D主要存在于增殖性T细胞中，具体机制未深入探讨 | 探究FAM72家族成员在肝癌中的表达模式、预后价值及其与肿瘤发生的关系 | 肝癌组织和正常组织中的FAM72A-D基因 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 389 | 2026-01-16 |
GPR68, A Proton-sensing GPCR, Mediates Acid-induced Visceral Nociception
2025-Nov-04, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101671
PMID:41197770
|
研究论文 | 本研究揭示了质子感知GPCR GPR68在结肠感觉神经元中的表达及其在酸诱导的结肠痛觉中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序发现GPR68在结肠伤害感受器中的表达，并验证其在酸诱导痛觉中的特异性介导作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证有限，且疾病模型为急性DSS结肠炎，慢性炎症情况未涉及 | 探究GPR68在酸诱导的结肠痛觉中的作用机制 | 结肠伤害感受器、背根神经节神经元、野生型和GPR68敲除小鼠、人类炎症性肠病组织 | 生物医学研究 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、钙成像、药理学研究 | NA | RNA测序数据、电生理记录、钙成像数据 | 野生型和GPR68敲除小鼠模型、人类炎症性肠病组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2026-01-16 |
MUSE: A Multi-slice Joint Analysis Method for Spatial Transcriptomics Experiments
2025-Nov, Proceedings of the ... ACM International Conference on Information & Knowledge Management. ACM International Conference on Information and Knowledge Management
DOI:10.1145/3746252.3761240
PMID:41527556
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MUSE的计算框架，用于处理大规模多切片空间转录组数据的联合嵌入、空间域识别和基因表达插补 | 开发了首个专门针对多切片空间转录组数据的联合分析框架，采用双模块架构（对齐模块和优化模块）结合最优传输和虚拟邻居生成技术，有效解决了跨切片不一致性和数据质量差异问题 | 方法性能在模拟和真实数据集上得到验证，但未提及对超大规模切片数量（如数百个切片）的扩展性测试 | 开发一个能够有效整合多切片空间转录组数据的计算框架，以提高跨切片一致性、空间域识别和基因表达插补的准确性 | 空间转录组数据，特别是来自同一组织或实验的多个连续或相关切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图模型，最优传输，联合嵌入框架 | 空间转录组数据（基因表达矩阵与空间坐标） | 12个真实数据集和48个模拟数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 391 | 2026-01-16 |
Single-cell analysis of Barrett's esophagus and carcinoma reveals cell types conferring risk via genetic predisposition
2025-Oct-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100980
PMID:40925382
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Barrett食管和食管腺癌，结合全基因组关联数据，揭示了与疾病风险相关的细胞类型和细胞过程 | 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联数据整合，识别出Barrett食管和食管腺癌发展中的特定细胞类型风险贡献，特别是肠化生细胞和柱状细胞分化过程 | 未明确探索所识别细胞类型和细胞过程标记物在食管腺癌预测中的具体诊断价值 | 确定Barrett食管和食管腺癌发展中涉及的细胞类型和遗传风险 | Barrett食管、食管腺癌及配对正常组织 | 单细胞组学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | Barrett食管、食管腺癌及配对正常组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 392 | 2026-01-16 |
Sensitive dissection of a genomic regulatory landscape using bulk and targeted single-cell activation
2025-Oct-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100984
PMID:40930101
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研究论文 | 本研究开发了一种名为TESLA-seq的新方法，结合CRISPRa筛选与靶向单细胞RNA测序，用于高灵敏度解析PHOX2B基因座中的增强子-基因调控关系 | 开发了TESLA-seq技术，首次将CRISPRa筛选与靶向单细胞RNA测序结合，实现了对数百个增强子并行调控效应的单细胞水平分析 | 研究主要聚焦于PHOX2B基因座，在其他基因组区域的普适性有待验证；实验系统可能无法完全模拟体内复杂调控环境 | 开发高分辨率方法以直接识别和功能扰动内源性增强子及其靶基因 | PHOX2B基因座及其周围的增强子调控元件 | 基因组学 | 神经母细胞瘤 | CRISPR激活筛选, 靶向单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2026-01-16 |
CD34+CLDN5+ tumor associated senescent endothelial cells through IGF2-IGF2R signaling increased cholangiocellular phenotype in hepatocellular carcinoma
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.008
PMID:39674501
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出肝细胞癌中与胆管细胞表型形成相关的特定衰老内皮细胞亚群，并揭示了其通过IGF2-IGF2R信号通路招募间充质干细胞促进肿瘤恶性进展的机制 | 首次在肝细胞癌中鉴定出CD34+CLDN5+衰老内皮细胞亚群，并阐明其通过分泌IGF2招募间充质干细胞、增强癌症干细胞样特性从而促进胆管细胞表型形成的全新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人类患者中的临床验证仍需进一步开展 | 阐明肝细胞癌中胆管细胞表型形成的细胞机制和分子通路 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的内皮细胞、间充质干细胞和肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 394 | 2026-01-16 |
Insulin-like growth factor binding protein 7 identified in aged dental pulp by single-cell RNA sequencing
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.018
PMID:39674503
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了年轻与衰老牙髓组织的异质性，并鉴定出衰老牙髓的新标记物IGFBP7，进一步探究了其在缓解细胞衰老中的作用机制 | 首次在单细胞水平上系统解析了年轻与衰老牙髓组织的细胞组成异质性，并发现IGFBP7作为衰老牙髓的新标记物，能减轻过氧化氢诱导的牙髓成纤维细胞衰老 | 需要更全面的研究来阐明IGFBP7影响牙髓衰老的确切机制，样本量相对有限 | 探索年轻与衰老牙髓组织的异质性，寻找衰老牙髓的新标记物并研究其作用机制 | 年轻与衰老的人牙髓组织样本、过氧化氢诱导的牙髓成纤维细胞衰老模型 | 单细胞组学 | 牙髓衰老 | 单细胞RNA测序、免疫组化染色、RNA测序、SA-β-Gal染色、γ-H2AX染色、F-actin细胞骨架染色 | NA | 单细胞转录组数据、RNA测序数据、图像数据 | 8个牙髓样本，共32,012个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 395 | 2026-01-16 |
Comprehensive analysis of heterogeneity and cell-cell interactions in Crohn's disease reveals novel location-specific insights
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.042
PMID:39732334
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了克罗恩病中结肠和回肠的异质性，并发现了一个新的DUOX2高表达上皮细胞亚群 | 首次在单细胞水平系统比较克罗恩病结肠与回肠的异质性，发现DUOX2-epi新上皮亚群及其部位特异性炎症机制 | 研究样本限于初治患者，未涵盖治疗中或难治性病例，且样本量相对较小 | 阐明克罗恩病结肠与回肠的异质性及其对发病机制和治疗反应的影响 | 克罗恩病初治患者的结肠和回肠组织 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及初治克罗恩病患者的结肠和回肠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 396 | 2026-01-16 |
Multi-omics approach reveals TGF-β signaling-driven senescence in periodontium stem cells
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.037
PMID:39743213
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研究论文 | 本研究采用多组学方法揭示了TGF-β信号驱动牙周膜干细胞衰老的机制 | 首次绘制了小鼠颌骨组织的空间转录组图谱，并发现DNA甲基化是TGF-β1诱导牙周膜干细胞衰老的关键机制 | 研究主要基于体外细胞模型，体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 阐明TGF-β1在牙周膜干细胞衰老中的作用及其分子机制，以促进对年龄相关性牙周疾病的理解和靶向治疗策略的开发 | 小鼠颌骨组织及人牙周膜干细胞 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 空间转录组学，DNA甲基化分析，伪时间分析 | NA | 空间转录组数据，细胞表型数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 397 | 2026-01-16 |
Parkin modulates the hepatocellular carcinoma microenvironment by regulating PD-1/PD-L1 signalling
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.045
PMID:39755271
|
研究论文 | 本研究探讨了Parkin蛋白通过调节PD-1/PD-L1信号通路影响肝细胞癌免疫微环境的机制 | 揭示了Parkin作为E3泛素连接酶通过泛素化降解PD-1来调节肿瘤免疫微环境的新机制，并首次在单细胞水平解析了Parkin缺失对肝肿瘤中T淋巴细胞和髓系细胞亚群的影响 | 研究主要基于小鼠模型，人体内的验证尚不充分；Parkin调节PD-1的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究Parkin在肝肿瘤免疫微环境中的作用及其通过PD-1/PD-L1信号通路调节抗肿瘤免疫的机制 | 四氯化碳诱导的肝肿瘤小鼠模型（Park2-/-小鼠） | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、Western blot、免疫荧光、免疫共沉淀、定量蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据、免疫组化图像 | Park2-/-小鼠与对照小鼠的肝肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 398 | 2026-01-16 |
Exploring therapeutic targets for hepatocellular carcinoma through druggable genes
2025-Sep-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000044627
PMID:41029168
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化等方法探索肝细胞癌的潜在治疗靶点 | 整合多种分析方法（包括两样本孟德尔随机化、基于汇总数据的MR、贝叶斯共定位和蛋白质-蛋白质相互作用网络）来优先排序药物靶点，并结合单细胞RNA测序验证细胞类型特异性表达模式 | NA | 识别与肝细胞癌风险相关的潜在治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化（MR）、基于汇总数据的MR、贝叶斯共定位、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2026-01-16 |
Prior chemotherapy deteriorates T-cell quality for CAR T-cell therapy in B-cell non-Hodgkin's lymphoma
2025-Apr-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010709
PMID:40210237
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研究论文 | 本研究评估了化疗对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者T细胞功能的影响，发现化疗会降低T细胞质量，从而影响CAR T细胞疗法的效果 | 首次通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和全基因组DNA甲基化阵列综合分析化疗对T细胞功能的影响，为优化CAR T细胞疗法提供了新见解 | 样本量相对较小，且仅针对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者，结果可能不适用于其他癌症类型 | 评估化疗对T细胞功能的影响，以优化CAR T细胞疗法的效果 | B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 多参数流式细胞术, 单细胞RNA测序, 全基因组DNA甲基化阵列, 体外功能测试 | NA | 细胞, 基因表达数据, 甲基化数据 | 两个患者队列（治疗前和治疗后），具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组DNA甲基化阵列 | NA | NA |
| 400 | 2026-01-16 |
Cross-species analyses of thymic mimetic cells reveal evolutionarily ancient origins and both conserved and species-specific elements
2025-Jan-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.025
PMID:39731911
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞，揭示了其进化上的古老起源以及物种特异性和保守性元素 | 首次在人类儿科供体中高分辨率地描绘了胸腺模拟细胞的单细胞图谱，并进行了跨物种比较分析，突出了神经内分泌和肌肉亚型的多样化 | 研究主要基于儿科供体样本，可能无法完全代表成人或疾病状态下的胸腺模拟细胞特征 | 探究胸腺模拟细胞的进化起源、物种间保守性及适应性，以理解其在自身免疫中的潜在作用 | 人类儿科供体、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类儿科供体的纯化胸腺模拟细胞区室 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |