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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-05-16
Mitochondrial and Ribosomal Stress Underlying Pronuclear Envelope Breakdown Failure: Insights From Single-Cell Transcriptomics in Human Zygotes
2026-03, Molecular reproduction and development IF:2.7Q2
研究论文 通过单细胞转录组学分析人类受精卵,揭示线粒体和核糖体应激导致原核膜破裂失败的分子机制 首次从单细胞转录组水平揭示MT-ND1-RPL10A/RPL38轴在PNEB失败中的核心调控作用,并建立多组学整合策略用于评估ICSI胚胎质量 研究样本量较小,仅基于PNEB型2PN受精卵与3PN对照受精卵的比较,未涉及其他发育异常类型 阐明原核膜破裂失败发生的核心调控网络及其对胚胎发育的影响 人类ICSI受精卵(PNEB型2PN受精卵与3PN对照受精卵) 机器学习 生殖疾病 单细胞RNA测序 WGCNA, LASSO 转录组数据 人类受精卵样本(具体数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
382 2026-05-16
PBRM1 Deficiency Reshapes an Immune Suppressive Microenvironment Through Epigenetic Tuning of PBRM1-KDM5C-IL6 Axis in ccRCC
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究PBRM1缺失通过表观遗传调控PBRM1-KDM5C-IL-6轴重塑ccRCC免疫抑制微环境 首次揭示PBRM1缺失通过招募KDM5C调节IL-6表达,驱动M2型TAM极化,形成免疫屏障并限制CD8 T细胞浸润的机制 主要基于小鼠模型和临床样本验证,尚未在人类临床试验中验证联合抗IL-6与抗PD-1治疗的效果 阐明PBRM1突变在ccRCC免疫逃逸中的作用机制并探索潜在免疫治疗策略 PBRM1基因敲除小鼠、原位肾肿瘤小鼠模型、ccRCC临床样本 数字病理学 肾透明细胞癌 单细胞RNA测序、多重免疫组化 NA 基因表达数据、组织切片图像 PBRM1敲除小鼠自发肿瘤和原位肿瘤模型,以及ccRCC临床样本(具体数量未在摘要中明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
383 2026-05-16
CRISPLD2 Attenuates Intervertebral Disc Degeneration by Suppressing Oxidative Stress-Induced Ferroptosis through the miR-548I-IL17A Axis
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 CRISPLD2通过miR-548I-IL17A轴抑制氧化应激诱导的铁死亡,从而减轻椎间盘退变 首次发现CRISPLD2作为椎间盘退变中髓核细胞稳态的关键调节因子,并揭示CRISPLD2-miR-548I-IL17A轴在调控铁死亡中的作用 未提及明显局限性,但可能涉及样本量或模型局限性 探究椎间盘退变的分子机制,特别是CRISPLD2在其中的作用 髓核细胞和小鼠椎间盘退变模型 数字病理学 椎间盘退变 单细胞转录组分析 NA 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
384 2026-05-16
Hepatocyte BPGM Induces RET Lactylation and Macrophage Reprogramming to Promote Tumorigenesis in Hepatocellular Carcinoma
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文发现肝细胞中BPGM通过诱导RET乳糖基化和巨噬细胞重编程促进肝细胞癌的肿瘤发生 首次揭示BPGM通过乳酸介导的RET乳糖基化增强其稳定性,并促进巨噬细胞M2极化,为肝细胞癌提供潜在治疗靶点 未说明具体局限性 探究BPGM在肝细胞癌进展中的功能和分子机制 肝细胞癌临床样本、肝细胞特异性Bpgm敲除小鼠模型、HCC细胞系 机器学习 肝细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 液相色谱-串联质谱 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 临床样本(数量未明确)、小鼠模型(数量未明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学
385 2026-05-16
Conversion of Transplanted Mature Hepatocytes into Afp+ Reprogrammed Cells for Liver Regeneration After Injury
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 移植的成熟肝细胞转化为Afp+重编程细胞,通过PPARγ代谢轴和TNF-α/AP-1信号促进肝损伤后再生 揭示了移植成熟肝细胞在肝损伤后转化为Afp+重编程细胞的再生机制,并鉴定出PPARγ/AFP代谢轴和TNF-α/AP-1有丝分裂信号作为优化基于终末分化肝细胞的再生疗法的可操作靶点 NA 探究移植成熟肝细胞驱动肝再生的分子机制 移植的成熟肝细胞及其形成的Afp+重编程细胞 NA 肝脏疾病 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、谱系追踪、连续移植 NA 基因表达数据、染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
386 2026-05-16
Female iPSC X-chromosome inactivation (XCI) erosion and its transcriptomic effects during CRISPR gene editing and neural differentiation
2026-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用大量CRISPR编辑的女性iPSC系和iPSC衍生神经元的RNA-seq数据,探究了X染色体失活侵蚀在CRISPR编辑和神经分化过程中的影响及其对转录组分析的混淆效应 首次系统性揭示了CRISPR基因编辑和神经分化过程中XCI侵蚀的变异性及其对差异表达基因分析的混淆效应,并发现诱导的等位基因特异性表达在影响神经发育基因的位点上具有保守的位置模式 未明确提及具体局限性,但研究仅基于女性iPSC系和神经分化模型,可能受限于样本数量及体外模型的代表性 研究女性iPSC中X染色体失活侵蚀在CRISPR编辑和神经分化过程中的变化,并评估其对转录组差异表达分析的潜在混淆影响 来自四个供体系的女性iPSC衍生的神经元和CRISPR编辑的女性iPSC系 机器学习 神经发育障碍 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA 图像 来自四个供体系的数百个CRISPR编辑的女性iPSC系(针对66个基因),以及其中42个编辑基因的iPSC衍生神经元子集 Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 Illumina NovaSeq bulk RNA-seq和single-cell RNA-seq测序平台
387 2026-05-16
Body composition predicts poor outcomes and reveals immunometabolic dysfunction via single-cell profiling in anti-BCMA CAR T-treated myeloma
2026-Mar, HemaSphere IF:7.6Q1
研究论文 本研究揭示身体成分(特别是低皮下脂肪和肌肉减少症)作为预后生物标志物,通过单细胞多组学分析揭示其对CAR-T治疗多发性骨髓瘤患者的免疫代谢功能障碍的影响 首次将身体成分(低皮下脂肪和肌肉减少症)与抗BCMA CAR-T细胞治疗多发性骨髓瘤的预后及免疫代谢功能障碍联系起来,并通过单细胞多组学技术揭示相关机制 回顾性研究设计,样本量相对较小(108例),且未分析身体成分对无进展生存期的影响 探究身体成分对接受抗BCMA CAR-T细胞治疗的复发/难治性多发性骨髓瘤患者预后的预测价值及其免疫代谢机制 108例接受抗BCMA CAR-T细胞治疗的复发/难治性多发性骨髓瘤患者 机器学习 多发性骨髓瘤 流式细胞术,单细胞多组学 NA 影像数据,流式细胞术数据,单细胞转录组数据 108例复发/难治性多发性骨髓瘤患者 10x Genomics 单细胞多组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞多组学平台
388 2026-05-16
Single-cell RNA sequencing identifies M2-like macrophage polarization associated with mesenchymal stem cell treatment in a murine sepsis model
2026-Feb-20, Biomolecules & biomedicine
研究论文 通过单细胞RNA测序分析间充质干细胞治疗对脓毒症小鼠模型免疫细胞的影响 首次利用单细胞RNA测序技术揭示间充质干细胞治疗通过促进M2样巨噬细胞极化改善脓毒症存活的机制 小鼠模型与临床转化的差距以及仅分析了术后6小时的单时间点数据 阐明间充质干细胞在脓毒症病理中与免疫细胞互作的具体机制 脓毒症小鼠模型中的CD45阳性免疫细胞 机器学习 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 脓毒症小鼠模型中分离的CD45阳性免疫细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于CD45阳性免疫细胞测序
389 2026-05-16
Microglia and Myeloid Cell Populations of the Developing Mouse Retina
2026-02, Glia IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和单核RNA测序揭示了发育中小鼠视网膜中独特的髓系细胞群及其解剖位置和功能 首次在视网膜发育过程中识别出由Spp1和Hmox1基因标记的两种密切相关的小胶质细胞亚群,并发现Hmox1小胶质细胞在视网膜血管生成过程中特异性定位于发育中血管的前缘,提示血管生成相关事件调节NRF2活性驱动小胶质细胞状态转换 研究仅限于小鼠模型,未在人体中进行验证;部分发育特异性髓系细胞群在脑scRNA-seq数据集中已有描述但未在体内验证 阐明小胶质细胞和髓系细胞群在视网膜发育过程中的作用机制和分子特征 发育中的小鼠视网膜髓系细胞和小胶质细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 组织学染色 NA 基因表达数据 多个时间点的发育中小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
390 2026-05-16
Charting immune variation through genetics and single-cell genomics
2026-01-21, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 通过多组学单细胞方法分析428名健康中国成人的免疫细胞,构建免疫多组学图谱 整合单细胞RNA测序和染色质可及性测序,识别73个免疫细胞亚群并构建细胞类型特异性基因调控网络,扩展了祖先多样性和数据模态 NA 研究人类免疫变异,通过遗传学和单细胞基因组学绘制免疫细胞图谱 428名健康中国成人的免疫细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,单细胞染色质可及性测序 NA 单细胞转录组和表观基因组数据 428名健康中国成人,超过1000万免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
391 2026-05-16
SpaceBF: spatial coexpression analysis using Bayesian fused approaches in spatial omics datasets
2026-01-21, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 提出SpaceBF,一种用于空间组学数据中空间共表达分析的贝叶斯融合模型 通过融合马靴先验在预定义空间邻接图边上实现空间平滑,允许大边缘差异逃脱收缩而保留整体结构 未提供具体限制信息 开发稳健方法识别空间组学数据中分子对间的空间变异共表达 空间组学数据集(空间转录组学、质谱成像蛋白质组学) 机器学习 NA 空间转录组学, 质谱成像, 贝叶斯建模 贝叶斯融合模型 空间表达数据(基因、肽、脂质、N-聚糖) NA NA 空间转录组学, 质谱成像 NA NA
392 2026-05-16
Efficient stem cell-derived mouse embryo models for environmental studies
2026-Jan-14, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 通过模块化聚集三种小鼠干细胞类型,高效生成囊胚样结构(iG4-囊胚),用于环境因素影响胚胎发育的研究 开发了一种模块化方法,通过聚集三种小鼠干细胞(ESC、iG4-ESC和TSC)高效生成具有约80%效率的囊胚样结构,并首次用于研究环境因素(如咖啡因、酒精、尼古丁)对胚胎发生的影响 未提及具体局限性,但可能包括模型与天然胚胎的差异和体外培养条件的限制 开发高效的干细胞衍生小鼠胚胎模型,用于研究环境因素对胚胎发育的影响 三种小鼠干细胞类型:胚胎干细胞(ESC)、可诱导GATA4表达的ESC(iG4-ESC)和滋养层干细胞(TSC) 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 约80%效率的iG4-囊胚结构,其中约12%经历体外植入后形态发生 NA 单细胞RNA测序 NA NA
393 2026-05-16
Integrative Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Uncover Distinct Fibroblast-Macrophage Crosstalk in Human Hip Synovium Between Patients With Femoroacetabular Impingement and Osteoarthritis
2026-Jan-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 整合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示股骨髋臼撞击症与骨关节炎患者髋关节滑膜中成纤维细胞-巨噬细胞的不同相互作用 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,比较股骨髋臼撞击症与髋关节骨关节炎患者的滑膜细胞组成、转录组特征及细胞间相互作用,发现EREG+成纤维细胞样滑膜细胞在骨关节炎中显著增加,并鉴定出FGF2-SDC4信号通路介导的成纤维细胞-巨噬细胞相互作用 样本量较小,每组仅6例患者;仅分析了髋关节滑膜组织,未涉及其他关节部位;细胞间相互作用的验证可能需要进一步的功能实验 研究股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎患者的滑膜细胞组成、转录组谱及细胞-细胞相互作用的差异 股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎患者的髋关节滑膜组织 单细胞基因组学 骨关节炎, 股骨髋臼撞击症 单细胞RNA测序, 空间转录组学 伪时间分析 基因表达数据 12例患者(每组6例) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学
394 2026-05-16
Altered Inflammatory Signature in a C9ORF72 -ALS iPSC-Derived Motor Neuron and Microglia Coculture Model
2026-01, Glia IF:5.4Q1
研究论文 利用C9ORF72相关ALS患者iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型,揭示了小胶质细胞介导的神经炎症特征改变 首次在iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养体系中,通过单细胞RNA测序发现C9ORF72突变导致LPS响应性小胶质细胞亚群缺失并削弱炎症反应 未明确共培养模型中细胞间相互作用的完整分子机制,且仅使用了C9ORF72一种基因变异模型 阐明C9ORF72突变对ALS中小胶质细胞介导的神经炎症的影响机制 人iPSC来源的运动神经元和小胶质细胞 数字病理学 肌萎缩侧索硬化症 iPSC分化、单细胞RNA测序 共培养模型 单细胞基因表达数据 多个iPSC系,包括C9ORF72 HRE患者系和C9ORF72敲除系 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
395 2026-05-16
S100A4-lineage cells contribute modestly to angiotensin II-mediated thoracic aortic aneurysms through angiotensin II type 1a receptor in mice
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 研究S100A4谱系细胞通过血管紧张素II 1a型受体参与小鼠胸主动脉瘤形成的作用 首次揭示S100A4谱系细胞通过AT1aR受体部分介导AngII诱导的胸主动脉瘤形成 S100A4谱系细胞贡献程度中等,可能存在其他细胞类型协同作用 探究S100A4谱系细胞是否通过AT1aR参与AngII介导的胸主动脉瘤形成 小鼠主动脉壁中的S100A4谱系细胞 机器学习 心血管疾病 蛋白质组学、批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白丰度数据 小鼠模型,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
396 2026-05-16
Genetic insights into drug targets for alzheimer's disease: integrative multi-omics analysis
2025-12-05, Alzheimer's research & therapy
研究论文 整合多组学孟德尔随机化分析识别阿尔茨海默病药物靶点 通过大规模多组学数据整合(包括50多个GWAS数据集、蛋白质组QTL、单细胞RNA测序和蛋白质互作网络),建立了一个全面的阿尔茨海默病靶点图谱,并验证了六个最高置信度靶点 未明确说明,但可能包括依赖现有数据库的质量和样本量,以及孟德尔随机化方法的固有局限性 识别阿尔茨海默病的稳健治疗靶点,建立从机制到安全性的临床可操作框架 阿尔茨海默病的潜在药物靶点 机器学习 阿尔茨海默病 全基因组关联研究、蛋白质组定量性状位点分析、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 涉及超过50个GWAS数据集及大规模蛋白质组学研究数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
397 2026-05-16
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-12, The Journal of nutrition IF:3.7Q2
研究论文 构建小鼠回肠综合单细胞图谱,揭示营养代谢与上皮-免疫细胞互作机制 首次整合小鼠回肠单细胞转录组图谱,同时覆盖上皮和免疫细胞群体,发现Bco2-Il18在多种细胞类型中的共表达以及非经典杯状细胞的高表达特征 研究仅基于雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别和遗传背景差异;缺乏功能验证实验 构建回肠细胞异质性图谱,解析上皮分化、营养代谢程序及上皮-免疫互作在健康与疾病中的作用 8周龄雄性C57BL/6J小鼠的回肠细胞 计算生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 32,076个回肠细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 使用Seurat软件进行基因表达聚类分析,结合伪时间轨迹、细胞间通讯和通路富集分析
398 2026-05-16
Oxidative Stress and Pyroptosis Mediated by CEBPB/HMGB1 Signaling in Sepsis-Exacerbated Coronary Atherosclerosis
2025-12, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨了CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加重冠状动脉粥样硬化中介导氧化应激和细胞焦亡的作用 首次揭示了CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加重冠心病中的分子机制,为心血管并发症的预防提供了新靶点 研究主要在动物模型和细胞实验中进行,尚需更大规模临床样本验证 阐明脓毒症加重冠状动脉疾病的氧化应激和炎症信号通路机制 雄性ApoE小鼠模型和THP-1来源巨噬细胞及人主动脉内皮细胞 数字病理学 冠状动脉疾病 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因检测, 酶联免疫吸附测定, 活性氧检测, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 分子生物学数据 使用ApoE小鼠模型(样本量未明确报告),以及THP-1来源巨噬细胞和人主动脉内皮细胞 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
399 2026-05-16
Gene-metabolite interactions in aortic dissection: Insights from metabolic and single-cell analyses
2025-Nov-21, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 该研究整合单细胞RNA测序、代谢组学、机器学习和孟德尔随机化方法,探讨主动脉夹层中平滑肌细胞变化及基因-代谢物相互作用 首次构建主动脉夹层的基因-代谢物网络,明确APOE和PLTP通过调节胆固醇酯和甘油三酯影响平滑肌细胞功能及疾病进展 样本量较小(9个代谢组学样本),且未提供功能验证实验 探索主动脉夹层的发病机制,寻找潜在治疗靶点 主动脉夹层组织样本中的平滑肌细胞及代谢物 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、代谢组学、机器学习、孟德尔随机化 Seurat、Monocle2、机器学习模型 单细胞基因表达数据、代谢组学数据 9个样本(6个主动脉夹层,3个对照) NA 单细胞RNA测序 NA NA
400 2026-05-16
Pan-cancer NK cell-related immunotherapy signatures for predicting PD-1 treatment response
2025-Nov-21, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 利用机器学习和单细胞RNA测序数据构建泛癌自然杀伤细胞免疫治疗预测模型(NKCIPM),用于预测PD-1治疗反应 首次通过整合多种癌症类型的单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据,结合机器学习算法,建立泛癌水平的NK细胞免疫治疗预测模型,并鉴定出APOE作为关键枢纽基因 NK细胞在癌症中的全面研究仍有限,尤其是对免疫治疗反应的影响 建立泛癌NK细胞免疫治疗预测模型,评估免疫治疗反应并指导临床决策 自然杀伤细胞及其在肿瘤微环境中的特征基因 机器学习 泛癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序 机器学习模型 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据 164份样本(6种癌症类型) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
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