单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 29712 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-07-11 |
Taurine-mediated metabolic immune crosstalk indicates and promotes immunosuppression with anti-PD-1 resistance in bladder cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618439
PMID:40630945
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组分析，揭示了膀胱癌肿瘤微环境中牛磺酸代谢失调的分子机制及其在免疫抑制中的作用 | 开发了牛磺酸代谢失调指数（TMs）作为独立的预后生物标志物，并揭示了其在免疫治疗抵抗中的作用 | 研究主要基于计算分析和体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索牛磺酸代谢在膀胱癌肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 膀胱癌（BLCA）患者样本和肿瘤微环境中的细胞亚群 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）、批量转录组分析 | 机器学习方法 | 转录组数据 | TCGA队列中的膀胱癌患者样本 |
| 382 | 2025-07-11 |
Single-cell analysis with childhood and adult systemic lupus erythematosus
2024-12, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2023.2281228
PMID:38347676
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析儿童和成人系统性红斑狼疮(SLE)患者的外周血单个核细胞(PBMCs)组成和转录特征，揭示了两者之间的差异和潜在的治疗靶点 | 首次在单细胞水平比较儿童和成人SLE患者的PBMC组成和转录特征，并鉴定出潜在的治疗靶点 | 样本量可能有限，且未进行功能验证实验 | 探究儿童和成人SLE患者在PBMC组成和转录特征上的差异 | 儿童和成人SLE患者及健康对照者的PBMCs | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童和成人SLE患者及匹配的健康供体 |
| 383 | 2025-07-11 |
Understanding disease-associated metabolic changes in human colon epithelial cells using i ColonEpithelium metabolic reconstruction
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619644
PMID:39484551
|
研究论文 | 本研究通过构建首个结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，揭示了与炎症性肠病相关的代谢变化 | 首次构建了人类结肠上皮细胞的特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，并整合单细胞RNA测序数据预测疾病相关代谢特征 | 模型预测结果需要进一步实验验证，且目前仅关注结肠上皮细胞，未全面考虑其他细胞类型的影响 | 解析人类结肠上皮细胞的代谢活动及其在疾病状态下的变化 | 人类结肠上皮细胞及其在炎症性肠病(克罗恩病和溃疡性结肠炎)中的代谢特征 | 系统生物学 | 炎症性肠病(包括克罗恩病和溃疡性结肠炎) | 基因组尺度代谢模型(GEM)、单细胞RNA测序 | iColonEpithelium代谢网络模型 | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 384 | 2025-07-11 |
Metabolic coordination between skin epithelium and type 17 immunity sustains chronic skin inflammation
2024-07-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.022
PMID:38772365
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研究论文 | 本研究探讨了皮肤炎症中上皮细胞与17型免疫之间的代谢协调机制 | 揭示了HIF1α在IL-17信号下游驱动银屑病上皮重塑的作用，并发现糖酵解自主促进上皮病理和乳酸产生，进而增强γδ T17细胞反应 | 研究主要基于小鼠模型和体外人类银屑病病变，可能不完全反映人类体内复杂情况 | 探究炎症性上皮疾病中免疫和上皮细胞如何同时维持其高度代谢需求 | 皮肤上皮细胞和17型免疫细胞 | 免疫代谢 | 银屑病 | 单细胞转录组学、空间转录组学(ST)、免疫荧光 | 小鼠皮肤炎症模型 | 转录组数据、图像数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人类银屑病病变和小鼠模型 |
| 385 | 2025-07-11 |
Transcriptomic Approaches to Cardiomyocyte-Biomaterial Interactions: A Review
2024-Jul-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00303
PMID:38934720
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review | 本文综述了转录组学方法在心肌细胞与生物材料相互作用研究中的应用及其在心脏生物工程和再生医学中的重要性 | 强调了转录组学方法在揭示心肌细胞与生物材料相互作用中的基因表达模式、调控通路和细胞过程方面的创新应用 | 存在成本高、细胞尺寸限制、样本差异和分析过程复杂等挑战 | 探讨转录组学方法在心肌细胞与生物材料相互作用研究中的应用，以促进心脏健康和疾病治疗 | 心肌细胞与生物材料的相互作用 | 再生医学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | 转录组数据 | NA |
| 386 | 2025-07-11 |
SpotSweeper: spatially-aware quality control for spatial transcriptomics
2024-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.06.597765
PMID:38895212
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research paper | 本文介绍了SpotSweeper，一种用于空间转录组学数据的空间感知质量控制方法 | SpotSweeper能够识别局部异常值和区域伪影，减少生物异质性带来的偏差，并改进下游聚类和标记基因检测 | 目前尚无针对SRT特有的组织学伪影的识别方法 | 开发适用于空间转录组学数据的质量控制方法 | 空间转录组学数据 | digital pathology | NA | spatially-resolved transcriptomics (SRT), single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) | NA | spatial transcriptomics data | 公开可用的Visium数据 |
| 387 | 2025-07-11 |
Dynamic Transcriptional Programs During Single NK Cell Killing: Connecting Form to Function in Cellular Immunotherapy
2024-Jun, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-024-00812-3
PMID:39050513
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研究论文 | 该研究通过结合单细胞RNA测序和活细胞成像技术，探索了自然杀伤（NK）细胞在杀伤过程中的动态转录程序 | 首次将单细胞RNA测序与活细胞成像技术结合，用于研究NK细胞杀伤功能与转录因子活性的关系 | 研究仅使用了NK-92细胞系和HeLa宫颈癌细胞系作为模型，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探索NK细胞杀伤功能与细胞内信号传导的关系，以改进基于NK细胞的免疫治疗方法 | NK-92细胞系和HeLa宫颈癌细胞系 | 细胞免疫治疗 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（10× Genomics平台）、活细胞成像、ViPER和DoRothEA R包分析 | NA | 转录组数据、显微成像数据 | NK-92细胞系与HeLa细胞的共培养系统 |
| 388 | 2025-07-11 |
Single-cell RNA sequencing reveals aberrant sphingolipid metabolism in non-small cell lung cancer impacts tumor-associated macrophages and stimulates angiogenesis via macrophage inhibitory factor signaling
2024-05, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15283
PMID:38587042
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，揭示了非小细胞肺癌中鞘脂代谢异常如何影响肿瘤相关巨噬细胞并通过巨噬细胞抑制因子信号刺激血管生成 | 首次整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，全面分析肿瘤微环境中鞘脂代谢的作用，并识别出关键的MIF-CD74配体-受体对 | 研究主要基于公开数据集，缺乏实验验证 | 探究鞘脂代谢在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的作用及其对巨噬细胞极化和血管生成的影响 | 非小细胞肺癌组织及肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 多个公开scRNA-seq数据集（具体数量未说明） |
| 389 | 2025-07-11 |
Immune cell-related prognostic risk model and tumor immune environment modulation in esophageal carcinoma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2024-05, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15301
PMID:38587029
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序技术，探讨了食管癌中免疫细胞的作用及其对肿瘤微环境的影响，并构建了一个基于免疫细胞的预后风险模型 | 首次在单细胞水平上构建食管癌的独立预后模型，并深入分析了免疫浸润和免疫检查点表达的差异 | 当前生物标志物不足以完全捕捉肿瘤免疫微环境的复杂性和多样性 | 探索食管癌中免疫细胞的组成、功能及其对患者预后的影响 | 食管癌患者的免疫细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 预后风险模型 | RNA测序数据 | NA |
| 390 | 2025-07-11 |
Single-cell sequencing reveals the immune landscape of breast cancer patients with brain metastasis
2024-03, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15243
PMID:38316626
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析乳腺癌脑转移患者的脑脊液免疫细胞，揭示其免疫微环境景观 | 首次使用scRNA-seq技术非侵入性地描述乳腺癌脑转移患者的肿瘤免疫微环境，并发现促进和抑制肿瘤免疫功能的基因 | 研究样本可能有限，且仅分析了脑脊液中的免疫细胞，未涵盖其他可能的免疫微环境组成部分 | 揭示乳腺癌脑转移患者的免疫微环境特征，以指导免疫治疗 | 乳腺癌脑转移患者的脑脊液免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 乳腺癌脑转移患者的脑脊液样本 |
| 391 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the links between the metabolic heterogeneity and cell identity in NBM and AML
2024-03, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19233
PMID:38009537
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2025-07-11 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment of small cell lung cancer-associated malignant pleural effusion
2024-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15145
PMID:38010064
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示小细胞肺癌相关恶性胸腔积液的肿瘤免疫微环境特征 | 首次在恶性胸腔积液背景下应用单细胞RNA测序技术分析小细胞肺癌的免疫微环境 | 样本量较小（仅1例患者），未进行功能验证实验 | 解析小细胞肺癌恶性胸腔积液的免疫微环境特征 | 小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（10x Genomics） | NA | 单细胞转录组数据 | 8008个高质量细胞（来自1例患者） |
| 393 | 2025-07-11 |
Inference after latent variable estimation for single-cell RNA sequencing data
2023-12-15, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac047
PMID:36511385
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研究论文 | 本文提出了一种名为count splitting的新框架，用于在单细胞RNA测序数据分析中实现有效的统计推断 | 引入了count splitting框架，能够在单细胞RNA测序数据分析中实现有效的统计推断，适用于几乎任何潜在变量估计技术和推断方法 | 方法基于泊松假设，可能不适用于不符合该假设的数据 | 解决单细胞RNA测序数据分析中潜在变量估计后的统计推断问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 模拟研究和多能干细胞分化为心肌细胞的数据集 |
| 394 | 2025-07-11 |
T cell-Mediated Development of Stromal Fibroblasts with an Immune-Enhancing Chemokine Profile
2023-08-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0593
PMID:37216570
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞(CAFs)在炎症组织中的适应性及其对免疫微环境的影响 | 首次发现CAFs具有表型可塑性，能够从免疫抑制表型转变为免疫激活表型 | 研究主要基于小鼠模型，人类CAFs的类似机制需要进一步验证 | 探究CAFs如何适应不同的免疫微环境并调节免疫反应 | 小鼠胰腺腺癌中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰腺腺癌模型中的CAFs |
| 395 | 2025-07-10 |
Gut microbial Nordihydroguaiaretic acid suppresses macrophage pyroptosis to regulate epithelial homeostasis and inflammation
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2518338
PMID:40596758
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研究论文 | 研究探讨了衰老相关的肠道菌群失调如何通过减少Nordihydroguaiaretic acid (NDGA)的产生加剧炎症性肠病(IBD)，并发现NDGA通过下调GSDMD/NR4A1/NLRP3轴介导的巨噬细胞焦亡来缓解结肠炎 | 揭示了肠道微生物NDGA在调节巨噬细胞焦亡中的新作用，并提出了其作为老年相关IBD治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本数据有限，需要进一步验证NDGA在人类IBD中的治疗效果 | 探究衰老相关肠道菌群失调对结肠炎发展的影响及其机制 | 野生型和IL-10缺陷小鼠、IBD患者和老年人 | 肠道微生物组学 | 炎症性肠病(IBD) | 粪便微生物移植(FMT)、16S rDNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠结肠炎模型 | 微生物组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型、IBD患者和老年人样本 |
| 396 | 2025-05-12 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24531
PMID:40346999
|
撤稿声明 | 该文章因同行评审过程存在问题而被撤稿 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2025-07-10 |
Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2) CreERT2
2025-Aug, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70021
PMID:40580015
|
研究论文 | 本研究通过生成可诱导的Cntn2CreERT2小鼠系，追踪了发育中嗅觉系统中Cntn2的表达，以研究早期迁移神经元 | 利用Cntn2CreERT2小鼠系作为时间控制的工具，特异性操纵感兴趣的神经元群体 | 可用的分子标记数量有限，可能限制了研究的广泛性 | 研究发育中嗅觉系统的神经元迁移过程 | 早期迁移神经元，特别是起源于嗅觉区域的神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，可诱导的CreERT2系统 | Cntn2CreERT2小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 398 | 2025-07-10 |
Cellular heterogeneity and patterning strategies as revealed by upper respiratory epithelium single cell atlas
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112845
PMID:40612507
|
research paper | 通过单细胞RNA测序和空间验证，生成了小鼠上呼吸道上皮细胞的分子图谱，揭示了18种上皮细胞类型及其空间分布 | 首次生成了上呼吸道上皮的单细胞和分子图谱，揭示了细胞类型的空间分布和多样性 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本 | 解析上呼吸道上皮细胞的异质性和空间分布模式 | 小鼠上呼吸道上皮细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠上呼吸道上皮细胞样本 |
| 399 | 2025-07-10 |
Single-Cell RNA Sequencing Highlights a Contribution of Human Amniotic Mesenchymal Stem Cells-Derived Exosomes to Androgenetic Alopecia
2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500853R
PMID:40622121
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研究论文 | 本研究探讨了人羊膜间充质干细胞来源的外泌体（hAMSC-exo）对雄激素性脱发（AGA）的治疗效果及其分子机制 | 首次在单细胞水平揭示了hAMSC-exo通过Wnt/β-catenin信号通路减轻DHT诱导的毛乳头细胞（DPC）损伤，并促进毛囊再生的分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证 | 探索hAMSC-exo对AGA的治疗潜力及其作用机制 | 雄激素性脱发（AGA）小鼠模型及人羊膜间充质干细胞来源的外泌体（hAMSC-exo） | 干细胞治疗 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及小鼠背部皮肤的多种细胞类型 |
| 400 | 2025-07-10 |
Myeloid-specific deficiency of ribosomal protein L13a alters macrophage polarity and diversity during differentiation from bone marrow
2025-Jul-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf102
PMID:40631353
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研究论文 | 本文揭示了核糖体蛋白L13a在骨髓来源巨噬细胞分化和极化过程中的新作用 | 发现了L13a在调节巨噬细胞极化中的新角色，超越了传统的M1-M2二分法概念 | 研究主要基于体外骨髓来源巨噬细胞分化模型，体内验证有待进一步研究 | 探究核糖体蛋白L13a在巨噬细胞分化和极化过程中的调控机制 | 骨髓来源巨噬细胞和CD4+ T细胞 | 免疫学 | NA | RNA测序（bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq） | 基因敲除小鼠模型（L13aflox/flox LysMCre+） | 基因表达数据 | 对照小鼠和L13a敲除小鼠的骨髓来源细胞 |