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当前共找到 32106 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-04 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Novel Prognostic Signatures in HNSCC Immunotherapy Response
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70171
PMID:40791099
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析头颈鳞状细胞癌免疫治疗反应，开发预后特征模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据开发LASSO-Cox风险分层模型，识别治疗前后细胞亚群变化 | 样本量较小（仅3例患者），需更大队列验证 | 分析肿瘤免疫微环境变化并建立免疫治疗反应的预后模型 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 3例HNSCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-11-04 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a metastasis-associated PCSK1+ neuroendocrine subpopulation in pancreatic neuroendocrine tumors
2025-Nov, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70084
PMID:40817830
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现胰腺神经内分泌肿瘤中与转移相关的PCSK1+神经内分泌亚群 | 首次在胰腺神经内分泌肿瘤中鉴定出富含于肝转移灶的PCSK1+神经内分泌亚群，并揭示其高拷贝数变异负荷、低分化潜能和独特的转录调控特征 | 基于公开数据库的回顾性分析，样本量有限（27个样本），需要后续实验验证机制 | 探索胰腺神经内分泌肿瘤中神经内分泌细胞的异质性及其与转移的关系 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者组织样本（包括癌旁正常组织、原发肿瘤和肝转移灶） | 单细胞组学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异分析, 伪时间轨迹分析, 转录调控网络分析, 细胞间通讯分析 | CytoTRACE2, Monocle3, SCENIC, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 27个样本（包括正常组织、原发肿瘤和肝转移灶） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-11-04 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定胰腺癌肝转移中具有免疫代谢重编程特征的新型OLR1+SLC7A7+肝脏富集转移亚群 | 首次发现并表征了胰腺癌肝转移中独特的终末分化恶性细胞亚群LEMS，揭示了其代谢重编程和免疫抑制通路超活化特征 | 需要扩大临床队列和建立体内模型来全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制性相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群，阐明其与转移微环境的相互作用，定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PDAC原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-11-04 |
Neoadjuvant chemotherapy modulates mast cell phenotypes and immune infiltration in high-grade serous carcinoma
2025-Nov-01, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.10.014
PMID:41176887
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研究论文 | 本研究探讨新辅助化疗对高级别浆液性癌免疫浸润模式的影响，特别关注肥大细胞表型变化 | 首次揭示NACT诱导肥大细胞从CD52+KIT+表型向JUN+/TNFRSF12A+亚群转变的动态过程 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 研究新辅助化疗对高级别浆液性癌免疫景观的影响及其临床意义 | 高级别浆液性癌患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序，免疫组织化学，单细胞RNA测序 | Scissor分析，伪时间分析 | RNA测序数据，免疫组织化学图像，单细胞RNA测序数据 | 81对NACT前后样本（8+7内部RNA-seq，73对IHC），三个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-11-04 |
Retrospective transcriptomic analysis indicates temporal dysregulation of mitochondrial genes and metabolic pathways after volumetric muscle loss injury
2025-Nov, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70612
PMID:41178047
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研究论文 | 通过回顾性转录组分析研究体积性肌肉损失损伤后线粒体基因和代谢途径的时间性失调 | 首次利用现有RNA-seq数据集综合分析VML损伤后线粒体相关基因和代谢途径的时序变化 | 回顾性研究，数据来源于公开数据库，样本数量有限 | 研究体积性肌肉损失损伤后线粒体和代谢转录组的变化 | 大鼠和小鼠的肌肉组织 | 转录组学 | 肌肉损伤疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 包含bulk RNA-seq数据集（大鼠）和单细胞RNA-seq数据集（小鼠） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-11-04 |
Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf202
PMID:41180020
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间代谢组学技术，揭示了人参属植物根尖细胞分化及人参皂苷生物合成的细胞特异性 | 首次在人参属植物中构建单细胞转录图谱，发现新型转录因子调控内皮层木栓化和人参皂苷生物合成，揭示跨物种保守及分化的配体-受体互作模式 | 研究仅针对三种人参属植物，样本代表性有限；空间代谢组学分辨率有待进一步提高 | 探究人参属植物根尖早期发育过程中细胞分化命运及人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 三种人参属植物（Panax ginseng, Panax quinquefolius, Panax notoginseng）的根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 双荧光素酶报告基因检测, 电泳迁移率变动分析, RNA原位杂交, 质谱成像, LC-MS/MS | NA | 单细胞转录组数据, 空间代谢组数据, 质谱数据 | 三种人参属植物的根尖样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 27 | 2025-11-04 |
Identification of C1QA as a prognostic marker and regulator of immunosuppressive neutrophils in early-stage lung adenocarcinoma through integrated bioinformatics analyses
2025-Oct-31, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01881-y
PMID:41171372
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定C1QA作为早期肺腺癌预后标志物和免疫抑制中性粒细胞调节因子 | 首次发现C1QA是调控早期肺腺癌免疫抑制中性粒细胞的关键基因，并揭示其通过补体受体与中性粒细胞相互作用机制 | 研究主要基于公共数据库分析，需要进一步实验验证C1QA功能机制 | 探索早期肺腺癌中中性粒细胞的分子调控机制 | 早期肺腺癌患者样本和基因表达数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 基因表达分析,单细胞RNA测序,免疫荧光染色,RT-qPCR | CIBERSORTx,WGCNA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 公共数据集GSE31210及独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-11-04 |
Hidden network preserved in Slide-tags data allows reference-free spatial reconstruction
2025-Oct-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65295-w
PMID:41173855
|
研究论文 | 通过重新分析Slide-tags空间转录组数据，发现并利用细胞-珠子网络实现无参考的空间组织重建 | 首次发现Slide-tags数据中隐含的空间信息细胞-珠子网络，并将其用于无辅助的组织重建，突破了传统基于预索引阵列的空间技术 | NA | 开发基于网络的空间转录组数据分析方法，实现无参考的空间组织重建 | Slide-tags空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 网络优化模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Slide-tags | 基于预解码珠子阵列的空间转录组技术，通过探针扩散标记组织细胞核 |
| 29 | 2025-11-04 |
The involvement of microglia and the CXCL16-CXCR6 axis in the recruitment of CD8+ T cells to an amyloidogenic mouse brain
2025-Oct-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22137-5
PMID:41174156
|
研究论文 | 本研究探讨了小胶质细胞和CXCL16-CXCR6轴在淀粉样蛋白小鼠大脑中招募CD8+ T细胞的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示CXCL16-CXCR6轴在阿尔茨海默病模型中的表达模式，并发现小胶质细胞消融后存在补偿机制 | 未进行体内分析验证CD8+ T细胞招募机制，依赖公开数据集和体外实验 | 阐明阿尔茨海默病中CD8+ T细胞大脑招募的分子机制 | APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠的大脑组织及细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | 公开单细胞RNA测序数据集，APP/PS1与野生型小鼠对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-04 |
Transcriptomic response analysis of rubber tree saplings to water-deficit stress at single-cell resolution
2025-Oct-31, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09046-z
PMID:41174182
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了橡胶树幼苗在水分亏缺胁迫下的细胞和分子响应机制 | 首次构建了橡胶树树皮在水分亏缺胁迫下的高分辨率单细胞转录组图谱，系统揭示了不同细胞类型对干旱胁迫的转录响应特征 | 研究仅分析了4天和7天两个时间点的胁迫响应，缺乏更长时间的动态变化数据 | 探究橡胶树对水分亏缺胁迫的细胞和分子适应机制 | 橡胶树幼苗的树皮组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,994个单个细胞，来自对照、4天干旱胁迫和7天干旱胁迫的树皮组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴式单细胞RNA测序技术 |
| 31 | 2025-11-04 |
Pan-Cancer Landscape of Magnesium Homeostasis: Bulk Omics Research and Single-Cell Sequencing Validation
2025-Oct-31, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00294-1
PMID:41174507
|
研究论文 | 本研究全面分析了33种癌症类型中镁稳态的作用，探索其在肿瘤发生、免疫调节和治疗潜力中的功能 | 首次在泛癌水平系统研究镁稳态，结合批量组学和单细胞测序验证，发现镁稳态评分可作为预后生物标志物 | 需要进一步的临床验证来推进个性化癌症治疗 | 全面分析镁稳态在多种癌症中的作用及其临床意义 | 33种癌症类型的肿瘤样本和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 多种癌症 | 批量组学分析, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 单细胞测序数据 | 33种癌症类型的多个样本 | NA | 单细胞测序, 批量组学分析 | NA | NA |
| 32 | 2025-11-04 |
From pixels to cell types: a comprehensive review of computational methods for spatial transcriptomics deconvolution
2025-Oct-31, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00055-2
PMID:41174717
|
综述 | 对空间转录组学反卷积计算方法进行全面分析的方法学手册 | 系统对比了20种算法的计算原理、建模方法和数据处理流程，重点关注方法学基础 | NA | 提供空间转录组学反卷积计算方法的全面理解，帮助开发新策略和选择适用工具 | 20种空间转录组反卷积算法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2025-11-04 |
An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2025-Oct-31, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03996-4
PMID:41174727
|
研究论文 | 通过整合转录组、甲基化组和单细胞RNA测序数据，鉴定出UBE2H作为结直肠癌奥沙利铂耐药性的生物标志物 | 首次通过多组学整合分析揭示UBE2H与奥沙利铂耐药性的关联，并发现其与免疫耗竭和增殖性未分化细胞的联系 | 研究主要基于细胞系和公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 寻找结直肠癌奥沙利铂耐药性的预测生物标志物 | 结直肠癌细胞系和TCGA、GEO数据库中的结直肠癌样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型 | 转录组数据, 甲基化数据, 单细胞基因表达数据 | TCGA数据集和五个GEO数据集中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 甲基化测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-11-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals bidirectional development of infantile hemangioma
2025-Oct-31, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.593
PMID:41177260
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示婴儿血管瘤的双向发育机制 | 首次在人类婴儿血管瘤中构建单细胞图谱，发现血管瘤壁细胞通过释放VEGFA和PGF配体促进内皮细胞增殖和血管生成的新机制 | 样本量较小（仅3名婴儿），缺乏功能验证实验 | 探究婴儿血管瘤的发病机制和细胞组成 | 婴儿血管瘤组织样本 | 单细胞组学 | 血管瘤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光共定位 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名婴儿的血管瘤样本，共36,237个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-11-04 |
Single-cell sequencing analysis reveals CHURC1 as a non-canonical oncoprotein governing goblet cell-driven colorectal tumorigenesis
2025-Oct-31, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112197
PMID:41177418
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研究论文 | 通过单细胞测序分析发现杯状细胞是结直肠癌的潜在细胞起源，并鉴定CHURC1作为新型致癌基因 | 首次发现杯状细胞作为结直肠癌的细胞起源，并揭示CHURC1作为非经典致癌蛋白的功能机制 | 样本量较小（4名患者），需要更大规模研究验证 | 探索结直肠癌的细胞起源和致癌机制 | 结直肠癌患者肿瘤组织、肠息肉和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名患者的14个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-11-04 |
CXCR6 sustains TRM-driven psoriasis relapse by CXCL16 chemotaxis and curcumol targeting
2025-Oct-31, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.066
PMID:41177431
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研究论文 | 本研究揭示CXCR6/CXCL16轴通过调控组织驻留记忆T细胞（TRM）驱动银屑病复发，并证实姜黄醇可通过靶向该轴抑制疾病复发 | 首次系统阐明CXCR6/CXCL16轴在TRM介导的银屑病复发中的关键作用，并发现姜黄醇作为潜在治疗药物的新机制 | 动物模型与人类疾病存在差异，临床转化需进一步验证 | 阐明CXCR6/CXCL16轴调控TRM细胞导致银屑病复发的机制，探索姜黄醇的治疗潜力 | 银屑病患者临床样本、咪喹莫特诱导的小鼠银屑病模型、TRM细胞 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,流式细胞术,免疫荧光,体外细胞实验 | CXCR6基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞表型数据 | 未明确样本数量，包含临床样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2025-11-04 |
A novel spatial framework to validate arsenic exposure gene expression profiling in bladder cancer using multiplex FISH and AI-powered digital pathology
2025-Oct-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23396-y
PMID:41168438
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研究论文 | 本研究开发了一种结合多重荧光原位杂交和AI数字病理学的空间框架，用于验证膀胱癌中砷暴露相关基因表达特征 | 首次将mFISH与AI驱动的数字病理学整合，在单细胞分辨率下验证砷暴露相关三基因风险模型的空间分布特征 | 仅为探索性试点研究，样本量较小（5个膀胱肿瘤标本），需要更大规模研究验证 | 验证砷暴露相关基因表达特征在膀胱癌中的空间分布及其临床意义 | 膀胱肿瘤组织标本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多重荧光原位杂交(mFISH), AI数字病理分析 | HoverNet | 全切片图像, 基因表达数据 | 5个膀胱肿瘤标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2025-11-04 |
Genome-wide association, single-cell, and spatial transcriptomics analyses reveal the role of the STK24-expressing positive cells in LUAD progression and the tumor microenvironment, identifying STK24 as a potential therapeutic target
2025-Oct-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07111-z
PMID:41168822
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研究论文 | 本研究通过整合基因组关联分析、单细胞转录组学和空间转录组学，揭示了STK24阳性细胞在肺腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次整合GWAS、单细胞和空间转录组学数据，发现STK24作为新的凋亡相关基因在LUAD中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索肺腺癌的遗传机制和潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | GWAS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 多种机器学习算法, 预后模型 | 基因组数据, 转录组数据, 空间位置数据 | 来自FinnGen、IEU OpenGWAS、GWAS Catalog和GEO数据库的多中心样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2025-11-04 |
Ex vivo lung-organoid model for aberrant basaloid cell induction and activation
2025-Oct-30, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00396-z
PMID:41168897
|
研究论文 | 本研究开发了一种离体小鼠肺类器官模型，用于诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞 | 开发了首个能够诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞的离体肺类器官模型，并识别出两种不同的ABC亚群 | 研究基于小鼠模型，与人类疾病可能存在差异；模型验证仍需进一步临床相关性研究 | 研究肺纤维化中异常基底样细胞的诱导机制和功能 | 小鼠肺类器官和异常基底样细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，细胞-细胞相互作用分析 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-11-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals beneficial mechanisms of Exendin-4 in autoimmune uveitis
2025-Oct-30, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117483
PMID:41173056
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的有益作用机制 | 首次探索Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的作用，并发现其通过PIM1-AKT-FOXO1通路调节Teff/Treg细胞平衡的新机制 | NA | 研究Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗作用及其分子机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)模型和Vogt-Koyanagi-Harada病(VKH)患者 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |