单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40432 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-06-14
CD49a+ NK cells promote M2 polarization and are associated with poor pathological response in NSCLC
2026-Jun-12, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究鉴定出CD49a+组织驻留NK细胞亚群,并揭示其通过驱动M2巨噬细胞极化促进非小细胞肺癌免疫抑制微环境的机制 首次鉴定CD49a+ NK细胞作为非小细胞肺癌中的组织驻留亚群,发现其通过CSF-1表达驱动M2巨噬细胞极化并与不良病理反应相关 研究主要基于手术标本,未涉及其他样本类型;机制研究尚未深入阐明CD49a+ NK细胞调控M2极化的具体信号通路 分析非小细胞肺癌肿瘤微环境中NK细胞的异质性,鉴定组织驻留亚群及其临床相关性 非小细胞肺癌手术标本中的NK细胞亚群 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于单细胞转录组分析
22 2026-06-14
Endothelial AGO1 deficiency reduces breast cancer burden in mice
2026-Jun-12, Angiogenesis IF:9.2Q1
研究论文 本研究探讨了内皮细胞特异性AGO1基因敲除对小鼠乳腺癌肿瘤血管生成和免疫调节的影响 首次揭示内皮细胞中AGO1对乳腺癌肿瘤微环境中血管和免疫稳态的关键调控作用,并提出靶向内皮AGO1可能是一种增强抗肿瘤免疫的新型治疗策略 未明确AGO1敲除在人类乳腺癌中的具体机制及长期治疗效果 研究内皮细胞AGO1在乳腺癌血管生成和免疫调节中的功能 小鼠内皮细胞和E0771乳腺癌细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 内皮特异性AGO1敲除小鼠与野生型小鼠若干只 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
23 2026-06-14
Developing WNT-derived bone anabolic peptides for skeletal aging and fracture by reconstructing thumb and index domains of WNT7B
2026-Jun-12, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1
研究论文 通过重建WNT7B的拇指和索引结构域,开发出WNT来源的骨合成肽,用于治疗骨骼老化和骨折 利用AlphaFold增强的序列预测和计算机对接筛选,首次识别WNT7B的重组结构域作为骨合成肽,并通过非经典Ca-NFAT通路独立于致癌的经典Wnt/β-catenin信号发挥作用 未提及具体局限性 开发WNT来源的骨合成肽以治疗骨骼老化和促进骨折愈合 WNT7B肽对老龄小鼠和猪骨质疏松模型的治疗效果,以及其促进间充质干细胞功能和骨再生的机制 机器学习 骨骼老化,骨质疏松 AlphaFold序列预测,计算机对接筛选,单细胞测序,转基因谱系追踪,生化分析 AlphaFold 序列数据,单细胞测序数据,图像(用于骨再生评估) 老龄小鼠和猪骨质疏松模型,临界尺寸骨缺损模型,涉及多种组织样本和细胞(间充质干细胞) NA 单细胞测序 NA NA
24 2026-06-14
Fibronectin 1 mediates pressure-induced aggressive phenotypes in colorectal cancer cells and cancer stem cells
2026-Jun-12, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究揭示纤维连接蛋白1在结直肠癌细胞中介导压力诱导的侵袭性表型及癌症干细胞作用 首次阐明机械压力与纤维连接蛋白1在结直肠癌进展中的协同作用机制 研究主要基于体外模型,缺乏体内实验验证;样本量较小(n=19) 评估纤维连接蛋白1在结直肠癌中的预后作用及其与机械压力的相互作用 结直肠癌细胞及癌症干细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 19对结直肠癌组织及癌旁正常组织;单细胞RNA测序数据(GSE302903) NA 单细胞RNA-seq NA NA
25 2026-06-14
Single-cell RNA sequencing reveals immune-peritubular myoid cell crosstalk driving testicular interstitial fibrosis in idiopathic non-obstructive azoospermia
2026-Jun-12, Cell & bioscience
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示特发性非梗阻性无精子症中免疫-管周肌样细胞交互驱动睾丸间质纤维化的机制 首次识别管周肌样细胞为睾丸间质纤维化的主要贡献者,发现巨噬细胞来源的PDGF信号促进纤维化,并鉴定瑞戈非尼为潜在治疗药物 研究主要基于计算分析和有限样本验证,需进一步在更大队列和动物模型中验证机制及治疗效果 探究特发性非梗阻性无精子症的发病机制,特别是睾丸间质纤维化的细胞和分子机制 特发性非梗阻性无精子症患者和健康对照者的睾丸组织样本 数字病理学, 机器学习 男性不育症 单细胞RNA测序, H&E染色, Masson三色染色, 多重免疫荧光, 网络药理学, 分子对接 细胞间通信分析模型 单细胞转录组数据, 组织图像 特发性非梗阻性无精子症患者和健康对照者的睾丸组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-06-14
Brillouin microscopy for contact- and label-free quantification of tissue stiffness in lung fibrosis
2026-Jun-12, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 利用布里渊显微镜对肺纤维化组织硬度进行无标记、无接触的定量评估 首次证明布里渊显微镜可对肺纤维化组织进行定量空间硬度测量,并整合到常规研究流程中 该研究为概念验证性研究,且仅限于冷冻切片的离体测量,未涉及活体组织检测 评估布里渊显微镜在肺纤维化组织硬度定量表征中的可行性,为机械生物学研究提供新工具 小鼠肺组织冷冻切片(含纤维化及对照组)和人类纤维化肺组织切片 数字病理学 肺纤维化 布里渊显微镜 NA 图像 未在标题和摘要中明确说明样本数量 NA 空间转录组学、空间蛋白质组学、布里渊显微镜 NA 自制布里渊显微镜系统,已用水凝胶刚度标准进行校准
27 2026-06-14
Unraveling the HGF/MET axis in Mallory-Denk body pathogenesis associated with liver fibrosis through single-cell transcriptomics
2026-Jun-11, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 利用单细胞转录组学揭示Mallory-Denk小体(MDB)发病机制中HGF/MET轴的作用及其与肝纤维化的关系 首次通过单核RNA测序(snRNA-seq)识别出与MDB相关的肝细胞亚群(MAHs)及肝星状细胞亚群(aHSCs),并揭示HGF/MET/Ubd轴在MDB形成和肝纤维化中的正反馈调控机制 主要基于动物模型和体外类器官实验,人类样本验证规模有限 探究肝内细胞间交互驱动MDB发病机制及肝纤维化进展的分子途径 小鼠肝纤维化模型、MDB类器官培养样本、含MDB的人肝活检组织 数字病理学 肝纤维化、肝细胞癌 单核RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型(含Ubd基因敲除鼠)及人类肝活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单核RNA测序(snRNA-seq)
28 2026-06-14
ScRNA-seq Data Reveal Gene Upregulation and Downregulation in Oxygen-Induced Retinopathy
2026-Jun-11, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research IF:2.2Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序数据分析氧气诱导的视网膜病变中的基因上调和下调 首次利用单细胞RNA测序数据全面解析氧气诱导视网膜病变中的关键基因表达变化,并鉴定了多个潜在靶基因如Hnrnpu、Vamp2等 研究基于小鼠模型,结果需在人类样本中验证;数据来源单一(GSE150703),可能缺乏普适性 探索早产儿视网膜病变中氧气诱导视网膜病变的靶基因 小鼠视网膜组织细胞 数字病理学 早产儿视网膜病变 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据 来自GSE150703数据集的视网膜组织样本 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
29 2026-06-14
Subgroup-Specific Associations of GRIA Genes Encoding AMPA Glutamate Receptor Subunits with Patient Survival in Medulloblastoma
2026-Jun-11, Neuromolecular medicine IF:3.3Q2
研究论文 探讨了编码AMPA谷氨酸受体亚基的GRIA基因在髓母细胞瘤不同分子亚型中的表达模式及其与患者生存的关联 首次系统分析了GRIA1-4基因在髓母细胞瘤不同分子亚型和组织学变异中的表达差异,并发现其与患者总生存期存在亚型特异性的对立关联,特别是SHH亚型中GRIA3和GRIA4的预后作用截然相反 研究主要基于公开数据集和细胞系分析,缺乏独立队列验证和功能机制研究 探索AMPA受体亚基编码基因GRIA在髓母细胞瘤不同亚型中的表达特征及其对预后的影响 髓母细胞瘤肿瘤组织样本和细胞系 数字病理学 髓母细胞瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR NA 转录组数据, 单细胞转录组数据 包含多个髓母细胞瘤数据集和细胞系,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
30 2026-06-14
Fgf18 marks reserve skeletal progenitors in the fibrous periosteum contributing to bone fracture repair
2026-Jun-11, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和RNA原位杂交技术,鉴定出Fgf18标记的纤维骨膜储备祖细胞在骨修复中的关键作用 首次发现Fgf18作为纤维骨膜层中离散祖细胞群的分子标记,并证明其在骨折后被激活分化为软骨细胞和成骨细胞,补充了现有骨膜祖细胞知识 未明确Fgf18细胞的体内激活信号通路,且研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类骨修复过程 阐明骨膜中祖细胞的分子身份和生态位,揭示其在骨折修复中的功能 小鼠长骨中的纤维骨膜细胞 数字病理学 骨折修复 单细胞RNA测序, RNA原位杂交, 谱系追踪, 基因消融 NA 基因表达数据, 组织化学图像 小鼠长骨组织样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞RNA测序;RNA原位杂交采用标准流程
31 2026-06-14
Causal effect estimation from trans-regulatory single-cell CRISPR screens
2026-Jun-10, Cell genomics IF:11.1Q1
评论 介绍从反式调控单细胞CRISPR筛选实验中估计因果效应的关键概念和原则 系统解析了在单细胞CRISPR研究中将统计关联解释为因果效应所需的核心假设,并通过实例展示假设违背如何导致偏差 未提出新的统计方法或验证框架,仅对现有方法进行因果假设层面的综述性分析 阐明在反式调控单细胞CRISPR研究中实现因果效应估计的统计原则与假设条件 单细胞CRISPR筛选实验中的基因扰动与表达数据的因果关联 机器学习 NA CRISPR, 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-06-14
circVDJ-seq for T cell clonotype detection in single-cell and spatial multi-omics
2026-Jun-10, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 介绍circVDJ-seq技术,用于在单细胞和空间多组学中简化且经济高效地检测T细胞受体库 提出一种无需专用测序设备的简化TCR检测方法,适用于多种3'端定向工作流程(如单细胞RNA-seq、ATAC+RNA多组学和空间转录组学) 未在摘要中明确说明研究局限性 开发一种简化且经济高效的T细胞受体(TCR)分析方法,以克服现有VDJ信息获取的资源密集型或设备专用限制 新鲜切除的神经母细胞瘤标本以及受肺炎或COVID-19影响的尸检淋巴结组织 数字病理学 神经母细胞瘤, 肺炎, COVID-19 circVDJ-seq NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, ATAC+RNA多组学数据 新鲜切除的神经母细胞瘤标本和受肺炎或COVID-19影响的尸检淋巴结(具体样本数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC+RNA多组学, 空间转录组学 NA NA
33 2026-06-14
A Systemic Immune State Axis Distinguishes Psoriatic Arthritis from Psoriasis
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过分析多项公开数据集,定义了区分银屑病关节炎与银屑病的系统性免疫状态轴 首次定义了一个与银屑病关节炎相关的系统性免疫状态坐标(CRS),该坐标独立于皮肤炎症反应轴(DIR),并在多种数据层面验证其区分能力 研究依赖公开数据集,可能受限于样本异质性和数据整合的批次效应;主要关注未治疗患者,治疗影响未充分探讨 揭示区分银屑病与银屑病关节炎的系统性免疫状态特征 银屑病患者、银屑病关节炎患者及健康对照者 机器学习 银屑病、银屑病关节炎 全血甲基化测序、单细胞RNA测序、RNA测序、甲基化测序 NA 甲基化数据、单细胞转录组数据、转录组数据 跨四个核心公开数据集,涉及全血甲基化、PBMC单细胞RNA测序(受试者层面汇总)、皮肤RNA测序和纯化CD4 T细胞甲基化,外加两个外部皮肤队列 NA 单细胞RNA测序、全血甲基化测序、RNA测序 NA NA
34 2026-06-14
Integrated Transcriptomic Analysis Suggests a C1Q-Related Macrophage-Fibroblast Signaling Axis in Keloids
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过整合转录组分析,揭示瘢痕疙瘩中C1Q相关的巨噬细胞-成纤维细胞信号轴 首次提出C1Q相关的巨噬细胞-成纤维细胞通讯模型,并通过体外实验初步验证C1Q对瘢痕疙瘩成纤维细胞的激活作用 研究主要基于公共数据集和初步体外实验,缺乏体内实验验证和更深入的机制研究 阐明巨噬细胞功能状态如何调控瘢痕疙瘩中成纤维细胞的病理性激活 瘢痕疙瘩组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 生物信息学 瘢痕疙瘩 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 组织免疫荧光 NA 转录组数据, 图像 多个公共数据集及组织样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
35 2026-06-14
Integrating Single-Cell Profiling with Generative AI for De Novo Design of MMP9 Protein Binders in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2026-Jun-05, Molecules (Basel, Switzerland)
研究论文 结合单细胞RNA测序和生成式AI设计针对弥漫大B细胞淋巴瘤中MMP9的蛋白结合剂 首次整合单细胞RNA测序与生成式AI管道(RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold),用于设计靶向MMP9 PEX结构域的蛋白结合剂 研究仅验证了部分设计蛋白的结合能力,且蛋白结合剂的体内功能及疗效尚未评估 探索MMP9在弥漫大B细胞淋巴瘤ABC亚型中的细胞来源,并设计靶向MMP9的蛋白结合剂 MMP9蛋白及其PEX结构域,弥漫大B细胞淋巴瘤ABC亚型中的特异性巨噬细胞 机器学习 弥漫大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序,生成式AI(RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold),ELISA RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold 单细胞转录组数据、蛋白质结构数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-06-14
Integrative Transcriptomics and Machine Learning Identify Macrophage-Associated Biomarkers in Hypertrophic Cardiomyopathy
2026-Jun-04, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过整合转录组学和机器学习,在单细胞水平上分析巨噬细胞相关基因在肥厚型心肌病中的表达,识别出三个核心基因并构建诊断模型 首次利用单细胞RNA测序结合机器学习方法系统鉴定肥厚型心肌病中巨噬细胞相关的生物标志物并建立诊断模型 基于公开数据集,结果需进一步在独立队列中验证;样本量有限,可能影响模型泛化性 探究肥厚型心肌病的分子机制,识别巨噬细胞相关的生物标志物并构建诊断模型 肥厚型心肌病患者的心肌组织细胞,包括巨噬细胞在内的免疫细胞亚群 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序,批量RNA测序,LASSO回归 LASSO回归模型,机器学习 基因表达数据 多个公开数据集(GSE181764、GSE161921、GSE249925),具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
37 2026-06-14
SpatioCell: deep integration of histology and spatial transcriptomics for profiling the cellular microenvironment at single-cell level
2026-Jun-03, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 提出了SpatioCell算法,通过整合组织学与空间转录组学数据,以单细胞分辨率自动提取细胞类型和表达信息 创新性地通过动态规划结合形态与转录组信息,实现确定性单细胞空间重构,纠正去卷积错误并揭示被忽视的微环境特征 NA 开发一种计算算法,将空间转录组数据提升至单细胞分辨率,以深入理解细胞空间组织 三阴性乳腺癌组织样本中的空间转录组数据 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 动态规划 图像, 转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
38 2026-06-14
Integrated Single-Cell RNA-Seq and Machine Learning to Construct an EMT Infiltration Scoring Model for Prostate Cancer
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序和机器学习构建前列腺癌上皮-间充质转化浸润评分模型 首次在单细胞水平系统描绘前列腺癌中EMT的细胞异质性,并整合机器学习构建一个稳健的EMT浸润评分模型,用于预后预测和治疗指导 未提及明显的局限性 探索前列腺癌中EMT的细胞异质性及其临床意义,构建预后预测模型 前列腺癌细胞,包括恶性上皮细胞 机器学习 前列腺癌 单细胞RNA测序 LASSO回归 单细胞转录组数据、批量转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
39 2026-06-14
Multi-Dimensional Transcriptomics Reveals the Prominent Role of Neuroinflammation in Alzheimer's Disease
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在阿尔茨海默病神经炎症研究中的应用,揭示了细胞异质性和区域异质性 通过整合单细胞和空间转录组技术,首次系统描绘了阿尔茨海默病中神经炎症的细胞状态转换和区域特异性微环境特征 作为综述未提供新的实验数据,且不同研究平台间的数据整合仍存在挑战 阐明阿尔茨海默病中神经炎症的细胞和分子机制,总结单细胞和空间组学技术的应用进展 阿尔茨海默病动物模型和人类脑组织中的小胶质细胞、星形胶质细胞及神经炎症相关基因表达 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
40 2026-06-14
Beyond Molecular Classification in Metastatic Triple-Negative Breast Cancer: Toward Subtype-Guided Precision Oncology
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了转移性三阴性乳腺癌的分子分类及其在精准肿瘤学中的应用 系统整合了mTNBC的基因组、转录组、表观遗传、免疫、基质及生物力学维度的肿瘤异质性,并介绍了新兴工具如单细胞RNA测序、空间转录组学和循环肿瘤DNA分析在患者分层中的潜力 临床实施需要更高的方法学标准化、经过验证的预测性生物标志物、可及的诊断平台以及能够捕捉治疗压力下亚型演变的动态监测策略 探索mTNBC的分子分类和亚型导向的精准治疗策略 转移性三阴性乳腺癌及其分子亚型(BL1、BL2、M、MSL、IM、LAR) 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 循环肿瘤DNA分析, 长链非编码RNA分析, 免疫组化 NA 基因表达数据, 表观遗传数据, 免疫组化数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 单细胞RNA测序和空间转录组学技术
回到顶部