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当前共找到 33780 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-12-09 |
Targeting the pentose phosphate pathway mitigates graft-versus-host disease by rewiring alloreactive T cell metabolism
2025-Dec-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.192774
PMID:41355795
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研究论文 | 本研究揭示了磷酸戊糖途径在急性移植物抗宿主病中的关键作用，并发现靶向该途径的限速酶6PGD可减轻疾病严重程度同时保留抗肿瘤效应 | 首次系统阐明磷酸戊糖途径在调控同种异体T细胞代谢重编程和aGvHD发病中的核心作用，并验证6PGD抑制剂6AN的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；长期抑制PPP对免疫系统的潜在影响尚未明确 | 探索葡萄糖代谢替代途径在减轻急性移植物抗宿主病中的作用机制 | 同种异体造血细胞移植中的供体T细胞 | 单细胞组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的同种异体和异种移植T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-12-09 |
scSemiPLC: a semi-supervised learning framework for annotating single-cell RNA-Seq data by generating pseudo-labels through clustering
2025-Dec-08, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00223-25
PMID:41358754
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研究论文 | 本文提出了一种名为scSemiPLC的单细胞半监督注释训练框架，通过聚类和一致性正则化生成伪标签，以提高单细胞RNA测序数据的注释效率和准确性 | scSemiPLC利用现有标签信息指导未标记数据的聚类，并通过扰动数据预测与伪标签的一致性约束，解决了传统高阈值伪标签范式对未标记数据利用率低的问题，为半监督学习领域的细胞注释提供了新方法 | NA | 开发一种高效且便捷的自动化单细胞RNA测序数据注释方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 半监督学习框架 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-12-09 |
Single-cell sequencing and organoids: applications in organ development and disease
2025-Dec-08, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00364-6
PMID:41359105
|
综述 | 本文综述了单细胞测序与类器官技术在器官发育和疾病研究中的整合应用及其协同潜力 | 系统性地探索了单细胞测序与类器官技术的协同潜力，并展望了其与空间转录组学、基因编辑等前沿技术的深度整合，以推动生命科学从描述性研究向机制驱动、精准导向和个性化方法的转变 | NA | 探讨单细胞测序与类器官技术在器官发育、疾病机制及治疗创新等生物医学研究领域的应用 | 器官（包括大脑、肺、心脏、肝脏、肠道和肾脏）的发育机制，以及神经退行性疾病、遗传病、传染病、代谢综合征和肿瘤等多种疾病的体外模型 | 数字病理学 | 多种疾病（包括神经退行性疾病、遗传病、传染病、代谢综合征和肿瘤） | 单细胞测序，空间转录组学，基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2025-12-09 |
Interferon signaling pathways in health and disease
2025-Dec-08, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00381-5
PMID:41359111
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综述 | 本文全面综述了干扰素信号通路的分子机制及其在健康和疾病中的作用 | 整合了经典与非经典干扰素信号通路，并探讨了新兴的单细胞组学技术如何推动个性化干扰素治疗策略的发展 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，且新兴治疗策略的临床有效性仍需进一步验证 | 概述干扰素信号通路的分子机制及其在免疫调节、疾病发生和治疗中的临床意义 | 干扰素及其信号通路组件，包括JAK-STAT、MAPK、PI3K-AKT-mTOR等 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病、神经炎症、心血管疾病、癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-12-09 |
IER3 drives the transition from sepsis-associated AKI to CKD by suppressing the mitochondrial translocation of PRDX5
2025-Dec-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05963-8
PMID:41359162
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研究论文 | 本研究揭示了IER3通过抑制PRDX5的线粒体转位，驱动肾小管上皮细胞应激诱导的衰老，从而促进脓毒症相关急性肾损伤向慢性肾病转变的分子机制 | 首次阐明了IER3在脓毒症相关急性肾损伤慢性化过程中的关键作用，并发现了IER3通过与Parl相互作用抑制PRDX5线粒体转位这一新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；IER3-Parl-PRDX5轴在其它器官纤维化中的作用未探讨 | 探究IER3在脓毒症相关急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的作用机制 | 肾小管上皮细胞、小鼠脓毒症相关急性肾损伤模型 | 分子病理学 | 急性肾损伤、慢性肾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织病理数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和患者单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-12-09 |
Endothelial LRRC8A mitigates pressure overload-induced cardiac hypertrophy by promoting coronary angiogenesis
2025-Dec-07, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-10021-9
PMID:41353685
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞LRRC8A在压力超负荷诱导的心脏肥大中的作用，发现其通过促进冠状动脉血管生成来缓解病理变化 | 首次揭示内皮LRRC8A通过调节VEGF-VEGFR2轴和促进VEGFR2内吞作用来促进冠状动脉血管生成，从而缓解压力超负荷诱导的心脏肥大 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；机制细节如LRRC8A与VEGFR2互作的具体分子途径需进一步探索 | 研究内皮LRRC8A在压力超负荷诱导的病理性心脏肥大中的功能和机制 | 人类和小鼠的肥大心脏及心脏内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及患者和小鼠样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-12-09 |
RBM8A confers oxaliplatin resistance in gastric cancer by maintaining EGFR mRNA stability
2025-Dec-07, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03655-y
PMID:41354714
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研究论文 | 本研究揭示了RBM8A通过稳定EGFR mRNA促进胃癌细胞对奥沙利铂化疗耐药的新机制 | 首次通过靶向siRNA筛选发现RBM8A在胃癌奥沙利铂耐药中的核心作用，并阐明其通过招募eIF4A3稳定EGFR mRNA、促进NHEJ介导的DNA修复的分子机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床验证仍需扩大样本量；EGFR抑制剂与奥沙利铂的联合疗法需进一步临床试验验证 | 探究RNA结合蛋白在胃癌化疗耐药中的作用机制 | 胃癌细胞系、异种移植模型、临床组织样本 | 癌症生物学 | 胃癌 | siRNA筛选、单细胞RNA测序、组织芯片分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、临床生存数据 | 40个RBM家族成员的siRNA筛选、临床组织芯片样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-12-09 |
Harnessing plasma transcriptomics for non-invasive cancer biomarker identification: a comprehensive review
2025-Dec-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04232-1
PMID:41354890
|
综述 | 本文全面综述了利用血浆转录组学进行非侵入性癌症生物标志物识别的技术、分析流程、挑战及未来趋势 | 系统性地评估了多种转录组学技术（如RNA-seq、scRNA-seq、空间转录组学）在血浆样本中的应用潜力，并强调了整合分析（如元分析和AI辅助多组学整合）等新兴趋势对增强生物标志物发现的推动作用 | 血浆转录组学目前存在技术局限性，包括RNA降解、低产量以及缺乏标准化流程，限制了其临床转化 | 旨在为癌症研究人员和临床医生提供血浆转录组学的基础知识和实用见解，推动其在精准肿瘤学和非侵入性癌症诊断中的应用 | 血浆样本中的转录组 | 自然语言处理 | 癌症 | 高通量测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-12-09 |
A DSSM network for inferring and prioritizing cell-type-specific regulons using single-cell RNA-seq data
2025-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06329-4
PMID:41354912
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为DSSMReg的深度结构化语义模型，用于从单细胞RNA-seq数据中推断和优先排序细胞类型特异性调控子 | 开发了首个结合单细胞转录组数据和转录因子基序数据，通过深度结构化语义模型将转录因子和靶基因映射到低维语义空间，并利用余弦相似度评估调控强度以推断细胞类型特异性调控子的方法 | 未明确说明模型对数据质量和规模的敏感性，以及在不同组织或疾病类型中的泛化能力 | 开发一种能够准确推断和优先排序细胞类型特异性调控子的计算方法 | 转录因子、靶基因、调控子、单细胞RNA-seq数据 | 计算生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | 深度结构化语义模型（DSSM） | 单细胞转录组数据、转录因子基序数据 | 五个细胞系、三阴性乳腺癌样本、人骨髓造血干细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-12-09 |
Organoid-derived photoreceptor precursors enriched by CD9⁻CD81mid sorting restore visual function in RCS rats
2025-Dec-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04848-8
PMID:41354961
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研究论文 | 本研究通过分析人视网膜类器官的单细胞RNA测序数据，鉴定出CD9⁻CD81mid表面标记物，用于富集光感受器前体细胞，并将其移植到RCS大鼠视网膜下腔，成功改善了视觉功能 | 开发了一种基于CD9⁻CD81mid表面标记物、无需基因标记的临床可转化策略，用于富集高纯度、低增殖活性的光感受器前体细胞 | 研究仅在RCS大鼠这一临床前模型中进行，尚未在人体中进行验证 | 开发一种安全、可临床转化的细胞疗法，用于治疗视网膜退行性疾病 | 人视网膜类器官来源的光感受器前体细胞和RCS大鼠模型 | 单细胞组学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人视网膜类器官和RCS大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-12-09 |
Fibroblast-driven MMP-9/TIMP-1 imbalance in bronchoalveolar lavage reflects fibrotic progression in interstitial lung disease
2025-Dec-07, European journal of clinical investigation
IF:4.4Q2
DOI:10.1111/eci.70162
PMID:41354972
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研究论文 | 本研究通过分析间质性肺病患者的支气管肺泡灌洗液，揭示了成纤维细胞驱动的MMP-9/TIMP-1失衡与纤维化进展的关系 | 首次在人类ILD患者中系统评估BAL液中MMP-9/TIMP-1比值与纤维化严重程度的关系，并利用单细胞RNA测序数据确认了成纤维细胞/肌成纤维细胞是TIMP-1的主要细胞来源 | 样本量较小（48例），为单中心研究，需要更大规模的多中心研究进行验证 | 评估ILD患者BAL液中MMP-9/TIMP-1比值，探究其与纤维化严重程度的关系及成纤维细胞/肌成纤维细胞的贡献 | 间质性肺病患者（包括非纤维化ILD、纤维化ILD和特发性肺纤维化） | 数字病理学 | 肺纤维化 | 酶联免疫吸附试验，明胶酶谱法，免疫荧光，单细胞RNA测序数据分析 | DESeq2模型 | 蛋白质浓度数据，酶活性数据，单细胞RNA测序数据 | 48例连续ILD患者的BAL样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-12-09 |
MicroRNA-mediated neuronal detargeting alters astrocyte cell fate conversion trajectories in vivo
2025-Dec-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09169-3
PMID:41350397
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研究论文 | 本研究通过在GFAP微型启动子驱动的转录盒中引入microRNA-124靶序列，优化了体内星形胶质细胞向神经元重编程的特异性，并揭示了不同转录因子组合对细胞命运转换轨迹的调控作用 | 首次将microRNA-124靶序列整合到星形胶质细胞重编程系统中，有效避免了内源性神经元的脱靶转染，并通过单细胞转录组学揭示了重编程过程中细胞命运分叉的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类细胞或临床环境中验证；对长期重编程细胞的稳定性和功能整合评估有限 | 优化体内星形胶质细胞向神经元重编程的特异性，并探究细胞命运转换的分子机制 | 小鼠星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、假时间轨迹分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及谱系追踪和单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-12-09 |
Genetic insights into drug targets for alzheimer's disease: integrative multi-omics analysis
2025-Dec-05, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-025-01901-9
PMID:41350740
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研究论文 | 本研究通过整合多组学孟德尔随机化分析，识别阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 克服了先前研究表型覆盖窄、多组学验证不足和机制探索不充分的限制，通过全面MR分析识别稳健治疗靶点 | NA | 识别阿尔茨海默病的遗传药物靶点 | 阿尔茨海默病及相关生物标志物、神经影像内表型、认知特征和风险因素 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组, 蛋白质组, 转录组 | 超过50个GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-12-09 |
CXCL12 deficiency promotes colorectal cancer progression and reduces anti-PD-L1 immunotherapy efficacy through MDSC regulation
2025-Dec-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07309-1
PMID:41351014
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组测序分析、体外细胞实验和体内动物实验，探讨了CXCL12缺乏如何通过调控髓源性抑制细胞（MDSC）促进结直肠癌进展并降低抗PD-L1免疫疗法的疗效 | 识别了CPEB3、DDX39B和SIDT2作为结直肠癌的生物标志物，并揭示了CXCL12通过调控MDSC影响抗PD-L1疗效的新机制，为理解免疫疗法失败提供了新框架 | NA | 探究CXCL12缺乏在结直肠癌进展及抗PD-L1免疫疗法耐药性中的作用机制 | 结直肠癌细胞、动物模型、单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、机器学习、体外细胞实验、体内动物实验 | 机器学习方法 | 转录组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-12-09 |
CausalGenDiff: Generative causal diffusion bridges scRNA-seq and spatial transcriptomics
2025-Dec-05, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2025.104966
PMID:41354118
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研究论文 | 本文提出了一种名为CausalGenDiff的生成式因果扩散模型，用于有效整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据 | 首次将因果基因关系纳入scRNA-seq与ST数据整合过程，通过结合扩散和自回归过程来利用潜在的因果依赖性，并将原本为图像生成设计的因果注意力变换器扩展到处理高维基因表达数据 | 未明确说明模型在更复杂组织或疾病状态下的泛化能力，也未讨论计算资源需求 | 提高单细胞RNA测序与空间转录组学数据整合的准确性和结构相似性 | 基因表达数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 扩散模型，自回归模型，变换器，变分自编码器 | 基因表达数据 | 10个组织数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2025-12-09 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Dec-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108331
PMID:41342897
|
研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠视网膜前体细胞中的Ptbp1基因，评估其在发育性神经发生中的作用，发现Ptbp1对视网膜细胞命运决定并非必需 | 首次在体内条件下系统评估Ptbp1在视网膜神经发生中的功能，挑战了Ptbp1作为神经发生核心抑制因子的传统观点 | 研究仅聚焦于视网膜发育，未在其他神经系统或成年神经发生中验证Ptbp1的功能 | 探究RNA结合蛋白Ptbp1在发育性神经发生中的具体作用机制 | 小鼠视网膜前体细胞和Müller胶质细胞 | 发育神经生物学 | NA | 条件性基因敲除、免疫染色、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、剪接模式数据 | 突变型小鼠视网膜组织（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-12-09 |
Altered somatostatin receptor 3 expression and functional dysregulation in tuberous sclerosis complex
2025-Dec-04, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2025.102864
PMID:41352576
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和电生理学方法，揭示了结节性硬化症中生长抑素信号通路的功能失调及其对抑制性网络的影响 | 首次在结节性硬化症中系统描述了生长抑素受体3的表达改变及其功能代偿作用，并揭示了该受体亚型在疾病中独特的调节机制 | 研究样本量有限，且主要基于体外电生理实验，体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究结节性硬化症中生长抑素信号通路的表达变化和功能失调机制 | 人脑皮质样本（对照组和结节性硬化症组）及非洲爪蟾卵母细胞 | 神经科学 | 结节性硬化症 | 单细胞RNA测序，电生理记录，膜片钳技术 | NA | 单细胞转录组数据，电生理信号数据 | 未明确具体样本数量，涉及对照组和结节性硬化症组的人脑皮质样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-12-09 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Molecular Mechanisms of Neutrophil Dysfunction in Chronic Bone Infection
2025-Dec-04, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了慢性骨感染中中性粒细胞功能障碍的分子机制 | 首次在MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中，通过单细胞RNA测序识别出7个中性粒细胞亚群，并发现NeuP2ry10亚群变化最显著，揭示了中性粒细胞向N2抗炎表型极化的分子特征 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性有待验证；单细胞测序样本量可能有限 | 探究慢性骨感染中中性粒细胞功能异常的分子机制 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中的骨髓细胞 | 单细胞组学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序，基因本体论分析，通路富集分析，免疫荧光染色，活性氧定量 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2025-12-09 |
Identification of Neurotrophic Factor Related Biomarkers and Mechanistic Insights into Neuropathic Pain via Integrated Bioinformatics Analysis
2025-Dec-02, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c07765
PMID:41358093
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学方法，识别了与神经病理性疼痛相关的关键生物标志物并探索其潜在机制 | 首次结合单细胞RNA测序、差异表达分析、孟德尔随机化及细胞通讯分析，系统识别了五个神经营养因子相关生物标志物，并揭示了它们在神经病理性疼痛中的潜在因果关联和细胞间相互作用 | 研究主要基于公共数据库和小鼠背根神经节数据，人类样本验证不足，且机制探索仍处于生物信息学预测阶段 | 识别神经病理性疼痛的关键生物标志物并探索其潜在机制 | 小鼠背根神经节细胞及神经病理性疼痛相关基因表达数据 | 生物信息学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序，差异表达分析，孟德尔随机化，细胞通讯分析 | NA | RNA-seq数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-12-09 |
Distinct roles of Atf3, Zfp711 and Bcl6b in early embryonic hematopoietic and endothelial lineage specification
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204792
PMID:41200855
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术结合基因敲除，探讨了Atf3、Zfp711和Bcl6b这三个转录因子在小鼠胚胎干细胞早期造血和内皮谱系分化中的独特作用 | 首次在单细胞分辨率下系统研究了Atf3、Zfp711和Bcl6b这三个相对未被充分研究的转录因子在早期胚胎造血发育中的功能，揭示了它们在谱系分化中的不同调控机制 | 研究主要基于体外分化的小鼠胚胎干细胞模型，可能无法完全反映体内胚胎发育的复杂性；Bcl6b在早期造血中的作用未观察到明显效应，其具体功能仍需进一步探索 | 解析早期胚胎造血和内皮谱系分化中转录因子的调控网络 | 小鼠胚胎干细胞及其分化产生的造血和内皮谱系细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及体外分化的小鼠胚胎干细胞及其衍生细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |