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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-14 |
Bioinformatics driven in gene targeting platform for gold anticancer strategy delivery
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102438
PMID:41209699
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别TNBC中高表达基因SDC1,并构建金纳米簇靶向核酸递送系统抑制肿瘤血管生成 | 首次发现SDC1基因与TNBC预后及依托泊苷耐药性的正相关性,并开发了基于肿瘤微环境响应性的金纳米簇靶向递送系统 | NA | 发现新的靶向基因并开发核酸递送系统用于三阴性乳腺癌治疗 | 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤微环境 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因芯片数据分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-11-14 |
Probiotics derived sodium benzoate improves social behavior of offspring exposed in the maternal immune activation through regulation of histone lysine benzoylation in astrocytes
2025-Dec, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03164-0
PMID:40855005
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研究论文 | 本研究揭示益生菌衍生的苯甲酸钠通过调控星形胶质细胞组蛋白赖氨酸苯甲酰化改善母体免疫激活后代社交行为 | 首次发现益生菌代谢物苯甲酸钠通过组蛋白赖氨酸苯甲酰化表观遗传机制调节星形胶质细胞功能,揭示微生物-肠-脑轴新作用通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 | 探索益生菌代谢物改善自闭症谱系障碍社交行为的分子机制 | 母体免疫激活诱导的自闭症小鼠模型及星形胶质细胞 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,RNA测序,Cut & Tag分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,表观遗传数据 | 自闭症队列人群及MIA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,表观遗传分析 | NA | NA |
| 23 | 2025-11-14 |
Comparative transcriptomics of lateral hypothalamic cell types reveals conserved growth hormone-tachykinin dynamics in feeding
2025-Dec, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102251
PMID:40947010
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研究论文 | 本研究通过比较转录组学分析揭示了侧下丘脑细胞类型中生长激素-速激肽动态在摄食行为中的保守机制 | 首次在斑马鱼和老鼠中鉴定出共表达生长激素受体和速激肽的保守GABA能神经元集群,并发现其在摄食状态下的激活机制 | 研究主要基于幼虫斑马鱼模型,在成年动物和人类中的保守性需要进一步验证 | 阐明侧下丘脑神经元在食欲调控中的分子和细胞特征及其进化保守性 | 斑马鱼和老鼠的侧下丘脑神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序,Act-seq方法,整合比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 幼虫斑马鱼侧下丘脑神经元(饥饿和饱食状态) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Act-seq方法(活动依赖性转录特征捕获) |
| 24 | 2025-11-14 |
LILRB4 regulates circadian disruption-induced mammary tumorigenesis via non-canonical WNT signaling pathway
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03597-5
PMID:41102383
|
研究论文 | 本研究探讨了昼夜节律紊乱通过LILRB4和非经典WNT信号通路促进乳腺肿瘤发生的作用机制 | 首次揭示LILRB4作为昼夜节律紊乱与侵袭性乳腺肿瘤发生之间的关键连接分子,并证明靶向LILRB4免疫疗法可抑制肿瘤转移 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明昼夜节律紊乱促进乳腺肿瘤发生的分子机制 | 侵袭性乳腺癌基因工程小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫染色,实时PCR | 基因工程小鼠模型 | 单细胞测序数据,流式数据,图像数据,基因表达数据 | LD12:12和昼夜节律紊乱小鼠的肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-11-14 |
Uncovering the Molecular Networks of Extracellular Vesicles in the Pathogenesis of Periodontitis
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103936
PMID:41138693
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研究论文 | 通过整合多种组学数据揭示牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和因果遗传分析系统研究牙周炎中的EV相关基因网络 | 需要进一步的实验验证 | 探索牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 牙周炎患者组织、外周血及糖尿病共病牙周炎病例 | 生物信息学 | 牙周炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 因果遗传分析, 药物重定位, 分子对接 | XGBoost, 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-11-14 |
Multi-tissue spatial transcriptomics identified simultaneous responses to oxidative stress and apoptosis in parallel with tissue-specific reprogramming in modeled chronic kidney disease-mineral and bone disorder
2025-Dec, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf161
PMID:41216610
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研究论文 | 本研究采用多组织空间转录组学方法,揭示了慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱模型中氧化应激和凋亡的同步响应以及组织特异性重编程 | 首次在多组织水平上同时分析皮质骨、肌肉和骨髓的空间转录组变化,识别了组织共性和特异性基因组重编程 | 研究仅使用雄性小鼠模型,样本量相对有限,且为饮食诱导的疾病模型 | 探究慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱中肌肉骨骼功能障碍的分子机制 | 腺嘌呤饮食诱导的慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱雄性小鼠的股骨-肌肉组织 | 空间转录组学 | 慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱 | 空间转录组学,qPCR | UMAP分析 | 空间转录组数据,基因表达数据 | 腺嘌呤饮食组和酪蛋白对照组雄性小鼠 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组技术 |
| 27 | 2025-11-14 |
Elucidating the Mechanism of Radiation Therapy on Mesenchymal Cell Fate in Preventing Heterotopic Ossification
2025-Dec-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006366
PMID:38829115
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研究论文 | 本研究通过动物模型探究放射治疗预防异位骨化的机制,在单细胞水平分析辐射对间充质细胞命运的影响 | 首次在创伤性异位骨化预防中探索放射治疗的机制,通过单细胞RNA测序揭示辐射对间充质祖细胞的影响 | 研究仅使用C57BL6J雄性小鼠模型,结果可能不适用于其他物种或性别 | 阐明放射治疗预防异位骨化的分子机制 | C57BL6J雄性小鼠的间充质祖细胞 | 单细胞生物学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序,免疫荧光显微镜,显微计算机断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | C57BL6J雄性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-11-14 |
Analysis of the role of RNA regulatory networks in cancer treatment: Mechanisms, applications and future prospects (Review)
2025-Dec, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2909
PMID:41220798
|
综述 | 本文综述了RNA调控网络在癌症治疗中的作用机制、应用前景及未来发展方向 | 重点关注isomiRs的独特功能特性及其在精准肿瘤学中的转化潜力,整合了单细胞测序和CRISPR筛选等先进技术 | NA | 探讨RNA调控网络在癌症治疗中的作用机制和应用前景 | RNA调控网络、isomiRs、竞争性内源RNA网络 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞测序、CRISPR筛选 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-11-14 |
A drop-based workflow for fast and robust joint profiling of transcriptome and chromatin accessibility in the same cell
2025-Dec, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000258
PMID:41221081
|
研究论文 | 开发了一种基于液滴的微流控工作流程,可在同一细胞中同时分析转录组和染色质可及性 | 提出快速稳健的液滴微流控方案实现单细胞多组学联合分析,具有高灵敏度和特异性 | NA | 开发单细胞多组学技术以解析细胞异质性和表观遗传调控机制 | 单个细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 数万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | 基于液滴的微流控系统,包含凝胶珠乳浊液(GEM)生成技术 |
| 30 | 2025-11-14 |
TLR4-IN-C34 attenuates the progression of osteoarthritis through inhibiting inflammation, angiogenesis and pain
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112084
PMID:40854507
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研究论文 | 本研究探讨TLR4抑制剂C34通过抑制炎症、血管生成和疼痛减缓骨关节炎进展的作用机制 | 首次在单细胞水平证实TLR4在OA患者软骨中表达升高,并发现新型TLR4抑制剂C34具有多重抗OA效应 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行人体临床试验 | 探索TLR4抑制剂C34对骨关节炎的治疗潜力及作用机制 | 人类软骨样本、小鼠骨关节炎模型、软骨细胞 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、体外细胞实验、动物模型 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 人类OA患者软骨样本、DMM手术小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-11-14 |
Fibroblast Ferroptosis Aggravates Inflammation Response in Dental Pulpitis
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103927
PMID:41076786
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研究论文 | 本研究揭示了牙髓成纤维细胞铁死亡在牙髓炎炎症反应中的关键作用 | 首次发现牙髓成纤维细胞铁死亡与牙髓免疫病理之间的机制联系 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化需进一步验证 | 探究铁死亡在牙髓炎中的功能意义及治疗策略 | 人牙髓组织、小鼠模型、牙髓成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光共定位、细胞培养 | NA | 转录组数据、图像数据 | 人牙髓组织样本、实验小鼠模型、体外细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-11-14 |
Simultaneously infer cell pseudotime, velocity field, and gene interaction from multi-branch scRNA-seq data with scPN
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf144
PMID:41229398
|
研究论文 | 提出一种名为scPN的新型高维动力学建模方法,可从单细胞RNA测序数据中同时推断细胞伪时间、速度场和基因相互作用 | 首次能够在多分支数据集上同时恢复伪时间、速度场和基因相互作用,使用分段基因-基因相互作用网络建模基因调控动力学 | NA | 从单细胞RNA测序数据建模细胞动力学,理解细胞发育和基因调控关系 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高维动力学模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-11-14 |
Allele-specific immune gene quantification and expression analysis in single-cell RNA-seq data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf149
PMID:41229397
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据中等位基因特异性免疫基因定量和表达分析的新型计算方法 | 开发了新颖的R/Bioconductor数据结构,能够处理多个免疫遗传注释层的表达数据,并支持免疫基因表达的交互式探索 | NA | 研究人类免疫基因组多样性中的等位基因特异性表达模式 | 人类免疫基因(如HLA和杀伤性Ig样受体) | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-11-14 |
Mitochondrial iron transport via MFRN1 is required for erythroid cell cycle progression
2025-Nov-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014887
PMID:40601908
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体铁转运蛋白MFRN1通过促进红细胞周期G2/M期进展来调控红细胞生成的新机制 | 首次在体内证明MFRN1介导的线粒体铁转运对红细胞周期进程的关键作用,并发现其特异性影响终末分化红细胞的发育 | 研究主要基于斑马鱼胚胎模型,在哺乳动物系统中的普适性需要进一步验证 | 探究铁代谢如何调控红细胞生成过程 | 斑马鱼胚胎红细胞系 | 发育生物学 | 贫血 | 单细胞RNA测序, 荧光激活流式分选 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 斑马鱼胚胎(1.5和3天受精后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-11-14 |
Mapping atherogenesis mechanisms in smooth muscle cells by targeting genes linked to coronary artery disease
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113698
PMID:41210961
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研究论文 | 本研究结合冠状动脉疾病GWAS与单细胞RNA测序,识别平滑肌细胞中的风险基因并揭示其在动脉粥样硬化中的调控机制 | 首次将CAD GWAS与动脉粥样硬化斑块单细胞RNA测序整合,通过扰动实验发现不同风险基因共同调控收缩装置、细胞周期等关键通路 | 研究主要聚焦于平滑肌细胞,未全面评估其他血管细胞类型的贡献 | 解析冠状动脉疾病中平滑肌细胞的发病机制 | 人类动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞及SMC来源的间充质细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-11-14 |
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113726
PMID:41210995
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CHD7通过SOX5介导的自我激活机制调控心脏神经嵴细胞分化的新机制 | 首次发现CHD7通过与SOX5在上游增强子相互作用实现自我激活,并证明SOX5过表达可恢复CHD7表达和挽救心肌细胞分化 | 研究主要基于体外细胞培养模型,需要进一步体内验证 | 阐明CHARGE综合征相关先天性心脏缺陷的分子机制 | 心脏神经嵴细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-11-14 |
Early female germline development in Xenopus laevis: Stem cells, nurse cells, and germline cysts
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2522343122
PMID:41213017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高分辨率成像技术重建了非洲爪蟾早期雌性生殖系发育过程,揭示了生殖细胞囊肿的极性和功能 | 首次在非哺乳动物脊椎动物中识别出独特的生殖干细胞群体,并发现囊肿细胞中形成不对称的类fusome结构,约80%的囊肿细胞具有滋养细胞命运而非形成卵母细胞 | 研究主要聚焦于非洲爪蟾,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究非哺乳动物脊椎动物卵巢中生殖细胞囊肿的极性和功能 | 非洲爪蟾的雌性生殖系发育过程,包括生殖干细胞、囊肿细胞和卵母细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 高分辨率成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-11-14 |
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2518762122
PMID:41223220
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研究论文 | 本研究揭示DPF2通过调控CACNA1D表达和MAPK通路影响巨噬细胞炎症极化,从而调节肠道损伤与再生过程 | 首次发现DPF2通过表观遗传调控CACNA1D表达影响巨噬细胞极化,并建立了DPF2-CACNA1D-MAPK信号轴在肠道炎症中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证仍需进一步扩大样本量 | 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症极化的分子机制 | 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病患者样本 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、小鼠遗传学、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床样本数据 | 小鼠模型、患者来源类器官和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-11-14 |
From plasma proteomics Mendelian randomization to neuropathological validation: The potential role of CTSH-GRN-TMEM106B and TREM2-IL-34 networks of microglia in Alzheimer's disease
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178297
PMID:41138838
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研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化框架结合神经病理学验证,揭示了外周生物标志物与阿尔茨海默病之间的因果关系及小胶质细胞相关网络的作用机制 | 首次采用双向孟德尔随机化方法系统分析血浆、脑脊液和脑组织蛋白质与AD的因果关系,并结合单细胞转录组数据和神经病理学验证构建了小胶质细胞相关网络 | 研究主要基于遗传工具变量和相关性分析,无法完全排除潜在混杂因素的影响,且样本来源主要为死后脑组织 | 阐明外周生物标志物与中枢系统在阿尔茨海默病发生发展中的相互作用机制 | 血浆蛋白质(734种)、脑脊液蛋白质(151种)、脑组织蛋白质(1296种)及AD患者死后脑组织标本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 蛋白质相互作用分析 | 双向孟德尔随机化框架 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 神经病理学图像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及734种血浆蛋白、151种脑脊液蛋白、1296种脑蛋白及AD死后脑组织标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2025-11-14 |
Paraptosis landscape reveals distinct prognoses and immune microenvironments in osteosarcoma: Experimental validation of key regulator TNK2
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178304
PMID:41167410
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法描绘了骨肉瘤中副凋亡相关基因的景观及其与预后和免疫微环境的关联 | 首次系统描绘骨肉瘤中副凋亡相关基因景观,发现TNK2在副凋亡调控中的关键作用 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索骨肉瘤中副凋亡相关基因的预后价值和免疫微环境特征 | 骨肉瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, 共识聚类, 通路富集分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | TARGET和GSE21257队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |