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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-11 |
Targeting FGFR1-regulated SPP1 signaling repolarizes immunosuppressive macrophages and sensitizes Hepatocellular Carcinoma to anti-PD-1 therapy
2026-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218361
PMID:41786278
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研究论文 | 本研究揭示FGFR1通过调控SPP1信号使免疫抑制性巨噬细胞复极化,并增强肝细胞癌对抗PD-1治疗的敏感性 | 首次发现FGFR1在肝细胞癌免疫检查点阻断疗法耐药中的关键作用,并阐明其通过MAPK-SPP1轴调控肿瘤微环境的机制 | 主要基于小鼠模型和临床数据集分析,尚需进一步在大型临床试验中验证FGFR1作为生物标志物和治疗靶点的临床价值 | 探究FGFR1在肝细胞癌免疫检查点阻断疗法耐药中的作用及其机制 | 肝细胞癌小鼠模型及临床患者样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及临床数据集中的肝细胞癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 22 | 2026-06-11 |
Di-(2-ethylhexyl) terephthalate promotes breast cancer progression: Multi-omics integrated experimental validation
2026-May-25, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.112002
PMID:41780785
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研究论文 | 该研究整合多组学方法,系统分析了 DOTP 可能通过干扰细胞增殖、基因转录调控、肿瘤微环境及 PI3K-Akt-mTOR 通路来促进乳腺癌进展的致癌机制 | 首次结合网络毒理学、机器学习、分子对接、单细胞测序和空间转录组学等综合方法,系统评估 DOTP 的致癌风险,并通过实验验证其促增殖效应 | NA | 系统性评估 DOTP 的潜在致癌机制及风险 | DOTP(对苯二甲酸二异辛酯)及其影响的核心致癌基因和信号通路 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2026-06-11 |
Self-reinforcing IL-1β signaling accelerates the development and recurrence of TCF3::HLF-positive B-ALL
2026-May-21, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031521
PMID:41774513
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研究论文 | 本研究通过建立新的小鼠模型,揭示TCF3::HLF阳性B细胞急性淋巴细胞白血病中自我强化的IL-1β信号网络驱动疾病进展和复发 | 首次建立能忠实再现人类TCF3::HLF B-ALL(包括溶骨性骨病变)的小鼠模型,并发现TCF3::HLF直接结合IL1B基因内含子调控元件,揭示自强化IL-1β信号作为疾病核心驱动机制 | 未提及具体限制 | 探究TCF3::HLF阳性B-ALL的疾病进展和复发机制 | TCF3::HLF阳性B细胞急性淋巴细胞白血病 | 计算机视觉 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 患者样本(诊断与复发配对) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-06-11 |
Targeting noncanonical nuclear factor kappa B signalling in CYLD cutaneous syndrome by selective inhibition of IκB kinase alpha
2026-May-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag044
PMID:41779628
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研究论文 | 通过选择性抑制IκB激酶α靶向CYLD皮肤综合征中的非经典核因子κB信号 | 首次在CYLD皮肤综合征肿瘤角质形成细胞中发现非经典NF-κB信号激活,并鉴定IKKα为候选治疗靶点 | 主要基于患者来源的体外模型,缺乏体内实验和临床验证 | 探究CCS肿瘤中NF-κB信号通路,识别可药物靶向的分子 | CCS患者肿瘤细胞及肿瘤球体培养模型 | 医学研究 | CYLD皮肤综合征 | 转录组学,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 患者来源的CCS肿瘤细胞分群和肿瘤球体培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-06-11 |
Spatial Transcriptomics Reveals Location-Specific Tumor Cell Subtypes and Signaling within Multifocal Small Intestinal Neuroendocrine Tumors
2026-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2854
PMID:41779010
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示多灶性小肠神经内分泌肿瘤中位置特异性的肿瘤细胞亚型及其信号通路 | 首次应用空间转录组学技术分析多灶性小肠神经内分泌肿瘤中肿瘤细胞亚型在不同解剖位置的特异性,并鉴定出四种基于位置的亚型及其独特的配体-受体相互作用网络 | 需要进一步验证,且样本量有限(4名患者) | 表征多灶性小肠神经内分泌肿瘤中肿瘤细胞群在不同解剖位点的表型,并识别影响肿瘤发展的局部微环境因素 | 多灶性小肠神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理学 | 小肠神经内分泌肿瘤 | 空间转录组学 | 无监督聚类 | 图像 | 4名患者,72个组织微阵列核心 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-06-11 |
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250363
PMID:41787974
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研究论文 | 利用Scissor算法识别与结直肠癌预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,并据此对结直肠癌亚型进行分类及评估免疫景观 | 首次利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据,筛选出与结直肠癌极差预后显著相关的Scissor+成纤维细胞亚群,并揭示其激活促转移通路及免疫活化但功能耗竭的特征 | 未明确提及,但可能包括数据来源的偏倚、Scissor算法对细胞亚群识别的可重复性、以及预测标志物的临床验证需求 | 通过整合单细胞与批量转录组数据,识别与预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,从而对结直肠癌进行亚型分类并评估其免疫景观 | 结直肠癌患者的批量RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据及临床信息 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Scissor算法 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个结直肠癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2026-06-11 |
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-May-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114757
PMID:41780688
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示胰腺导管腺癌中细胞异质性与动态相互作用方面的应用,包括样本制备、数据分析流程及治疗靶点发现 | 系统整合了scRNA-seq在解析PDAC肿瘤内异质性、微环境动态变化及生物标志物鉴定中的技术流程与关键发现,并探讨了联合免疫治疗策略 | 未提及Meta分析或计算方法的定量比较,对scRNA-seq技术在PDAC中的临床应用挑战讨论较为笼统 | 阐明单细胞转录组学在胰腺癌异质性及微环境研究中的应用价值与工作流程 | 胰腺导管腺癌肿瘤组织中的肿瘤细胞、免疫细胞、肿瘤相关成纤维细胞及微环境成分 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 28 | 2026-06-11 |
BPHL promotes TNBC stemness by resolving R-loops via POLR2A lactylation inhibition and BARD1-mediated ubiquitination
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218388
PMID:41765360
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研究论文 | 本文揭示了BPHL通过抑制POLR2A乳酸化修饰和BARD1介导的泛素化来解析R-loop,从而维持三阴性乳腺癌干细胞的干性 | 首次发现BPHL通过调控R-loop稳态维持三阴性乳腺癌干细胞干性,并阐明了其通过POLR2A乳酸化抑制和BARD1介导的泛素化解决R-loop的分子机制 | 结果主要基于体外和动物模型,临床验证样本量有限 | 阐明三阴性乳腺癌干细胞中R-loop稳态的调控机制及BPHL的作用 | 三阴性乳腺癌干细胞和肿瘤样本 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26个乳腺癌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 29 | 2026-06-11 |
Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Mitochondrial Transporter Gene Programs in Human Spermatogonial Stem Cells
2026-May, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11092-x
PMID:41770292
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研究论文 | 整合批量芯片和单细胞转录组数据分析揭示人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因程序 | 首次系统性描绘人类精原干细胞中线粒体转运蛋白(TOM/TIM复合体)和转运蛋白基因的转录谱,并识别关键枢纽基因和潜在miRNA调控机制 | 未在功能水平验证预测的miRNA调控关系,且样本量有限可能影响结果的普适性 | 阐明人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因的表达特征和调控网络 | 人类精原干细胞富集群体(每组3个生物学重复) | 机器学习 | NA | 微阵列芯片, scRNA-seq | WGCNA, STRING/cytoHubba, limma | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 3组生物学重复(微阵列芯片)和多个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-06-11 |
SEAL: Semantic-Aware Contrastive Learning for scRNA-Seq Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3669981
PMID:41774662
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研究论文 | 提出一种语义感知对比学习方法SEAL用于单细胞RNA测序数据聚类 | 首次将语义感知对比学习应用于scRNA-seq数据聚类,通过随机掩码生成增强数据并利用伪标签捕获语义不变表示 | 未明确说明局限性,但文中提到现有方法在高缺失率和噪声数据中无法完全捕获细胞内在特性,该方法可能仍面临类似挑战 | 开发一种稳定的无监督scRNA-seq聚类方法以准确区分不同细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | 不适用 | scRNA-seq | 对比学习(语义感知对比学习) | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 31 | 2026-06-11 |
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived small extracellular vesicles accelerate diabetic wound healing by reprogramming fibroblast subpopulations and delivering pro-regenerative cargos
2026-May, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2026.107910
PMID:41775031
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研究论文 | 人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡通过重编程成纤维细胞亚群和递送促再生因子加速糖尿病伤口愈合 | 首次利用单细胞转录组测序和邻近条形码分析技术揭示了hUC-MSC-sEVs通过重编程成纤维细胞亚群(特别是Trps1+成纤维细胞)和递送功能特异的sEV亚群(如ITGB1富集亚群)的双重机制来加速糖尿病伤口愈合 | 未明确指出具体局限性 | 探究人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡在糖尿病伤口愈合中的作用机制 | 糖尿病小鼠伤口模型中的成纤维细胞和小细胞外囊泡亚群 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序、批量RNA测序、邻近条形码分析、免疫荧光 | 未指定 | 基因表达数据 | 糖尿病小鼠(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 32 | 2026-06-11 |
PH2ST: Prompt-guided hypergraph learning for spatial transcriptomics prediction in whole slide images
2026-May, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2026.104008
PMID:41775138
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研究论文 | 提出了一种基于提示引导的超图学习框架PH2ST,用于从H&E染色全切片图像预测空间转录组学数据 | 提出提示引导的超图学习框架,利用有限的空间转录组信号指导多尺度组织学表示学习,实现准确稳健的空间基因表达预测 | 未明确说明,但基于摘要推断可能受限于数据集规模和提示采样策略的普适性验证 | 开发从H&E染色图像预测空间转录组学的计算框架,克服现有技术成本高、覆盖有限和异质性挑战 | 两个公共空间转录组学数据集 | 数字病理学 | 未指定 | 空间转录组学 | 超图学习、提示引导学习 | 图像(H&E染色全切片图像)和基因表达数据 | 两个公共空间转录组数据集 | 未指定 | 空间转录组学 | 未指定 | 未指定 |
| 33 | 2026-06-11 |
Inhibiting VTCN1 overcomes immunosuppression in colorectal cancer to activate T cells via galectin-3
2026-May-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00323.2025
PMID:41778365
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研究论文 | 通过多组学框架阐明VTCN1-半乳糖凝集素3轴在结直肠癌中驱动免疫抑制,抑制VTCN1可激活T细胞并抑制肿瘤进展 | 首次揭示VTCN1-半乳糖凝集素3轴作为结直肠癌免疫抑制的关键通路,并验证VTCN1抑制剂SGN-B7H4的治疗潜力 | NA | 探究VTCN1和半乳糖凝集素3在结直肠癌免疫抑制中的作用机制及治疗潜力 | 结直肠癌细胞及T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | 单细胞数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 34 | 2026-06-11 |
Unraveling pancreatic ductal adenocarcinoma at single-cell resolution with spatial insights: From mechanisms to clinical translation
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218391
PMID:41771343
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综述 | 综述单细胞RNA测序在揭示胰腺导管腺癌异质性与肿瘤微环境中的进展,并探讨结合空间多组学方法转化至临床应用 | 系统整合单细胞与空间多组学方法,提出以单细胞和空间分辨率理解胰腺导管腺癌生物学的框架 | NA | 总结单细胞RNA测序在胰腺导管腺癌研究中的应用,探索从机制到临床翻译的路径 | 胰腺导管腺癌细胞及其肿瘤微环境,包括T细胞、髓系细胞、成纤维细胞和恶性上皮细胞 | 机器学习 | 胰腺癌 | scRNA-seq, 空间多组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-06-11 |
Comparison of single-cell sequencing technologies for allele-specific expression analysis in rabbit spermatids
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111224
PMID:41780767
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研究论文 | 比较单细胞测序技术在兔精子细胞等位基因特异性表达分析中的应用 | 首次在兔精子细胞中利用长读长测序技术进行等位基因特异性表达分析,并比较了不同测序平台的性能 | 短读长测序(Illumina)被认为不适用于该分析,且结果需要进一步验证其在基因生物防治中的适用性 | 识别兔精子细胞中候选等位基因特异性表达基因,用于未来基因生物防治研究 | 欧洲兔(Oryctolagus cuniculus)的精子细胞 | 数字病理学 | 遗传性疾病 | 单细胞测序、长读长测序、短读长测序 | NA | 序列数据 | 兔精子细胞样本(具体数量未提及) | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 长读长测序平台(具体未指定) | 短读长测序采用Illumina平台,长读长测序采用未明确指定的平台 |
| 36 | 2026-06-11 |
Spatial transcriptomics characterisation of radionecrotic changes in glioblastoma patients
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag026
PMID:41783996
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研究论文 | 通过空间转录组学分析,表征胶质母细胞瘤患者放疗后放射性坏死变化的细胞和分子特征 | 首次使用空间单细胞转录组学技术(Xenium平台)详细描绘胶质母细胞瘤进展与放射性坏死脑组织的空间转录组图谱,揭示肿瘤细胞在不同病理状态下的基因表达差异,特别是EGFR表达和增殖特征 | 样本量较小(9例患者的10个样本),可能限制结果的普适性;研究依赖手术切除的组织样本,无法完全反映动态的肿瘤微环境变化 | 区分胶质母细胞瘤放疗后放射性坏死与肿瘤进展的分子和空间特征,为临床诊断和治疗提供新见解 | IDH野生型胶质母细胞瘤患者的放疗后组织样本,包括肿瘤复发和放射性坏死样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间单细胞转录组数据 | 9例患者的10个样本(4例肿瘤复发、4例放射性坏死、1例两者兼有) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium平台 | Xenium空间单细胞转录组分析平台 |
| 37 | 2026-06-11 |
Neutrophil CAPNS1 regulates cardiac inflammation and injury by promoting NETosis in CVB3-induced myocarditis
2026-May, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究了中性粒细胞CAPNS1在柯萨奇病毒B3诱导的心肌炎中通过促进NETosis调节心脏炎症和损伤的作用 | 首次揭示中性粒细胞CAPNS1通过calpain介导的Nesprin 1降解促进NETs形成,从而加重病毒性心肌炎的心脏损伤,并提出了靶向CAPNS1的新治疗策略 | 未提及 | 探讨中性粒细胞CAPNS1在CVB3诱导心肌炎中的免疫调节机制及其作为治疗靶点的潜力 | CVB3感染的小鼠模型及分离的骨髓来源中性粒细胞 | machine learning | 心肌炎 | 单细胞测序,免疫共沉淀,条件性基因敲除 | NA | 单细胞测序数据 | CVB3感染小鼠及对照小鼠的心脏组织、骨髓来源中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-06-11 |
Targeting ACSS2 disrupts metabolic-epigenetic crosstalk to restore apoptosis and temozolomide chemosensitivity in pancreatic neuroendocrine tumors
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218406
PMID:41786280
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研究论文 | 本研究发现乙酰辅酶A合成酶2通过代谢表观遗传轴驱动胰腺神经内分泌肿瘤对替莫唑胺的耐药性,并揭示了靶向ACSS2/BCL6/P53通路可恢复凋亡和化疗敏感性 | 首次阐明ACSS2通过代谢-表观遗传互作调控BCL6转录进而抑制TP53表达的耐药机制,并验证了ACSS2抑制剂联合免疫治疗的协同增效作用 | 未提及具体研究局限 | 探究胰腺神经内分泌肿瘤对替莫唑胺耐药的分子机制并寻找治疗新靶点 | 胰腺神经内分泌肿瘤细胞、患者源性类器官和免疫活性Rip1-Tag2小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床队列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-06-11 |
Sensitizer-Induced Basophils Accelerate Skin Re-Epithelialization via IL-4/IL-13-Mediated Macrophage Polarization
2026-May, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70279
PMID:41787818
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research paper | 本研究揭示致敏物诱导的嗜碱性粒细胞通过IL-4/IL-13介导的巨噬细胞极化加速皮肤再上皮化 | 发现嗜碱性粒细胞在致敏皮肤中具有促进组织修复的新功能,超越其传统致痒和促炎作用,并阐明IL-4/IL-13依赖的巨噬细胞重编程机制 | 未在论文标题和摘要中明确说明局限性 | 探究致敏皮肤反应中募集的嗜碱性粒细胞是否促进伤口愈合 | 嗜碱性粒细胞在致敏物诱导的皮肤损伤模型中的功能 | machine learning | atopic dermatitis | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、RT-qPCR、免疫组化 | NA | image | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-06-11 |
Single-Cell Analysis Identified a Recurrent Malignant-Associated Transcriptional State in Colorectal Cancer
2026-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70335
PMID:41770629
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研究论文 | 对四名日本结直肠癌患者的肿瘤及癌旁组织进行单细胞RNA测序,识别出一个共同的恶性相关转录状态,并发现KCNQ1OT1高表达与RASSF6低表达的特征 | 首次在日本人结直肠癌队列中通过单细胞分析发现一个跨患者共有的恶性相关转录状态,并揭示RASSF6表达在东亚人群中与西方人群存在差异 | 仅基于四名日本患者数据,样本量小且种族单一,结论的普适性需进一步验证 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌的肿瘤异质性和恶性细胞特征 | 四名日本结直肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名日本结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |