单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-06-08	Multi-omics exploration of CAV1+ tumor epithelial subcelltype in oral squamous cell carcinoma and its impact on the immune microenvironment 2025-Jun-05, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02843-2 PMID:40471478	研究论文	本研究通过多组学方法探索口腔鳞状细胞癌中CAV1+肿瘤上皮亚细胞类型及其对免疫微环境的影响	首次揭示了CAV1+上皮亚细胞类型(CAV1+EIP)在肿瘤进展中的关键作用及其通过NECTIN1-CD96信号网络与T细胞的相互作用机制	研究样本量有限，且未进行体内功能验证实验	揭示口腔鳞状细胞癌肿瘤上皮细胞亚型的特征及其在肿瘤进展中的作用	口腔鳞状细胞癌(OSCC)肿瘤上皮细胞亚型和免疫微环境	数字病理学	口腔鳞状细胞癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学	NA	单细胞转录组数据、空间转录组数据	未明确说明具体样本数量
22	2025-06-08	Muscle stem cells in Duchenne muscular dystrophy exhibit molecular impairments and altered cell fate trajectories impacting regenerative capacity 2025-Jun-05, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07755-1 PMID:40473604	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了杜氏肌营养不良症（DMD）中卫星细胞的分子损伤和细胞命运轨迹变化对再生能力的影响	首次使用单细胞RNA测序技术系统比较了不同DMD小鼠模型中卫星细胞的转录组差异，发现了一个新的DMD富集细胞群，并揭示了自噬诱导可以挽救DMD前体细胞的分化能力	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类DMD患者中验证	探究DMD中卫星细胞功能障碍的分子机制及其对肌肉再生的影响	杜氏肌营养不良症（DMD）小鼠模型中的卫星细胞	分子生物学	杜氏肌营养不良症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	两种DMD小鼠模型（mdx和D2-mdx）的卫星细胞
23	2025-06-08	Machine learning and multi-omics analysis reveal key regulators of proneural-mesenchymal transition in glioblastoma 2025-Jun-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-04862-z PMID:40473799	研究论文	通过机器学习和多组学分析揭示了胶质母细胞瘤中前神经-间质转化的关键调控因子	鉴定了17个与PMT相关的关键基因，并发现这些基因主要在免疫细胞和血管中表达，与不良预后相关	PMT的细胞和分子机制仍不完全清楚	探究胶质母细胞瘤中前神经-间质转化的关键调控因子及其与免疫微环境的关系	胶质母细胞瘤（GBM）及其前神经和间质亚型	机器学习	胶质母细胞瘤	多组学分析、转录组数据分析、单细胞转录组数据分析	Lasso、Cox、Step机器学习算法	转录组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据	NA
24	2025-06-08	Multi-omics analyses reveal interactions between GREM1+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in gastric cancer 2025-Jun-05, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-00967-w PMID:40473882	研究论文	通过多组学分析揭示了胃癌中GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用	整合了bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学技术，首次揭示了GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞在胃癌中的相互作用及其临床意义	研究主要基于转录组数据，缺乏功能性实验验证这些细胞互作的具体分子机制	探究胃癌微环境中细胞间相互作用的特征及其治疗价值	胃癌组织中的GREM1+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞	肿瘤微环境研究	胃癌	bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫组化染色	NA	转录组数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像	12个独立的胃癌数据集
25	2025-06-08	Dissecting the tumor microenvironment in primary breast angiosarcoma: insights from single-cell RNA sequencing 2025-Jun-05, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s13058-025-02022-9 PMID:40474296	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术解析原发性乳腺血管肉瘤的肿瘤微环境，揭示其细胞异质性和潜在治疗靶点	首次应用单细胞RNA测序技术全面分析乳腺血管肉瘤的肿瘤微环境组成和细胞间通讯网络	样本量较小（仅3例患者），且缺乏正常组织对照	阐明乳腺血管肉瘤的致病机制并改善治疗策略	原发性乳腺血管肉瘤患者的肿瘤组织	数字病理学	乳腺血管肉瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	3例患者（1例双侧原发性乳腺血管肉瘤，2例浸润性乳腺癌）共31,771个细胞
26	2025-06-08	RORγt is crucial for gut homeostasis by regulating the expression of HB-EGF rather than IL-22 in activated ILC3s 2025-Jun-05, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115793 PMID:40478733	research paper	该研究探讨了RORγt在调节ILC3s中HB-EGF表达而非IL-22表达中的关键作用，及其对肠道稳态的影响	通过单细胞RNA测序分析揭示了RORγt在ILC3激活中的基本参与，并发现RORγt缺失后ILC3仍能维持肠道健康	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	阐明RORγt在ILC3s中的具体作用及其对肠道稳态的影响	ILC3s及其产生的HB-EGF和IL-22	免疫学	炎症性肠病	单细胞RNA测序，Il22Rosa26Rorc小鼠模型	NA	基因表达数据	NA
27	2025-06-08	Widespread and cell-type-specific transcriptomic reorganization following mild traumatic brain injury 2025-Jun-05, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115795 PMID:40478731	研究论文	该研究通过小鼠模型和空间转录组学技术，探讨了轻度创伤性脑损伤（TBI）后大脑的广泛和细胞类型特异性转录组重组	使用CHIMERA TBI模型和空间转录组学技术，首次在亚急性期系统地识别了TBI的跨脑区和细胞类型特异性转录组特征	研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全反映人类TBI的复杂性	理解轻度创伤性脑损伤（TBI）如何改变大脑的转录组	小鼠大脑	神经科学	创伤性脑损伤	空间转录组学	CHIMERA TBI模型	转录组数据	多只小鼠
28	2025-06-08	Olaparib and Radiotherapy Induce Type I Interferon- and CD8+ T Cell-Dependent Sensitization to Immunotherapy in Pancreatic Cancer 2025-Jun-04, Molecular cancer therapeutics IF:5.3Q1 DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0210 PMID:39688341	研究论文	该研究探讨了PARP抑制剂奥拉帕尼联合放疗如何通过诱导I型干扰素和CD8+ T细胞依赖的免疫反应，增强胰腺癌对免疫治疗的敏感性	揭示了奥拉帕尼增强放疗诱导的I型干扰素介导的免疫信号和适应性免疫反应的新机制，为胰腺癌免疫治疗提供了新策略	研究主要基于免疫健全模型，临床转化效果需进一步验证	探究奥拉帕尼联合放疗对胰腺癌免疫治疗的增敏作用及其机制	胰腺导管腺癌(PDAC)	肿瘤免疫治疗	胰腺癌	单细胞RNA测序、免疫组化(IHC)、流式细胞术	NA	基因表达数据、免疫细胞表型数据	免疫健全小鼠模型（具体数量未明确说明）
29	2025-06-08	The high efficacy of claudin18.2-targeted CAR-T cell therapy in advanced pancreatic cancer with an antibody-dependent safety strategy 2025-Jun-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.01.012 PMID:39797399	研究论文	本研究报道了利用表达tEGFR的claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌的高效性，并探索了抗体依赖性安全策略控制副作用的可行性	首次展示了claudin18.2靶向CAR-T细胞在胰腺癌中的显著抗肿瘤活性，并创新性地采用抗体依赖性安全开关策略控制脱靶毒性	样本量较小（仅3例患者），且观察到对正常胃黏膜的脱靶毒性	评估claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌的疗效和安全性	3例晚期胰腺癌患者	肿瘤免疫治疗	胰腺癌	CAR-T细胞治疗、单细胞转录组测序、T细胞受体测序	NA	临床数据、测序数据	3例晚期胰腺癌患者
30	2025-06-08	Activity-dependent development of the body's touch receptors 2025-Jun-04, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2025.04.015 PMID:40381613	research paper	研究发现神经元活动在体感神经元发育中的作用，特别是Piezo2和Na1.6通道对机械感受器终末器官形成的影响	揭示了机械刺激引发的神经元活动在早期生命中对机械感受器终末器官成熟的关键作用	研究主要关注Piezo2和Na1.6通道，可能还有其他未被发现的机制参与这一过程	探究神经元活动在体感神经元发育中的作用	体感神经元和机械感受器终末器官	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
31	2025-06-08	Single-cell RNA sequencing analysis reveals a lack of CXCL13+ T cell subsets associated with the recurrence of cervical squamous cell carcinoma following concurrent chemoradiotherapy 2025-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-04083-3 PMID:40464813	research paper	通过单细胞RNA测序分析，研究宫颈鳞状细胞癌在同步放化疗后复发的机制，重点关注CXCL13+ T细胞亚群的作用	首次构建了宫颈鳞状细胞癌患者在同步放化疗前的肿瘤微环境细胞图谱，并发现CXCL13+ T细胞亚群在非复发肿瘤中显著增加，揭示了其与肿瘤相关巨噬细胞和癌相关成纤维细胞的相互作用	样本量较小（仅6例患者），且仅分析了同步放化疗前的肿瘤微环境	探究宫颈鳞状细胞癌在同步放化疗后复发的细胞和分子机制	宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境细胞	digital pathology	cervical cancer	single-cell RNA sequencing	random forest	RNA-seq data	6例宫颈鳞状细胞癌患者（3例复发，3例未复发）
32	2025-06-08	CTSE inhibits anti-tumor T cell response by promoting des-γ-carboxy prothrombin releasing in hepatocellular carcinoma 2025-Jun-04, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07753-3 PMID:40467555	研究论文	本研究探讨了CTSE在肝细胞癌中通过促进DCP释放抑制抗肿瘤T细胞反应的机制	揭示了CTSE高表达的癌细胞通过上调泛醌信号通路促进DCP合成和释放，进而抑制T细胞免疫反应的新机制	研究主要基于公共数据库的单细胞测序数据和体外实验，临床样本验证不足	探究肝细胞癌中癌细胞与免疫细胞相互作用的调控机制	肝细胞癌细胞和T细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	NA
33	2025-06-08	The transcriptome of playfulness is sex biased in the juvenile rat medial amygdala: A role for inhibitory neurons 2025-Jun-04, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115782 PMID:40478737	research paper	本研究探讨了幼年大鼠内侧杏仁核（MeA）中与玩耍行为相关的转录组特征，揭示了性别差异及其与抑制性神经元的关系	首次揭示了幼年大鼠MeA中与玩耍行为相关的转录组性别差异，并发现抑制性神经元是驱动这种差异的主要因素	研究仅基于大鼠模型，结果是否适用于其他物种尚不清楚	探索玩耍行为性别差异的分子机制	幼年大鼠的内侧杏仁核（MeA）	神经科学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	幼年大鼠（性别未明确说明具体数量）
34	2025-06-08	SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy 2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0701 PMID:39976545	研究论文	本文揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用，促使其从膜上移位，从而增强突变p53和KRAS的致癌协同作用	首次发现SMURF2通过PPLP基序介导GAP17-1的膜移位机制，阐明了突变p53和KRAS协同致癌的新机制	研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证仍需扩大	探究突变p53和KRAS协同致癌的分子机制	胰腺癌细胞系、小鼠模型及临床样本	肿瘤分子生物学	胰腺癌	单细胞RNA测序、组织微阵列	iKras; iKras, p53, and p48-Cre; Kras小鼠模型	基因表达数据、组织病理数据	多个胰腺癌细胞系、三种基因工程小鼠模型、临床前和临床样本
35	2025-06-08	Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis 2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI182790 PMID:40067358	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索了B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观	首次使用单细胞RNA测序技术全面分析了B细胞耗竭治疗后多发性硬化症患者中枢和外周免疫细胞的变化	研究样本量有限，且未探讨这些免疫变化与临床症状改善的直接关系	探究B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的调节机制	多发性硬化症患者在接受B细胞耗竭治疗前后的免疫细胞	免疫学	多发性硬化症	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	转录组数据	未明确说明样本数量，但涉及脑脊液和外周血样本
36	2025-06-08	Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis 2025-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC PMID:39642371	研究论文	该研究揭示了表观遗传调节因子CBX5在肺纤维化过程中对成纤维细胞代谢重编程的关键作用	首次发现CBX5通过调控代谢重编程促进成纤维细胞活化，并鉴定了其作为IPF治疗靶点的潜力	研究主要基于体外实验和动物模型，临床转化效果需进一步验证	探究表观遗传调控在肺纤维化发病机制中的作用	肺成纤维细胞和特发性肺纤维化(IPF)组织	分子病理学	肺纤维化	单细胞RNA测序、免疫组化、RNA测序分析	NA	基因表达数据、组织样本	IPF患者肺组织样本和实验动物模型
37	2025-06-08	BNT162b2 COVID-19 vaccination elicits the expansion of CD16+CD8+ T cells endowed with natural killer cell features 2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.024 PMID:39894227	研究论文	研究BNT162b2 COVID-19疫苗接种后CD16+CD8+ T细胞的扩增及其自然杀伤细胞特性	首次发现BNT162b2 mRNA疫苗接种后CD16+CD8+ T细胞的扩增，并揭示其具有自然杀伤细胞的功能特性	样本量较小（30名健康个体），且仅针对BNT162b2疫苗进行研究	表征BNT162b2 mRNA疫苗接种后出现的非常规T细胞亚群	30名接受BNT162b2 mRNA疫苗接种的健康个体的外周血	免疫学	COVID-19	多参数流式细胞术和单细胞转录组分析	NA	外周血细胞数据	30名健康个体
38	2025-06-08	ICOSL, OX40L, and CD30L control persistence of asthmatic CD4 tissue-resident memory CD4 T cells 2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1097 PMID:39921040	research paper	该研究探讨了共刺激分子ICOSL、OX40L和CD30L在控制哮喘CD4组织驻留记忆T细胞持久性中的作用	发现ICOSL、OX40L和CD30L的联合抑制能有效减少肺部炎症性Trm细胞的积累，为哮喘治疗提供了新策略	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化效果尚需进一步验证	寻找控制过敏原诱导的记忆CD4 T细胞再激活的共刺激分子，并评估其作为哮喘治疗靶点的潜力	哮喘患者和小鼠模型中的肺CD4 T细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	小鼠过敏性哮喘模型	基因表达数据	人类哮喘患者和小鼠模型的肺CD4 T细胞样本
39	2025-06-08	Adulthood outcomes of thymic transplantation in a case of congenital athymia due to FOXN1 mutation 2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2025.02.006 PMID:39956280	research paper	报道了一例因FOXN1突变导致先天性无胸腺症患者接受胸腺移植后的长期临床和免疫学结果	首次详细描述了异体胸腺移植后T细胞的长期生物学特性及免疫重建机制	仅为单病例研究，样本量有限	评估先天性无胸腺症患者胸腺移植后的长期免疫重建效果	一名R255X纯合FOXN1突变的成年患者	免疫学	先天性免疫缺陷	高维光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、T细胞受体测序	NA	临床数据、流式细胞数据、测序数据	1例患者（随访19年）
40	2025-06-08	Genomic determinants of antigen expression hierarchy in African trypanosomes 2025-Jun, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08720-w PMID:40074895	研究论文	本文报道了一种高灵敏度的单细胞RNA测序方法，用于研究非洲锥虫抗原表达层次的基因组决定因素	开发了一种高灵敏度的单细胞RNA测序方法，揭示了抗原转换过程中单个细胞内发生的基因组重排	研究仅针对模型原生动物寄生虫Trypanosoma brucei，结果可能不适用于其他病原体	揭示非洲锥虫抗原表达层次的基因组决定因素	非洲锥虫（Trypanosoma brucei）	基因组学	寄生虫感染	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	单个细胞水平的研究