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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-06-04
Single-immunocyte transcriptomics reveal the role of natural killer cell-dependent exogenous antigen presentation in ankylosing spondylitis severity
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示自然杀伤细胞依赖性外源抗原呈递在强直性脊柱炎严重程度中的作用 首次发现并深入解析APC-NK细胞亚群通过抗原呈递驱动CD4 T细胞活化从而加剧强直性脊柱炎严重程度的新机制,并建立先天防御与NK依赖性抗原呈递之间的权衡模型 研究主要基于外周血单核细胞,未涉及组织驻留免疫细胞;动物模型使用SKG小鼠可能无法完全模拟人类疾病复杂性 探究强直性脊柱炎发病、加重和缓解过程中的免疫学特征及内在规律 健康供体及不同疾病阶段的强直性脊柱炎患者外周血单核细胞 单细胞转录组学 自身免疫性疾病,强直性脊柱炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个健康供体和不同疾病阶段患者 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'测序平台
22 2026-06-04
GCSH promotes colorectal cancer progression by inhibiting Cuproptosis through the PI3K/AKT-FDX1 axis
2026-Jan-27, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 GCSH通过PI3K/AKT-FDX1轴抑制铜凋亡促进结直肠癌进展 首次发现GCSH是铜凋亡的新型调节因子,并揭示其通过PI3K/AKT-GCSH/FDX1轴抑制铜凋亡以促进结直肠癌进展的机制 文章摘要未明确提及局限性 探究GCSH在结直肠癌中的作用及其对铜凋亡的调控机制 结直肠癌组织、血液样本及结直肠癌细胞系 机器学习 结直肠癌 RNA-seq NA 基因表达数据 TCGA数据集689例,4个独立GEO数据集共709例,以及临床组织、血液样本和细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
23 2026-06-04
Prediction of tumor-infiltrating lymphocytes through habitat radiomics and exploration of response mechanisms in neoadjuvant immunochemotherapy-treated lung cancer
2026-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 开发并验证了一种基于栖息地影像组学的方法,用于无创预测新辅助免疫化疗后非小细胞肺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞状态 首次将栖息地影像组学与机器学习结合,用于无创预测新辅助免疫化疗后非小细胞肺癌的TIL状态,并通过单细胞RNA测序探索了免疫抑制微环境的机制 回顾性研究设计、样本量相对有限、数据来自单一机构,可能导致选择偏倚 开发并验证一种基于栖息地影像组学的方法,用于无创预测TIL状态以评估新辅助免疫化疗反应 238名接受新辅助免疫化疗的非小细胞肺癌患者(其中201名纳入影像组学分析) 数字病理学 肺癌 CT影像组学,单细胞RNA测序 随机森林 CT图像,单细胞RNA测序数据 238名患者(201名纳入影像组学分析,140名训练集,61名测试集) NA 单细胞RNA-seq NA NA
24 2026-06-04
FAP expression as a marker of malignant transformation enabling in vivo characterization in peripheral nerve sheath tumors: a multimodal and translational study
2026-Jan-27, Acta neuropathologica IF:9.3Q1
研究论文 通过多模态分析研究FAP在恶性周围神经鞘瘤中作为恶性转化标志物的表达 首次整合批量转录组学、空间转录组学、单细胞RNA测序及免疫组化,并结合FAP靶向PET/CT成像,全面验证FAP在MPNST中的表达及临床转化潜力 样本量有限,仅在一名NF-1患者中验证PET/CT,缺乏大规模前瞻性临床验证 评估成纤维细胞活化蛋白α作为周围神经鞘瘤恶性转化生物标志物及治疗靶点的潜力 恶性周围神经鞘瘤与良性神经纤维瘤的肿瘤样本 数字病理学 神经纤维瘤病1型,恶性周围神经鞘瘤 批量转录组学,空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫组化,PET/CT成像 NA 转录组数据,空间转录组数据,单细胞转录组数据,组织切片图像,PET/CT图像 多个公开数据集及独立存档组织样本 NA 批量RNA-seq,空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
25 2026-06-04
Kynurenine mediates the chemotherapy-induced intestinal toxicity through modulation of gut microbiota
2026-Jan-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究揭示了犬尿氨酸在化疗诱导的肠道毒性中的关键作用,通过调节肠道菌群导致肠道损伤 首次发现髓系细胞来源的犬尿氨酸通过导致肠道菌群失调(特别是约氏乳杆菌减少)激活TNFα/JNK通路,加重化疗引起的肠道毒性 尚未充分探讨其他肠道微生物群体的变化及其与犬尿氨酸的相互作用,需要进一步动物模型和临床验证 阐明化疗诱导肠道毒性中系统性代谢与局部肠道损伤之间的联系机制 化疗后出现严重肠道毒性的患者、髓系细胞特异性基因敲除小鼠模型 数字病理学 化疗相关性肠道毒性 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 化疗后出现严重肠道毒性的患者样本及髓系细胞特异性基因敲除小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
26 2026-06-04
A spatially resolved atlas of gastric cancer characterises a lymphocyte-aggregated region
2026-Jan-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过整合单细胞和空间转录组学,识别胃癌微环境中的四个空间区域,并重点描述了一个淋巴细胞聚集区域 首次以空间分辨率绘制胃癌微环境图谱,并识别出淋巴细胞聚集区域及其与不同淋巴细胞亚群和转录组类型相关的分布模式 未明确提及限制 探究胃癌肿瘤微环境的细胞组成和空间组织 胃癌组织中的肿瘤微环境细胞 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 未提及 单细胞数据, 空间转录组数据 未提及 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
27 2026-06-04
Spatial FBA reveals heterogeneous Warburg niches in renal tumors and lactate consumption in colorectal cancer
2026-Jan-27, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 提出空间通量平衡分析(spFBA)框架,揭示肾癌中异质性Warburg生态位和结直肠癌中的乳酸消耗 首次将空间通量平衡分析(spFBA)框架应用于空间转录组学数据,以相对估计代谢通量,从而揭示空间约束对癌症代谢的影响 未明确提及局限性 研究空间约束如何塑造癌症代谢,并验证spFBA框架的生物学有效性 配对的原发性结直肠肿瘤和肝转移样本,以及肾癌公共数据集 数字病理学 结直肠癌,肾癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 新生成的高分辨率配对原发结直肠癌和肝转移数据集,以及独立公共数据集 NA 空间转录组学 NA NA
28 2026-06-04
Unveiling the early defense response dynamics in grapevines against Plasmopara viticola by single-cell transcriptomics
2026-Jan-27, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术,构建了葡萄叶片在霜霉病菌感染下的首个单细胞转录组图谱,揭示了早期防御反应的动态变化 首次在单细胞水平解析葡萄对霜霉病菌的防御反应动态,发现病菌通过重编程保卫细胞转录组影响气孔运动以促进侵染 仅关注感染早期阶段的细胞动态,缺乏对后续时间点及整体组织水平的综合验证 揭示葡萄在单细胞水平上对霜霉病菌感染的早期防御反应机制 葡萄叶片在霜霉病菌感染早期的细胞群体 单细胞转录组学 葡萄霜霉病 单细胞RNA测序、空间RNA测序 NA 基因表达数据 约100,000个单个细胞(约89,000个来自单细胞RNA测序,约11,000个来自空间RNA测序) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
29 2026-06-04
SCITO-seq2: ultra-high-throughput single-cell transcriptome and epitope sequencing
2026-Jan-27, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 介绍SCITO-seq2,一种超高通量单细胞转录组与表位测序技术 结合探针基础RNA检测与超高通量蛋白分析,共享池条形码策略确保多液滴分子图谱精准匹配 未在摘要中明确提及 开发可扩展、高效、经济的下一代单细胞多组学工作流程 自身免疫疾病患者样本,包括儿童系统性红斑狼疮和CTLA4单倍体不足伴自身免疫浸润 数字病理学 自身免疫疾病 单细胞RNA测序,表位测序 NA 单细胞转录组及蛋白数据 超过100,000个细胞 NA 单细胞多组学 SCITO-seq2 SCITO-seq2技术,整合探针RNA检测和超高通量蛋白分析,使用共享池条形码策略
30 2026-06-04
Deciphering stromal cell interactions in osteosarcoma highlights CDKN2A and MMP14 as novel diagnostic and therapeutic biomarkers
2026-Jan-27, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞和转录组分析解析骨肉瘤基质细胞相互作用,发现CDKN2A和MMP14作为新型诊断和治疗生物标志物 首次整合单细胞RNA测序和转录组数据,利用高维WGCNA和CellChat分析解析骨肉瘤基质细胞网络,并筛选出CDKN2A和MMP14作为潜在诊断和治疗靶点,同时预测白藜芦醇能稳定结合MMP14 依赖公开数据集,缺乏大规模临床样本验证;体外实验限于细胞系,未进行体内动物模型验证 揭示骨肉瘤基质细胞相互作用网络,识别新型诊断标志物和治疗靶点 骨肉瘤基质细胞、巨噬细胞等其他细胞亚群 机器学习和数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、转录组分析 Seurat, CellChat, hdWGCNA, DESeq2 单细胞转录组数据、转录组数据 公开数据集的样本量未具体说明,但包含来自GEO的数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-06-04
omnideconv: a unifying framework for using and benchmarking single-cell-informed deconvolution of bulk RNA-seq data
2026-Jan-26, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出omnideconv框架,用于使用和基准测试基于单细胞信息的大规模RNA-seq数据解卷积方法 首次全面基准测试第二代解卷积工具,区分不同变异和偏差来源 未提及具体限制 评估和优化基于单细胞RNA-seq数据的细胞类型解卷积方法 多种第二代解卷积工具 机器学习和生物信息学 NA RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞测序数据 使用真实和模拟数据构成的多样本面板 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
32 2026-06-04
Spatially resolved molecular signatures of Lewy body dementia
2026-Jan-26, Acta neuropathologica IF:9.3Q1
研究论文 通过空间转录组学解析路易体痴呆中SNCA基因剂量和APOE4基因型对脑区特异性分子病理的影响 首次将空间转录组学应用于具有SNCA三倍体或不同APOE基因型的LBD患者脑组织,揭示了灰质第5层作为易感区域及其与APOE4相关的加重效应,并发现Reelin信号通路是跨皮层的核心路易体相关通路 研究样本量有限,且主要基于死后脑组织,可能无法完全反映疾病动态变化 阐明SNCA基因剂量和APOE4基因型如何通过空间和细胞类型特异性机制影响LBD病理 具有SNCA三倍体或不同APOE基因型的LBD患者死后颞叶皮层组织,以及年龄和性别匹配的对照 空间转录组学 路易体痴呆 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 LBD病例(包括SNCA三倍体或不同APOE基因型)及年龄和性别匹配的对照 NA 空间转录组学 NA NA
33 2026-06-04
Identification and characterization of fibroblast-related biomarkers and pro-inflammatory subpopulations in periodontitis by integrated transcriptomic and single-cell analysis
2026-Jan-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过整合转录组学和单细胞RNA测序数据,鉴定牙周炎中成纤维细胞相关生物标志物和促炎性亚群 首次通过整合批量转录组和单细胞RNA测序数据,利用LASSO回归鉴定出六个成纤维细胞相关基因(FRGs)并构建诊断模型,同时发现CXCL13⁺成纤维细胞为促炎性亚群 未提及 探索牙周炎中成纤维细胞相关生物标志物和促炎性成纤维细胞亚群,为诊断和治疗提供新策略 牙周炎组织样本中的成纤维细胞 机器学习 牙周炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组化, 荧光原位杂交, LASSO回归 LASSO回归, 诊断模型 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 三个数据集(GSE10334, GSE16134, GSE173078) NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-06-04
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 研究发现乳腺癌细胞通过外泌体传递RAB10至巨噬细胞,结合IFNAR1抑制JAK1/STAT1通路,阻碍M1极化并促进M2极化,从而促进肿瘤免疫逃逸 首次揭示外泌体RAB10通过结合IFNAR1抑制JAK1/STAT1通路调控巨噬细胞极化的新机制,并发现联合靶向RAB10与PD-L1可协同抑制肿瘤生长 未提及 探究外泌体RAB10对巨噬细胞极化和肿瘤生长的影响及机制 乳腺癌细胞系、巨噬细胞、单细胞RNA测序数据、荷瘤小鼠模型 癌症生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 乳腺癌细胞系及单细胞RNA测序样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
35 2026-06-04
Single-Cell Sequencing Reveals the Crosstalk Between MuSCs and FAPs in Ruminant Skeletal Muscle Development
2026-Jan-22, Cells IF:5.1Q2
研究论文 首次构建山羊骨骼肌发育全过程的单细胞转录组图谱,揭示肌肉干细胞与纤维脂肪祖细胞间的互动机制 首次创建涵盖从胚胎30天至出生后11年共14个发育阶段的山羊骨骼肌单细胞RNA测序图谱,鉴定出胚胎早期特有的MuSCs__high亚群和衰老相关的MuSCs__high亚群,并发现DLK1-NOTCH3配体-受体对在调控细胞互作中的关键作用 未提及具体局限性,但作为单细胞图谱研究,可能受限于样本数量、测序深度及功能验证实验的缺乏 揭示山羊骨骼肌发育过程中肌肉干细胞与纤维脂肪祖细胞的细胞异质性及互作机制 山羊背最长肌组织中的肌肉干细胞和纤维脂肪祖细胞 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 120,944个细胞,覆盖14个发育阶段(胚胎第30天至出生后11年) NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-06-04
The Role of Cancer-Associated Fibroblasts and Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Microenvironment and Their Impact on Ovarian Cancer Survival and Therapy
2026-Jan-19, Current oncology (Toronto, Ont.)
综述 该论文综述了癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对治疗和生存的影响 结合单细胞测序和空间转录组学新技术,深入分析了CAFs和TAMs的亚型多样性及其在靶向治疗中的潜力 作为综述,其结论依赖于已有研究,未提供新的实验数据;CAFs和TAMs的异质性可能使靶向策略复杂化 探讨CAFs和TAMs在卵巢癌肿瘤微环境中的作用,并评估靶向这些细胞改善治疗效果的可能性 卵巢癌中的癌相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞测序、空间转录组学 NA 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium FFPE空间转录组学
37 2026-06-04
Analysis of cranial tenocyte heterogeneity reveals a role for Wnt signaling in tendon attachments
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 通过斑马鱼胚胎头部结缔组织的单细胞RNA测序,揭示肌腱细胞和韧带细胞在发育过程中的异质性,并发现Wnt信号在肌腱附着中的作用 首次通过单细胞RNA测序识别出发育中肌腱细胞和韧带细胞的不同亚群,揭示了肌腱细胞在空间和功能上的异质性,并明确了经典Wnt信号通路在肌腱附着模式形成中的新作用 主要基于斑马鱼模型,可能无法完全代表人类肌腱发育;仅聚焦于胚胎阶段,未涉及成年或老化过程 探究肌腱和韧带发育过程中细胞异质性的遗传机制,以及Wnt信号在肌腱附着中的作用 斑马鱼胚胎头部的结缔组织,包括发育中的肌腱细胞和韧带细胞 单细胞生物学 肌腱损伤及年龄相关退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 斑马鱼胚胎头部结缔组织样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
38 2026-06-04
Network Hypoactivity in ALG13-CDG: Disrupted Developmental Pathways and E/I Imbalance as Early Drivers of Neurological Features in CDG
2026-Jan-14, Cells IF:5.1Q2
研究论文 通过人多能干细胞来源的皮质类器官研究ALG13-CDG导致的脑特异性低糖基化对神经发育和网络功能的影响 首次整合多组学分析和MEA电生理记录,揭示ALG13-CDG中早期网络低活跃性、神经元成熟时序错乱及E/I失衡随疾病进展向补偿性过度兴奋转变的机制 未明确说明 探究ALG13功能异常对人类大脑糖基化和神经发育的影响,以及皮质网络功能障碍的机制 ALG13-CDG患者来源的iPSC分化的人皮质类器官 数字病理学 先天性糖基化障碍 RNA-seq, 蛋白质组学, 糖蛋白质组学, N-糖成像, 脂质组学, 代谢组学 NA 图像, 文本 ALG13-CDG个体来源的iPSC和hCO样本 NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 糖组学 NA NA
39 2026-06-04
Integrative Network Analysis of Single-Cell RNA Findings and a Priori Knowledge Highlights Gene Regulators in Multiple Myeloma Progression
2026-Jan-13, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 整合单细胞RNA测序发现与先验知识网络分析,揭示多发性骨髓瘤进展中的关键基因调控因子 通过将单细胞RNA测序数据与多发性骨髓瘤先验知识整合,构建合成基因网络图谱,并利用综合影响力指标识别跨疾病阶段的关键调控因子 未提及具体限制 揭示多发性骨髓瘤从癌前阶段进展为活动性疾病过程中的关键调控因子 多发性骨髓瘤患者CD138阳性浆细胞的单细胞RNA测序数据 生物信息学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-06-04
Integrated Analyses Identify CDH2 as a Hub Gene Associated with Cisplatin Resistance and Prognosis in Ovarian Cancer
2026-Jan-10, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过整合分析识别CDH2为卵巢癌顺铂耐药和预后相关的关键基因 首次通过加权基因共表达网络和单细胞RNA-seq数据整合分析,鉴定CDH2为卵巢癌顺铂耐药的核心枢纽基因,并探讨其与免疫细胞浸润的关联 研究主要基于公开数据集和体外实验验证,缺乏大规模前瞻性临床队列的外部验证 识别与卵巢癌顺铂耐药相关的关键基因并探究其临床意义 卵巢癌顺铂耐药的分子机制和生物标志物 机器学习 卵巢癌 转录组测序, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫组化 加权基因共表达网络分析 基因表达数据, 单细胞转录组数据 GSE73935数据集(具体样本量未说明), GSE211956单细胞RNA-seq数据(具体样本量未说明) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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