单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-05-08	Longitudinal MRI-Driven Multi-Modality Approach for Predicting Pathological Complete Response and B Cell Infiltration in Breast Cancer 2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413702 PMID:39921294	research paper	该研究开发了一种基于纵向MRI的多模态模型，用于预测乳腺癌患者对新辅助治疗的病理完全缓解及B细胞浸润情况	整合了纵向MRI空间栖息地放射组学、转录组学和单细胞RNA测序数据，能够捕捉新辅助治疗期间肿瘤内部的动态异质性	模型需要在不同患者群体和临床环境中进行前瞻性验证	准确预测乳腺癌患者对新辅助治疗的病理完全缓解(pCR)并探索其生物学基础	2279名乳腺癌患者	digital pathology	breast cancer	MRI, 放射组学, 转录组学, 单细胞RNA测序	multi-modality model	MRI图像, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据	2279名患者(来自12个中心)
22	2025-05-08	Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis 2025-Mar, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748 PMID:39921941	研究论文	通过先进的单细胞转录组学分析，识别囊性纤维化中的新型治疗靶点	发现了以前未与囊性纤维化气道疾病相关的新基因和调控网络，为开发更有效的干预措施提供了新的潜在治疗靶点	NA	深入了解囊性纤维化相关基因表达，以改善囊性纤维化患者的预后和生活质量	囊性纤维化患者和健康对照者的单细胞转录组数据	数字病理学	囊性纤维化	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
23	2025-05-08	Endoplasmic reticulum stress and unfolded protein response play roles in recurrent pregnancy loss: A bioinformatics study 2025-Mar, Journal of reproductive immunology IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.jri.2025.104446 PMID:39923360	research paper	本研究通过生物信息学方法探讨内质网应激(ERS)和未折叠蛋白反应(UPR)在复发性流产(RPL)中的作用	首次发现ERS和UPR过程与RPL发生相关，并确定了6个关键基因在RPL诊断中的潜在价值	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证	探索ERS和UPR过程作为RPL预防、诊断和治疗靶点的可能性	复发性流产患者样本数据	生物信息学	复发性流产	差异表达基因分析、机器学习、scRNA-seq	机器学习模型	基因表达数据	两个RPL数据集(GSE165004和GSE26787)
24	2025-05-08	Single-cell transcriptomics reveals the alteration of immune cell profile in peripheral blood of Henoch-Schonlein purpura 2025-Mar, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110443 PMID:39924084	research paper	该研究通过单细胞转录组学和多参数流式细胞术，揭示了过敏性紫癜（HSP）患者外周血中免疫细胞谱的变化	首次全面评估了HSP患者外周血单个核细胞的免疫细胞类型和状态，揭示了不同HSP亚型中免疫细胞的动态变化	研究样本量未明确说明，且仅关注外周血免疫细胞，未涉及组织特异性免疫反应	探究过敏性紫癜（HSP）患者外周血中免疫细胞谱的变化及其与疾病亚型的关系	健康供体和HSP患者的外周血单个核细胞	免疫学	过敏性紫癜	单细胞RNA测序（scRNA-seq），多参数流式细胞术	NA	单细胞转录组数据，流式细胞术数据	健康供体和HSP患者（具体数量未说明）
25	2025-05-08	A Unique Signature for Cancer-Associated Fibroblasts in Melanoma Metastases 2025-Mar, Pigment cell & melanoma research IF:3.9Q2 DOI:10.1111/pcmr.70002 PMID:39924882	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了黑色素瘤原发肿瘤和肺转移中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的独特转录特征及其与中性粒细胞的相互作用	首次在黑色素瘤转移中识别出CAFs的独特亚群，并揭示了其通过SAA3和IL1b相关信号通路与中性粒细胞的肿瘤依赖性串扰	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩大样本量	探究黑色素瘤转移中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用	小鼠黑色素瘤原发肿瘤及肺转移组织中的CAFs和正常成纤维细胞，以及人类黑色素瘤转移样本	肿瘤微环境研究	黑色素瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据、RNA和蛋白质水平空间表征数据	约8400个CAFs和正常成纤维细胞
26	2025-05-08	MAIT cells protect against sterile lung injury 2025-Feb-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115275 PMID:39918959	研究论文	研究MAIT细胞在无菌性肺损伤中的保护作用及其机制	首次揭示了MAIT细胞通过促进cDC1驱动的抗纤维化途径在无菌性肺损伤中的保护作用	研究主要基于小鼠模型和人类scRNA-seq数据，未涉及其他动物模型或更广泛的人类样本	探索MAIT细胞在无菌性肺损伤中的功能及其保护机制	MAIT细胞及其在无菌性肺损伤中的作用	免疫学	肺纤维化	scRNA-seq, 光谱分析, 过继转移	小鼠模型	RNA序列数据	小鼠模型和人类特发性肺纤维化患者的scRNA-seq数据
27	2025-05-08	Combining T cell receptor sequencing and transcriptomics to characterize tissue-resident T cells from human gut biopsies 2025-02-16, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151353 PMID:39837221	研究论文	本研究首次结合流式细胞术、T细胞受体测序和转录组学，分析来自人类肠道活检组织的T细胞	首次将流式细胞术、TCR测序和转录组学结合，从批量分选的T细胞和单细胞水平分析T细胞库	研究为概念验证性质，样本量有限，且仅关注特定炎症条件下的T细胞反应	深入理解胃肠道T细胞在黏膜免疫中的作用及其在炎症条件下的反应	人类胃、结肠活检样本及血液样本中的T细胞	免疫学	胃炎	NGS, 流式细胞术, 单细胞测序	NA	基因表达数据, TCR序列数据	来自有/无炎症患者的胃、结肠活检样本及血液样本
28	2025-05-08	Targeted FTO knockout in endothelial cells Boosts adhesion and lowers inflammatory infiltration to alleviate pulmonary arterial hypertension 2025-02-16, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151339 PMID:39869947	研究论文	本研究探讨了内皮细胞特异性FTO敲除对肺动脉高压（PAH）发展的影响	首次揭示了内皮细胞中FTO的缺失通过调节内皮粘附和炎症反应缓解PAH的机制	研究主要关注内皮细胞中的FTO作用，未全面探讨其他细胞类型中FTO的可能影响	探索FTO在肺动脉高压中的作用及其潜在治疗策略	内皮细胞和肺动脉高压模型	分子生物学	肺动脉高压	单细胞RNA测序	基因敲除模型	基因表达数据	未明确说明样本数量
29	2025-05-08	Autonomous function of Antennapedia in adult muscle precursors directly connects Hox genes to adult muscle development 2025-Feb-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.204341 PMID:39918891	研究论文	本研究揭示了果蝇Hox基因Antennapedia在成年飞行肌发育中的自主功能，直接连接Hox基因与成年肌肉发育	挑战了T2作为'Hox-free'区域的观念，揭示了Antp通过调控细胞周期速率和Hedgehog信号传导在成年飞行肌发育中的关键作用	研究仅针对果蝇模型，结果在其他生物中的普适性尚待验证	探究Hox基因在成年肌肉发育中的直接作用机制	果蝇成年飞行肌前体细胞(AMPs)	发育生物学	NA	单细胞转录组学、CRISPR技术、功能获得性实验	NA	基因表达数据	果蝇翅盘单细胞样本
30	2025-05-08	Mesenchymal retinoic acid signaling is required for normal diaphragm development in mice 2025-Feb-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202402182R PMID:39921473	研究论文	本研究探讨了间充质视黄酸信号在小鼠正常膈肌发育中的作用	首次通过单细胞RNA测序分析揭示了发育中膈肌的10种不同细胞群，并发现间充质细胞是CDH和视黄酸信号相关基因的主要表达者	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	更好地理解膈肌发育和先天性膈疝(CDH)的病因学	小鼠发育中的膈肌	发育生物学	先天性膈疝	单细胞RNA测序	条件性视黄酸受体显性阴性敲入小鼠模型	RNA测序数据	NA
31	2025-05-08	Spatiotemporal transcriptomics elucidates the pathogenesis of fulminant viral myocarditis 2025-Feb-10, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-025-02143-9 PMID:39924580	研究论文	通过单核和空间转录组学全面分析柯萨奇病毒B3诱导的暴发性心肌炎，揭示其发病机制及潜在治疗靶点	首次利用时空转录组学技术系统描绘暴发性心肌炎的动态病理过程，并发现间皮细胞作为早期病毒感染靶点及IFN-γ/Spi1轴的关键作用	研究基于A/J小鼠模型，人类疾病相关性需进一步验证	阐明暴发性心肌炎的分子机制并探索治疗靶点	CVB3感染的A/J小鼠心肌组织	数字病理学	心血管疾病	单核转录组测序、空间转录组学	小鼠疾病模型	转录组数据	7个不同时间点的处理前后样本
32	2025-05-08	NEAT1-mediated regulation of proteostasis and mRNA localization impacts autophagy dysregulation in Rett syndrome 2025-Feb-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf074 PMID:39921568	研究论文	本研究探讨了长链非编码RNA NEAT1在MeCP2缺失背景下对Rett综合征中蛋白稳态和mRNA定位的调控作用及其对自噬失调的影响	揭示了NEAT1作为MeCP2功能的关键介质，通过RNA-RNA相互作用调控自噬基因的亚细胞定位和自噬复合体生物发生	研究主要基于人类神经细胞和RTT患者样本，尚未在动物模型中进行验证	阐明NEAT1在MeCP2缺失导致的Rett综合征细胞功能障碍中的作用机制	人类神经细胞和Rett综合征患者样本	神经科学	Rett综合征	单细胞RNA测序和分子分析	MECP2敲除细胞模型	RNA测序数据和分子分析数据	未明确说明样本数量
33	2025-05-08	Single-cell sequencing reveals that AK5 inhibits apoptosis in AD oligodendrocytes by regulating the AMPK signaling pathway 2025-Feb-08, Molecular biology reports IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s11033-025-10311-x PMID:39921763	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了AK5通过调节AMPK信号通路抑制阿尔茨海默病(AD)少突胶质细胞凋亡的机制	首次发现AK5在AD少突胶质细胞中的抗凋亡作用及其通过AMPK信号通路的调控机制	研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证	探究AK5在AD能量代谢和神经炎症中的作用机制	阿尔茨海默病患者样本和少突胶质细胞	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞测序	NA	基因表达数据	来自GEO数据库的AD患者和正常样本数据
34	2025-05-08	Single cell transcriptome profiling reveals pathogenesis of bullous pemphigoid 2025-Feb-08, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-07629-4 PMID:39922909	research paper	通过单细胞转录组分析揭示大疱性类天疱疮的发病机制	首次在BP患者中进行了单细胞转录组分析，揭示了免疫和非免疫细胞的功能变化及其在疾病进展中的作用	样本量可能有限，且未涉及所有相关细胞类型的功能验证	探究大疱性类天疱疮的发病机制及潜在治疗靶点	大疱性类天疱疮患者的皮肤和血液样本	digital pathology	bullous pemphigoid	single-cell transcriptome analysis	NA	RNA-seq	BP患者的皮损和非皮损皮肤样本以及血液样本
35	2025-05-08	ANO7 expression in the prostate modulates mitochondrial function and lipid metabolism 2025-Feb-08, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02081-7 PMID:39923095	研究论文	本研究探讨了ANO7在前列腺中的表达如何影响线粒体功能和脂质代谢	揭示了ANO7在前列腺细胞中调控代谢途径的新功能，特别是对氧化磷酸化和脂质代谢的影响	ANO7在前列腺中的具体作用机制尚未完全阐明	探索ANO7在前列腺细胞中的功能及其与前列腺癌的关系	RWPE1细胞、前列腺组织单细胞RNA测序数据集和前列腺组织RNA测序数据	分子生物学	前列腺癌	RNA-seq, scRNA-seq, 氧化磷酸化测量, 糖酵解测量, 靶向代谢组学, 线粒体形态图像分析, 脂质组学	NA	基因表达数据, 代谢组学数据, 图像数据	工程改造的RWPE1细胞和前列腺组织样本
36	2025-05-08	IL-4 induces CD22 expression to restrain the effector program of virtual memory T cells 2025-Feb-07, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk4841 PMID:39919198	research paper	该研究揭示了IL-4通过诱导CD22表达来调控虚拟记忆CD8 T细胞的效应程序	首次发现CD22作为IL-4诱导的T细胞选择性表面标志物，并阐明其内在调控机制	研究主要关注IL-4诱导的T细胞，未涉及其他细胞因子的影响	阐明IL-4依赖性T细胞活化和扩增的调控机制	虚拟记忆CD8 T细胞	免疫学	寄生虫感染	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确说明样本数量
37	2025-05-08	Retrotrans-genomics identifies aberrant THE1B endogenous retrovirus fusion transcripts in the pathogenesis of sarcoidosis 2025-Feb-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-56567-6 PMID:39920152	研究论文	通过逆转录基因组学方法，研究发现THE1B内源性逆转录病毒融合转录本在结节病发病机制中的异常表达	首次识别出19种THE1B融合转录本，其中15种为先前未发现的，并发现其在结节病中的表达模式与结核病不同	样本量相对较小，仅包括16名结节性肌病患者和400名其他肌肉疾病对照	探究THE1B内源性逆转录病毒融合转录本在结节病发病机制中的作用	结节性肌病患者和其他肌肉疾病对照	基因组学	结节病	RNA-seq（短读长和长读长），单细胞或单核RNA-seq	NA	RNA-seq数据	16名结节性肌病患者和400名其他肌肉疾病对照
38	2025-05-08	Mechanistic elucidation of human pancreatic acinar development using single-cell transcriptome analysis on a human iPSC differentiation model 2025-Feb-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-88690-1 PMID:39920294	研究论文	通过单细胞转录组分析人类iPSC分化模型，阐明人类胰腺腺泡细胞的发育机制	发现REG4作为胰腺腺泡祖细胞的候选标记物，并揭示cAMP相关信号通路在hiPSC来源的胰腺腺泡细胞分化中的作用	研究依赖于小鼠模型，可能不完全反映人类胰腺发育的全部复杂性	阐明胰腺外分泌腺泡细胞的发育机制，建立从hiPSCs定向分化胰腺腺泡细胞的方法	人类诱导多能干细胞(hiPSCs)分化的胰腺腺泡细胞	干细胞生物学	胰腺外分泌疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据	NA
39	2025-05-08	Multiomics identify the gene expression signature of the spinal cord during aging process 2025-Feb-07, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-07475-4 PMID:39920442	研究论文	该研究通过多组学方法鉴定了衰老过程中脊髓的基因表达特征	结合批量RNA测序和空间转录组学揭示了衰老脊髓的转录特征，并发现Fth1基因在衰老混合胶质细胞中对铁死亡的抵抗作用	研究主要基于小鼠模型，人类脊髓衰老的适用性需要进一步验证	探索衰老过程中脊髓的分子变化机制	年轻和衰老的脊髓组织	生物医学	老年疾病	批量RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、CCK-8检测、siRNA和慢病毒实验	NA	基因表达数据	年轻和衰老的脊髓样本（具体数量未明确说明）
40	2025-05-08	Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity, gene expression profiles, and pathway dynamics in acne vulgaris 2025-Feb-07, Archives of dermatological research IF:1.8Q3 DOI:10.1007/s00403-025-03894-9 PMID:39920471	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析痤疮患者的皮肤组织，揭示细胞异质性、基因表达谱及代谢通路动态变化	首次在痤疮研究中应用单细胞RNA测序技术，识别了8种不同的细胞簇，并发现了与痤疮相关的特定配体-受体对及代谢通路异常	样本量较小（仅6名患者），且数据来源于公共数据库，可能缺乏临床治疗反应的关联分析	探究痤疮的细胞和分子机制，为治疗策略提供新见解	痤疮患者的皮肤组织（病变与非病变部位）	数字病理学	痤疮	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	6名痤疮患者的皮肤组织样本（来自GEO数据库GSE175817）