单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 21 | 2025-10-22 |
Single-cell clonal lineage tracing identifies the transcriptional program controlling the cell fate decisions by neoantigen-specific CD8 + T cells
2025-Aug-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.670223
PMID:40894735
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研究论文 | 通过单细胞克隆谱系追踪揭示新抗原特异性CD8+T细胞命运决定的转录程序 | 首次结合单细胞转录组和TCR分析，系统描绘了新抗原特异性CD8+T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化轨迹 | 研究仅限于小鼠前列腺癌模型，尚未在人类患者中直接验证 | 解析新抗原特异性CD8+T细胞命运决定的转录调控机制 | 小鼠前列腺癌模型中的新抗原特异性CD8+T细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序, TCR谱分析, 克隆谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据, TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-22 |
Single cell RNA-sequencing reveals no evidence for meiotic sex chromosome inactivation in the threespine stickleback fish
2025-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.26.625488
PMID:39651240
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示三刺棘鱼在精子发生过程中不存在减数分裂性染色体失活现象 | 首次在三刺棘鱼中发现性染色体在减数分裂期间保持基因表达活性，未形成浓缩的性染色体小体，这与哺乳动物等物种的MSCI模式截然不同 | 研究仅针对三刺棘鱼一个物种，需要更多鱼类物种的验证来确认MSCI在硬骨鱼类中的保守性 | 探究三刺棘鱼在精子发生过程中是否存在减数分裂性染色体失活现象 | 三刺棘鱼的性染色体(X和Y染色体)及其在精子发生过程中的基因表达模式 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-22 |
Astragalus polysaccharide reduces the severity of acute pancreatitis under a high-fat diet through enriching L. reuteri and propionate
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140021
PMID:39837455
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研究论文 | 本研究探讨黄芪多糖通过富集罗伊氏乳杆菌和丙酸盐减轻高脂饮食下急性胰腺炎严重程度的机制 | 首次揭示黄芪多糖通过调节肠道菌群-胰腺轴缓解急性胰腺炎的具体机制，发现罗伊氏乳杆菌和丙酸盐的协同保护作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 研究黄芪多糖对高脂饮食诱导的急性胰腺炎的保护作用及其机制 | 高脂饮食诱导的急性胰腺炎小鼠模型 | 生物医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-22 |
The endothelial growth factor Angiopoietin-2 is an accurate prognostic biomarker in patients with acetaminophen-induced acute liver failure
2025-Feb-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.02.19.25322567
PMID:40034764
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研究论文 | 本研究评估血管生成素-2作为对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭预后生物标志物的价值 | 首次发现血管生成素-2在急性肝衰竭患者中具有优越的预后预测价值，特别是在早期就诊患者中优于MELD评分 | 样本量相对有限（总样本量123例），需要在更大规模研究中进一步验证 | 评估血管生成素-2作为对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭预后生物标志物的有效性 | 对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭患者 | 生物标志物研究 | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序，生物标志物检测 | NA | 基因表达数据，临床数据 | 123例患者（凤凰队列43例+ALFSG队列80例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-22 |
Single-cell analysis of human airway epithelium identifies cell type-specific responses to Aspergillus and Coccidioides
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.612147
PMID:39314271
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析人类气道上皮细胞对两种真菌病原体的特异性反应 | 首次报道了使用单细胞转录组分析人类气道上皮细胞感染曲霉菌和球孢子菌的研究 | 动物模型不能完全重现人类疾病，需要使用先进模型研究人类-真菌病原体相互作用 | 研究人类气道上皮细胞对不同真菌病原体的细胞特异性反应机制 | 原代人类气道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸道真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-22 |
Single-cell DNA methylation analysis tool Amethyst reveals distinct noncanonical methylation patterns in human glial cells
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607670
PMID:39211069
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研究论文 | 开发了用于单细胞DNA甲基化数据分析的R软件包Amethyst，并发现人脑胶质细胞中存在非典型甲基化模式 | 开发了首个用于图谱级单细胞甲基化测序数据分析的综合性R软件包，并首次在人星形胶质细胞和少突胶质细胞中发现非典型甲基化模式 | 未明确说明软件包的性能限制或计算资源要求 | 开发单细胞DNA甲基化数据分析工具并探索人脑细胞中的甲基化模式 | 人外周血单核细胞(PBMC)、人脑皮层组织、星形胶质细胞和少突胶质细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞DNA甲基化测序 | NA | 单细胞甲基化测序数据 | 图谱级脑数据集，包含PBMC和脑皮层样本 | NA | 单细胞甲基化测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-22 |
CoCo-ST: Comparing and Contrasting Spatial Transcriptomics data sets using graph contrastive learning
2024-May-20, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4359834/v1
PMID:38826463
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研究论文 | 提出一种名为CoCo-ST的图对比学习特征表示方法，用于比较和对比空间转录组数据集 | 通过引入代表正常组织的背景数据集，增强目标数据集中感兴趣模式的识别，同时减少共享主导模式的影响 | 方法依赖于背景数据集的选择，可能对结果产生影响 | 开发能够更好识别空间转录组数据中生物学相关特征的方法 | 小鼠癌前肺组织样本 | 空间转录组学 | 肺癌 | 图对比学习 | 图对比学习模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-22 |
Universal recording of immune cell interactions in vivo
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07134-4
PMID:38448581
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研究论文 | 开发了一种通用版本的LIPSTIC技术，用于记录体内免疫细胞间的物理相互作用 | 将LIPSTIC技术从依赖特定CD40L-CD40通路扩展到可记录任何受体-配体介导的细胞间相互作用 | NA | 开发能够普遍记录体内免疫细胞相互作用的技术 | 免疫细胞与非免疫细胞间的物理相互作用 | 免疫学 | NA | LIPSTIC技术，单细胞转录组学 | NA | 细胞相互作用数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-22 |
Universal recording of cell-cell contacts in vivo for interaction-based transcriptomics
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.533003
PMID:36993443
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研究论文 | 开发了一种通用型细胞间接触记录技术uLIPSTIC，用于在体监测免疫细胞间的瞬时相互作用 | 将LIPSTIC技术从特定CD40L-CD40通路扩展为不依赖特定受体-配体的通用型细胞相互作用记录平台 | 技术仍处于开发验证阶段，在更多生物系统中的适用性有待进一步验证 | 建立能够普遍记录体内细胞间物理相互作用的技术方法 | 免疫细胞（T细胞、树突状细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞）与肠道上皮细胞等 | 单细胞生物学 | NA | 酶标记技术、单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-21 |
Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development
2025-Nov, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251336191
PMID:40454459
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转基因小鼠模型揭示了Wnt1在颅面骨和牙齿发育中的差异作用 | 首次系统揭示Wnt1对神经嵴来源和间充质来源颅面骨发育的差异影响，并发现其对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探究Wnt1信号在颅面骨和牙齿发育中的具体作用机制 | 小鼠切牙及颅面骨组织 | 发育生物学 | 颅面发育异常 | 单细胞测序, bulk RNA测序, 显微CT, 体外实验 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-21 |
Cellular senescence and its association with aldose reductase promote cyst growth in autosomal dominant polycystic kidney disease
2025-Nov, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.05.027
PMID:40578685
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研究论文 | 本研究探讨细胞衰老及其相关因子醛糖还原酶在常染色体显性多囊肾病囊肿生长中的作用 | 首次揭示细胞衰老通过SASP促进ADPKD囊肿生长，并鉴定AKR1B1为关键SASP因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明细胞衰老在ADPKD发病机制中的作用 | Pkd1突变小鼠和人类ADPKD肾脏组织 | 病理生物学 | 常染色体显性多囊肾病 | 单细胞RNA测序，转基因小鼠模型 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | 基因表达数据，组织学数据 | Pkd1突变小鼠和人类ADPKD肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-21 |
Novel biomarkers related to mitochondrial permeability transition driven-necrosis in hypertrophic cardiomyopathy
2025-Oct, Journal of cardiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.jjcc.2025.04.008
PMID:40306461
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研究论文 | 本研究通过转录组学和孟德尔随机化分析识别与肥厚型心肌病中线粒体渗透性转换驱动坏死相关的新基因 | 首次结合单细胞RNA测序、转录组测序和孟德尔随机化分析识别HCM中MPTDN相关基因 | NA | 探索线粒体渗透性转换驱动坏死相关基因与肥厚型心肌病的关联 | 肥厚型心肌病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, mRNA-seq, 孟德尔随机化分析, 基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 三个GEO数据集：GSE36961（训练集）、GSE141910（验证集）、GSE174691（单细胞数据集） | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-21 |
distQTL: Distribution Quantitative Trait Loci Identification by Population-Scale Single-Cell Data
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.04.647121
PMID:40291679
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研究论文 | 开发了一种基于Fréchet回归的分布数量性状位点识别方法distQTL，利用单细胞RNA测序数据分析遗传变异对基因表达分布的影响 | 首次将Fréchet回归应用于分布数量性状位点识别，使用完整的经验分布作为响应对象而非简单的汇总统计量 | NA | 识别分布数量性状位点，研究遗传变异如何影响基因表达分布 | 982名供体的外周血单个核细胞单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Fréchet回归 | 单细胞RNA测序数据 | 982名供体的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-21 |
scooby: Modeling multi-modal genomic profiles from DNA sequence at single-cell resolution
2025-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.19.613754
PMID:39345504
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研究论文 | 开发首个从DNA序列建模单细胞分辨率多组学图谱的框架scooby | 首个在单细胞分辨率从序列建模scRNA-seq覆盖度和scATAC-seq插入谱的框架，利用预训练模型Borzoi作为基础模型并配备细胞特异性解码器 | NA | 理解调控DNA元件如何影响单个细胞的基因表达，构建跨基因表达步骤的统一基因调控模型 | 造血系统数据集中的单细胞多组学数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，多组学分析 | 基础模型，细胞特异性解码器 | DNA序列，单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-21 |
Role of Dual Specificity Phosphatase 1 (DUSP1) in influencing inflammatory pathways in macrophages modulated by Borrelia burgdorferi lipoproteins
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624562
PMID:39605372
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研究论文 | 本研究探讨双特异性磷酸酶1（DUSP1）在伯氏疏螺旋体脂蛋白调控巨噬细胞炎症通路中的作用机制 | 首次应用单细胞RNA测序和多组学方法系统解析脂蛋白诱导的巨噬细胞异质性反应，并发现DUSP1在早期炎症调控中的关键作用 | 研究仅使用小鼠骨髓来源巨噬细胞，未在人体细胞或动物模型中进行验证 | 阐明DUSP1在莱姆病病原体脂蛋白诱导的宿主免疫反应中的调控机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞（BMDMs） | 免疫学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-21 |
Single-cell technology grows up: Leveraging high-resolution omics approaches to understand neurodevelopmental disorders
2025-Jun, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.102990
PMID:40036988
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综述 | 探讨利用单细胞和空间转录组学技术研究神经发育障碍的病因和机制 | 系统整合单细胞基因组学技术与神经发育障碍模型，在细胞分辨率层面定义疾病病因 | NA | 理解神经发育障碍的分子、细胞和环路机制 | 神经发育障碍模型和人类脑组织 | 基因组学 | 神经发育障碍 | 单细胞基因组学、空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-21 |
A Low Expression of NRF2 Enhances Oxidative Stress and Autophagy in Myofibroblasts, Promoting Progression of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现肌成纤维细胞中NRF2低表达通过激活氧化应激和自噬通路促进慢性阻塞性肺疾病进展 | 首次在单细胞水平揭示肌成纤维细胞中NRF2低表达通过氧化应激和自噬通路促进COPD进展的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型，需要进一步临床验证 | 探索慢性阻塞性肺疾病炎症反应的潜在机制 | 人肺组织单细胞RNA测序数据和COPD小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | GSE171541数据集中的肺组织样本和COPD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-21 |
FixNCut: A Practical Guide to Sample Preservation by Reversible Fixation for Single Cell Assays
2024-Sep-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5063
PMID:39315321
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研究论文 | 本文提供了FixNCut可逆固定方案的优化实用指南，用于单细胞分析中的样本保存 | 开发了可逆固定策略，将样本采集与下游应用分离，避免应激或坏死相关伪影 | NA | 建立可逆固定方案以改善单细胞分析中的样本保存 | 生物样本（组织和细胞悬液） | 单细胞分析 | NA | 可逆固定技术 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-20 |
Spatially resolved transcriptomics reveals a unique disease signature and potential biomarkers for chronic traumatic encephalopathy
2025-Nov-01, Journal of neuropathology and experimental neurology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jnen/nlaf078
PMID:40680295
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研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示慢性创伤性脑病的独特疾病特征和潜在生物标志物 | 首次通过空间转录组学在CTE病灶中发现21个基因的共同特征，揭示星形胶质细胞激活和细胞外基质重塑等关键病理机制 | 研究样本仅限于死后组织，无法进行纵向动态观察 | 解析慢性创伤性脑病的分子病理机制并寻找潜在诊断生物标志物 | 慢性创伤性脑病患者病灶组织与匹配正常组织 | 数字病理学 | 慢性创伤性脑病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 来自同一患者个体的CTE病灶和匹配正常组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 40 | 2025-10-20 |
Neoadjuvant immune checkpoint inhibition improves protection against hepatic melanoma metastasis
2025-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217950
PMID:40714065
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型证明新辅助免疫检查点抑制剂治疗对肝黑色素瘤转移具有更好的保护作用 | 首次比较新辅助与辅助免疫检查点抑制剂治疗在预防肝黑色素瘤转移中的效果差异 | 研究基于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 评估新辅助免疫检查点抑制剂是否能预防肝黑色素瘤转移和治疗耐药性 | WT31和B16F10 luc2黑色素瘤细胞系的小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光,原位杂交,多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,图像数据,细胞因子数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |