单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 39758 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-29 |
Enhanced endocrine-metabolic support and axonemal assembly in high-sperm-motility geese: insights from testicular cellular heterogeneity by scRNA-seq
2026-Jun, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106840
PMID:41916058
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高精子运动能力鹅的睾丸细胞异质性，发现内分泌-代谢支持及轴丝组装增强与精子运动能力相关 | 首次在鹅中利用单细胞转录组学解析精子运动能力差异的细胞基础，发现支持细胞和间质细胞的内分泌-代谢增强及圆形精子的轴丝组装程序上调 | 样本量较小（每组3只），且仅关注生理范围内的精子运动能力差异，未涉及极端低活力情况 | 探究鹅精子运动能力差异的睾丸细胞和分子基础 | 60只鹅中精子运动能力最高和最低的10%各6只，其中3只用于单细胞RNA测序 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 12只鹅用于表型比较，6只用于单细胞测序 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 22 | 2026-05-29 |
stGNN: Spatially Informed Cell-Type Deconvolution Based on Deep Graph Learning and Statistical Modeling
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00728-0
PMID:40571903
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研究论文 | 提出基于深度图学习和统计建模的stGNN方法，用于空间转录组数据的细胞类型反卷积 | 创新性地结合图卷积网络与自编码器的双编码模块，以及自适应注意力机制，从低阶到高阶捕捉多尺度空间结构；采用负对数似然损失函数对齐ST与scRNA-seq参考数据的分布 | 依赖性于高质量scRNA-seq参考数据；未明确讨论计算效率或大规模数据扩展性 | 开发利用空间信息的细胞类型反卷积方法，提升空间转录组数据中细胞类型组成预测准确性 | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等多个平台的六套空间转录组数据集，以及小鼠脑组织样本 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 图卷积网络、自编码器 | 空间转录组基因表达数据 | 六套来自多种平台的空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seqV2, Visium HD | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等不同分辨率的空间转录组平台 |
| 23 | 2026-05-29 |
A Novel Dual-Level Momentum Distillation Method with Extreme Thresholding for Imputing Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00754-y
PMID:40841490
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研究论文 | 提出了一种名为MoDET的新方法，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值，以提高数据质量和后续分析准确性 | 提出双重水平动量蒸馏与极端阈值机制相结合的方法，有效提升了细胞表征学习能力和对稀有细胞类型的识别精度 | 未提及跨平台或更大规模数据集验证，且对极端阈值机制的普适性未作深入讨论 | 解决单细胞RNA测序数据因缺失现象导致的稀疏性问题，提升下游聚类分析和稀有细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 双重水平动量蒸馏模型 | 基因表达矩阵 | 七个真实世界数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-05-29 |
Joint Low Rank Representation with Symmetric Orthogonal Decomposition for Clustering of scRNA-seq Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00767-7
PMID:41131369
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研究论文 | 提出一种结合低秩表示与对称正交分解的单细胞RNA测序数据聚类新方法LRRS | 引入新的正交对称分解策略，无需预设聚类数量，通过测量正交空间下的加权距离自适应表征局部特性 | 未在更大规模或更复杂的数据集上验证，且迭代优化方法可能增加计算复杂度 | 开发高效的单细胞RNA测序数据聚类方法以准确识别细胞类型，揭示复杂疾病分子机制 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型组成 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示与对称正交分解模型 | 基因表达数据 | 11个基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-05-29 |
Monocyte-derived IL-1β predicts and promotes HBsAg decline in chronic hepatitis B patients under nucleoside analogue therapy
2026-Jun-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000957
PMID:42190271
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示单核细胞来源的IL-1β在核苷类似物治疗的慢性乙型肝炎患者中预测和促进HBsAg下降 | 首次发现单核细胞来源的IL-1β与NA治疗中的HBsAg下降相关，并可作为功能性治愈的预测生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 探究NA治疗中HBsAg下降的免疫相关因素 | NA治疗的慢性乙型肝炎患者 | 机器学习 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序、转录组学、功能性检测 | NA | 单细胞转录组数据、血清IL-1β数据 | 多个队列，包括单细胞RNA测序队列、独立多中心验证队列和回顾性队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 26 | 2026-05-29 |
Implications of the Cuproptosis Protein SLC31A1 for the Immune Microenvironment and Temozolomide Sensitivity in Glioblastoma
2026-Jun, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.18188
PMID:42203322
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研究论文 | 探究铜死亡相关蛋白SLC31A1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的作用及其对替莫唑胺敏感性的影响 | 首次揭示铜死亡关键蛋白SLC31A1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的分布及其与免疫细胞浸润的关联，并评估铜死亡激动剂联合替莫唑胺的协同抗肿瘤效应 | 仅基于转录组和单细胞测序数据的生物信息学分析，缺乏多中心临床样本验证，且未深入探讨SLC31A1调控免疫微环境的分子机制 | 研究铜死亡通路关键蛋白SLC31A1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的分布及其对化疗敏感性的影响 | 胶质母细胞瘤组织样本、GBM细胞系及异种移植瘤模型 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞测序, 免疫组化, 蛋白质印迹, 定量荧光PCR, 细胞增殖实验, 划痕愈合实验 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 图像数据（免疫组化）, 蛋白质表达数据 | 未明确样本量，涉及GBM肿瘤组织、细胞系及小鼠异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-05-29 |
Multi-omics reveals a novel Cxcr4+ subpopulation of alveolar macrophages and therapeutic effect of AMD3100 in mice with advanced silicosis
2026-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70705
PMID:42204838
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research paper | 通过整合单细胞RNA测序与空间转录组学，揭示了小鼠晚期矽肺中Cxcr4+肺泡巨噬细胞亚群的特征及AMD3100的治疗效果 | 首次鉴定出Cxcr4+巨噬细胞与Cxcl12+成纤维细胞在矽肺纤维化中的空间共定位模式，并揭示其通过正反馈环路驱动纤维化进展 | 研究基于小鼠模型，需进一步在人体样本中验证；AMD3100的长期疗效和安全性有待评估 | 探索矽肺纤维化进展中Cxcr4+巨噬细胞的作用机制及AMD3100的潜在治疗价值 | 小鼠矽肺模型肺组织样本及MH-S巨噬细胞系 | machine learning | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Robust Cell Type Decomposition算法 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 矽肺小鼠模型肺组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 28 | 2026-05-29 |
The GATA1 N terminus coordinates metabolic reprogramming in erythropoiesis
2026-May-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030464
PMID:41587073
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序等手段，揭示GATA1 N端缺失如何导致红细胞生成缺陷及糖酵解基因异常上调 | 首次发现GATA1 N端缺失通过组蛋白乳酸化修饰直接激活PKM基因，驱动糖酵解重编程，并关联红细胞生成缺陷 | 未明确GATA1s诱导的组蛋白乳酸化是否由乳酸积累直接介导，且仅在胎肝细胞和患者样本中验证，缺乏体内长期功能验证 | 阐明GATA1蛋白N端缺失（GATA1s）在红细胞生成中调控代谢重编程的分子机制 | Gata1突变胚胎的胎肝细胞、急性GATA1缺失的红系细胞、伴有RPS19突变的Diamond-Blackfan贫血患者 | 分子生物学 | 唐氏综合征相关髓系白血病、Diamond-Blackfan贫血 | 单细胞RNA测序、精确核运行测序、CUT&RUN | NA | 基因表达数据、表观基因组数据 | Gata1突变胚胎胎肝细胞、急性GATA1缺失红系细胞、DBA患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-05-29 |
Beyond Suppression: The Plasticity, Dysfunction, and Therapeutic Reprogramming of Regulatory T Cells in Inflammatory Bowel Disease
2026-May-28, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag067
PMID:42203202
|
综述 | 系统性阐述调节性T细胞在炎症性肠病中的可塑性、功能缺陷及治疗性重编程策略 | 提出以谱系缺陷性ex-Tregs和耗竭性效应Tregs（eTregs）的关键区分为核心的新概念框架，并整合多组学见解重新定义IBD中Treg的功能衰竭 | 未提及具体局限性 | 阐述Treg在IBD中的复杂生物学特性、异常变化及新兴治疗策略 | 调节性T细胞（Tregs） | 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-29 |
scFAST-seq reveals a wide diversity of transcripts, CNV events, and regulatory activity in adrenocortical tumor
2026-May-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44117-z
PMID:42203806
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研究论文 | 比较10X Chromium 3' scRNA-seq和SeekGene scFAST-seq在肾上腺皮质肿瘤配对样本中的表现，发现scFAST-seq检测到更多长链非编码RNA、基因和转录本 | 首次系统比较scFAST-seq与主流10X Chromium 3' scRNA-seq技术在肾上腺皮质肿瘤单细胞转录组分析中的差异，揭示了scFAST-seq在检测长链非编码RNA、基因和转录本方面的优势 | 仅使用两个配对样本，样本量较小；未对不同肿瘤类型的适用性进行验证；对RNA动态和拷贝数变异检测差异的机制解释不够深入 | 比较两种高通量液滴式单细胞RNA测序技术在肾上腺皮质肿瘤研究中的性能差异 | 来自肾上腺皮质肿瘤的两个配对样本 | 单细胞转录组学 | 肾上腺皮质肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个肾上腺皮质肿瘤配对样本 | 10x Genomics, SeekGene | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium 3', SeekGene scFAST-seq | 10x Chromium 3' 单细胞RNA测序, SeekGene scFAST-seq单细胞RNA测序 |
| 31 | 2026-05-29 |
Flowerbed-Inspired Mg-Loaded Scaffold Accelerates Critical-Sized Bone-Defect Repair by Reprogramming the Microenvironment
2026-May-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c02723
PMID:42204979
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研究论文 | 受花坛启发，开发了一种镁负载仿生复合支架，通过重编程微环境加速临界尺寸骨缺损修复 | 创新性地将镁离子负载水凝胶嵌入三周期极小曲面多孔钛合金框架，模拟花坛结构构建成骨微环境；发现并鉴定出CCN3间充质干细胞亚群在镁富集微环境中的招募及其通过Wnt/β-catenin信号通路参与早期成骨、通过分泌PTN因子调控巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于大鼠和比格犬动物模型，尚需进一步验证在人体内的效果和安全性 | 开发一种能够加速临界尺寸骨缺损修复的仿生支架材料 | 临界尺寸骨缺损的大鼠颅骨缺损模型和比格犬股骨髁缺损模型 | 机器学习 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大鼠颅骨缺损模型和比格犬股骨髁缺损模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-05-29 |
Spatial and Single-Cell Mapping Reveals Valvular Interstitial Cell and Macrophage Sex Differences in Calcific Aortic Valve Disease
2026-May-28, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.126.324694
PMID:42206364
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研究论文 | 通过空间和单细胞测序揭示钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞和巨噬细胞的性别差异 | 首次结合单细胞和空间转录组学分析人类主动脉瓣组织中钙化位点附近瓣膜间质细胞和巨噬细胞的性别依赖性基因表达异质性 | 未明确说明 | 探究驱动主动脉瓣组织纤维钙化性别差异的细胞机制 | 人类主动脉瓣组织（男性和女性） | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、空间转录组学、组织学分析、扫描电子显微镜、RNA原位杂交 | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据、组织学图像 | 健康患者和钙化性主动脉瓣疾病患者的人主动脉瓣组织 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-05-29 |
Microplastic Exposure Aggravates Cardiomyopathy Under Hemodynamic Stress Through the Gut-Heart Axis
2026-May-28, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了双酚F通过肠道微生物代谢产物N-乙酰腐胺经肠心轴加重心肌病的机制 | 首次阐明双酚F通过肠道菌群依赖的Sat1-NAP途径引发心脏毒性的分子机制，并发现Akkermansia muciniphila及其代谢产物色醇可缓解该毒性 | 未明确讨论样本量大小及模型代表性等潜在局限性 | 探究双酚F对心血管系统及肠道屏障的毒性作用及其机制 | 双酚F对小鼠心血管及肠道系统的影响，以及人体样本验证 | 机器学习和生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、非靶向代谢组学、空间代谢组学、粪便微生物移植 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、临床尿液数据 | 285例人尿液样本 | NA | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | NA |
| 34 | 2026-05-29 |
ZNF469 drives TGF-β1/SMAD3-mediated extracellular matrix regulation in pulmonary fibrosis
2026-May-28, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2026.14165
PMID:42206677
|
研究论文 | 本文发现ZNF469通过TGF-β1/SMAD3信号通路调控肺成纤维细胞中细胞外基质的转录，促进肺纤维化进程 | 首次揭示ZNF469在肺纤维化中的促纤维化作用，并阐明其通过TGF-β1/SMAD3轴调控ECM基因表达的机制 | 研究基于体外细胞实验和公共数据库分析，缺乏体内动物模型验证及临床试验数据 | 探究ZNF469在肺纤维化中调控成纤维细胞活化和ECM沉积的分子机制 | 肺成纤维细胞及特发性肺纤维化、系统性硬化症患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RNA测序、CUT&RUN检测 | NA | 转录组数据 | 特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本（具体数量未提及） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-05-29 |
Intrathecal Allogeneic B7-H3-targeted CAR γδ T Cells for Leptomeningeal Metastasis from Solid Tumors: Safety, Efficacy, and Immunological Dynamics in a Phase 1 Trial
2026-May-28, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-26-0738
PMID:42207176
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研究论文 | 评估异体B7-H3靶向嵌合抗原受体γδ T细胞鞘内注射治疗软脑膜转移瘤的安全性、有效性和免疫动力学 | 首次在临床试验中评估异体B7-H3-CAR γδ T细胞疗法通过鞘内给药治疗软脑膜转移瘤，并展示了早期安全性、临床活性、局部持久性和IFN-γ相关的脑脊液免疫重塑 | 样本量小，仅有三名患者，且为单臂试验，缺乏对照组，初步概念验证性质 | 评估鞘内注射异体B7-H3靶向CAR γδ T细胞治疗软脑膜转移瘤的临床反应、安全性、总生存期、生活质量和药代动力学/药效学特征 | 三名来自B7-H3阳性实体瘤的软脑膜转移瘤患者，包括两名肺腺癌患者和一名三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌, 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 3名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-05-29 |
Exploratory multiomics analysis identifies WDR17 as a potential biomarker of tyrosine kinase inhibitor resistance in lung adenocarcinoma
2026-May-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05286-5
PMID:42207214
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研究论文 | 利用多组学分析探索WDR17作为肺腺癌酪氨酸激酶抑制剂耐药潜在生物标志物的研究 | 首次通过多组学分析识别WDR17与肺腺癌TKI耐药相关，并发现其通过维持蛋白质稳态和代谢平衡影响药物敏感性 | 样本量小且为探索性研究，结果需在更大独立队列中验证 | 识别肺腺癌中TKI耐药相关的常见失调基因，为新型治疗策略提供机制见解 | TCGA LUAD患者TKI治疗队列及公开单细胞数据集中的TKI耐药细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 8例TCGA LUAD患者（TKI治疗后），以及公开数据集中的细胞系样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-05-29 |
Protocol for the isolation of human buccal cells for single-cell applications
2026-May-27, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104601
PMID:42201808
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研究论文 | 描述了一种从人体颊粘膜活检组织中分离高活力单细胞悬浮液的温和解离方案，适用于单细胞应用 | 结合可控酶消化（胶原酶和核酸酶）与优化的速度、温度和孵育时间，高效释放异质性细胞群同时最小化细胞损伤，获得≥80%活力的单细胞悬浮液 | NA | 建立一种可靠的人体颊粘膜细胞分离方案用于单细胞RNA测序和流式细胞术 | 人体颊粘膜活检组织中的上皮细胞、基质细胞和驻留免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、细胞表型数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-05-29 |
CCR5 and CD74 are potential therapeutic targets for necroinflammation in preclinical cholesterol crystal embolism
2026-May-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv8372
PMID:42202044
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胆固醇晶体栓塞肾脏的细胞图谱，发现CCR5和CD74是坏死性炎症的潜在治疗靶点 | 首次构建胆固醇晶体栓塞（CCE）肾脏的单细胞图谱，并鉴定CCR5和CD74通路在CCE相关坏死性炎症中的关键作用 | 基于小鼠模型和少量人类肾活检样本，需进一步验证临床转化潜力 | 探讨CCE诱导急性肾损伤的分子机制，并识别潜在治疗靶点 | C57BL/6J小鼠CCE模型和人CCE患者肾活检组织 | 机器学习和生物信息学 | 心血管疾病、肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肾动脉注射CC模型（未明确具体样本数）；人肾活检切片 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 39 | 2026-05-29 |
Genomic instability drives POSTN+ myofibroblasts via STING-WNT axis to promote immunosuppression and PARPi resistance in ovarian cancer
2026-May-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ady2719
PMID:42202048
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研究论文 | 本研究揭示了卵巢癌中基因组不稳定性通过STING-WNT轴驱动POSTN+肌成纤维细胞，促进免疫抑制和PARP抑制剂耐药性的机制 | 首次阐明肿瘤内在基因组不稳定性通过STING-WNT轴重编程基质成纤维细胞，形成免疫抑制微环境并导致PARP抑制剂耐药的完整机制，并发现POSTN作为基质特异性免疫检查点 | 未在更大样本或不同癌症类型中验证POSTN阻断的治疗效果，且可能缺乏体内长期安全性数据 | 探究肿瘤内在基因组不稳定性如何通过基质重编程驱动免疫抑制和治疗耐药 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本，以及卵巢癌和乳腺癌模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学、单细胞表观基因组学 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞表观基因组数据 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-29 |
AdPrST:An Adversarial Graph Deep Learning Pre-clustering Framework for Deciphering Spatiotemporal Structures in Spatially Resolved Transcriptomics
2026-May-27, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3697726
PMID:42202195
|
研究论文 | 提出一种名为AdPrST的对抗性图深度学习预聚类框架，用于从空间分辨转录组学数据中解码时空结构，包括空间域识别、轨迹推断和伪时空图谱构建 | 通过对抗性自监督对比学习结合Wasserstein距离GAN和双重视图图结构，实现鲁棒的时空结构推断 | 未明确提及 | 解决空间分辨转录组学中复杂组织时空结构推断的挑战 | 空间分辨转录组学数据中的空间域、发育轨迹和时空特征 | 数字病理学 | 未指定 | 空间转录组学 | 生成对抗网络 | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |