单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32055 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-02 |
Integrated analysis identifies CD276 in fibroblasts as a malignancy predictor and regulator of neutrophil infiltration in hepatoblastoma
2025-Nov-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000826
PMID:41171428
|
研究论文 | 本研究通过整合分析发现成纤维细胞中的CD276是肝母细胞瘤恶性程度的预测因子和中性粒细胞浸润的调节因子 | 首次系统表征CD276在肝母细胞瘤中的表达特征，发现其在癌相关成纤维细胞中高表达，并揭示其通过调节CXCL2调控中性粒细胞浸润的新机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要更多前瞻性研究验证 | 探索免疫检查点配体CD276在肝母细胞瘤中的临床意义及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 肝母细胞瘤患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多重免疫组化, 反卷积分析, 相关性分析 | 逻辑回归模型, 风险评分模型, 列线图 | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像 | 肝母细胞瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-11-02 |
Duplicated genes find their space: Spatial transcriptomics illuminates evolutionary fates
2025-Nov-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf265
PMID:41175099
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2025-11-02 |
Systematic characterization of full-length RNA isoforms in human colorectal cancer at single-cell resolution
2025-Oct-31, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf049
PMID:40702779
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研究论文 | 本研究通过单细胞长读长RNA测序系统表征了人类结直肠癌中全长RNA亚型的特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘结直肠癌全长转录组图谱，揭示了癌症特异性剪接变异和等位基因特异性表达模式 | 样本量相对有限(12例患者)，功能验证实验仍需扩展 | 解析结直肠癌中RNA剪接调控的分子机制 | 结直肠癌患者的上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-11-02 |
Tumor-derived RAC1A159V mutation promotes an immunosuppressive microenvironment that represses response to immune checkpoint inhibitor
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea1212
PMID:41160695
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研究论文 | 研究RAC1A159V突变通过激活mTORC1信号通路促进免疫抑制微环境并导致免疫检查点抑制剂耐药 | 首次揭示RAC1突变通过糖鞘脂生物合成-mTORC1信号轴驱动免疫抑制微环境形成的新机制 | 研究主要基于基因编辑小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探索RAC1突变导致免疫检查点抑制剂耐药的分子机制 | RAC1突变肿瘤细胞及肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 基因编辑,流式细胞术,单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 基因编辑小鼠肿瘤样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-11-02 |
Circulating tumor cells as predictive biomarkers in the risk stratification of DCIS: Evidence of early dissemination
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz0187
PMID:41160699
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研究论文 | 本研究探讨循环肿瘤细胞作为DCIS风险分层生物标志物的潜力，通过单细胞RNA测序分析证实了早期播散现象 | 首次在DCIS患者中系统分析CTC的单细胞转录组特征，并提供了早期播散的实验证据 | 样本量较小（34例患者），需要更大规模研究验证 | 改善DCIS患者风险分层，寻找可靠的预后生物标志物 | DCIS患者和健康对照的循环肿瘤细胞及匹配组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，微流控技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 34例DCIS患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-11-02 |
Intestinal fibroblast heterogeneity: unifying RNA-seq studies and introducing consensus-driven nomenclature
2025-Oct-31, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.264147
PMID:41170756
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别小鼠结肠黏膜中六个不同的成纤维细胞亚群，并提出标准化的肠道成纤维细胞命名体系 | 首次系统鉴定结肠黏膜成纤维细胞亚群并建立统一命名标准，整合多数据集揭示保守细胞群体 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 解析肠道成纤维细胞异质性并建立标准化分类体系 | 小鼠结肠黏膜成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠结肠黏膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-11-02 |
CellSNVReg: a multidimensional resource for SNV-mediated regulatory perturbations in single-cell and spatial omics
2025-Oct-31, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1076
PMID:41171131
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研究论文 | 介绍CellSNVReg——一个系统表征单核苷酸变异在细胞类型和空间分辨率下调控扰动效应的多维资源数据库 | 首次整合单细胞和空间组学数据，在六个维度系统分析SNV介导的调控扰动，并提供定性和定量评估 | NA | 解析单核苷酸变异在多分子层面的调控扰动及其对细胞功能状态的影响 | 人类正常组织、肿瘤组织及其他疾病组织 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 460万个细胞谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-11-02 |
SEA version 4.0: a major expansion and update of the Super-Enhancer Archive
2025-Oct-31, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1114
PMID:41171129
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研究论文 | 介绍超级增强子数据库SEA版本4.0的重大扩展和更新 | 新增H3K4me1组蛋白标记，扩展至14个物种，引入基于香农熵的算法识别特异性SE，提供交互式调控网络和细胞特异性SE检测器 | NA | 阐明超级增强子在细胞命运和疾病中的表观遗传调控作用 | 超级增强子和增强子 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，组蛋白修饰分析 | 香农熵算法 | 基因组数据，表观遗传数据 | 12个癌症和正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-11-02 |
connectomeDB2025: a rigorously curated, multi-species resource of experimentally supported ligand-receptor interactions
2025-Oct-31, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1108
PMID:41171146
|
研究论文 | 介绍更新版connectomeDB2025，一个经过严格筛选、包含多物种实验支持的配体-受体相互作用的开放获取数据库 | 通过AI辅助文献挖掘和手动筛选，新增827对配体-受体相互作用和718篇支持文献，其中264对为2020年后首次描述，包含2359个独有的证据链接 | 仅包含脊椎动物的肽基配体-受体相互作用，不涵盖其他类型的分子相互作用 | 构建一个经过严格筛选、具有实验支持的配体-受体相互作用参考数据库 | 脊椎动物的配体-受体相互作用 | 生物信息学 | NA | AI辅助文献挖掘，手动筛选 | NA | 文献数据，实验证据 | 3579个脊椎动物相互作用，来自2803篇研究文章，5429个证据链接 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-02 |
Identification of C1QA as a prognostic marker and regulator of immunosuppressive neutrophils in early-stage lung adenocarcinoma through integrated bioinformatics analyses
2025-Oct-31, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01881-y
PMID:41171372
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定C1QA作为早期肺腺癌预后标志物和免疫抑制中性粒细胞的调控因子 | 首次发现C1QA是调控早期肺腺癌免疫抑制中性粒细胞的关键基因，并揭示其通过补体受体与中性粒细胞相互作用的机制 | 基于公共数据库分析，需要进一步实验验证C1QA的具体功能机制 | 研究早期肺腺癌中中性粒细胞的分子调控机制 | 早期肺腺癌患者样本和基因表达数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,CIBERSORTx,免疫荧光染色,RT-qPCR | WGCNA,CIBERSORTx | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 公共数据集GSE31210及其他独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-11-02 |
Cancer-associated fibroblast miR-148a-5p/CALD1/collagen VI pathway promotes proliferation in Helicobacter pylori-positive gastric cancer
2025-Oct-31, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01116-y
PMID:41171370
|
研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌阳性胃癌中癌症相关成纤维细胞通过miR-148a-5p/CALD1/胶原蛋白VI通路促进肿瘤增殖的机制 | 首次在幽门螺杆菌阳性胃癌中发现并验证了CAFs中TLR/miR-148a-5p/CALD1/胶原蛋白VI信号通路的关键作用 | NA | 探究幽门螺杆菌对癌症相关成纤维细胞的影响及潜在治疗靶点 | 幽门螺杆菌阳性胃癌中的癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 胃癌 | microRNA测序,转录组测序,单细胞测序,分子生物学实验,体外细胞共培养,CDX模型,PDX模型 | NA | 测序数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-11-02 |
Ex Vivo Spatiotemporal Characterization of Spermatogenesis in Mouse Testicular Organoids
2025-Oct-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512670
PMID:41173796
|
研究论文 | 开发了一种小鼠睾丸类器官培养策略，实现了体外精子发生的时空特征表征 | 建立了单细胞悬浮液自重组形成睾丸类器官的方法，首次在体外实现了包含单倍体精子的完整精子发生过程 | 类器官中精子样细胞仅占总生殖细胞的约2.43%，效率仍有待提高 | 研究睾丸类器官中精子发生的时空特征及其在生育力保存中的应用 | 新生小鼠睾丸单细胞悬浮液和睾丸类器官 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，形态学分析，谱系特异性标记分析 | 小鼠睾丸类器官模型 | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | 新生小鼠睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-11-02 |
Exploration of Novel Biomarkers Through a Precision Medicine Approach Using Multi-Omics and Brain Organoids in Patients With Atypical Depression and Psychotic Symptoms
2025-Oct-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508383
PMID:41173797
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研究论文 | 通过整合临床数据、白细胞单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学和脑类器官模型，探索非典型抑郁症伴精神病性症状患者的新型生物标志物 | 首次将白细胞单细胞转录组、血浆蛋白质组和患者来源脑类器官模型相结合，构建理解精神疾病病理生理学的新框架 | 白细胞计数差异在年龄校正后不显著，样本量未明确说明 | 探索非典型抑郁症伴精神病性症状的精准医学生物标志物 | 非典型抑郁症伴精神病性症状患者 | 精准医学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 脑类器官模型 | 脑类器官模型 | 临床数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-11-02 |
Hidden network preserved in Slide-tags data allows reference-free spatial reconstruction
2025-Oct-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65295-w
PMID:41173855
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研究论文 | 重新分析Slide-tags空间转录组数据，发现通过条形码扩散形成的细胞-珠子网络包含空间信息，可实现无参考组织重构 | 首次发现Slide-tags数据中隐藏的细胞-珠子网络具有空间信息，将其重新定义为基于网络的测序成像方法，实现无需预索引阵列的组织重构 | NA | 探索Slide-tags空间转录组技术中隐含的空间信息利用方式 | Slide-tags空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 网络优化模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Slide-tags | 基于预解码珠子阵列的空间转录组技术，通过探针扩散标记组织核 |
| 35 | 2025-11-02 |
Systematic production of human kidney organoids for transplantation in porcine kidneys during ex vivo machine perfusion
2025-Oct-31, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01542-1
PMID:41174010
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研究论文 | 开发可规模化生产的人源肾脏类器官并将其移植到离体猪肾中的方法 | 建立了可扩展、可重复且经济高效的人多能干细胞肾脏类器官分化体系，并首次实现在离体机器灌注的猪肾中进行人源类器官移植 | 未明确说明类器官长期存活率和功能整合效果，临床试验可行性仍需进一步验证 | 开发用于移植治疗的人类肾脏类器官规模化生产技术 | 人多能干细胞衍生的肾脏类器官和离体猪肾 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 免疫组化, 流式细胞术, 共聚焦显微镜 | 类器官模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-11-02 |
The involvement of microglia and the CXCL16-CXCR6 axis in the recruitment of CD8+ T cells to an amyloidogenic mouse brain
2025-Oct-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22137-5
PMID:41174156
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研究论文 | 本研究探讨了小胶质细胞和CXCL16-CXCR6轴在淀粉样蛋白小鼠大脑中招募CD8+ T细胞的作用 | 发现PLX5622敏感的小胶质细胞在CXCR6+ CD8 T细胞脑部招募过程中并非必需，揭示了补偿性表达机制 | 需要未来体内分析来解析CD8 T细胞脑部招募的具体机制 | 探究阿尔茨海默病中CD8 T细胞脑部招募的分子机制 | APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 体外实验 | NA | 基因表达数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-11-02 |
Transcriptomic response analysis of rubber tree saplings to water-deficit stress at single-cell resolution
2025-Oct-31, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09046-z
PMID:41174182
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了橡胶树幼苗在水分亏缺胁迫下的细胞和分子响应机制 | 首次构建了橡胶树树皮在水分亏缺胁迫下的高分辨率单细胞转录组图谱，系统揭示了不同细胞类型对干旱胁迫的响应特征 | 研究仅分析了4天和7天两个时间点的胁迫响应，缺乏更长时间的动态变化数据 | 探究橡胶树对水分亏缺胁迫的适应机制，为提升橡胶树抗旱性提供理论基础 | 橡胶树(Hevea brasiliensis)幼苗的树皮组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,994个单个细胞，来自对照、4天干旱胁迫和7天干旱胁迫的树皮组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴式单细胞RNA测序技术 |
| 38 | 2025-11-02 |
Effect of the mitophagy inducer urolithin A on age-related immune decline: a randomized, placebo-controlled trial
2025-Oct-31, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00996-x
PMID:41174221
|
研究论文 | 评估线粒体自噬诱导剂尿石素A对年龄相关免疫功能衰退影响的随机对照试验 | 首次在人体临床试验中证明尿石素A能够通过诱导线粒体自噬改善免疫功能，扩展幼稚样CD8+T细胞并增强脂肪酸氧化能力 | 样本量较小(50人)，干预时间较短(4周)，研究对象仅限于健康中年人群 | 研究尿石素A对年龄相关免疫功能衰退的干预效果 | 50名健康中年成年人 | 免疫学 | 年龄相关免疫衰退 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 细胞因子检测 | 随机对照试验 | 临床数据, 分子数据, 细胞数据 | 50名健康中年成年人 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 39 | 2025-11-02 |
Non-cell-autonomous control of mouse gastruloid development by the ultra-conserved lncRNA T-UCstem1
2025-Oct-31, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00558-2
PMID:41174250
|
研究论文 | 本研究探讨超保守长链非编码RNA T-UCstem1在小鼠胃胚体发育中的非细胞自主调控作用 | 首次揭示T-UCstem1通过调控DKK1依赖性WNT通路以非细胞自主方式控制胃胚体发育 | 使用干细胞模型而非真实胚胎，可能存在模型系统局限性 | 研究超保守lncRNA在哺乳动物体轴形成中的功能机制 | 小鼠胃胚体（干细胞衍生模型） | 发育生物学 | NA | 形态学成像、免疫荧光分析、bulk转录组测序、单细胞转录组测序 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-11-02 |
Pan-Cancer Landscape of Magnesium Homeostasis: Bulk Omics Research and Single-Cell Sequencing Validation
2025-Oct-31, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00294-1
PMID:41174507
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研究论文 | 本研究通过批量组学分析和单细胞测序验证，全面描绘了镁稳态在33种癌症类型中的全景图谱 | 首次系统性地分析镁稳态在泛癌中的作用，发现镁稳态评分与肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性和免疫调节的关联 | 需要进一步的临床验证来推进个性化癌症治疗 | 全面分析镁稳态在33种癌症类型中的作用，探索其在肿瘤发生、免疫调节和治疗潜力中的功能 | 33种癌症类型，包括CD8+T细胞等免疫细胞 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 批量组学分析，单细胞测序 | NA | 基因组数据，单细胞测序数据 | 33种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序，批量组学分析 | NA | NA |