单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-05-23	Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension 2025-May-22, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321173 PMID:40401371	research paper	该研究探讨了脂肪酸结合蛋白FABP4和FABP5在肺动脉高压（PAH）发病机制中的作用	首次揭示了FABP4/5通过调控内皮细胞糖酵解和动脉编程促进PAH血管重塑的分子机制	研究主要基于动物模型，人类样本验证仍需进一步扩大	阐明内皮细胞FABP4/5在PAH发病中的分子机制	肺动脉内皮细胞和PAH患者/动物模型	分子病理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序、空间转录组分析、RNA-seq	Egln1Tie2Cre小鼠模型	基因表达数据、蛋白质组数据	PAH患者样本和PH大鼠模型
22	2025-05-23	Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.191059 PMID:40401523	review	本文综述了心肺血管系统中内皮细胞（ECs）在健康和疾病状态下的免疫调节功能及其转录特征	揭示了心肺血管系统中内皮细胞亚群的多样性及其在免疫调节中的特殊作用，强调了ECs在疾病发病机制中的关键角色和作为未来治疗靶点的潜力	NA	探讨心肺血管系统中内皮细胞在免疫调节中的作用及其在健康和疾病状态下的转录特征	心肺血管系统中的内皮细胞（ECs）	生物医学	心肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
23	2025-05-23	A conserved epilepsy-associated gene co-expression module identifies increased metabolic rate as a shared pathomechanism 2025-May-22, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052307 PMID:40401642	研究论文	通过果蝇全脑单细胞RNA测序，研究癫痫相关基因共表达网络，揭示代谢率增加作为癫痫的共同病理机制	利用果蝇单细胞表达数据和行为验证人类基因共表达网络，首次将代谢率增加与癫痫易感性联系起来	研究结果主要基于果蝇模型，需要在人类样本中进一步验证	揭示癫痫的分子机制，特别是代谢与癫痫易感性的关系	果蝇和人类癫痫相关基因	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序	果蝇基因敲低模型	RNA测序数据	26个基因的果蝇全脑单细胞RNA测序数据
24	2025-05-23	Single-cell sequencing on PBMCs from HA & HB patients with inhibitors reveals different immune responses to FVIII & FIX 2025-May-22, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2025015799 PMID:40402102	研究论文	通过单细胞测序技术研究血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫反应	首次在单细胞水平上比较了HA和HB患者对FVIII和FIX的免疫反应差异，揭示了淋巴细胞亚群组成和功能状态的差异	样本量较小（5例HA和5例HB患者），可能影响结果的普遍性	探索HA和HB患者对FVIII和FIX的不同免疫反应机制	血友病A和血友病B患者的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞测序	血友病	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	5例HA患者和5例HB患者的PBMCs，共75,051个细胞
25	2025-05-23	Myeloid Cells in Abdominal Aortic Aneurysm 2025-May-22, Current atherosclerosis reports IF:5.7Q1 DOI:10.1007/s11883-025-01302-1 PMID:40402405	review	综述了髓系细胞在腹主动脉瘤(AAA)发病机制中的关键作用及其治疗潜力	单细胞RNA测序揭示了AAA中髓系细胞的多样性，并阐明了不同髓系细胞亚群在疾病中的作用机制	临床转化面临微环境串扰和潜在脱靶效应的挑战	探讨髓系细胞在腹主动脉瘤发病机制中的作用及治疗靶向潜力	腹主动脉瘤中的髓系细胞	血管生物学	腹主动脉瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
26	2025-05-23	Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in TP53-Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse 2025-May-21, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3192 PMID:40397797	研究论文	该研究探讨了TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨初始治疗反应及后续复发的潜在机制	整合了靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序和单细胞转录组学分析，揭示了白血病与免疫细胞群之间的动态变化	样本量有限，且为单中心研究	阐明TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨治疗反应及复发的分子机制	骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓系白血病(AML)患者	血液肿瘤学	骨髓增生异常综合征/急性髓系白血病	靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序、单细胞转录组学	NA	基因组数据、转录组数据	II期临床试验中的系列患者样本
27	2025-05-23	Exploring the untapped potential of single-cell and spatial omics in plant biology 2025-May-21, The New phytologist DOI:10.1111/nph.70220 PMID:40398874	综述	本文探讨了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的未开发潜力及其当前应用	强调了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的创新应用，包括多组学、谱系追踪、分子记录和高通量遗传与化学扰动表型分析等新兴技术	植物特有的技术挑战和资源限制，如细胞壁复杂性和抗体资源有限，以及需要更完整的参考图谱和计算工具	探索单细胞和空间组学技术在植物生物学中的应用潜力，推动植物科学的发展	植物细胞和组织	植物生物学	NA	单细胞转录组分析、染色质可及性分析、空间转录组学、多组学、谱系追踪、分子记录、高通量遗传与化学扰动表型分析	NA	分子和细胞数据	多个模型植物物种的综合细胞图谱
28	2025-05-23	Identification of cell specific biomarkers for intellectual disability via single cell RNA sequencing and transcriptomic bioinformatics approaches 2025-May-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-85162-4 PMID:40399537	研究论文	通过单细胞RNA测序和转录组生物信息学方法，识别与智力障碍相关的T细胞特异性生物标志物	利用单细胞RNA测序技术结合转录组数据分析，首次鉴定出与智力障碍相关的T细胞特异性生物标志物，并发现多个关键转录因子和microRNAs	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证	寻找可用于智力障碍诊断和评估的T细胞相关生物标志物	智力障碍患者的T细胞	生物信息学	智力障碍	scRNA-seq, 转录组分析	NA	RNA测序数据	NA
29	2025-05-23	Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke 2025-May-21, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-025-01523-6 PMID:40399534	研究论文	研究发现PPM1D基因的功能获得性突变可以减轻缺血性脑损伤，并验证了其药物稳定剂T2755作为缺血性中风的有前景疗法	首次发现PPM1D基因的功能获得性突变与缺血性中风患者的临床表型改善相关，并揭示了PPM1D通过PPARα途径保护内皮细胞功能的机制	研究中仅发现8例携带PPM1D突变的患者，样本量较小	探索缺血性中风的遗传基础及潜在治疗靶点	10,241名缺血性中风患者和Ppm1d缺陷小鼠	遗传学	缺血性中风	全基因组测序、空间转录组学、蛋白质组学分析	Ppm1d缺陷小鼠模型	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	10,241名缺血性中风患者（其中8例携带PPM1D突变）和Ppm1d缺陷小鼠
30	2025-05-23	Inflammatory metabolite 7α,25-OHC promotes TIMP1 expression in COVID-19 monocytes through synergy effect of SMARCC1/JUND/H3K27ac 2025-May-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-025-05721-w PMID:40399563	研究论文	本研究揭示了炎症代谢物7α,25-OHC通过SMARCC1/JUND/H3K27ac的协同作用促进COVID-19单核细胞中TIMP1表达的机制	首次发现7α,25-OHC通过增强SMARCC1-JUND相互作用来共同调控TIMP1表达，并揭示了SMARCC1和JUND在COVID-19炎症中的关键作用	研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，需要进一步的体内实验验证	探索COVID-19患者单核细胞中炎症反应的分子机制	COVID-19患者的单核细胞	分子生物学	COVID-19	单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、Co-IP、ChIP-qPCR	NA	单细胞测序数据	COVID-19患者的单核细胞样本
31	2025-05-23	A single-cell spatial chart of the airway wall reveals proinflammatory cellular ecosystems and their interactions in health and asthma 2025-May-21, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-025-02161-3 PMID:40399607	研究论文	应用单细胞空间转录组学揭示健康和哮喘状态下气道壁的细胞生态系统及其相互作用	首次绘制了气道壁的单细胞空间图谱，揭示了健康和哮喘中促炎性细胞生态系统的空间分布及其相互作用	未提及样本量是否足够大以覆盖所有哮喘亚型	揭示气道壁在健康和哮喘状态下的细胞空间分布及其相互作用机制	健康和哮喘患者的气道壁细胞	单细胞组学	哮喘	单细胞空间转录组学	NA	单细胞转录组数据	NA
32	2025-05-23	Multigenerational cell tracking of DNA replication and heritable DNA damage 2025-May-21, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08986-0 PMID:40399682	research paper	该研究通过多代单细胞追踪技术，结合内源性标记蛋白和定制计算工具，探讨了致癌扰动如何诱导姐妹细胞不对称和表型异质性	使用双CRISPR基因组编辑同时追踪DNA复制模式和可遗传的内源性DNA损伤，结合单细胞转录组学揭示了致癌事件如何触发多倍体化的多种途径	研究仅追踪了最多四代的细胞谱系树，可能无法完全反映长期细胞异质性的发展过程	解析细胞异质性的来源及其在多代细胞中的传递机制	异步生长的细胞及其多代谱系	基因组学	癌症	双CRISPR基因组编辑、单细胞转录组学、迭代染色	NA	基因组数据、转录组数据	异步生长的细胞谱系树（最多四代）
33	2025-05-23	A multi-kingdom genetic barcoding system for precise clone isolation 2025-May-21, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-025-02649-1 PMID:40399693	research paper	介绍了一种名为CloneSelect的多界遗传条形码系统，用于从复杂细胞群中精确分离目标克隆	开发了一种通过CRISPR碱基编辑触发目标克隆表达报告基因的新方法，实现了对特定表型或基因型克隆的精确分离	未提及具体的技术限制或应用范围限制	开发一种能够从复杂细胞群中精确分离目标克隆的技术	人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞	基因编辑技术	NA	CRISPR base editing, single-cell RNA sequencing	NA	基因序列数据	多种细胞类型（人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞）
34	2025-05-23	Unveiling the hidden dance: SPP1 + macrophages identified in ulcerative colitis reveal crosstalk with CHI3L1 + fibroblasts 2025-May-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06565-5 PMID:40399882	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了溃疡性结肠炎中SPP1+巨噬细胞和CHI3L1+成纤维细胞的关键作用及其在疾病进展中的互作机制	首次鉴定出SPP1+巨噬细胞和CHI3L1+成纤维细胞作为溃疡性结肠炎的关键致病因素，并揭示其在炎症部位富集与疾病严重程度的相关性	研究样本量有限，且主要依赖生物信息学分析，需要更多实验验证	探索巨噬细胞和成纤维细胞在溃疡性结肠炎发病机制中的具体作用及其互作关系	溃疡性结肠炎患者的巨噬细胞和成纤维细胞	digital pathology	ulcerative colitis	scRNA-seq, bulk RNA-seq, spatial transcriptomics, flow cytometry, mIHC	NA	RNA-seq数据、空间转录组数据、流式细胞术数据、多重免疫组化数据	UC患者外周血和结肠活检样本（具体数量未明确说明）
35	2025-05-23	RNAcare: integrating clinical data with transcriptomic evidence using rheumatoid arthritis as a case study 2025-May-21, BMC medical genomics IF:2.1Q3 DOI:10.1186/s12920-025-02162-z PMID:40399884	研究论文	介绍了一个名为RNAcare的计算平台，旨在整合临床数据和转录组学数据，以类风湿性关节炎为例进行研究	RNAcare平台提供了一个交互式和可重复的解决方案，专门设计用于在临床背景下分析患者样本的转录组学数据，并能够整合基因表达数据与临床特征	平台目前可能仅支持特定类型的转录组学数据，且需要用户具备一定的转录组学基础知识	开发一个能够整合临床数据和转录组学数据的计算平台，以帮助研究人员分析基因表达与临床症状之间的关系	类风湿性关节炎患者及其转录组学和临床数据	生物信息学	类风湿性关节炎	RNA-Seq	机器学习	基因表达数据和临床数据	NA
36	2025-05-23	Long noncoding RNAs in familial hypercholesterolemia: biomarkers, therapeutics, and AI in precision medicine 2025-May-21, Lipids in health and disease IF:3.9Q2 DOI:10.1186/s12944-025-02605-7 PMID:40399983	综述	本文综述了长链非编码RNA（lncRNA）在家族性高胆固醇血症（FH）中的机制作用及其作为非侵入性生物标志物和治疗靶点的潜力	探讨了lncRNA作为FH的新型生物标志物和治疗靶点，以及AI驱动的lncRNA发现和单细胞转录组学在精准医疗中的应用	生物标志物验证、RNA递送效率和监管批准等挑战仍需解决	研究lncRNA在FH发病机制中的作用及其在精准医疗中的应用	家族性高胆固醇血症（FH）患者	精准医疗	心血管疾病	单细胞转录组学、RNA测序	NA	转录组数据	NA
37	2025-05-23	Targeting CD74 in microglia to modulate experimental cerebral ischemia and reperfusion injury: insights from Single-Cell and bulk transcriptomics 2025-May-21, Molecular brain IF:3.3Q2 DOI:10.1186/s13041-025-01197-8 PMID:40400029	研究论文	本研究探讨了CD74在微胶质细胞中的作用及其在实验性脑缺血再灌注损伤中的调节机制	首次发现CD74在微胶质细胞中的上调与神经炎症相关，并通过基因敲除实验验证了其作为治疗靶点的潜力	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探索CD74在缺血性脑卒中中的作用及其作为治疗靶点的可能性	微胶质细胞和脑缺血再灌注损伤	神经科学	脑卒中	单细胞RNA测序和批量RNA测序	CX3CR1Cre/ERT2小鼠模型	RNA测序数据	未明确说明具体样本数量，但使用了小鼠模型进行研究
38	2025-05-23	Controlling Human Stem Cell-Derived Islet Composition Using Magnetic Sorting 2025-May-21, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.29030 PMID:40400171	research paper	该研究开发了一种通过磁激活细胞分选技术富集干细胞来源胰岛中功能性β细胞的方法，以提高其治疗1型糖尿病的潜力	首次使用CD49a标记的磁激活细胞分选技术控制干细胞来源胰岛的细胞组成，显著提高了β细胞比例和功能	研究仅在小鼠模型中进行体内验证，尚未进行人体临床试验	改善干细胞来源胰岛的细胞组成和功能，用于1型糖尿病细胞替代治疗	人类多能干细胞来源的胰岛样细胞团	干细胞治疗	1型糖尿病	磁激活细胞分选技术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据、免疫染色图像	人类多能干细胞来源的胰岛样细胞团(包括CD49a富集、CD49a缺失和未分选三组)
39	2025-05-23	TLR7 responses in glomerular macrophages accelerate the progression of glomerulonephritis in NZBWF1 mice 2025-May-21, International immunology IF:4.8Q2 DOI:10.1093/intimm/dxaf005 PMID:40401698	研究论文	探讨TLR7在肾小球巨噬细胞中的反应如何加速NZBWF1小鼠肾小球肾炎的进展	揭示了TLR7信号通过促进单核细胞迁移至肾小球及巨噬细胞产生IL-1β等机制加速肾小球肾炎的进展	研究仅基于NZBWF1小鼠模型，未在人类患者中验证	阐明巨噬细胞TLR7反应在肾小球肾炎中的作用机制	NZBWF1小鼠及其肾小球巨噬细胞	免疫学	系统性红斑狼疮/肾小球肾炎	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NZBWF1小鼠模型
40	2025-05-23	Synergistic effects of PA (S184N) and PB2 (E627K) mutations on the increased pathogenicity of H3N2 canine influenza virus infections in mice and dogs 2025-May-20, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.01984-24 PMID:40183583	研究论文	本研究通过在小鼠体内连续传代H3N2犬流感病毒，建立了致死性感染模型，并揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变协同增强病毒对狗和小鼠的致病性	首次揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变在H3N2犬流感病毒中对哺乳动物适应性的协同作用，并通过单细胞RNA测序阐明了其逃避宿主抗病毒反应的机制	研究主要集中在小鼠和狗模型，对人类潜在风险的研究仍需进一步验证	阐明H3N2犬流感病毒适应哺乳动物的分子机制	H3N2犬流感病毒及其在小鼠和狗中的感染模型	病毒学	流感	单细胞RNA测序、病毒连续传代	动物感染模型	基因序列数据、病毒滴度数据	小鼠和狗的肺组织样本