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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-06-02
Peroxisomal DBP deficiency causes male infertility through disruption of lipid homeostasis in Drosophila
2026-Jun-01, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 该论文利用果蝇模型结合单细胞RNA测序分析,研究了过氧化物酶体DBP缺乏导致男性不育的致病机制,发现Mfe2(人类HSD17B4的果蝇同源物)缺失破坏脂质稳态,导致精子发生缺陷 首次利用果蝇DBP缺乏模型结合单细胞RNA测序分析,揭示了Mfe2缺失通过干扰脂质稳态(尤其是磷脂酰肌醇衍生物)导致精子发生障碍的分子机制,并通过补充多不饱和磷脂部分挽救细胞分裂缺陷 未明确说明研究局限性,但可能包括:果蝇模型与人类之间的物种差异、饮食补充部分挽救而非完全恢复表型、未深入探讨其他脂质代谢途径的潜在贡献 阐明过氧化物酶体DBP缺乏导致男性不育的致病机制 果蝇Mfe2突变体的精子发生过程,包括精原细胞、精母细胞及细胞分裂行为 数字病理学 男性不育 单细胞RNA测序、脂质组学分析 果蝇突变模型(Mfe2敲除) 单细胞转录组数据、脂质组学数据 果蝇睾丸组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2026-06-02
CCDC6, a ferroptosis-related gene, modulates stemness features of pancreatic cancer cells in vitro
2026-Jun-01, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据,鉴定铁死亡相关基因CCDC6在胰腺癌中调控干细胞特性的作用 首次将铁死亡相关基因CCDC6与胰腺癌干细胞特性调控联系起来,并构建了基于铁死亡相关基因的预后模型 仅进行了体外实验验证,缺乏体内实验数据支持 鉴定铁死亡相关基因作为胰腺癌预后标志物,构建风险预测模型,并探索其生物学机制 胰腺癌细胞及其干细胞特性 机器学习 胰腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 风险预测模型 转录组数据, 单细胞测序数据 独立数据集用于验证 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
23 2026-06-02
Hybrid untargeted short-read and targeted long-read RNA sequencing facilitates genotype-phenotype associations at single-cell resolution
2026-Jun-01, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出一种结合非靶向短读长和靶向长读长RNA测序的混合策略,以在单细胞分辨率下实现基因型-表型关联分析 首次系统比较短读长全转录组扩增、长读长全转录组扩增和长读长靶向测序,并开发基于Snakemake管道的混合策略,结合两者的优势 长读长全转录组扩增的限制在于低读段覆盖度,限制了单细胞分辨率的基因型-表型分析 在单细胞分辨率下实现基因型-表型关联分析 短读长全转录组扩增、长读长全转录组扩增和长读长靶向测序数据 自然语言处理 不适用 RNA测序 不适用 RNA序列数据 不适用 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
24 2026-06-02
Single-Cell Annotation and Localization via Integrating Spatial Transcriptomics Maps the Mouse Ocular Atlas and RAO Dynamics
2026-Jun-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过整合空间转录组学技术开发ASCAL流程,构建小鼠全眼单细胞空间图谱并揭示视网膜动脉闭塞的细胞时空动态变化 提出了ASCAL流程,结合单核分辨率SeekSpace和均匀覆盖Stereo-seq两种空间转录组技术,实现大规模单细胞RNA测序数据的自动注释和定位,无需大量空间切片即可构建全眼单细胞空间图谱 标题和摘要未提及具体局限性 开发单细胞注释与定位方法并绘制小鼠眼部细胞图谱,解析视网膜动脉闭塞的病理机制 小鼠全眼组织及视网膜动脉闭塞模型 单细胞组学与空间转录组学 视网膜动脉闭塞 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光染色、RNAscope分析 NA 空间转录组数据、单细胞转录组数据 小鼠全眼组织样本(具体数量未提及)及视网膜动脉闭塞模型样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 SeekSpace、Stereo-seq 单核分辨率SeekSpace用于细胞注释参考,均匀覆盖Stereo-seq用于注释细胞定位
25 2026-06-02
Beta-Glucan modulates monocyte plasticity and differentiation capacity to mitigate DSS-induced colitis
2026-Jun-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 Beta-葡聚糖通过训练免疫重编程单核细胞可塑性和分化能力,减轻DSS诱导的结肠炎 首次揭示β-葡聚糖诱导的训练免疫通过重编程骨髓造血祖细胞和外周单核细胞,调节单核细胞可塑性,并证明这种保护效应可通过过继转移传递,为IBD治疗提供新策略 未明确说明,但可能包括:研究主要在动物模型中进行,尚未在人体中验证;训练免疫的长期安全性及潜在副作用未深入探讨 探究训练免疫在炎症性肠病(IBD)发病机制中的作用及其治疗潜力 小鼠骨髓造血祖细胞、外周单核细胞、结肠上皮细胞及肠道菌群 机器学习 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型,具体样本数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
26 2026-06-02
The role of MXRA7 in bone marrow senescence involves macrophage polarization and microenvironment remodeling
2026-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
研究论文 研究MXRA7在骨髓衰老中的作用,涉及巨噬细胞极化和微环境重塑 首次揭示MXRA7通过调控巨噬细胞极化和微环境信号通路影响骨髓衰老 未在人类样本中验证,且机制仅基于小鼠模型,可能不直接适用于人类 探究MXRA7在骨髓衰老中的作用机制 年轻和老年野生型及MXRA7基因敲除小鼠的骨髓细胞 单细胞转录组学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 2月龄和2年龄小鼠的骨髓细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
27 2026-06-02
Oncogenic PIK3CA mutations shape an immunoregulatory microenvironment in mosaic overgrowth disorders
2026-Jun, PNAS nexus IF:2.2Q1
研究论文 该研究表明致癌性PIK3CA突变通过代谢重编程和免疫微环境重塑驱动过度生长疾病中的组织过度生长和免疫抑制 首次揭示PIK3CA突变在非肿瘤性过度生长疾病中通过Warburg样效应和TREM2+巨噬细胞浸润重塑免疫微环境,与肿瘤微环境相似 过度生长障碍的罕见性限制了人类样本的可及性;结论主要基于小鼠模型,人类验证样本量可能有限 探究PIK3CA突变在PIK3CA相关过度生长谱系障碍中如何塑造组织微环境 PIK3CA相关过度生长谱系障碍患者和小鼠模型 数字病理学 过度生长障碍 单细胞转录组测序、流式细胞术、多重免疫荧光 NA 基因表达数据、细胞群数据、组织图像 小鼠模型(Adipo-Cre驱动的PIK3CA激活突变)及PIK3CA相关过度生长谱系障碍患者组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
28 2026-06-02
Organ-Specific Cancer-Associated Fibroblast Subtypes Across the Digestive System Linked to Cancer Hallmarks
2026-Jun-01, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 综合单细胞RNA测序数据定义消化系统器官特异性癌相关成纤维细胞亚型及其与癌症标志的关联 首次整合多个数据集全面定义消化系统腺癌中八种CAF亚型,并揭示其器官特异性分布及与预后的关联 NA 阐明消化系统癌症中CAF的异质性、组织特异性及临床意义 239例消化道腺癌样本及3396例患者的批量转录组数据 生物信息学、计算生物学 消化系统癌症(包括胃肠道腺癌) 单细胞RNA测序、批量转录组测序、空间转录组学 机器学习解卷积模型 基因表达数据 239例单细胞测序样本及3396例批量转录组样本 多个平台 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 多个平台 NA
29 2026-06-02
Identification of Polyamine Metabolism-Related Biomarkers in Psoriasis: A Study Based on Transcriptomics and Single-Cell Sequencing
2026-Jun, Experimental dermatology IF:3.5Q1
研究论文 本研究整合转录组学和单细胞RNA测序技术,鉴定银屑病中多胺代谢相关生物标志物并阐明其机制 首次结合差异表达分析、三种机器学习算法与单细胞RNA测序,系统鉴定银屑病中多胺代谢相关基因作为诊断生物标志物,并通过蛋白质印迹验证及诊断列线图构建 未提及具体局限性 鉴定银屑病中多胺代谢相关生物标志物并揭示其机制 银屑病患者与对照组的皮肤组织样本 生物信息学 银屑病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹 机器学习算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 GSE13355数据集及蛋白质印迹验证样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
30 2026-06-02
GLI1 activation induced by intermittent hypoxia drives cardiac fibroblast activation via enhanced PKM2-mediated glycolysis
2026-Jun-01, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 间歇性缺氧通过GLI1激活和PKM2介导的糖酵解增强驱动心脏成纤维细胞活化 首次揭示GLI1作为间歇性缺氧诱导心脏纤维化的关键转录因子,并阐明其通过直接靶向PKM2增强糖酵解的分子机制 未提及具体局限性 研究间歇性缺氧如何促进心脏成纤维细胞活化及心脏纤维化的分子机制 间歇性缺氧暴露的小鼠心脏组织及心脏成纤维细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、RNA测序、ChIP测序 NA 基因表达数据、染色质免疫沉淀数据 1509名阻塞性睡眠呼吸暂停患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-06-02
Human Fibroblast-Myeloid cell tissue atlas across lung, synovium, skin and heart
2026-Jun-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 通过整合14个公开的单细胞RNA测序数据集,分析了人类肺、滑膜、皮肤和心脏中成纤维细胞和髓系细胞的共性和特异性 跨四个组织(肺、滑膜、皮肤和心脏)系统比较了成纤维细胞和髓系细胞的细胞亚群,发现了共享的致病亚群如SPP1+巨噬细胞和POSTN+成纤维细胞 数据来自多个研究,可能存在批次效应和异质性,且仅基于公共数据集,缺乏更多独立验证 表征不同组织中髓系和间质细胞表型的共性和组织特异性,揭示参与致病组织激活的关键细胞亚型 人类肺、滑膜、皮肤和心脏组织样本 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 14个公开数据集,包含136741个髓系细胞和117102个成纤维细胞,样本数:心脏41例、肺25例、皮肤34例、滑膜48例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-06-02
CLEC14A correlates with neutrophil infiltration in hepatocellular carcinoma and mediates neutrophil recruitment across liver endothelial cells
2026-Jun-01, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究揭示CLEC14A与肝细胞癌中中性粒细胞浸润相关,并通过肝内皮细胞介导中性粒细胞的募集 首次发现CLEC14A在肝细胞癌血管和急性肝损伤血管中高表达,并证实其通过调节中性粒细胞与肝内皮的牢固粘附来促进中性粒细胞募集,且该作用不依赖于其已知配体MMRN2 研究主要基于细胞实验和小鼠模型,尚需在更大规模临床样本中验证CLEC14A作为治疗靶点的有效性 阐明CLEC14A在肝细胞癌中调控中性粒细胞募集的机制,探索其作为免疫治疗新靶点的潜力 肝细胞癌患者肿瘤组织、人肝内皮细胞、小鼠肝缺血再灌注损伤模型 机器学习 肝细胞癌 空间转录组学、siRNA敲低、抗体阻断、流式细胞术、免疫组化 NA 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像 公共数据集和手术切除的肝细胞癌组织样本(具体数量未明确) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于分析CLEC14A表达肿瘤的基因表达
33 2026-06-02
Exploring the potential targets and mechanisms of artemisinin in the treatment of diabetic kidney disease using network pharmacology and molecular docking
2026-Jun-01, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 该研究通过网络药理学和分子对接技术,探讨青蒿素治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在靶点和作用机制 首次将网络药理学、转录组数据、三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、RF)及单细胞测序数据相结合,系统筛选和验证青蒿素治疗DKD的关键靶点FLT1 仅使用人肾小球内皮细胞(HRGECs)进行体外实验验证,缺乏体内动物模型验证;且未进行FLT1下游信号通路的深入探索 探究青蒿素对糖尿病肾病的潜在治疗作用及其分子机制 青蒿素及其治疗糖尿病肾病的分子靶点 自然语言处理 糖尿病肾病 网络药理学,分子对接,单细胞测序,Western blot,MTT,TUNEL,ELISA LASSO,SVM-RFE,随机森林 基因表达数据,单细胞测序数据 人肾小球内皮细胞(HRGECs)体外高糖损伤模型 不适用 单细胞测序 不适用 不适用
34 2026-06-02
ScSpTITH: a rank-correlation framework for robust quantification of multi-dimensional tumor heterogeneity
2026-Jun-01, Human genetics IF:3.8Q2
研究论文 提出了一个名为ScSpTITH的鲁棒计算框架,用于在单细胞和空间转录组数据中定量肿瘤内和肿瘤间异质性 利用斯皮尔曼等级相关对高度零膨胀的单细胞RNA测序数据具有固有权重,能抵抗技术噪声、非正态性和高丢失率 摘要未明确提及局限性 开发一种鲁棒的计算方法,以克服单细胞RNA测序数据中丢失伪影的影响,进而准确量化多维肿瘤异质性 来自多种癌症和发育数据集的单细胞RNA测序和空间转录组数据 机器学习 癌症 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
35 2026-06-02
Integrative multi-omics analysis identifies a circadian rhythm-associated gene signature for prognosis and therapeutic stratification in lung adenocarcinoma
2026-Jun-01, Discover oncology IF:2.8Q2
research paper 通过整合多组学数据,构建了一个基于生物节律相关基因的预后特征,用于肺腺癌的风险分层和个体化治疗策略 开发了10基因昼夜节律相关基因预后特征,结合十种机器学习算法和单细胞RNA测序,揭示了昼夜节律紊乱在肺腺癌肿瘤免疫微环境和治疗响应中的新作用 研究基于计算机模拟预测,缺乏前瞻性验证;单细胞分析可能受限于数据分辨率 建立稳健的昼夜节律相关基因特征,以改善肺腺癌的风险分层并指导个体化治疗 超过900名肺腺癌患者的多组学数据,包括TCGA和GEO数据库资源 machine learning lung cancer 多组学分析,单细胞RNA测序,机器学习 CNN, LSTM, GAN 多组学数据,单细胞RNA测序数据 超过900名肺腺癌患者 NA single-cell RNA-seq NA NA
36 2026-06-02
A risk stratification framework based on ammonia-induced cell death signatures for prognostic assessment and therapeutic insights in colorectal cancer
2026-Jun-01, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 基于氨诱导细胞死亡信号构建结直肠癌预后风险评估框架,并探讨其治疗意义 首次将氨相关基因特征用于结直肠癌的预后分层,通过多组学分析和人工智能虚拟筛选发现CLK2作为潜在药物靶点,揭示了氨在肿瘤微环境中的代谢应激调控作用 研究仅基于TCGA-COAD数据集进行模型构建,外部验证局限于单细胞RNA-seq数据,缺乏大规模独立临床队列验证 探究氨相关基因在结直肠癌中的预后价值及治疗潜力,建立风险分层模型 结直肠癌患者的转录组和临床数据,以及肿瘤微环境中的细胞亚群 数字病理学 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR Cox回归, LASSO 转录组数据, 单细胞转录组数据 TCGA-COAD数据集(样本数未明确),GSE132465单细胞数据集 NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
37 2026-06-02
Hyper-activated low-density neutrophil-derived NGAL predicts fatal SFTS: a multi-cohort and single-cell study
2026-Jun-01, Infection IF:5.4Q1
研究论文 该研究通过多队列临床数据和单细胞RNA测序,揭示血清NGAL作为致死性SFTS的早期预测因子,并发现其来源于高度活化的低密度中性粒细胞 首次在单细胞水平阐明SFTS患者中血清NGAL主要来源于低密度中性粒细胞,而非传统观点中的其他免疫细胞,并揭示高表达NGAL的LDNs具有高炎症和干扰素刺激的转录特征 研究为回顾性多中心设计,样本量有限(215例),且单细胞RNA测序数据来自公共数据库,可能无法完全代表不同人群或环境下的细胞状态 评估血清NGAL对SFTS患者死亡风险的预测能力,并在单细胞水平揭示其细胞来源 215例SFTS患者(来自三家中国医院)及SFTS患者和健康对照的外周血单核细胞单细胞RNA测序数据 数字病理学 发热伴血小板减少综合征(SFTS) RNA测序,单细胞RNA测序 NA 临床数据,单细胞RNA测序数据 215例SFTS患者(训练队列152例,外部验证队列63例)及公开单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-06-02
Unveiling the Impact of Copper Metabolism on Epithelial-Mesenchymal Transition of Triple-Negative Breast Cancer: Identification of Therapeutic Targets
2026-Jun-01, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 本研究探讨铜代谢对三阴性乳腺癌上皮-间充质转化的影响,并识别潜在治疗靶点 首次系统揭示铜代谢相关基因与三阴性乳腺癌上皮-间充质转化及转移的联系,并构建具有高诊断和预后价值的基因模型 转移特异性分类模型因标记转移样本数量有限而性能下降,且临床注释不完整 探索铜代谢在三阴性乳腺癌进展中的作用,发现新的诊断和预后生物标志物 三阴性乳腺癌患者肿瘤及邻近正常组织样本的转录组数据 机器学习 乳腺癌 RNA-seq Cox比例风险模型,随机森林,XGBoost,AdaBoost,梯度提升机 基因表达数据 229个三阴性乳腺癌及邻近正常样本 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
39 2026-06-02
EXPRESS: Metabolic reprogramming of oligodendrocyte lineage cells in ischemic stroke: insights from literature review and single-cell transcriptomic re-analyses
2026-May-31, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism IF:4.9Q1
研究论文 通过文献综述和单细胞转录组再分析,揭示缺血性脑卒中后少突胶质细胞谱系细胞的代谢重编程 整合文献综述与三个独立小鼠卒中模型的单细胞RNA测序数据的再分析,首次揭示少突胶质细胞前体细胞和成熟少突胶质细胞中分期特异性的代谢变化,如氧化磷酸化、肌醇磷酸代谢、鞘脂代谢及胆固醇生物合成 仅基于小鼠卒中模型的单细胞转录组数据再分析,缺乏人体研究验证,且系统性的代谢变化全景尚未完全阐明 系统了解经典代谢通路与少突胶质细胞谱系在缺血性脑卒中中的相互作用,并探索潜在治疗靶点 少突胶质细胞谱系细胞,包括少突胶质细胞前体细胞和成熟少突胶质细胞 数字病理学 缺血性脑卒中 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 三个独立的小鼠卒中模型数据集,涵盖超急性期、急性期和慢性恢复期 NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-06-02
Distinct cellular and subcellular distributions of the alpha and beta isoforms of Heat Shock Protein 90 in the mouse cerebral cortex
2026-May-30, Gene expression patterns : GEP IF:1.0Q4
研究论文 研究揭示热休克蛋白90的α和β亚型在小鼠大脑皮层中具有不同的细胞和亚细胞分布 首次通过免疫荧光染色、荧光原位杂交和单细胞RNA测序数据,详细展示了HSP90α和HSP90β在成年小鼠大脑皮层中差异性的细胞类型和亚细胞定位,提示它们在特定细胞类型中具有独特功能 NA 探讨HSP90α和HSP90β在小鼠大脑皮层中的分布差异及其潜在的功能专一性 小鼠大脑皮层中的细胞(包括第五层兴奋性神经元、各层抑制性神经元、少突胶质细胞和第六层神经元)以及神经突远端区域 机器学习 NA 免疫荧光染色,荧光原位杂交,单细胞RNA测序 NA 图像,文本 小鼠大脑皮层样本(具体数量未明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台(具体配置未详述)
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