单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-05-13 |
Stromal heterogeneity in the adult lung delineated by single-cell genomics
2025-May-12, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00285.2025
PMID:40353369
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review | 本文综述了通过单细胞RNA测序研究揭示的肺基质细胞异质性及其功能特征和位置 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了肺基质细胞的异质性及其在解剖学上的独特定位 | NA | 探讨肺基质细胞的异质性及其在炎症、修复和纤维化中的作用 | 肺基质细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 22 | 2025-05-13 |
Rescue of naïve porcine circovirus type 3 and its pathogenesis in CD pigs
2025-May-12, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00341-25
PMID:40353661
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研究论文 | 本研究成功拯救了原始猪圆环病毒3型（PCV3）并研究了其在剖腹产猪（CD猪）中的致病机制 | 首次通过TEM观察PCV3病毒颗粒，并阐明了其在CD猪中的免疫抑制机制 | 由于病毒分离失败，PCV3在猪中的致病机制尚未准确阐明 | 研究PCV3病毒的致病机制及其对免疫系统的影响 | 原始猪圆环病毒3型（PCV3）和剖腹产猪（CD猪） | 病毒学 | 猪圆环病毒感染 | 免疫荧光检测（IFA）、Western blotting、透射电子显微镜（TEM）、scRNA-seq | NA | 分子生物学数据、细胞学数据、组织病理学数据 | 剖腹产猪（CD猪） |
| 23 | 2025-05-13 |
Construction of a novel CD8T cell-related index for predicting clinical outcomes and immune landscape in ovarian cancer by combined single-cell and RNA-sequencing analysis
2025-May-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02582-4
PMID:40354001
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研究论文 | 通过结合单细胞和RNA测序分析，构建了一个新的CD8T细胞相关指数（CCAI），用于预测卵巢癌的临床结果和免疫景观 | 首次构建了一个基于CD8T细胞相关生物标志物的指数（CCAI），用于预测卵巢癌患者的预后和免疫治疗效果 | 研究依赖于公开数据集，可能受到样本量和数据质量的限制 | 探索CD8T细胞相关生物标志物在预测卵巢癌预后和免疫治疗效果中的潜在作用 | 卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | TCGA-OV队列、GSE26712和GSE26193队列 |
| 24 | 2025-05-13 |
Multi-omics identify ribosome related causal genes methylation, splicing, and expression in prostate cancer
2025-May-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02584-2
PMID:40354008
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研究论文 | 该研究通过多组学方法探讨了核糖体相关基因在前列腺癌中的作用 | 整合了基因组学和转录组学数据，利用SMR和共定位分析以及单细胞分析，揭示了核糖体相关基因NSUN4和MPHOSPH6与前列腺癌风险的因果关系 | 研究结果需要进一步的功能实验验证，样本来源可能限制了结果的普遍性 | 探究核糖体相关基因在前列腺癌发生发展中的作用机制 | 前列腺癌患者的多组学数据 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 多组学整合分析、SMR分析、共定位分析、单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 来自The Prostate Cancer Association Group to Investigate Cancer Associated Alterations in the Genome和FinnGen研究的总结水平数据 |
| 25 | 2025-05-13 |
Gas Bubbles from Biodegradable Magnesium Implants Convey Mechanical Cues and Promote Immune Cell Stimulation
2025-May-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503123
PMID:40349156
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研究论文 | 研究可降解镁植入物产生的气泡对周围组织和细胞行为的影响 | 揭示了气泡通过机械信号和炎症途径影响组织愈合的机制 | 研究仅在大鼠模型中进行，未涉及人类患者 | 探究镁植入物降解产生的气泡对周围组织的生物学影响 | 大鼠的软组织和免疫细胞 | 生物医学工程 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 大鼠模型 |
| 26 | 2025-05-13 |
Presbycusis: Pathology, Signal Pathways, and Therapeutic Strategy
2025-May-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410413
PMID:40349177
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综述 | 本文综述了老年性耳聋的病理学、信号通路及治疗策略，特别关注血管纹在老年性耳聋中的关键作用 | 重点探讨了血管纹在老年性耳聋中的作用，并介绍了单细胞转录组学在该领域的应用 | NA | 增强对老年性耳聋中血管纹作用的理解，为个性化治疗和预防策略提供依据 | 老年性耳聋（ARHL）及其相关病理机制 | NA | 老年性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 27 | 2025-05-13 |
Microglial MS4A4A Protects against Epileptic Seizures in Alzheimer's Disease
2025-May-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417733
PMID:40349168
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病(AD)中与癫痫发作相关的基因MS4A4A的作用及其机制 | 首次发现MS4A4A基因缺失会加剧AD模型小鼠的癫痫发作，并阐明其通过调节小胶质细胞吞噬功能发挥保护作用的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化仍需进一步验证 | 探索AD相关基因MS4A4A在AD伴发癫痫中的保护作用机制 | 淀粉样β蛋白驱动的AD小鼠模型和癫痫患者脑组织样本 | 神经科学 | 阿尔茨海默病/癫痫 | 单细胞测序/LNP递送技术 | AD小鼠模型 | 基因表达数据/细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及AD小鼠模型和人类癫痫患者脑组织 |
| 28 | 2025-05-13 |
Spatial transcriptomics highlights B cells as key contributors to a complete and durable response to chemo-immunotherapy in a patient with resectable NSCLC
2025-May-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011563
PMID:40350207
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research paper | 该研究通过空间转录组学、单细胞RNA测序和血清蛋白质组学分析，揭示B淋巴细胞在可切除NSCLC患者化疗免疫治疗中的关键作用 | 首次利用多组学方法揭示B淋巴细胞在肿瘤微环境中的关键作用及其在治疗反应中的贡献 | 研究仅基于单个病例，结果需要更大样本量验证 | 探索可切除NSCLC患者化疗免疫治疗反应的分子机制 | ALK/EGFR野生型可切除NSCLC患者 | digital pathology | lung cancer | spatial transcriptomics, single-cell RNA-sequencing, serum proteomic profiling | NA | transcriptomic data, proteomic data | 1名患者(原发肺肿瘤和脑转移灶组织) |
| 29 | 2025-05-13 |
Identification of MACF1 as a causative gene of generalised epilepsy
2025-May-11, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2025-110699
PMID:40350249
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研究论文 | 该研究通过全外显子测序发现MACF1基因是全身性癫痫的潜在致病基因 | 首次揭示了MACF1基因变异与全身性癫痫的关联，并阐明了不同变异类型的基因型-表型关联 | 样本量较小（仅10例患者），需要更大规模的验证研究 | 探索MACF1基因在癫痫和神经发育中的作用 | 来自中国癫痫基因1.0项目的全身性癫痫患者队列 | 遗传学 | 癫痫 | 全外显子测序、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 10例无关患者 |
| 30 | 2025-05-13 |
Integrated bioinformatic analysis identifies GADD45B as an immune-related prognostic biomarker in skin cutaneous melanoma
2025-May-11, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00437-0
PMID:40350499
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research paper | 该研究通过整合多个数据库和实验方法，全面探讨了GADD45B在皮肤黑色素瘤(SKCM)中的功能及其作为免疫相关预后生物标志物的潜力 | 首次全面研究GADD45B在SKCM中的功能，发现其作为新型免疫检查点的潜力，并证实其通过抑制PI3K/Akt信号通路抑制肿瘤生长 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，临床样本验证有限 | 探究GADD45B在皮肤黑色素瘤中的功能及其临床意义 | 皮肤黑色素瘤(SKCM) | digital pathology | skin cutaneous melanoma | RNA-seq, 单细胞测序, 基因集变异分析(GSVA) | NA | 基因表达数据, 临床数据 | 26个SKCM相关数据集, 30个人类SKCM细胞系, 29个SKCM体外表型特征分析, 异种移植小鼠模型 |
| 31 | 2025-05-13 |
CIEC: Cross-tissue Immune Cell Type Enrichment and Expression Map Visualization for Cancer
2025-May-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae067
PMID:39363510
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research paper | 介绍了一个名为CIEC的基于网络的应用程序，用于跨组织免疫细胞类型或状态的富集分析和基因表达图谱可视化 | 首个整合数据库和富集分析的网络应用程序，用于估计跨组织免疫细胞类型或状态 | 样本量相对有限，仅包含323名癌症患者的480个样本 | 深入理解肿瘤免疫系统中免疫细胞的跨组织特性和功能 | 癌症患者的免疫细胞 | digital pathology | cancer | single-cell transcriptome sequencing | KOBAS algorithm | gene expression data | 480 samples from 323 cancer patients |
| 32 | 2025-05-13 |
Anti-Müllerian hormone signalling sustains circadian homeostasis in zebrafish
2025-May-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59528-1
PMID:40348785
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研究论文 | 该研究揭示了抗穆勒氏管激素（Amh）信号在维持斑马鱼昼夜节律稳态中的重要作用 | 首次发现Amh信号通过Bmpr2a/Bmpr1bb受体激活Smad1/5/9磷酸化途径来调控昼夜节律基因表达 | 研究仅针对斑马鱼模型，尚未在高等生物中验证 | 探索维持昼夜节律稳态的关键信号通路 | 斑马鱼的分子钟系统及其行为/激素节律 | 生物节律研究 | NA | 基因敲除、单细胞转录组分析 | 斑马鱼基因敲除模型 | 基因表达数据、行为数据 | NA |
| 33 | 2025-05-13 |
Mapping the molecular signature of ABA-regulated gene expression in germinating barley embryos
2025-May-10, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-025-06654-z
PMID:40348990
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research paper | 本研究通过整合转录组学、代谢组学和空间转录组学技术，揭示了ABA在发芽大麦胚胎中调控基因表达的分子特征 | 首次在植物组织中成功应用Visium空间转录组学技术，实现了对胚胎六个区域基因表达的精确定位 | 空间转录组学技术在植物组织中的应用仍存在技术挑战 | 阐明ABA调控种子萌发的分子机制 | ABA处理的大麦(Hordeum vulgare)发芽胚胎 | 植物分子生物学 | NA | Visium Spatial Transcriptomics (10× Genomics), RNA-seq, 代谢组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间基因表达数据 | NA |
| 34 | 2025-05-13 |
Thioredoxin: a key factor in cold tumor formation and a promising biomarker for immunotherapy resistance in NSCLC
2025-May-10, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03259-w
PMID:40349025
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研究论文 | 该研究探讨了硫氧还蛋白（TXN）在非小细胞肺癌（NSCLC）中作为免疫治疗抵抗的关键因子及其在冷肿瘤形成中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了TXN在NSCLC患者中的上调表达及其与冷肿瘤特征的关联，并发现TXN敲低可增强T细胞介导的细胞毒性 | 研究主要基于体外细胞实验和有限的临床样本，未涉及大规模临床试验验证 | 探究TXN在NSCLC免疫逃逸中的作用及其作为免疫治疗抵抗生物标志物的潜力 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者及A549和SK-MES-1细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NSCLC患者样本及A549和SK-MES-1细胞系 |
| 35 | 2025-05-13 |
Diversity and functional specialization of oyster immune cells uncovered by integrative single-cell level investigations
2025-May-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.102622
PMID:40343849
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研究论文 | 通过整合单细胞水平的研究揭示了牡蛎免疫细胞的多样性和功能特化 | 首次广泛表征了牡蛎的多种血细胞，识别出至少七种功能不同的细胞类型和三种造血谱系 | 需要更深入的软体动物和非模式无脊椎动物细胞免疫学研究 | 研究牡蛎免疫细胞的多样性和功能特化 | 太平洋牡蛎的血细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序、定量细胞学、细胞分选、功能测定和伪时间分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 36 | 2025-05-13 |
Microvascular immunity is organ-specific and remodeled after kidney injury in mice
2025-May-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59609-1
PMID:40346040
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研究论文 | 研究小鼠急性肾损伤前后微血管免疫细胞的表型变化及其在肾脏、肝脏和肺中的独特特征 | 揭示了微血管作为免疫细胞活动的独特位点，并发现了急性肾损伤后肾脏微血管界面的持续重塑 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探究急性肾损伤后微血管免疫细胞的动态变化及其在疾病进展中的作用 | 小鼠的肾脏、肝脏和肺的微血管免疫细胞 | 免疫学 | 急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 |
| 37 | 2025-05-13 |
Identification of programmed cell death-related genes and construction of a prognostic model in oral squamous cell carcinoma using single-cell and transcriptome analysis
2025-May-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02520-4
PMID:40346375
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研究论文 | 通过单细胞和转录组分析，识别程序性细胞死亡相关基因并构建口腔鳞状细胞癌的预后模型 | 基于程序性细胞死亡相关基因构建了一个新的五基因预后特征，并在单细胞水平上验证了这些基因的表达模式 | 研究样本量有限，且仅基于公开数据库的回顾性数据 | 探索程序性细胞死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌预后中的作用 | 口腔鳞状细胞癌患者和健康对照的肿瘤组织和单细胞数据 | 数字病理 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, Cox回归 | 转录组数据, 单细胞数据 | 341例OSCC肿瘤组织, 31例健康样本, 6例OSCC单细胞样本, 76例验证样本 |
| 38 | 2025-05-13 |
Multi-omics integration reveals Vha68-3 as a testicular aging-specific factor that coordinates spermatid elongation through mitochondrial metabolic homeostasis
2025-May-09, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00737-3
PMID:40346547
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研究论文 | 本研究通过多组学整合揭示了Vha68-3作为睾丸衰老特异性因子，通过线粒体代谢稳态协调精子细胞伸长 | 首次发现Vha68-3在睾丸衰老过程中对精子细胞伸长和线粒体代谢稳态的关键调控作用，并提出了通过饮食补充相关化合物缓解睾丸衰老的潜在治疗策略 | 研究主要在果蝇模型中进行，尚未在高等哺乳动物中验证 | 探究睾丸衰老过程中线粒体影响精子发生的分子机制 | 果蝇睾丸组织 | 生殖生物学 | 男性不育 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、转录组-代谢组关联分析、液相色谱-串联质谱 | 果蝇基因敲除模型 | 基因表达数据、代谢组数据、蛋白质互作数据 | Vha68-3基因敲除果蝇模型 |
| 39 | 2025-05-13 |
S100A9 as a potential novel target for experimental autoimmune cystitis and interstitial cystitis/bladder pain syndrome
2025-May-09, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00763-5
PMID:40346703
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研究论文 | 本文探讨了S100A9作为间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征（IC/BPS）和实验性自身免疫性膀胱炎（EAC）的新型治疗靶点的潜力 | 发现S100A9通过TLR4/NF-κB和TLR4/p38信号通路促进炎症反应和组织损伤，并验证了抑制S100A9可显著减轻病理过程 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行大规模验证 | 阐明IC/BPS的关键靶点和潜在机制，寻找有效的干预目标 | IC/BPS患者和EAC小鼠模型 | 分子生物学 | 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征 | 单细胞RNA测序、蛋白质组测序、分子生物学实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 40 | 2025-05-13 |
Multidimensional bioinformatics analysis reveals the potential carcinogenic role of acrylamide in colorectal cancer
2025-May-09, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118281
PMID:40347726
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研究论文 | 本研究通过多维生物信息学分析揭示了丙烯酰胺在结直肠癌中的潜在致癌作用 | 识别了四个关键的丙烯酰胺相关结直肠癌驱动基因，并揭示了它们通过PI3K-AKT通路和免疫微环境调控的致癌机制 | 需要更多队列和实验模型验证关键靶点 | 阐明丙烯酰胺诱导结直肠癌的分子机制，为早期诊断和预防提供理论基础 | 结直肠癌相关基因和丙烯酰胺靶基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 双向双样本孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO和CTDbase数据库的基因数据 |