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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2025-10-08
Disentangling associations between complex traits and cell types with seismic
2024-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种名为seismic的新框架,用于整合单细胞RNA测序与全基因组关联研究,以揭示复杂性状与细胞类型之间的关联 提出了一种新的特异性评分来表征细胞类型,能够系统、可扩展且可解释地识别疾病-细胞类型关联 NA 揭示复杂性状和疾病的细胞类型特异性生物学过程 28种复杂性状和超过1,000种不同粒度级别的细胞类型表征 生物信息学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 seismic框架 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2025-10-07
scSTD: A Swin Transformer-Based Diffusion Model for Recovering scRNA-Seq Data
2025-Oct, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出一种基于Swin Transformer和扩散模型的单细胞RNA测序数据恢复方法scSTD 首次将Swin Transformer架构与潜在扩散模型相结合用于scRNA-seq数据恢复 未明确说明方法在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件和技术噪声问题 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 Swin Transformer, 扩散模型, 自编码器 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
23 2025-10-07
Human airway epithelial B-cell activating factor is reduced in early life but is virally induced via JAK/STAT
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了人类气道上皮细胞通过JAK/STAT信号通路调控B细胞活化因子产生,影响早期生命阶段气道B细胞发育和抗病毒免疫应答的机制 首次发现婴儿气道上皮细胞BAFF产生减少但可通过病毒刺激激活,并阐明其通过I型和III型干扰素及JAK/STAT信号通路诱导的分子机制 研究主要关注儿科人群,缺乏成人对照;机制研究主要在体外进行,需要更多体内验证 探究人类气道B细胞发育动态及其与气道上皮细胞的相互作用,特别是在早期生命阶段和病毒感染条件下的变化 儿科患者的气道B细胞和气道上皮细胞 免疫学 呼吸道病毒感染 单细胞RNA测序,PCR确认,体外刺激实验 NA 基因表达数据,细胞培养数据 不同儿科年龄组的气道样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
24 2025-10-07
Transcriptomic profiling of vitiligo patients shows polar immune dysregulation in involved and uninvolved skin
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 通过转录组分析揭示白癜风患者皮损和非皮损区域存在极化的免疫失调现象 首次全面揭示白癜风不仅皮损区域存在TH1/干扰素驱动的免疫异常,非皮损区域也表现出明显的TH2和TH17/22相关标志物上调 样本量相对有限(15例白癜风样本和14例健康对照),需要更大规模研究验证 获取白癜风皮损和非皮损区域的整体皮肤转录组特征 白癜风患者的皮损和非皮损皮肤活检样本 转录组学 白癜风 RNA测序, 实时PCR, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据, 基因表达数据 15例白癜风皮损和非皮损样本,14例匹配健康对照 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA NA
25 2025-10-07
Positionally distinct interferon-stimulated dermal immune-acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet syndrome
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了Sweet综合征皮肤中位置不同的干扰素激活成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的作用 首次在Sweet综合征中发现位置不同的干扰素激活成纤维细胞亚群,并阐明其通过I型干扰素识别和中性粒细胞招募参与疾病发病机制 研究使用存档临床样本,样本数量可能有限;功能验证主要在体外细胞培养中进行 定义Sweet综合征患者皮肤的细胞和分子景观 Sweet综合征患者、坏疽性脓皮病患者和健康对照者的皮肤样本 数字病理学 皮肤炎症疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、bulk RNA-seq NA 转录组数据、空间定位数据 临床皮肤样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
26 2025-10-07
FOXP Genes Regulate Purkinje Cell Diversity in Cerebellar Development and Evolution
2024-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了FOXP基因在调控小脑浦肯野细胞多样性中的关键作用 首次在小鼠胚胎小脑中鉴定出11种浦肯野细胞亚型,并开发了新的无监督方法进行三维空间定位 研究主要基于小鼠模型,人类和小鸡样本的比较分析相对有限 探究小脑发育过程中浦肯野细胞多样性的分子调控机制 小鼠、人类和小鸡的小脑浦肯野细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 无监督学习方法 单细胞转录组数据 胚胎小鼠小脑浦肯野细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
27 2025-10-06
Cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2025-Oct-02, Cell IF:45.5Q1
研究论文 提出一种基于细胞类型特异性网络校正的阿尔茨海默病联合疗法 首次将单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录整合,开发细胞类型特异性多靶点药物发现策略 研究基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 开发针对阿尔茨海默病多因素特征的精准联合疗法 阿尔茨海默病小鼠模型(同时具有Aβ和tau沉积) 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞转录组测序 NA 转录组数据、临床记录 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
28 2025-10-06
An inducible model of human post-implantation development derived from primed and naive stem cells
2025-Oct-02, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究通过结合启动态和初始态人多能干细胞开发了可诱导干细胞胚胎模型,模拟人类植入后早期发育过程 首次通过结合启动态hPSC和初始态hPSC来源的转基因诱导胚外细胞,建立了可诱导的干细胞胚胎模型 模型尚不完美,存在一定局限性 研究人类植入后早期发育过程 人类干细胞胚胎模型 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 可诱导干细胞胚胎模型(iSCBEMs) 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
29 2025-10-06
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-Oct, Nature IF:50.5Q1
研究论文 开发了一种多组学单细胞测序方法,用于精确识别CRISPR编辑的疾病等位基因功能效应 结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模式单细胞功能基因组学方法 未明确说明样本规模和技术重复次数 识别疾病相关非编码等位基因的因果变异及其功能效应 人类原代T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因 功能基因组学 自身免疫疾病 CRISPR-Cas编辑, 多组学单细胞测序 NA 基因组DNA, 转录组, 蛋白质表达 NA NA 单细胞多组学 NA NA
30 2025-10-06
Protocol for single-cell spatial transcriptomic profiling of cultured cells and engineered tissues without embedding or sectioning
2025-Sep-19, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文提出了一种无需包埋或切片即可对培养细胞和工程组织进行单细胞空间转录组分析的新方案 开发了适用于标准包埋切片不兼容的2D工程组织和细胞培养物的空间转录组分析新方法 NA 建立适用于特殊样本类型的空间转录组分析技术方案 2D工程组织和细胞培养物 空间转录组学 NA 空间转录组分析 NA 空间转录组数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 Visium HD Visium HD空间技术
31 2025-10-06
Multi-omics analysis reveals the attenuation of the interferon pathway as a driver of chemo-refractory ovarian cancer
2025-Sep-16, Cell reports. Medicine
研究论文 通过多组学分析揭示干扰素通路减弱是卵巢癌化疗耐药的关键驱动因素 首次发现化疗耐药卵巢癌中I型干扰素通路活性降低与缺氧通路增强的分子特征,并证实干扰素活性可独立预测化疗反应 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 探索卵巢高级别浆液性癌化疗耐药的分子机制 DECIDER观察性试验中化疗耐药卵巢癌患者的治疗前活检样本 多组学分析 卵巢癌 单细胞RNA测序,空间蛋白质分析,体外实验 NA 基因组学数据,转录组学数据,蛋白质组学数据 DECIDER临床试验注册患者(NCT04846933) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 NA NA
32 2025-10-06
Appendiceal B lymphocytes contribute to the pathogenesis of experimental colitis through fueling colonic CD4+ T polarization
2025-Sep-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示阑尾B淋巴细胞通过CCL20-CCR6轴迁移至结肠并促进CD4+ T细胞介导的Th1/Th17免疫反应,从而加剧实验性结肠炎 首次阐明阑尾B淋巴细胞通过特定迁移机制加剧结肠炎的具体病理机制,并提出阑尾口炎症可能代表溃疡性结肠炎的特殊亚型 研究主要基于动物模型,人类数据验证仍需进一步扩展 探究阑尾B淋巴细胞在实验性结肠炎发病机制中的作用 小鼠模型和溃疡性结肠炎患者的结肠组织 免疫学 溃疡性结肠炎 单细胞测序,免疫荧光共染色 NA 基因表达数据,组织图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2025-10-06
Single-cell RNA sequencing: enhancing the predictive accuracy of tumor immunotherapy efficacy
2025-Sep-08, Essays in biochemistry IF:5.6Q1
综述 本文综述单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗疗效预测中的应用现状与前景 系统阐述scRNA-seq技术如何提升免疫治疗疗效预测准确性,并探讨生物材料整合带来的新研究方向 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究进行理论分析 探讨单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗领域的应用价值与发展方向 肿瘤微环境中的免疫细胞 生物信息学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
34 2025-10-06
Folliculin Deletion in the Mouse Kidney Results in Cystogenesis of the Loops of Henle via Aberrant TFEB Activation
2025-Sep, The American journal of pathology
研究论文 本研究通过构建肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型,揭示了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的关键作用 首次证明Folliculin基因缺失通过异常激活TFEB导致亨利氏袢囊肿形成,并阐明了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的特异性作用 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 探究Folliculin基因在整个肾单位中的具体功能及其在囊肿形成中的作用机制 肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型 分子生物学 肾脏疾病 单细胞RNA测序,基因敲除技术 基因敲除小鼠模型 基因表达数据,组织形态学数据 基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
35 2025-10-06
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞转录组技术解码HepaRG细胞在化学物质暴露下的应激状态 首次使用TempO-LINC平台系统分析多种化学物质诱导的细胞应激反应,并基于文献来源的基因特征对单个细胞进行应激表型评分 仅使用HepaRG细胞系,未验证其他细胞类型;仅观察24小时暴露效应,缺乏更长时程的动态变化数据 解码细胞应激状态以应用于毒理学研究 HepaRG肝细胞系 单细胞组学 毒理学 单细胞转录组测序 基于广义Jaccard度量的聚类分析 单细胞转录组数据 约40,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq TempO-LINC TempO-LINC单细胞转录组平台
36 2025-10-06
Cellular communication network factor 2 regulates smooth muscle cell transdifferentiation and lipid accumulation in atherosclerosis
2024-12-31, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究揭示了细胞通讯网络因子2在调控平滑肌细胞转分化和动脉粥样硬化脂质积累中的保护作用 首次发现SMC特异性CCN2缺失通过调控内质网应激、内吞作用和脂质积累机制促进动脉粥样硬化发展 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 阐明CCN2在动脉粥样硬化中调控平滑肌细胞可塑性的功能和机制 人类和小鼠的血管平滑肌细胞 细胞生物学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 可诱导小鼠SMC CCN2缺失模型 基因表达数据 人类和小鼠动脉粥样硬化样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
37 2025-10-06
Physical modeling of embryonic transcriptomes identifies collective modes of gene expression
2024-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过统计物理学方法分析海鞘胚胎单细胞测序数据,识别基因表达的集体模式 利用自然变异和统计物理建模技术,首次在完整互连胚胎水平研究发育过程,推断细胞间相互作用网络 研究基于海鞘胚胎数据,结果在其他生物系统中的普适性需要进一步验证 研究胚胎发育过程中基因表达的集体协调机制 早期海鞘胚胎细胞 计算生物学 NA 单细胞测序 统计物理模型 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
38 2025-10-05
Remodeling of senescent macrophages in synovium alleviates trauma- and aging-induced osteoarthritis
2026-Jan, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 本研究开发了一种新型senotherapeutic纳米颗粒pCQ/SOD,通过重塑滑膜衰老巨噬细胞缓解创伤性和衰老性骨关节炎 首次发现滑膜衰老巨噬细胞在骨关节炎中的关键作用,并开发了靶向递送SOD的纳米颗粒治疗策略 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 探索骨关节炎中免疫衰老机制并开发相应治疗策略 骨关节炎滑膜组织中的衰老巨噬细胞 单细胞测序分析 骨关节炎 单细胞测序, RNA-seq, 免疫荧光 NA 基因表达数据, 图像数据 小鼠骨关节炎模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2025-10-05
Short-chain fatty acids from gut microbiota restore Th17/Treg balance in rheumatoid arthritis: Mechanisms and therapeutic potential
2025-Dec, Journal of translational autoimmunity IF:4.7Q2
综述 系统阐述肠道微生物来源的短链脂肪酸通过多重机制恢复类风湿关节炎中Th17/Treg平衡的作用及治疗潜力 首次系统整合多组学方法揭示肠道-关节轴机制,提出微生物组指导的个性化医疗新范式 NA 探讨短链脂肪酸调节Th17/Treg平衡的机制及其在类风湿关节炎治疗中的应用潜力 类风湿关节炎患者及临床前模型 NA 类风湿关节炎 代谢组学、单细胞测序、空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞测序、空间转录组学、代谢组学 NA NA
40 2025-10-05
Loss of Prominin 2 expression inhibits AKT/mTOR signaling to limit glycolysis and drive ferroptosis in breast cancer cells
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
研究论文 本研究揭示了Prominin 2通过AKT/mTOR信号通路促进乳腺癌糖酵解和抑制铁死亡的致癌机制 首次发现PROM2通过与AKT相互作用激活mTOR信号通路,同时调控糖酵解和铁死亡两个关键生物学过程 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需要进一步验证 阐明Prominin 2在乳腺癌中的致癌功能及分子机制 乳腺癌组织和细胞系 癌症生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,Western blot,RNA测序,GSEA,免疫共沉淀 NA 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,代谢指标数据 临床样本和细胞系(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
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