单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-07-10	Thioredoxin regulates T cell proliferation and aggravates the severity of influenza a virus infection 2025-Jul-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-10676-w PMID:40629048	研究论文	该研究通过多组学方法鉴定了TXN作为T细胞增殖的关键靶基因，并阐明了其与甲型流感病毒(IAV)感染的密切关联	首次将TXN鉴定为IAV感染中T细胞增殖的靶基因，并提出了T细胞死亡的新方向	未明确解释IAV感染后T细胞发育是否受到负调控	探究IAV感染期间T细胞的免疫变化及相关靶基因	T淋巴细胞	免疫学	甲型流感病毒感染	转录组分析、单细胞转录组分析、差异分析、WGCNA、Friends分析	NA	转录组数据	NA
22	2025-07-10	CAF-derived GLUT1 and its role in modulating ovarian cancer progression: a multi-dimensional analysis of the tumor microenvironment 2025-Jul-08, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08380-6 PMID:40629043	研究论文	本文通过多维分析揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)中GLUT1在卵巢癌微环境中调控葡萄糖代谢的作用及其对肿瘤进展的影响	首次发现GLUT1在CAFs中的高表达通过TGF-β1/p38/MMP2/MMP9通路促进卵巢癌细胞增殖和迁移，并利用单细胞RNA测序和3D生物打印模型验证了这一机制	未涉及GLUT1靶向治疗在临床前模型中的具体效果验证	解析卵巢癌微环境中CAFs的葡萄糖代谢重编程机制及其对肿瘤进展的影响	癌症相关成纤维细胞(CAFs)和卵巢癌细胞	肿瘤微环境研究	卵巢癌	单细胞RNA测序、生物信息学分析、3D生物打印	3D生物打印模型	基因表达数据、生物模型数据	NA
23	2025-07-10	Single-cell analysis links DCUN1D5 to immune remodeling and cisplatin resistance in recurrent osteosarcoma 2025-Jul-08, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08409-w PMID:40629059	研究论文	通过单细胞分析揭示了DCUN1D5在复发性骨肉瘤中的免疫重塑和顺铂耐药性作用	首次将DCUN1D5基因与骨肉瘤的免疫微环境重塑及顺铂耐药性联系起来，并发现其通过外泌体促进破骨细胞前体成熟的新机制	研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步的体内实验验证	探究骨肉瘤复发和顺铂耐药的分子机制	复发性骨肉瘤患者样本和细胞模型	肿瘤微环境	骨肉瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)	NA	单细胞转录组数据、批量转录组数据	多个单细胞RNA测序数据集（具体数量未说明）
24	2025-07-10	Peripheral immune imbalance in pediatric fulminant myocarditis revealed by single-cell sequencing and plasma proteomics 2025-Jul-08, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-025-00343-5 PMID:40629105	研究论文	通过单细胞测序和血浆蛋白质组学揭示了小儿暴发性心肌炎的外周免疫失衡	鉴定了外周血中几种独特的细胞类型，并揭示了急性期FM中免疫细胞比例和功能的显著失调	未提及样本量是否足够大以支持广泛推广	阐明小儿暴发性心肌炎的免疫特征和细胞通讯	小儿暴发性心肌炎患者的外周血单个核细胞和血浆	免疫学	心血管疾病	scRNA-seq, 血浆蛋白质组学	NA	单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据	未明确提及具体样本量
25	2025-07-10	Giardia-induced Type 2 mucosal immunity attenuates intestinal inflammation caused by co-infection or colitis in mice 2025-Jul-08, Nature microbiology IF:20.5Q1 DOI:10.1038/s41564-025-02051-2 PMID:40629110	research paper	该研究探讨了贾第虫感染如何通过诱导2型黏膜免疫反应减轻小鼠中由共感染或结肠炎引起的肠道炎症	揭示了贾第虫通过诱导IL-10产生的Th2细胞扩增，促进寄生虫持续存在并保护免受炎症性病理的机制	研究主要基于小鼠模型，人类数据有限，且保护机制的具体细节仍需进一步探索	探究贾第虫感染如何调节黏膜免疫以减轻肠道炎症	尼日利亚学龄儿童和小鼠模型	免疫学	肠道炎症	单细胞RNA测序、多参数流式细胞术	小鼠模型	基因表达数据、细胞表型数据	尼日利亚学龄儿童（数量未明确）和小鼠模型
26	2025-07-10	Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals the cellular heterogeneity of vestibular schwannoma 2025-Jul-08, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-01028-y PMID:40629113	研究论文	本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了前庭神经鞘瘤的细胞异质性	发现了VEGFA富集的施万细胞亚型，并通过空间转录组学验证了其存在，同时构建了前庭神经鞘瘤组织的初步细胞图谱	样本量较小（3例单细胞RNA测序数据和2例空间转录组数据）	探索前庭神经鞘瘤的发展和空间异质性机制	前庭神经鞘瘤组织	数字病理学	前庭神经鞘瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学	NA	单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据	3例单细胞RNA测序样本(VS1-3), 2例空间转录组样本(VS_S1-2)
27	2025-07-10	Temporal control of progenitor competence shapes maturation in GABAergic neuron development in mice 2025-Jul-08, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-025-01999-y PMID:40629142	研究论文	本研究探讨了小鼠胚胎中GABA能神经元发育过程中祖细胞能力的时间控制如何影响其成熟和分化	揭示了神经发生的时间进程如何塑造神经节隆起祖细胞的成熟能力，以及染色质重塑和转录因子NFIB及其靶基因如何影响晚期出生神经元的成熟能力	研究仅限于小鼠胚胎，未涉及其他物种或人类	理解GABA能神经元发育过程中祖细胞能力的时间控制机制	小鼠胚胎中的GABA能投射神经元和中间神经元	神经科学	NA	单细胞转录组学、染色质可及性分析、谱系追踪、出生日期标记、跨发育阶段移植和扰动测序	NA	转录组数据、染色质可及性数据	小鼠胚胎样本
28	2025-07-10	Mechanistic study of CTHRC1 in promoting Wilms' tumor progression by regulating M2-type tumor-associated macrophages polarization 2025-Jul-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06752-4 PMID:40629408	研究论文	本研究探讨了CTHRC1在Wilms瘤进展中的作用及其通过调节M2型肿瘤相关巨噬细胞极化的分子机制	揭示了CTHRC1通过TNFSF9-TNFRSF9轴诱导M2-TAMs极化，进而通过PI3K/Akt通路促进Wilms瘤进展的新机制	未明确说明样本量及实验重复次数	探究CTHRC1在Wilms瘤进展中的作用机制	Wilms瘤组织及细胞	肿瘤生物学	Wilms瘤	生物信息学分析、单细胞测序、RT-qPCR、Western blot、免疫组化、免疫荧光、转录组测序、异种移植模型	NA	基因表达数据、蛋白质数据、组织样本	NA
29	2025-07-10	Pancreatic alpha and beta cell fate choice is directed by apical-basal polarity dynamics 2025-Jul-07, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2025.02.008 PMID:40056911	研究论文	本文研究了胰腺内分泌祖细胞（EPs）的顶-基底极性动态如何调控其分化为α或β细胞命运	首次发现顶-基底极性状态是决定多能性胰腺内分泌祖细胞分化为α或β细胞命运的关键调控因素	研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证这些发现	探索细胞外信号如何调控多能性祖细胞在动态变化微环境中的分化	人类胰腺Neurogenin3内分泌祖细胞（EPs）	细胞生物学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
30	2025-07-10	Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression 2025-Jul-07, Gut IF:23.0Q1 DOI:10.1136/gutjnl-2024-334412 PMID:40199574	研究论文	本研究探讨了肠道和肝内CD8+ T细胞在酒精相关肝病(ALD)中的相反调控作用及其对疾病进展的影响	揭示了CD8+ T细胞在肠道和肝脏中的相反调控机制及其在ALD中的关键作用，提出BCL2调控CD8+ T细胞存活的新治疗策略	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步扩大	阐明肠道-肝脏轴中CD8+ T细胞的调控机制及其在ALD发病中的作用	ALD患者和小鼠模型中的肠道及肝内CD8+ T细胞	肝脏病理学	酒精性肝病	单细胞RNA测序(scRNA seq)，转录组学分析	Cd8 Bcl-2转基因小鼠模型	基因表达数据，免疫细胞分析数据	ALD患者样本和多种基因修饰小鼠模型
31	2025-07-10	Genomic evolution reshapes cell-type diversification in the amniote brain 2025-Jul-07, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.014 PMID:40367951	研究论文	通过创建包含乌龟、斑胸草雀、鸽子、小鼠和猕猴的端脑和小脑的单细胞图谱，研究揭示了羊膜动物大脑细胞类型在进化中的保守性和多样性	首次构建了跨物种的单细胞分辨率空间转录组图谱，揭示了鸟类和哺乳动物在端脑兴奋性神经元和小脑细胞类型上的显著差异，并发现了一种鸟类特有的浦肯野细胞亚型	研究仅涵盖了有限的物种范围（五种羊膜动物），可能无法完全代表所有羊膜动物的进化多样性	探索羊膜动物大脑复杂性和认知能力进化的遗传和基因表达机制	乌龟、斑胸草雀、鸽子、小鼠和猕猴的端脑和小脑细胞	基因组学	NA	单细胞分辨率空间转录组学	NA	单细胞基因表达数据	超过130万个细胞，来自五种羊膜动物（乌龟、斑胸草雀、鸽子、小鼠和猕猴）的端脑和小脑
32	2025-07-10	Molecular Mechanisms of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization 2025-Jul-07, Cellular and molecular neurobiology IF:3.6Q2 DOI:10.1007/s10571-025-01590-w PMID:40622473	研究论文	本研究通过单细胞测序和孟德尔随机化分析探索了血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的分子机制	结合单细胞测序与孟德尔随机化分析，鉴定了四个与AD风险显著相关的关键基因，揭示了PVMs在免疫调节和代谢通路中的作用	研究依赖于现有数据库(GSE264648和eQTLGen)的数据，可能需要进一步实验验证	阐明血管周围巨噬细胞(PVMs)在阿尔茨海默病发病机制中的分子作用机制	阿尔茨海默病患者血管周围巨噬细胞	生物医学	阿尔茨海默病	单细胞测序, 孟德尔随机化分析(MR)	NA	单细胞测序数据, eQTL数据	来自GSE264648和eQTLGen数据库的数据(具体样本量未明确说明)
33	2025-07-10	Single-nucleus rna sequencing identifies universal camk1d upregulation and dysregulated c-ltmr subtypes as key drivers of paclitaxel-induced neuropathy 2025-Jul-07, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-025-10065-z PMID:40622640	研究论文	通过单核RNA测序技术研究紫杉醇诱导的神经性疼痛的分子机制	首次利用单核RNA测序技术揭示紫杉醇诱导神经性疼痛中C_LTMR亚型的转录组变化及Camk1d的上调作用	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证	探究紫杉醇诱导神经性疼痛的分子机制	小鼠背根神经节(DRG)细胞	单细胞转录组学	神经性疼痛	单核RNA测序(snRNA-seq)	NA	RNA测序数据	紫杉醇处理的小鼠DRG细胞
34	2025-07-10	Single-cell transcriptomic analysis identifies systemic immunosuppressive myeloid cells and local monocytes/macrophages as key regulators in polytrauma-induced immune dysregulation 2025-Jul-07, Bone research IF:14.3Q1 DOI:10.1038/s41413-025-00444-x PMID:40623986	研究论文	通过单细胞转录组分析，识别了多发性创伤诱导的免疫失调中的系统性免疫抑制性髓系细胞和局部单核细胞/巨噬细胞的关键调控作用	同时研究了全身和局部免疫细胞，发现了创伤相关的免疫抑制性髓系细胞群及其标记物CD1d，以及局部缺陷组织中的Spp1单核细胞/巨噬细胞	研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究多发性创伤诱导的免疫失调及其对骨折愈合的影响	大鼠多发性创伤模型中的血液、骨髓和局部缺陷软组织	免疫学	多发性创伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
35	2025-07-10	Single-cell transcriptomic profiling of immune landscape in triple-negative breast cancer during neoadjuvant chemotherapy 2025-Jul-07, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1 DOI:10.1038/s41540-025-00549-3 PMID:40624003	research paper	该研究通过单细胞转录组测序技术，探索了三阴性乳腺癌（TNBC）在新辅助化疗（NAC）期间的免疫景观变化，并鉴定了与化疗耐药相关的因素	首次在S100АMHC单核细胞群中鉴定了髓系来源的抑制细胞（MDSC）的特征，并计算了MDSC评分，验证了其在非响应患者中的升高	研究样本量有限，且仅关注了NAC初始阶段的免疫变化	研究TNBC患者在新辅助化疗期间的免疫系统功能变化及其对化疗效果的影响	三阴性乳腺癌（TNBC）患者	digital pathology	breast cancer	single-cell RNA sequencing	NA	RNA-seq data	TNBC患者（响应者与非响应者）及独立队列验证数据
36	2025-07-10	Integrated bioinformatics analysis identifies CHAD association with osteoporosis and in vitro chondrogenic effects of Wogonin 2025-Jul-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-05861-w PMID:40624035	研究论文	通过整合生物信息学分析发现CHAD与骨质疏松症的关联，并探讨黄酮类化合物Wogonin在体外对软骨形成的影响	首次通过多组学生物信息学方法识别CHAD作为骨质疏松症的潜在关键基因，并验证了Wogonin在体外对软骨形成的促进作用	研究仅进行了体外实验验证，缺乏体内实验和临床数据支持	探索骨质疏松症的新型治疗靶点和中药替代治疗方案	骨质疏松症相关基因和中药化合物	生物信息学	骨质疏松症	RNA测序（bulk和single-cell）、分子对接、qRT-PCR	ATDC5细胞模型	基因表达数据	未明确说明具体样本数量，使用了公共数据集和ATDC5细胞系
37	2025-07-10	Neurogenomic and behavioral principles shape freezing dynamics and synergistic performance in Drosophila melanogaster 2025-Jul-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-61313-z PMID:40624091	研究论文	该研究通过大规模行为实验和GWAS分析，揭示了果蝇在集体行为中应对威胁的神经和遗传机制	发现了Ptp99A和kirre等关键基因位点对视觉神经元发育和行为的影响，并提出了遗传多样性促进群体协同反应的机制	研究仅针对果蝇这一模式生物，结果在其他物种中的普适性有待验证	探究集体行为中检测和逃避捕食者的神经遗传基础	黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)	神经科学	NA	GWAS、单细胞转录组学、功能分析、基于代理的模拟	NA	行为数据、基因数据	大规模果蝇群体
38	2025-07-10	Novel single-cell preservation and RNA sequencing technology unlocks field studies for Plasmodium natural infections 2025-Jul-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-08765-x PMID:40624152	研究论文	本文介绍了一种新型的单细胞保存和RNA测序技术，用于疟原虫自然感染的研究	开发了适用于低资源环境的单细胞RNA保存和测序技术，首次在自然感染疟原虫的研究中应用	目前仅在P. knowlesi疟原虫中进行了验证，尚未在其他疟原虫种类中测试	开发适用于野外研究的单细胞RNA测序技术，以更好地理解疟原虫生物学	疟原虫(P. knowlesi)自然感染样本	基因组学	疟疾	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	6个样本，共22,345个P. knowlesi单细胞转录组
39	2025-07-10	Regulation of revival stem cell differentiation by CREPT/RPRD1B during intestinal regeneration 2025-Jul-07, Cell & bioscience DOI:10.1186/s13578-025-01434-6 PMID:40624542	研究论文	本研究探讨了CREPT/RPRD1B在肠道再生过程中对复兴干细胞(revSCs)分化的调控作用	首次发现CREPT/RPRD1B蛋白在肠道再生过程中对复兴干细胞分化的重要调控作用	研究主要基于小鼠模型，人类肠道再生中的类似机制尚需验证	阐明肠道再生过程中复兴干细胞分化的调控机制	小鼠肠道复兴干细胞(revSCs)	干细胞生物学	肠道损伤修复	单细胞转录组分析、谱系追踪实验	Villin-Cre介导的CREPT敲除小鼠模型	基因表达数据	未明确说明具体样本数量，使用基因工程小鼠模型
40	2025-07-10	Integrated analysis of polytranscriptomics reveals TNFSF ligand genes in pancreatic cancer prognosis and immune regulation 2025-Jul-07, BMC immunology IF:2.9Q3 DOI:10.1186/s12865-025-00733-4 PMID:40624624	研究论文	本研究通过整合分析多转录组数据，揭示了TNFSF配体基因在胰腺癌预后和免疫调节中的作用	首次基于TNFSF配体表达谱对胰腺癌进行分子分型，并发现TNFSF4在B细胞中的高表达与良好预后和免疫治疗反应相关	研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于qRT-PCR，缺乏更深入的机制研究	探究TNF配体家族成员在胰腺癌中的表达模式及预后意义，重点关注TNFSF4的作用	胰腺癌(PC)患者样本	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)、非负矩阵分解(NMF)、单样本基因集富集分析(ssGSEA)、qRT-PCR	NMF聚类模型	RNA测序数据	GSE212966数据集和TCGA-PAAD数据集中的胰腺癌样本